Toju, Hirokazu(Graduate School of Biostudies) | Activity Database on Education and Research, Kyoto University

Toju, Hirokazu

Graduate School of Biostudies Professor

Last Updated :2025/05/03

Basic Information

Professional Memberships

日本分子生物学会

THE ECOLOGICAL SOCIETY OF JAPAN

THE JAPANESE SOCIETY OF MICROBIAL ECOLOGY

Academic Degree

修士（理学）(京都大学)

博士（理学）(九州大学)

Academic Resume (Graduate Schools)

京都大学, 大学院理学研究科生物科学専攻修士課程, 修了

九州大学, 大学院理学研究府生物科学専攻博士課程, 修了

Academic Resume (Undergraduate School/Majors)

京都大学, 理学部, 卒業

High School

High School
新潟県立長岡高等学校

Research History

From Oct. 2023, To Present
Kyoto University, Graduate School of Biostudies, Professor

From Apr. 2017, To Sep. 2023
Kyoto University, Center for Ecological Research, Associate professor

From Apr. 2012, To Mar. 2017
Kyoto University, Graduate School of Human and Environmental Sciences, Assistant Professor

From Apr. 2010, To Mar. 2012
Kyoto University, Hakubi Center for Advanced Research, Assistant Professor

Last Updated :2025/05/03

Research

Research Topics, Overview of the research

Research Topics
Biodiversity
Species interactions
Ecosystem design
Sustainable agriculture
Overview of the research
Ongoing global warming has become one of the most serious environmental issues, which destabilize and threaten agriculture, human health, economics and politics on a global scale. Each year, the amount of green house gas circulating between the atmosphere and soil biosphere is much more than that emitted through human activities. This fact suggests that the basic understanding of the structure and dynamics of terrestrial ecosystems is indispensable for finding fundamental solutions for global warming and the related environmental issues.

Our aim in this project is to develop a series of new methodologies for understanding the diversity and community structure of belowground organisms and thereby construct theoretical and empirical bases for restoring forest ecosystems or designing efficient agricultural ecosystems. We are trying to integrate ecology, evolutionary biology, genomics and computer sciences in order to elucidate the “coevolutionary” interactions of belowground organisms.

Research Interests

集団遺伝学

共進化

自然選択

Research Areas

Life sciences, Ecology and environmental science

Papers

Sucrose-preferring gut microbes prevent host obesity by producing exopolysaccharides
Hidenori Shimizu; Junki Miyamoto; Keiko Hisa; Ryuji Ohue-Kitano; Hiromi Takada; Mayu Yamano; Akari Nishida; Daiki Sasahara; Yuki Masujima; Keita Watanabe; Shota Nishikawa; Sakura Takahashi; Takako Ikeda; Yuya Nakajima; Naofumi Yoshida; Chiaki Matsuzaki; Takuya Kageyama; Ibuki Hayashi; Akari Matsuki; Ryo Akashi; Seiichi Kitahama; Masako Ueyama; Takumi Murakami; Shinsuke Inuki; Junichiro Irie; Noriko Satoh-Asahara; Hirokazu Toju; Hiroshi Mori; Shinji Nakaoka; Tomoya Yamashita; Atsushi Toyoda; Kenji Yamamoto; Hiroaki Ohno; Takane Katayama; Hiroshi Itoh; Ikuo Kimura
Nature Communications, 29 Jan. 2025

Alternative stable states of microbiome structure and soil ecosystem functions
Hiroaki Fujita; Shigenobu Yoshida; Kenta Suzuki; Hirokazu Toju
Environmental Microbiome, 06 Mar. 2025

Water environmental data collection for assessment of ecosystem services for paddy fields
KATO Tasuku; KUNII Daisuke; HASHIMOTO Shizuka; YOSHIKAWA Natsuki; TOJU Hirokazu; OSAWA Takeshi; SUGIHARA Soh; KAMII Hiroyuki
Proceeding of Annual Conference, 2022

Airborne DNA reveals predictable spatial and seasonal dynamics of fungi
Nerea Abrego; Brendan Furneaux; Bess Hardwick; Panu Somervuo; Isabella Palorinne; Carlos A. Aguilar-Trigueros; Nigel Andrew; Ulyana V. Babiy; Tan Bao; Gisela Bazzano; Svetlana Bondarchuk; Timothy C. Bonebrake; Georgina Brennan; Marion Syndonia Bret-Harte; Claus Bässler; Luciano Cagnolo; Erin K. Cameron; Elodie Chapurlat; Simon Creer; D'Acqui Luigi P.; Natasha de Vere; Marie-Laure Desprez-Loustau; Michel Arnaud DONGMO KENFAK; Ida Bomholt Dyrholm Jacobsen; Brian L. Fisher; Miguel Flores de Jesus; Gregory S Gilbert; Gareth W. Griffith; Anna A. Gritsuk; Andrin Gross; Håkan Grudd; Panu Halme; Rachid Hanna; Jannik Hansen; Lars Holst Hansen; HEGBE A.D.M.T; Sarah Hill; Ian D. Hogg; Jenni Johanna Hultman; Kevin Hyde; Nicole Hynson; Natalia Ivanova; Petteri Karisto; Deirdre Kerdraon; Anastasia Knorre; Irmgard Krisai-Greilhuber; Juri Kurhinen; Masha Kuzmina; Nicolas Lecomte; Erin Lecomte; Viviana Loaiza
Nature, 10 Jul. 2024

Global Spore Sampling Project: A global, standardized dataset of airborne fungal DNA
Otso Ovaskainen; Nerea Abrego; Brendan Furneaux; Bess Hardwick; Panu Somervuo; Isabella Palorinne; Nigel Andrew; Ulyana V. Babiy; Tan Bao; Gisela Bazzano; Svetlana Bondarchuk; Timothy C. Bonebrake; Georgina L. Brennan; Syndonia Bret-Harte; Claus Bässler; Luciano Cagnolo; Erin K. Cameron; Elodie Chapurlat; Simon Creer; D'Acqui Luigi P.; Natasha de Vere; Marie-Laure Desprez-Loustau; Michel Arnaud DONGMO KENFAK; Ida Bomholt Dyrholm Jacobsen; Brian L. Fisher; Miguel Flores de Jesus; Gregory S Gilbert; Gareth W. Griffith; Anna A. Gritsuk; Andrin Gross; Håkan Grudd; Panu Halme; Rachid Hanna; Jannik Hansen; Lars Holst Hansen; HEGBE A.D.M.T; Sarah Hill; Ian D. Hogg; Jenni Johanna Hultman; Kevin D. Hyde; Nicole Hynson; Natalia Ivanova; Petteri Karisto; Deirdre Kerdraon; Anastasia Knorre; Irmgard Krisai-Greilhuber; Juri Kurhinen; Masha Kuzmina; Nicolas Lecomte; Erin Lecomte; Viviana Loaiza
Scientific Data, 30 May 2024

Leaf, root, and soil microbiomes of an invasive plant, Ardisia crenata, differ between its native and exotic ranges
Naoto Nakamura; Hirokazu Toju; Kaoru Kitajima
Frontiers in Microbiology, 22 Nov. 2023

Mycorrhizal and endophytic fungi structure forest below-ground symbiosis through contrasting but interdependent assembly processes
Mikihito Noguchi; Hirokazu Toju
Environmental Microbiome, 02 Nov. 2024
Access this paper :

Erratum to: Core microbiomes for sustainable agroecosystems (Nature Plants, (2018), 4, 5, (247-257), 10.1038/s41477-018-0139-4)
Toju, H.; Peay, K.G.; Yamamichi, M.; Narisawa, K.; Hiruma, K.; Naito, K.; Fukuda, S.; Ushio, M.; Nakaoka, S.; Onoda, Y.; Yoshida, K.; Schlaeppi, K.; Bai, Y.; Sugiura, R.; Ichihashi, Y.; Minamisawa, K.; Kiers, E.T.
Nature Plants, 2018

Soil prokaryotic and fungal biome structures associated with crop disease status across the Japan Archipelago
Hiroaki Fujita; Shigenobu Yoshida; Kenta Suzuki; Hirokazu Toju
mSphere, 23 Apr. 2024
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Deterministic and stochastic processes generating alternative states of microbiomes
Ibuki Hayashi; Hiroaki Fujita; Hirokazu Toju
ISME Communications, 05 Apr. 2023

Interaction network rewiring and species’ contributions to community-scale flexibility
Hirokazu Toju; Sayaka S Suzuki; Yuki G Baba
PNAS Nexus, 29 Feb. 2024
Access this paper :

Dynamics of species-rich predator–prey networks and seasonal alternations of core species
Sayaka S. Suzuki; Yuki G. Baba; Hirokazu Toju
Nature Ecology & Evolution, 17 Jul. 2023

Basins of attraction of microbiome structure and soil ecosystem functions
Hiroaki Fujita; Shigenobu Yoshida; Kenta Suzuki; Hirokazu Toju
25 Aug. 2022

Reframing Agricultural Policies by the Concept of Ecosystem Services
KAMII Hiroyuki; HASHIMOTO Shizuka; KATO Tasuku; YOSHIKAWA Natsuki; OSAWA Takeshi; SUGIHARA Soh; TOJU Hirokazu
Water,Land and Environmental Engineering, 2021

Core species and interactions prominent in fish-associated microbiome dynamics
Daii Yajima; Hiroaki Fujita; Ibuki Hayashi; Genta Shima; Kenta Suzuki; Hirokazu Toju
Microbiome, 20 Mar. 2023
Access this paper :

Synergistic and offset effects of fungal species combinations on plant performance
Yoshie Hori; Hiroaki Fujita; Kei Hiruma; Kazuhiko Narisawa; Hirokazu Toju
Frontiers in microbiology, 09 May 2021, Peer-reviewed
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Facilitative interaction networks in experimental microbial community dynamics
Hiroaki Fujita; Masayuki Ushio; Kenta Suzuki; Masato S. Abe; Masato Yamamichi; Yusuke Okazaki; Alberto Canarini; Ibuki Hayashi; Keitaro Fukushima; Shinji Fukuda; E. Toby Kiers; Hirokazu Toju
Frontiers in Microbiology, 21 Jan. 2023

Metagenomic analysis of ecological niche overlap and community collapse in microbiome dynamics
Hiroaki Fujita; Masayuki Ushio; Kenta Suzuki; Masato S. Abe; Masato Yamamichi; Yusuke Okazaki; Alberto Canarini; Ibuki Hayashi; Keitaro Fukushima; Shinji Fukuda; E. Toby Kiers; Hirokazu Toju
Frontiers in Microbiology, 18 Jan. 2023

Alternative stable states, nonlinear behavior, and predictability of microbiome dynamics
Hiroaki Fujita; Masayuki Ushio; Kenta Suzuki; Masato S. Abe; Masato Yamamichi; Koji Iwayama; Alberto Canarini; Ibuki Hayashi; Keitaro Fukushima; Shinji Fukuda; E.Toby Kiers; Hirokazu Toju
Microbiome, 29 Mar. 2023

Effects of source sample amount on biodiversity surveys of bacteria, fungi, and nematodes in soil ecosystems
Takuya Kageyama; Hirokazu Toju
Frontiers in Ecology and Evolution, 13 Sep. 2022

Aboveground herbivores drive stronger plant species-specific feedback than belowground fungi to regulate tree community assembly
Kohmei Kadowaki; Satoshi Yamamoto; Hirotoshi Sato; Akifumi S. Tanabe; Hirokazu Toju
Oecologia, Mar. 2021

Scoring Species for Synthetic Community Design: Network Analyses of Functional Core Microbiomes
Hirokazu Toju; Masato S. Abe; Chiharu Ishii; Yoshie Hori; Hiroaki Fujita; Shinji Fukuda
Frontiers in Microbiology, 25 Jun. 2020
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Isotopic and molecular data support mixotrophy in Ophioglossum at the sporophytic stage
Kenji Suetsugu; Shintaro Taketomi; Akifumi S. Tanabe; Takashi F. Haraguchi; Ichiro Tayasu; Hirokazu Toju
New Phytologist, 11 Mar. 2020, Peer-reviewed

Leaf-associated microbiomes of grafted tomato plants
Toju, H.; Okayasu, K.; Notaguchi, M.
Scientific Reports, 11 Feb. 2019, Peer-reviewed
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Timing of evolutionary innovation: scenarios of evolutionary diversification in a species-rich fungal clade, Boletales
Sato, H.; Toju, H.
New Phytologist, Jun. 2019, Peer-reviewed

Consortia of anti-nematode fungi and bacteria in the rhizosphere of soybean plants attacked by root-knot nematodes
Toju, H.; Tanaka, Y.
Royal Society Open Science, 29 Mar. 2019, Peer-reviewed
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Factors Influencing Leaf- and Root-Associated Communities of Bacteria and Fungi Across 33 Plant Orders in a Grassland
Toju Hirokazu; Kurokawa Hiroko; Kenta Tanaka
Frontiers in Microbiology, 19 Feb. 2019, Peer-reviewed
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Structural diversity across arbuscular mycorrhizal, ectomycorrhizal, and endophytic plant-fungus networks
Toju, H.; Sato, H.; Yamamoto, S.; Tanabe, A.S.
BMC Plant Biology, Dec. 2018, Peer-reviewed
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Beneficial associations between Brassicaceae plants and fungal endophytes under nutrient-limiting conditions: evolutionary origins and host–symbiont molecular mechanisms
Kei Hiruma; Yoshihiro Kobae; Hirokazu Toju
Current Opinion in Plant Biology, 01 Aug. 2018, Peer-reviewed

Composition and diversity of soil fungi in dipterocarpaceae-dominated seasonal tropical forests in Thailand
Amma S; Toju H; Wachrinrat C; Sato H; Tanabe A.S; Artchawakom T; Kanzaki M
Microbes and Environments, 04 Jul. 2018, Peer-reviewed

Network hubs in root-associated fungal metacommunities
Hirokazu Toju; Akifumi S. Tanabe; Hirotoshi Sato
Microbiome, 23 Jun. 2018, Peer-reviewed
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Bioactive polyamine production by a novel hybrid system comprising multiple indigenous gut bacterial strategies.
Yusuke Kitada; Koji Muramatsu; Hirokazu Toju; Ryoko Kibe; Yoshimi Benno; Shin Kurihara; Mitsuharu Matsumoto
Science advances, Jun. 2018, Peer-reviewed
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Core microbiomes for sustainable agroecosystems
Hirokazu Toju; Kabir G. Peay; Masato Yamamichi; Kazuhiko Narisawa; Kei Hiruma; Ken Naito; Shinji Fukuda; Masayuki Ushio; Shinji Nakaoka; Yusuke Onoda; Kentaro Yoshida; Klaus Schlaeppi; Yang Bai; Ryo Sugiura; Yasunori Ichihashi; Kiwamu Minamisawa; E. Toby Kiers
Nature Plants, 01 May 2018, Peer-reviewed

Root-associated fungi shared between arbuscular mycorrhizal and ectomycorrhizal conifers in a temperate forest
Hirokazu Toju; Hirotoshi Sato
Frontiers in Microbiology, 12 Mar. 2018, Peer-reviewed

Priority effects can persist across floral generations in nectar microbial metacommunities
Hirokazu Toju; Rachel L. Vannette; Marie-Pierre L. Gauthier; Manpreet K. Dhami; Tadashi Fukami
Oikos, 01 Mar. 2018, Peer-reviewed

DNA metabarcoding of spiders, insects, and springtails for exploring potential linkage between above- and below-ground food webs
Hirokazu Toju; Yuki G. Baba
Zoological Letters, 15 Feb. 2018, Peer-reviewed

Mycorrhizal fungi mediate the direction and strength of plant–soil feedbacks differently between arbuscular mycorrhizal and ectomycorrhizal communities
Kadowaki, K.; Yamamoto, S.; Sato, H.; Tanabe, A.S.; Hidaka, A.; Toju, H.
Communications Biology, 2018, Peer-reviewed
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Eukaryotic diversity in late Pleistocene marine sediments around a shallow methane hydrate deposit in the Japan Sea
M. Kouduka; A. S. Tanabe; S. Yamamoto; K. Yanagawa; Y. Nakamura; F. Akiba; H. Tomaru; H. Toju; Y. Suzuki
GEOBIOLOGY, Sep. 2017, Peer-reviewed

Convergence and contrast in the community structure of Bacteria, Fungi and Archaea along a tropical elevation-climate gradient
Kabir G. Peay; Christian von Sperber; Emily Cardarelli; Hirokazu Toju; Christopher A. Francis; Oliver A. Chadwick; Peter M. Vitousek
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, May 2017, Peer-reviewed

Host shifts enhance diversification of ectomycorrhizal fungi: diversification rate analysis of the ectomycorrhizal fungal genera Strobilomyces and Afroboletus with an 80-gene phylogeny
Hirotoshi Sato; Akifumi S. Tanabe; Hirokazu Toju
NEW PHYTOLOGIST, Apr. 2017, Peer-reviewed

Species-rich networks and eco-evolutionary synthesis at the metacommunity level
Hirokazu Toju; Masato Yamamichi; Paulo R. Guimaraes; Jens M. Olesen; Akihiko Mougi; Takehito Yoshida; John N. Thompson
NATURE ECOLOGY & EVOLUTION, Feb. 2017, Peer-reviewed

Networks Depicting the Fine-Scale Co-Occurrences of Fungi in Soil Horizons
Hirokazu Toju; Osamu Kishida; Noboru Katayama; Kentaro Takagi
PLOS ONE, Nov. 2016, Peer-reviewed
Access this paper :

Ericaceous plant-fungus network in a harsh alpine-subalpine environment
H. Toju; A. S. Tanabe; H. S. Ishii
MOLECULAR ECOLOGY, Jul. 2016, Peer-reviewed

Structure of phyllosphere fungal communities in a tropical dipterocarp plantation: A massively parallel next-generation sequencing analysis
Ayako Izuno; Akifumi S. Tanabe; Hirokazu Toju; Michimasa Yamasaki; Sapto Indrioko; Yuji Isagi
MYCOSCIENCE, May 2016, Peer-reviewed

Network modules and hubs in plant-root fungal biomes
Hirokazu Toju; Satoshi Yamamoto; Akifumi S. Tanabe; Takashi Hayakawa; Hiroshi S. Ishii
JOURNAL OF THE ROYAL SOCIETY INTERFACE, Mar. 2016, Peer-reviewed
Access this paper :

Two New Computational Methods for Universal DNA Barcoding: A Benchmark Using Barcode Sequences of Bacteria, Archaea, Animals, Fungi, and Land Plants (vol 8, e76910, 2013)
Akifumi S. Tanabe; Hirokazu Toju
PLOS ONE, Mar. 2016, Peer-reviewed

Below-ground plant-fungus network topology is not congruent with above-ground plant-animal network topology
Hirokazu Toju; Paulo R. Guimaraes; Jens M. Olesen; John N. Thompson
SCIENCE ADVANCES, Oct. 2015, Peer-reviewed
Access this paper :

Contrasting Diversity and Host Association of Ectomycorrhizal Basidiomycetes versus Root-Associated Ascomycetes in a Dipterocarp Rainforest
Hirotoshi Sato; Akifumi S. Tanabe; Hirokazu Toju
PLOS ONE, Apr. 2015, Peer-reviewed

High-throughput DNA barcoding for ecological network studies
Hirokazu Toju
POPULATION ECOLOGY, Jan. 2015, Peer-reviewed

Diet disparity among sympatric herbivorous cichlids in the same ecomorphs in Lake Tanganyika: amplicon pyrosequences on algal farms and stomach contents
Hiroki Hata; Akifumi S. Tanabe; Satoshi Yamamoto; Hirokazu Toju; Masanori Kohda; Michio Hori
BMC BIOLOGY, Nov. 2014, Peer-reviewed

Assembly of complex plant-fungus networks
Hirokazu Toju; Paulo R. Guimaraes; Jens M. Olesen; John N. Thompson
NATURE COMMUNICATIONS, Oct. 2014, Peer-reviewed
Access this paper :

Spatial Segregation and Aggregation of Ectomycorrhizal and Root-Endophytic Fungi in the Seedlings of Two Quercus Species
Satoshi Yamamoto; Hirotoshi Sato; Akifumi S. Tanabe; Amane Hidaka; Kohmei Kadowaki; Hirokazu Toju
PLOS ONE, May 2014, Peer-reviewed

Detection of the horizontal spatial structure of soil fungal communities in a natural forest
Kohmei Kadowaki; Hirotoshi Sato; Satoshi Yamamoto; Akifumi S. Tanabe; Amane Hidaka; Hirokazu Toju
POPULATION ECOLOGY, Apr. 2014, Peer-reviewed

Diet disparity among sympatric herbivorous cichlids in the same ecomorphs in Lake Tanganyika: Amplicon pyrosequences on algal farms and stomach contents
Hiroki Hata; Akifumi S. Tanabe; Satoshi Yamamoto; Hirokazu Toju; Masanori Kohda; Michio Hori
BMC Medicine, 2014, Peer-reviewed

Diversity and Spatial Structure of Belowground Plant-Fungal Symbiosis in a Mixed Subtropical Forest of Ectomycorrhizal and Arbuscular Mycorrhizal Plants
Hirokazu Toju; Hirotoshi Sato; Akifumi S. Tanabe
PLOS ONE, Jan. 2014, Peer-reviewed

Two New Computational Methods for Universal DNA Barcoding: A Benchmark Using Barcode Sequences of Bacteria, Archaea, Animals, Fungi, and Land Plants
Akifumi S. Tanabe; Hirokazu Toju
PLOS ONE, Oct. 2013, Peer-reviewed
Access this paper :

Sharing of Diverse Mycorrhizal and Root-Endophytic Fungi among Plant Species in an Oak-Dominated Cool-Temperate Forest
Hirokazu Toju; Satoshi Yamamoto; Hirotoshi Sato; Akifumi S. Tanabe
PLOS ONE, Oct. 2013, Peer-reviewed
Access this paper :

How are plant and fungal communities linked to each other in belowground ecosystems? A massively parallel pyrosequencing analysis of the association specificity of root-associated fungi and their host plants
Hirokazu Toju; Hirotoshi Sato; Satoshi Yamamoto; Kohmei Kadowaki; Akifumi S. Tanabe; Shigenobu Yazawa; Osamu Nishimura; Kiyokazu Agata
ECOLOGY AND EVOLUTION, Sep. 2013, Peer-reviewed

Diversification of endosymbiosis: replacements, co-speciation and promiscuity of bacteriocyte symbionts in weevils
Hirokazu Toju; Akifumi S. Tanabe; Yutaka Notsu; Teiji Sota; Takema Fukatsu
ISME JOURNAL, Jul. 2013, Peer-reviewed

Community composition of root-associated fungi in a Quercus-dominated temperate forest: "codominance" of mycorrhizal and root-endophytic fungi
Hirokazu Toju; Satoshi Yamamoto; Hirotoshi Sato; Akifumi S. Tanabe; Gregory S. Gilbert; Kohmei Kadowaki
ECOLOGY AND EVOLUTION, May 2013, Peer-reviewed

High-Coverage ITS Primers for the DNA-Based Identification of Ascomycetes and Basidiomycetes in Environmental Samples
Hirokazu Toju; Akifumi S. Tanabe; Satoshi Yamamoto; Hirotoshi Sato
PLOS ONE, Jul. 2012, Peer-reviewed
Access this paper :

Arms race between weevil rostrum length and camellia pericarp thickness: Geographical cline and theory
Naoyuki Iseki; Akira Sasaki; Hirokazu Toju
JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY, Sep. 2011, Peer-reviewed

METAPOPULATION STRUCTURE OF A SEED-PREDATOR WEEVIL AND ITS HOST PLANT IN ARMS RACE COEVOLUTION
Hirokazu Toju; Saneyoshi Ueno; Fumiya Taniguchi; Teiji Sota
EVOLUTION, Jun. 2011, Peer-reviewed

Climatic Gradients of Arms Race Coevolution
Hirokazu Toju; Harue Abe; Saneyoshi Ueno; Yoshiyuki Miyazawa; Fumiya Taniguchi; Teiji Sota; Tetsukazu Yahara
AMERICAN NATURALIST, May 2011, Peer-reviewed

Weevils and camellias in a Darwin's race: model system for the study of eco-evolutionary interactions between species
Hirokazu Toju
ECOLOGICAL RESEARCH, Mar. 2011, Peer-reviewed

Diversity and infection prevalence of endosymbionts in natural populations of the chestnut weevil: relevance of local climate and host plants
Hirokazu Toju; Takema Fukatsu
MOLECULAR ECOLOGY, Feb. 2011, Peer-reviewed

"Candidatus Curculioniphilus buchneri," a Novel Clade of Bacterial Endocellular Symbionts from Weevils of the Genus Curculio
Hirokazu Toju; Takahiro Hosokawa; Ryuichi Koga; Naruo Nikoh; Xian Ying Meng; Nobutada Kimura; Takema Fukatsu
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Jan. 2010, Peer-reviewed

Natural selection drives the fine-scale divergence of a coevolutionary arms race involving a long-mouthed weevil and its obligate host plant
Hirokazu Toju
BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY, Nov. 2009, Peer-reviewed

Do arms races punctuate evolutionary stasis? unified insights from phylogeny, phylogeography and microevolutionary processes
Hirokazu Toju; Teiji Sota
Molecular Ecology, Sep. 2009, Peer-reviewed

Fine-scale local adaptation of weevil mouthpart length and camellia pericarp thickness: Altitudinal gradient of a putative arms race
Hirokazu Toju
EVOLUTION, May 2008, Peer-reviewed

Interpopulation variation in predator foraging behaviour promotes the evolutionary divergence of prey
H. Toju
JOURNAL OF EVOLUTIONARY BIOLOGY, Jul. 2007, Peer-reviewed

Arms race of Japanese camellia Camellia japonica camellia weevil Curculio camelliae: Coevoution theory and geographical cline
Sasaki, A.; Toju, H.; Iseki, N.
Japanese Journal of Ecology, 2007, Peer-reviewed

Adaptive divergence of scaling relationships mediates the arms race between a weevil and its host plant
Hirokazu Toju; Teiji Sota
BIOLOGY LETTERS, Dec. 2006, Peer-reviewed

Phylogeography and the geographic cline in the armament of a seed-predatory weevil: effects of historical events vs. natural selection from the host plant
Hirokazu Toju; Teiji Sota
MOLECULAR ECOLOGY, Nov. 2006, Peer-reviewed

Imbalance of predator and prey armament: Geographic clines in phenotypic interface and natural selection
H Toju; T Sota
AMERICAN NATURALIST, Jan. 2006, Peer-reviewed

Misc.

Environmental Data Collection and Integration for Assessment of Ecosystem Services
加藤亮; 國井大輔; 橋本禅; 吉川夏樹; 東樹宏和; 大澤剛士; 杉原創; 神井弘之
農業農村工学会誌, 2022

Massive replications of microbial community: understanding the stochasticity behind the community assembly process
林息吹; 東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2023

interaction network dynamics of microbial community in soil ecosystem
景山拓矢; 東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2023

spatial distributions of root associated fungi in the forest dominated by ectomycorrizal trees
野口幹仁; 東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2023

Empirical understanding of stochastic community assembly in environmentally derived multi-replicate bacterial communities
林息吹; 東樹宏和
日本微生物生態学会大会(Web), 2023

Alternative stable state of bacterial communities in aquaculture tanks under disturbing events
島玄太; 東樹宏和
日本微生物生態学会大会(Web), 2023

Factors influencing the assembly of root-associated microbiomes under the forest
野口幹仁; 東樹宏和
日本微生物生態学会大会(Web), 2023

Exploring the seasonal dynamics of food web networks from large-scale dietary analysis
鈴木紗也華; 馬場友希; 木庭啓介; 東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2022

Challenge for revealing the interaction of soil microbiome.
景山拓矢; 東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2022

Relationship between ectomycorrhizal fungi and endophyte in the root of their host
野口幹仁; 東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2022

Analysis of water environment for assessment of ecosystem services in Ikeda cho, Fukui
加藤亮; 國井大輔; 橋本禅; 吉川夏樹; 東樹宏和; 大澤剛士; 杉原創; 神井弘之
農業農村工学会大会講演会講演要旨集(CD-ROM), 2022

Relationship between microbiome in leaves, roots and soil and invasiveness of exotic plants
中村直人; 東樹宏和; FLORY Luke S.; 北島薫
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2021

From DNA metabarcoding of arthropod communities to the seasonal dynamics of prey-predator networks
鈴木紗也華; 馬場友希; 東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2021

草原性クモ群集の食性解析:季節動態と個体群動態に着目して
鈴木紗也華; 馬場友希; 東樹宏和
Acta Arachnologica, 2021

生態系サービス評価に向けた環境データ集積と統合化に関する研究—Environmental Data Collection and Integration for Assessment of Ecosystem Services—小特集みどりの食料システム戦略に貢献する農業農村工学
加藤亮; 國井大輔; 橋本禅; 吉川夏樹; 東樹宏和; 大澤剛士; 杉原創; 神井弘之
水土の知 : 農業土木学会誌, journal of Japanese Society of Irrigation, Drainage and Reclamation Engineering / 農業農村工学会編, Sep. 2022

生態系サービス概念による農業・農村政策のリフレーミング—Reframing Agricultural Policies by the Concept of Ecosystem Services—小特集政策のグリーン化に向けた農業農村整備の新たな展開
神井弘之; 橋本禅; 加藤亮; 吉川夏樹; 大澤剛士; 杉原創; 東樹宏和
水土の知 : 農業土木学会誌, journal of Japanese Society of Irrigation, Drainage and Reclamation Engineering / 農業農村工学会編, Nov. 2021

6 自然栽培が土壌中の養分・微生物群集に与える影響（関西支部講演会）
水島洸; 真常仁志; 東樹宏和; 間藤徹
日本土壌肥料学会講演要旨集, 03 Sep. 2019

共進化の地理的モザイクと生物群集
東樹宏和
進化生物学からせまる, 2009

細菌学とマイクロバイオーム研究生物種間の関係性ネットワークと微生物叢設計
東樹宏和
日本細菌学雑誌, Feb. 2021

Are microbiomes controllable? Frontiers in science of interactions
東樹宏和; 東樹宏和
日本植物生理学会年会(Web), 2020

Seasonal dynamics of prey composition in grassland spider communities: diet analysis using metabarcoding
鈴木紗也華; 東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2020

Prediction and management of community dynamics for designing robust ecosystems
東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2020

Evaluating community dynamics stability of microbiome time series data
藤田博昭; 阿部真人; 山道真人; 木庭啓介; 潮雅之; 潮雅之; 潮雅之; 鈴木健大; 東樹宏和; 東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2020

Impacts on the Host Plants by Inoculation of Root Endophytes
堀淑恵; 成澤才彦; 東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2020

Comparison of microbial community associated with invasive species, coral ardisia (Ardisia crenata), between native population and invasive population
中村直人; 北島薫; 東樹宏和; LUKE S Flory
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2020

Temporal dynamics of bioaerosol in Tokyo area under COVID-19 Lockdown
西貝茂辰; 西貝茂辰; 村田浩太郎; 鴨川仁; 東樹宏和
個体群生態学会大会プログラム・講演要旨集(Web), 2020

Analysis, forecasting, control, and design of microbial ecosystems
東樹宏和
実験医学, 2020

DNAメタバーコーディングによるクモ群集の食物網解析
鈴木紗也華; 馬場友希; 東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2019

細菌叢時系列を用いたネットワーク解析
藤田博昭; 阿部真人; 山道真人; 木庭啓介; 潮雅之; 潮雅之; 潮雅之; 東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2019

複雑微生物叢を設計・制御する:「コア微生物叢」の組み立て
東樹宏和
日本微生物生態学会大会(Web), 2019

時系列データから読み解く細菌群集の種間相互作用強度ネットワークと非線形動態
藤田博昭; 阿部真人; 山道真人; 木庭啓介; 潮雅之; 潮雅之; 潮雅之; 東樹宏和; 東樹宏和
日本微生物生態学会大会(Web), 2019

大規模ネットワーク分析による菌叢動態の解明と制御
東樹宏和
日本生物工学会大会講演要旨集, 2019

Bioactive polyamine production by a novel hybrid system comprising multiple indigenous gut bacterial strategies.
栗原新; 栗原新; 北田雄祐; 村松幸治; 東樹宏和; 木邊量子; 辨野義己; 松本光晴
Institute for Fermentation, Osaka. Research Communications, 2019

自然栽培が土壌中の養分・微生物群集に与える影響
水島洸; 真常仁志; 東樹宏和; 間藤徹
日本土壌肥料学会講演要旨集(Web), 2019

Interdisciplinary sciences for the understanding and application of plant microbiomes
東樹宏和
作物研究, 17 Nov. 2018

自然栽培が土壌中の養分存在量に与える影響
水島洸; 真常仁志; 東樹宏和; 間藤徹; 舟川晋也
日本土壌肥料学会講演要旨集, 29 Aug. 2018

タイ熱帯季節林における真菌類・細菌類群集の季節的変動・多様性解析
安間更紗; 東樹宏和; WACHRINRAT Chongrak; ARTCHAWACOM Taksin; 神崎護
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2018

32 自然栽培が土壌中の養分存在量に与える影響（関西支部講演会，2017年度各支部会）
水島洸; 真常仁志; 東樹宏和; 間藤徹; 舟川晋也
日本土壌肥料学会講演要旨集, 2018

ネットワーク理論をもとに共生微生物叢を制御する
東樹宏和; 東樹宏和
植物の生長調節, 22 Dec. 2017

コア共生微生物の探索技術を基に農業生態系のデザインを考える
東樹宏和
植物微生物研究会研究交流会講演要旨集, Dec. 2017

根圏共生微生物の解析と持続的な農業生産への活用 1 地下の微生物叢と農地生態系
東樹宏和
アグリバイオ, 20 Sep. 2017

微生物が織りなす複雑ネットワーク
東樹宏和; 東樹宏和
日本微生物生態学会誌, 01 Sep. 2017

Below-ground microbiomes and agricultural ecosystems
東樹宏和
アグリバイオ = Agricultural biotechnology, Sep. 2017

次世代シーケンシングで食物網を探る:クモ・寄生蜂・土壌動物・植食性昆虫
東樹宏和; 馬場友希
日本応用動物昆虫学会大会講演要旨, 10 Mar. 2017

多数遺伝子座を用いた分子系統推定から明らかになるイグチ目菌の進化
佐藤博俊; 東樹宏和
日本植物分類学会大会研究発表要旨集, 05 Mar. 2017

地下の微生物叢と農地生態系
東樹宏和
アグリバイオ, 2017

植物と微生物叢の相互作用の研究開発戦略―理解・応用・制御に向けて―関連する国内の研究開発動向,今後のあるべき方向性など微生物叢の把握と分離培養―近年のブレイクスルー―植物を取り巻く微生物叢から中核菌候補を抽出する
東樹宏和
科学技術未来戦略ワークショップ報告書植物と微生物叢の相互作用の研究開発戦略-理解・制御・応用に向けて平成29年, 2017

菌根菌・内生菌・寄生菌で構成される植物共生微生物系を読み解く:ネットワーク科学の視点から
東樹宏和; 東樹宏和
日本微生物生態学会大会(Web), 2017

私たちは生態系を設計できるのか?情報革新で究極の相互作用網を編む
東樹宏和; 東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2017

腸内マイクロバイオーム内の異菌種間の異なる代謝系を介したポリアミン産生
北田雄祐; 東樹宏和; 栗原新; 松本光晴
日本ポリアミン学会年会プログラム及び抄録集, 2017

腸内マイクロバイオーム内の異菌種間の独立代謝系を介したプトレッシン産生経路
北田雄祐; 東樹宏和; 栗原新; 松本光晴
日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2017

DNA情報とネットワーク理論で微生物生態系を読み解く
東樹宏和
日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 05 Mar. 2016

群集生態学であぶり出す共生微生物間の大規模ネットワーク
東樹宏和
日本微生物生態学会大会(Web), 2016

魑魅魍魎はびこる土壌微生物圏に秩序は見いだせるのか?環境DNAデータをネットワーク理論で料理する
東樹宏和
日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web), 20 Aug. 2015

フロンティアを失った世代の逆襲:微生物の超多様性に生命進化の本質を見いだす
東樹宏和
日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web), 20 Aug. 2015

大規模遺伝子配列の分子系統解析から明らかになる外生菌根菌オニイグチ属の種多様化の起源
佐藤博俊; 田辺晶史; 東樹宏和
日本菌学会大会講演要旨集, 27 Apr. 2015

大量塩基配列を用いたタイ熱帯季節林における土壌菌類相と多様性の解析
安間更紗; 東樹宏和; 佐藤博俊; 田辺晶史; WACHRINRAT Chongrak; ARTCHAWACOM Taksin; 神崎護
日本菌学会大会講演要旨集, 27 Apr. 2015

土壌真菌群集と植物のネットワーク解析:土壌管理への展望
東樹宏和
土と微生物, 01 Apr. 2015

次世代シーケンスデータで相互作用ネットワークを描く
東樹宏和
日本応用動物昆虫学会大会講演要旨, 10 Mar. 2015

外生菌根菌オニイグチ属の進化とその種多様化の起源について~大規模遺伝子配列を用いた分子系統学的研究~
佐藤博俊; 田辺晶史; 東樹宏和
日本植物分類学会大会研究発表要旨集, 05 Mar. 2015

微生物生態系の複雑性を手なずける:対象系の枠を超えた大規模データ解析の流れ
東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2015

土壌真菌群集と植物のネットワーク解析:土壌管理への展望
東樹宏和
日本土壌微生物学会講演要旨集, 16 Oct. 2014

菌根共生からみる植物栄養の新時代
小八重善裕; 東樹宏和; 山本哲史; 竹本大吾; 江沢辰広; 河原愛; 荒川竜太; 齋藤勝晴; 中川知己
日本土壌肥料学雑誌, 05 Jun. 2014

ハラタケ亜門のシングルコピー遺伝子を対象とした新規プライマーの開発~次世代シーケンサーを用いた分子系統推定を想定して~
佐藤博俊; 田辺晶史; 東樹宏和
日本菌学会大会講演要旨集, 31 May 2014

タンガニイカ湖で共存する藻食シクリッドの生息場所と餌資源にみられるニッチ分化
畑啓生; 田辺晶史; 山本哲史; 東樹宏和; 柴田淳也; 大森浩二; 幸田正典; 堀道雄
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2014

群集安定性理論における実証研究の今日的限界:理論と連携して枠組みから問い直す
東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2014

次世代シーケンサーを用いたタイ熱帯季節林における土壌菌類の遺伝構造・多様性解析
安間更紗; 東樹宏和; WACHRINRAT Chongrak; 神崎護
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2014

New age of plant nutrition research through the studies of mycorrhizal roots
KOBAE Yoshihiro; TOJU Hirokazu; YAMAMOTO Satoshi; TAKEMOTO Daigo; EZAWA Tatsuhiro; KAWAHARA Ai; ARAKAWA Ryota; SAITO Katsuharu; NAKAGAWA Tomomi
Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition, 2014

S31-04 土壌真菌群集と植物のネットワーク解析 : 土壌管理への展望((2)網羅的解析の先を見据えて,S31 土壌微生物学会60周年記念シンポジウム:「21世紀の土壌微生物研究の目指すもの」,シンポジウム)
東樹宏和
日本微生物生態学会講演要旨集, 2014

植物と真菌の共生関係を森林全体レベルで解明する外生菌根菌・アーバスキュラー菌根菌・内生菌が形作る複雑な地下群集
東樹宏和
日本土壌肥料学会講演要旨集, 11 Sep. 2013

Foliar fungi diversity in the tropical rainforest uncovered by metagenomic analysis
Izuno A; Tanabe AS; Toju H; Yamasaki M; Indrioko S; Kanzaki M; Isagi Y
The 11th INTECOL Congress, "Ecology: Into the next 100 years", Aug. 2013

土壌共生菌がつくりだす森林の多様性:大規模移入操作実験と最先端分子同定技術の融合
門脇浩明; 東樹宏和
日本森林学会大会学術講演集(CD-ROM), 25 Mar. 2013

マレーシアサラワク州の低地フタバガキ材における外生菌根菌と根圏菌の宿主特異性とα,β多様性について
佐藤博俊; 服部力; 東樹宏和
日本森林学会大会学術講演集(CD-ROM), 25 Mar. 2013

野外におけるコナラ実生の生育状態と真菌群集の関係
日高周; 山本哲史; 田邉晶史; 佐藤博俊; 東樹宏和
根の研究, 20 Mar. 2013

土壌生物群集のめくるめく超複雑ネットワークに生態系動態の真髄を見る
東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨集, 05 Mar. 2013

根に居住する菌類どうしの相互作用はホスト植物間の菌群集の分化を促すか?
山本哲史; 佐藤博俊; 田邊晶史; 日高周; 門脇浩明; 東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨集, 05 Mar. 2013

メタゲノム解析による熱帯多雨林の葉圏菌類多様性の解明
伊津野彩子; 山崎理正; 田辺晶史; 東樹宏和; INDRIOKO Sapto; 井鷺裕司
日本生態学会大会講演要旨集, 05 Mar. 2013

タンガニイカ湖のなわばり性藻食シクリッド類の多種共存:メタゲノミクス解析を用いたシクリッド類の藻食性における特殊化と種間の多様化の解明
畑啓生; 田辺晶史; 山本哲史; 大久保智司; 東樹宏和; 宮下英明; 幸田正典; 堀道雄
日本生態学会大会講演要旨集, 05 Mar. 2013

「軍拡競走」で進化するゾウムシの長い口
東樹宏和
ミルシル, 2013

II-2 植物と真菌の共生関係を森林全体レベルで解明する : 外生菌根菌・アーバスキュラー菌根菌・内生菌が形作る複雑な地下群集(II 菌根共生からみる植物栄養の新時代,シンポジウム,2013年度名古屋大会)
東樹宏和
日本土壌肥料学会講演要旨集, 2013

Host specificity, alpha- and beta-diversity of ectomycorrhizal fungi and other root-associated fungi in a lowland dipterocarp forest, Sarawak, Malaysia
Sato Hirotoshi; Hattori Tsutomu; Toju Hirokazu
The Japanese Forest Society Congress, 2013

共生・共進化する植物の世界(第8回)「軍拡競走」で進化するゾウムシの長い口
東樹宏和
Milsil : 自然と科学の情報誌, Jan. 2013

次世代シーケンサを用いたアジア熱帯林における内生菌類の群集構造の比較
阪口瀬理奈; 松岡俊将; 伊藤公一; 広瀬大; 矢澤重信; 西村理; 田邉晶史; 東樹宏和; 大園享司
日本菌学会大会講演要旨集, 17 May 2012

あらゆる生物に適用可能なDNA塩基配列同定システム:「網羅的メタゲノミックバーコーディング」へ向けて
田辺晶史; 東樹宏和
日本菌学会大会講演要旨集, 17 May 2012

菌根共生の動態を次世代シーケンシングで解き明かす
東樹宏和; 佐藤博俊; 山本哲史; 田辺晶史; 日高周; 門脇浩明
日本森林学会大会学術講演集(CD-ROM), 26 Mar. 2012

Claident:DNA塩基配列のホスト生物同定システム
田辺晶史; 東樹宏和
日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web), 2012

Evolving in the Red Queen world
東樹宏和
Biological science, Sep. 2011

共生と共進化「共進化する世界」でつながる生命
東樹宏和
生物科学, 01 Sep. 2011

気候変動下での共進化過程と遺伝子流動
東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨集, 08 Mar. 2011

「共進化する世界」でつながる生命
東樹宏和
生物科学, 2011

ツバキシギゾウムシ
東樹宏和
昆虫と自然, 2011

Understanding the dynamics of mycorrhizal mutualism by means of next-generation sequencing
Toju Hirokazu; Sato Hirotoshi; Yamamoto Satoshi; Tanabe Akifumi; Hidaka Amane; Kadowaki Kohmei
The Japanese Forest Society Congress, 2011

Evolution of the rostrum of Curculio camelliae
東樹宏和
The Nature and insects, 2011

軍拡競走の曙,そして,落日:共進化のモデル系としてのゾウムシ‐ツバキ相互作用
東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨集, 15 Mar. 2010

進化する世界でつながる生物:赤の女王と群集生態学
東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨集, 15 Mar. 2010

鏡の国のツバキとゾウムシ~共進化する世界の果てを目指して~
東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨集, 15 Mar. 2010

シギゾウムシ類を中心とした共進化ネットワークをひも解く
東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨集, 17 Mar. 2009

「象の鼻」を持つ虫はどうして進化したの?--ゾウムシとツバキの進化のレース (特集進化論の目で生物を見よう!)
東樹宏和
Rikatan, Dec. 2008

ツバキとゾウムシの共進化‐厚い果皮と長い口吻の軍拡競走
東樹宏和
種生物学研究, 31 Mar. 2008

ゾウムシ‐ツバキ共進化は平衡に達したか?予測進化速度と実現進化速度の不一致
東樹宏和; 曽田貞滋
日本生態学会大会講演要旨集, 14 Mar. 2008

軍拡競走:ゾウムシの口吻とツバキ果実の共進化
東樹宏和
日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web), 2008

「象の鼻」をもつ虫はどうして進化したの？ ~ゾウムシとツバキの進化のレース~
東樹宏和
理科の探検 RikaTan, 2008

ツバキとゾウムシの進化のレース
東樹宏和
自然保護, 2008

生態学における理論研究と実証研究の連携ヤブツバキとシギゾウムシの軍拡競走
佐々木顕; 東樹宏和; 井磧直行
日本生態学会誌, 31 Jul. 2007, Peer-reviewed, Invited

「ツバキ果皮とゾウムシ口吻の軍拡競走:相互作用の地理変異から共進化過程を読み解く」
東樹宏和
個体群生態学会会報, 17 Jul. 2007

自然選択の地理的モザイクと共進化過程
東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨集, 19 Mar. 2007

ゾウムシの産卵戦略:最適採餌の視点から
佐伯晃一; 東樹宏和; 巌佐庸
日本動物行動学会大会発表要旨集, 2007

Arms race of Japanese camellia Camellia japonica and camellia weevil Curculio camelliae : Coevolution theory and geographical cline
Sasaki Akira; Toju Hirokazu; Iseki Naoyuki
JAPANESE JOURNAL OF ECOLOGY, 2007

軍拡競走理論と検証ツバキとゾウムシの軍拡競走:自然選択の地理的勾配と適応的分化
東樹宏和; 曽田貞滋
日本生態学会誌, 25 Apr. 2006, Peer-reviewed, Invited

理論と実証の共進化:ゾウムシ‐ツバキ軍拡競走の地理勾配とその予測性
東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨集, 24 Mar. 2006

どこで軍拡競走は加速する?:ツバキ‐ゾウムシ共進化の局所性と空間的な階層
東樹宏和
日本生態学会大会講演要旨集, 24 Mar. 2006

Coevolutionary arms race between Japanese camellia and camellia weevil : Geographic cline in natural selection and adaptive diversification
Toju Hirokazu; Sota Teiji
JAPANESE JOURNAL OF ECOLOGY, 2006

ツバキ果皮とシギゾウムシ口吻: 軍拡競走の時空間動態
東樹宏和; 曽田貞滋
日本生態学会大会講演要旨集, 27 Mar. 2005

Origin of Exaggerated Arms in Plant-Insect Coevolution
Toju Hirokazu; Sota Teiji
Abstracts of the Annual Meeting of the Ecological Society of Japan, 2004

Presentations

趣旨説明：生物群集の多重安定性と生態系機能の制御可能性
東樹宏和
日本生態学会第71回全国大会シンポジウム「生物群集の安定性と生態系機能：大規模データと理論でよみとく」, 19 Mar. 2024

多種生命システムの機能と安定性
東樹宏和
東京工業大学情報理工学院山村雅幸研究室セミナー, 18 Apr. 2024, Invited

生物叢の DNA 分析から見えてくる土壌の状態
東樹宏和
日本土壌微生物学会2024年度大会大会シンポジウム「”ディープ”な土壌微生物の世界を”掘る”」, 16 Apr. 2024, Invited

大規模データで群集集合の共通原理を探る
東樹宏和
統計思考院人材育成事業ワークショップ「生物多様性と群集動態：定量化の数理と統計的推定法」, 09 Nov. 2023, Invited

生物叢の時空間動態と生物間相互作用ネットワーク
東樹宏和
第75回日本生物工学会シンポジウム「データサイエンスと環境バイオテクノロジーの接点」, 04 Sep. 2023, Invited

生物多様性の科学 -生態系の視点とSDGs-
東樹宏和
京大発イノベーションを探る＠健都微生物ベンチャーが目指す地球規模の課題解決～統合的な科学アプローチで生態系のリデザインへ～, 08 Mar. 2023, Invited

微生物多様性と生態系の情報で持続可能な生産システムを実装する
東樹宏和
日本農芸化学会第39回さんわかセミナー「微生物 x SDGs GXを加速する微生物科学」, 18 Jan. 2023, Invited

時間と空間のデータで複雑な生物システムを読み解く
東樹宏和
名古屋大学理学研究科GTRセミナー/アドバンス生命理学特論, 16 Dec. 2022, Invited

理論生態学とゲノム科学の融合は水産資源管理に何をもたらすか?
東樹宏和
第5回海と漁業と生態系に関する研究集会「海洋生態系のなかで漁業を科学する」. 水産資源研究所, 26 Nov. 2022, Invited

生物種間ネットワークと微生物叢動態分析で難培養生物に挑む
東樹宏和
第 74 回日本生物工学会大会シンポジウム「生物工学が拓く未培養微生物（微生物ダークマター）の未来」, 20 Oct. 2022, Invited

生物間相互作用における非相加的効果と生物群集の俯瞰
東樹宏和
個体群生態学会第38回大会, 02 Oct. 2022, Invited

Synthetic Biology, Artificial Organisms, and Artificial Ecosystems
Hirokazu Toju
Third Japanese-American-German Kavli Frontiers of Science Symposium, 18 Sep. 2022, Invited

生物多様性を知り、地球生態系を設計する
東樹宏和
京都大学建築学科平田晃久研究室宵山ゼミ「叢の思考」, 16 Jul. 2022, Invited

「世界でここでしか解き明かせない」を求めて -大学研究室の運営奮闘記-
東樹宏和
フォーラム「人生の選択の裏側を聞いてみよう３：博士課程とポスドクのための前向きキャリア論」, 15 Mar. 2022, Invited

生態系から考える20年後のまち・社会宇宙船地球号と持続可能な生態系
東樹宏和
日本学術会議公開シンポジウム「縮退時代において、20年後のまち・社会を考える～宇宙×都市×遺伝子×生態～」, 01 Mar. 2022, Invited

多種生物システムの動態理解に向けたゲノム科学と群集生態学の融合
東樹宏和
ERATO共生進化機構先端セミナー, 22 Feb. 2022, Invited

生物間の複雑化学ネットワークと共進化- 生態系と天然物 -
東樹宏和
日本学術会議公開シンポジウム「地球と生命をつなぐ高度な化学物質ネットワーク‐天然物化学再考‐」, 08 Dec. 2021, Invited

土壌微生物・植物共生微生物と持続可能な農業生態系
東樹宏和
東京大学大学院農学生命科学研究科生圏システム学専攻セミナー., 07 Dec. 2021, Invited

「共生体」としての植物の姿を読み解く生物間相互作用学
東樹宏和
シンポジウム「植物の個体性―植物にとって「個体」とは何か」.日本植物学会第85回大会 . 2, 18 Sep. 2021, Invited

異分野融合で解き明かす生物間相互作用と生態系動態
東樹宏和
高遠分子細胞生物学シンポジウム., 19 Aug. 2021, Invited

むし・きのこ・植物：生物どうしのつながりを読み解く科学
東樹宏和
京都府立大学新自然史科学創生センター設立記念シンポジウム, 08 Aug. 2021, Invited

微生物叢の制御は可能か？相互作用の科学が切り拓くフロンティア
東樹宏和
京都大学ウイルス・再生医学研究所田畑泰彦研究室セミナー, 14 Jun. 2021, Invited

生物種間の関係性ネットワークと微生物叢設計
東樹宏和
ワークショップ「細菌学とマイクロバイオーム研究」. 第94回日本細菌学会総会, 23 Mar. 2021, Invited

共生微生物と植物研究のフロンティア
東樹宏和
名古屋大学GTR 植物科学シリーズセミナー, 16 Dec. 2020, Invited

農業生態系の総合的管理による持続可能な食糧生産に向けて
東樹宏和
農林水産省, 27 Jan. 2021, Invited

Microbiome design for optimizing multi-species biological functions
Hirokazu Toju
Workshop "New Trends and Fundamental Technologies for Microbial Ecosystems ". Organized by Nobuo Sasaki & Shinji Fukuda. The 44th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan, 02 Dec. 2020, Invited

Does informatics of microbiomes revolutionize agriculture?
Hirokazu Toju
Keynote lecture. The Joint;Meeting of The;eDNA Society;The Society of;Population Ecology, 15 Nov. 2020, Invited

微生物叢データを生態学で読み解く
東樹宏和
セミナー、トヨタ自動車, 25 Aug. 2020, Invited

微生物叢のビッグデータを農業に活かす
東樹宏和
全国土壌改良資材協議会講演会, 16 Dec. 2019, Invited

Core microbiomes for the future of sustainalbe Earth's ecosystems
Hirokazu Toju
Hakubi Autumn Camp 2019, Hakubi Center for Advanced Research, Kyoto University, 14 Dec. 2019, Invited

土から考える農業
東樹宏和
第5回農学中手の会, 12 Dec. 2019

未利用の微生物機能と持続可能農業：コア微生物叢の設計
東樹宏和
東京大学生物生産工学研究センターシンポジウム「植物-微生物相互作用 -農業生産性の視点から-」, 13 Nov. 2019, Invited

森のきのこや植物・虫たちの社会
東樹宏和
京大ウィークス, 12 Oct. 2019

複雑微生物叢を設計・制御する；「コア微生物叢」の組み立て
東樹宏和
シンポジウム「次世代のバイオプロセスを拓く複合微生物系精密制御技術」. 第71回日本生物工学会., 17 Sep. 2019, Invited

大規模ネットワーク分析による菌叢動態の解明と制御
東樹宏和
シンポジウム「植物微生物研究で共創する未来」. 第33回日本微生物生態学会, 11 Sep. 2019, Invited

複雑微生物叢の制御は可能か？
東樹宏和
2019年度発酵と代謝研究会第１回勉強会. 一般財団法人バイオインダストリー協会, 12 Jul. 2019, Invited

Bird's-eye views of species interactions
Hirokazu Toju
The 10th International Seminar on Biodiversity and Evolution, 11 Jun. 2019, Invited

地球生態系を設計する
東樹宏和
京都大学白眉センター離席者セミナー合宿, 10 Feb. 2019

生物間相互作用、生物多様性
東樹宏和
京都大学生態学研究センター特別講座生態学・生物多様性科学の基礎と応用～科学的に自然を知るために～, 17 Jan. 2019

頑健な植物共生システムの設計に向けた「コア共生微生物」探索技術の開発
Hirokazu Toju
JSTさきがけ第12回さきがけ研究者交流会, 2019

微生物叢の設計と制御に向けた「コア微生物」探索
Hirokazu Toju
サントリーグローバルイノベーションセンター株式会社, 2019, Invited

生態系デザインに向けた動物・植物・真菌・細菌・その他いろいろネットワーク分析
Hirokazu Toju
日本生態学会第66回大会., 2019, Invited

多様な植物内生菌の中からコア微生物を探す
Hirokazu Toju
植物バイオ第160委員会第5期第１０回研究会・意見交換会, 2019, Invited

「コア微生物」で持続可能な農業を設計する
Hirokazu Toju
先端シーズフォーラム「気候変動時代を生きる」〜植物と微生物の共生による農業先端技術〜, 2019, Invited

Bird's-eye views of microbe-microbe interactions for managing ecosystems
Hirokazu Toju
The 1st International Symposium on Chemical Communication (ISCC2019), 2019, Invited

「DNAバーコーディング」で探る共生のネットワーク
東樹宏和
サイバーフィールドワーク、京都大学メディアセンター, 22 Nov. 2018

植物たちをつなぐきのこの地下ネットワーク
東樹宏和
京大ウィークス, 13 Oct. 2018

せめぎ合い、そして、助け合う－生物どうしの関わりに秘められた謎を解く－
東樹宏和
京都大学生態学研究センターシリーズ公開講演会第9回., 03 Feb. 2018

最強の植物共生菌を求めて
Hirokazu Toju
第4回農学中手の会, 2018

コア共生微生物を見出し、生態系を設計する
Hirokazu Toju
日本微生物生態学会第32回大会シンポジウム｢進化・群集生態学の新手法で切り拓く微生物研究のフロンティア｣, 2018

異分野融合プロジェクトで複雑共生系を設計・構成・制御する
Hirokazu Toju
分子生物学×生態学：生物学を原点に回帰する Part II. 日本分子生物学会, 2018

Core microbiomes for designing sustainable ecosystems
Hirokazu Toju
Frontiers in Rhizosphere Research, 2018, Invited

共生微生物でよみとく植物の世界
Hirokazu Toju
生命科学研究科セミナー, 2018, Invited

共生ネットワークでよみとく地球生態系の未来
Hirokazu Toju
京都大学春秋講義, 2018, Invited

生態系を駆動するコア微生物を探る
Hirokazu Toju
平成30年度遺伝研研究会, 2018, Invited

Exploring "hidden" ecosystem functions of plant_microbiome linkages
Hirokazu Toju
Symposium: Advances in Ecology with Functional Traits. 65th Annual meeting of Ecological Society of Japan., 2018, Yusuke Onoda, Hiroko Kurokawa, and Kouki Hikosaka, Invited

朝飯前の論文執筆と研究者としての原点回帰
Hirokazu Toju
第65回日本生態学会, 2018, キャリア支援専門委員会（木村恵、曽我昌史、鈴木智之、三宅恵子）, Invited

DNA情報で生態系をまるごと理解する
東樹宏和
京都大学サマースクール2017, 11 Aug. 2017

誰も知らない生態系の奥深くへ -生物どうしのつながりを知る-
東樹宏和
嵯峨野高校見学会、京都大学生態学研究センター, 28 Jul. 2017

最強の植物内生菌がわかったかもしれない
Hirokazu Toju
第3回農学中手の会, 2017

菌根菌・内生菌・寄生菌で構成される植物共生微生物系を読み解く -ネットワーク科学の視点から-
Hirokazu Toju
環境微生物系学会合同大会2017, 2017

白眉と地球生態系
Hirokazu Toju
白眉の日講演, 2017

次世代シーケンシングで食物網を探る：クモ・寄生蜂・土壌動物・植食性昆虫
Hirokazu Toju
日本応用動物昆虫学会, 2017

私たちは生態系を設計できるのか？情報革新で究極の相互作用網を編む
Hirokazu Toju
日本生態学会シンポジウム, 2017

微生物間の相互作用ネットワークを俯瞰する
Hirokazu Toju
えこえぴWS2017, 2017, 立木佑弥・岩見真吾, Invited

コア共生微生物で農業生態系を設計する
Hirokazu Toju
植物科学シンポジウム2017, 2017, Invited

植物体内の多様な植物共生菌
Hirokazu Toju
近畿作物・育種研究会, 2017, Invited

微生物群集内における内生菌の機能解明に向けて
Hirokazu Toju
茨城大学重点研究ジョイントシンポジウム, 2017, Invited

微生物どうしの関係性をネットワークでとらえる
Hirokazu Toju
住友化学セミナー, 2017, 廣富大, Invited

コア共生微生物の探索技術を基に農業生態系のデザインを考える
Hirokazu Toju
植物微生物研究会第27回研究交流会, 2017, 杉山暁史, Invited

ネットワークで生物種間の関係を探る
Hirokazu Toju
ネットワーク科学セミナー2017, 2017, 水高将吾, Invited

Detecting core microbiomes for designing natural and agricultural ecosystems
Hirokazu Toju
RIKEN Shirasu Lab Seminar, 2017, Invited

「コア共生微生物」で強い植物をつくる：みえてきた微生物共生ネットワーク
Hirokazu Toju
日本育種学会若手の会, 2017, Invited

自然生態系に潜む超多様な真菌たちは農業の救世主となるのか?
Hirokazu Toju
第1回茨城大学重点研究ジョイントシンポジウム, 2017, Invited

長~い「鼻」のゾウムシはどうして進化したの?
東樹宏和
京都大学総合博物館特別展「虫を知り尽くす」, 24 Jul. 2016

「コア共生微生物」探索のインフォマティクスによる頑健な植物共生システムの設計体系研究計画
Hirokazu Toju
さきがけ領域会議, 2016

「強い農業生態系」の設計に向けて：共生微生物・捕食者群集・土壌生物圏
Hirokazu Toju
第２回農学中手の会, 2016

Coevolutionary Networks in Metacommunities
Hirokazu Toju
The Society of American Naturalist Meeting, 2016

植物と共生微生物の超複雑ネットワークを読み解く
Hirokazu Toju
IGERセミナー, 2016, Invited

植物を取り巻く微生物叢から中核菌候補を抽出する
Hirokazu Toju
科学技術未来戦略ワークショップ, 2016, Invited

菌類・微生物の「超」多様性をひも解き、地球の未来を考える
Hirokazu Toju
第32回国際生物学賞記念シンポジウム, 2016, Invited

群集生態学であぶり出す共生微生物間の大規模ネットワーク
Hirokazu Toju
日本微生物生態学会第31回大会シンポジウム, 2016, 中川聡・加藤広海, Invited

DNA情報とネットワーク理論で微生物生態系を読み解く
Hirokazu Toju
日本農芸化学会シンポジウム, 2016, 福田真嗣, Invited

MiSeqを用いた超多検体分析 _サンプリングからシーケンスまで_
Hirokazu Toju
第63回日本生態学会・自由集会, 2016, 田辺晶史, Invited

High-throughput DNA sequencing and network science for designing eco-evolutionary feedback research
Hirokazu Toju
Workshop of Ecological Society of Japan, 2016, Takehito Yoshida, Invited

High-throughput DNA sequencing for understanding hyper-species-rich ecological and coevolutionary networks
Hirokazu Toju
EE Biology Department Seminar, UCSC, 2016, John N. Thompson, Invited

「エコミメティクス」の創成；ミクロ生命圏の異分野融合研究プロジェクトが目指す生態学の発展と応用
Hirokazu Toju
第62回日本生態学会, 2015, 瀧本岳・東樹宏和

How can we use high-throughput DNA sequencing towards the understanding of natural community dynamics?
Hirokazu Toju
High-throughput DNA sequencing and network science for designing eco-evolutionary feedback research, 2015, Po-Ju Ke and Tadashi Fukami, Invited

Uncovering the most complex biosphere: coexistence of microbes in the soil
Hirokazu Toju
The 5th China-Japan-Korea Colloquium on Mathematical Biology, 2015, Shinji Nakaoka and Kenta Suzuki, Invited

フロンティアを失った世代の逆襲：微生物の超多様性に生命進化の本質を見いだす
Hirokazu Toju
第17回日本進化学会シンポジウム, 2015, 山道真人・笠田実, Invited

魑魅魍魎はびこる土壌微生物圏に秩序は見いだせるのか？環境DNAデータをネットワーク理論で料理する
Hirokazu Toju
第17回日本進化学会ワークショップ, 2015, 荒木仁志・佐藤行人, Invited

大規模DNAバーコーディング情報をもとに地下生態系の超複雑ネットワークを紐解く
Hirokazu Toju
複雑ネットワークグループセミナー, 2015, 高口太朗, Invited

大規模DNAバーコーディングで地下の隠れた生物間相互作用を探る
Hirokazu Toju
山形大学農学部招待講演, 2015, 安田弘法, Invited

次世代シーケンサーで相互作用ネットワークを描く
Hirokazu Toju
応用動物昆虫学会小集会, 2015, 菊池義智, Invited

群集生態学の理論と実証をつなぎ直す: 「空間」への視点で群集理解を革新する
Hirokazu Toju
第61回日本生態学会大会, 2014, 東樹宏和

土壌真菌群集と植物のネットワーク解析：土壌管理への展望
Hirokazu Toju
土壌微生物学会60周年記念シンポジウム, 2014, 齋藤雅典, Invited

Arms race, cooperation, and the web of life
Hirokazu Toju
Kyoto University & National Taiwan University Symposium 2014, 2014, Atsuko Sehara, Invited

How are plant and fungal communities linked to each other in below-ground ecosystems? A community-wide analysis of the partner preference of root-associated fungi and their host plants
Hirokazu Toju
INTECOL2013, 2013

Below-ground networks of plants and fungi
Hirokazu Toju
Hakubi Camp Seminar, 2013

先端技術で野外生態学を革新する：「誰でも次世代シーケンス」の時代で独自路線を歩むために
Hirokazu Toju
日本生態学会第60回全国大会, 2013, 東樹宏和

Does massively-parallel pyrosequencing revolutionize empirical studies of ecological networks?
Hirokazu Toju
Plenary symposium of the 29th Annual Meeting of the Society of Population Ecology, 2013, Toshiyuki Namba, Invited

植物と真菌の共生関係を森林全体レベルで解明する外生菌根菌・アーバスキュラー菌根菌・内生菌が形作る複雑な地下群集
Hirokazu Toju
2013年土壌肥料学会, 2013, 小八重善裕, Invited

次世代シーケンシングで生物種間の共生ネットワークを読みとく
Hirokazu Toju
第三回NGS現場の会, 2013, 岩崎渉・古田芳一, Invited

Belowground networks of ecosystems
Hirokazu Toju
Hakubi Camp Seminar, 2012

地下生態系をまるごと解き明かす：ネットワーク理論・物質循環・ゲノム情報を統合した新戦略を立ち上げる
Hirokazu Toju
日本生態学会第59回全国大会., 2012, 東樹宏和

微生物の世界と環境ジェノミクス
Hirokazu Toju
第１６回龍谷エコロジーセミナー, 2012, 近藤倫生, Invited

生物間相互作用の巨大ネットワークを読み解く
Hirokazu Toju
東北大学第75回生態適応セミナー, 2012, 占部城太郎, Invited

次世代シーケンシングで解き明かす地下生態系の構造
Hirokazu Toju
第237回生態研セミナー, 2012, 山内淳, Invited

未知の多様性探索とゲノム情報
Hirokazu Toju
日本進化学会2011, 2011, 東樹宏和・瀬川高弘

知の共進化と多様性
Hirokazu Toju
白眉プロジェクト年次報告会白眉のコスモロジー2011, 2011, 東樹宏和

Coevolutionary dynamics in ecological communities: How bioinformatics fil the gap between ecology and evolutionary biology?
Hirokazu Toju
Fukami Lab Seminar, 2011, Fukami Tadashi & Mifuyu Nakajima, Invited

Coevolution, diversification and network structuring in terrestrial ecosystems: Developing an integrative approach for understanding ecological and evolutionary dynamics
Hirokazu Toju
Department Seminar of EEB Biology, 2011, John N. Thompson, Invited

共進化の視点で生態系を読み解く
Hirokazu Toju
農薬系研究施設セミナー, 2011, 吉永直子, Invited

生態系の動態を探る：生物は自然界でどうつながっているのか？
Hirokazu Toju
京都大学微生物科学寄附研究部門主催シンポジウム, 2011, 島純, Invited

軍拡競走と相利共生：共進化がかたちづくる生態系
Hirokazu Toju
自然科学縦横無尽, 2011, 自然科学縦横無尽実行委員会, Invited

生物間相互作用の進化的・生態学的動態
Hirokazu Toju
SHEEPセミナー, 2011, 栗田和紀, Invited

共進化生態学の新天地を求めて
Hirokazu Toju
第57回日本生態学会企画集会, 2010, 東樹宏和

Latitudinal gradient of the coevolutionary arms race involving a long-mouthed weevil and its host camellia plant
Hirokazu Toju
2010 Ecological Society of America Annual Meeting., 2010, Tania Kim, Invited

軍拡競走のはじまりとおわり
Hirokazu Toju
昆虫学土曜セミナー, 2010, 宮竹貴久, Invited

鏡の国のツバキとゾウムシ：共進化する世界の果てを目指して
Hirokazu Toju
第57回日本生態学会宮地賞受賞講演, 2010, 日本生態学会, Invited

進化する世界でつながる生物：赤の女王と群集生態学
Hirokazu Toju
第57回日本生態学会企画集会, 2010, 近藤倫生・大串隆之, Invited

軍拡競走の起源と結末
Hirokazu Toju
第29回北海道若手生態学研究会, 2010, 矢澤佳子, Invited

Arms race of weevil mouthparts and thick camellia fruits: natural selection vs. gene flow in coevolving metapopulations
Hirokazu Toju
Evolution 2009 oral session, 2009

Long drills and thick walls in a weevil-camellia arms race
Hirokazu Toju
International symposium, 2009, Invited

4者系の共進化：クリシギゾウムシ・寄主植物・寄生蜂・共生細菌系の適応進化を探る
Hirokazu Toju
特別研究員SPD研究発表会, 2009, 日本学術振興会, Invited

軍拡競走は終わるのか？ゾウムシの「ドリル」とツバキの「防衛壁」の共進化
Hirokazu Toju
京都大学農学部昆虫生態学研究室院生セミナー, 2009, 鈴木紀之, Invited

シギゾウムシ類を中心とした共進化ネットワークをひも解く
Hirokazu Toju
第56回生態学会企画集会, 2009, 土松隆志・池田啓, Invited

長い「鼻」のゾウムシとリンゴツバキの共進化：屋久島のリンゴツバキはなぜ大きいか
東樹宏和
屋久島研究講座京都大学グローバルCOEプログラム「生物多様性と進化研究のための拠点形成 -ゲノムから生態系まで」, 12 Sep. 2008

軍拡競走：ゾウムシの口吻とツバキ果実の共進化
Hirokazu Toju
日本進化学会第10回東京大会ワークショップ, 2008, 林文男, Invited

Spatial Scales of Coevolutionary Arms Races
Hirokazu Toju
Evolution 2007 poster session, 2007

自然選択の地理的モザイクと共進化過程
Hirokazu Toju
第54回日本生態学会ポスター発表, 2007

共進化の地理的モザイクと生物群集
Hirokazu Toju
第54回日本生態学会自由集会, 2007, 吉田丈人・大串隆之・近藤倫生, Invited

Geographic Clines of Coevolutionary Arms Races
Hirokazu Toju
Evolution 2006 poster session, 2006

どこで軍拡競走は加速する？：ツバキ−ゾウムシ共進化の局所性と空間的な階層
Hirokazu Toju
第53回日本生態学会ポスター発表, 2006

ツバキ果皮とゾウムシ口吻の軍拡競走：相互作用の地理変異から共進化過程を読み解く
Hirokazu Toju
2006年個体群生態学会研究集会, 2006, Invited

ツバキ‐ゾウムシ軍拡進化の地理的モザイク
Hirokazu Toju
信州大学生物科学科教室セミナー, 2006, 市野隆雄・服部充, Invited

共進化過程の空間構造と適応的分化
Hirokazu Toju
筑波大学共存生物学研究室セミナー, 2006, 大橋一晴, Invited

共進化の適応地形を探る実証的試み
Hirokazu Toju
東京大学伊藤元己研究室セミナー., 2006, 土松隆志, Invited

捕食者「一人勝ち」から被食者「善戦」の緯度クライン：軍備間のバランスから自然選択を予測する
Hirokazu Toju
第53回日本生態学会自由集会, 2006, 細将貴, Invited

理論と実証の共進化？：ゾウムシ−ツバキ軍拡競走の地理勾配とその予測性
Hirokazu Toju
第53回日本生態学会公募シンポジウム, 2006, 吉田丈人, Invited

相互作用系における自然選択の地理構造と共進化動態
Hirokazu Toju
第52回日本生態学会自由集会, 2005, 巖圭介, Invited

ツバキ果皮とツバキシギゾウムシ口吻：軍拡競争の時空間動態
Hirokazu Toju
第52回日本生態学会公募シンポジウム, 2005, 佐々木顕, Invited

ツバキ‐シギゾウムシ相互作用系における軍拡競争の時空間動態
Hirokazu Toju
第166回生態研セミナー, 2005, 酒井章子, Invited

極端な表現型の共進化 ‐平衡から軍拡競争への地理クライン
Hirokazu Toju
第51回日本生態学会ポスター発表, 2004

共進化が促進する表現型の多様性：実証的研究の展望
Hirokazu Toju
第6回日本進化学会ワークショップ, 2004

極端な表現型共進化の起源: 相互作用の地理変異解析による大進化パターンの解明
Hirokazu Toju
第36回種生物学シンポジウム, 2004, 横山潤, Invited

ツバキ‐シギゾウムシ共進化系における軍拡競争の起源
Hirokazu Toju
第35回種生物学会ポスター発表, 2003

Books and Other Publications

微生物生態系の分析から予測・制御・設計へ In. 微生物生態系の分析から予測・制御・設計へ
Contributor
羊土社, Nov. 2020

「ゾウムシの「槍」とツバキの「盾」の共進化」. In 金子修治 , 鈴木紀之, 安田弘法編「博士の愛した地味な昆虫」.
Contributor
岩波書店, Apr. 2020

DNA情報で生態系を読み解く：環境DNA・網羅的群集調査・生態ネットワーク
東樹宏和, Single work
共立出版, 2016, Not refereed

行動生物学辞典
東樹宏和, Contributor, 「軍拡競走」・「適応地形」・「適応放散」.In 上田恵介編
東京化学同人, 2013, Not refereed

進化のすべて
東樹宏和, Contributor, 「共進化」,「植物と昆虫の共進化」
共立出版, 2012, Not refereed

生き物の進化ゲームー進化生態学最前線ー
東樹宏和, Contributor, 生物の不思議を解く
共立出版, 2012, Not refereed

シリーズ群集生態学２進化生物学からせまる
東樹宏和, Contributor, 共進化の地理的モザイクと生物群集
京都大学学術出版会, 2009, Not refereed

共進化の生態学
東樹宏和, Contributor, ツバキとゾウムシの共進化: 厚い果皮と長い口吻の軍拡競走. In 種生物学会編
文一総合出版社, 2008, Not refereed

Awards

18 Mar. 2010
日本生態学会, 日本生態学会　宮地賞

01 Apr. 2010
京都大学, 京都大学　白眉研究者

15 Apr. 2020
文部科学省, 文部科学大臣表彰　若手科学者賞

28 Mar. 2019
Human Frontier Science Proram Organization, Human Frontier Science Proram Award 2019

External funds: Kakenhi

Prediction and control of multi-species systems: 10000-microbiome experiments
Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
Medium-sized Section 45:Biology at organismal to population levels and anthropology, and related fields
Kyoto University
東樹宏和
From 30 Jul. 2020, To 31 Mar. 2024, Granted
時系列動態;生態系;生物群集;微生物;微生物叢;生物間相互作用;群集動態;代替安定性;群集の安定性
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20K20586/

Ecology and chemistry of plant-microbiome interactions in iron-deficient soil
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Basic Section 45040:Ecology and environment-related
Kyoto University
東樹宏和
From 25 Sep. 2020, To 31 Mar. 2023, Project Closed
symbiosis;plants;mycorrhizal fungi;共生;土壌;植物;microbiomes;chemical ecology;stable isotopes;nutrient defficiency
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20F20084/

Integration of DNA metabarcoding and stable isotope analyses for disentangling below-ground ecosystem processes
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
Medium-sized Section 45:Biology at organismal to population levels and anthropology, and related fields
Kyoto University
Hirokazu Toju
From 01 Apr. 2018, To 31 Mar. 2022, Project Closed
群集;食物網;地下生態系;クモ;ネットワーク;時系列変動;相互作用ネットワーク;生物間相互作用;炭素循環;DNAメタバーコーディング;生態系
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18H04009/

An interdisciplinary research on food circulation based on Low-nitrogen agriculture and livestock farming
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Kyoto University
AKIRA YOSHINO
From 10 Jul. 2015, To 31 Mar. 2019, Project Closed
窒素循環;循環型農業;無肥料栽培;自然農法;土壌分析;土壌圏微生物;山地酪農;自然栽培;微生物叢;次世代シーケンシング;地力窒素;消費者需要;バイオマス利活用;土壌肥料;マーケティング
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15KT0032/

Restructuring community theory: below-ground ecosystems as "black boxes" in ecology
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
Kyoto University
Hirokazu Toju
From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2018, Project Closed
生態系;生物間相互作用;ネットワーク;共生;群集;土壌;真菌;種間相互作用;生物多様性;内生菌;シーケンシング;菌根;地下;生態学;進化;微生物;次世代シーケンシング;生物群集
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26711026/

High-throughput DNA barcoding for foodweb analysis
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
Kyoto University
Hirokazu Toju
From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2016, Project Closed
生態学;群集;食物網;ネットワーク;DNAバーコーディング;クモ;群集生態学
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26650144/

軍拡競走による適応的分化: 分子集団遺伝学による共進化過程の解明
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
Kyoto University
東樹宏和
From 01 Apr. 2010, To 31 Mar. 2012, Project Closed
共進化;自然選択;集団遺伝学
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22870014/

Elucidation of the soil decomposition process by the dynamic multiomics approach
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
Medium-sized Section 40:Forestry and forest products science, applied aquatic science, and related fields
Kyoto University
木庭啓介
From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2026, Granted
土壌炭素;炭素隔離;窒素循環;安定同位体;土壌;炭素;窒素;土壌炭素隔離;土壌分解;微生物群集;オミクス解析
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22H00383/

External funds: others

環境保全型農業管理における生態系サービスの評価に向けた地理空間データベースの構築と解析の研究
農林水産省農林水産政策研究所, 連携研究スキームによる研究
From 01 Apr. 2020, To 31 Mar. 2024
加藤亮
東樹宏和

資源循環の最適化による農地由来温室効果ガスの排出削減
NEDO, ムーンショット型研究開発制度
From 2020, To 2022
Kiwamu Minamisawa
Hirokazu Toju

Tracking trade across symbiotic networks
HFSP Organization, Human Frontier Science Program
From 01 Oct. 2019, To 30 Sep. 2022
E. Toby Kiers
Hirokazu Toju

多種生命システムの安定化と機能最適化を実現する融合科学の創生
JST, CREST
From 01 Oct. 2023
Hirokazu Toju
鈴木健太・山道真人（共同研究者）

生態系レベルの生物機能最適化を実現する越境科学フロンティア
JST, FOREST
From 01 Apr. 2022
Hirokazu Toju

頑健な植物共生システムの設計に向けた「コア共生微生物」探索技術の開発
JST, PRESTO
From 01 Oct. 2016, To 31 Mar. 2020
Hirokazu Toju

「共生ネットワークのメタゲノム解析」を基礎とする安定な森林生態系の再生
内閣府　最先端・次世代研究育成プログラム
From 20 Mar. 2011, To 31 Mar. 2014
代表

Last Updated :2025/05/03

Education

Teaching subject(s)

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Introduction to Biology and Life Science
N484, Spring, Institute for Liberal Arts and Sciences, 2

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Advanced Course of Genome Life Science
M216, Spring, Institute for Liberal Arts and Sciences, 1

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Beginning Science
1025, Spring, Graduate School of Biostudies, 1

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Advanced course of genome life sciences
1038, Year-long, Graduate School of Biostudies, 1

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Advanced Course in Multicellular Network
1030, Spring, Graduate School of Biostudies, 1

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Advanced Experiments in Integrated Life Sciences
5012, Spring, Graduate School of Biostudies, 4

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Advanced Experiments in Integrated Life Sciences
5012, Fall, Graduate School of Biostudies, 4

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Experimental Course and Seminar A
2006, Spring, Graduate School of Biostudies, 5

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Experimental Course and Seminar A
2006, Fall, Graduate School of Biostudies, 5

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Experimental Course and Seminar B
2007, Fall, Graduate School of Biostudies, 5

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Experimental Course and Seminar C
2008, Spring, Graduate School of Biostudies, 5

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Experimental Course and Seminar C
2008, Fall, Graduate School of Biostudies, 5

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Experimental Course and Seminar B
2007, Spring, Graduate School of Biostudies, 5

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Experimental Course and Seminar D
2009, Spring, Graduate School of Biostudies, 5

From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025
Experimental Course and Seminar D
2009, Fall, Graduate School of Biostudies, 5

From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
Fundamentals of Organismal and Population Biology
N485, Fall, Institute for Liberal Arts and Sciences, 2

From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
Seminars in Biological Science B
4732, Fall, Faculty of Science, 2

From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
Biotic Interactions
3751, Fall, Faculty of Science, 2

From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
Genome Science
3729, Fall, Faculty of Science, 2

From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
Seminar on Ecological Sciences I-IID
8082, Fall, Graduate School of Science, 2

From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
Advanced Lectures : Ecological Science I-IIB
8035, Fall, Graduate School of Science, 2

From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
Advanced Lectures : Ecological Science I-IIA
8034, Spring, Graduate School of Science, 2

From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
Seminar on Ecological Sciences I-IIC
8081, Spring, Graduate School of Science, 2

From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
Seminar on Ecological Sciences I-IIB
8080, Fall, Graduate School of Science, 2

From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024
Seminar on Ecological Sciences I-IIA
8079, Spring, Graduate School of Science, 2

From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
Seminar on Ecological Sciences I-IID
8082, Fall, Graduate School of Science, 2

From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
Advanced Lectures : Ecological Science I-IIB
8035, Fall, Graduate School of Science, 2

From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
Seminar on Ecological Sciences I-IIC
8081, Spring, Graduate School of Science, 2

From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
Seminar on Ecological Sciences I-IIA
8079, Spring, Graduate School of Science, 2

From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
Advanced Lectures : Ecological Science I-IIA
8034, Spring, Graduate School of Science, 2

From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
Genome Science
3729, Fall, Faculty of Science, 2

From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
Seminars in Biological Science B
4732, Fall, Faculty of Science, 2

From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
Fundamentals of Organismal and Population Biology
N485, Fall, Institute for Liberal Arts and Sciences, 2

From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
Seminar on Ecological Sciences I-IIB
8080, Fall, Graduate School of Science, 2

From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
Biotic Interactions
3751, Fall, Faculty of Science, 2

From Apr. 2011, To Mar. 2012
Biodiversity and symbiotic networks in ecosystems
Spring, 全学共通科目

From Apr. 2011, To Mar. 2012
ゲノム科学
Fall, 理学部

From Apr. 2012, To Mar. 2013
Biodiversity and Ecosystems
Spring, 全学共通科目

From Apr. 2012, To Mar. 2013
Genome Science
Fall, 理学部

From Apr. 2013, To Mar. 2014
Genome Science
Fall, 理学部

From Apr. 2013, To Mar. 2014
Special Lecture on Natural History
Year-long, 総合人間学部

From Apr. 2013, To Mar. 2014
Studies of Biology
Year-long, 総合人間学部

From Apr. 2013, To Mar. 2014
Experimental Practice in Biology I
Spring, 全学共通科目

From Apr. 2013, To Mar. 2014
Experimental Practice in Biology II (Marine Biology)
Spring, 全学共通科目

From Apr. 2013, To Mar. 2014
Experimental Practice in Biology III
Spring, 全学共通科目

From Apr. 2014, To Mar. 2015
Genome Science
Fall, 理学部

From Apr. 2014, To Mar. 2015
Special Lecture on Natural History
Year-long, 総合人間学部

From Apr. 2014, To Mar. 2015
Studies of Biology
Year-long, 総合人間学部

From Apr. 2014, To Mar. 2015
Experimental Practice in Biology I
Spring, 全学共通科目

From Apr. 2014, To Mar. 2015
Experimental Practice in Biology II (Marine Biology)
Spring, 全学共通科目

From Apr. 2014, To Mar. 2015
Experimental Practice in Biology III
Spring, 全学共通科目

From Apr. 2015, To Mar. 2016
Experimental Practice in Biology I
Spring, 全学共通科目

From Apr. 2015, To Mar. 2016
Experimental Practice in Biology II (Marine Biology)
Spring, 全学共通科目

From Apr. 2015, To Mar. 2016
Experimental Practice in Biology III
Spring, 全学共通科目

From Apr. 2015, To Mar. 2016
Special Lecture on Natural History
Year-long, 総合人間学部

From Apr. 2015, To Mar. 2016
Studies of Biology
Year-long, 総合人間学部

From Apr. 2016, To Mar. 2017
Experimental Practice in Biology I
Spring, 全学共通科目

From Apr. 2016, To Mar. 2017
Experimental Practice in Biology I
Fall, 全学共通科目

From Apr. 2016, To Mar. 2017
Experimental Practice in Biology II
Spring, 全学共通科目

From Apr. 2016, To Mar. 2017
Genome Science
Fall, 理学部

From Apr. 2016, To Mar. 2017
Special Lecture on Natural History
Year-long, 総合人間学部

From Apr. 2016, To Mar. 2017
Studies of Biology
Year-long, 総合人間学部

From Apr. 2017, To Mar. 2018
Biotic Interactions
Fall, 理学部

From Apr. 2017, To Mar. 2018
Genome Science
Fall, 理学部

From Apr. 2018, To Mar. 2019
Fundamentals of Organismal and Population Biology
Fall, 全学共通科目

From Apr. 2018, To Mar. 2019
Advanced Course in Plant Biology
Fall, 生命科学研究科

From Apr. 2018, To Mar. 2019
Seminar on Ecological Sciences I-IIA
Spring, 理学研究科

From Apr. 2018, To Mar. 2019
Seminar on Ecological Sciences I-IIB
Fall, 理学研究科

From Apr. 2018, To Mar. 2019
Seminar on Ecological Sciences I-IIC
Spring, 理学研究科

From Apr. 2018, To Mar. 2019
Seminar on Ecological Sciences I-IID
Fall, 理学研究科

From Apr. 2018, To Mar. 2019
Advanced Lectures : Ecological Science I-IIA
Spring, 理学研究科

From Apr. 2018, To Mar. 2019
Advanced Lectures : Ecological Science I-IIB
Fall, 理学研究科

From Apr. 2018, To Mar. 2019
Seminars in Biological Science B
Fall, 理学部

From Apr. 2018, To Mar. 2019
Biotic Interactions
Fall, 理学部

From Apr. 2018, To Mar. 2019
Genome Science
Fall, 理学部

From Apr. 2019, To Mar. 2020
Fundamentals of Organismal and Population Biology
Fall, 全学共通科目

From Apr. 2019, To Mar. 2020
Advanced Course in Plant Biology
Spring, 生命科学研究科

From Apr. 2019, To Mar. 2020
Seminar on Ecological Sciences I-IIA
Spring, 理学研究科

From Apr. 2019, To Mar. 2020
Seminar on Ecological Sciences I-IIB
Fall, 理学研究科

From Apr. 2019, To Mar. 2020
Seminar on Ecological Sciences I-IIC
Spring, 理学研究科

From Apr. 2019, To Mar. 2020
Seminar on Ecological Sciences I-IID
Fall, 理学研究科

From Apr. 2019, To Mar. 2020
Advanced Lectures : Ecological Science I-IIA
Spring, 理学研究科

From Apr. 2019, To Mar. 2020
Advanced Lectures : Ecological Science I-IIB
Fall, 理学研究科

From Apr. 2019, To Mar. 2020
Seminars in Biological Science B
Fall, 理学部

From Apr. 2019, To Mar. 2020
Biotic Interactions
Fall, 理学部

From Apr. 2019, To Mar. 2020
Genome Science
Fall, 理学部

From Apr. 2019, To Mar. 2020
Advanced laboratory skills in field biology A
Spring, 理学研究科

From Apr. 2019, To Mar. 2020
Advanced training in field biology A
Spring, 理学研究科

From Apr. 2020, To Mar. 2021
Fundamentals of Organismal and Population Biology
Fall, 全学共通科目

From Apr. 2020, To Mar. 2021
Seminar on Ecological Sciences I-IIA
Spring, 理学研究科

From Apr. 2020, To Mar. 2021
Seminar on Ecological Sciences I-IIB
Fall, 理学研究科

From Apr. 2020, To Mar. 2021
Seminar on Ecological Sciences I-IIC
Spring, 理学研究科

From Apr. 2020, To Mar. 2021
Seminar on Ecological Sciences I-IID
Fall, 理学研究科

From Apr. 2020, To Mar. 2021
Advanced Lectures : Ecological Science I-IIA
Spring, 理学研究科

From Apr. 2020, To Mar. 2021
Advanced Lectures : Ecological Science I-IIB
Fall, 理学研究科

From Apr. 2020, To Mar. 2021
Seminars in Biological Science B
Fall, 理学部

From Apr. 2020, To Mar. 2021
Biotic Interactions
Fall, 理学部

From Apr. 2020, To Mar. 2021
Genome Science
Fall, 理学部

From Apr. 2021, To Mar. 2022
Fundamentals of Organismal and Population Biology
Fall, 全学共通科目

From Apr. 2021, To Mar. 2022
Seminar on Ecological Sciences I-IIA
Spring, 理学研究科

From Apr. 2021, To Mar. 2022
Seminar on Ecological Sciences I-IIB
Fall, 理学研究科

From Apr. 2021, To Mar. 2022
Seminar on Ecological Sciences I-IIC
Spring, 理学研究科

From Apr. 2021, To Mar. 2022
Seminar on Ecological Sciences I-IID
Fall, 理学研究科

From Apr. 2021, To Mar. 2022
Advanced Lectures : Ecological Science I-IIA
Spring, 理学研究科

From Apr. 2021, To Mar. 2022
Advanced Lectures : Ecological Science I-IIB
Fall, 理学研究科

From Apr. 2021, To Mar. 2022
Seminars in Biological Science B
Fall, 理学部

From Apr. 2021, To Mar. 2022
Biotic Interactions
Fall, 理学部

From Apr. 2021, To Mar. 2022
Genome Science
Fall, 理学部

Participation in PhD Defense

Predictability of microbiome dynamics
FUJITA HIROAKI, Graduate School of Science, Chief Examiner
23 May 2023

野生のショウジョウバエ幼虫の成長を支える共生微生物叢の機能解析
MURE AYUMI, Graduate School of Biostudies, Sub-chief Examiner
25 Mar. 2024

Community structure and seasonal changes of soil fungi in seasonal tropical forests of northeast Thailand under different fire regimes
AMMA SARASA, Graduate School of Agriculture, Sub-chief Examiner
23 May 2022

Student achievements: Awards

第70回日本生態学会動物群集分野ポスター優秀賞
Takuya Kageyama, 日本生態学会, Mar. 2023

奨励賞
Ibuki Hayashi, 日本生態学会近畿地区会, Dec. 2023

First-place award
Ibuki Hayashi, Ecological Society of Japan, Mar. 2024

第68回日本生態学会　ポスター賞　最優秀賞
鈴木紗也華, 日本生態学会, Mar. 2021

第65回日本応用動物昆虫学会　ポスター賞
鈴木紗也華, 日本応用動物昆虫学会, Mar. 2021

Part-time lecturer

From Dec. 2022
スマート農業演習第11回: オミックス情報利用による新世代栽培技術の開発
摂南大学, 農学部

From May 2019
植物生命科学特論
京都大学, 生命科学研究科

From 06 Dec. 2021, To 07 Dec. 2021
生物多様性科学特論
集中, University of Tokyo, 農学研究科

From 01 Oct. 2023, To 31 Mar. 2024
生物学セミナーB

From 01 Oct. 2023, To 31 Mar. 2024
生物間相互作用

From 01 Oct. 2023, To 31 Mar. 2024
ゲノム科学

Last Updated :2025/05/03

Administration

Faculty management (title, position)

From 01 Apr. 2024
自己評価委員会

From 01 Oct. 2023
将来像検討委員会

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Toju, Hirokazu

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