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  nagasaki.shinji.3skyoto-u.ac.jp

Academic Degree

• 23 Mar. 2023

  京都大学博士（生命科学）
• 23 Mar. 2020

  京都大学修士（生命科学）

Academic Resume (Undergraduate School/Majors)

• 早稲田大学, 教育学部理学科, 卒業

Research History

• From Apr. 2025, To Present

  Kyoto University, 大学院生命科学研究科附属 生命情報解析教育センター, 先端的生命科学推進プロジェクト助教
• From Apr. 2023, To Mar. 2025

  Kyoto University, 医生物学研究所, 特定研究員
• From Apr. 2020, To Mar. 2023

  Japan Society for the Promotion of Science, 特別研究員 (DC1)

Profile

• Profile

   

  
  

  【研究テーマ】
  光を使って遺伝子発現を自在に制御する技術（光遺伝学／オプトジェネティクス）の開発と応用に取り組んでいます。
  あわせて、蛍光タンパク質や発光タンパク質を用いた生命現象や遺伝子発現の可視化技術の開発・応用も行っています。
  
  自ら新たな研究手法を開発し、これまでは研究技術的な制限によって着手不可能だった生命現象の解明を目指しています。
  
  開発した光操作・イメージング技術は、
  神経科学・神経発生学・再生医療の分野（培養細胞、マウス胎仔脳、成体脳など）で応用しています。
  特に、光による遺伝子発現の制御技術は、他の多くの研究分野にも応用可能ですので、
  現在、共同研究を実施中・募集中です。
  
  ご興味のある方は、共同研究のご相談や実験系に関する議論など、どうぞお気軽にご連絡ください。
  
  【経歴】
  2014年 4月 – 2018年 3月　早稲田大学 教育学部 理学科 生物学専修 卒業 (花嶋研究室)
  2018年 4月 – 2020年 3月　京都大学大学院 生命科学研究科 高次生命科学専攻 博士前期課程 修了 (今吉研究室)
  2020年 4月 – 2023年 3月　京都大学大学院 生命科学研究科 高次生命科学専攻 博士後期課程 修了 (今吉研究室)
  　　　　　　  2023年 3月　京都大学 博士 (生命科学) 学位取得
  
  2020年 4月 – 2023年 3月　日本学術振興会特別研究員 (DC1)
  2023年 4月 – 2025年 3月   京都大学 医生物学研究所 特定研究員 (今吉研究室)
  2025年 4月 – 現在     　     京都大学大学院 生命科学研究科附属 生命情報解析教育センター 助教 (今吉研究室)
  　　　　　　　　　　　　　(先端的生命科学推進プロジェクト助教)
  
  【研究指導】
  修士課程の修了者　2021年度 1名、2022年度 2名、2023年度 2名、2025年度 3名
  学部生　　　　　　2021年度 1名
  2026年度(現在)　  博士課程 ２名、修士課程 2名
  
  【出身】
  愛知県 高浜市（刈谷高校）

  
  

   

ID,URL

• J-Global ID

  202301004627234949

researchmap URL

• https://researchmap.jp/Nagasaki_C_Shinji

Research

Research Interests

• Optogenetics
• 遺伝子発現
• 光作動性転写因子
• 神経発生学
• 神経幹細胞

Papers

• Application of Lentivirus Vectors to Adult Neurogenesis and Manipulation of Neural Stem Cells

  Itaru Imayoshi; Mayumi Yamada; Shinji C. Nagasaki; Tomonori D. Fukuda; Ikumi Nagano; Tomohisa Toda

  Methods in Molecular Biology, 23 Nov. 2025

  
• A spinal synergy of excitatory and inhibitory neurons coordinates ipsilateral body movements

  Marito Hayashi; Miriam Gullo; Gokhan Senturk; Stefania Di Costanzo; Shinji C. Nagasaki; Ryoichiro Kageyama; Itaru Imayoshi; Martyn Goulding; Samuel L. Pfaff; Graziana Gatto

  eLife, 02 Aug. 2023

  
• Enhancement of Vivid-based photo-activatable Gal4 transcription factor in mammalian cells.

  Shinji C Nagasaki; Tomonori D Fukuda; Mayumi Yamada; Yusuke Iii Suzuki; Ryo Kakutani; Adam T Guy; Itaru Imayoshi

  Cell structure and function, 08 Feb. 2023, Lead author, Corresponding author

  Access this paper :

  
• Optimization of Light-Inducible Gal4/UAS Gene Expression System in Mammalian Cells.

  Mayumi Yamada; Shinji C Nagasaki; Yusuke Suzuki; Yukinori Hirano; Itaru Imayoshi

  iScience, 27 Aug. 2020

  Access this paper :

  
• Light-mediated control of Gene expression in mammalian cells.

  Mayumi Yamada; Shinji C Nagasaki; Takeaki Ozawa; Itaru Imayoshi

  Neuroscience research, Mar. 2020

  Access this paper :

  
• Light Control of the Tet Gene Expression System in Mammalian Cells.

  Mayumi Yamada; Yusuke Suzuki; Shinji C Nagasaki; Hiroyuki Okuno; Itaru Imayoshi

  Cell reports, 09 Oct. 2018

  

Industrial Property Rights

• 特開WO/2020/045651, 特願PCT/JP2019/034217, PHOTOACTIVATABLE TET EXPRESSION CONTROL SYSTEM

  IMAYOSHI Itaru; YAMADA Mayumi; SUZUKI Yusuke; NAGASAKI Shinji

  

Awards

• 04 May 2019

  Best Poster Presentation（National Taiwan University）