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• Faculty of Agriculture

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  kudoh.aoi.7kkyoto-u.ac.jp

Academic Degree

• 23 Jul. 2026

  京都大学博士（農学）
• 24 Mar. 2023

  京都大学修士（農学）

Academic Resume (Graduate Schools)

• 京都大学, 大学院農学研究科博士後期課程応用生物科学専攻, 修了
• 京都大学, 大学院農学研究科博士後期課程応用生物科学専攻, 研究指導認定退学
• 京都大学, 大学院農学研究科修士課程応用生物科学専攻, 修了

Academic Resume (Undergraduate School/Majors)

• 京都大学, 農学部資源生物科学科, 卒業

Research History

• From Apr. 2026, To Present

  Kyoto University, Graduate School of Agriculture, Assistant Professor
• From Apr. 2023, To Mar. 2026

  Kyoto University, Graduate School of Agriculture, JSPS Doctoral Course (DC) Research Fellow

Profile

• Profile

  野生植物および栽培植物における形態や生態の進化に関心があり、野外調査と遺伝学的手法を組み合わせて研究を行っています。主な研究テーマとして、雄株と雌株に分かれる雌雄異株植物における性決定機構とその進化過程の解明に取り組んでいます。

  
  

  
  

  個人ホームページ

  
  

  所属研究室ホームページ

  
  

  
  

   

  
  

   

ID,URL

• ORCID ID

  0000-0002-2271-9193

• J-Global ID

  202601017836403339

• Researcher number

  31041080

researchmap URL

• https://researchmap.jp/aoikudoh

Research

Papers

• Whole-genome sequencing reveals a possible molecular basis of sex determination in the dioecious wild yam Dioscorea tokoro

  Aoi Kudoh; Satoshi Natsume; Yu Sugihara; Hiroaki Kato; Akira Abe; Kaori Oikawa; Motoki Shimizu; Kazue Itoh; Mai Tsujimura; Yoshitaka Takano; Toshiyuki Sakai; Hiroaki Adachi; Atsushi Ohta; Mina Ohtsu; Takuma Ishizaki; Toru Terachi; Hideki Innan; Ryohei Terauchi

  PLOS Genetics, 20 Apr. 2026

  Access this paper :

  
• Reproductive Responses to Increased Shoot Density and Global Change Drivers in a Widespread Clonal Wetland Species, Schoenoplectus americanus

  Aoi Kudoh; J. Patrick Megonigal; J. Adam Langley; Genevieve L. Noyce; Toshiyuki Sakai; Dennis F. Whigham

  Estuaries and Coasts, Jan. 2024

  Access this paper :

  
• Human iPSC-derived renal collecting duct organoid model cystogenesis in ADPKD

  Shin-Ichi Mae; Fumihiko Hattanda; Hiroyoshi Morita; Aya Nozaki; Naoko Katagiri; Hanako Ogawa; Kaori Teranaka; Yu Nishimura; Aoi Kudoh; Sanae Yamanaka; Kyoko Matsuse; Makoto Ryosaka; Akira Watanabe; Tomoyoshi Soga; Saori Nishio; Kenji Osafune

  Cell Reports, Dec. 2023

  Access this paper :

  
• Genome Analysis Revives a Forgotten Hybrid Crop Edo-dokoro in the Genus Dioscorea

  Satoshi Natsume; Yu Sugihara; Aoi Kudoh; Kaori Oikawa; Motoki Shimizu; Yuko Ishikawa; Masahiro Nishihara; Akira Abe; Hideki Innan; Ryohei Terauchi

  Plant and Cell Physiology, 22 Nov. 2022

  Access this paper :

  
• Whole genome sequencing of a wild yam species Dioscorea tokoro reveals a genomic region associated with sex

  Satoshi Natsume; Hiroki Yaegashi; Yu Sugihara; Akira Abe; Motoki Shimizu; Kaori Oikawa; Benjamen White; Aoi Kudoh; Ryohei Terauchi

  BioRxiv, 13 Jun. 2022

  
• Characterization and role of collagen gene expressing hepatic cells following partial hepatectomy in mice

  Yusuke Kimura; Yukinori Koyama; Kojiro Taura; Aoi Kudoh; Kanae Echizen; Daichi Nakamura; Li Xuefeng; Nguyen Hai Nam; Yusuke Uemoto; Takahiro Nishio; Gen Yamamoto; Satoru Seo; Keiko Iwaisako; Akira Watanabe; Etsuro Hatano

  Hepatology, 23 May 2022

  
• Population Genomics of Yams: Evolution and Domestication of Dioscorea Species

  Yu Sugihara; Aoi Kudoh; Muluneh Tamiru Oli; Hiroki Takagi; Satoshi Natsume; Motoki Shimizu; Akira Abe; Robert Asiedu; Asrat Asfaw; Patrick Adebola; Ryohei Terauchi

  Population Genomics, 2021

  
• Detection of herbivory: eDNA detection from feeding marks on leaves

  Aoi Kudoh; Toshifumi Minamoto; Satoshi Yamamoto

  Environmental DNA, Oct. 2020

  Access this paper :

  

Misc.

• Discovery of new interests by young scientists, 4th

  Koichi Yamamori; Shoya Komura; Moeko Okada; Shumpei Hashimoto; Aoi Kudoh; Issei Nakazato; Yasuhiro Sato

  Breeding Research, Apr. 2026

  
• PREreview of "A new level of RNA-based plant protection - dsRNAs designed from functionally characterized siRNAs highly effective against Cucumber Mosaic Virus"

  Emma Turley; Yordan Dolaptchiev; Hyeon-Min Jeong; Aoi Kudoh

  PREreview, 01 Sep. 2024

  
• Discovery of new interests by young scientists ～What is the future of agricultural science～

  Akito Nashiki; Koichi Yamamori; Shoya Komura; Aoi Kudoh; Rieko Kuwada; Ami Takeuchi; Hiroaki Shimizu; Taiki Ogawa; Moeko Okada

  Breeding Research, 01 Jun. 2024

  

Presentations

• 雌雄異株植物オニドコロにおける性決定候補遺伝子の同定

  工藤葵; 杉原優; 阿部陽; 及川香梨; 夏目俊; 清水元樹; 伊藤和江; 辻村真衣; 寺地徹; 太田敦士; 寺内良平

  第73回日本生態学会大会, Mar. 2026

  
• 雌雄異株植物オニドコロにおける性決定候補遺伝子の同定

  工藤葵; 杉原優; 阿部陽; 及川香梨; 夏目俊; 清水元樹; 伊藤和江; 辻村真衣; 寺地徹; 太田敦士; 寺内良平

  第57回種生物学シンポジウム, Dec. 2025

  
• 主要作物ギニアヤムにおける性決定候補miRNAの特定

  工藤葵; 杉原優; 井関洸太朗; 松本亮; 美濃地弘樹; 小内清; 阿部陽; 夏目俊; 堺俊之; 及川香梨; 清水元樹; 伊藤和江; 安達広明; 本田晃大; 山中愼介; Patrick Adebola; Asrat Asfaw; 寺内良平

  第148回育種学会講演会, Sep. 2025

  
• 雌雄異株植物オニドコロにおける性決定ゲノム基盤

  工藤葵; 夏目俊; 杉原優; 加藤大明; 阿部陽; 及川香梨; 清水元樹; 伊藤和江; 辻村真衣; 寺地徹; 堺俊之; 太田敦士; 寺内良平

  第147回育種学会講演会, Mar. 2025

  
• 雌雄異株植物オニドコロにおける性決定候補遺伝子の同定

  工藤葵; 杉原優; 阿部陽; 及川香梨; 夏目俊; 清水元樹; 伊藤和江; 辻村真衣; 寺地徹; 太田敦士; 寺内良平

  学術変革領域「挑戦的両性花原理」若手の会, Oct. 2023

  
• 雌雄異株植物オニドコロにおける性決定候補遺伝子の同定

  工藤葵; 杉原優; 阿部陽; 及川香梨; 夏目俊; 清水元樹; 伊藤和江; 辻村真衣; 寺地徹; 太田敦士; 寺内良平

  第144回育種学会講演会, Sep. 2023

  
• 形態が異なるが種分類指標遺伝子には差異がないトコロミコガ2系統における全ゲノム解析

  工藤葵

  第82回レピゼミ, Apr. 2023

  
• 雌雄異株植物オニドコロにおける青色光応答で上を向くオス花序の送粉効率

  工藤葵; 杉原優; 太田敦士; 堺俊之; 寺内良平

  第70回日本生態学会大会, Mar. 2023

  
• 上向きのオスと下向きのメス：雌雄異株植物オニドコロのオス花序は青色光に応答して上を向く

  工藤葵; 杉原優; 太田敦士; 堺俊之; 寺内良平

  第54回種生物学シンポジウム, Nov. 2022

  
• 上向きのオスと下向きのメス：雌雄異株植物オニドコロのオス花序は青色光に応答する

  工藤葵; 杉原優; 太田敦士; 堺俊之; 寺内良平

  学術変革領域「挑戦的両性花原理」若手の会, Oct. 2022

  
• 上向きのオスと下向きのメス：雌雄異株植物オニドコロの花序角度と送粉効率・種子被食率の関係

  工藤葵; 杉原優; 太田敦士; 寺内良平

  日本植物分類学会第21回大会, Mar. 2022

  
• Upright male and pendente female: effects of pollinators and seed eater in inflorescence angle of Dioscorea tokoro

  工藤葵, 杉原優, 太田敦士, 寺内良平

  第69回日本生態学会大会, Mar. 2022

  
• 直立するオスと下垂するメス：雌雄異株植物オニドコロの花序角度に種子食者が及ぼす影響

  工藤葵; 杉原優; 太田敦士; 寺内良平

  第53回種生物学シンポジウム, Dec. 2021

  
• ヤマノイモ属オニドコロに誘引される送粉昆虫相

  工藤葵; 杉原優; 太田敦士; 寺内良平

  日本植物分類学会第20回大会, Mar. 2021

  
• 直立するオスと下垂するメス ―雌雄異株植物オニドコロにおける花形質と訪花数の雌雄差

  工藤葵; 杉原優; 太田敦士; 寺内良平

  第68回日本生態学会大会, Mar. 2021

  
• 雌雄異株植物オニドコロにおける昆虫誘因の雌雄差

  工藤葵; 杉原優; 太田敦士; 寺内良平

  第52回種生物学シンポジウム, Dec. 2020

  
• 雌雄異株植物オニドコロにおける訪花昆虫の特定と訪花数の雌雄差

  工藤葵; 杉原優; 太田敦士; 寺内良平

  第9回近畿植物学会講演会, Nov. 2020

  
• 塩性湿原に優占するカヤツリグサ科植物の種子繁殖における二酸化炭素・窒素への応答

  工藤葵; Megonigal JP; Langley JA; Whigham D.

  日本植物学会第84回大会, Sep. 2020

  
• 塩性湿原におけるカヤツリグサ科フトイ属植物の種子繁殖の制限要因

  工藤葵; Megonigal JP; Langley JA; Whigham D.

  第67回日本生態学会大会, Mar. 2020

  
• Seed production of a marsh plant, Schoenoplectus americanus; responses to change in density and differences in environmental factors

  Kudoh A.; Megonigal JP; Langley JA; Whigham D.

  Symposium of Integrative Biology: World Tour, Nov. 2019

  
• Detecting herbivore’s DNA from feeding marks

  Kudoh A.; Minamoto T.; Yamamoto S.

  Symposium of Integrative Biology: Biodiversity in Asia, Feb. 2019

  
• 植食性昆虫の食痕からの環境DNA検出

  工藤葵; 源利文; 山本哲史

  第1回環境DNA学会, Sep. 2018

  

Books and Other Publications

• 昆虫と自然 特集 環境DNAは昆虫調査に使えるか?

  Contributor, 食痕に残された昆虫の環境 DNA の検出

  東京 : ニューサイエンス社, Oct. 2022

  

External funds: Kakenhi

• 雌雄異株植物ヤマノイモ属における性決定システム転換過程の解明

  Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

  0703:Biology at organismal to population levels and anthropology, and related fields

  Kyoto University

  工藤 葵

  From 31 Jul. 2026, To 31 Mar. 2028, Adopted

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26K24937/

Education

Teaching subject(s)

• From 01 Apr. 2026, To 31 Mar. 2027

  Seminar in Origin of Cultivated Plants

  DF02, Spring, Graduate School of Agriculture, 1.5
• From 01 Apr. 2026, To 31 Mar. 2027

  Seminar in Origin of Cultivated Plants

  DF02, Fall, Graduate School of Agriculture, 1.5
• From 01 Apr. 2026, To 31 Mar. 2027

  Experiments on Evolution of Cultivated Plants

  DG02, Spring, Graduate School of Agriculture, 3
• From 01 Apr. 2026, To 31 Mar. 2027

  Experiments on Evolution of Cultivated Plants

  DG02, Fall, Graduate School of Agriculture, 3
• From 01 Apr. 2026, To 31 Mar. 2027

  Crop Evolutionary Genomics

  DA52, Fall, Graduate School of Agriculture, 2