Basic Information

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  minegishi.misa.2xkyoto-u.ac.jp

Academic Degree

• 26 Mar. 2019

  東京工業大学修士（工学）
• 26 Mar. 2022

  東京工業大学博士（工学）

Academic Resume (Undergraduate School/Majors)

• 東京工業大学, 生命理工学部生命工学科, 卒業

Research History

• From Mar. 2025, To Present

  Kyoto University, Institute for Life and Medical Sciences, Assistant professor
• From Apr. 2022, To Sep. 2023

  RIKEN, 開拓研究本部, 訪問研究員
• From Apr. 2024, To Feb. 2025

  Kyoto University, Institute for Life and Medical Sciences, Kyoto University, Program-Specific Assistant Professor
• From Oct. 2023, To Mar. 2024

  RIKEN, RIKEN Cluster for Pioneering Research, 学振特別研究員PD
• From Apr. 2022, To Sep. 2023

  Japan Society for the Promotion of Science, JSPS Research Fellowship for PD
• From Apr. 2020, To Mar. 2022

  Japan Society for the Promotion of Science, JSPS Research Fellowship for DC2

ID,URL

• ORCID ID

  0009-0009-1980-6593

• J-Global ID

  202201010632176852

• Researcher number

  30963011

• External link

  https://misa-minegishi.sakura.ne.jp/

researchmap URL

• https://researchmap.jp/m-minegishi

Research

Research Interests

• 細胞間相互作用
• 微小環境

Research Areas

• Life sciences, Tumor biology

Papers

• An open source for multiplexed, stable and transient flows to advance life science using microfluidic control automation

  Junichi Murai; Mahmoud Abdelmoez; Keisuke Kondo; Kohei Takamuro; Keiji Nozaki; Tim Schiller; Thomas Scheibel; Keiji Numata; Hisano Yajima; Kanako Terakado Kimura; Takao Hashiguchi; Taikopaul Kaneko; Misa Minegishi; Shintaku Hirofumi

  Lab on a Chip, Aug. 2025, Peer-reviewed

  Access this paper :

  
• 細胞間相互作用可視化光技術を使ったがん転移形成過程の1細胞オミクス解析

  峯岸 美紗; 門之園 哲哉; 近藤 科江; 口丸 高弘

  JSMI Report, Feb. 2022, Peer-reviewed, Lead author

  
• 超高感度生体発光イメージングによる骨転移過程の一個のがん細胞の非侵襲追跡

  口丸 高弘; 峯岸 美紗; 近藤 科江

  JSMI Report, May 2019

  
• Secretory GFP reconstitution labeling of neighboring cells interrogates cell–cell interactions in metastatic niches

  Misa Minegishi; Takahiro Kuchimaru; Kaori Nishikawa; Takayuki Isagawa; Satoshi Iwano; Kei Iida; Hiromasa Hara; Shizuka Miura; Marika Sato; Shigeaki Watanabe; Akifumi Shiomi; Yo Mabuchi; Hiroshi Hamana; Hiroyuki Kishi; Tatsuyuki Sato; Daigo Sawaki; Shigeru Sato; Yutaka Hanazono; Atsushi Suzuki; Takahide Kohro; Tetsuya Kadonosono; Tomomi Shimogori; Atsushi Miyawaki; Norihiko Takeda; Hirofumi Shintaku; Shinae Kizaka-Kondoh; Satoshi Nishimura

  Nature Communications, 05 Dec. 2023, Peer-reviewed, Lead author

  
• Antibody-guided design and identification of CD25-binding small antibody mimetics using mammalian cell surface display

  Kyra See; Tetsuya Kadonosono; Kotaro Miyamoto; Takuya Tsubaki; Yumi Ota; Marina Katsumi; Sumoe Ryo; Kazuki Aida; Misa Minegishi; Tatsuhiro Isozaki; Takahiro Kuchimaru; Shinae Kizaka-Kondoh

  Scientific Reports, 11 Nov. 2021, Peer-reviewed

  
• Multiplexed bioluminescence imaging of cancer cell response to hypoxia and inflammation in the caudal-artery injection model of bone metastasis during zoledronic acid treatment

  Misa Minegishi; Takahiro Kuchimaru; Kenji Nakagawa; Tatsuhiro Isozaki; Satoshi Fujimori; Tetsuya Kadonosono; Shinae Kizaka-Kondoh

  Journal of Cancer Metastasis and Treatment, 2021, Peer-reviewed, Lead author

  
• A reliable murine model of bone metastasis by injecting cancer cells through caudal arteries

  Takahiro Kuchimaru; Naoya Kataoka; Kenji Nakagawa; Tatsuhiro Isozaki; Hitomi Miyabara; Misa Minegishi; Tetsuya Kadonosono; Shinae Kizaka-Kondoh

  Nature Communications, 30 Jul. 2018, Peer-reviewed

  

Presentations

• 細胞牽引活動の大規模シーケンシング

  才田 隼輔; Abdelmoez Mahmoud; 峯岸 美紗; 西川 香里; 岩城 光宏; 一條 遼; 新宅 博文

  第78回日本細胞生物学会大会, 13 Jul. 2026

  
• 力学的拘束によるがん細胞の休眠と細胞死への運命分岐機構の解明

  野崎 佳司; 峯岸 美紗; 近藤 桂祐; Abdelmoez Mohamoud; 西川 香里; 新宅 博文

  第78回日本細胞生物学会大会, 14 Jul. 2026

  
• 1細胞メカノシーケンス

  新宅 博文; 塩見 晃史; 峯岸 美紗; 野崎 佳司; 金子 泰洸ポール

  第36回日本サイトメトリー学会学術集会, 06 Jun. 2026, Invited

  
• RasV12発現細胞の力学的排除機構

  北村 仁; 村井 潤一; 塩見 晃史; 峯岸 美紗; Abdelmoez Mahmoud; 金子 泰洸ポール; 新宅 博文

  日本機械学会学生会2025年学生員卒業研究発表講演会, 15 Mar. 2026

  
• 牽引力のシーケンシング

  才田 隼輔; Abdelmoez Mahmoud; 峯岸 美紗; 福永 裕樹; 岩城 光宏; 新宅 博文

  日本機械学会学生会2025年学生員卒業研究発表講演会, 15 Mar. 2026

  
• Mechano sequencing of single cells

  Hirofumi Shintaku; Akifumi Shiomi; Misa Minegishi; Keiji Nozaki; Junichi Murai; Taikopaul Kaneko

  Pacifichem 2025, 18 Dec. 2025, Invited

  
• 時空間遺伝子発現イメージング

  峯岸 美紗

  さきがけ「高次構造体」・ACT-X「生命と情報」合同公開シンポジウム 「若い知性が開拓する新しい生命科学」, 14 Feb. 2026

  
• Interaction-activated transcriptomics dissects molecular crosstalk in cancer cell–microenvironment

  Misa Minegishi; Keiji Nozaki; Keisuke Kondo; Kaori Nishikawa; Takahiro Kuchimaru; Hirofumi Shintaku

  第84回日本癌学会学術総会/国際がん研究集会in金沢, 27 Sep. 2025, Invited

  
• Nano-Electrokinetics Links Hidden Transcriptomic Dynamics to Stochastic Single-Cell Behavior

  新宅 博文; 塩見 晃史; 金子 泰洸ポール; 峯岸 美紗; 鳥井 孝太郎; 土田 新

  第63回 日本生物物理学会年会,, 26 Sep. 2025, Invited

  
• 生命科学実験自動化のための極微量流体制御装置の開発

  村井 潤一; アブデルモエズ マハムド; 金子 泰洸ポール; 峯岸 美紗; 新宅 博文

  日本機械学会 2025年度年次大会, 06 Sep. 2025

  
• Molecular mechanisms behind the induction to dormant state of cancer cells under mechanical microenvironment

  Misa Minegishi; Keiji Nozaki; Keisuke Kondo; Mahmoud N. Abdelmoez; Kaori Nishikawa; Hirofumi Shintaku

  Physics and Chemistry of Microfluidics Gordon Research Conference, 06 Jun. 2025

  
• Development of microfluidic sequence automation for spatio-tensional transcriptomics

  Junichi Murai; Mahmoud N. Abdelmoez; Akifumi Shiomi; Misa Minegishi; Taikopaul Kaneko; Hirofumi Shintaku

  Physics and Chemistry of Microfluidics Gordon Research Seminar, 31 May 2025

  
• 浸潤能が異なる乳がん細胞が示す力学的拘束に対する応答の多様性

  近藤 桂祐; 野崎 佳司; 峯岸 美紗; 新宅 博文

  日本機械学会関西支部 2024年度関西学生会卒業研究発表講演会, 18 Mar. 2025

  
• 時空間トランスクリプトミクスのための極微量流体制御装置の開発

  村井 潤一; 金子 泰洸ポール; 峯岸 美紗; 新宅 博文

  日本機械学会関西支部 2024年度関西学生会卒業研究発表講演会, 18 Mar. 2025

  
• 三次元がん微小環境下における1細胞の遺伝子発現と動態の統合解析

  峯岸 美紗; 新宅 博文

  第15回マイクロ・ナノ工学シンポジウム, 25 Nov. 2024, Invited

  
• 分泌・再構成型蛍光標識技術を用いたがん近傍組織細胞の詳細解析

  峯岸 美紗; 新宅 博文; 口丸 高弘

  第11回JCRベーシックリサーチカンファレンス, 15 Nov. 2024, Invited

  
• マイクロハイドロゲルの力学的制約により休眠誘導されたがん細胞の大規模解析

  野崎 佳司; 峯岸 美紗; 西川 香里; 新宅 博文

  日本機械学会 2024年度年次大会, 10 Sep. 2024

  
• A high-throughput analysis of cancer-cell dormancy under mechanical confinement with micro-hydrogel beads

  Misa Minegishi; Keiji Nozaki; Kaori Nishikawa; Hirofumi Shintaku

  21st IUPAB and 62nd BSJ JOINT CONGRESS 2024, 25 Jun. 2024, Invited

  
• 近接細胞蛍光標識技術を用いた転移微小環境内でがん細胞と周辺細胞相互作用の解析

  峯岸 美紗; 門之園 哲哉; 近藤 科江

  第28回 日本がん分子標的治療学会学術集会, 20 Jun. 2024

  
• Profiling proliferation phenotype of cancer cells under micro-mechanical confinement with cytometry and sequencing

  Keiji Nozaki; Misa Minegishi; Kaori Nishikawa; Hirofumi Shintaku

  International Symposium on Mechanical Control of Biological Self-organization, 17 Jun. 2024

  
• 力学的制約によるがん細胞の状態遷移を大規模に測定する実験系の構築

  峯岸 美紗

  第5回 日本結合組織学会若手セミナー, 14 Jun. 2024

  
• A large-scale analysis of dormant cancer cells under mechanical confinement by micro-hydrogel

  Keiji Nozaki; Misa Minegishi; Kaori Nishikawa; Hirofumi Shintaku

  Serendipity Symposium 2024, 12 Mar. 2024

  
• がん細胞の休眠-増殖状態遷移の大規模スクリーニングを実現する実験系の構築

  峯岸 美紗

  第7回 転移シグナル若手研究会, 18 Nov. 2023

  
• Microgels for a large-scale screening and longitudinal observations of cancer cell dormancy

  Misa Minegishi; Hirofumi Shintaku

  The 27th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences (µTAS 2023), 16 Oct. 2023

  
• 近接細胞光標識による転移ニッチの細胞間相互作用解析

  峯岸 美紗

  第45回 日本分子生物学会年会, 30 Nov. 2022, Invited

  
• 近接細胞蛍光標識技術による乳がん細胞と相互作用した肝細胞の解析

  峯岸 美紗

  第6回 乳がん・転移若手研究会, 21 Nov. 2022

  
• 近接細胞蛍光標識技術を用いたがん細胞と相互作用した細胞の1細胞トランスクリプトーム解析

  峯岸 美紗; 西川 香里; 新宅 博文; 口丸 高弘

  シングルセルゲノミクス研究会2022FES, 30 Aug. 2022

  
• Combining optical labeling system with single-cell RNA-seq for characterizing metastatic niche cells

  Misa Minegishi; Shinae Kizaka-Kondoh; Hirofumi Shintaku; Takahiro Kuchimaru

  Serendipity Workshop 2022, 14 May 2022

  

Books and Other Publications

• 微小電気穿孔法による細胞の力学特性と遺伝子発現の統合解析

  塩見 晃史; 北村 仁; 村井 潤一; 金子 泰洸ポール; 峯岸 美紗; 新宅 博文, Contributor, 第58巻第4号(2026)，pp. 30-32 (278-280)

  （株）ニュー・サイエンス社, Apr. 2026

  

Awards

• 17 Dec. 2024

  JST-CREST 多細胞 若手の会 2024, JST-CREST 「多細胞」, YORC発表賞

  峯岸 美紗
• 16 Dec. 2024

  日本機械学会マイクロ・ナノ工学部門, 若手優秀講演表彰

  第15回マイクロ・ナノ工学シンポジウム

  峯岸 美紗
• 12 Oct. 2024

  The Poster Award

  The 19th International Symposium of the Institute Network for Biomedical Sciences, International society

  Misa Minegishi
• 27 Jun. 2024

  日本生物物理学会, 若手招待講演賞

  Japan society

  峯岸 美紗
• 12 Mar. 2024

  理化学研究所, 桜舞賞（研究奨励賞）

  International academic award

  峯岸 美紗
• 14 May 2022

  Best Poster Award

  Serendipity Workshop, International society

  Misa Minegishi
• 30 Jul. 2021

  優秀ポスター賞

  第30回 日本がん転移学会学術集会, Japan society

  峯岸 美紗
• 27 May 2021

  優秀発表賞

  日本分子イメージング学会 第15回 学術集会, Japan society

  峯岸 美紗
• 03 Nov. 2017

  Taiwan- Japan Joint Meeting on Bioimaging for Young Researchers, Poster Award

  Taiwan, Province of China, International society

  Misa Minegishi
• 03 Mar. 2017

  東京工業大学生体分子コース卒業論文発表会, 優秀発表賞

  Others

  峯岸 美紗
• 27 Mar. 2017

  東京工業大学, 平成28年度東京工業大学優秀学生賞

  Others
• 01 Mar. 2017

  東京工業大学生命理工学院, 高宮賞

  峯岸 美紗

External funds: Kakenhi

• 微小細胞外基質を用いた細胞動態と遺伝子発現の統合解析による再発転移機構の解明

  Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

  Basic Section 50010:Tumor biology-related

  Kyoto University

  峯岸 美紗

  From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2027, Granted

  転移微小環境;休眠;再発;転移;力学的拘束;休眠がん細胞;転移ニッチ

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24K18529/
• 遠隔臓器での乳がん細胞の休眠維持と再発転移を誘発する遺伝子発現制御機構の解明

  Grant-in-Aid for JSPS Fellows

  Basic Section 50010:Tumor biology-related

  Kyoto University;Institute of Physical and Chemical Research

  峯岸 美紗

  From 08 Mar. 2023, To 31 Mar. 2025, Project Closed

  再発転移;休眠がん;休眠がん細胞;周辺微小環境;遺伝子発現解析

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ3140/
• ハイドロゲルビーズを用いたヘテロ力学環境とがん細胞状態の大規模探索

  Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)

  Medium-sized Section 28:Nano/micro science and related fields

  Kyoto University

  新宅 博文

  From 27 Jun. 2025, To 31 Mar. 2029, Granted

  がん微小環境;マイクロ流体工学;休眠;RNA-sequencing;遺伝子発現

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25K21702/

External funds: others

• がん細胞増殖を促進する動的細胞相互作用機構の解明

  生命と情報

  国立研究開発法人科学技術振興機構, ACT-X

  From 01 Oct. 2024, To 31 Mar. 2027

  峯岸 美紗
• がん細胞の近接細胞を蛍光標識する新規技術を用いた骨転移ニッチの解明

  日本学術振興会, 特別研究員奨励費（DC2）

  From 01 Apr. 2020, To 31 Mar. 2022

  峯岸 美紗

Education

Teaching subject(s)

• From 01 Apr. 2026, To 31 Mar. 2027

  Mechanical and System Engineering Laboratory 1

  5056, Spring, Faculty of Engineering, 1
• From 01 Apr. 2026, To 31 Mar. 2027

  Mechanical and System Engineering Laboratory 1

  5056, Fall, Faculty of Engineering, 1
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  特別研究２

  Fall
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  特別研究１

  Spring
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Global Frontier in Life Science A

  1018, Spring, Graduate School of Biostudies, 2

Student achievements: Awards

• 日本機械学会若手優秀講演フェロー賞

  野﨑 佳司, 日本機械学会, 16 Dec. 2024
• Next Gen Scientist

  Ileana Sofia Cabrera Blanco, Technológico de Monterrey, 12 Mar. 2026

Student achievements: Presentations

• Dissecting molecular mechanisms behind cancer cell dormancy induced by mechanical confinement using MECH-seq

  Keiji Nozaki, Misa Minegishi, Keisuke Kondo, Mahmoud N. Abdelmoez, Kaori Nishikawa, Hirofumi Shintaku

  Physics and Chemistry of Microfluidics Gordon Research Seminar, 31 May 2025, From 31 May 2025, To 01 Jun. 2025, Not invited, English, Poster presentation
• Development of microfluidic sequence automation for spatio-tensional transcriptomics

  Junichi Murai, Mahmoud N. Abdelmoez, Akifumi Shiomi, Misa Minegishi, Taikopaul Kaneko, Hirofumi Shintaku

  Physics and Chemistry of Microfluidics Gordon Research Seminar, 31 May 2025, From 31 May 2025, To 01 Jun. 2025, Not invited, English, Oral presentation
• Development of microfluidic sequence automation for spatio-tensional transcriptomics

  Junichi Murai, Mahmoud N. Abdelmoez, Akifumi Shiomi, Misa Minegishi, Taikopaul Kaneko, Hirofumi Shintaku

  Physics and Chemistry of Microfluidics Gordon Research Conference, 05 Jun. 2025, From 01 Jun. 2025, To 07 Jun. 2025, English, Poster presentation
• A large-scale analysis of dormant cancer cells under mechanical confinement by micro-hydrogel

  Keiji Nozaki, Misa Minegishi, Kaori Nishikawa, Hirofumi Shintaku

  Serendipity Symposium 2024, From 10 Mar. 2024, To 13 Mar. 2024, Not invited, English, Poster presentation
• Profiling proliferation phenotype of cancer cells under micro-mechanical confinement with cytometery and sequencing

  Keiji Nozaki, Misa Minegishi, Kaori Nishikawa, Hirofumi Shintaku

  International Symposium on Mechanical Control of Biological Self-organization, 17 Jan. 2024, From 17 Jan. 2024, To 18 Jan. 2024, Not invited, English, Poster presentation
• Molecular mechanisms behind the dormant state of cancer cells in a mechanical microenvironment

  Keiji Nozaki, Misa Minegishi, Mahmoud N. Abdelmoez, Kaori Nishikawa, Hirofumi Shintaku

  Global Young Scientist Summit 2025, From 06 Jan. 2025, To 10 Jan. 2025, English, Poster presentation
• マイクロハイドロゲルの力学的制約により休眠誘導されたがん細胞の大規模解析

  野崎 佳司, 峯岸 美紗, 西川 香里, 新宅 博文

  日本機械学会 2024年度年次大会, 10 Sep. 2024, From 08 Sep. 2024, To 11 Sep. 2024, Not invited, Oral presentation
• 時空間トランスクリプトミクスのための極微量流体制御装置の開発

  村井 潤一，金子 泰洸ポール，峯岸 美紗，新宅 博文

  日本機械学会関西支部 2024年度関西学生会卒業研究発表講演会, 18 Mar. 2025, From 18 Mar. 2025, To 18 Mar. 2025, Oral presentation
• 浸潤能が異なる乳がん細胞が示す力学的拘束に対する応答の多様性

  近藤 桂祐，野崎 佳司，峯岸 美紗，新宅 博文

  日本機械学会関西支部 2024年度関西学生会卒業研究発表講演会, 18 Mar. 2025, From 18 Mar. 2025, To 18 Mar. 2025, Oral presentation
• 生命科学実験自動化のための極微量流体制御装置の開発

  村井 潤一, アブデルモエズ マハムド, 金子 泰洸ポール，峯岸 美紗，新宅 博文

  日本機械学会 2025年度年次大会, 06 Sep. 2025, From 06 Sep. 2025, To 06 Sep. 2025, Not invited, Japanese, Oral presentation
• 力学的拘束環境はがん細胞に休眠状態を誘導する

  野崎 佳司, 峯岸 美紗, 近藤 桂祐, アブデルモエズ マハムド, 西川 香里, 新宅 博文

  第16回マイクロ・ナノ工学シンポジウム, 13 Nov. 2025, From 13 Nov. 2025, To 13 Nov. 2025, Not invited, Japanese, Oral presentation
• 牽引力のシーケンシング

  才田 隼輔，Abdelmoez Mahmoud，峯岸 美紗，福永 裕樹，岩城 光宏，新宅 博文

  日本機械学会学生会2025年学生員卒業研究発表講演会, 15 Mar. 2026, From 15 Mar. 2026, To 15 Mar. 2026, Not invited, Japanese, Oral presentation
• RasV12発現細胞の力学的排除機構

  北村 仁，村井 潤一，塩見 晃史，峯岸 美紗，Abdelmoez Mahmoud，金子 泰洸ポール，新宅 博文

  日本機械学会学生会2025年学生員卒業研究発表講演会, 15 Mar. 2026, From 15 Mar. 2026, To 15 Mar. 2026, Not invited, Japanese, Oral presentation

Administration

Faculty management (title, position)

• From 01 Apr. 2024

  共同利用機器等委員会
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  令和7年度医生物学研究所教員会議運営委員

Academic, Social Contribution

Committee Memberships

• From Apr. 2025, To Present

  共通利用機器等委員, 京都大学 医生物学研究所
• From Apr. 2025, To Mar. 2026

  令和7年度教員会議運営委員会, 京都大学 医生物学研究所

Social Contribution

• 博士課程での経験とその後

  Lecturer

  東京理科大学 野田キャンパス 学生博士会, 2023年度 第1回 博士会イベント「現在の博士の話」 ~博士号取得後に活躍している社会人の"生の声"~, From 31 Oct. 2023

  
• 研究者を志して過ごした10年間と研究を仕事とする人生について

  Panelist

  共立女子中学・高等学校, From 17 Nov. 2022