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Kitabatake, Makoto

Institute for Life and Medical Sciences (LiMe) Assistant Professor

Kitabatake, Makoto
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    Last Updated :2025/05/27

    Basic Information

    Affiliated programs (koza)

    • Graduate School of Science, 生物科学専攻 生物物理学系, 助教

    Professional Memberships

    • 日本RNA学会
    • 日本分子生物学会

    Academic Degree

    • 修士（理学）(京都大学)
    • 博士（理学）(京都大学)

    Research History

    • From 2002, To 2004
      京都大学 研究員
    • From 2004
      - 京都大学 助手
    • From 2002, To 2002
      理化学研究所 リサーチアソシエイト
    • From 1999, To 2002
      理化学研究基礎科学 特別研究員
    • From 1998, To 1999
      イェール大学 特別研究員
    • From 1996, To 1998
      学術振興会 海外特別研究員（米国Yale大学）

    Language of Instruction

    • English

    ID,URL

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      Last Updated :2025/05/27

      Research

      Research Topics, Overview of the research

      • Research Topics

        Quality control mechanism of biomolecules

      • Overview of the research

        Proteins and RNAs in the cells often form a stable complex. An error in any components of a complex can kill the function of the complex. Using S. cerevisiae ribosome as a model, we are trying to reveal the molecular mechanism that eliminates such nonfunctional complexes from the cell.

      Research Interests

      • リボソーム
      • RNA
      • 品質管理
      • 分子認識
      • RNA
      • quality control

      Research Areas

      • Life sciences, Molecular biology

      Papers

      • Quick and affordable DNA cloning by reconstitution of Seamless Ligation Cloning Extract using defined factors.
        Alexander Y Liu; Hiroto Koga; Chihiro Goya; Makoto Kitabatake
        Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms, 03 May 2023
        Access this paper :
      • ISG20 and nuclear exosome promote destabilization of nascent transcripts for spliceosomal U snRNAs and U1 variants
        Takahito Kawamoto; Rei Yoshimoto; Ichiro Taniguchi; Makoto Kitabatake; Mutsuhito Ohno
        Genes to Cells, Jan. 2021, Peer-reviewed
      • Translational Control of Sox9 RNA by mTORC1 Contributes to Skeletogenesis
        Takashi Iezaki; Tetsuhiro Horie; Kazuya Fukasawa; Makoto Kitabatake; Yuka Nakamura; Gyujin Park; Yuki Onishi; Kakeru Ozaki; Takashi Kanayama; Manami Hiraiwa; Yuka Kitaguchi; Katsuyuki Kaneda; Takayuki Manabe; Yasuhito Ishigaki; Mutsuhito Ohno; Eiichi Hinoi
        Stem Cell Reports, 10 Jul. 2018, Peer-reviewed
        Access this paper :
      • Ribosomal protein uS7/Rps5 serine-223 in protein kinase-mediated phosphorylation and ribosomal small subunit maturation.
        Makoto Tomioka; Mitsugu Shimobayashi; Makoto Kitabatake; Mutsuhito Ohno; Yasunori Kozutsumi; Shogo Oka; Hiromu Takematsu
        Scientific reports, 19 Jan. 2018, Peer-reviewed
        Access this paper :
      • Transport Granules Bound with Nuclear Cap Binding Protein and Exon Junction Complex Are Associated with Microtubules and Spatially Separated from eIF4E Granules and P Bodies in Human Neuronal Processes.
        Dan O Wang; Kensuke Ninomiya; Chihiro Mori; Ayako Koyama; Martine Haan; Makoto Kitabatake; Masatoshi Hagiwara; Kazuhiro Chida; Shin-Ichiro Takahashi; Mutsuhito Ohno; Naoyuki Kataoka
        Frontiers in molecular biosciences, 2017, Peer-reviewed
      • Crt10 directs the cullin-E3 ligase Rtt101 to nonfunctional 25S rRNA decay
        Tomoko Sakata; Kotaro Fujii; Mutsuhito Ohno; Makoto Kitabatake
        BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Jan. 2015, Peer-reviewed
        Access this paper :
      • Random mutagenesis of yeast 25S rRNA identify bases critical for 60S subunit structural integrity and function.
        Nemoto N; Udagawa T; Chowdhury W; Kitabatake M; Hiraishi H; Wang S; Singh CR; Brown SJ; Ohno M; Asano K
        Translation, Sep. 2013, Peer-reviewed
      • 40S subunit dissociation and proteasome-dependent RNA degradation in nonfunctional 25S rRNA decay
        Kotaro Fujii; Makoto Kitabatake; Tomoko Sakata; Mutsuhito Ohno
        EMBO JOURNAL, May 2012, Peer-reviewed
        Access this paper :
      • Site-specific incorporation of 4-Iodo-l-phenylalanine through opal suppression
        Koichiro Kodama; Hiroshi Nakayama; Kensaku Sakamoto; Seketsu Fukuzawa; Takanori Kigawa; Takashi Yabuki; Makoto Kitabatake; Koji Takio; Shigeyuki Yokoyama
        JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, Aug. 2010, Peer-reviewed
      • Insights into tRNA-Dependent Amidotransferase Evolution and Catalysis from the Structure of the Aquifex aeolicus Enzyme
        Jing Wu; Weishu Bu; Kelly Sheppard; Makoto Kitabatake; Suk-Tae Kwon; Dieter Soell; Janet L. Smith
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Aug. 2009, Peer-reviewed
      • A role for ubiquitin in the clearance of nonfunctional rRNAs
        Kotaro Fujii; Makoto Kitabatake; Tomoko Sakata; Atsumi Miyata; Mutsuhito Ohno
        GENES & DEVELOPMENT, Apr. 2009, Peer-reviewed
      • [Quality control of ribosomal RNAs].
        M. Kitabatake; K. Fujii; M. Ohno
        Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme, 2009, Peer-reviewed
      • Protein synthesis in Escherichia coli with mischarged tRNA
        B Min; M Kitabatake; C Polycarpo; J Pelaschier; G Rraczniak; B Ruan; H Kobayashi; S Namgoong; D Soll
        JOURNAL OF BACTERIOLOGY, Jun. 2003, Peer-reviewed
      • Escherichia coli glutamyl-tRNA reductase - Trapping the thioester intermediate
        S Schauer; S Chaturvedi; L Randau; J Moser; M Kitabatake; S Lorenz; E Verkamp; WD Schubert; T Nakayashiki; M Murai; K Wall; HU Thomann; DW Heinz; H Inokuchi; D Soll; D Jahn
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Dec. 2002, Peer-reviewed
      • Site-specific incorporation of an unnatural amino acid into proteins in mammalian cells
        K Sakamoto; A Hayashi; A Sakamoto; D Kiga; H Nakayama; A Soma; T Kobayashi; M Kitabatake; K Takio; K Saito; M Shirouzu; Hirao, I; S Yokoyama
        NUCLEIC ACIDS RESEARCH, Nov. 2002, Peer-reviewed
      • Indolmycin resistance of Streptomyces coelicolor A3(2) by induced expression of one of its two tryptophanyl-tRNA synthetases
        M Kitabatake; K Ali; A Demain; K Sakamoto; S Yokoyama; D Soll
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Jun. 2002, Peer-reviewed
      • A mutant Escherichia coli tyrosyl-tRNA synthetase utilizes the unnatural amino acid azatyrosine more efficiently than tyrosine
        F Hamano-Takaku; T Iwama; S Saito-Yano; K Takaku; Y Monden; M Kitabatake; D Soll; S Nishimura
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Dec. 2000, Peer-reviewed
      • A dual-specificity aminoacyl-tRNA synthetase in the deep-rooted eukaryote Giardia lamblia
        S Bunjun; C Stathopoulos; D Graham; B Min; M Kitabatake; AL Wang; CC Wang; CP Vivares; LM Weiss; D Soll
        PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, Nov. 2000, Peer-reviewed
      • Ancient adaptation of the active site of tryptophanyl-tRNA synthetase for tryptophan binding
        M Praetorius-Ibba; N Stange-Thomann; M Kitabatake; K Ali; Soll, I; CW Carter; M Ibba; D Soll
        BIOCHEMISTRY, Oct. 2000, Peer-reviewed
      • Cysteine biosynthesis pathway in the archaeon Methanosarcina barkeri encoded by acquired bacterial genes?
        M Kitabatake; MW So; DL Tumbula; D Soll
        JOURNAL OF BACTERIOLOGY, Jan. 2000, Peer-reviewed
      • Cysteinyl-tRNA formation: the last puzzle of aminoacyl-tRNA synthesis
        T Li; DE Graham; C Stathopoulos; PJ Haney; H Kim; U Vothknecht; M Kitabatake; KW Hong; G Eggertsson; AW Curnow; W Lind; Celic, I; W Whitman; D Soll
        FEBS LETTERS, Dec. 1999, Peer-reviewed
      • Cloning of a gene from Escherichia coli that confers resistance to fosmidomycin as a consequence of amplification
        S Fujisaki; S Ohnuma; T Horiuchi; Takahashi, I; S Tsukui; Y Nishimura; T Nishino; M Kitabatake; H Inokuchi
        GENE, Oct. 1996, Peer-reviewed
      • Genetic analysis of functional connectivity between substrate recognition domains of Escherichia coli glutaminyl-tRNA synthetase
        M Kitabatake; M Ibba; KW Hong; D Soll; H Inokuchi
        MOLECULAR AND GENERAL GENETICS, Oct. 1996, Peer-reviewed
      • Cloning of a gene from Escherichia coli that confers resistance to fosmidomycin as a consequence of amplification
        S Fujisaki; S Ohnuma; T Horiuchi; Takahashi, I; S Tsukui; Y Nishimura; T Nishino; M Kitabatake; H Inokuchi
        GENE, Oct. 1996, Peer-reviewed
      • 10Sa RNA is associated with 70S ribosome particles in Escherichia coli
        Y Komine; M Kitabatake; H Inokuchi
        JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, Mar. 1996, Peer-reviewed
      • 10Sa RNA complements the temperature-sensitive phenotype caused by a mutation in the phosphoribosyl pyrophosphate synthetase (prs) gene in Escherichia coli
        H Ando; M Kitabatake; H Inokuchi
        GENES & GENETIC SYSTEMS, Feb. 1996, Peer-reviewed
      • A TRANSFER-RNA-LIKE STRUCTURE IS PRESENT IN 10SA RNA, A SMALL STABLE RNA FROM ESCHERICHIA-COLI
        Y KOMINE; M KITABATAKE; T YOKOGAWA; K NISHIKAWA; H INOKUCHI
        PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, Sep. 1994, Peer-reviewed
      • A SIMPLIFIED METHOD FOR GENERATING STEP-WISE DELETIONS USING PCR
        M KITABATAKE; H INOKUCHI
        GENE, Jan. 1993, Peer-reviewed

      Misc.

      • 市販の酵素を混ぜるだけの相同組換えDNAクローニング
        Alexander Y. Liu; 古賀大翔; 合屋智尋; 北畠 真
        実験医学, Mar. 2024, Invited, Corresponding author
      • Development of a batch culture system that works for a long period of time, using a combination of quorum sensing, lysis system, and mechanism for recycling dead E. coli.
        Ryohei Ishibashi; Issei Mihara; Hayato Mitoma; Junnosuke Abe; Misaki Tsuchida; Taku Fukuoka; Ryu Sekikawa; Taiyo Hayashi; Montanez Marjana; Kento Kiriyama; Yuta Inagaki; Haru Okamoto; Shiko Kanai; Rei Suzawa; Taiki Odo; Knut Woltjen; Makoto Kitabatake
        MBSJ 2023, Dec. 2023, Corresponding author
      • Quick and affordable DNA cloning by reconstitution of Seamless Ligation Cloning Extract (SLiCE) using defined factors
        Alexander Y. Liu; Hiroto Koga; Chihiro Goya; Makoto Kitabatake
        MBSJ 2023, Dec. 2023, Corresponding author
      • 機能不全リボソーム品質管理機構25S NRDにおけるプロテアソーム標的タンパク質の探索
        浜島 りな; 酒井 朗恵; 藤井 耕太郎; 北畠 真; 大野 睦人
        第5回リボソームミーティング、新潟大学、9月13日ー9月14日, Sep. 2018
      • リボソームの品質管理25S NRDはリン酸化酵素CK2により制御されている
        北畠 真; 鎌田 宏美; 佐野 広大; 大野 睦人
        第5回リボソームミーティング、新潟大学、9月13日ー9月14日, Sep. 2018
      • 機能不全 25S rRNA 分解機構におけるプロテアソーム標的因子の探索
        浜島 りな; 酒井 朗恵; 藤井 耕太郎; 北畠 真; 大野 睦人
        第20回日本RNA学会、ホテルフクラシア大阪ベイ（大阪）、7月9日−7月11日, Jul. 2018
      • リボソームの品質管理におけるリン酸化酵素CK2の役割
        鎌田 宏美; 佐野 広大; 北畠 真; 大野 睦人
        第20回日本RNA学会、ホテルフクラシア大阪ベイ（大阪）、7月9日−7月11日, Jul. 2018
      • Novel factor involved in the quality control of eukaryotic ribosomes
        KITABATAKE Makoto
        4th Ribosome Meeting, Osaka Medical University, 9/17-9/18, 2016, Sep. 2016, Peer-reviewed
      • Selective ubiquitination and degradation of defective 60S particles
        Kitabatake, M; Sakata, T; Ohno, M
        RNA2016 satellite-symposium, Kyoto, Jun. 2016, Invited
      • A bridge that links an E3 ubiquitin ligase complex and nonfunctional 60S ribosomal particles.
        KITABATAKE Makoto; SAKATA Tomoko; OHNO Mutsuhito
        RNA2016、京都国際会議場、6月28日-7月2日, Jun. 2016, Peer-reviewed
      • Quality Control of Eukaryotic Ribosomes
        KITABATAKE Makoto
        18th Tokyo RNA Club, Jan. 2016, Peer-reviewed, Invited
      • 真核生物60Sリボソームの品質管理とストレス応答経路との関わり
        北畠真
        第3回リボソームミーティング、宮崎、3月17日-18日, Mar. 2015
      • Crt10 directs the cullin-E3 ligase Rtt101 to nonfunctional 25S rRNA decay
        Tomoko Sakata; Kotaro Fujii; Mutsuhito Ohno; Makoto Kitabatake
        BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Jan. 2015, Peer-reviewed
        Access this misc :
      • 真核生物リボソームRNAの機能を検査し,不良品を分解する共通のメカニズム
        北畠真; 佐野広大; 坂田知子; 大野睦人
        第36回日本分子生物学会年会、神戸市、2013年12月4日, Dec. 2013
      • リボソームの機能調節と疾患 II.リボソームRNAの転写後修飾とアセンブリー II‐4 リボソームの品質管理機構~選択的分解から修復まで
        北畠真
        生化学, Oct. 2013, Invited
      • 真核生物リボソームの品質管理
        北畠真
        第2回リボソームミーティング、東京農工大、2013年3月29日, Mar. 2013
      • 40S subunit dissociation and proteasome-dependent RNA degradation in nonfunctional 25S rRNA decay
        Makoto Kitabatake; Kotaro Fujii; Tomoko Sakata; Mutsuhito Ohno
        The 9th International Conference on Ribosome Synthesis, Banff, August 22-26 ( 2012), Aug. 2012
      • 40S subunit dissociation and proteasome-dependent RNA degradation in nonfunctional 25S rRNA decay
        Makoto Kitabatake; Kotaro Fujii; Tomoko Sakata; Mutsuhito Ohno
        The 17th Annual Meeting of the RNA Society, Ann Arbor, May29-June3, 2012, Jul. 2012
      • 真核生物リボソームの品質管理に関わる新たな因子の探索
        佐野広大; 北畠真; 大野睦人
        第14 回日本RNA 学会年会、仙台市、2012 年7月18-20日, Jul. 2012
      • 機能不全リボソームRNA の分解においてたんぱく質分解経路の果たす役割
        北畠真; 藤井耕太郎; 坂田知子; 大野睦人
        第12 回 日本蛋白質科学会年会、名古屋市、2012年6月20-22日, Jun. 2012, Invited
      • 機能不全リボソームの分解に関わるE3ユビキチンリガーゼ複合体の解析
        坂田知子; 北畠真; 藤井耕太郎; 大野睦人
        第1回リボソームミーティング、広島市、2012 年3 月16 日, Mar. 2012
      • 機能不全RNA の分解においてクンパク質分解経路の果たす役割
        藤井耕太郎; 北畠真; 坂田知子; 酒井朗恵; 大野睦人
        第1回リボソームミーティング、広島市、2012 年3 月16 日, Mar. 2012
      • 真核生物リボソームの品質管理
        北畠真; 藤井耕太郎; 坂田知子; 酒井朗恵; 大野睦人
        第1回リボソームミーティング、広島市、2012 年3 月16 日, Mar. 2012
      • 真核生物におけるリボソームRNA の品質管理のメカニズム
        北畠真; 藤井耕太郎; 坂田知子; 酒井朗恵; 大野睦人
        第34 回日本分子生物学会年会, 横浜市,2011年12月13-16日, Dec. 2011
      • Nonfunctional rRNA decay functionally requires proteasome activity.
        Fujii K; Kitabatake M; Sakata T; Sakai T; Ohno M
        第34 回日本分子生物学会年会, 横浜市, 2011年12月13-16日, Dec. 2011
      • Characterization of a degradation intermediate of the nonfunctional ribosome.
        Sakai T; Fujii K; Kitabatake M; Ohno M
        第34 回日本分子生物学会年会, 横浜市, 2011年12月13-16日, Dec. 2011
      • Nonfunctional rRNA decay functionally requires proteasome activity.
        KITABATAKE Makoto
        NTU-JST Joint Meeting on RNA and Biofunctions-Asia Studies, Taiwan, Nov.10, 2011, Nov. 2011
      • Unraveling the Molecular Mechanism of Nonfunctional 25 S rRNA Decay: Proteasome-Dependent Step-wise Degradation of Mutant rRNAs in S. cerevisiae.
        Kitabatake M; Fujii K; Sakata T; Sakai T; Ohno M
        The 16th Annual Meeting of the RNA Society, Kyoto, Japan, Jun 14-19,2011., Jun. 2011
      • マウス細胞内における28S rRNA 上に生じた紫外線損傷の修復
        宮田淳美; 北畠真; 鈴木健夫; 小林洋平; 坂田知子; 米原伸; 森和俊; 鈴木勉; 大野睦人
        RNA フロンティア ミーティング2011 、大府市,2011 年8 月30 日-9 月1 日, 2011, Peer-reviewed
      • 真核生物における機能不全リボソームの選択的分解
        北畠真; 藤井耕太郎; 酒井朗恵; 坂田知子; 大野睦人
        第33回分子生物学会・第83回生化学会、神戸、2010, Dec. 2010, Invited
      • リボソームRNAの品質管理におけるユビキチンの役割~DNA修復との接点~
        北畠真; 藤井耕太郎; 坂田知子; 酒井朗恵; 大野睦人
        第39回日本環境変異原学会大会, Oct. 2010, Invited
      • 翻訳阻害剤等によるリボソーム複合体のユビキチン化の解析
        坂田知子; 北畠真; 大野睦人
        第12 回日本RNA 学会年会, 東京,2010 年7 月27-29 日, Jul. 2010
      • 機能不全リボソームが分解される仕組み
        北畠真; 藤井耕太郎; 酒井朗恵; 大野睦人
        第12 回日本RNA学会年会、東京、2010年7月27-29日, Jul. 2010
      • Distinct ubiquitinations of ribosomal particles caused by translation elongation inhibitors.
        Sakata T; Kitabatake M; Ohno M
        The 15th Annual Meeting of the RNA Society, University of Washington, Seattle Jun 22-26. 2010, Jun. 2010
      • Multistep RNA degradation mechanism in nonfunctional 25S rRNA decay.
        Fujii K; Kitabatake M; Ohno M
        The 15th Annual Meeting of the RNA Society, University of Washington, Seattle Jun 22-26. 2010, Jun. 2010
      • Biochemical purification and characterization of nonfunctional mutant ribosomes.
        Kitabatake M; Fujii K; Sakata T; Miyata A; Ohno M
        The 15th Annual Meeting of the RNA Society, University of Washington, Seattle Jun 22-26. 2010, Jun. 2010
      • Biosynthesis and quality control of ribosomes
        KITABATAKE Makoto
        実験医学, Jun. 2010, Invited
      • Selective Degradation of nonfunctional ribosomal particles.
        北畠真; 藤井耕太郎; 酒井朗恵; 大野睦人
        第12 回日本RNA 学会年会, 東京,2010年7 月27-29 日, 2010, Peer-reviewed
      • 機能不全rRNA の品質管理機構~ユビキチン-プロテアソーム系の関わり
        藤井耕太郎; 坂田知子; 宮田淳美; 北畠真; 大野睦人
        第82回生化学会, 神戸, 2009年12月9-12日, Dec. 2009
      • リボソームRNAの品質管理
        北畠真; 藤井耕太郎; 大野睦人
        蛋白質 核酸 酵素, Dec. 2009, Invited
      • リボソームRNAの品質管理におけるユビキチンの新たな役割
        北畠真; 藤井耕太郎; 坂田知子; 宮田淳美; 大野睦人
        第32回分子生物学会、横浜、2009, Sep. 2009, Invited
      • Selective degradation of nonfunctional ribosomal protein in S.cerevisiae.
        Sakata T; Kitabatake M; Fujii K; Miyata A; Ohno M
        The 8th International Conference on Ribosome Synthesis, Regensburg, Germany Aug 26-30, 2009, Aug. 2009
      • A Role for Ubiquitin in the Clearance of nonfunctional rRNAs
        Makoto Kitabatake; Kotaro Fujii; Tomoko Sakata; Atsumi Miyata; Mutsuhito Ohno
        The 14th Annual Meeting of the RNA Society, UW-Madison, 5/26-31, 2009, Jun. 2009
      • A role for ubiquitin in the clearance of nonfunctional rRNAs
        Kotaro Fujii; Makoto Kitabatake; Tomoko Sakata; Atsumi Miyata; Mutsuhito Ohno
        GENES & DEVELOPMENT, Apr. 2009
      • 出芽酵母における機能不全リボソーム蛋白質の選択的分解
        坂田知子; 北畠真; 大野睦人
        第31 回日本分子生物学会、神戸、2008 年12 月9-12 日, Dec. 2008
      • 出芽酵母におけるrRNAの品質管理機構
        藤井耕太郎; 北畠真; 大野睦人
        第30回日本分子生物学会、横浜、2007年12月11日-15日, Dec. 2007
      • A comprehensive analysis of miRNA expression during human cell cycle progression
        McCloskey A; Kitabatake M; Ohno M
        20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress, Kyoto, June 18-23,2006., Jun. 2006
      • 放線菌の持つ2つのトリプトファニルtRNA合成酵素 インドールマイシン耐性の分子機構
        北畠真; ALI K; DEMAIN A; 横山茂之; SOELL D
        第3回日本RNA学会, Aug. 2001
      • グルタミルtRNA合成酵素のグルタミン酸認識メカニズム
        北畠真; 関根俊一; 濡木理; 坂本健作; 横山茂之
        第23回日本分子生物学会、神戸市、2000年12月13日-16日, Nov. 2000
      • 放線菌トリプトファニルtRNA合成酵素のクローニングと解析 インドールマイシン耐性の分子機構
        北畠真; ALI K; DEMAIN A; 横山茂之; SOELL D
        第2回日本RNA学会, Jul. 2000
      • トリプトファニルtRNA合成酵素を標的とした抗生物質indolmycinの作用機構
        北畠真; YIN Y W; ALI K; IBBA M P; CARTER C W JR; SOELL D
        第1回日本RNA学会, Aug. 1999
      • 大腸菌dnaY株からの新奇な温度感受性変異株
        中野宏昭; 中屋敷徹; 北畠真; 井口八郎
        第19回日本分子生物学会、札幌、8月26日-30日, Aug. 1996
      • 10Sa RNAによる温度感受性変異の相補
        北畠真; 中屋敷徹; 中野宏昭; 井口八郎
        第19回日本分子生物学会、札幌、8月26日-30日, Aug. 1996
      • 10Sa RNAによって相補される大腸菌の温度感受性変異株
        中野宏昭; 北畠真; 中屋敷徹; 井口八郎
        第18回日本分子生物学会、名古屋、12月6日-9日, Dec. 1995
      • 大腸菌su+6とsu+1株からの新奇な温度感受性変異株
        井口八郎; 中野宏昭; 北畠真; 中屋敷徹
        第18回日本分子生物学会、名古屋、12月6日-9日, Dec. 1995
      • su+2 am tRNAGinに対するチャージング効率の変化した大腸菌グルタミニルtRNA合成酵素の変異株
        北畠真; 井口八郎
        第18回日本分子生物学会、名古屋、12月6日-9日, Dec. 1995
      • 大腸菌10Sa RNAの機能
        安東英明; 北畠真; 井口八郎
        第17回日本分子生物学会、神戸、12月13日-16日, Dec. 1994
      • 大腸菌グルタミニルtRNA合成酵素の遺伝学的解析
        北畠真; 井口八郎
        第17回日本分子生物学会、神戸、12月13日-16日, Dec. 1994
      • 大腸菌のヘミン透過性変異株の解析
        北畠真; 西村耕一; 井口八郎
        第17回日本分子生物学会、神戸、12月13日-16日, Dec. 1994
      • サプレッサーtRNAの成熟に関わる因子の研究
        北畠真; 井口八郎
        第16回日本分子生物学会、幕張、12月16日-19日, Dec. 1993
      • 大腸菌10SaRNAの機能
        安東英明; 北畠真; 井口八郎
        第16回日本分子生物学会、幕張、12月16日-19日, Dec. 1993

      Presentations

      • 出芽酵母のリボソーム合成経路における品質管理
        北畠 真
        第８８回酵母研究会, 05 Mar. 2021, Invited
      • 真核生物リボソームの品質管理に関わる新たな因子の探索
        北畠真
        国立遺伝学研究所研究会「単細胞システムの細胞構築・運動・増殖機構の研究」, 25 Mar. 2014
      • 40S Subunit Dissociation and Proteasome-dependent RNA Degradation in Nonfunctional 25S rRNA Decay
        Makoto Kitabatake; Kotaro Fujii; Tomoko Sakata; Mutsuhito Ohno
        The 22nd CDB Meeting RNA Sciences in Cell and Developmental Biology II, 11 Jun. 2012
      • Selective degradation of nonfunctional ribosomal RNAs mediated by the Ubiquitin-proteasome system.
        Kitabatake M; Fujii K; Sakata T; Miyata A; Ohno M
        The 19th CDB Meeting RNA Sciences in Cell and Developmental Biology, 10 May 2010
      • リボソームの品質管理における機能不全25S rRNA の分解
        酒井朗恵; 北畠真; 藤井耕太郎; 大野睦人
        RNA フロンティアミーティング2010、静岡、2010年9 月27-29 日, 2010
      • Functional Decay of Nonfunctional 25 S rRNA Requires Proteasome Activity.
        Fujii K; Sakata T; Kitabatake M; Miyata A; Ohno M
        The 16th East Asia Joint Conference on Biomedical Research. Kyoto, Japan. Sep 13-14, 2009 ・, 2009
      • Quality Control of Ribosomal RNAs in S.cerevisiae
        Fujii K; Kitabatake M; Sakata T; Ohno M
        The 6th International Student Seminar International Symposium Kyoto, Japan March 6, 2008., 2008

      Books and Other Publications

      • mRNAの制御機構の解明と治療薬・ワクチンへの活用
        技術情報協会, Contributor, 18節 リボソームの機能不全と細胞内での検出
        技術情報協会, Feb. 2023
        Find Kyoto University's collection of books :

      Media Coverage

      • 京大生が格安反応液開発
        京都新聞社, 「京都新聞」, 夕刊 第１面, 28 Jun. 2023, Paper
      • 安価で簡便なDNAクローニング技術、京都大学の学部生研究団体が開発
        ユニバースケープ株式会社, 「大学ジャーナルONLINE」, 研究成果, 28 May 2023, Internet
      • 京大、低コストで実行できるDNAクローニング技術
        角川アスキー総合研究所, 「MIT Technology Review Japan」, 23 May 2023, Internet
      • 新しいDNAクローニング技術の開発―京大学部生研究チームの発見が契機に―
        「日本の研究.com」, 17 May 2023, Internet

      External funds: Kakenhi

      • Substrate recognition system for quality control of eukaryotic ribosome
        Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
        Basic Section 43010:Molecular biology-related
        Kyoto University
        Kitabatake Makoto
        From 01 Apr. 2019, To 31 Mar. 2024, Project Closed
        リボソーム;品質管理;ユビキチン;RNA
        https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19K06487/
      • Recognition of ribosomes damaged by vero-toxin
        Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
        Kyoto University
        Makoto Kitabatake
        From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2017, Project Closed
        リボソーム;品質管理;ユビキチン;RNA;ベロ毒素
        https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26440004/
      • Quality control system that monitors ribosomes damaged by verotoxin
        Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
        Kyoto University
        Makoto KITABATAKE
        From 01 Apr. 2012, To 31 Mar. 2014, Project Closed
        リボソーム;品質管理;RNA
        https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24657117/
      • リボソームの品質管理における機能不全ＲＮＡの認識メカニズム
        Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
        Biological Sciences
        Kyoto University
        北畠 真
        From 01 Apr. 2011, To 31 Mar. 2013, Project Closed
        リボソーム;品質管理;ユビキチン;RNA
        https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-23112710/
      • 機能不全リボソームRNAを選択的に認識する因子の同定
        Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
        Biological Sciences
        Kyoto University
        北畠 真
        From 01 Apr. 2009, To 31 Mar. 2011, Project Closed
        品質管理;リボソーム;RNA
        https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-21112511/
      • 酵母リボソームRNAの品質管理機構の研究
        Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
        Kyoto University
        北畠 真
        From 01 Apr. 2006, To 31 Mar. 2008, Project Closed
        リボソーム;RNA;品質管理;DNA損傷
        https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18770151/
      • アミノアシルtRNA合成酵素を標的とした抗生物質に対する耐性メカニズム
        Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
        特殊法人理化学研究所
        北畠 真
        From 01 Apr. 2001, To 31 Mar. 2003, Project Closed
        抗生物質耐性;アミノアシレーション;tRNA;転写制御;放線菌;分子認識;アミノアシルtRNA合成酵素
        https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13771397/
      • リボソームの品質管理における機能不全分子の識別機構
        Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
        Basic Section 43010:Molecular biology-related
        Kyoto University
        北畠 真
        From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2025, Granted
        リボソーム;品質管理;ユビキチン
        https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06080/
      list
        Last Updated :2025/05/27

        Education

        Teaching subject(s)

        • From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
          ILAS Seminar
          Z001, Spring, Institute for Liberal Arts and Sciences, 2
        • From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
          Introduction to Gene Expression
          9008, Fall, Graduate School of Science, 2
        • From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
          Molecular Genetics I
          2704, Fall, Faculty of Science, 2
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Molecular Genetics I
          2704, Fall, Faculty of Science, 2
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Introduction to Gene Expression
          9008, Fall, Graduate School of Science, 2
        • From Apr. 2013, To Mar. 2014
          The Front Line of Life Science Research I
          Spring, 全学共通科目
        • From Apr. 2014, To Mar. 2015
          The Front Line of Life Science Research I
          Spring, 全学共通科目
        • From Apr. 2015, To Mar. 2016
          The Front Line of Life Science Research I
          Spring, 全学共通科目
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Gene Expression Seminar IA
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Gene Expression Seminar IB
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Gene Expression Seminar IC
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Gene Expression Seminar ID
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Gene Expression Seminar IIA
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Gene Expression Seminar IIB
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Gene Expression Seminar IIC
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Gene Expression Seminar IID
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Gene Expression Seminar IA
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Gene Expression Seminar IB
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Gene Expression Seminar IC
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Gene Expression Seminar ID
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Gene Expression Seminar IIA
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Gene Expression Seminar IIB
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Gene Expression Seminar IIC
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Gene Expression Seminar IID
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Gene Expression Seminar IA
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Gene Expression Seminar IB
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Gene Expression Seminar IC
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Gene Expression Seminar ID
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Gene Expression Seminar IIA
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Gene Expression Seminar IIB
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Gene Expression Seminar IIC
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Gene Expression Seminar IID
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Gene Expression Seminar IA
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Gene Expression Seminar IB
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Gene Expression Seminar IC
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Gene Expression Seminar ID
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Gene Expression Seminar IIA
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Gene Expression Seminar IIB
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Gene Expression Seminar IIC
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Gene Expression Seminar IID
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Molecular Genetics I
          Fall, 理学部
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Gene Expression Seminar IA
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Gene Expression Seminar IB
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Gene Expression Seminar IC
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Gene Expression Seminar ID
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Gene Expression Seminar IIA
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Gene Expression Seminar IIB
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Gene Expression Seminar IIC
          Spring, 理学研究科
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Gene Expression Seminar IID
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Introduction to Gene Expression
          Fall, 理学研究科
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Molecular Genetics I
          Fall, 理学部
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Introduction to Gene Expression
          Fall, 理学研究科

        Other educational achievements

        • As a supervisor of the undergraduate research group iGEM Kyoto, I have been supervising the research activities of the team: from 2013 as an advisor, from 2014 as an instructor and from 2016 as PI. 2016, 2019, 2021 and 2023 at the giant jamboree in Boston, the team was a gold medal winner; in 2019, 2021 and 2023, in addition, the team was nominated to category award(s).
        list
          Last Updated :2025/05/27

          Administration

          School management (title, position)

          • From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2025
            京都大学化学物質専門委員会
          • From 01 Apr. 2021, To 31 Mar. 2023
            京都大学化学物質専門委員会

          Faculty management (title, position)

          • From 01 Apr. 2023
            広報委員会　委員
          • From 01 Apr. 2024
            医生物学研究所　研究支援室　広報ユニット
          • From 01 Apr. 2024
            医生物学研究所　研究支援室　共同研究拠点推進ユニット
          • From 01 Apr. 2019
            化学物質管理委員会　委員長
          • From 01 Apr. 2019
            安全衛生委員会　委員
          • From 01 Apr. 2018, To 31 Mar. 2023
            共同利用機器等委員会　委員
          • From 01 Apr. 2010, To 31 Mar. 2012
            図書委員会　委員
          • From 01 Apr. 2011, To 31 Mar. 2012
            共同利用機器等委員会　委員
          • From 01 Apr. 2011, To 31 Mar. 2013
            化学物質管理委員会　委員
          • From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2019
            共同利用機器等委員会　委員
          • From 01 Apr. 2013, To 31 Mar. 2015
            化学物質管理委員会　委員
          • From 01 Apr. 2015, To 31 Mar. 2017
            化学物質管理委員会　委員長
          • From 01 Apr. 2015, To 31 Mar. 2019
            安全衛生委員会　委員
          • From 01 Oct. 2016, To 31 Mar. 2018
            （旧ウイルス研）共同利用機器等委員会　委員
          • From 01 Oct. 2016, To Mar. 2018
            安全衛生委員会　委員
          • From 01 Oct. 2016, To 31 Mar. 2019
            化学物質管理委員会　委員

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