Basic Information

Professional Memberships

• American society for microbiology
• JAPAN SOCIETY FOR BIOSCIENCE, BIOTECHNOLOGY, AND AGROCHEMISTRY
• The Society for Biotechnology, Japan

Academic Degree

• 博士（医学）(京都大学)

Academic Resume (Graduate Schools)

• 京都大学, 大学院医学研究科博士課程病理系専攻, 修了

Research History

• From Apr. 2018, To Present

  Kyoto University, Institute of Advanced Energy, 特定教授
• From Apr. 2016, To Mar. 2018

  京都高度技術研究所, 客員研究員（兼任）
• From Apr. 2016, To Oct. 2017

  Kyoto Prefectural University of Medicine, 特任教授
• From Apr. 2011, To Mar. 2016

  Yamagata University Graduate School of Science and Engineering, 教授

Profile

• Profile

  研究紹介: http://www.iae.kyoto-u.ac.jp/new-iae//organization/center/Environmental.html

ID,URL

• J-Global ID

  201101025980657751

researchmap URL

• https://researchmap.jp/read0154778

Research

Research Interests

• コマモナス属細菌
• Environmental microbiology
• リゾクトニア属真菌

Research Areas

• Life sciences, Applied microbiology

Papers

• Draft Genome Sequence of the Polychlorinated Biphenyl Degrader Comamonas testosteroni Strain YAZ2, Isolated from a Natural Landscape in the Tohoku Region of Japan

  Tomijiro Hara; Yumiko Takatsuka; Yuh Shiwa; Kenji Yokota

  Microbiology Resource Announcements, 20 Jan. 2022, Peer-reviewed, Lead author, Corresponding author

  Access this paper :

  
• Augmentation of an Engineered Bacterial Strain Potentially Improves the Cleanup of PCB Water Pollution

  Tomijiro Hara; Yumiko Takatsuka; Eiji Nakata; Takashi Morii

  Microbiology Spectrum, 22 Dec. 2021, Peer-reviewed, Lead author, Corresponding author

  Access this paper :

  
• Manual recursive mapping method for the draft genome sequence of Comamonas testosteroni strain YAZ2

  Tomijiro Hara; Yumiko Takatsuka; Yuh Shiwa; Kenji Yokota; Tadasu Shin-i

  figshare, Dec. 2021, Lead author, Corresponding author

  
• Effect of ZnO Nanoparticles on the Physical Properties of PLA/PBS Biocomposite Films

  Tongsai Jamnongkan; Aksaraphak Yosta; Budsakorn Thanesthakul; Masataka Sugimoto; Tomijiro Hara; Yumiko Takatsuka; Rattanaphol Mongkholrattanasit

  Materials Science Forum, Jun. 2021, Peer-reviewed

  
• Green adsorbents for copper (II) biosorption from waste aqueous solution based on hydrogel-beads of biomaterials

  Tongsai Jamnongkan; Rattanaphol Mongkholrattanasit; Amnuay Wattanakornsiri; Piyada Wachirawongsakorn; Yumiko Takatsuka; Tomijiro Hara

  South African Journal of Chemical Engineering, Jan. 2021, Peer-reviewed

  
• Cooperative improvement in growth rate, red‐colour score and astaxanthin level of white‐leg shrimp by Bacillus strains originating from shrimp gut

  T.T. Nguyen; H.T. Nguyen; H.T.T. Pham; A.H. Nguyen; T.N. Phan; T. Hara; Y. Takatsuka; A.T.V. Nguyen

  Journal of Applied Microbiology, Jul. 2020, Peer-reviewed

  
• Detoxification of endocrine disruptors by microbial enzymes.

  Takatsuka Y; Hara T; E. Nakata; T. Morii. M

  Proceedings of The 8th International Symposium of Advanced Energy Science, Sep. 2017, Corresponding author

  
• Towards novel wound dressings: Antibacterial properties of zinc oxide nanoparticles and electrospun fiber mats of zinc oxide nanoparticle/poly(vinyl alcohol) hybrids

  Tongsai Jamnongkan; Sathish K. Sukumaran; Masataka Sugimoto; Tomijiro Hara; Yumiko Takatsuka; Kiyohito Koyama

  Journal of Polymer Engineering, 01 Aug. 2015, Peer-reviewed

  
• 複合微生物触媒でポリ塩化ビフェニル類汚染廃棄物を分解(トピックス)

  原 富次郎

  日本機械学会誌, 2015, Peer-reviewed, Invited, Lead author, Corresponding author

  
• Development of the composite microbial catalysis for polychlorinated biphenyls degradation

  鈴木貫; 高塚由美子; 原富次郎

  地下水・土壌汚染とその防止対策に関する研究集会講演集(CD-ROM), 19 Jun. 2014, Peer-reviewed, Corresponding author

  
• Monitoring method for polychlorinated biphenyls degradation by composite bacterial catalyst.

  Hara T; Takatsuka Y; Makuta T; Katakura S; Nakasato M

  Proceeding of IWEE2014, 2014, Peer-reviewed, Corresponding author

  
• ビフェニルジオキシゲナーゼ高発現細菌製剤の超音波利用型マイクロバブルによる触媒反応制御

  原富次郎; 幕田寿典; 高塚由美子; 佐野克憲; 新國時生

  日本機械学会環境工学総合シンポジウム講演論文集, 09 Jul. 2013, Peer-reviewed, Lead author, Corresponding author

  
• Thioredoxin-1 ameliorates cigarette smoke-induced lung inflammation and emphysema in mice

  Atsuyasu Sato; Yuma Hoshino; Tomijiro Hara; Shigeo Muro; Hajime Nakamura; Michiaki Mishima; Junji Yodoi

  Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics, May 2008, Peer-reviewed

  
• Cell-surface thioredoxin-1: Possible involvement in thiol-mediated leukocyte-endothelial cell interaction through lipid rafts

  Tomijiro Hara; Norihiko Kondo; Hajime Nakamura; Hiroaki Okuyama; Akira Mitsui; Yuma Hoshino; Junji Yodoi

  Antioxidants and Redox Signaling, Sep. 2007, Peer-reviewed, Lead author

  
• Thioredoxin-1 suppresses systemic inflammatory responses against cigarette smoking

  Atsuyasu Sato; Tomijiro Hara; Hajime Nakamura; Noriko Kato; Yuma Hoshino; Norihiko Kondo; Michiaki Mishima; Junji Yodoi

  Antioxidants and Redox Signaling, Sep. 2006, Peer-reviewed, Lead author

  
• チオレドキシンによる喫煙肺傷害の抑制効果の検討

  佐藤篤靖; 星野焉馬; 原富次郎; 室 繁郎; 成田牧子; 中村 肇; 三嶋理晃; 淀井淳司

  第9回京都免疫ワークショップ, 京都, 2006 年4 月, 2006, Peer-reviewed

  
• Thioredoxin-binding protein-2 (TBP-2): Its potential roles in the aging process

  Toru Yoshida; Norihiko Kondo; Shin Ichi Oka; Md Kaimul Ahsan; Tomijiro Hara; Hiroshi Masutani; Hajime Nakamura; Junji Yodoi

  BioFactors, 2006, Peer-reviewed, Invited

  
• 肺障害に対するレドッ クス制御による治療有効性の検討̶喫煙モデルマウスを用いて

  佐藤篤靖; 星野勇馬; 原富次郎; 成田牧子; 室繁郎; 中村肇; 三嶋理晃; 淀井淳司

  第８回伊豆レスピロロジーフォーラ ム 2005 年８月２０日 伊東, 2005, Peer-reviewed

  
• Hepatitis E Virus: CDNA Cloning and Expression

  Toshikazu Uchida; Koyu Suzuki; Nakanobu Hayashi; Fusae Iida; Tomijiro Hara; San San Oo; Chung kwe Wang; Toshio Shikata; Munetaka Ichikawa; Tetsuji Rikihisa; Kyosuke Mizuno; Khin Maung Win

  Microbiology and Immunology, 1992, Peer-reviewed

  

Misc.

• ポリ塩化ビフェニル類汚染地区に棲息する嫌気性微生物に関する調査

  高塚 由美子; 原 富次郎; 平野 竜行

  日本生物工学会大会講演要旨集, Aug. 2018

  
• 変異型ビフェニルジオキシゲナーゼを用いたPCB分解特性改変の検討

  青澤理恵; 泉咲綾; 原富次郎; 高塚由美子; 渡辺誠也; 渡辺誠也

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 05 Mar. 2017

  
• 組み換えラッカーゼによるPCB分解の検討

  泉咲綾; 青澤理恵; 家藤治幸; 原富次郎; 高塚由美子; 渡辺誠也; 渡辺誠也

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 05 Mar. 2017

  
• 抗糸状菌作用を示す微生物の単離とそのメカニズムの解析

  杉村祐哉; 高塚由美子; 横田健治; 西野徳三; 原富次郎

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 05 Mar. 2016

  
• 1P-159 Composite microbial catalyst for Biological control

  Hara Tomijiro; Takatsuka Yumiko; Nishino Tokuzo

  日本生物工学会大会講演要旨集, Sep. 2015

  
• 2P-151 Degradation of polychlorinated biphenyls by composite bacterial catalyst with recombinant Escherichia coli expressing two types of biphenyl dioxygenase

  Takatsuka Yumiko; Ota Marisa; Hara Tomijiro

  日本生物工学会大会講演要旨集, Sep. 2015

  
• 山形県米沢市の高活性型ポリ塩化ビフェニル分解細菌の単離とbphオペロン解析

  太田茉莉紗; 太田茉莉紗; 高塚由美子; 櫻間晴子; 原富次郎

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 05 Mar. 2015

  
• ビフェニルジオキシゲナーゼサブタイプ複合型の細菌触媒によるポリ塩化ビフェニル類の分解

  西山亜紀; 高塚由美子; 片倉苑香; 大場好弘; 原富次郎

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 05 Mar. 2014

  
• 203 Ultrasonically generated microbubble with oxygen up-modulates the catalytic reaction of the biphenyl dioxygenase over-expressed bacterial formulation.

  Hara Tomijiro; Makuta Toshinori; Takatsuka Yumiko; Sano Katsunori; Niikuni Tokio

  The Proceedings of the Symposium on Environmental Engineering, 2013

  
• 3P-119 Composite ratio of biphenyl dioxygenase-overexpressed bacterial formulations seems to influence on the catalytic activity of polychlorinated biphenyl degradation

  Hara Tomijiro; Takatsuka Yumiko

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2013

  
• 微量PCB廃棄物処理対策と簡易分析法 好気性細菌によるポリ塩化ビフェニル無害化研究と山形における実用化の将来展望

  原富次郎; 高塚由美子

  月刊産業と環境, Oct. 2012

  
• 新規ポリ塩化ビフェニル分解細菌の単離

  室月祥枝; 田中俊也; 高塚由美子; 神尾好是; 原富次郎

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 05 Mar. 2012

  
• 「バイオストレスマーカー”チオレドキシン”」を終えて 最終回 チオレドキシン実用化の展望とストレスモニタリング~らくなん進都「高機能性化学研究開発拠点」におけるこれからの活動~

  淀井淳司; 原富次郎

  Schneller, 2011

  
• レドックス制御と疾病治療

  淀井淳司; 原富次郎; 望月芳香; 王冬梅; 増谷弘

  第37回放射線による制癌シンポジウムつくば、2007 年7 月, 2007, Peer-reviewed

  
• チオレドキシンによる喫煙の炎症応答反応制御

  原富次郎; 佐藤篤靖; 星野勇馬; 淀井淳司

  月刊臨床免疫・アレルギー科, Jan. 2007

  
• チオレドキシンによる喫煙の炎症応答反応制御機構の解明

  原富次郎; 近藤則彦; 孫安生; 中村肇; 淀井淳司

  日本免疫学会総会・学術集会記録, Nov. 2005

  
• Development of Pharmaceutical Drungs Based on Redox Regulation by Thioredoxin

  原富次郎; 原富次郎; 成田牧子; 村田一夫

  細胞, Jul. 2005, Invited

  
• TRX‐TBP/VDUP1システムによる紫外線とストレス防御機構

  原富次郎; 岡新一; 船坂陽子; 市橋正光; 平林容子; 井上達; 増谷弘; 淀井淳司

  太陽紫外線防御研究委員会学術報告, Aug. 2004

  
• レドックス制御タンパク チオレドキシンの臨床応用

  藤倉(西川)舞; 原富次郎; 中村肇; 淀井淳司

  メディカルドゥ, Apr. 2004, Peer-reviewed

  
• TRX‐TBP/VDUP1システムによる紫外線とストレス防御機構

  淀井淳司; 原富次郎; 岡新一; 船坂陽子; 市橋正光; 平林容子; 井上達; 増谷弘

  太陽紫外線防御研究委員会シンポジウム講演要旨集, Mar. 2004

  
• レドックス制御による肝臓疾患の予防治療について

  淀井淳司; 原富次郎; 中村肇

  肝臓, Oct. 2003

  
• 抗ストレス蛋白チオレドキシンの実用化

  近藤 則彦; 原 富次郎; 中村 肇; 淀井 淳司

  バイオサイエンスとインダストリー, May 2003

  
• チオレドキシン系レドックス制御薬の可能性

  原富次郎; 中村肇; 淀井淳司

  大阪医薬品協会会報, Mar. 2003

  
• E型肝炎ウイルスの遺伝子クローニングと抗体アッセイ

  原 富次郎

  肝臓, Oct. 1990

  

Presentations

• 微生物が生み出す小さなエネルギーの社会利用〜五月雨を集めてはやし最上川〜

  第36回京都大学宇治キャンパス産学交流会, Invited

  
• 起業への想いから実現へ！

  原 富次郎

  京都次世代ものづくり産業雇用創出プロジェクト, 01 Dec. 2016, Invited

  
• 複合微生物触媒によるポリ塩化ビフェニル類の分解とその実用化

  原 富次郎

  第10回京都コモンズ会員セミナー, 18 Nov. 2015, Invited

  
• Microbe World and its Harmless Technology of PCBs

  TOMIJIRO HARA

  The Bachelor of Science Program in Chemistry, Kasetsart University, 19 Aug. 2015, Invited

  

Books and Other Publications

• 「医学のあゆみ」別冊レドックスUPDATE

  平家俊夫; 淀井淳司, Contributor, コマモナス属細菌にみるレドックス代謝と内分泌攪乱物質の分解メカニズム

  医歯薬出版, Jul. 2013, Not refereed

  
• 『２０世紀の負の遺産PCB』（世界と日本大図解シリーズNO.1070）

  石井 友恵; 細見 正明; 原 富次郎, Supervisor

  中日新聞（東京新聞）, Nov. 2012, Not refereed

  
• バイオストレスマーカーチオレドキシン

  淀井淳司, Contributor, チオレドキシン実用化の展望とストレスモニタリング

  NPO法人 日本バイオストレス研究振興財団アライアンス, Jun. 2012, Not refereed

  

Industrial Property Rights

• 特開2021-020864, 特願2019-136696, 抗菌剤、農薬、および微生物による植物伝染病害の防除方法

  原 富次郎; ▲高▼塚 由美子

  
• WO2017-150556, JP2017007903, 抗菌剤、農薬、微生物による植物病害の防除方法、および新規バチルス・サブティリス

  原 富次郎; 高塚 由美子; 杉村 祐哉; 横田 健治

  
• 特許第6619557号, 特開2016-044173, 特願2015-020400, 微生物触媒及びその使用

  原 富次郎; 高塚 由美子; 杉本 昌隆; トンサイ・ジャモノンカン

  
• 特許第6347315号, 特開2015-012830, 特願2013-141383, 酸素添加酵素含有組成物の活性化方法並びにこれに基づく汚染物質の無害化方法及び装置

  原 富次郎; 高塚 由美子; 片倉 苑香; 幕田 寿典; 佐野 克憲; 新國 時生

  
• 特開2017-169459, 特願2016-056374, 改変ビフェニルジオキシゲナーゼ及びポリ塩化ビフェニル類を分解するためのその使用

  原 富次郎; 高塚 由美子

  
• 特願2016-230230, ポリ塩化ビフェニル類またはダイオキシン類用分解剤およびポリ塩化ビフェニル類またはダイオキシン類の分解方法

  原 富次郎; 高塚 由美子

  
• 特開2016-096733, 特願2014-233593, 微生物触媒によるポリ塩化ビフェニル類分解反応のモニタリング方法

  原 富次郎; 幕田 寿典; 高塚 由美子; 片倉 苑香; 中里 雅一

  
• 特許第5930289号, 特開2013-179890, 特願2012-046270, 新規微生物及びこれを用いるポリ塩化ビフェニルの分解方法

  原 富次郎; 高塚 由美子; 室月 祥枝; 三嶋 瑠璃子; 木島 龍朗; 神尾 好是; 田中 俊也

  
• 特開2016-042827, 特願2014-169561, ポリ塩化ビフェニル類分解用微生物触媒及びその組み合わせ

  原 富次郎; 高塚 由美子; トンサイ ジャモノンカン; 杉本 昌隆

  
• 特願2016-042659, 抗菌剤、農薬、細菌による植物病害の防除方法、および新規バチルス・サブティリス

  原 富次郎; 高塚 由美子; 杉村 裕哉; 横田 健治

  
• 特開2015-139432, 特願2014-015750, ポリ塩化ビフェニル類分解用組成物及びポリ塩化ビフェニル類を無害化するためのその使用

  原 富次郎; 高塚 由美子; 片倉 苑香; 西山 亜紀

  
• 特開2014-183742, 特願2013-058850, ポリ塩化ビフェニル類無害化複合組成物ならびにその製造方法

  原 富次郎; 高塚 由美子; 新國 時生

  

External funds: Kakenhi

• Challenge to dechlorinate polychlorinated biphenyls under aerobic conditions with an engineered reductive dehalogenase

  Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

  Medium-sized Section 64:Environmental conservation measure and related fields

  Kyoto University

  Yumiko Takatsuka

  From 29 Jun. 2018, To 31 Mar. 2021, Project Closed

  ポリ塩化ビフェニル;還元的脱塩素化酵素;遺伝子組換え細菌;ビタミンB12;Dehalococcoides;ポリ塩化ビフェニル類;新機能性酵素;好気条件下;金属結合型ビタミンB12

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18K19881/
• Creation of novel aromatic-ring hydroxylating dioxygenase with extended substrate specificity toward polychlorinated biphenyls

  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

  Kyoto Gakuen University;Yamagata University

  Haruko Sakurama

  From 21 Oct. 2015, To 31 Mar. 2018, Project Closed

  ポリ塩化ビフェニル;芳香環水酸化ジオキシゲナーゼ;環境浄化

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15K00590/
• Biocontainment of genetically modified bacterium by programed bacterial cell death.

  Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

  Yamagata University

  TOMIJIRO HARA

  From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2016, Project Closed

  コマモナス・テストステロニYAZ2株;分子育種;生物学的封じ込め;プログラム細菌細胞死;環境修復;ポリ塩化ビフェニル;コマモナ・ステストステロニ;ゲノム解析;バイオレメディエーション;遺伝子組み換え技術;拡散防止技術;人工微生物;遺伝子組換え微生物の非拡散;合成生物;C. testosteroni YAZ2株;ビフェニルジオキシゲナーゼ

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26550066/
• Attempt to achieve reductive dechlorination of highly chlorinated polychlorinated biphenyls by an engineered dehalogenase under atmospheric conditions

  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

  Basic Section 64020:Environmental load reduction and remediation-related

  Kyoto University

  Yumiko Takatsuka

  From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2025, Project Closed

  ポリ塩化ビフェニル類;還元的脱塩素化酵素;遺伝子組換え細菌;ビタミンB12;Dehalococcoides;網羅的細菌叢解析;網羅的細菌叢メタゲノム解析;ポリ塩化ビフェニル

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K12427/
• Rhizoctonia 属糸状菌由来の新奇な抗真菌性蛋白質の機能解明

  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

  Basic Section 38020:Applied microbiology-related

  Kyoto University

  高塚 由美子

  From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2028, Granted

  Rhizoctonia solani;DRHS-AFP;抗真菌性蛋白質

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25K08880/

Administration

Faculty management (title, position)

• From 01 Apr. 2018

  エネルギー理工学研究所自己点検・評価委員会ＷＧ委員
• From 01 Apr. 2018

  エネルギー理工学研究所面積利用検討委員会委員
• From 01 Apr. 2018

  エネルギー理工学研究所安全衛生委員会委員

Academic, Social Contribution

Committee Memberships

• From Sep. 2016, To Feb. 2017

  専門委員, 経済産業省近畿経済産業局
• From Apr. 2014, To Mar. 2016

  参与, 日本農芸化学会東北支部
• From Apr. 2012, To Mar. 2016

  委員長, 置賜マイクロナノ・バイオフォーラム
• From Apr. 2010, To Mar. 2016

  専門委員, 科学技術振興機構

Social Contribution

• Life Innovation LLC顧問(兼業)

  Consultant

  From 01 Apr. 2020, To 31 Mar. 2021

  
• アグリ・コア株式会社顧問(兼業)

  Consultant

  From 01 Apr. 2019, To 28 Feb. 2022

  
• オーガニック・テックファーム株式会社顧問(兼業)

  Consultant

  From 01 Oct. 2017, To 31 Mar. 2020

  
• みやこキャピタル株式会社顧問(兼業)

  Consultant

  From 01 Mar. 2016, To 31 Mar. 2018

  
• アプリザイム株式会社顧問(兼業)

  Consultant

  From 01 Jan. 2015, To 31 Mar. 2016

  
• アプリザイム株式会社取締役(兼業)

  Other

  From 01 Apr. 2013, To 31 Mar. 2014

  
• アプリザイム株式会社代表取締役(兼業)

  Other

  From 01 Aug. 2011, To 31 Mar. 2013