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後藤 佑樹

ゴトウ ユウキ

理学研究科 化学専攻生物化学講座 教授

後藤 佑樹
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    Last Updated :2025/05/01

    基本情報

    学部兼担

    • 理学部

    全学メールアドレス

    • 全学メールアドレス

      goto.yuki.4xkyoto-u.ac.jp

    学位

    • 2008年03月25日
      東京大学博士(工学)
    • 2005年03月23日
      京都大学修士(工学)

    出身学校・専攻等

    • 京都大学, 工学部工業化学科, 卒業

    経歴

    • 自 2024年01月, 至 現在
      京都大学, 大学院理学研究科 化学専攻, 教授
    • 自 2016年10月, 至 2023年12月
      東京大学, 大学院理学系研究科化学専攻, 准教授
    • 自 2010年04月, 至 2016年09月
      東京大学大学院理学系研究科, 助教
    • 自 2011年12月, 至 2015年03月
      国立研究開発法人 科学技術振興機構, さきがけ研究 「細胞機能の構成的な理解と制御」, 研究者
    • 自 2009年10月, 至 2010年03月
      東京大学先端科学技術研究センター, 助教
    • 自 2008年04月, 至 2009年09月
      日本学術振興会, 海外特別研究員
    • 自 2008年04月, 至 2009年09月
      イリノイ大学アーバナ・シャンペーン校, 博士研究員
    • 自 2006年04月, 至 2008年03月
      日本学術振興会, 特別研究員

    ID,URL

    関連Webサイト

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      Last Updated :2025/05/01

      研究

      研究キーワード

      • 試験管内分子選択
      • 擬天然物
      • 試験管内生合成系
      • 非天然アミノ酸
      • 遺伝暗号のリプログラミング
      • ペプチド
      • 翻訳合成
      • ペプチドライブラリー
      • リボザイム

      研究分野

      • ライフサイエンス, 応用生物化学
      • ライフサイエンス, 生物有機化学
      • ナノテク・材料, 生体化学

      論文

      • Oxidation-guided and collision-induced linearization assists de novo sequencing of thioether macrocyclic peptides
        Ayaka Hayashi; Yuki Goto; Yutaro Saito; Hiroaki Suga; Jumpei Morimoto; Shinsuke Sando
        Chemical Communications, 2024年
      • De Novo Discovery of Pseudo‐Natural Prenylated Macrocyclic Peptide Ligands
        Sumika Inoue; Dinh Thanh Nguyen; Keisuke Hamada; Rika Okuma; Chikako Okada; Masahiro Okada; Ikuro Abe; Toru Sengoku; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Angewandte Chemie International Edition, 2024年06月05日
      • A Compact Reprogrammed Genetic Code for De Novo Discovery of Proteolytically Stable Thiopeptides.
        Alexander A Vinogradov; Yue Zhang; Keisuke Hamada; Shunsuke Kobayashi; Kazuhiro Ogata; Toru Sengoku; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Journal of the American Chemical Society, 2024年03月27日
      • Switching Prenyl Donor Specificities of Cyanobactin Prenyltransferases
        Yuchen Zhang; Keisuke Hamada; Masayuki Satake; Toru Sengoku; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Journal of the American Chemical Society, 2023年10月25日
      • Reactivity and mechanism in chemical and synthetic biology
        Nigel G. J. Richards; Stephen L. Bearne; Yuki Goto; Emily J. Parker
        Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 2023年01月11日
      • Label-free quantification of passive membrane permeability of cyclic peptides across lipid bilayers: penetration speed of cyclosporin A across lipid bilayers
        Takahiro Ono; Kazuhito V. Tabata; Yuki Goto; Yutaro Saito; Hiroaki Suga; Hiroyuki Noji; Jumpei Morimoto; Shinsuke Sando
        Chemical Science, 2023年
      • Discovery, biochemical characterization, and bioengineering of cyanobactin prenyltransferases
        Yuchen Zhang; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Trends in Biochemical Sciences, 2022年12月
      • Post-translational backbone-acyl shift yields natural product-like peptides bearing hydroxyhydrocarbon units.
        Tomohiro Kuroda; Yichao Huang; Soichiro Nishio; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Nature chemistry, 2022年11月03日
      • Solid-Phase-Based Synthesis of Lactazole-Like Thiopeptides
        Yue Zhang; Alexander A. Vinogradov; Jun Shi Chang; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Organic Letters, 2022年10月25日
      • De Novo Discovery of Thiopeptide Pseudo-natural Products Acting as Potent and Selective TNIK Kinase Inhibitors
        Alexander A. Vinogradov; Yue Zhang; Keisuke Hamada; Jun Shi Chang; Chikako Okada; Hirotaka Nishimura; Naohiro Terasaka; Yuki Goto; Kazuhiro Ogata; Toru Sengoku; Hiroyasu Onaka; Hiroaki Suga
        Journal of the American Chemical Society, 2022年10月25日, 査読有り
      • LimF is a versatile prenyltransferase for histidine-C-geranylation on diverse non-natural substrates
        Yuchen Zhang; Keisuke Hamada; Dinh Thanh Nguyen; Sumika Inoue; Masayuki Satake; Shunsuke Kobayashi; Chikako Okada; Kazuhiro Ogata; Masahiro Okada; Toru Sengoku; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Nature Catalysis, 2022年08月15日
      • Accurate Models of Substrate Preferences of Post-Translational Modification Enzymes from a Combination of mRNA Display and Deep Learning
        Alexander A. Vinogradov; Jun Shi Chang; Hiroyasu Onaka; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        ACS Central Science, 2022年05月26日
      • Discovery and Development of Cyclic Peptide Inhibitors of CIB1
        Victoria A. Haberman; Steven R. Fleming; Tina M. Leisner; Ana C. Puhl; Emerald Feng; Ling Xie; Xian Chen; Yuki Goto; Hiroaki Suga; Leslie V. Parise; Dmitri Kireev; Kenneth H. Pearce; Albert A. Bowers
        ACS Medicinal Chemistry Letters, 2021年10月27日
      • In Vitro Selection of Thioether-Closed Macrocyclic Peptide Ligands by Means of the RaPID System
        Takayuki Katoh; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Methods in Molecular Biology, 2021年10月02日
      • The RaPID Platform for the Discovery of Pseudo-Natural Macrocyclic Peptides.
        Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Accounts of chemical research, 2021年09月21日
      • Site-Specific Nonenzymatic Peptide S/O-Glutamylation Reveals the Extent of Substrate Promiscuity in Glutamate Elimination Domains.
        Alexander A Vinogradov; Masanobu Nagano; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Journal of the American Chemical Society, 2021年08月25日
      • Posttranslational chemical installation of azoles into translated peptides.
        Haruka Tsutsumi; Tomohiro Kuroda; Hiroyuki Kimura; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Nature communications, 2021年01月29日
      • New developments in RiPP discovery, enzymology and engineering.
        Manuel Montalbán-López; Thomas A Scott; Sangeetha Ramesh; Imran R Rahman; Auke J van Heel; Jakob H Viel; Vahe Bandarian; Elke Dittmann; Olga Genilloud; Yuki Goto; María José Grande Burgos; Colin Hill; Seokhee Kim; Jesko Koehnke; John A Latham; A James Link; Beatriz Martínez; Satish K Nair; Yvain Nicolet; Sylvie Rebuffat; Hans-Georg Sahl; Dipti Sareen; Eric W Schmidt; Lutz Schmitt; Konstantin Severinov; Roderich D Süssmuth; Andrew W Truman; Huan Wang; Jing-Ke Weng; Gilles P van Wezel; Qi Zhang; Jin Zhong; Jörn Piel; Douglas A Mitchell; Oscar P Kuipers; Wilfred A van der Donk
        Natural product reports, 2021年01月01日, 査読有り
      • Human trans-editing enzyme displays tRNA acceptor-stem specificity and relaxed amino acid selectivity.
        Oscar Vargas-Rodriguez; Marina Bakhtina; Daniel McGowan; Jawad Abid; Yuki Goto; Hiroaki Suga; Karin Musier-Forsyth
        The Journal of biological chemistry, 2020年11月27日
      • Accurate Broadcasting of Substrate Fitness for Lactazole Biosynthetic Pathway from Reactivity-Profiling mRNA Display.
        Alexander A Vinogradov; Emiko Nagai; Jun Shi Chang; Kakeru Narumi; Hiroyasu Onaka; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Journal of the American Chemical Society, 2020年11月19日
      • A Macrocyclic Peptide Library with a Structurally Constrained Cyclopropane-containing Building Block Leads to Thiol-independent Inhibitors of Phosphoglycerate Mutase.
        Rika Okuma; Tomoki Kuwahara; Takafumi Yoshikane; Mizuki Watanabe; Patricia Dranchak; James Inglese; Satoshi Shuto; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Chemistry, an Asian journal, 2020年09月01日, 査読有り
      • Promiscuous Enzymes Cooperate at the Substrate Level En Route to Lactazole A.
        Alexander A Vinogradov; Morito Shimomura; Naokazu Kano; Yuki Goto; Hiroyasu Onaka; Hiroaki Suga
        Journal of the American Chemical Society, 2020年08月12日, 査読有り
      • Minimal lactazole scaffold for in vitro thiopeptide bioengineering.
        Alexander A Vinogradov; Morito Shimomura; Yuki Goto; Taro Ozaki; Shumpei Asamizu; Yoshinori Sugai; Hiroaki Suga; Hiroyasu Onaka
        Nature communications, 2020年05月08日, 査読有り
      • Improved Stability of siRNA-Loaded Lipid Nanoparticles Prepared with a PEG-Monoacyl Fatty Acid Facilitates Ligand-Mediated siRNA Delivery.
        Yu Sakurai; Wataru Mizumura; Kenichiro Ito; Kazuhiro Iwasaki; Takayuki Katoh; Yuki Goto; Hiroaki Suga; Hideyoshi Harashima
        Molecular pharmaceutics, 2020年04月06日, 査読有り
      • Exploring the Post-translational Enzymology of PaaA by mRNA Display.
        Steven R Fleming; Paul M Himes; Swapnil V Ghodge; Yuki Goto; Hiroaki Suga; Albert A Bowers
        Journal of the American Chemical Society, 2020年03月18日, 査読有り
      • In Vitro Biosynthesis of Peptides Containing Exotic Azoline Analogues.
        Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Chembiochem : a European journal of chemical biology, 2020年01月15日, 査読有り
      • Chemoenzymatic Posttranslational Modification Reactions for the Synthesis of Ψ[CH2 NH]-Containing Peptides.
        Yasuharu Kato; Tomohiro Kuroda; Yichao Huang; Risa Ohta; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Angewandte Chemie (International ed. in English), 2020年01月07日, 査読有り
      • Ribosomal Formation of Thioamide Bonds in Polypeptide Synthesis.
        Rumit Maini; Hiroyuki Kimura; Ryo Takatsuji; Takayuki Katoh; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Journal of the American Chemical Society, 2019年12月26日, 査読有り
      • Generation of non-standard macrocyclic peptides specifically binding TSC-22 homologous gene-1.
        Sophie T PhuongDung Tran; Christopher J Hipolito; Hiroyuki Suzuki; Rudy Xie; Huynh Dam Kim Tuyen; Peter Ten Dijke; Naohiro Terasaka; Yuki Goto; Hiroaki Suga; Mitsuyasu Kato
        Biochemical and biophysical research communications, 2019年08月20日, 査読有り
      • Meeting Peptides in Kyoto.
        Shiroh Futaki; Katsumi Matsuzaki; Yuki Goto
        Chembiochem : a European journal of chemical biology, 2019年08月16日, 査読有り
      • Ribosomal Synthesis of Backbone-Cyclic Peptides Compatible with In Vitro Display.
        Ryo Takatsuji; Koki Shinbara; Takayuki Katoh; Yuki Goto; Toby Passioura; Ryo Yajima; Yamato Komatsu; Hiroaki Suga
        Journal of the American Chemical Society, 2019年02月13日, 査読有り
      • Flexizyme-Enabled Benchtop Biosynthesis of Thiopeptides.
        Steven R Fleming; Tessa E Bartges; Alexander A Vinogradov; Christine L Kirkpatrick; Yuki Goto; Hiroaki Suga; Leslie M Hicks; Albert A Bowers
        Journal of the American Chemical Society, 2019年01月16日, 査読有り
      • Engineering of RiPP pathways for the production of artificial peptides bearing various non-proteinogenic structures.
        Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Current opinion in chemical biology, 2018年10月, 査読有り
      • Artificial &ITIn Vitro&IT Biosynthesis Systems for the Development of Pseudo-Natural Products
        Yuki Goto; Hiroaki Suga
        BULLETIN OF THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN, 2018年03月, 査読有り
      • Non-competitive cyclic peptides for targeting enzyme-substrate complexes
        T. E. McAllister; T. L. Yeh; M. I. Abboud; I. K.H. Leung; E. S. Hookway; O. N.F. King; B. Bhushan; S. T. Williams; R. J. Hopkinson; M. Münzel; N. D. Loik; R. Chowdhury; U. Oppermann; T. D.W. Claridge; Y. Goto; H. Suga; C. J. Schofield; A. Kawamura
        Chemical Science, 2018年, 査読有り
      • Quality control by trans-editing factor prevents global mistranslation of non-protein amino acid α-aminobutyrate.
        Jo Marie Bacusmo; Alexandra B Kuzmishin; William A Cantara; Yuki Goto; Hiroaki Suga; Karin Musier-Forsyth
        RNA biology, 2018年, 査読有り
      • Artificial Division of Codon Boxes for Expansion of the Amino Acid Repertoire of Ribosomal Polypeptide Synthesis.
        Yoshihiko Iwane; Takayuki Katoh; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2018年, 査読有り
      • Conformational and chemical selection by a trans-acting editing domain (vol 114, pg E6774, 2017)
        Eric M. Danhart; Marina Bakhtina; William A. Cantara; Alexandra B. Kuzmishin; Xiao Ma; Brianne L. Sanford; Oscar Vargas-Rodriguez; Marija Kosutic; Yuki Goto; Hiroaki Suga; Kotaro Nakanishi; Ronald Micura; Mark P. Foster; Karin Musier-Forsyth
        PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2017年11月
      • Efficient siRNA Delivery by Lipid Nanoparticles Modified with a Nonstandard Macrocyclic Peptide for EpCAM-Targeting.
        Yu Sakurai; Wataru Mizumura; Manami Murata; Tomoya Hada; Shoshiro Yamamoto; Kenichiro Ito; Kazuhiro Iwasaki; Takayuki Katoh; Yuki Goto; Asako Takagi; Michinori Kohara; Hiroaki Suga; Hideyoshi Harashima
        Molecular pharmaceutics, 2017年10月02日, 査読有り
      • Conformational and chemical selection by a trans-acting editing domain.
        Eric M Danhart; Marina Bakhtina; William A Cantara; Alexandra B Kuzmishin; Xiao Ma; Brianne L Sanford; Oscar Vargas-Rodriguez; Marija Košutić; Yuki Goto; Hiroaki Suga; Kotaro Nakanishi; Ronald Micura; Mark P Foster; Karin Musier-Forsyth
        Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2017年08月15日, 査読有り
      • Highly selective inhibition of histone demethylases by de novo macrocyclic peptides.
        Akane Kawamura; Martin Münzel; Tatsuya Kojima; Clarence Yapp; Bhaskar Bhushan; Yuki Goto; Anthony Tumber; Takayuki Katoh; Oliver N F King; Toby Passioura; Louise J Walport; Stephanie B Hatch; Sarah Madden; Susanne Müller; Paul E Brennan; Rasheduzzaman Chowdhury; Richard J Hopkinson; Hiroaki Suga; Christopher J Schofield
        Nature communications, 2017年04月06日, 査読有り
      • Dissection of goadsporin biosynthesis by in vitro reconstitution leading to designer analogues expressed in vivo.
        Taro Ozaki; Kona Yamashita; Yuki Goto; Morito Shimomura; Shohei Hayashi; Shumpei Asamizu; Yoshinori Sugai; Haruo Ikeda; Hiroaki Suga; Hiroyasu Onaka
        Nature communications, 2017年02月06日, 査読有り
      • Characterization of the stereochemical configuration of lanthionines formed by the lanthipeptide synthetase GeoM.
        Neha Garg; Yuki Goto; Ting Chen; Wilfred A van der Donk
        Biopolymers, 2016年11月, 査読有り
      • A Post-translational Cyclodehydratase, PatD, Tolerates Sequence Variation in the C-terminal Region of Substrate Peptides
        Yuki Goto; Hiroaki Suga
        CHEMISTRY LETTERS, 2016年11月, 査読有り
      • Expanding the amino acid repertoire of ribosomal polypeptide synthesis via the artificial division of codon boxes.
        Yoshihiko Iwane; Azusa Hitomi; Hiroshi Murakami; Takayuki Katoh; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Nature chemistry, 2016年04月, 査読有り
      • Ribosomal Synthesis of Peptides with Multiple β-Amino Acids.
        Fujino T; Goto Y; Suga H; Murakami H
        Journal of the American Chemical Society, 2016年02月17日, 査読有り
      • A Fluorescent Imaging Probe Based on a Macrocyclic Scaffold That Binds to Cellular EpCAM.
        Kazuhiro Iwasaki; Yuki Goto; Takayuki Katoh; Taro Yamashita; Shuichi Kaneko; Hiroaki Suga
        Journal of molecular evolution, 2015年12月, 査読有り
      • Selection-based discovery of macrocyclic peptides for the next generation therapeutics.
        Tomomi Morioka; Nikita D Loik; Christopher J Hipolito; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Current opinion in chemical biology, 2015年06月, 査読有り
      • Homologous trans-editing factors with broad tRNA specificity prevent mistranslation caused by serine/threonine misactivation.
        Ziwei Liu; Oscar Vargas-Rodriguez; Yuki Goto; Eva Maria Novoa; Lluís Ribas de Pouplana; Hiroaki Suga; Karin Musier-Forsyth
        Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015年05月12日, 査読有り
      • Ancestral AlaX editing enzymes for control of genetic code fidelity are not tRNA-specific.
        Eva Maria Novoa; Oscar Vargas-Rodriguez; Stefanie Lange; Yuki Goto; Hiroaki Suga; Karin Musier-Forsyth; Lluís Ribas de Pouplana
        The Journal of biological chemistry, 2015年04月17日, 査読有り
      • Recent developments of engineered translational machineries for the incorporation of non-canonical amino acids into polypeptides.
        Naohiro Terasaka; Yoshihiko Iwane; Anna-Skrollan Geiermann; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        International journal of molecular sciences, 2015年03月20日, 査読有り
      • Investigating the role of a backbone to substrate hydrogen bond in OMP decarboxylase using a site-specific amide to ester substitution.
        Bijoy J Desai; Yuki Goto; Alessandro Cembran; Alexander A Fedorov; Steven C Almo; Jiali Gao; Hiroaki Suga; John A Gerlt
        Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2014年10月21日, 査読有り
      • One-pot synthesis of azoline-containing peptides in a cell-free translation system integrated with a posttranslational cyclodehydratase.
        Yuki Goto; Yumi Ito; Yasuharu Kato; Shotaro Tsunoda; Hiroaki Suga
        Chemistry & biology, 2014年06月19日, 査読有り
      • Distinct tRNA recognition strategies used by a homologous family of editing domains prevent mistranslation.
        Mom Das; Oscar Vargas-Rodriguez; Yuki Goto; Hiroaki Suga; Karin Musier-Forsyth
        Nucleic acids research, 2014年04月, 査読有り
      • Structural basis for potent inhibition of SIRT2 deacetylase by a macrocyclic peptide inducing dynamic structural change.
        Kenichiro Yamagata; Yuki Goto; Hiroshi Nishimasu; Jumpei Morimoto; Ryuichiro Ishitani; Naoshi Dohmae; Norihiko Takeda; Ryozo Nagai; Issei Komuro; Hiroaki Suga; Osamu Nureki
        Structure (London, England : 1993), 2014年02月04日, 査読有り
      • Selection-based discovery of druglike macrocyclic peptides.
        Toby Passioura; Takayuki Katoh; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Annual review of biochemistry, 2014年, 査読有り
      • Nonstandard peptide expression under the genetic code consisting of reprogrammed dual sense codons.
        Yuki Goto; Megumi Iseki; Azusa Hitomi; Hiroshi Murakami; Hiroaki Suga
        ACS chemical biology, 2013年12月20日, 査読有り
      • Reevaluation of the D-amino acid compatibility with the elongation event in translation.
        Tomoshige Fujino; Yuki Goto; Hiroaki Suga; Hiroshi Murakami
        Journal of the American Chemical Society, 2013年02月06日, 査読有り
      • Selective thioether macrocyclization of peptides having the N-terminal 2-chloroacetyl group and competing two or three cysteine residues in translation.
        Kazuhiro Iwasaki; Yuki Goto; Takayuki Katoh; Hiroaki Suga
        Organic & biomolecular chemistry, 2012年08月14日, 査読有り
      • Lantibiotics from Geobacillus thermodenitrificans.
        Neha Garg; Weixin Tang; Yuki Goto; Satish K Nair; Wilfred A van der Donk
        Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2012年04月03日, 査読有り
      • Charging of tRNAs using ribozymes and selection of cyclic peptides containing thioethers.
        Patrick C Reid; Yuki Goto; Takayuki Katoh; Hiroaki Suga
        Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2012年, 査読有り
      • Flexizymes as a tRNA acylation tool facilitating genetic code reprogramming.
        Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2012年, 査読有り
      • Selective thioether macrocyclization of peptides having the N-terminal 2-chloroacetyl group and competing two or three cysteine residues in translation (vol 10, pg 5783, 2012)
        Kazuhiro Iwasaki; Yuki Goto; Takayuki Katoh; Hiroaki Suga
        ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY, 2012年
      • Natural product-like macrocyclic N-methyl-peptide inhibitors against a ubiquitin ligase uncovered from a ribosome-expressed de novo library.
        Yusuke Yamagishi; Ikuo Shoji; Shoji Miyagawa; Takashi Kawakami; Takayuki Katoh; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Chemistry & biology, 2011年12月23日, 査読有り
      • Ribosomal synthesis of backbone macrocyclic peptides.
        Takayuki Katoh; Yuki Goto; Md Shamim Reza; Hiroaki Suga
        Chemical communications (Cambridge, England), 2011年09月28日, 査読有り
      • Flexizymes for genetic code reprogramming.
        Yuki Goto; Takayuki Katoh; Hiroaki Suga
        Nature protocols, 2011年06月, 査読有り
      • Ribosomal synthesis of backbone-macrocyclic peptides containing γ-amino acids.
        Ohshiro Y; Nakajima E; Goto Y; Fuse S; Takahashi T; Doi T; Suga H
        Chembiochem : a European journal of chemical biology, 2011年05月16日, 査読有り
      • Preparation of materials for flexizyme reactions and genetic code reprogramming
        Yuki Goto; Yuki Goto; Takayuki Katoh; Hiroaki Suga
        Protocol Exchange, 2011年05月12日
      • Mechanistic studies of Ser/Thr dehydration catalyzed by a member of the LanL lanthionine synthetase family.
        Yuki Goto; Ayşe Okesli; Wilfred A van der Donk
        Biochemistry, 2011年02月08日, 査読有り
      • Ribosome evolution for two artificial amino acids in E. coli.
        Gosuke Hayashi; Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Chemistry & biology, 2010年04月23日, 査読有り
      • Discovery of unique lanthionine synthetases reveals new mechanistic and evolutionary insights.
        Yuki Goto; Bo Li; Jan Claesen; Yanxiang Shi; Mervyn J Bibb; Wilfred A van der Donk
        PLoS biology, 2010年03月23日, 査読有り
      • Ribosomal synthesis of dehydrobutyrine- and methyllanthionine-containing peptides.
        Yuki Goto; Kazuhiro Iwasaki; Kohei Torikai; Hiroshi Murakami; Hiroaki Suga
        Chemical communications (Cambridge, England), 2009年06月21日, 査読有り
      • Ribosomal synthesis of cyclic peptides with a fluorogenic oxidative coupling reaction.
        Yusuke Yamagishi; Hiroshi Ashigai; Yuki Goto; Hiroshi Murakami; Hiroaki Suga
        Chembiochem : a European journal of chemical biology, 2009年06月15日, 査読有り
      • Ribosomal synthesis of peptides with C-terminal lactams, thiolactones, and alkylamides.
        Eiji Nakajima; Yuki Goto; Yusuke Sako; Hiroshi Murakami; Hiroaki Suga
        Chembiochem : a European journal of chemical biology, 2009年05月04日, 査読有り
      • Translation initiation with initiator tRNA charged with exotic peptides.
        Yuki Goto; Hiroaki Suga
        Journal of the American Chemical Society, 2009年04月15日, 査読有り
      • Initiating translation with D-amino acids.
        Yuki Goto; Hiroshi Murakami; Hiroaki Suga
        RNA (New York, N.Y.), 2008年07月, 査読有り
      • Ribosomal synthesis of peptidase-resistant peptides closed by a nonreducible inter-side-chain bond.
        Yusuke Sako; Yuki Goto; Hiroshi Murakami; Hiroaki Suga
        ACS chemical biology, 2008年04月18日, 査読有り
      • Ligand-stabilized hairpin structures interfere with elongation of human telomere.
        Masaki Hagihara; Yuki Goto; Kazuhiko Nakatani
        Chembiochem : a European journal of chemical biology, 2008年03月03日, 査読有り
      • Reprogramming the translation initiation for the synthesis of physiologically stable cyclic peptides.
        Yuki Goto; Atsushi Ohta; Yusuke Sako; Yusuke Yamagishi; Hiroshi Murakami; Hiroaki Suga
        ACS chemical biology, 2008年02月15日, 査読有り
      • 6 特殊骨格含有ペプチドの翻訳合成(口頭発表の部)
        後藤 佑樹; 村上 裕; 菅 裕明
        天然有機化合物討論会講演要旨集, 2007年08月24日
      • Analysis of mismatched DNA by mismatch binding ligand (MBL)-Sepharose affinity chromatography.
        Yuki Goto; Hitoshi Suda; Akio Kobori; Kazuhiko Nakatani
        Analytical and bioanalytical chemistry, 2007年07月, 査読有り
      • Small-molecule binding to the nonquadruplex form of the human telomeric sequence.
        Yuki Goto; Shinya Hagihara; Masaki Hagihara; Kazuhiko Nakatani
        Chembiochem : a European journal of chemical biology, 2007年05月07日, 査読有り
      • Evaluation of mismatch-binding ligands as inhibitors for Rev-RRE interaction.
        Kazuhiko Nakatani; Souta Horie; Yuki Goto; Akio Kobori; Shinya Hagihara
        Bioorganic & medicinal chemistry, 2006年08月01日, 査読有り
      • Flexizyme as a versatile tRNA acylation catalyst and the application for translation.
        Hiroshi Murakami; Atushi Ohta; Yuki Goto; Yusuke Sako; Hiroaki Suga
        Nucleic acids symposium series (2004), 2006年
      • Translation initiation by using various N-acylaminoacyl tRNAs.
        Yuki Goto; Hiroshi Ashigai; Yusuke Sako; Hiroshi Murakami; Hiroaki Suga
        Nucleic acids symposium series (2004), 2006年
      • Small-molecule ligand induces nucleotide flipping in (CAG)n trinucleotide repeats.
        Kazuhiko Nakatani; Shinya Hagihara; Yuki Goto; Akio Kobori; Masaki Hagihara; Gosuke Hayashi; Motoki Kyo; Makoto Nomura; Masaki Mishima; Chojiro Kojima
        Nature chemical biology, 2005年06月, 査読有り
      • A new ligand binding to G-G mismatch having improved thermal and alkaline stability.
        Tao Peng; Takashi Murase; Yuki Goto; Akio Kobori; Kazuhiko Nakatani
        Bioorganic & medicinal chemistry letters, 2005年01月17日, 査読有り
      • 2P137 CGG/CGG配列を含むDNAと認識薬剤のNMR立体構造解析(核酸 A) 構造・物性))
        野村 誠; 萩原 伸也; 後藤 佑樹; 中谷 和彦; 児嶋 長次郎
        生物物理, 2005年
      • NMR structural analysis of the G.G mismatch DNA complexed with naphthyridine-dimer.
        Makoto Nomura; Shinya Hagihara; Yuki Goto; Kazuhiko Nakatani; Chojiro Kojima
        Nucleic acids symposium series (2004), 2005年
      • Solution structure of a small-molecular ligand complexed with CAG trinucleotide repeat DNA.
        Kazuhiko Nakatani; Shinya Hagihara; Yuki Goto; Akio Kobori; Masaki Hagihara; Gosuke Hayashi; Motoki Kyo; Makoto Nomura; Masaki Mishima; Chojiro Kojima
        Nucleic acids symposium series (2004), 2005年
      • The binding of guanine-guanine mismatched DNA to naphthyridine dimer immobilized sensor surfaces: kinetic aspects.
        Kazuhiko Nakatani; Akio Kobori; Hiroyuki Kumasawa; Yuki Goto; Isao Saito
        Bioorganic & medicinal chemistry, 2004年06月15日, 査読有り
      • Detection of guanine-adenine mismatches by surface plasmon resonance sensor carrying naphthyridine-azaquinolone hybrid on the surface.
        Shinya Hagihara; Hiroyuki Kumasawa; Yuki Goto; Gosuke Hayashi; Akio Kobori; Isao Saito; Kazuhiko Nakatani
        Nucleic acids research, 2004年, 査読有り
      • Separation of mismatched DNA by using the affinity column immobilizing mismatch-binding ligands.
        Yuki Goto; Akio Kobori; Hitoshi Suda; Kazuhiko Nakatani
        Nucleic acids symposium series (2004), 2004年
      • The binding of naphthyridine tetramer to guanine-rich sequences.
        Yuki Goto; Shinya Hagihara; Akio Kobori; Kazuhiko Nakatani; Isao Saito
        Nucleic acids research. Supplement (2001), 2003年

      MISC

      • De novo RiPPs創薬を志向した非天然チオペプチド発酵生産系の確立
        伊地知新太; 永井栄美子; 浅水俊平; VINOGRADOV Alexander A.; 後藤佑樹; 菅裕明; 尾仲宏康
        日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2024年
      • RiPP創薬を志向する非天然環状ペプチドの発酵生産
        伊地知新太; 永井栄美子; 星野翔太郎; 浅水俊平; VINOGRADOV Alexander A.; 後藤佑樹; 後藤佑樹; 菅裕明; 尾仲宏康
        日本生物工学会大会講演要旨集, 2024年
      • シクロプロパン骨格を有する大環状ペプチドライブラリーの構築及び応用
        大熊里佳; 桑原智希; 渡邉瑞貴; 周東智; 後藤佑樹; 菅裕明
        日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM), 2020年
      • 新規labionen構造の形成に関与するlanthipeptide合成酵素の解析
        菅井佳宣; 江畑一真; 浅水俊平; 後藤佑樹; 菅裕明; 尾仲宏康
        日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2018年
      • In vitro再構成系を用いたゴードスポリン生合成酵素の解析と合理的な類縁体設計
        尾崎太郎; 尾崎太郎; 菅井佳宣; 浅水俊平; 尾仲宏康; 後藤佑樹; 菅裕明; 池田治生
        Institute for Fermentation, Osaka. Research Communications, 2018年
      • 新規ラビオネン構造の形成に関与するランチペプチド合成酵素の解析
        菅井佳宣; 菅井佳宣; 尾崎太郎; 尾崎太郎; 浅水俊平; 尾仲宏康; 菅裕明; 後藤佑樹
        Institute for Fermentation, Osaka. Research Communications, 2018年
      • [Elaboration of Pseudo-natural Products Using Artificial In Vitro Biosynthesis Systems].
        Yuki Goto
        Yakugaku zasshi : Journal of the Pharmaceutical Society of Japan, 2018年, 査読有り
      • 試験管内完全合成系によるゴードスポリン生合成経路の解析とデザイナーアナログ創製
        尾仲宏康; 尾崎太郎; 山下湖奈; 後藤佑樹; 下村杜人; 林昌平; 浅水俊平; 菅井佳宣; 菅裕明
        日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2017年
      • 多様なリボゾーム翻訳後修飾ペプチド(RiPPs)の試験管内生合成
        尾崎太郎; 後藤佑樹; 尾仲宏康
        バイオサイエンスとインダストリー, 2017年
      • D体アミノ酸の翻訳伸長反応への適合性
        藤野 公茂; 後藤 佑樹; 菅 裕明; 村上 裕
        Chemical biology = ケミカルバイオロジー, 2016年06月
      • 無細胞翻訳後系を利用したゴードスポリン生合成経路の再構成と新奇アナログの創製
        尾崎太郎; 山下湖奈; 下村杜人; 後藤佑樹; 菅井佳宣; 浅水俊平; 菅裕明; 尾仲宏康
        日本放線菌学会大会講演要旨集, 2016年
      • 無細胞翻訳系を用いたラクタゾールの試験管内再構成系の確立
        下村杜人; 尾崎太郎; 菅井佳宣; 浅水俊平; 山下湖奈; 後藤佑樹; 菅裕明; 尾仲宏康
        日本放線菌学会大会講演要旨集, 2016年
      • ゴードスポリンの酵素的全合成
        山下湖奈; 尾崎太郎; 浅水俊平; 後藤佑樹; 菅裕明; 尾仲宏康
        日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2016年
      • Streptomyces sp.TP-A0584株由来ゴードスポリン生合成のin vitro再構成
        山下湖奈; 尾崎太郎; 浅水俊平; 後藤佑樹; 菅裕明; 尾仲宏康
        日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2015年
      • Streptomyces sp.TP-A0584由来ゴードスポリン生合成の試験管内再構成系の確立
        山下湖奈; 尾崎太郎; 浅水俊平; 後藤佑樹; 菅裕明; 尾仲宏康
        日本放線菌学会大会講演要旨集, 2015年
      • In vitro selection of macrocyclic peptides against human aminoacyl-tRNA synthetase complex-interacting protein -1 (AIMP-1)
        SONG Xiao; KIM Kibom; KATOH Takayuki; GOTO Yuki; KIM Sunghoon; SUGA Hiroaki
        Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium, 2013年03月01日
      • In Vitro Selection of Cyclic Peptides Closed by an Oxidative Coupling Reaction
        MURAKAMI Naohisa; GOTO Yuki; YAMAGISHI Yusuke; KATOH Takayuki; BOZZA William; YANG Kun; ZHUANG Zhihao; SUGA Hiroaki
        Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium, 2013年03月01日
      • New strategies for genetic code reprogramming ; dual genetic code and artificial division of codon boxes
        GOTO Yuki; HITOMI Azusa; MURAKAMI Hiroshi; SUGA Hiroaki
        Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium, 2011年03月01日
      • Discovery of Cyclic Peptides Binding to a Cyclophilin Powered by the RaPID System
        ITO Risa; GOTO Yuki; SUGA Hiroaki
        Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium, 2011年03月01日
      • Ribosomal Synthesis of γ-Amino Acid-Containing Cyclic Peptides
        OHSHIRO Yukinori; NAKAJIMA Eiji; GOTO Yuki; KAWAKAMI Takashi; OHTA Atsushi; SUGA Hiroaki
        Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium, 2011年03月01日
      • ペプチド医薬品開発の新基盤技術「RaPIDシステム」 (特集 次世代ケミカルバイオロジーの新展開)
        下舞 大; 後藤 佑樹; 菅 裕明
        化学工業, 2011年02月
      • Ribosomal Synthesis of Cyclic Peptides Composed of non-Proteinogenic Amino Acids
        SAKO Yusuke; GOTO Yuki; MURAKAMI Hiroshi; SUGA Hiroaki
        Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium, 2008年03月01日
      • A Novel Method for Modification and Cyclization of Peptides Using an Oxidative Coupling Reaction
        YAMAGISHI Yusuke; ASHIGAI Hiroshi; GOTO Yuki; MURAKAMI Hiroshi; SUGA Hiroaki
        Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium, 2008年03月01日
      • Ribosomal Synthesis of Peptides Containing Various Unusual Structures and Its Application to the Synthesis of Cyclic Peptides
        GOTO Yuki; MURAKAMI Hiroshi; SUGA Hiroaki
        Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium, 2008年03月01日
      • Ribosomal Synthesis of Peptides Having Various Acyl Groups on the N-Terminus
        GOTO Yuki; ASHIGAI Hiroshi; SAKO Yusuke; MURAKAMI Hiroshi; SUGA Hiroaki
        Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium, 2007年03月01日
      • Ribosomal Synthesis of Non-Natural Peptide Using the Flexizyme System
        MURAKAMI Hiroshi; OHTA Atsushi; GOTO Yuki; SAKO Yusuke; SUGA Hiroaki
        Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium, 2007年03月01日

      受賞

      • 2024年11月25日
        Certificate presented to Distinguished Lecturer(一般財団法人 国際有機化学財団)
      • 2024年11月25日
        Outstanding Lecturer at the 7th Yoshida Prize Symposium(一般財団法人 国際有機化学財団)
      • 2024年11月25日
        Outstanding Lecturer at the 7th Yoshida Prize Symposium(一般財団法人 国際有機化学財団)
      • 2024年12月17日
        大隅ライフサイエンス研究会奨励賞
      • 2013年09月28日
        生体機能関連化学部会講演賞(日本化学会・生体機能関連化学部会)
      • 2017年03月17日
        日本化学会第66回進歩賞
      • 2013年04月16日
        平成25年度科学技術分野の文部科学大臣表彰若手科学者賞(文部科学省)
      • 2023年06月02日
        第24回酵素応用研究奨励賞(天野エンザイム科学技術振興財団)
      • 2010年02月04日
        井上研究奨励賞(井上科学振興財団)
      • 2008年03月25日
        東京大学大学院工学系研究科研究科長賞(研究)
      • 2017年10月11日
        第1回バイオインダストリー奨励賞
      • 2016年10月27日
        日本ぺプチド学会奨励賞

      外部資金:科学研究費補助金

      • 天然物生合成酵素の流用によるタンパク質の脂質ラベル法の開発
        基盤研究(B)
        小区分37020:生物分子化学関連
        京都大学
        後藤 佑樹
        自 2024年04月01日, 至 2027年03月31日, 交付
        プレニル化;タンパク質ラベル化;タンパク質局在;機械学習
      • 天然物未踏ケミカルスペースを開拓するペプチドライブラリーの構築と探索
        学術変革領域研究(A)
        学術変革領域研究区分(Ⅱ)
        京都大学
        後藤 佑樹
        自 2024年04月01日, 至 2026年03月31日, 交付
        ペプチド;擬天然物;プレニル化;生物活性分子
      • 試験管内リボソーム進化工学によるリボソーム触媒活性の改変
        基盤研究(B)
        小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連
        大阪大学
        青木 航
        自 2023年04月01日, 至 2026年03月31日, 交付
        人工リボソーム
      • ペプチド修飾酵素の基質配列の深層学習による人工グリコシル化ペプチドの創製
        学術変革領域研究(A)
        学術変革領域研究区分(Ⅱ)
        京都大学;東京大学
        後藤 佑樹
        自 2023年04月01日, 至 2025年03月31日, 交付
        グリコシル化;人工ペプチド;ペプチド修飾酵素;深層学習
      • 試験管内リボソーム進化工学によるリボソーム触媒活性の改変
        基盤研究(B)
        小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連
        大阪大学
        青木 航
        自 2023年04月01日, 至 2026年03月31日, 交付
        人工リボソーム
      • 細胞内標的プレニル化ペプチド薬剤の創製原理の確立
        基盤研究(B)
        小区分37020:生物分子化学関連
        東京大学
        後藤 佑樹
        自 2020年04月01日, 至 2024年03月31日, 交付
        中分子ペプチド;プレニル化ペプチド;擬天然物;生物活性分子
      • 天然物の閉環様式を活用した膜透過キメラペプチドの開発
        挑戦的研究(萌芽)
        中区分37:生体分子化学およびその関連分野
        東京大学
        後藤 佑樹
        自 2019年06月28日, 至 2022年03月31日, 完了
        ペプチド;RiPP;擬天然物;チオペプチド
      • 高分子間相互作用を制御する合成機能分子を論理的・効率的に創出する方法論の確立
        基盤研究(A)
        中区分47:薬学およびその関連分野
        北海道大学
        周東 智
        自 2019年04月01日, 至 2023年03月31日, 完了
        シクロプロパン;三次元多様性;タンパク質間相互作用;ペプチドミメティクス;環状ペプチド;膜透過性ペプチド;ホールダマー;αヘリックス;高分子間相互作用
      • 特定の立体構造を有する生物活性中分子の汎用創製手法の確立
        新学術領域研究(研究領域提案型)
        東京大学
        後藤 佑樹
        自 2018年04月01日, 至 2020年03月31日, 完了
        ペプチド;中分子;環状ペプチド;阻害剤
      • ポリケチド類似化合物の翻訳合成による新規生物活性分子の創製
        若手研究(A)
        東京大学
        後藤 佑樹
        自 2017年04月01日, 至 2020年03月31日, 完了
        翻訳合成;ポリケチド;ペプチド;擬天然物;生合成
      • 試験管内人工生合成系を活用した擬天然物合成生物学
        新学術領域研究(研究領域提案型)
        理工系
        東京大学
        菅 裕明
        自 2016年06月30日, 至 2021年03月31日, 中途終了
        試験管内リデザイン整合性系;主鎖修飾型ペプチド;人工生合成系;擬天然物;試験管内リデザイン生合成系
      • 共有結合を介して標的を阻害する高選択性中分子阻害剤の汎用創製手法の確立
        新学術領域研究(研究領域提案型)
        理工系
        東京大学
        後藤 佑樹
        自 2016年04月01日, 至 2018年03月31日, 完了
        ペプチド;中分子;阻害剤;共有結合形成;in vitro selection;あ
      • 人工天然物の創製
        挑戦的萌芽研究
        東京大学
        後藤 佑樹
        自 2015年04月01日, 至 2018年03月31日, 完了
        ペプチド;主鎖修飾ペプチド;人工生合成系;翻訳後修飾;化学修飾
      • 超小型人工ペプチダーゼドメインの創成
        挑戦的萌芽研究
        東京大学
        後藤 佑樹
        自 2012年04月01日, 至 2014年03月31日, 完了
        ペプチド;人工酵素;試験管内分子進化
      • 二重遺伝暗号と分割遺伝暗号を用いた人工翻訳システムの創成
        若手研究(B)
        東京大学
        後藤 佑樹
        自 2010年04月01日, 至 2012年03月31日, 完了
        遺伝暗号のリプログラミング;翻訳合成;ペプチド;ペプチドライブラリー;リボザイム;非天然アミノ酸
      • ペプチド修飾酵素の流用と拡張による含窒素芳香環のプレニル化触媒の開発
        挑戦的研究(萌芽)
        中区分33:有機化学およびその関連分野
        東京大学
        後藤 佑樹
        自 2024年06月28日, 至 2026年03月31日, 採択
      • ペプチド修飾酵素の流用と拡張による含窒素芳香環のプレニル化触媒の開発
        挑戦的研究(萌芽)
        中区分33:有機化学およびその関連分野
        京都大学
        後藤 佑樹
        自 2024年06月28日, 至 2026年03月31日, 交付
        生体触媒;プレニル化
      list
        Last Updated :2025/05/01

        教育

        担当科目

        • 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日
          生物化学ゼミナールIA
          7088, 前期, 理学研究科, 1
        • 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日
          生物化学ゼミナールID
          7091, 後期, 理学研究科, 1
        • 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日
          生物化学ゼミナールIC
          7090, 前期, 理学研究科, 1
        • 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日
          生物化学ゼミナールIB
          7089, 後期, 理学研究科, 1
        • 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日
          生物化学演習IA
          7192, 前期, 理学研究科, 1
        • 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日
          生物化学演習ID
          7195, 後期, 理学研究科, 1
        • 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日
          生物化学演習IC
          7194, 前期, 理学研究科, 1
        • 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日
          生物化学演習IB
          7193, 後期, 理学研究科, 1
        • 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日
          化学課題研究16
          5643, 通年集中, 理学部, 12
        • 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日
          生物化学IV
          4614, 前期, 理学部, 2
        • 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日
          生物化学演習
          3628, 後期, 理学部, 2
        • 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日
          生物化学II
          8601, 前期, 理学部, 2
        • 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日
          生体分子機能論
          7031, 後期, 理学研究科, 2
        • 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日
          ケミカルバイオロジー概論
          7001, 前期, 理学研究科, 2

        非常勤講師

        • 自 2024年04月01日, 至 2024年09月30日
          名古屋市立大学, 大学院薬学研究科

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