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中曽根 祐介

ナカソネ ユウスケ

理学研究科 化学専攻物性化学講座 助教

中曽根 祐介
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    Last Updated :2022/05/13

    基本情報

    学部兼担

    • 理学部

    学位

    • 修士(理学)(京都大学)
    • 博士(理学)(京都大学)

    ID,URL

    researchmap URL

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      Last Updated :2022/05/13

      研究

      研究テーマ・研究概要

      • 研究テーマ

        高速混合と過渡回折格子法を組み合わせた新規測定法の開発

      論文

      • Dynamics of the Amino-Terminal and Carboxyl-Terminal Helices of Arabidopsis Phototropin 1 LOV2 Studied by the Transient Grating
        Kimitoshi Takeda; Yusuke Nakasone; Kazunori Zikihara; Satoru Tokutomi; Masahide Terazima
        JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, 2013年12月, 査読有り
      • Photochemistry of Arabidopsis phototropin 1 LOV1: Transient tetramerization
        Yusuke Nakasone; Kazunori Zikihara; Satoru Tokutomi; Masahide Terazima
        Photochemical and Photobiological Sciences, 2013年, 査読有り
      • Modeling the functioning of YtvA in the general stress response in Bacillus subtilis
        Jeroen B. van der Steen; Yusuke Nakasone; Johnny Hendriks; Klaas J. Hellingwerf
        MOLECULAR BIOSYSTEMS, 2013年, 査読有り
      • Time-Resolved Tracking of Interprotein Signal Transduction: Synechocystis PixD-PixE Complex as a Sensor of Light Intensity
        Keisuke Tanaka; Yusuke Nakasone; Koji Okajima; Masahiko Ikeuchi; Satoru Tokutomi; Masahide Terazima
        JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2012年05月, 査読有り
      • Light-Induced Conformational Change and Transient Dissociation Reaction of the BLUF Photoreceptor Synechocystis PixD (Slr1694)
        Keisuke Tanaka; Yusuke Nakasone; Koji Okajima; Masahiko Ikeuchi; Satoru Tokutomi; Masahide Terazima
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, 2011年06月, 査読有り
      • On the Binding of BODIPY-GTP by the Photosensory Protein YtvA from the Common Soil Bacterium Bacillus subtilis
        Yusuke Nakasone; Klaas J. Hellingwerf
        PHOTOCHEMISTRY AND PHOTOBIOLOGY, 2011年05月, 査読有り
      • A way to sense light intensity: Multiple-excitation of the BLUF photoreceptor TePixD suppresses conformational change
        Keisuke Tanaka; Yusuke Nakasone; Koji Okajima; Masahiko Ikeuchi; Satoru Tokutomi; Masahide Terazima
        FEBS LETTERS, 2011年03月, 査読有り
      • Kinetics of Conformational Changes of the FKF1-LOV Domain upon Photoexcitation
        Yusuke Nakasone; Kazunori Zikihara; Satoru Tokutomi; Masahide Terazima
        BIOPHYSICAL JOURNAL, 2010年12月, 査読有り
      • When Is the Helix Conformation Restored after the Reverse Reaction of Phototropin?
        Yuki Kawaguchi; Yusuke Nakasone; Kazunori Zikihara; Satoru Tokutomi; Masahide Terazima
        JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2010年07月, 査読有り
      • When Is the Helix Conformation Restored after the Reverse Reaction of Phototropin?
        Yuki Kawaguchi; Yusuke Nakasone; Kazunori Zikihara; Satoru Tokutomi; Masahide Terazima
        JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2010年07月, 査読有り
      • Temperature-Sensitive Reaction of a Photosensor Protein YcgF: Possibility of a Role of Temperature Sensor
        Yusuke Nakasone; Taka-aki Ono; Asako Ishii; Shinji Masuda; Masahide Terazima
        BIOCHEMISTRY, 2010年03月, 査読有り
      • Oligomeric-State-Dependent Conformational Change of the BLUF Protein TePixD (Tll0078)
        Keisuke Tanaka; Yusuke Nakasone; Koji Okajima; Masahiko Ikeuchi; Satoru Tokutomi; Masahide Terazima
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, 2009年03月, 査読有り
      • Stability of Dimer and Domain-Domain Interaction of Arabidopsis Phototropin 1 LOV2
        Yusuke Nakasone; Takeshi Eitoku; Kazunori Zikihara; Daisuke Matsuoka; Satoru Tokutomi; Masahide Terazima
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, 2008年11月, 査読有り
      • Photochemical intermediates of Arabidopsis phototropin 2 LOV domains associated with conformational changes
        Takeshi Eitoku; Yusuke Nakasone; Kazunori Zikihara; Daisuke Matsuoka; Satoru Tokutomi; Masahide Terazima
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, 2007年08月, 査読有り
      • Transient dimerization and conformational change of a BLUF protein: YcgF
        Yusuke Nakasone; Taka-aki Ono; Asako Ishii; Shinji Masuda; Masahide Terazima
        JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2007年06月, 査読有り
      • Dynamics of conformational changes of Arabidopsis phototropin 1 LOV2 with the linker domain
        Yusuke Nakasone; Takeshi Eitoku; Daisuke Matsuoka; Satoru Tokutomi; Masahide Terazima
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, 2007年03月, 査読有り
      • Kinetic measurement of transient dimerization and dissociation reactions of Arabidopsis phototropin 1 LOV2 domain
        Yusuke Nakasone; Takeshi Eitoku; Daisuke Matsuoka; Satoru Tokutomi; Masahide Terazima
        Biophysical Journal, 2006年, 査読有り
      • Conformational dynamics of phototropin 2 LOV2 domain with the linker upon photoexcitation
        T Eitoku; Y Nakasone; D Matsuoka; S Tokutomi; M Terazima
        JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2005年09月, 査読有り

      受賞

      • 2013年04月18日
        日本化学会, 優秀講演賞(学術)

      外部資金:科学研究費補助金

      • 夾雑微小空間におけるタンパク質の動的挙動-揺らぎ・反応・局在化と機能-
        新学術領域研究(研究領域提案型)
        理工系
        京都大学
        中曽根 祐介
        自 2020年04月01日, 至 2022年03月31日, 交付
        揺らぎ;反応ダイナミクス;閉じ込め効果;混み合い効果;相分離;微小空間;光センサー;過渡回折格子法
      • 分子夾雑系におけるタンパク質の動的挙動-揺らぎと反応ダイナミクス-
        新学術領域研究(研究領域提案型)
        京都大学
        中曽根 祐介
        自 2018年04月01日, 至 2020年03月31日, 完了
        分子夾雑効果;光反応;混み合い効果;揺らぎ;反応速度;酵素活性;ダイナミクス;生体分子反応;過渡回折格子法;時間分解熱力学;クラウディング;光活性化型アデニル酸シクラーゼ;反応ダイナミクス;光センサー
      • 複雑な分子間反応の連鎖を光操作で解き明かすーアポトーシス機構の分子論的理解ー
        若手研究(A)
        京都大学
        中曽根 祐介
        自 2017年04月01日, 至 2021年03月31日, 完了
        細胞死;光操作;分子間反応;過渡回折格子法;LOVドメイン;Caspase8;反応ダイナミクス;アポトーシス;光制御;Caspase;光センサー;光遺伝学;光解離反応;光センサータンパク質;分子ダイナミクス
      • 新規拡散係数測定装置の開発および生体分子反応ダイナミクスへの応用
        挑戦的萌芽研究
        京都大学
        中曽根 祐介
        自 2015年04月01日, 至 2018年03月31日, 完了
        拡散係数;過渡回折格子法;タンパク質反応;時間分解;ストップトフロー;反応ダイナミクス;タンパク質;拡散係数測定;過渡回折光子法;過渡吸収;分子間反応;高速混合
      • 光受容体フォトトロピンの光情報認識からキナーゼ活性化に至る分子機構の解明
        若手研究(B)
        京都大学
        中曽根 祐介
        自 2013年04月01日, 至 2015年03月31日, 完了
        phototropin;LOVドメイン;過渡回折格子法;蛋白質反応;光センサータンパク質;光センサー蛋白質
      • 枯草菌の光ストレス応答に迫る~光センサー蛋白質YtvAの反応分子機構の解明
        研究活動スタート支援
        京都大学
        中曽根 祐介
        自 2011年08月24日, 至 2013年03月31日, 完了
        YtvA;LOV;光ストレス応答;枯草菌;光反応;過渡回折格子法;STAS;国際情報交換オランダ;LOVドメイン;ストレス応答;光センサー蛋白質;過渡回析格子法
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        Last Updated :2022/05/13

        教育

        担当科目

        • 自 2014年04月, 至 2015年03月
          化学課題研究7
          通年, 理学部
        • 自 2014年04月, 至 2015年03月
          物性化学ゼミナールIA
          前期, 理学研究科
        • 自 2014年04月, 至 2015年03月
          物性化学ゼミナールIB
          後期, 理学研究科
        • 自 2014年04月, 至 2015年03月
          物性化学ゼミナールIC
          前期, 理学研究科
        • 自 2014年04月, 至 2015年03月
          物性化学ゼミナールID
          後期, 理学研究科
        • 自 2014年04月, 至 2015年03月
          物性化学演習IA
          前期, 理学研究科
        • 自 2014年04月, 至 2015年03月
          物性化学演習IB
          後期, 理学研究科
        • 自 2014年04月, 至 2015年03月
          物性化学演習IC
          前期, 理学研究科
        • 自 2014年04月, 至 2015年03月
          物性化学演習ID
          後期, 理学研究科
        • 自 2015年04月, 至 2016年03月
          化学課題研究7
          通年, 理学部
        • 自 2015年04月, 至 2016年03月
          物性化学ゼミナールIA
          前期, 理学研究科
        • 自 2015年04月, 至 2016年03月
          物性化学ゼミナールIB
          後期, 理学研究科
        • 自 2015年04月, 至 2016年03月
          物性化学ゼミナールIC
          前期, 理学研究科
        • 自 2015年04月, 至 2016年03月
          物性化学ゼミナールID
          後期, 理学研究科
        • 自 2015年04月, 至 2016年03月
          物性化学演習IA
          前期, 理学研究科
        • 自 2015年04月, 至 2016年03月
          物性化学演習IB
          後期, 理学研究科
        • 自 2015年04月, 至 2016年03月
          物性化学演習IC
          前期, 理学研究科
        • 自 2015年04月, 至 2016年03月
          物性化学演習ID
          後期, 理学研究科
        • 自 2016年04月, 至 2017年03月
          化学課題研究7
          通年, 理学部
        • 自 2016年04月, 至 2017年03月
          物性化学ゼミナールIA
          前期, 理学研究科
        • 自 2016年04月, 至 2017年03月
          物性化学ゼミナールIB
          後期, 理学研究科
        • 自 2016年04月, 至 2017年03月
          物性化学ゼミナールIC
          前期, 理学研究科
        • 自 2016年04月, 至 2017年03月
          物性化学ゼミナールID
          後期, 理学研究科
        • 自 2016年04月, 至 2017年03月
          物性化学演習IA
          前期, 理学研究科
        • 自 2016年04月, 至 2017年03月
          物性化学演習IB
          後期, 理学研究科
        • 自 2016年04月, 至 2017年03月
          物性化学演習IC
          前期, 理学研究科
        • 自 2016年04月, 至 2017年03月
          物性化学演習ID
          後期, 理学研究科
        • 自 2017年04月, 至 2018年03月
          化学課題研究7
          通年, 理学部
        • 自 2017年04月, 至 2018年03月
          基礎化学実験
          後期, 全学共通科目
        • 自 2017年04月, 至 2018年03月
          物性化学ゼミナールIA
          前期, 理学研究科
        • 自 2017年04月, 至 2018年03月
          物性化学ゼミナールIB
          後期, 理学研究科
        • 自 2017年04月, 至 2018年03月
          物性化学ゼミナールIC
          前期, 理学研究科
        • 自 2017年04月, 至 2018年03月
          物性化学ゼミナールID
          後期, 理学研究科
        • 自 2017年04月, 至 2018年03月
          物性化学演習IA
          前期, 理学研究科
        • 自 2017年04月, 至 2018年03月
          物性化学演習IB
          後期, 理学研究科
        • 自 2017年04月, 至 2018年03月
          物性化学演習IC
          前期, 理学研究科
        • 自 2017年04月, 至 2018年03月
          物性化学演習ID
          後期, 理学研究科
        • 自 2018年04月, 至 2019年03月
          化学課題研究7
          通年, 理学部
        • 自 2018年04月, 至 2019年03月
          物性化学ゼミナールIA
          前期, 理学研究科
        • 自 2018年04月, 至 2019年03月
          物性化学ゼミナールIB
          後期, 理学研究科
        • 自 2018年04月, 至 2019年03月
          物性化学ゼミナールIC
          前期, 理学研究科
        • 自 2018年04月, 至 2019年03月
          物性化学ゼミナールID
          後期, 理学研究科
        • 自 2018年04月, 至 2019年03月
          物性化学演習IA
          前期, 理学研究科
        • 自 2018年04月, 至 2019年03月
          物性化学演習IB
          後期, 理学研究科
        • 自 2018年04月, 至 2019年03月
          物性化学演習IC
          前期, 理学研究科
        • 自 2018年04月, 至 2019年03月
          物性化学演習ID
          後期, 理学研究科
        • 自 2019年04月, 至 2020年03月
          化学課題研究7
          通年, 理学部
        • 自 2019年04月, 至 2020年03月
          基礎化学実験
          後期, 全学共通科目
        • 自 2019年04月, 至 2020年03月
          物性化学ゼミナールIA
          前期, 理学研究科
        • 自 2019年04月, 至 2020年03月
          物性化学ゼミナールIB
          後期, 理学研究科
        • 自 2019年04月, 至 2020年03月
          物性化学ゼミナールIC
          前期, 理学研究科
        • 自 2019年04月, 至 2020年03月
          物性化学ゼミナールID
          後期, 理学研究科
        • 自 2019年04月, 至 2020年03月
          物性化学演習IA
          前期, 理学研究科
        • 自 2019年04月, 至 2020年03月
          物性化学演習IB
          後期, 理学研究科
        • 自 2019年04月, 至 2020年03月
          物性化学演習IC
          前期, 理学研究科
        • 自 2019年04月, 至 2020年03月
          物性化学演習ID
          後期, 理学研究科
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          入門化学実験
          前期, 理学部
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          入門化学実験
          後期, 理学部
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          化学実験A
          前期集中, 理学部
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          化学実験B
          後期集中, 理学部
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          化学課題研究7
          通年, 理学部
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          物性化学ゼミナールIA
          前期, 理学研究科
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          物性化学ゼミナールIB
          後期, 理学研究科
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          物性化学ゼミナールIC
          前期, 理学研究科
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          物性化学ゼミナールID
          後期, 理学研究科
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          物性化学演習IA
          前期, 理学研究科
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          物性化学演習IB
          後期, 理学研究科
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          物性化学演習IC
          前期, 理学研究科
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          物性化学演習ID
          後期, 理学研究科
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          入門化学実験
          前期, 理学部
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          入門化学実験
          後期, 理学部
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          化学実験A
          前期集中, 理学部
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          化学実験B
          後期集中, 理学部
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          化学課題研究7
          通年, 理学部
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          物性化学ゼミナールIA
          前期, 理学研究科
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          物性化学ゼミナールIB
          後期, 理学研究科
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          物性化学ゼミナールIC
          前期, 理学研究科
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          物性化学ゼミナールID
          後期, 理学研究科
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          物性化学演習IA
          前期, 理学研究科
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          物性化学演習IB
          後期, 理学研究科
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          物性化学演習IC
          前期, 理学研究科
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          物性化学演習ID
          後期, 理学研究科
        list
          Last Updated :2022/05/13

          大学運営

          部局運営(役職等)

          • 自 2014年04月01日, 至 2015年03月31日
            理学研究科放射線委員会委員
          • 自 2015年04月01日, 至 2016年03月31日
            理学研究科放射線委員会委員
          • 自 2016年04月01日, 至 2017年03月31日
            理学研究科放射線委員会委員委員
          • 自 2017年04月01日, 至 2018年03月31日
            理学研究科放射線委員会委員
          • 自 2018年04月01日, 至 2019年03月31日
            理学研究科放射線委員会委員
          • 自 2019年04月01日, 至 2020年03月31日
            理学研究科放射線委員会委員
          • 自 2020年04月01日, 至 2021年03月31日
            理学研究科放射線委員会委員
          • 自 2021年04月01日, 至 2022年03月31日
            理学研究科放射線委員会委員

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