Maki, Koichiro(Institute for Life and Medical Sciences (LiMe)) | Activity Database on Education and Research, Kyoto University

Maki, Koichiro

Institute for Life and Medical Sciences (LiMe) Associate Professor

Last Updated :2025/05/29

Basic Information

Affiliated programs (koza)

Graduate School of Engineering, マイクロエンジニアリング専攻バイオメカニクス, 助教

Graduate School of Biostudies, 高次生命科学専攻生体適応力学分野, 准教授

Graduate School of Medicine, 医科学専攻バイオメカニクス, 助教

Graduate School of Medicine, 医学専攻バイオメカニクス, 助教

Faculty

生命科学研究科高次生命科学専攻生体適応力学, 助教

医学研究科医学専攻バイオメカニクス, 助教

医学研究科医科学専攻バイオメカニクス, 助教

工学研究科マイクロエンジニアリング専攻バイオメカニクス, 助教

Professional Memberships

From Feb. 2021, To Present
日本基礎老化学会

From Nov. 2020, To Present
日本分子生物学会

From Oct. 2012, To Present
日本生物物理学会

From Sep. 2012, To Present
日本機械学会

From Sep. 2015, To Present
European Society of Biomechanics

Academic Degree

修士（工学）(京都大学)

博士（工学）(京都大学)

Academic Resume (Graduate Schools)

京都大学, 大学院工学研究科修士課程マイクロエンジニアリング専攻, 修了

京都大学, 大学院工学研究科博士後期課程マイクロエンジニアリング専攻, 修了

Academic Resume (Undergraduate School/Majors)

京都大学, 工学部物理工学科, 卒業

High School

High School
私立洛星高等学校

Research History

From Apr. 2025, To Present
Kyoto University, 医生物学研究所, 准教授

From Oct. 2019, To Mar. 2024
Kyoto University, 医生物学研究所, 助教

From Apr. 2018, To Sep. 2019
ヘルシンキ大学, 客員研究員

From Apr. 2017, To Sep. 2019
日本学術振興会, 特別研究員PD

From Apr. 2014, To Mar. 2017
日本学術振興会, 特別研究員DC1

From Aug. 2016, To Oct. 2016
コロンビア大学, 客員研究員

From Jun. 2016, To Aug. 2016
シェフィールド大学, 客員研究員

ID,URL

ORCID ID
0000-0002-7607-2903
J-Global ID
202001011911311001

Website(s) (URL(s))

https://mechanobioeng.org/

researchmap URL

https://researchmap.jp/koichiro-maki

Last Updated :2025/05/29

Research

Research Interests

パターン形成

原子間力顕微鏡

メカノバイオロジー

クロマチン構造

組織・細胞・分子の力学計測

細胞分化・老化

Mechanical engineering

Single-molecule biophysics

Biomechanics

Research Areas

Life sciences, Genomics

Life sciences, Biophysics

Life sciences, Cell biology

Manufacturing technology (mechanical, electrical/electronic, chemical engineering), Machine materials and mechanics

Life sciences, Biomedical engineering

Nanotechnology/Materials, Nanobioscience

Papers

Super-resolution imaging reveals nucleolar encapsulation by single-stranded DNA
Koichiro Maki; Jumpei Fukute; Taiji Adachi
Journal of Cell Science, 29 Aug. 2024, Peer-reviewed, Lead author, Corresponding author

Chondrocyte hypertrophy in the growth plate promotes stress anisotropy affecting long bone development through chondrocyte column formation
Yuka Yokoyama; Yoshitaka Kameo; Junko Sunaga; Koichiro Maki; Taiji Adachi
Bone, Feb. 2024, Peer-reviewed

Sclerostin modulates the degree of mineralization and the stiffness profile of the fibrocartilaginous enthesis for mechanical tissue integrity
Shinsei Yambe; Yuki Yoshimoto; Kazutaka Ikeda; Koichiro Maki; Aki Takimoto; Shinnosuke Higuchi; Xinyi Yu; Kenta Uchibe; Shigenori Miura; Hitomi Watanabe; Tetsushi Sakuma; Takashi Yamamoto; Kotaro Tanimoto; Gen Kondoh; Denitsa Docheva; Taiji Adachi; Chisa Shukunami
bioRxiv, 15 Nov. 2023

Spatial cell fate manipulation of human pluripotent stem cells by controlling the microenvironment using photocurable hydrogel
Zhe Wang; Akira Numada; Fumi Wagai; Yusuke Oda; Masatoshi Ohgushi; Koichiro Maki; Taiji Adachi; Mototsugu Eiraku
Development, 15 Mar. 2024, Peer-reviewed

The nucleolar shell provides anchoring sites for DNA untwisting
Jumpei Fukute; Koichiro Maki; Taiji Adachi
Communications Biology, Jan. 2024, Peer-reviewed, Corresponding author
Access this paper :

Cyclic stretching enhances angiocrine signals at liver bud stage from hPSCs in 2-dimensional culture
Koki Yoshimoto; Koichiro Maki; Taiji Adachi; Ken-ichiro Kamei
Tissue Engineering Part A, 07 Dec. 2023, Peer-reviewed

AFMによる１分子レベルのメカノトランスダクション機構の解明
牧功一郎; 安達泰治
生体の科学, Aug. 2019, Invited, Lead author

接着結合を介した力の感知－分子引張実験によるアプローチ－
牧功一郎; 安達泰治
高度物理刺激と生体応答, Aug. 2017, Invited, Lead author

原子間力顕微鏡による細胞・分子の力学イメージング
牧功一郎; 安達泰治
病理と臨床, Dec. 2015, Invited, Lead author

メカノセンサーシグナル
牧功一郎; 安達泰治
生体の科学, Sep. 2015, Invited, Lead author

AFMでメカノセンサ1分子を釣り上げる
牧功一郎; 安達泰治
牧功一郎、韓成雄、安達泰治, Sep. 2014, Invited, Lead author

Directionality of developing skeletal muscles is set by mechanical forces
Kazunori Sunadome; Alek Erickson; Delf Kah; Ben Fabry; Csaba Adori; Polina Kameneva; Louis Faure; Shigeaki Kanatani; Markéta Kaucká; Ivar Dehnisch Ellström; Marketa Tesarova; Tomas Zikmund; Jozef Kaiser; Steven Edwards; Koichiro Maki; Taiji Adachi; Takuya Yamamoto; Kaj Fried; Igor Adameyko
Nature Communications, May 2023, Peer-reviewed

Age-associated reduction of nuclear shape dynamics in excitatory neurons of the visual cortex
Tanita Frey; Tomonari Murakami; Koichiro Maki; Takumi Kawaue; Ayaka Sugai; Naotaka Nakazawa; Taiji Adachi; Mineko Kengaku; Kenichi Ohki; Yukiko Gotoh; Yusuke Kishi
Aging Cell, 22 Jun. 2023, Peer-reviewed

Vasculature atrophy causes a stiffened microenvironment that augments epidermal stem cell differentiation in aged skin
Ryo Ichijo; Koichiro Maki; Mio Kabata; Teruasa Murata; Arata Nagasaka; Seiichiro Ishihara; Hisashi Haga; Tetsuya Honda; Taiji Adachi; Takuya Yamamoto; Fumiko Toyoshima
Nature Aging, 11 Jul. 2022, Peer-reviewed

Hydrostatic pressure prevents chondrocyte differentiation through heterochromatin remodeling
Koichiro Maki; Michele M. Nava; Clementine Villeneuve; Minki Chang; Katsuko S. Furukawa; Takashi Ushida; Sara A. Wickström
Journal of Cell Science, 27 Jan. 2021, Peer-reviewed, Lead author

Talin is required to increase stiffness of focal molecular complex in its early formation process
Nobuhiko Nakao; Koichiro Maki; Mohammad R K Mofrad; Taiji Adachi
Biochemical and Biophysical Research Communications, 20 Oct. 2019, Peer-reviewed
Access this paper :

Real-time TIRF observation of vinculin recruitment to stretched α-catenin by AFM
Koichiro Maki; Sung-Woong Han; Yoshinori Hirano; Shigenobu Yonemura; Toshio Hakoshima; Taiji Adachi
Scientific Reports, 25 Jan. 2018, Peer-reviewed, Lead author
Access this paper :

Hyaluronic acid selective anchoring to the cytoskeleton: An atomic force microscopy study
Stefania Marcotti; Koichiro Maki; Gwendolen C Reilly; Damien Lacroix; Taiji Adachi
PLoS ONE, 2018, Peer-reviewed
Access this paper :

Nano-mechanical characterization of tension-sensitive helix bundles in talin rod
Koichiro Maki; Nobuhiko Nakao; Taiji Adachi
Biochemical and Biophysical Research Communications, 04 Mar. 2017, Peer-reviewed, Lead author
Access this paper :

Mechano-adaptive sensory mechanism of α-catenin under tension
Koichiro Maki; Sung-Woong Han; Yoshinori Hirano; Shigenobu Yonemura; Toshio Hakoshima; Taiji Adachi
Scientific Reports, 25 Apr. 2016, Peer-reviewed, Lead author
Access this paper :

Beta-Catenin as a Tension Transmitter Revealed by AFM Nanomechanical Testing
Koichiro Maki; Sung-Woong Han; Taiji Adachi
Cellular and Molecular Bioengineering, Mar. 2015, Peer-reviewed, Lead author
Access this paper :

Presentations

NPM分子との相互作用を介したDNAアンツイスティング
長谷川太一; 牧功一郎; 福手淳平; 安達泰治
日本機械学会第35回バイオフロンティア講演会, Dec. 2024

張力作用下におけるヌクレオソーム展開の初期挙動にヒストン末端切断が与える影響
スウシキン; 牧功一郎; 大友瞳; 安達泰治
日本機械学会第35回バイオフロンティア講演会, Dec. 2024

老化骨組織中の骨細胞核内DNAに対するヒストン結合量評価
大友瞳; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第35回バイオフロンティア講演会, Dec. 2024

DNA untwisting and melting under intranuclear mechanical forces
Koichiro Maki
Cell, Developmental, and Systems Biology Course Meeting, Nov. 2024

Looking into mechanical forces in a cell nucleus
牧功一郎
京都大学医生物学研究所LiMeセミナー, Oct. 2024

Exploring mechano-regulation of DNA untwisting and melting
牧功一郎
京都大学医生物学研究所リトリート, Sep. 2024

The regulatory mechanism of long bone development through mechanical stress anisotropy promoted by chondrocyte hypertrophy
Yuka Yokoyama; Yoshitaka Kameo; Junko Sunaga; Koichiro Maki; Taiji Adachi
Society for Developmental Biology 83rd Annual Meeting, Jul. 2024

Mechanical behaviors of DNA-protein complex in cell nucleus
牧功一郎
第25回京都大学生命科学研究科シンポジウム, Jun. 2024

Mechanical stress analysis in the growth plate toward understanding the mechanism of long bone development
Yuka Yokoyama; Yoshitaka Kameo; Junko Sunaga; Koichiro Maki; Taiji Adachi
EMBO workshop on Limb Development, Jun. 2024

DNA underwinding mechanism in mammalian cells
Jumpei Fukute; Koichiro Maki; Taiji Adachi
EuroEvoDevo2024, Jun. 2024

Mechanical behaviors of DNA-protein complexes
Koichiro Maki
KSME Bioengineering Conference, Apr. 2024, Invited

Single-stranded DNA encapsulates the nucleolus
Koichiro Maki
Global Young Scientist Summit 2024, Jan. 2024, Invited

マルチスケール力学計測とバイオロジーの接点
牧功一郎
BioAFM User Meeting, Invited

流れ付与による核内DNAの二次元展開
上林凌也; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第36回バイオエンジニアリング講演会, May 2024

一本鎖 DNA とヒストン H1 が形成する液滴状態に静水圧変化が及ぼす影響
蟹川修; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第36回バイオエンジニアリング講演会, May 2024

DNA アンツイスティング機構の解明に向けた in vitro 実験系の構築
長谷川太一; 福手淳平; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第36回バイオエンジニアリング講演会, May 2024

Histone clippingに着目したヌクレオソームの力学挙動解析
ZOU ZHIXIN; 大友瞳; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第36回バイオエンジニアリング講演会, May 2024

マウス骨細胞におけるHistone tail切断機構の検討
大友瞳; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第36回バイオエンジニアリング講演会, May 2024

静水圧負荷がクロマチン構造変化を導くひとつの道筋：分子複合体に着目して
牧功一郎
日本機械学会第36回バイオエンジニアリング講演会, May 2024, Invited

DNA underwinding in the mechanical environment of the nucleolus
Jumpei Fukute; Koichiro Maki; Taiji Adachi
EMBO Workshop on Nuclear Mechano-Genomics, Apr. 2024

Cyclic stretching enhances angiocrine signals at liver bud stage from human pluripotent stem cells
Koki Yoshimoto; Satoshi Imamura; Koichiro Maki; Taiji Adachi; Ken-Ichiro Kamei
The 20th Biostudies Student Symposium, Mar. 2024

AFM を用いた生体組織・単一分子の力学計測
牧功一郎
日本顕微鏡学会 SPM研究会, Feb. 2024, Invited

細胞の分解と安定化
牧功一郎
JST-CREST「分解・劣化・安定化の精密材料科学」, Jan. 2024

DNA underwinding mechanism in mammalian cells
Jumpei Fukute; Koichiro Maki; Taiji Adachi
EuroEvoDevo2024, Jan. 2024

DNA untwisting and melting by in situ super-resolution microscopy
Koichiro Maki; Jumpei Fukute; Taiji Adachi
EMBO Workshop on Chromatin Dynamics and Nuclear Organization in Genome Maintenance, Jun. 2024

Encapsulation of cell nucleolus by single-stranded DNA
Koichiro Maki; Jumpei Fukute; Taiji Adachi
21st International Union for Pure and Applied Biophysics and 62nd Biophysics Society of Japan, Jan. 2024

Single-stranded DNA-based condensates encapsulate the cell nucleolus
Koichiro Maki
Global Young Scientists Summit 2024, Jan. 2024, Invited

骨形態形成中の軟骨カラム形成を制御する組織内応力場の力学解析
横山優花; 亀尾佳貴; 須長純子; 牧功一郎; 安達泰治
第34回バイオフロンティア講演会, Dec. 2023

ニューロンにおける核ダイナミクス
岸雄介; Tanita Frey; 長田侑; 牧功一郎; 安達泰治; 後藤由季子
第46回日本分子生物学会年会, Dec. 2023

骨細胞ネットワーク形成機構の解明を目指した培養モデルの構築
杉本浩太郎; 須長純子; 牧功一郎; 安達泰治
第34回バイオフロンティア講演会, Dec. 2023

筋細胞の方向を制御する生体力学的なメカニズム
Sunadome, K; Erickson, A-G; Kah, D; Fabry, B; Adori, C; Kanatani, S; Kameneva, P; Faure, L; Kaucka, M; Ellström, I.D; Tesarova, M; Zikmund, T; Kaiser, J; Edwards, S; Maki, K; Adachi, T; Yamamoto, K; Adameyko, I
第61回日本生物物理学会年会, Nov. 2023

Mechanical behaviors of nuclear chromatin in chondrocytes under hydrostatic pressure
牧功一郎
日本生物物理学会第61回年会, Nov. 2023, Invited

細胞核内におけるDNA underwindingの力学的理解
福手淳平; 牧功一郎; 安達泰治
日本生物物理学会第61回年会, Nov. 2023

Hydrostatic pressure induces heterochromatin remodeling in chondrocytes
Koichiro Maki; Katsuko Furukawa; Takashi Ushida
6th Japan-Switzerland Workshop on Biomechanics, Sep. 2023, Invited

In situ imaging of single-stranded DNA in a cell nucleus
Koichiro Maki; Jumpei Fukute; Taiji Adachi
6th Japan-Switzerland Workshop on Biomechanics, Sep. 2023, Invited

骨組織の超薄切片に対するナノ力学特性評価
牧功一郎
JST-CREST「分解・劣化・安定化の精密材料科学」, Jul. 2023

前駆骨細胞株を用いた in vitro 石灰化におけるカルシウム塩の蛍光イメージング
濱崎彩葉; 牧功一郎; 須長純子; 安達泰治
日本機械学会第35回バイオエンジニアリング講演会, Jun. 2023

分子引張試験によるヌクレオソームの力学挙動解析
スウシキン; 福手淳平; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第35回バイオエンジニアリング講演会, Jun. 2023

核小体におけるunderwound DNAの力学的発生メカニズムの検証
福手淳平; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第35回バイオエンジニアリング講演会, Jun. 2023

核内クロマチンを介した力感知機構の理解に向けて”
牧功一郎
第75回日本細胞生物学会大会, Jun. 2023, Invited

AFM-based mechanical mapping of ultrathin-sectioned bone tissue and the future perspective
牧功一郎
JST-CREST「分解・劣化・安定化の精密材料科学」, May 2023

AFMを用いた骨細胞核内のナノ構造イメージング
竹本祐也; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第33回バイオフロンティア講演会, Dec. 2022

細胞核内におけるunderwound DNAの蛍光イメージング
福手淳平; 牧功一郎; 安達泰治
日本生物物理学会第60回年会, Sep. 2022

一本鎖DNAは核小体周囲に凝集体を形成する
牧功一郎; 福手淳平; 安達泰治
日本生物物理学会第60回年会, Sep. 2022

A novel fluorescent technique for single-stranded DNA in cell nucleus: toward understanding biomechanical behaviors of genomic DNA
Koichiro Maki; Jumpei Fukute; Takashi Suetake; Taiji Adachi
The 9th World Congress of Biomechanics, Jul. 2022, Invited

In vitro 三次元骨細胞ネットワークにおける力学刺激応答の細胞間伝播特性
杉本浩太郎; 牧功一郎; 須長純子; 中島友紀; 安達泰治
日本機械学会第34回バイオエンジニアリング講演会v, Jun. 2022

細胞核内における一本鎖 DNA 凝集体のイメージング
牧功一郎
日本機械学会第34回バイオエンジニアリング講演会, Jun. 2022, Invited

Polymer & mechanicsで考える細胞間張力伝達
牧功一郎
Olympus-Bruker共催ウェビナー『光学顕微鏡&AFMから見えてくるバイオの世界』, Feb. 2022, Invited

コラーゲン埋没環境における骨芽細胞様細胞遊走の3次元イメージング
山口大輝; 須長純子; 牧功一郎; 中島友紀; 安達泰治
日本機械学会第32回バイオフロンティア講演会, Jan. 2022

Analysis of osteocytic network formation focusing on intercellular communication via cell junctions between osteocytes
Hiroki Yamaguchi; Koichiro Maki; Junko Sunaga; Taiji Adachi
The 11th Asian-Pacific Conference on Biomechanics, Dec. 2021

Morphological imaging of osteocytes and bone matrix in aged murine bone
Yuya Takemoto; Koichiro Maki; Taiji Adachi
The 11th Asian-Pacific Conference on Biomechanics, Dec. 2021

Chromatin unfolding and PAR chain synthesis in DNA damage response
Takashi Suetake; Koichiro Maki; Taiji Adachi
The 11th Asian-Pacific Conference on Biomechanics, Dec. 2021

Exploring mechanical effects of DNA twisting on RNA polymerase II activities
Jumpei Fukute; Koichiro Maki; Taiji Adachi
The 11th Asian-Pacific Conference on Biomechanics, Dec. 2021

A microfluidic platform to promote hepatic differentiation from human pluripotent stem cells with mechanical stretching stimulation
Koki Yoshimoto; Jiandong Yang; Yoshikazu Hirai; Koichiro Maki; Taiji Adachi; Ken-ichiro Kamei
Symposium on Materials, Mimics, and Microfluidics: Engineering Tools for Mechanobiology (3M 2021), Jul. 2021

コラーゲン埋没環境における骨芽細胞様細胞遊走の3次元イメージング
山口大輝; 牧功一郎; 須長純子; 安達泰治
日本機械学会第33回バイオエンジニアリング講演会, Jun. 2021

老化マウス骨組織における骨細胞・骨基質の形態イメージング
竹本祐也; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第33回バイオエンジニアリング講演会, Jun. 2021

DNA 損傷応答における PAR 鎖の合成とクロマチン脱凝縮
末竹崇志; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第33回バイオエンジニアリング講演会, Jun. 2021

トポイソメラーゼ活性の阻害による遺伝子転写の活性化
福手淳平; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第33回バイオエンジニアリング講演会, Jun. 2021

静水圧作用下における軟骨細胞のクロマチンリモデリングが細胞周期に及ぼす効果
牧功一郎
日本機械学会第33回バイオエンジニアリング講演会, Jun. 2021, Invited

原子間力顕微鏡により探るメカノセンサ１分子の力学挙動
牧功一郎
第73回日本細胞生物学会大会, Jun. 2021, Invited

DNA超らせん形成が核内クロマチンのアクセシビリティに与える効果
福手淳平; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第31回バイオフロンティア講演会, Dec. 2020

ATP 枯渇条件における細胞核内 DNA のライブイメージング
福手淳平; 牧功一郎; 安達泰治
第43回日本バイオレオロジー学会年会, May 2020

AFMによる力学計測
牧功一郎
新学術領域「脳構築における発生時計と場の連携」, Jan. 2020

Time dependent change in nano-mechanical properties of nascent focal complex
Nobuhiko Nakao; Koichiro Maki; Taiji Adachi
The 8th World Congress of Biomechanics, Jul. 2018

Hydrostatic pressure-induced DNA breaks in chondrocytes and its relationship with chromatin architecture
Koichiro Maki; Katsuko Furukawa; Takashi Ushida
The Joint Meeting of ESCHM-ISB-ISCH Joint Meeting of ESCHM-ISB-ISCH, Jul. 2018

DNA breaks in chondrocyte progenitor cells under cyclic hydrostatic pressure
Koichiro Maki; Katsuko Furukawa; Takashi Ushida
The 8th World Congress of Biomechanics, Jul. 2018

形成初期における細胞接着分子構造体のナノ引張特性
仲尾信彦; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第30回バイオエンジニアリング講演会, Dec. 2017

静水圧負荷が軟骨細胞のDNA損傷に及ぼす影響に関する検討
牧功一郎; 古川克子; 牛田多加志
日本機械学会第30回バイオエンジニアリング講演会, Dec. 2017

Outside-in シグナルを介して成熟する接着分子複合体のナノ力学挙動解析
仲尾信彦; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会 2017年度年次大会, Sep. 2017

Analysis of mechanical behaviors of maturating focal complex by nano-tensile testing
Nobuhiko Nakao; Koichiro Maki; Taiji Adachi
The 5th Switzerland-Japan Workshop on Biomechanics, Sep. 2017

Monitoring vinculin association with α-catenin under tension by AFM-TIRF system
Koichiro Maki; Taiji Adachi
The 5th Switzerland-Japan Workshop on Biomechanics, Sep. 2017

Mechanical characterization of tension-sensitive helix bundles in talin rod by nano-tensile testing
Koichiro Maki; Nobuhiko Nakao; Taiji Adachi
23rd Congress of the European Society of Biomechanics, Jul. 2017

Nanofishing of hyaluronic acid on murine osteoblast precursor cells
Stefania Marcotti; Koichiro Maki; Taiji Adachi; Gwendolen C. Reilly; Damien Lacroix
The Orthopaedic Research Society Annual Meeting, May 2017

Nano-mechanical measurement of integrin-based focal complex using AFM
Nobuhiko Nakao; Koichiro Maki; Taiji Adachi
CDB Symposium 2017, Mar. 2017

Adaptive mechanosensory mechanism of α-catenin revealed by single-molecule AFM and TIRFM
Koichiro Maki; Taiji Adachi
The 9th Cell, Developmental, and Systems Biology Course Meeting, Feb. 2017

Biomechanical characterization of α-catenin by single-molecule approaches using AFM and TIRFM
Koichiro Maki; Taiji Adachi
The 15th International Student Seminar (ISS), Feb. 2017

細胞間接着結合におけるαカテニン分子の力-構造-機能ダイナミクス
牧功一郎; 安達泰治
日本生物物理学会第54回年会, Nov. 2016

Actin remodeling in nascent focal adhesion explored by integrin nanofishing
Nobuhiko Nakao; Koichiro Maki; Taiji Adachi
IGER International Symposium on "Now in actin study: Motor protein research reaching a new stage, Nov. 2016

ECMに刺激されたインテグリン-アクチン構造体の成熟過程におけるナノ力学特性評価
仲尾信彦; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第27回バイオフロンティア講演会, Oct. 2016

原子間力顕微鏡を用いた張力感知分子のナノフィッシングおよび構造イメージング
牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第27回バイオフロンティア講演会, Oct. 2016

Mechano-adaptive conformational change of α-catenin to sense and transmit intercellular force
Koichiro Maki; Taiji Adachi
22nd Congress of the European Society of Biomechanics, Jul. 2016

αカテニンに対するビンキュリン結合のAFM分子イメージング
広橋佑紀; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第28回バイオエンジニアリング講演会, Jan. 2016

細胞間張力を感知するα-カテニンの力学的分子適応メカニズム
牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会第28回バイオエンジニアリング講演会, Jan. 2016

立体構造変化を伴う接着構成分子間のAFM相互作用測定
広橋佑紀; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会2015年度年次大会, Sep. 2015

Mechanical roles of β-catenin for AJ-mediated force transmission
Koichiro Maki; Sung-Woong Han; Taiji Adachi
The 8th Asian-Pacific Conference on Biomechanics, Sep. 2015

Single-molecule AFM for exploring the force responses of adherens junction proteins
Koichiro Maki; Taiji Adachi
iCeMS International Symposium -Hierarchical Dynamics in Soft Materials and Biological Matter, Sep. 2015

Nanomechanical behaviors of β-catenin revealed by single-molecule AFM
Koichiro Maki; Sung-Woong Han; Taiji Adachi
21st Congress of the European Society of Biomechanics, Jul. 2015

張力感知分子のアンフォールディング経路探索
牧功一郎; 韓成雄; 安達泰治
文部科学省生命動態システム科学推進拠点事業「多次元定量イメージングに基づく数理モデルを用いた動的生命システムの革新的研究体系の開発・教育拠点」生命動態の分子メカニズムと数理, Mar. 2015

分子間相互作用測定におけるAFMフォースカーブ解析手法の検討
広橋佑紀; 牧功一郎; 安達泰治
日本機械学会関西支部第90期定時総会講演会, Mar. 2015

メカノセンサー生体分子のAFMナノフィッシング
安達泰治; 牧功一郎
医工学フォーラム特別講演会2014, Feb. 2015

構成ドメインの力学的安定性に依存したα-カテニンのアンフォールディング
牧功一郎; 韓成雄; 安達泰治
日本機械学会第27回バイオエンジニアリング講演会, Jan. 2015

AFM nanofishing of mechano-sensitive molecules at adherens junction
Taiji Adachi; Koichiro Maki; Sung-Woong Han
The 4th Japan-Switzerland Workshop on Biomechanics, Sep. 2014

Single-molecule analysis of adherens junction-mediated mechanotransduction using AFM
Taiji Adachi; Koichiro Maki; Sung-Woong Han
Frontiers of Single Cell Analysis, Sep. 2014

Single-molecule mechanical unfolding of α-catenin as an intercellular mechanosensor
Koichiro Maki; Sung-Woong Han; Taiji Adachi
Frontiers of Single Cell Analysis, Sep. 2014

Nanomechanical behaviors of α-catenin as a mechanotransduction switch revealed by AFM nanofishing
Koichiro Maki; Sung-Woong Han; Taiji Adachi
7th World Congress of Biomechanics, Jul. 2014

α-Catenin switches mechanotransduction ‘on’ under tensile force–based on single-molecule force spectroscopy using AFM
Koichiro Maki; Sung-Woong Han; Taiji Adachi
International symposium on mechanobiology 2014, May 2014

Fishing a single biomolecule : α-catenin as a mechanical switch for intercellular mechanotransduction
牧功一郎; 韓成雄; 安達泰治
文部科学省生命動態システム科学推進拠点事業「多次元定量イメージングに基づく数理モデルを用いた動的生命システムの革新的研究体系の開発・教育拠点」リトリート, Jan. 2014

張力作用下におけるα-カテニンのナノ力学挙動解析
牧功一郎; 韓成雄; 安達泰治
日本機械学会第26回バイオエンジニアリング講演会, Jan. 2014

張力作用下におけるα-カテニンのナノ力学挙動解析
牧功一郎; 韓成雄; 安達泰治
京都大学再生医科学研究所若手発表会, Dec. 2013

AFMを用いた接着結合分子の力学挙動解析
韓成雄; 牧功一郎; 安達泰治
日本生物物理学会第51回年会, Oct. 2013

原子間力顕微鏡を用いたα-カテニンの単分子力学測定
牧功一郎; 韓成雄; 安達泰治
日本機械学会 2013年度年次大会, Sep. 2013

Mechanical properties of β-catenin revealed by SMFS
Koichiro Maki; Sung-Woong Han; Taiji Adachi
The 7th Asia Pacific Conference of Biomechanics, Aug. 2013

Linear-elastic behaviors of β-catenin revealed by AFM-based SMFS
Koichiro Maki; Sung-Woong Han; Taiji Adachi
Proceeding of the 35th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC'13), Jul. 2013

AFM nanofishing of adherens junction component molecules
牧功一郎; 韓成雄; 安達泰治
文部科学省科学研究費補助金新学術領域研究「ミクロからマクロへ階層を超える秩序形成のロジック」第4回班会議, Jun. 2013

AFMナノフィッシングによる接着結合構成タンパク質の力学的挙動解析
牧功一郎; 韓成雄; 安達泰治
文部科学省科学研究費補助金新学術領域研究「細胞機能と分子活性の多次元蛍光生体イメージング」第3回vivid workshop, Feb. 2013

細胞は「力」で会話する
牧功一郎
京都大学附属博物館レクチャーシリーズ No.107, Dec. 2012, Invited

β-カテニンのAFM単分子力学測定
牧功一郎; 韓成雄; 安達泰治
日本機械学会第23回バイオフロンティア講演会, Oct. 2012

Evaluation for mechanical behavior for nanospring protein in adherens junction using AFM
Sung-Woong Han; Koichiro Maki; Taiji Adachi
Proceeding of the 12th International Discussion & Conference on Nano Interface Controlled Electronic Devices, Oct. 2012

AFMを用いたβ-カテニンの力学的挙動解析
牧功一郎; 韓成雄; 安達泰治
日本生物物理学会第50回年会, Sep. 2012

Nanospring behaviors of β-catenin in adherens junctions
牧功一郎; 韓成雄; 安達泰治
文部科学省科学研究費補助金新学術領域研究「ミクロからマクロへ階層を超える秩序形成のロジック」第3回班会議, Jun. 2012

Evaluation for mechanical properties of nanospring protein using AFM
Koichiro Maki; Sung-Woong Han; Taiji Adachi
Proceeding of International Symposium on Cellular Mechanobiology, Mar. 2012

接着結合における張力伝達要素としてのβ-カテニン
牧功一郎; 韓成雄; 安達泰治
日本生物物理学会第53回年会

Books and Other Publications

タンパク質分子の引張挙動からゲノムの静水圧動態まで～力に対する未知なる生体応答を探して～
京機会短信－研究最前線, Jul. 2024

丁寧に、大胆に、よきー例に（京都大学創立１２５周年記念寄稿）
京機会短信, Sep. 2022

フィンランドでの自然と時間
牧功一郎
日本機械学会誌 My メカライフ, Jul. 2020

ヘルシンキでの研究生活のご紹介
牧功一郎
日本機械学会バイオエンジニアリング部門報（ニュースレター）, Sep. 2019

Comprehensive Biomaterials II
Joint work
Elsevier, 11 Aug. 2017
Find Kyoto University's collection of books :

Media Coverage

Understanding how DNA is untwisted inside cells
京都大学プレスリリース, https://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research-news/2024-01-24, Jan. 2024, Internet

First person – Koichiro Maki (Interview)
Journal of Cell Science, Jan. 2021

The JPK NanoWizard® AFM is used at Kyoto University to study mechanotransduction mechanisms
Bruker Nano GmbH, Sponsored Posts, Mar. 2018, Others

京大の「実は！」Vol.17 「京大生の実は！－FILE.2 京大生の勉学事情に迫る！－」
京都大学広報, Apr. 2014, Pr

External funds: Kakenhi

Elucidating mechano-sensing mechanisms by transcriptional machineries
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Basic Section 90110:Biomedical engineering-related
Kyoto University
Koichiro Maki
From 01 Apr. 2020, To 31 Mar. 2023, Project Closed
バイオメカニクス;ＤＮＡ;力学的構造変化;クロマチン;一本鎖ＤＮＡ;力学計測;原子間力顕微鏡;生体医工学;遺伝子転写;１本鎖DNA;DNA損傷-修復;細胞老化;トルク;転写;分子構造変化
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20K20180/

骨細胞のクロマチン動態を介した力感知メカニズムの解明
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Basic Section 90110:Biomedical engineering-related
Kyoto University
牧功一郎
From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2026, Granted
バイオメカニクス;クロマチン;ゲノムDNA;超解像度顕微鏡
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23K17196/

Last Updated :2025/05/29

Education

Teaching subject(s)

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
機械製作実習
Fall, 工学部

From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
機械製作実習
Fall, 工学部

From 01 Apr. 2021, To 31 Mar. 2022
機械製作実習
Fall, 工学部

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Mechanical and System Engineering Laboratory 1
5056, Spring, Faculty of Engineering, 1

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Mechanical and System Engineering Laboratory 1
5056, Fall, Faculty of Engineering, 1

From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
Mechanical and System Engineering Laboratory 1
5056, Spring, Faculty of Engineering, 1

From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
Mechanical and System Engineering Laboratory 1
5056, Fall, Faculty of Engineering, 1

From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
Mechanical and System Engineering Laboratory 1
5056, Fall, Faculty of Engineering, 1

From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
Mechanical and System Engineering Laboratory 1
5056, Spring, Faculty of Engineering, 1

From Apr. 2021, To Mar. 2022
Mechanical and System Engineering Laboratory 1
Spring, 工学部

From Apr. 2021, To Mar. 2022
Mechanical and System Engineering Laboratory 1
Fall, 工学部

From Apr. 2021, To Mar. 2022
Mechanical and System Engineering Laboratory 2
Spring, 工学部

Last Updated :2025/05/29

Administration

Faculty management (title, position)

From 01 Apr. 2023
男女共同参画推進委員会　委員

From 01 Apr. 2023
共同利用機器等委員会　委員

From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2025
病院構内実験排水系管理委員会

From 01 Apr. 2022
化学物質管理委員会　委員

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