基本情報

学部兼担

• 医学部

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  seo.wooseok.2ikyoto-u.ac.jp

所属学協会

• 自 2019年11月, 至 現在

  日本癌学会
• 自 2009年11月, 至 現在

  日本免疫学会

学位

• 2002年10月30日

  カルガリー大学修士（理学）
• 2008年05月30日

  ブリティッシュコロンビア大学博士（医学）

出身学校・専攻等

• 淸州大学, 遺伝工学部, 卒業

経歴

• 自 2025年08月, 至 現在

  京都大学創発 PI
• 自 2025年04月, 至 現在

  京都大学大学院医学研究科附属 がん免疫総合研究センター, がん免疫多細胞システム制御部門, 准教授
• 自 2025年04月, 至 現在

  名古屋大学大学院, 医学系研究科, 招へい教員
• 自 2023年04月, 至 2025年03月

  名古屋大学, 高等研究院, 若手新分野創成研究ユニット, 代表研究者 (兼任)
• 自 2019年11月, 至 2025年03月

  名古屋大学大学院, 医学系研究科・分子細胞免疫学, 特任准教授
• 自 2009年11月, 至 2019年10月

  理化学研究所, 生命医科学研究センター・免疫転写制御研究チーム, 研究員
• 自 2013年04月, 至 2017年03月

  理化学研究所, 基礎科学特別研究員 (兼任)
• 自 2010年10月, 至 2013年03月

  理化学研究所, 日本学術振興会特別研究員 (兼任)
• 自 2008年05月, 至 2009年10月

  University of British Columbia, Biomedical Research Centre, 研究員

プロフィール

• プロフィール

  ＜研究経歴＞

  
  

  理化学研究所　生命医科学研究センター　免疫転写制御研究チーム

  
  

  生物の設計図であるゲノム情報がいかにして読み出され、精緻な生命システムを構築するかという「遺伝子発現制御の根本原理」の解明に従事しました。谷内一郎チームリーダーのもと、転写因子複合体の機能解析およびクロマチン高次構造の動態解析に注力し、免疫細胞（T細胞）への分化と活性のプロセスを分子レベルで明らかにしました。この期間に、遺伝子改変マウス作製技術と分子生物学的実験手法（Wet）に加え、ChIP-seqやATAC-seqなどのエピゲノム解析とバイオインフォマティクス解析（Dry）の技術を習得しました。自ら仮説を立て、検証のためのマウスモデルを作製し、最先端のゲノム解析で答えを導き出す「シームレスな解析する研究遂行能力」は、現在の私の研究の核となっています。

  
  

   

  
  

  名古屋大学　医学系研究科　分子細胞免疫学

  
  

  理化学研究所で培った基礎知見を「疾患における分子機構の破綻」へと展開させるため、名古屋大学・西川博嘉教授の研究室に合流しました。同研究室では、がん微小環境における細胞機能不全（疲弊）のメカニズムを、転写制御とエピジェネティック変化の観点から解析しました。特に、臨床検体の解析から得られた知見に基づき、症例の遺伝子発現を忠実に再現する独自の疾患マウスモデルを自ら作製・解析する、独自の応用的基礎研究を展開しました。さらに、この研究過程で見出した「神経系と免疫系のクロストーク」に着目し、若手新分野創成研究ユニット（文部科学省・研究大学強化促進事業）を立ち上げ、ユニットリーダーを務めました。「老化・神経・免疫ネットワーク研究ユニット」では、異分野の研究者を結集させた学際的なチームを主導し、老化による免疫機能低下（免疫老化）の分子機構解明を目指して、マウスモデルを用いた多角的な検証を行いました。

  
  

   

  
  

  ＜現在の研究内容＞

  
  

  京都大学　がん免疫総合研究センター　がん免疫多細胞システム制御部門

  
  

  https://www.ccii.med.kyoto-u.ac.jp/research/divisions-labs/division-of-cancer-immune-multicellular-system-regulation/

  
  

  2025年度より、本庶佑先生が創設した京都大学がん免疫総合研究センター（CCII）にて、がん免疫多細胞システム制御部門の准教授に着任し、西川博嘉教授の下で研究を継続しています。こちらでは、がん免疫を単一細胞の解析に留めず、個体レベルの「多細胞システム」として捉える新たな接近法に挑戦しています。私の強みは、臨床検体のオミクス解析から得られた知見を、自ら作製する精密な疾患マウスモデルで再現し、機能実証を行う一気通貫の解析スタイルです。現在はとりわけ、がん免疫を分子レベルの解析に留めず、概日リズムや加齢といった「時間軸」の視点から理解する「時間免疫学」の確立に注力しています。これらの研究を通じて、臨床現場の問いを科学的に解明するトランスレーショナルリサーチ（TR）を推進し、がんの治療のみならず、将来的ながん予防を実現できる世界の創造に貢献したいと考えています。

  
  

    

  
  

  京都大学創発 PI (JST創発的研究支援事業　塩見パネル)

  
  

  https://www.jst.go.jp/souhatsu/research/panel_shiomi.html

  
  

  JST創発的研究支援事業では、「領域特異的解析による転写ファクトリーの分子実体と機能の解明」に取り組んでいます。複数の遺伝子が核内の特定領域に集まり、効率的な転写制御を受ける「転写ファクトリー」仮説の分子基盤解明が目標です。 本研究の核心は、領域特異的免疫沈降法（Locus-specific ChIP）を駆使し、特定のゲノム領域に形成される転写複合体を直接捉えることにあります。これにより、従来のChIP-seqのような「平均化されたデータ」では見えない、特定の遺伝子座（ローカル環境）の動態を4次元的に定量することを目指します。本研究による免疫系の転写ファクトリーの解明は、新規免疫チェックポイント分子の同定や評価を可能にするポテンシャルを秘めており、がん免疫研究への応用を加速させています。

  
  

    

  
  

   ＜主な研究手法＞

  
  

  遺伝子改変マウスの作製（ES細胞、Crispr/Cas9）

  
  

  分子生物学的解析（Western Blotting, ELISA）

  
  

  細胞生物学解析（フローサイトメトリー, RNA-seq, scRNA-seq）

  
  

  エピジェネティック解析 (ChIP-seq, ATAC-seq, Hi-C)

  
  

  バイオインフォマティクス (NGSデータ解析)

ID,URL

• J-Global ID

  202001015313895886

• 研究者番号

  40574116

researchmap URL

• https://researchmap.jp/seow

研究

研究キーワード

• クロマチン構造
• エピゲノム
• 転写制御
• バイオインフォマティクス
• 免役
• がん免疫

研究分野

• ライフサイエンス, 分子生物学, Life Science / Molecular Biology
• ライフサイエンス, 免疫学, Life Science / Immunology

論文

• Genetic Disruption of Pdcd-1 Upstream Enhancer Boosts T Cell Function and Antitumor Responses

  Chandsultana Jerin; Wooseok Seo; Hiroyoshi Nishikawa

  Immunology Letters, 2026年03月, 査読有り, 筆頭著者, 責任著者

  
• Reticulocalbin1-mediated regulation of calcium homeostasis in naïve T lymphoncytes

  Takeru Kobayashi; Wooseok Seo; Norihisa Ichimura; Yusuke Urata; Hideharu Hibi; Hiroyoshi Nishikawa

  Cell Calcium, 2026年01月, 査読有り, 筆頭著者, 責任著者

  この論文にアクセスする：

  
• Neuropeptidergic input from the lateral hypothalamus to the suprachiasmatic nucleus alters the circadian period in mice

  Chi Jung Hung; Chang-Ting Tsai; Sheikh Mizanur Rahaman; Akihiro Yamanaka; Wooseok Seo; Tatsushi Yokoyama; Masayuki Sakamoto; Daisuke Ono

  The Journal of Neuroscience, 2024年12月02日, 査読有り

  
• Protocol for acquiring samples to assess the impact of microplastics on immune microenvironments in the mouse intestine

  Akihito Harusato; Wooseok Seo; Hirohito Abo; Yoshitaka Nakanishi; Hiroyoshi Nishikawa; Yoshito Itoh

  STAR Protocols, 2023年12月

  
• Identification of a novel enhancer essential forSatb1expression in TH2 cells and activated ILC2s

  Aneela Nomura; Tetsuro Kobayashi; Wooseok Seo; Michiko Ohno-Oishi; Kiyokazu Kakugawa; Sawako Muroi; Hideyuki Yoshida; Takaho A Endo; Kazuyo Moro; Ichiro Taniuchi

  Life Science Alliance, 2023年08月, 査読有り

  
• Impact of particulate microplastics generated from polyethylene terephthalate on gut pathology and immune microenvironments.

  Akihito Harusato; Wooseok Seo; Hirohito Abo; Yoshitaka Nakanishi; Hiroyoshi Nishikawa; Yoshito Itoh

  iScience, 2023年04月21日, 査読有り

  
• Dietary Emulsifiers Exacerbate Food Allergy and Colonic Type 2 Immune Response through Microbiota Modulation

  Akihito Harusato; Benoit Chassaing; Charlène J. G. Dauriat; Chihiro Ushiroda; Wooseok Seo; Yoshito Itoh

  Nutrients, 2022年11月23日, 査読有り

  
• The Roles of RUNX Proteins in Lymphocyte Function and Anti-Tumor Immunity

  Wooseok Seo; Aneela Nomura; Ichiro Taniuchi

  Cells, 2022年10月03日, 査読有り, 筆頭著者

  
• Transcriptional regulatory network for the establishment of CD8+ T cell exhaustion

  Wooseok Seo; Chandsultana Jerin; Hiroyoshi Nishikawa

  Experimental & Molecular Medicine, 2021年02月24日, 査読有り, 筆頭著者, 責任著者

  
• Runx-mediated regulation of CCL5 via antagonizing two enhancers influences immune cell function and anti-tumor immunity

  Wooseok Seo; Kanako Shimizu; Satoshi Kojo; Arinze Okeke; Terumi Kohwi-Shigematsu; Shin-ichiro Fujii; Ichiro Taniuchi

  Nature Communications, 2020年12月, 査読有り, 筆頭著者, 責任著者

  
• The Roles of RUNX Family Proteins in Development of Immune Cells

  Wooseok Seo; Ichiro Taniuchi

  Molecules and cells, 2020年02月29日, 査読有り, 筆頭著者, 責任著者

  
• Constitutive CD8 expression drives innate CD8+ T-cell differentiation via induction of iNKT2 cells

  Satoshi Kojo; Michiko Ohno-Oishi; Hisashi Wada; Sebastian Nieke; Wooseok Seo; Sawako Muroi; Ichiro Taniuchi

  Life Science Alliance, 2020年02月, 査読有り

  
• Essential functions of Runx/Cbfβ in gut conventional dendritic cells for priming Rorγt+ T cells

  Mari Tenno; Alicia Yoke Wei Wong; Mika Ikegaya; Eiji Miyauchi; Wooseok Seo; Peter See; Tamotsu Kato; Takashi Taida; Michiko Oishi-Ohno; Hiroshi Ohno; Hideyuki Yoshida; Florent Ginhoux; Ichiro Taniuchi

  Life Science Alliance, 2020年01月, 査読有り

  
• Too much can be as bad as too little

  Wooseok Seo; Ichiro Taniuchi

  Nature Immunology, 2019年10月12日, 筆頭著者

  
• Tle corepressors are differentially partitioned to instruct CD8⁺ T cell lineage choice and identity

  Shaojun Xing; Peng Shao; Fengyin Li; Xudong Zhao; Wooseok Seo; Justin C. Wheat; Selvi Ramasamy; Jianfeng Wang; Xiang Li; Weiqun Peng; Shuyang Yu; Chengyu Liu; Ichiro Taniuchi; David A. Sweetser; Hai-Hui Xue

  The Journal of Experimental Medicine, 2018年07月25日, 査読有り

  
• Priming of lineage-specifying genes by Bcl11b is required for lineage choice in post-selection thymocytes

  Satoshi Kojo; Hirokazu Tanaka; Takaho A. Endo; Sawako Muroi; Ye Liu; Wooseok Seo; Mari Tenno; Kiyokazu Kakugawa; Yoshinori Naoe; Krutula Nair; Kazuyo Moro; Yoshinori Katsuragi; Akinori Kanai; Toshiya Inaba; Takeshi Egawa; Byrappa Venkatesh; Aki Minoda; Ryo Kominami; Ichiro Taniuchi

  Nature Communications, 2017年09月26日, 査読有り

  
• Essential Roles of SATB1 in Specifying T Lymphocyte Subsets

  Kiyokazu Kakugawa; Satoshi Kojo; Hirokazu Tanaka; Wooseok Seo; Takaho A. Endo; Yohko Kitagawa; Sawako Muroi; Mari Tenno; Nighat Yasmin; Yoshinori Kohwi; Shimon Sakaguchi; Terumi Kowhi-Shigematsu; Ichiro Taniuchi

  Cell Reports, 2017年05月, 査読有り

  
• Regulation of hematopoiesis and immune responses by long non-coding RNAs

  Wooseok Seo; Ichiro Taniuchi

  International Immunology, 2017年04月01日, 査読有り, 筆頭著者

  
• Roles of RUNX Complexes in Immune Cell Development

  Takashi Ebihara; Wooseok Seo; Ichiro Taniuchi

  Advances in Experimental Medicine and Biology, 2017年03月16日, 査読有り

  
• Distinct requirement of Runx complexes for TCRβ enhancer activation at distinct developmental stages

  Wooseok Seo; Sawako Muroi; Kaori Akiyama; Ichiro Taniuchi

  Scientific Reports, 2017年02月02日, 査読有り, 筆頭著者

  
• Transcriptional regulation of early T‐cell development in the thymus

  Wooseok Seo; Ichiro Taniuchi

  European Journal of Immunology, 2016年02月12日, 査読有り, 筆頭著者

  
• Functional B-1 progenitor cells are present in the hematopoietic stem cell-deficient embryo and depend onCbfβfor their development

  Michihiro Kobayashi; W. Christopher Shelley; Wooseok Seo; Sasidhar Vemula; Yang Lin; Yan Liu; Reuben Kapur; Ichiro Taniuchi; Momoko Yoshimoto

  Proceedings of the National Academy of Sciences, 2014年08月04日, 査読有り

  
• Epigenetic Thpok silencing limits the time window to choose CD4+ helper-lineage fate in the thymus

  Hirokazu Tanaka; Taku Naito; Sawako Muroi; Wooseok Seo; Risa Chihara; Chizuko Miyamoto; Ryo Kominami; Ichiro Taniuchi

  The EMBO Journal, 2013年03月12日, 査読有り

  
• Runx1–Cbfβ facilitates early B lymphocyte development by regulating expression of Ebf1

  Wooseok Seo; Tomokatsu Ikawa; Hiroshi Kawamoto; Ichiro Taniuchi

  Journal of Experimental Medicine, 2012年06月04日, 査読有り, 筆頭著者

  
• Roles of VWRPY motif‐mediated gene repression by Runx proteins during T‐cell development

  Wooseok Seo; Hirokazu Tanaka; Chizuko Miyamoto; Ditsa Levanon; Yoram Groner; Ichiro Taniuchi

  Immunology and Cell Biology, 2012年02月28日, 査読有り, 筆頭著者

  
• CD43 processing and nuclear translocation of CD43 cytoplasmic tail are required for cell homeostasis

  Wooseok Seo; Hermann J. Ziltener

  Blood, 2009年10月22日, 査読有り, 筆頭著者

  
• PSGL‐1 function in immunity and steady state homeostasis

  Douglas A. Carlow; Klaus Gossens; Silvia Naus; Krystle M. Veerman; Wooseok Seo; Hermann J. Ziltener

  Immunological Reviews, 2009年06月29日, 査読有り

  
• Insertion of group II intron retroelements after intrinsic transcriptional terminators

  Aaron R. Robart; Wooseok Seo; Steven Zimmerly

  Proceedings of the National Academy of Sciences, 2007年04月17日, 査読有り

  
• CD34 and CD43 Inhibit Mast Cell Adhesion and Are Required for Optimal Mast Cell Reconstitution

  Erin Drew; Jasmeen S. Merzaban; Wooseok Seo; Hermann J. Ziltener; Kelly M. McNagny

  Immunity, 2005年01月, 査読有り

  
• Non-cognate template usage and alternative priming by a group II intron-encoded reverse transcriptase

  Tatiana Morozova; Wooseok Seo; Steven Zimmerly

  Journal of Molecular Biology, 2002年02月, 査読有り

  

外部資金：科学研究費補助金

• ゲノムオーガナイザーSatb1によるT細胞の疲弊の制御機構

  基盤研究(C)

  小区分49070:免疫学関連

  名古屋大学

  SEO WOOSEOK

  自 2023年04月01日, 至 2026年03月31日, 交付

  SATB1;ヘルパーT細胞;Treg;細胞傷害性T細胞;がん;疲弊T細胞;Satb1

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23K06581/
• 腸管恒常性維持機構に着目した食物アレルギー発症メカニズムの解明

  基盤研究(C)

  小区分59040:栄養学および健康科学関連

  名古屋大学;京都府立医科大学

  春里 暁人

  自 2022年04月01日, 至 2026年03月31日, 交付

  食物アレルギー;サイトカイン;IL-36;2型免疫応答;マイクロ・ナノプラスチック;ナノ/マイクロプラスチック;食品乳化剤;マイクロプラスチック;腸管;腸内細菌

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K11731/
• Regulatory mechanisms controlling CCL5 chemokine to maintain tissue homeostasis

  基盤研究(C)

  小区分49070:免疫学関連

  名古屋大学;国立研究開発法人理化学研究所

  SEO WOOSEOK

  自 2018年04月01日, 至 2021年03月31日, 完了

  CCL5;Enhancer;Cancer;がん免疫;ケモカイン;転写制御;Chemokine

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18K07186/
• Runx-mediated regulation of chemokine CCL5 for lung diseases

  基盤研究(Ｃ)

  国立研究開発法人理化学研究所

  SEO WOOSEOK

  自 2015年10月21日, 至 2018年03月31日, 完了

  アレルギー;免疫関連疾患;免疫関連病患

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15K08535/
• Effects of Runx1-associated lncRNA on asthma pathogenesis

  若手研究(B)

  独立行政法人理化学研究所

  SEO WOOSEOK

  自 2013年04月01日, 至 2015年03月31日, 完了

  CD4T細胞;Runx1転写因子;long non-coding RNA;ヒト喘息疾患発症;CD4+ T 細胞

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25860374/