Basic Information

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  nishikawa.seiya.3ekyoto-u.ac.jp

Professional Memberships

• 日本発生生物学会
• THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN
• THE JAPANESE SOCIETY FOR MATHEMATICAL BIOLOGY

Academic Degree

• 26 Mar. 2015

  早稲田大学修士（理学）
• 15 Feb. 2020

  早稲田大学博士（理学）

Academic Resume (Undergraduate School/Majors)

• 早稲田大学, 先進理工学部電気・情報生命工学科, 卒業
• 早稲田大学本庄高等学院, 卒業

Research History

• From Dec. 2024, To Present

  Kyoto University, 国際高等教育院附属 データ科学イノベーション教育研究センター, 特定講師
• From Dec. 2024, To Present

  Kyoto University, Center for Living Systems Information Science (CeLiSIS), 特定講師
• From Apr. 2022, To Nov. 2024

  Japan Society for the Promotion of Science, 特別研究員（PD）
• From Oct. 2021, To Mar. 2022

  The University of Tokyo, Graduate School of Arts and Sciences Basic Science,Section of Multi-Disciplinary Sciences, 特任助教
• From Apr. 2020, To Sep. 2021

  Waseda University, Faculty of Science and Engineering, 助教
• From Apr. 2018, To Mar. 2020

  Waseda University, Faculty of Science and Engineering, 助手

ID,URL

• J-Global ID

  201901009133074263

• Researcher number

  90822255

researchmap URL

• https://researchmap.jp/seiya_nishikawa

Research

Research Interests

• 細胞性粘菌
• 定量生物学
• 数理モデル
• 自律分散
• 細胞競合
• 非平衡
• 数理生物学

Research Areas

• Natural sciences, Bio-, chemical, and soft-matter physics
• Life sciences, Biophysics

Papers

• Active Matter under Cyclic Stretch: Modeling Microtubule Alignment and Bundling

  Takumi Tagaki; Seiya Nishikawa; Shuji Ishihara

  25 May 2025

  
• Anti-aligning Self-propelled Model of Two Species: Emergence of \textit{Self-organized Heterogeneous Aligned and Clustered Order}

  Takahiro Oki; Tetsuhiro S. Hatakeyama; Seiya Nishikawa; Shuji Ishihara; Toshinori Namba

  24 Feb. 2025

  
• Diversity in self-organized forms and migration modes in isolated epithelial cells

  Shota Mise; Shimon Shibagaki; Seiya Nishikawa; Hiroko Nakamura; Hiroshi Kimura; Atsuko Takamatsu

  Artificial Life and Robotics, 2020, Peer-reviewed, Lead author

  
• Effects of cell death-induced proliferation on a cell competition system

  Seiya Nishikawa; Atsuko Takamatsu

  Mathematical Biosciences, Oct. 2019, Peer-reviewed, Lead author, Corresponding author

  
• Asymmetry in cilia configuration induces hydrodynamic phase locking

  Keiji Okumura; Seiya Nishikawa; Toshihiro Omori; Takuji Ishikawa; Atsuko Takamatsu

  Physical Review E, 20 Mar. 2018, Peer-reviewed

  
• Mathematical model for cell competition: Predator-prey interactions at the interface between two groups of cells in monolayer tissue

  Seiya Nishikawa; Atsuko Takamatsu; Shizue Ohsawa; Tatsushi Igaki

  Journal of Theoretical Biology, 07 Sep. 2016, Peer-reviewed, Lead author

  

Misc.

• アリの複数個体運搬の解明に向けて

  久本峻平; 西川星也

  自律分散システム・シンポジウム 36th, Feb. 2024

  
• 細胞競合による組織品質管理システムのシミュレーション

  西川星也

  自律分散システム・シンポジウム 36th, Feb. 2024, Lead author, Last author, Corresponding author

  
• 3D Tissue formation by two types of cell models

  西川星也; 石原秀至; 石原秀至

  日本数理生物学会年会(Web), 2023

  
• Control of cell dynamics by extracellular environment using a particle-fiber model

  八塚剛志; 三瀬翔太; 柴垣志文; 西川星也; 岡本直樹; 高松敦子

  自律分散システム・シンポジウム(CD-ROM), 2022

  
• Evolution of cooperative transport in ants.

  久本峻平; 西川星也

  日本生態学会大会講演要旨(Web), 2021

  
• Mathematical analysis of epithelial deformation using particle model

  西川星也

  日本数理生物学会年会(Web), 2021

  
• A Mathematical Model for Differentiation-potencial Maintenance by Cell Competition-Effect of Cell Motility-

  田野口佳奈; 西川星也; 高松敦子

  日本数理生物学会年会(Web), 2021

  
• Control of cell morphology by cell-substrate adhesion using a particle-fiber model

  八塚剛志; 三瀬翔太; 柴垣志文; 西川星也; 岡本直樹; 高松敦子

  日本数理生物学会年会(Web), 2021

  
• 【細胞競合による生体制御とがん】細胞競合の力学・動態・数理 細胞競合の数理モデル 組織の運命を決めるものとは?

  西川 星也; 高松 敦子

  医学のあゆみ, Aug. 2020

  
• Understanding epithelial migration as Escape Panic

  西川星也

  日本数理生物学会年会(Web), 2020

  
• A mathematical model for the cell system generating multiple modes of form and migration

  三瀬翔太; 柴垣志文; 西川星也; 八塚剛志; 中村寛子; 木村啓志; 高松敦子

  日本数理生物学会年会(Web), 2020

  
• 上皮組織における異常細胞の排出現象の数理解析

  西川星也; 高松敦子

  自律分散システム・シンポジウム(CD-ROM), 2019

  
• 細胞競合の勝敗を規定する組織環境条件の遺伝学および数理学的解析

  片山 宰; 西川 星也; 大澤 志津江; 高松 敦子; 井垣 達吏

  生命科学系学会合同年次大会, Dec. 2017

  
• Asymmetry of Arrangement Induces Phase Synchronization in Mouse Node Cilia

  Keiji Okumura; Seiya Nishikawa; Toshihiro Omori; Takuji Ishikawa; Atsuko Takamatsu

  26th IUPAP International conference on Statistical Physics, Jul. 2016

  
• Perspective of cell competition using mathematical models : an agent-based model for cell competition

  西川 星也; 高松 敦子

  生体の科学, Mar. 2016

  
• Agent-basedmodelを用いた細胞競合現象のシミュレーション

  西川星也; 高松敦子

  自律分散システム・シンポジウム(CD-ROM), 2016

  
• Phase locking due to asymmetric arrangement in a model of three identical cilia

  Okumura K; Nishikawa S; Omori T; Ishikawa T; Takamatsu A

  Meeting Abstracts of the Physical Society of Japan, 2016

  
• 遺伝学と理論的アプローチによる細胞競合機構の解析

  馬場 翔子; 大澤 志津江; 西川 星也; 高松 敦子; 井垣 達吏

  日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集, Dec. 2015

  
• 細胞社会を支える適者生存システム 細胞競合の分子基盤とその役割 細胞競合の数理モデル 上皮細胞群境界における捕食者-被食者相互作用

  西川 星也; 高松 敦子

  日本細胞生物学会大会講演要旨集, Jun. 2015

  
• 22pBL-8 Synchronized oscillation in a model of three nodal cilia with hydrodynamic interaction

  Okumura K; Nishikawa S; Omori T; Ishikawa T; Takamatsu A

  Meeting Abstracts of the Physical Society of Japan, 2015

  
• 16pCX-1 Parameter dependence on synchronization in a model of two nodal cilia

  Okumura K; Nishikawa S; Omori T; Ishikawa T; Takamatsu A

  Meeting Abstracts of the Physical Society of Japan, 2015

  
• Lotka-Volterra competition modelに基づく細胞競合モデル

  西川星也; 高松敦子; 大澤志津江; 井垣達吏

  日本数理生物学会大会講演要旨集, 2013

  
• アリの運動量と個体数の関係

  久本峻平; 西川星也; 高松敦子

  日本数理生物学会大会講演要旨集, 2013

  

Presentations

• Mathematical model for the fruit body formation in Dictyostelium discoideum

  Seiya Nishikawa; Satoshi Kuwana; Gen Honda; Satoshi Sawai; Shuji Ishihara

  57th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists, Jun. 2024

  
• Phase-field model of Dictyostelium fruiting body formation

  Seiya Nishikawa; Satoshi Kuwana; Gen Honda; Satoshi Sawai; Shuji Ishihara

  IUPAB2024 -21st International Union for Pure and Applied Biophysics and 62nd Biophysics Society of Japan, Jun. 2024

  
• Quantitative analysis and mathematical model of Dictyostelium fruiting body formation

  Seiya Nishikawa; Satoshi Kuwana; Gen Honda; Satoshi Sawai; Shuji Ishihara

  57th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists, Jun. 2024

  
• 競合精度と組織の適応度制御の関係

  西川 星也

  第11回細胞競合コロキウム, Mar. 2024

  
• アリの複数個体運搬の解明に向けて

  久本峻平; 西川星也

  自律分散システム・シンポジウム 36th, Feb. 2024

  
• 細胞競合による組織品質管理システムのシミュレーション

  西川 星也

  第36回自律分散システム・シンポジウム, Feb. 2024

  
• 細胞性粘菌の子実体形成の理論解析

  西川 星也; 桑名 悟史; 澤井 哲; 石原 秀至

  定量生物学の会 第11回年会, Jan. 2024

  
• 多細胞組織をシステムとして理解するアプローチ

  西川 星也

  多細胞休止を研究する会, Jan. 2024

  
• Theoretical analysis of fruiting body development by Dictyostelium discoideum

  西川 星也; 桑名 悟史; 澤井 哲; 石原 秀至

  第61回日本生物物理学会年会, Nov. 2023

  
• Wasserstein Distanceを用いた組織の変形解析PIVの構築

  西川 星也; 石原 秀至

  第3回領域班会議 学術変革領域 「競合的コミュニケーションから迫る多細胞生命システムの自律性」, Sep. 2023

  
• 2種細胞モデルによる3D組織形成

  西川 星也; 石原 秀至

  2023年度日本数理生物学会年会, Sep. 2023

  
• Investigation of 3D morphogenesis using thermodynamic and continuum modeling approaches

  Seiya Nishikawa; Shuji Ishihara

  STATPHYS28 Satellite Meeting “Statistical Physics and Information-Processing in Living Systems”, Aug. 2023

  
• Thermodynamic and continuum model approaches to understanding complex morphogenesis

  Seiya Nishikawa; Shuji Ishihara

  28th International Conference on Statistical Physics, Aug. 2023

  
• Wasserstein距離を用いた細胞集団の運動・変形解析PIVの構築

  西川 星也

  第10回細胞競合コロキウム, Mar. 2023

  
• 粒子-ファイバーモデルを用いた足場環境による細胞の動態制御

  八塚剛志; 三瀬翔太; 柴垣志文; 西川星也; 岡本直樹; 高松敦子

  自律分散システム・シンポジウム34th, Jan. 2023

  
• Continuum model for analyzing mechanical properties of Dictyostelium fruiting-body development

  西川 星也; 桑名 悟史; 橋村 秀典; 澤井 哲; 石原 秀至

  第61回日本生物物理学会年会, Sep. 2022

  
• 細胞競合による分化能維持機構の数理モデル-運動性の効果-

  田野口佳奈; 西川星也; 高松敦子

  日本数理生物学会年会 31st, Sep. 2021

  
• アリの協調運搬はどのように進化したのか?

  久本峻平; 西川星也

  日本生態学会大会 68th, Mar. 2021

  
• 細胞が多様な運動と形態モードを生成する機構に関する数理モデル

  三瀬翔太; 柴垣志文; 西川星也; 八塚剛志; 中村寛子; 木村啓志; 高松敦子

  日本数理生物学会年会 30th, Sep. 2020

  
• 哺乳類の指形成時に観察される細胞の集団移動をエスケープ・パニックとして理解する

  西川 星也

  2020年度日本数理生物学会年会, Sep. 2020

  
• Self-organized diverse forms and migration modes in isolated epithelial cells

  Shota Mise; Shimon Shibagaki; Seiya Nishikawa; Hiroko Nakamura; Hiroshi Kimura; Atsuko Takamatsu

  SWARM2019, Nov. 2019

  
• 孤立した上皮細胞における形態および運動の多様性

  柴垣志文; 中村寛子; 西川星也; 木村啓志; 高松敦子

  第57回日本生物物理学会, Sep. 2019

  
• 細胞逸脱の発生要因の数理解析

  西川 星也; 高松 敦子

  第8回細胞競合コロキウム, Mar. 2019

  
• 接着斑とストレスファイバーを考慮した細胞運動のシミュレーション

  三瀬翔太; 西川星也; 高松敦子

  定量生物学の会 第9回年会, Jan. 2019

  
• 孤立した上皮細胞の運動と形態の解析

  柴垣志文; 中村寛子; 西川星也; 木村啓志; 高松敦子

  定量生物学の会 第9回年会, Jan. 2019

  
• 上皮細胞の組織形成に寄与する力学的作用解明のための数理モデル

  西川 星也; 高松敦子

  定量生物学の会 第9回年会, Jan. 2019

  
• 上皮組織における異常細胞排出現象の数理解析

  西川 星也; 高松 敦子

  第31回自律分散システム・シンポジウム,, Jan. 2019

  
• 2種類の相互作用が細胞逸脱で果たす役割の粒子モデルによる解析

  西川 星也; 石原 えりか; 仁科 博史; 高松 敦子

  第7回細胞競合コロキウム, Mar. 2018

  
• 細胞競合の勝敗を規定する組織環境条件の遺伝学および数理学的解析

  片山 宰; 西川 星也; 大澤 志津江; 高松 敦子; 井垣 達吏

  生命科学系学会合同年次大会 2017年度, Dec. 2017

  
• Individual cell-based model for cell population considering cell-cell and cell-matrix adhesion

  西川 星也; 高松 敦子

  第55回日本生物物理学会年会, Sep. 2017

  
• Simulation of apical extrusion during cell competition using individual cell-based model

  Seiya Nishikawa; Erika Ishihara; Hiroshi Nishina; Atsuko Takamatsu

  3rd International Symposium on Cell Competition Cell Competition in Development and Cancer, Aug. 2017

  
• 不揃いな回転繊毛が引き起こす位相同期の流体力学的な理解に向けて

  奥村圭司; 西川星也; 大森俊宏; 石川拓司; 高松敦子

  CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」第8回数理デザイン道場, Jun. 2017

  
• 細胞死と代償性増殖を考慮した細胞増殖の数理モデルによる解析

  西川 星也; 高松 敦子

  第6回細胞競合コロキウム, Mar. 2017

  
• ノード繊毛の長さと配置に対する位相同期の安定性

  奥村圭司; 西川星也; 大森俊宏; 石川拓司; 高松敦子

  CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」第５回領域会議, Dec. 2016

  
• 非対称配置による同質な3繊毛モデルでの位相同期

  奥村 圭司; 西川 星也; 大森 俊宏; 石川 拓司; 高松 敦子

  日本物理学会 2016年秋季大会, Sep. 2016

  
• Fate after ‘cell competition’ depending on initial states in tumor-suppressor system

  西川 星也; 馬場 翔子; 大澤 志津江; 井垣 達吏; 高松 敦子

  The 2016 (26th) annual meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology, Sep. 2016

  
• Asymmetry of Arrangement Induces Phase Synchronization in Mouse Node Cilia

  Keiji Okumura; Seiya Nishikawa; Toshihiro Omori; Takuji Ishikawa; Atsuko Takamatsu

  26th IUPAP International conference on Statistical Physics, Jul. 2016

  
• Mathematical and experimental analysis of fate after “cell competition”

  Seiya Nihikawa; Shoko Baba; Ohsawa Shizue; Tatsushi Igaki; Atsuko Takamatsu

  10th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology and SMB Annual Meeting, Jul. 2016

  
• ３繊毛の回転運動モデルにおける配置の非対称性に起因した位相同期

  奥村圭司; 西川星也; 大森俊宏; 石川拓司; 高松敦子

  CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」第６回数理デザイン道場, Jun. 2016

  
• 遺伝学と理論的アプローチによる細胞競合機構の解析

  馬場 翔子; 西川 星也; 高松 敦子; 大澤 志津江; 井垣 達吏

  第5回細胞競合コロキウム, Mar. 2016

  
• 数理モデルによる細胞競合現象の運命予測

  西川 星也; 馬場 翔子; 大澤 志津江; 井垣 達吏; 高松 敦子

  第5回細胞競合コロキウム, Mar. 2016

  
• Agent-based modelを用いた細胞競合現象のシミュレーション

  西川 星也; 高松 敦子

  第28回自律分散システム・シンポジウム, Jan. 2016

  
• 遺伝学と理論的アプローチによる細胞競合機構の解析

  馬場 翔子; 大澤 志津江; 西川 星也; 高松 敦子; 井垣 達吏

  日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会 88回・38回, Dec. 2015

  
• 2繊毛モデルにおける同期のパラメータ依存性

  奥村 圭司; 西川 星也; 大森 俊宏; 石川 拓司; 高松 敦子

  日本物理学会 2015年秋季大会, Sep. 2015

  
• Mathematical analysis of fate after cell competition

  Seiya Nishikawa; Atsuko Takamatsu

  1st International Symposium on Cell Competition Cell Competition in Development and Cancer, Sep. 2015

  
• A mathematical model for “cell competition” considering a delayed interaction effect

  Seiya Nishikawa; Atsuko Takamatsu

  2015 Joint Meeting of JSMB and CJK Colloquium on Mathematical Biology, Aug. 2015

  
• ３繊毛モデルにおける配置と同期の関係

  奥村圭司; 西川星也; 大森俊宏; 石川拓司; 高松敦子

  CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」第４回数理デザイン道場, Jun. 2015

  
• 細胞社会を支える適者生存システム 細胞競合の分子基盤とその役割 細胞競合の数理モデル 上皮細胞群境界における捕食者-被食者相互作用

  西川 星也; 高松 敦子

  日本細胞生物学会大会講 67回, Jun. 2015

  
• 流体的相互作用する繊毛回転運動のモデル化と同期解析

  奥村 圭司; 西川 星也; 大森 俊宏; 石川 拓司; 高松 敦子

  日本物理学会 2015年第７０回年次大会, Mar. 2015

  
• 細胞競合現象の理解に向けた数理モデルによる取り組み

  西川 星也; 高松 敦子

  第4回細胞競合コロキウム, Mar. 2015

  
• ３繊毛系の力学的モデルと同期解析

  奥村圭司; 西川星也; 大森俊宏; 石川拓司; 高松敦子

  CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」第３回数理デザイン道場, Oct. 2014

  
• A Mathematical Model for Cell-Cell Interaction at Interface

  Seiya Nishikawa; Atsuko Takamatsu

  New Challenges in Complex Systems Science, Oct. 2014

  
• A Mathematical Model for “Cell Competition”

  Seiya Nishikawa; Atsuko Takamatsu

  Joint Annual Meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology and the Society for Mathematical Biology,, Jun. 2014

  
• Lotka-Volterra competition modelに基づく細胞競合モデル

  西川 星也; 高松 敦子; 大澤 志津江; 井垣 達吏

  第23回日本数理生物学会, Sep. 2013

  
• 粒子モデルを用いた上皮性組織の変形条件の数理解析

  西川 星也

  2021年度日本数理生物学会年会

  

External funds: Kakenhi

• １細胞から細胞集団までの競合的コミュニケーションが組織全体に及ぼす力学的作用

  Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)

  Transformative Research Areas, Section (III)

  The University of Tokyo

  西川 星也

  From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2026, Granted

  細胞競合;連続体モデル;パターン形成;定量生物学;理論生物学

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-24H01394/
• 競合的コミュニケーションと細胞集団-細胞間相互作用の協調システムの解明

  Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)

  Transformative Research Areas, Section (III)

  The University of Tokyo

  西川 星也

  From 16 Jun. 2022, To 31 Mar. 2024, Project Closed

  細胞競合;連続体モデル;パターン形成;数理モデル;格子モデル;定量生物学;理論生物学

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-22H05619/

Education

Teaching subject(s)

• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Data Analysis Practice II

  N812, Fall, Institute for Liberal Arts and Sciences, 2
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Introductory Statistics

  N801, Spring, Institute for Liberal Arts and Sciences, 2
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Overview of Data Science

  G205, Spring, Institute for Liberal Arts and Sciences, 2
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Mathematical, Statistical and Computational Biology for Expe rimental Biologists

  M344, Year-long, Institute for Liberal Arts and Sciences, 1
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Cutting-edge Life Sciences

  M229, Fall, Institute for Liberal Arts and Sciences, 1
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Beginning Science

  1025, Spring, Graduate School of Biostudies, 1
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Cutting-edge Life Sciences

  5014, Fall, Graduate School of Biostudies, 1
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Mathematical, Statistical and Computational Biology for Experimental Biologists

  1034, Year-long, Graduate School of Biostudies, 1