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Maki, Koichiro

Institute for Life and Medical Sciences (LiMe) Assistant Professor

Maki, Koichiro
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    Last Updated :2024/02/27

    Basic Information

    Affiliated programs (koza)

    • Graduate School of Engineering, マイクロエンジニアリング専攻 バイオメカニクス, 助教
    • Graduate School of Biostudies, 高次生命科学専攻 生体適応力学分野, 助教
    • Graduate School of Medicine, 医科学専攻 バイオメカニクス, 助教
    • Graduate School of Medicine, 医学専攻 バイオメカニクス, 助教

    Faculty

    • 生命科学研究科 高次生命科学専攻 生体適応力学, 助教
    • 医学研究科 医学専攻 バイオメカニクス, 助教
    • 医学研究科 医科学専攻 バイオメカニクス, 助教
    • 工学研究科 マイクロエンジニアリング専攻 バイオメカニクス, 助教

    Professional Memberships

    • From Feb. 2021, To Present
      日本基礎老化学会
    • From Nov. 2020, To Present
      日本分子生物学会
    • From Oct. 2012, To Present
      日本生物物理学会
    • From Sep. 2012, To Present
      日本機械学会
    • From Sep. 2015, To Present
      European Society of Biomechanics

    Academic Degree

    • 修士(工学)(京都大学)
    • 博士(工学)(京都大学)

    Academic Resume (Graduate Schools)

    • 京都大学, 大学院工学研究科修士課程マイクロエンジニアリング専攻, 修了
    • 京都大学, 大学院工学研究科博士後期課程マイクロエンジニアリング専攻, 修了

    Academic Resume (Undergraduate School/Majors)

    • 京都大学, 工学部物理工学科, 卒業

    High School

    • High School

      私立洛星高等学校

    Research History

    • From Apr. 2018, To Sep. 2019
      ヘルシンキ大学, 客員研究員
    • From Apr. 2017, To Sep. 2019
      日本学術振興会, 特別研究員PD
    • From Apr. 2014, To Mar. 2017
      日本学術振興会, 特別研究員DC1
    • From Aug. 2016, To Oct. 2016
      コロンビア大学, 客員研究員
    • From Jun. 2016, To Aug. 2016
      シェフィールド大学, 客員研究員

    ID,URL

    Website(s) (URL(s))

    researchmap URL

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      Last Updated :2024/02/27

      Research

      Research Interests

      • パターン形成
      • 原子間力顕微鏡
      • メカノバイオロジー
      • クロマチン構造
      • 組織・細胞・分子の力学計測
      • 細胞分化・老化
      • Mechanical engineering
      • Single-molecule biophysics
      • Biomechanics

      Research Areas

      • Life sciences, Genomics
      • Life sciences, Biophysics
      • Life sciences, Cell biology
      • Manufacturing technology (mechanical, electrical/electronic, chemical engineering), Machine materials and mechanics
      • Life sciences, Biomedical engineering
      • Nanotechnology/Materials, Nanobioscience

      Papers

      • Chondrocyte hypertrophy in the growth plate promotes stress anisotropy affecting long bone development through chondrocyte column formation
        Yuka Yokoyama; Yoshitaka Kameo; Junko Sunaga; Koichiro Maki; Taiji Adachi
        Bone, Feb. 2024, Peer-reviewed
      • Sclerostin modulates the degree of mineralization and the stiffness profile of the fibrocartilaginous enthesis for mechanical tissue integrity
        Shinsei Yambe; Yuki Yoshimoto; Kazutaka Ikeda; Koichiro Maki; Aki Takimoto; Shinnosuke Higuchi; Xinyi Yu; Kenta Uchibe; Shigenori Miura; Hitomi Watanabe; Tetsushi Sakuma; Takashi Yamamoto; Kotaro Tanimoto; Gen Kondoh; Denitsa Docheva; Taiji Adachi; Chisa Shukunami
        bioRxiv, 15 Nov. 2023
      • Spatial cell fate manipulation of human pluripotent stem cells by controlling the microenvironment using photocurable hydrogel
        Zhe Wang; Akira Numada; Fumi Wagai; Yusuke Oda; Masatoshi Ohgushi; Koichiro Maki; Taiji Adachi; Mototsugu Eiraku
        bioRxiv, 05 Oct. 2022
      • The nucleolar shell provides anchoring sites for DNA untwisting
        Jumpei Fukute; Koichiro Maki; Taiji Adachi
        Communications Biology, Jan. 2024, Peer-reviewed, Corresponding author
      • Cyclic stretching enhances angiocrine signals at liver bud stage from hPSCs in 2-dimensional culture
        Koki Yoshimoto; Koichiro Maki; Taiji Adachi; Ken-ichiro Kamei
        Tissue Engineering Part A, 07 Dec. 2023, Peer-reviewed
      • AFMによる1分子レベルのメカノトランスダクション機構の解明
        牧功一郎; 安達泰治
        生体の科学, Aug. 2019, Invited, Lead author
      • 接着結合を介した力の感知-分子引張実験によるアプローチ-
        牧功一郎; 安達泰治
        高度物理刺激と生体応答, Aug. 2017, Invited, Lead author
      • 原子間力顕微鏡による細胞・分子の力学イメージング
        牧功一郎; 安達泰治
        病理と臨床, Dec. 2015, Invited, Lead author
      • メカノセンサーシグナル
        牧功一郎; 安達泰治
        生体の科学, Sep. 2015, Invited, Lead author
      • AFMでメカノセンサ1分子を釣り上げる
        牧功一郎; 安達泰治
        牧功一郎、韓成雄、安達泰治, Sep. 2014, Invited, Lead author
      • Directionality of developing skeletal muscles is set by mechanical forces
        Kazunori Sunadome; Alek Erickson; Delf Kah; Ben Fabry; Csaba Adori; Polina Kameneva; Louis Faure; Shigeaki Kanatani; Markéta Kaucká; Ivar Dehnisch Ellström; Marketa Tesarova; Tomas Zikmund; Jozef Kaiser; Steven Edwards; Koichiro Maki; Taiji Adachi; Takuya Yamamoto; Kaj Fried; Igor Adameyko
        Nature Communications, May 2023, Peer-reviewed
      • Age-associated reduction of nuclear shape dynamics in excitatory neurons of the visual cortex
        Tanita Frey; Tomonari Murakami; Koichiro Maki; Takumi Kawaue; Ayaka Sugai; Naotaka Nakazawa; Taiji Adachi; Mineko Kengaku; Kenichi Ohki; Yukiko Gotoh; Yusuke Kishi
        Aging Cell, 22 Jun. 2023, Peer-reviewed
      • Vasculature atrophy causes a stiffened microenvironment that augments epidermal stem cell differentiation in aged skin
        Ryo Ichijo; Koichiro Maki; Mio Kabata; Teruasa Murata; Arata Nagasaka; Seiichiro Ishihara; Hisashi Haga; Tetsuya Honda; Taiji Adachi; Takuya Yamamoto; Fumiko Toyoshima
        Nature Aging, 11 Jul. 2022, Peer-reviewed
      • Hydrostatic pressure prevents chondrocyte differentiation through heterochromatin remodeling
        Koichiro Maki; Michele M. Nava; Clementine Villeneuve; Minki Chang; Katsuko S. Furukawa; Takashi Ushida; Sara A. Wickström
        Journal of Cell Science, 11 Dec. 2020, Peer-reviewed, Lead author
      • Talin is required to increase stiffness of focal molecular complex in its early formation process
        Nobuhiko Nakao; Koichiro Maki; Mohammad R K Mofrad; Taiji Adachi
        Biochemical and Biophysical Research Communications, 20 Oct. 2019, Peer-reviewed
      • Real-time TIRF observation of vinculin recruitment to stretched α-catenin by AFM
        Koichiro Maki; Sung-Woong Han; Yoshinori Hirano; Shigenobu Yonemura; Toshio Hakoshima; Taiji Adachi
        Scientific Reports, 25 Jan. 2018, Peer-reviewed, Lead author
      • Hyaluronic acid selective anchoring to the cytoskeleton: An atomic force microscopy study
        Stefania Marcotti; Koichiro Maki; Gwendolen C Reilly; Damien Lacroix; Taiji Adachi
        PLoS ONE, 2018, Peer-reviewed
      • Nano-mechanical characterization of tension-sensitive helix bundles in talin rod
        Koichiro Maki; Nobuhiko Nakao; Taiji Adachi
        Biochemical and Biophysical Research Communications, 04 Mar. 2017, Peer-reviewed, Lead author
      • Mechano-adaptive sensory mechanism of α-catenin under tension
        Koichiro Maki; Sung-Woong Han; Yoshinori Hirano; Shigenobu Yonemura; Toshio Hakoshima; Taiji Adachi
        Scientific Reports, 25 Apr. 2016, Peer-reviewed, Lead author
      • Beta-Catenin as a Tension Transmitter Revealed by AFM Nanomechanical Testing
        Koichiro Maki; Sung-Woong Han; Taiji Adachi
        Cellular and Molecular Bioengineering, Mar. 2015, Peer-reviewed, Lead author
      • 丁寧に、大胆に、よきー例に(京都大学創立125周年記念寄稿)
        京機会 短信, Sep. 2022
      • フィンランドでの自然と時間
        牧功一郎
        日本機械学会誌 My メカライフ, Jul. 2020
      • ヘルシンキでの研究生活のご紹介
        牧功一郎
        日本機械学会 バイオエンジニアリング部門報(ニュースレター), Sep. 2019
      • Comprehensive Biomaterials II
        Joint work
        Elsevier, 11 Aug. 2017

      Media Coverage

      • Understanding how DNA is untwisted inside cells
        京都大学 プレスリリース, https://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research-news/2024-01-24, Jan. 2024, Internet
      • First person – Koichiro Maki (Interview)
        Journal of Cell Science, Jan. 2021
      • The JPK NanoWizard® AFM is used at Kyoto University to study mechanotransduction mechanisms
        Bruker Nano GmbH, Sponsored Posts, Mar. 2018, Others
      • 京大の「実は!」Vol.17 「京大生の実は! -FILE.2 京大生の勉学事情に迫る!-」
        京都大学 広報, Apr. 2014, Pr

      External funds: Kakenhi

      • Elucidating mechano-sensing mechanisms by transcriptional machineries
        Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
        Basic Section 90110:Biomedical engineering-related
        Kyoto University
        Koichiro Maki
        From 01 Apr. 2020, To 31 Mar. 2023, Project Closed
        バイオメカニクス;DNA;力学的構造変化;生体医工学;遺伝子転写;クロマチン;1本鎖DNA;DNA損傷-修復;細胞老化;トルク;転写;分子構造変化
      • 骨細胞のクロマチン動態を介した力感知メカニズムの解明
        Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
        Basic Section 90110:Biomedical engineering-related
        Kyoto University
        牧 功一郎
        From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2026, Granted
        バイオメカニクス;クロマチン;ゲノムDNA
      list
        Last Updated :2024/02/27

        Education

        Teaching subject(s)

        • From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
          Mechanical and System Engineering Laboratory 1
          5056, Spring, Faculty of Engineering, 1
        • From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
          Mechanical and System Engineering Laboratory 1
          5056, Fall, Faculty of Engineering, 1
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Mechanical and System Engineering Laboratory 1
          5056, Fall, Faculty of Engineering, 1
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Mechanical and System Engineering Laboratory 1
          5056, Spring, Faculty of Engineering, 1
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Mechanical and System Engineering Laboratory 1
          Spring, 工学部
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Mechanical and System Engineering Laboratory 1
          Fall, 工学部
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Mechanical and System Engineering Laboratory 2
          Spring, 工学部
        list
          Last Updated :2024/02/27

          Administration

          Faculty management (title, position)

          • From 01 Apr. 2023
            男女共同参画推進委員会 委員
          • From 01 Apr. 2023
            共同利用機器等委員会 委員
          • From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2025
            病院構内実験排水系管理委員会
          • From 01 Apr. 2022
            化学物質管理委員会 委員
          list
            Last Updated :2024/02/27

            Academic, Social Contribution

            Committee Memberships

            • From Apr. 2023, To Present
              京都大学医生物学研究所 共同利用機器等委員会 委員
            • From Apr. 2023, To Present
              JST-CREST 多細胞 若手の会実行委員会 幹事
            • From Nov. 2022, To Present
              京都大学医生物学研究所 男女共同参画推進委員会 委員
            • From Apr. 2022, To Present
              京都大学医生物学研究所 化学物質管理委員会 委員
            • From Apr. 2022, To Present
              日本機械学会バイオエンジニアリング部門 運営委員会 委員
            • From Apr. 2023, To Present
              京都大学 病院構内実験排水系管理委員会 委員
            • From Apr. 2023, To Present
              日本機械学会バイオエンジニアリング部門 渉外委員会 幹事
            • From Dec. 2021, To Dec. 2022
              第33回バイオフロンティア講演会実行委員会 運営委員
            • From Apr. 2021, To Apr. 2022
              京都大学医生物学研究所 HPリニューアル 責任者
            • From Apr. 2021, To Mar. 2022
              京都大学ウイルス・再生医科学研究所 教員会議 運営委員
            • From Apr. 2022, To Mar. 2023
              広報委員会 幹事, 日本機械学会バイオエンジニアリング部門
            • From Jan. 2021, To Dec. 2021
              Program Committee Secretary, 11th Asian-Pacific Conference on Biomechanics
            • From Jun. 2020, To Jun. 2021
              実行委員, 日本機械学会 第33回バイオエンジニアリング講演会

            Academic Contribution

            • オンデマンド・万歳三唱リレー(コロナ禍でのオンライン懇親会の余興)
              Planning, management, etc., session chair, etc.
              第33回バイオエンジニアリング講演会・牧功一郎, From 25 Jun. 2021, To 25 Jun. 2021

            Social Contribution

            • 細胞が力を合わせる! 「組体操」的なうごき
              Guest, Lecturer
              京都大学, 出前授業(清教学園), From Feb. 2015, To Feb. 2015
            • 生命科学の不思議と「物理」
              Guest, Lecturer
              京都大学, 出前授業(播磨高校), From Feb. 2015, To Feb. 2015
            • 科学と芸術の交差展
              Guest, Host, Edit
              牧功一郎, 科学と芸術の交差展, From Dec. 2013, To Dec. 2013
            • 細胞が使っている「ことば」
              Guest, Lecturer
              京都大学, 学びコーディネーター(七尾高校および大阪国際大和田高校), From 20 Nov. 2013
            • 細胞のチカラ
              Guest
              京都大学, アカデミックデイ, From Sep. 2013, To Sep. 2013
            • 細胞は「力」で会話する
              Guest
              京都大学附属博物館, レクチャーシリーズ, From Dec. 2012, To Dec. 2012
            • 細胞「ガ」綱引き
              Guest
              京都大学, アカデミックデイ, From Sep. 2012, To Sep. 2012

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