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平島 剛志

ヒラシマ ツヨシ

白眉センター 特定准教授

平島 剛志
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    Last Updated :2022/05/14

    基本情報

    学部兼担

    • 医学部

    全学メールアドレス

    • 全学メールアドレス

      hirashima.tsuyoshi.2mkyoto-u.ac.jp

    所属学協会

    • 日本分子生物学会
    • 日本細胞生物学会
    • 日本生物物理学会
    • 日本数理生物学会
    • 日本発生生物学会

    学位

    • 修士(理学)(九州大学)
    • 博士(理学)(九州大学)

    出身高等学校

    • 出身高等学校

      宮崎県立宮崎西高校

    経歴

    • 自 2021年01月, 至 現在
      京都大学, 白眉センター/生命科学研究科, 特定准教授
    • 自 2019年10月, 至 現在
      科学技術振興機構(JST), さきがけ研究者
    • 自 2017年04月, 至 2020年12月
      京都大学, 医学研究科, 講師
    • 自 2014年04月, 至 2017年03月
      京都大学, 再生医科学研究所, 特定助教(生命動態拠点事業)
    • 自 2012年04月, 至 2014年03月
      京都大学, 日本学術振興会 特別研究員(PD)
    • 自 2011年04月, 至 2012年03月
      金沢大学・京都大学, 博士研究員(CREST)
    • 自 2009年04月, 至 2011年03月
      九州大学, 日本学術振興会 特別研究員(DC2)
    • 自 2010年04月, 至 2010年06月
      コロンビア大学, Visiting Researcher
    • 自 2009年06月, 至 2010年03月
      プリンストン大学, Visiting Student Research Collaborator

    使用言語

    • 日本語
    • 英語

    ID,URL

    関連Webサイト

    researchmap URL

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      Last Updated :2022/05/14

      研究

      研究キーワード

      • Imaging
      • システム生物学
      • メカノバイオロジー
      • 数理モデル
      • 器官発生
      • 形態形成

      研究分野

      • ライフサイエンス, 細胞生物学
      • ライフサイエンス, 生物物理学
      • ライフサイエンス, 形態、構造
      • ライフサイエンス, 発生生物学

      論文

      • C-type Natriuretic Peptide–induced PKA Activation Promotes Endochondral Bone Formation in Hypertrophic Chondrocytes
        Keisho Hirota; Tsuyoshi Hirashima; Kazuki Horikawa; Akihiro Yasoda; Michiyuki Matsuda
        Endocrinology, 2022年03月01日
      • Three-dimensional analysis and in vivo imaging for sperm release and transport in the murine seminiferous tubule
        Yuta Kanazawa; Takuya Omotehara; Hiroki Nakata; Tsuyoshi Hirashima; Masahiro Itoh
        Reproduction (Cambridge, England), 2022年05月31日
      • Live imaging approach of dynamic multicellular responses in ERK signaling during vertebrate tissue development
        Tsuyoshi Hirashima
        Biochemical Journal, 2022年01月28日
      • Development of Surgical and Visualization Procedures to Analyze Vasculatures by Mouse Tail Edema Model
        Shinji Kumegawa; Gen Yamada; Daiki Hashimoto; Tsuyoshi Hirashima; Mizuki Kajimoto; Kyoichi Isono; Kota Fujimoto; Kentaro Suzuki; Kazuhisa Uemura; Masatsugu Ema; Shinichi Asamura
        Biological Procedures Online, 2021年12月
      • Stalling interkinetic nuclear migration in curved pseudostratified epithelium of developing cochlea
        Mamoru Ishii; Tomoko Tateya; Michiyuki Matsuda; Tsuyoshi Hirashima
        Royal Society Open Science, 2021年12月, 査読有り, 最終著者, 責任著者
      • Retrograde ERK activation waves drive base-to-apex multicellular flow in murine cochlear duct morphogenesis.
        Mamoru Ishii; Tomoko Tateya; Michiyuki Matsuda; Tsuyoshi Hirashima
        eLife, 2021年03月05日, 査読有り, 責任著者
      • Theory of mechanochemical patterning and optimal migration in cell monolayers
        Daniel Boocock; Naoya Hino; Natalia Ruzickova; Tsuyoshi Hirashima; Edouard Hannezo
        Nature Physics, 2021年02月28日, 査読有り, 責任著者
      • Dynamic erectile responses of a novel penile organ model utilizing two photon excitation microscopy (TPEM).
        Daiki Hashimoto; Tsuyoshi Hirashima; Hisao Yamamura; Tomoya Kataoka; Kota Fujimoto; Taiju Hyuga; Atsushi Yoshiki; Kazunori Kimura; Shunsuke Kuroki; Makoto Tachibana; Kentaro Suzuki; Nobuhiko Yamamoto; Shin Morioka; Takehiko Sasaki; Gen Yamada
        Biology of reproduction, 2021年01月28日, 査読有り, 責任著者
      • Metastatic Single Tumor Cells Evade NK Cell-mediated Killing by Thrombin-mediated Loss of the Activating Ligand CD155/PVR/Necl-5
        Hiroshi Ichise; Shoko Tsukamoto; Tsuyoshi Hirashima; Yoshinobu Konishi; Choji Oki; Shinya Tsukiji; Satoshi Iwano; Atsushi Miyawaki; Kenta Sumiyama; Kenta Terai; Michiyuki Matsuda
        2021年01月17日
      • Orthotopic foetal lung tissue direct injection into lung showed a preventive effect against paraquat-induced acute lung injury in mice.
        Ryo Okabe; Toyofumi F Chen-Yoshikawa; Akihiko Yoshizawa; Tsuyoshi Hirashima; Masao Saito; Hiroshi Date; Takanori Takebe
        European journal of cardio-thoracic surgery : official journal of the European Association for Cardio-thoracic Surgery, 2020年09月01日, 査読有り
      • Mechanical Tissue Compression and Whole-mount Imaging at Single CellResolution for Developing Murine Epididymal Tubules.
        Tsuyoshi Hirashima
        Bio-protocol, 2020年08月05日, 査読有り, 責任著者
      • ERK-Mediated Mechanochemical Waves Direct Collective Cell Polarization.
        Naoya Hino; Leone Rossetti; Ariadna Marín-Llauradó; Kazuhiro Aoki; Xavier Trepat; Michiyuki Matsuda; Tsuyoshi Hirashima
        Developmental cell, 2020年06月22日, 査読有り, 責任著者
      • Incoherent Feedforward Regulation via Sox9 and ERK Underpins Mouse Tracheal Cartilage Development.
        Takuya Yoshida; Michiyuki Matsuda; Tsuyoshi Hirashima
        Frontiers in cell and developmental biology, 2020年, 査読有り, 責任著者
      • Polarized cellular mechano-response system for maintaining radial size in developing epithelial tubes.
        Tsuyoshi Hirashima; Taiji Adachi
        Development (Cambridge, England), 2019年12月02日, 査読有り, 筆頭著者, 責任著者
      • Three-dimensional live imaging of Atoh1 reveals the dynamics of hair cell induction and organization in the developing cochlea.
        Tomoko Tateya; Susumu Sakamoto; Fumiyoshi Ishidate; Tsuyoshi Hirashima; Itaru Imayoshi; Ryoichiro Kageyama
        Development (Cambridge, England), 2019年11月01日, 査読有り
      • Dynamic MAPK/ERK Activity Sustains Nephron Progenitors through Niche Regulation and Primes Precursors for Differentiation.
        Anneliis Ihermann-Hella; Tsuyoshi Hirashima; Jussi Kupari; Kristen Kurtzeborn; Hao Li; Hyuk Nam Kwon; Cristina Cebrian; Abdul Soofi; Arvydas Dapkunas; Ilkka Miinalainen; Gregory R Dressler; Michiyuki Matsuda; Satu Kuure
        Stem cell reports, 2018年10月09日, 査読有り
      • In vitro tubulogenesis of Madin-Darby canine kidney (MDCK) spheroids occurs depending on constituent cell number and scaffold gel concentration.
        Tsuyoshi Hirashima; Miho Hoshuyama; Taiji Adachi
        Journal of theoretical biology, 2017年12月21日, 査読有り, 責任著者
      • Cellular Potts modeling of complex multicellular behaviors in tissue morphogenesis.
        Tsuyoshi Hirashima; Elisabeth G Rens; Roeland M H Merks
        Development, growth & differentiation, 2017年06月, 査読有り, 責任著者
      • Mathematical study on robust tissue pattern formation in growing epididymal tubule.
        Tsuyoshi Hirashima
        Journal of theoretical biology, 2016年10月21日, 査読有り
      • Procedures for the quantification of whole-tissue immunofluorescence images obtained at single-cell resolution during murine tubular organ development.
        Tsuyoshi Hirashima; Taiji Adachi
        PloS one, 2015年, 査読有り, 責任著者
      • Pattern formation of an epithelial tubule by mechanical instability during epididymal development.
        Tsuyoshi Hirashima
        Cell reports, 2014年11月06日, 査読有り, 責任著者
      • On fundamental cellular processes for emergence of collective epithelial movement.
        Tsuyoshi Hirashima; Yoichiroh Hosokawa; Takanori Iino; Masaharu Nagayama
        Biology open, 2013年07月15日, 査読有り, 責任著者
      • Mathematical study of the role of Delta/Notch lateral inhibition during primary branching of Drosophila trachea development.
        Yoshiki Koizumi; Yoh Iwasa; Tsuyoshi Hirashima
        Biophysical journal, 2012年12月19日, 査読有り, 責任著者
      • A kinetic model of ERK cyclic pathway on substrate control.
        Tsuyoshi Hirashima
        Mathematical biosciences, 2012年10月, 査読有り, 責任著者
      • Mechanisms for split localization of Fgf10 expression in early lung development.
        Tsuyoshi Hirashima; Yoh Iwasa; Yoshihiro Morishita
        Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists, 2009年11月, 査読有り, 責任著者
      • Dynamic modeling of branching morphogenesis of ureteric bud in early kidney development.
        Tsuyoshi Hirashima; Yoh Iwasa; Yoshihiro Morishita
        Journal of theoretical biology, 2009年07月07日, 査読有り
      • Distance between AER and ZPA is defined by feed-forward loop and is stabilized by their feedback loop in vertebrate limb bud.
        Tsuyoshi Hirashima; Yoh Iwasa; Yoshihiro Morishita
        Bulletin of mathematical biology, 2008年02月, 査読有り
      • Functional visualization of NK cell-mediated killing of metastatic single tumor cells.
        Hiroshi Ichise; Shoko Tsukamoto; Tsuyoshi Hirashima; Yoshinobu Konishi; Choji Oki; Shinya Tsukiji; Satoshi Iwano; Atsushi Miyawaki; Kenta Sumiyama; Kenta Terai; Michiyuki Matsuda
        eLife, 2022年02月03日
      • Mechanical Feedback Control for Multicellular Tissue Size Maintenance: A Minireview
        Tsuyoshi Hirashima
        Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2022年01月14日

      MISC

      • システム制御の観点で眺める組織・器官のサイズ調節
        平島 剛志
        実験医学(サイズ生物学:“生命”が固有のサイズをもつ意味とそれを決定する仕組み), 2018年, 招待有り
      • Cellular Potts Modeling for Mechanical Wave Propagation in Multicellular Migration
        平島 剛志
        京都大学数理解析研究所講究録, 2018年, 招待有り
      • Adaptive Multicellular Behaviors as Mechanoresponse for Radial Size Maintenance of Epithelial Tube
        Tsuyoshi Hirashima; Taiji Adachi
        MECHANISMS OF DEVELOPMENT, 2017年07月
      • 精巣上体細管の形態形成を支える力学原理と細胞力学応答システム
        平島 剛志
        生物物理, 2017年, 査読有り, 招待有り
      • ライブイメージングに基づくシミュレーション解析
        平島 剛志
        (増刊号 わかる・できる 生命科学の数理モデルとシミュレーション), 2017年, 招待有り
      • 細胞間で働く力の受容と細胞応答による生体組織中の力の制御
        平島 剛志
        実験医学(増刊号 再生医療と疾患解明の鍵となる組織幹細胞), 2016年, 招待有り
      • 上皮管組織の異方的な成長を支える協調的な多細胞動態と力学
        平島 剛志
        生体の科学, 2016年, 招待有り
      • 伸びてねじれる精巣上体細管のかたち作り
        平島 剛志
        形の科学会誌, 2015年06月, 招待有り
      • Cellular Potts Model on Collective Cell Movement
        平島 剛志
        京都大学数理解析研究所講究録, 2013年, 招待有り
      • Modeling lung branching morphogenesis via epithelial-mesenchymal interaction
        Takashi Miura; Hiraga Kennichi; Tsuyoshi Hirashima
        DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 2011年08月
      • The signaling properties in MAPK cycle are modulated by its downstream substrates
        Tsuyoshi Hirashima; Yoosik Kim; Stanislav Y. Shvartsman
        DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 2010年08月, 査読有り

      講演・口頭発表等

      • ERK活性を介したメカノ・ケミカルフィードバック制御による肺上皮の分岐形態形成
        平島剛志
        第9回定量生物の会年会, 2019年, 定量生物の会
      • Adaptive movement of endothelial cells controlled via physical interaction with an developing epithelial tube
        平島剛志
        京都大学医学研究科 発生・細胞生物・システム生物学コース, 2018年, 京都大学医学研究科, 招待有り
      • ERK活性を介した 細胞集団遊走の数理モデル
        平島剛志
        第3回日本メカノバイオロジー学会年会, 2018年, 日本メカノバイオロジー学会
      • Intercellular mechanical wave via intracellular ERK activation during collective cell migration -- experiments and modeling
        平島剛志
        Frontline in DevelopmentalBiology, 2018年, 京都大学, 招待有り
      • シグナル活性のライブイメージングと多細胞運動のコンピュテーショナルモデル
        平島剛志
        第15回生物数学の理論とその応用―次世代の数理科学への展開―, 2018年, 京都大学数理解析研究所, 招待有り
      • 肺上皮シートの分岐形態形成におけるERK活性を介したメカノ応答
        平島剛志
        第56回日本生物物理学会年会, 2018年, 日本生物物理学会
      • ERK活性を介したメカノ・ケミカルフィードバック制御による肺上皮の分岐形態形成
        平島剛志
        日本発生生物学会 秋季シンポジウム2018, 2018年, 日本発生生物学会
      • ERK活性と上皮・組織変形のフィードバックループによる肺の分岐形態形成の制御機構
        平島剛志
        第41回日本分子生物学会年会, 2018年, 日本分子生物学会
      • パターン形成・形態形成のメカノバイオロジー
        平島剛志
        第8回CSJ化学フェスタ JST特別企画 メカノバイオロジーと光科学、分子技術 〜 未来を拓くトライアングル, 2018年, 日本化学会, 招待有り
      • 多細胞動態・形態の定量による恒常的な管径維持システムの解明
        平島剛志
        第8回定量生物の会年会, 2017年, 定量生物の会, 招待有り
      • Adaptive Cellular Response to Mechanical Forces for Shaping Epithelial Tube
        平島剛志
        京都大学医学研究科 再生医療・臓器再建医学コース, 2017年, 京都大学医学研究科, 招待有り
      • Multicellular communications via mechanical forces for tube morphogenesis
        平島剛志
        CDB seminar, 2017年, 理研CDB, 招待有り
      • 生体外培養下における管形成の誘導について
        平島剛志
        第2回日本メカノバイオロジー学会, 2017年, 日本メカノバイオロジー学会
      • 組織深部で血管内皮細胞が出会うためには 〜血管内皮と上皮管の力学的相互作用
        平島剛志
        第50回日本発生生物学会年会, 2017年, 日本発生生物学会
      • 上皮管の形態形成に働く細胞の力学応答システム
        平島剛志
        第69回日本細胞生物学会年会, 2017年, 日本細胞生物学会, 招待有り
      • Adaptive Multicellular Behaviors as Mechanoresponse for Radial Size Maintenance of Epithelial Tube
        平島剛志
        18th International Congress of Developmental Biology, 2017年, 国際発生生物学会
      • 細胞の異方的なメカノレスポンスが発生過程の精巣上体細管の径を維持する
        平島剛志
        第55回日本生物物理学会年会, 2017年, 日本生物物理学会
      • Cellular Potts Modeling for Mechanical Wave Propagation in Multicellular Movement
        平島剛志
        Theory of Biomathematics and its Applications XIV - Modelling and Analysis for Structured Population Dynamics and its Applications, 2017年, 京都大学数理解析研究所
      • 組織の異方成長に関与する新たな細胞力覚システム
        平島剛志
        第1回日本メカノバイオロジー学会, 2016年, 日本メカノバイオロジー学会
      • 増殖する上皮管の径サイズ維持を支える多細胞動態システム
        平島剛志
        生命動態の分子メカニズムと数理, 2016年, 生命動態拠点事業
      • Adaptive Cellular Behavior for Homeostatic Radial Size in Proliferating Tube
        平島剛志
        第14回CDBシンポジウム, Size in Development, 2016年, 理研CDB
      • 増殖する上皮管の径サイズ恒常維持に働く多細胞動態システムについて
        平島剛志
        第68回日本細胞生物学会年会, 2016年, 日本細胞生物学会, 招待有り
      • Adaptive Multicellular Dynamics via Directional Mechanosensing for Homeostatic Radial Size of Proliferating Tube
        平島剛志
        Mechanobiology from molecules to tissue, 2016年, Rencontres du Vietnam, Unesco
      • 増殖する上皮管の径サイズ維持に働く多細胞動態システム
        平島剛志
        日本発生生物学会 秋季シンポジウム2016, 2016年, 日本発生生物学会
      • On a Mechanism of Adaptive Cellular Behavior Achieving Stable Radial Size of a Developing Epithelial Tubule
        平島剛志
        第48回日本発生生物学会年会, 2015年, 日本発生生物学会
      • 伸びてねじれる精巣上体細管のかたち作り
        平島剛志
        第79回形の科学会, 2015年, 形の科学会, 招待有り
      • Modeling Apical Surface Dynamics in Elongating Tubule Morphogenesis
        平島剛志
        第25回日本数理生物学会, 2015年, 日本数理生物学会
      • On Dynamic Cellular Behaviors Realizing Stable Radial Size in Developing Epithelial Tubule
        平島剛志
        第53回日本生物物理学会年会, 2015年, 日本生物物理学会
      • Multi-cellular Surface Dynamics of Biological Tube for Homeostatic Radial Size
        平島剛志
        Hierarchical Dynamics in Soft Materials and Biological Matter, 2015年
      • On Dynamic Cellular Behaviors Realizing Homeostatic Radial Size in Developing Epithelial Tubule
        平島剛志
        EMBL Symposium - Physics of Cells and Tissues 2015, 2015年, EMBL
      • Adaptive Cellular Behaviors Realizing Homeostatic Radial Size in Developing Epithelial Tubule
        平島剛志
        Commemorative Symposium for the 31st International Prize for Biology, 2015年
      • 生き物の管の形態形成 ー管のかたちの動的恒常性と変形についてー
        平島剛志
        2015年, 立命館大学, 招待有り

      外部資金:科学研究費補助金

      • 精子アクティブマターによる生体内集団動態の物理機構
        挑戦的研究(萌芽)
        中区分13:物性物理学およびその関連分野
        京都大学
        平島 剛志
        自 2021年07月09日, 至 2024年03月31日, 交付
        精子;アクティブマター
      • 多細胞自律性を支える細胞競合機構の数理・物理学的解明
        学術変革領域研究(A)
        学術変革領域研究区分(Ⅲ)
        京都大学
        平島 剛志
        自 2021年09月10日, 至 2026年03月31日, 採択
      • 生殖細胞集団動態のシンギュラリティを生み出す運動能プロファイル
        新学術領域研究(研究領域提案型)
        複合領域
        京都大学
        平島 剛志
        自 2021年04月01日, 至 2023年03月31日, 交付
        細胞集団運動;精子乱流;生体イメージング;エージェントベースモデル
      • 細胞増殖因子情報伝達系の活性波による細胞集団移動制御機構
        基盤研究(A)
        中区分44:細胞レベルから個体レベルの生物学およびその関連分野
        京都大学
        松田 道行
        自 2019年04月01日, 至 2024年03月31日, 交付
        細胞生物学;顕微鏡;バイオセンサー;細胞運動;細胞集団運動;上皮細胞増殖因子;ERK;マップキナーゼ
      • 管径の恒常性維持に働く細胞力覚システムの応答特性の解明
        基盤研究(C)
        京都大学
        平島 剛志
        自 2017年07月18日, 至 2020年03月31日, 完了
        上皮管;ERK;メカノバイオロジー;数理モデル;ライブイメージング;精巣上体;肺;内耳;FRETイメージング;蝸牛;分岐形態形成;力学摂動;ERK活性;マウス;形態形成;MAPK/ERK;肺上皮;イメージング
      • 上皮の管径を維持するやわらかな力学機構の解明
        若手研究(B)
        京都大学
        平島 剛志
        自 2015年04月01日, 至 2018年03月31日, 完了
        サイズ維持;上皮管;形態形成;数理モデル;イメージング;器官形成;精巣上体;メカノバイオロジー;バーテクスモデル;蛍光ライブイメージング;バーテクスダイナミクスモデル;ライブイメージング;多細胞力学応答;多細胞ライブイメージング;多細胞動態の定量;多細胞動態の数理モデル
      • 細胞間コミュニケーションのライブイメージング
        新学術領域研究(研究領域提案型)
        生物系
        京都大学
        松田 道行
        自 2015年06月29日, 至 2020年03月31日, 完了
        蛍光イメージング;蛍光顕微鏡;バイオセンサー;上皮細胞増殖因子;FRET;PKA;ERK;蛍光タンパク質;筋再生;イメージング;細胞生物学;再生;蛍光バイオセンサー;BRET;生体イメージング;発光イメージング;FRETバイオセンサー;分子プローブ;蛍光共鳴エネルギー移動;タンパク質リン酸化酵素
      • 分岐器官の形態形成過程における細胞運動の測定と数理モデリング
        特別研究員奨励費
        京都大学
        至 2014年03月31日, 採択後辞退
        数理モデリング;ライブイメージング;内臓の形態形成;精巣上体細管の発生;尿管芽;多細胞動態;器官形成;イメージング
      • 分岐形態形成のダイナミックモデリング
        特別研究員奨励費
        九州大学
        完了
        分岐形態形成;数理モデル;シグナル制御;MAPK;Cellular Potts Model;腎管芽発生;肺発生;遺伝子制御ネットワーク;レトロアクティビティ
      list
        Last Updated :2022/05/14

        教育

        担当科目

        • 自 2017年04月, 至 2018年03月
          実験系研究者向けの数理・統計・計算生物学
          通年, 生命科学研究科
        • 自 2018年04月, 至 2019年03月
          実験系研究者向けの数理・統計・計算生物学
          通年, 生命科学研究科
        • 自 2019年04月, 至 2020年03月
          実験系研究者向けの数理・統計・計算生物学
          通年, 生命科学研究科
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          実験系生物学者のための数理・統計・計算生物学入門
          通年, 生命科学研究科
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          実験系生物学者のための数理・統計・計算生物学入門
          通年, 生命科学研究科
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          Last Updated :2022/05/14

          大学運営

          部局運営(役職等)

          • 自 2017年04月01日, 至 2019年03月31日
            医学図書館図書連絡委員会
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            Last Updated :2022/05/14

            学術・社会貢献

            委員歴

            • 自 2021年01月, 至 現在
              常任編集委員, 日本細胞生物学会
            • 自 2021年01月, 至 現在
              日本生物物理学会 分野別専門委員「C-27. 発生」
            • 自 2019年05月, 至 2021年12月
              会誌「生物物理」編集委員, 日本生物物理学会
            • 自 2019年04月, 至 2022年03月
              科学技術・学術政策研究所 専門調査委員
            • 自 2018年06月, 至 現在
              代議員, 日本細胞生物学会
            • 自 2019年01月, 至 2020年12月
              分野別専門委員「C-09. 細胞形態形成」, 日本生物物理学会
            • 自 2022年, 至 現在
              Editorial Board, Journal of Theoretical Biology

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