Basic Information

Faculty

• 農学部

Academic Degree

• 修士（農学）(京都大学)
• 博士（農学）(京都大学)

Research History

• From Oct. 2024, To Mar. 2025

  Kagoshima University, Graduate School of Science and Engineering, Adjunct lecturer
• From Oct. 2018, To Present

  Kyoto University, Graduate School of Biostudies, Associate Professor
• From Oct. 2013, To Sep. 2018

  Kyoto University, Graduate School of Biostudies, Assistant Professor
• From Nov. 2010, To Sep. 2013

  Kyoto University, Graduate School of Science, Program-specific Assistant Professor
• From Apr. 2008, To Nov. 2010

  The University of Tokyo, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, JSPS Postdoctoral Reserach Fellow
• From Oct. 2007, To Mar. 2008

  Ishikawa Prefectural University, Institute of Bioresource Engineering, Research Fellow
• From Jan. 2006, To Oct. 2007

  University of Oxford, Department of Plant Sciences, Postdoctoral Research Assistant
• From Apr. 2005, To Nov. 2005

  Tottori University, Faculty of Medicine, Research Fellow
• From Apr. 2003, To Mar. 2005

  Kyoto University, Graduate School of Medicine, Research Assistant

ID,URL

• ORCID ID

  0000-0003-4154-9967

• J-Global ID

  201401082716309740

Website(s) (URL(s))

• https://www.remod-reprod.com

researchmap URL

• https://researchmap.jp/7000009028

Research

Research Areas

• Life sciences, Applied molecular and cellular biology
• Life sciences, Plants: molecular biology and physiology

Papers

• MarpolBase: Genome database for Marchantia polymorpha featuring high quality reference genome sequences

  Yasuhiro Tanizawa; Takako Mochizuki; Masaru Yagura; Mika Sakamoto; Takatomo Fujisawa; Shogo Kawamura; Eita Shimokawa; Shohei Yamaoka; Ryuichi Nishihama; John L Bowman; Frederic Berger; Katsuyuki Yamato; Takayuki Kohchi; Yasukazu Nakamura

  03 Apr. 2025

  
• Co-option and neofunctionalization of stomatal executors for defense against herbivores in Brassicales

  Makoto Shirakawa; Tomoki Oguro; Shigeo Sugano; Shohei Yamaoka; Mayu Sagara; Mai Tanida; Kyoko Sunuma; Takuya Iwami; Tatsuyoshi Nakanishi; Keita Horiuchi; Kie Kumaishi; Soma Yoshida; Mutsumi Watanabe; Takayuki Tohge; Takamasa Suzuki; Yasunori Ichihashi; Atsushi Takemiya; Nobutoshi Yamaguchi; Takayuki Kohchi; Toshiro Ito

  Nature Plants, 25 Feb. 2025, Peer-reviewed

  
• PCIS1, Encoded by a Pentatricopeptide Protein Co-expressed Gene, Is Required for Splicing of Three Mitochondrial nad Transcripts in Angiosperms.

  Brody Frink; Matthias Burger; Maya Yarkoni; Sofia Shevtsov-Tal; Hagit Zer; Shohei Yamaoka; Oren Ostersetzer-Biran; Mizuki Takenaka

  Plant & cell physiology, 03 Oct. 2024

  
• Diminished Auxin Signaling Triggers Cellular Reprogramming by Inducing a Regeneration Factor in the Liverwort Marchantia polymorpha.

  Sakiko Ishida; Hidemasa Suzuki; Aya Iwaki; Shogo Kawamura; Shohei Yamaoka; Mikiko Kojima; Yumiko Takebayashi; Katsushi Yamaguchi; Shuji Shigenobu; Hitoshi Sakakibara; Takayuki Kohchi; Ryuichi Nishihama

  Plant & cell physiology, 11 Mar. 2022

  
• Transcription of the Antisense Long Non-Coding RNA, SUPPRESSOR OF FEMINIZATION, Represses Expression of the Female-Promoting Gene FEMALE GAMETOPHYTE MYB in the Liverwort Marchantia polymorpha.

  Tomoaki Kajiwara; Motoki Miyazaki; Shohei Yamaoka; Yoshihiro Yoshitake; Yukiko Yasui; Ryuichi Nishihama; Takayuki Kohchi

  Plant & cell physiology, 16 Apr. 2024

  
• A non-canonical BZR/BES transcription factor regulates the development of haploid reproductive organs in Marchantia polymorpha.

  Tomoyuki Furuya; Natsumi Saegusa; Shohei Yamaoka; Yuki Tomoita; Naoki Minamino; Masaki Niwa; Keisuke Inoue; Chiaki Yamamoto; Kazuki Motomura; Shunji Shimadzu; Ryuichi Nishihama; Kimitsune Ishizaki; Takashi Ueda; Hidehiro Fukaki; Takayuki Kohchi; Hiroo Fukuda; Masahiro Kasahara; Takashi Araki; Yuki Kondo

  Nature plants, May 2024, Peer-reviewed

  
• Conserved CKI1-mediated signaling is required for female germline specification in Marchantia polymorpha.

  Haonan Bao; Rui Sun; Megumi Iwano; Yoshihiro Yoshitake; Shiori S Aki; Masaaki Umeda; Ryuichi Nishihama; Shohei Yamaoka; Takayuki Kohchi

  Current biology : CB, 25 Mar. 2024

  
• Circadian clock does not play an essential role in daylength measurement for growth-phase transition in Marchantia polymorpha.

  Yuki Kanesaka; Keisuke Inoue; Yuki Tomita; Shohei Yamaoka; Takashi Araki

  Frontiers in plant science, 08 Nov. 2023, Peer-reviewed

  
• Thermospermine Is an Evolutionarily Ancestral Phytohormone Required for Organ Development and Stress Responses in Marchantia Polymorpha.

  Takuya Furumoto; Shohei Yamaoka; Takayuki Kohchi; Hiroyasu Motose; Taku Takahashi

  Plant & cell physiology, 16 Apr. 2024

  
• Three-Dimensional Morphological Analysis Revealed the Cell Patterning Bases for the Sexual Dimorphism Development in the Liverwort Marchantia polymorpha.

  Yihui Cui; Tetsuya Hisanaga; Tomoaki Kajiwara; Shohei Yamaoka; Takayuki Kohchi; Tatsuaki Goh; Keiji Nakajima

  Plant & cell physiology, 17 Aug. 2023

  
• A bHLH heterodimer regulates germ cell differentiation in land plant gametophytes.

  Misaki Saito; Ryosuke Momiki; Kazuo Ebine; Yoshihiro Yoshitake; Ryuichi Nishihama; Takuya Miyakawa; Takeshi Nakano; Nobutaka Mitsuda; Takashi Araki; Takayuki Kohchi; Shohei Yamaoka

  Current biology : CB, 20 Nov. 2023, Peer-reviewed, Corresponding author

  
• Biosynthesis of gibberellin-related compounds modulates far-red light responses in the liverwort Marchantia polymorpha

  Rui Sun; Maiko Okabe; Sho Miyazaki; Toshiaki Ishida; Kiyoshi Mashiguchi; Keisuke Inoue; Yoshihiro Yoshitake; Shohei Yamaoka; Ryuichi Nishihama; Hiroshi Kawaide; Masatoshi Nakajima; Shinjiro Yamaguchi; Takayuki Kohchi

  The Plant Cell, 19 Aug. 2023

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• The mutation of CaCKI1 causes seedless fruits in chili pepper (Capsicum annuum).

  Takahiro Maki; Hirokazu Kusaka; Yuki Matsumoto; Akira Yamazaki; Shohei Yamaoka; Sho Ohno; Motoaki Doi; Yoshiyuki Tanaka

  TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik, 25 Mar. 2023

  
• 植物細胞の分化運命の制御と可塑性

  丸山 大輔; 水多 陽子; 山岡 尚平

  植物科学の最前線, 2023

  
• 花粉とコケ植物配偶体の発生における配偶子前駆細胞の分化

  山岡 尚平

  植物科学の最前線, 2023

  
• Possible molecular mechanisms of persistent pollen tube growth without de novo transcription.

  Kazuki Motomura; Naoya Sugi; Atsushi Takeda; Shohei Yamaoka; Daisuke Maruyama

  Frontiers in plant science, 24 Nov. 2022, Peer-reviewed

  
• MarpolBase Expression: A Web-Based, Comprehensive Platform for Visualization and Analysis of Transcriptomes in the Liverwort Marchantia polymorpha.

  Shogo Kawamura; Facundo Romani; Masaru Yagura; Takako Mochizuki; Mika Sakamoto; Shohei Yamaoka; Ryuichi Nishihama; Yasukazu Nakamura; Katsuyuki T Yamato; John L Bowman; Takayuki Kohchi; Yasuhiro Tanizawa

  Plant & cell physiology, 22 Nov. 2022

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• Land plant gametogenesis is a flexible sytem

  Shohei Yamaoka

  The Cell, May 2022, Invited, Lead author, Corresponding author

  
• Identification of the sex-determining factor in the liverwort Marchantia polymorpha reveals unique evolution of sex chromosomes in a haploid system.

  Miyuki Iwasaki; Tomoaki Kajiwara; Yukiko Yasui; Yoshihiro Yoshitake; Motoki Miyazaki; Shogo Kawamura; Noriyuki Suetsugu; Ryuichi Nishihama; Shohei Yamaoka; Dierk Wanke; Kenji Hashimoto; Kazuyuki Kuchitsu; Sean A Montgomery; Shilpi Singh; Yasuhiro Tanizawa; Masaru Yagura; Takako Mochizuki; Mika Sakamoto; Yasukazu Nakamura; Chang Liu; Frédéric Berger; Katsuyuki T Yamato; John L Bowman; Takayuki Kohchi

  Current biology : CB, 20 Dec. 2021, Peer-reviewed

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• Coordination between growth and stress responses by DELLA in the liverwort Marchantia polymorpha.

  Jorge Hernández-García; Rui Sun; Antonio Serrano-Mislata; Keisuke Inoue; Carlos Vargas-Chávez; David Esteve-Bruna; Vicent Arbona; Shohei Yamaoka; Ryuichi Nishihama; Takayuki Kohchi; Miguel A Blázquez

  Current biology : CB, 23 Aug. 2021, Peer-reviewed

  
• Deep evolutionary origin of gamete-directed zygote activation by KNOX/BELL transcription factors in green plants.

  Tetsuya Hisanaga; Shota Fujimoto; Yihui Cui; Katsutoshi Sato; Ryosuke Sano; Shohei Yamaoka; Takayuki Kohchi; Frédéric Berger; Keiji Nakajima

  eLife, 28 Sep. 2021, Peer-reviewed

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• Regulation of gametangia and gametangiophore initiation in the liverwort Marchantia polymorpha.

  Shohei Yamaoka; Keisuke Inoue; Takashi Araki

  Plant reproduction, Dec. 2021, Peer-reviewed, Invited, Lead author, Corresponding author

  
• Development and Molecular Genetics of Marchantia polymorpha.

  Takayuki Kohchi; Katsuyuki T Yamato; Kimitsune Ishizaki; Shohei Yamaoka; Ryuichi Nishihama

  Annual review of plant biology, 08 Mar. 2021, Peer-reviewed, Invited

  
• Regulation of the Poly(A) Status of Mitochondrial mRNA by Poly(A)-Specific Ribonuclease Is Conserved among Land Plants.

  Mai Kanazawa; Yoko Ikeda; Ryuichi Nishihama; Shohei Yamaoka; Nam-Hee Lee; Katsuyuki T Yamato; Takayuki Kohchi; Takashi Hirayama

  Plant & cell physiology, 01 Mar. 2020, Peer-reviewed

  
• Chromatin Organization in Early Land Plants Reveals an Ancestral Association between H3K27me3, Transposons, and Constitutive Heterochromatin.

  Sean A Montgomery; Yasuhiro Tanizawa; Bence Galik; Nan Wang; Tasuku Ito; Takako Mochizuki; Svetlana Akimcheva; John L Bowman; Valérie Cognat; Laurence Maréchal-Drouard; Heinz Ekker; Syuan-Fei Hong; Takayuki Kohchi; Shih-Shun Lin; Li-Yu Daisy Liu; Yasukazu Nakamura; Lia R Valeeva; Eugene V Shakirov; Dorothy E Shippen; Wei-Lun Wei; Masaru Yagura; Shohei Yamaoka; Katsuyuki T Yamato; Chang Liu; Frédéric Berger

  Current biology : CB, 24 Feb. 2020, Peer-reviewed

  
• An Early Arising Role of the MicroRNA156/529-SPL Module in Reproductive Development Revealed by the Liverwort Marchantia polymorpha.

  Tsuzuki M; Futagami K; Shimamura M; Inoue C; Kunimoto K; Oogami T; Tomita Y; Inoue K; Kohchi T; Yamaoka S; Araki T; Hamada T; Watanabe Y

  Current biology : CB, Sep. 2019, Peer-reviewed

  
• Molecular mechanism and evolution of gametogenesis in land plants

  Shohei Yamaoka; Takayuki Kohchi; Takashi Araki

  SEIKAGAKU, Aug. 2019, Peer-reviewed, Invited, Lead author, Corresponding author

  
• Building new insights in plant gametogenesis from an evolutionary perspective.

  Hisanaga T; Yamaoka S; Kawashima T; Higo A; Nakajima K; Araki T; Kohchi T; Berger F

  Nature plants, Jul. 2019, Peer-reviewed, Lead author

  
• A cis ‐acting bidirectional transcription switch controls sexual dimorphism in the liverwort

  Tetsuya Hisanaga; Keitaro Okahashi; Shohei Yamaoka; Tomoaki Kajiwara; Ryuichi Nishihama; Masaki Shimamura; Katsuyuki T Yamato; John L Bowman; Takayuki Kohchi; Keiji Nakajima

  The EMBO Journal, 15 Mar. 2019, Peer-reviewed

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• Loss of CG Methylation in Marchantia polymorpha Causes Disorganization of Cell Division and Reveals Unique DNA Methylation Regulatory Mechanisms of Non-CG Methylation.

  Ikeda Y; Nishihama R; Yamaoka S; Arteaga-Vazquez MA; Aguilar-Cruz A; Grimanelli D; Pogorelcnik R; Martienssen RA; Yamato KT; Kohchi T; Hirayama T; Mathieu O

  Plant & cell physiology, Dec. 2018, Peer-reviewed

  
• Generative Cell Specification Requires Transcription Factors Evolutionarily Conserved in Land Plants.

  Shohei Yamaoka; Ryuichi Nishihama; Yoshihiro Yoshitake; Sakiko Ishida; Keisuke Inoue; Misaki Saito; Keitaro Okahashi; Haonan Bao; Hiroyuki Nishida; Katsushi Yamaguchi; Shuji Shigenobu; Kimitsune Ishizaki; Katsuyuki T Yamato; Takayuki Kohchi

  Current biology : CB, 05 Feb. 2018, Peer-reviewed, Lead author

  
• Insights into Land Plant Evolution Garnered from the Marchantia polymorpha Genome.

  John L Bowman; Takayuki Kohchi; Katsuyuki T Yamato; Jerry Jenkins; Shengqiang Shu; Kimitsune Ishizaki; Shohei Yamaoka; Ryuichi Nishihama; Yasukazu Nakamura; Frédéric Berger; Catherine Adam; Shiori Sugamata Aki; Felix Althoff; Takashi Araki; Mario A Arteaga-Vazquez; Sureshkumar Balasubrmanian; Kerrie Barry; Diane Bauer; Christian R Boehm; Liam Briginshaw; Juan Caballero-Perez; Bruno Catarino; Feng Chen; Shota Chiyoda; Mansi Chovatia; Kevin M Davies; Mihails Delmans; Taku Demura; Tom Dierschke; Liam Dolan; Ana E Dorantes-Acosta; D Magnus Eklund; Stevie N Florent; Eduardo Flores-Sandoval; Asao Fujiyama; Hideya Fukuzawa; Bence Galik; Daniel Grimanelli; Jane Grimwood; Ueli Grossniklaus; Takahiro Hamada; Jim Haseloff; Alexander J Hetherington; Asuka Higo; Yuki Hirakawa; Hope N Hundley; Yoko Ikeda; Keisuke Inoue; Shin-Ichiro Inoue; Sakiko Ishida; Qidong Jia; Mitsuru Kakita; Takehiko Kanazawa; Yosuke Kawai; Tomokazu Kawashima; Megan Kennedy; Keita Kinose; Toshinori Kinoshita; Yuji Kohara; Eri Koide; Kenji Komatsu; Sarah Kopischke; Minoru Kubo; Junko Kyozuka; Ulf Lagercrantz; Shih-Shun Lin; Erika Lindquist; Anna M Lipzen; Chia-Wei Lu; Efraín De Luna; Robert A Martienssen; Naoki Minamino; Masaharu Mizutani; Miya Mizutani; Nobuyoshi Mochizuki; Isabel Monte; Rebecca Mosher; Hideki Nagasaki; Hirofumi Nakagami; Satoshi Naramoto; Kazuhiko Nishitani; Misato Ohtani; Takashi Okamoto; Masaki Okumura; Jeremy Phillips; Bernardo Pollak; Anke Reinders; Moritz Rövekamp; Ryosuke Sano; Shinichiro Sawa; Marc W Schmid; Makoto Shirakawa; Roberto Solano; Alexander Spunde; Noriyuki Suetsugu; Sumio Sugano; Akifumi Sugiyama; Rui Sun; Yutaka Suzuki; Mizuki Takenaka; Daisuke Takezawa; Hirokazu Tomogane; Masayuki Tsuzuki; Takashi Ueda; Masaaki Umeda; John M Ward; Yuichiro Watanabe; Kazufumi Yazaki; Ryusuke Yokoyama; Yoshihiro Yoshitake; Izumi Yotsui; Sabine Zachgo; Jeremy Schmutz

  Cell, 05 Oct. 2017, Peer-reviewed

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• The mu Subunit of Arabidopsis Adaptor Protein-2 Is Involved in Effector-Triggered Immunity Mediated by Membrane-Localized Resistance Proteins

  Noriyuki Hatsugai; Rachel Hillmer; Shohei Yamaoka; Ikuko Hara-Nishimura; Fumiaki Katagiri

  MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, May 2016, Peer-reviewed

  
• 植物の陸上進出と成長相転換

  河内孝之; 山岡尚平

  化学と生物, 2016

  
• 植物における日長による成長相転換制御のメカニズムとその進化

  山岡 尚平; 河内孝之

  BSJ-Review 植物科学最前線, 2016, Lead author

  
• Eukaryotic Components Remodeled Chloroplast Nucleoid Organization during the Green Plant Evolution

  Yusuke Kobayashi; Mari Takusagawa; Naomi Harada; Yoichiro Fukao; Shohei Yamaoka; Takayuki Kohchi; Koichi Hori; Hiroyuki Ohta; Toshiharu Shikanai; Yoshiki Nishimura

  GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION, Jan. 2016, Peer-reviewed

  Access this paper :

  
• Formation of Mitochondrial Outer Membrane Derived Protrusions and Vesicles in Arabidopsis thaliana

  Akihiro Yamashita; Masaru Fujimoto; Kenta Katayama; Shohei Yamaoka; Nobuhiro Tsutsumi; Shin-ichi Arimura

  PLOS ONE, Jan. 2016, Peer-reviewed

  
• The mitochondrial Ras-related GTPase Miro: views from inside and outside the metazoan kingdom

  Shohei Yamaoka; Ikuko Hara-Nishimura

  FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, Jul. 2014, Peer-reviewed, Lead author, Corresponding author

  
• Identification and Dynamics of Arabidopsis Adaptor Protein-2 Complex and Its Involvement in Floral Organ Development

  Shohei Yamaoka; Yuki Shimono; Makoto Shirakawa; Yoichiro Fukao; Takashi Kawase; Noriyuki Hatsugai; Kentaro Tamura; Tomoo Shimada; Ikuko Hara-Nishimura

  PLANT CELL, Aug. 2013, Peer-reviewed, Lead author

  
• A newly discovered function of peroxisomes: Involvement in biotin biosynthesis

  Jun-Ichi Maruyama; Shohei Yamaoka; Ichiro Matsuo; Nobuhiro Tsutsumi; Katsuhiko Kitamoto

  Plant Signaling and Behavior, 2012, Peer-reviewed

  
• Peroxisomes Are Involved in Biotin Biosynthesis in Aspergillus and Arabidopsis

  Yasuko Tanabe; Jun-ichi Maruyama; Shohei Yamaoka; Daiki Yahagi; Ichiro Matsuo; Nobuhiro Tsutsumi; Katsuhiko Kitamoto

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Sep. 2011, Peer-reviewed

  
• MIRO1 influences the morphology and intracellular distribution of mitochondria during embryonic cell division in Arabidopsis

  Shohei Yamaoka; Masaki Nakajima; Masaru Fujimoto; Nobuhiro Tsutsumi

  PLANT CELL REPORTS, Feb. 2011, Peer-reviewed, Lead author

  
• Mitochondrial Dysfunction and Increased Reactive Oxygen Species Impair Insulin Secretion in Sphingomyelin Synthase 1-null Mice

  Masato Yano; Ken Watanabe; Tadashi Yamamoto; Kazutaka Ikeda; Takafumi Senokuchi; Meihong Lu; Tsuyoshi Kadomatsu; Hiroto Tsukano; Masahito Ikawa; Masaru Okabe; Shohei Yamaoka; Toshiro Okazaki; Hisanori Umehara; Tomomi Gotoh; Wen-Jie Song; Koichi Node; Ryo Taguchi; Kazuya Yamagata; Yuichi Oike

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Feb. 2011, Peer-reviewed

  
• Plant mitochondrial dynamics

  Shin-ichi Arimura; Shohei Yamaoka; Hideki Takanashi; Nobuhiro Tsutsumi

  Cell technology, May 2010

  
• EMB2473/MIRO1, an Arabidopsis Miro GTPase, is required for embryogenesis and influences mitochondrial morphology in pollen

  Shohei Yamaoka; Christopher J. Leaver

  PLANT CELL, Mar. 2008, Peer-reviewed, Lead author

  
• Gene organization of the liverwort Y chromosome reveals distinct sex chromosome evolution in a haploid system

  Katsuyuki T. Yamato; Kimitsune Ishizaki; Masaki Fujisawa; Sachiko Okada; Shigeki Nakayama; Mariko Fujishita; Hiroki Bando; Kohei Yodoya; Kiwako Hayashi; Tomoyuki Bando; Akiko Hasumi; Tomohisa Nishio; Ryoko Sakata; Masayuki Yamamoto; Arata Yamaki; Masataka Kajikawa; Takashi Yamano; Taku Nishide; Seung-Hyuk Choi; Yuu Shimizu-Ueda; Tsutomu Hanajiri; Megumi Sakaida; Kaoru Kono; Mizuki Takenaka; Shohei Yamaoka; Chiaki Kuriyama; Yoshito Kohzu; Hiroyuki Nishida; Axel Brennicke; Tadasu Shin-i; Yuji Kohara; Takayuki Kohchi; Hideya Fukuzawa; Kanji Ohyama

  PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, Apr. 2007, Peer-reviewed

  
• Thalidomide-induced antiangiogenic action is mediated by ceramide through depletion of VEGF receptors, and is antagonized by sphingosine-1-phosphate

  T Yabu; H Tomimoto; Y Taguchi; S Yamaoka; Y Igarashi; T Okazaki

  BLOOD, Jul. 2005, Peer-reviewed

  
• Role of membrane sphingomyelin and ceramide in platform formation for Fas-mediated apoptosis

  M Miyaji; ZX Jin; S Yamaoka; R Amakawa; S Fukuhara; SB Sato; T Kobayashi; N Domae; T Mimori; ET Bloom; T Okazaki; H Umehara

  JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE, Jul. 2005, Peer-reviewed

  
• Ceramide reduction and transcriptional up-regulation of glucosylceramide synthase through doxorubicin-activated Sp1 in drug-resistant HL-60/ADR cells

  Y Uchida; M Itoh; Y Taguchi; S Yamaoka; H Umehara; S Ichikawa; Y Hirabayashi; WM Holleran; T Okazaki

  CANCER RESEARCH, Sep. 2004, Peer-reviewed

  
• Expression cloning of a human cDNA restoring sphingomyelin synthesis and cell growth in sphingomyelin synthase-defective lymphoid cells

  S Yamaoka; M Miyaji; T Kitano; H Umehara; T Okazaki

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Apr. 2004, Peer-reviewed, Lead author

  
• A mutant with constitutive sexual organ development in Marchantia polymorpha L.

  S Yamaoka; M Takenaka; T Hanajiri; Y Shimizu-Ueda; H Nishida; KT Yamato; H Fukuzawa; K Ohyama

  SEXUAL PLANT REPRODUCTION, Jan. 2004, Peer-reviewed, Lead author

  
• Functional analysis of a beta-ketoacyl-CoA synthase gene, MpFAE2, by gene silencing in the liverwort Marchantia polymorpha L.

  M Kajikawa; S Yamaoka; KT Yamato; H Kanamaru; E Sakuradani; S Shimizu; H Fukuzawa; K Ohyama

  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Mar. 2003, Peer-reviewed

  
• Construction of male and female PAC genomic libraries suitable for identification of Y-chromosome-specific clones from the liverwort, Marchantia polymorpha

  S Okada; M Fujisawa; T Sone; S Nakayama; R Nishiyama; M Takenaka; S Yamaoka; M Sakaida; K Kono; M Takahama; KT Yamato; H Fukuzawa; A Brennicke; K Ohyama

  PLANT JOURNAL, Nov. 2000, Peer-reviewed

  
• Direct transformation and plant regeneration of the haploid liverwort Marchantia polymorpha L.

  M Takenaka; S Yamaoka; T Hanajiri; Y Shimizu-Ueda; KT Yamato; H Fukuzawa; K Ohyama

  TRANSGENIC RESEARCH, Jun. 2000, Peer-reviewed

  
• Bryophyte 5S rDNA was inserted into 45S rDNA repeat units after the divergence from higher land plants

  T Sone; M Fujisawa; M Takenaka; S Nakagawa; S Yamaoka; M Sakaida; R Nishiyama; KT Yamato; N Ohmido; K Fukui; H Fukuzawa; K Ohyama

  PLANT MOLECULAR BIOLOGY, Nov. 1999, Peer-reviewed

  
• Coexistence of nuclear DNA-encoded tRNA(Val)(AAC) and mitochondrial DNA-encoded tRNA(Val)(UAC) in mitochondria of a liverwort Marchantia polymorpha

  K Akashi; M Takenaka; S Yamaoka; Y Suyama; H Fukuzawa; K Ohyama

  NUCLEIC ACIDS RESEARCH, May 1998, Peer-reviewed

  
• Accumulation of nuclear-encoded tRNA(Thr)(AGU) in mitochondria of the liverwort Marchantia polymorpha

  K Akashi; J Hirayama; M Takenaka; S Yamaoka; Y Suyama; H Fukuzawa; K Ohyama

  BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENE STRUCTURE AND EXPRESSION, Feb. 1997, Peer-reviewed

  

Misc.

• 多くのPPRタンパク質と共発現パターンを示すPCIS1の翻訳産物は植物ミトコンドリアの三種類のnad遺伝子のスプライシングに必要である

  FRINK Brody; BURGER Matthias; YARKONI Maya; SHEVTSOV-TAL Sofi; ZER Hagit; 山岡尚平; OSTERZETZER-BIRAN Oren; 竹中瑞樹

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2024

  
• Mitochondrial dynamics in plants - the role of a Miro GTPase during pollen tube growth and embryonic cell division in Arabidopsis

  Shohei Yamaoka

  浙江大学農学院園芸系セミナー, Nov. 2010, Invited

  
• MIRO1 is required for proper morphology and intracellular distribution of mitochondria during pollen tube growth and embryonic cell division in Arabidopsis

  Shohei Yamaoka

  Cold Spring Harbor Asia Conference: From Plant Biology to Crop Biotechnology, Oct. 2010, Peer-reviewed, Lead author

  
• An evolutionarily conserved bHLH heterodimer for germ cell differentiation in the gametophyte of land plants

  Shohei Yamaoka; Misaki Saito; Ryosuke Momiki; Kazuo Ebine; Yoshihiro Yoshitake; Ryuichi Nishihama; Takuya Miyakawa; Takeshi Nakano; Nobutaka Mitsuda; Takashi Araki; Takayuki Kohchi

  Taiwan-Japan Plant Biology 2023, Oct. 2023, Invited, Lead author, Corresponding author

  
• A bHLH heterodimer for germ cell differentiation from Arabidopsis and Marchantia haploid gametophytes

  Shohei Yamaoka

  Plant Biology Graduate Group Seminar, University of California, Davis, Mar. 2023, Invited

  
• A bHLH heterocomplex regulates gamete progenitor differentiation in Arabidopsis and Marchantia

  Shohei Yamaoka; Misaki Saito; Ryosuke Momiki; Yoshihiro Yoshitake; Ryuichi Nishihama; Kazuo Ebine; Takashi Ueda; Nobutaka Mitsuda; Takashi Araki; Takayuki Kohchi

  EMBO workshop 2022 “An integrated view of early land plant evolution”, Nov. 2022, Invited, Lead author, Corresponding author

  
• BONOBOs, Evolutionarily Conserved bHLH Transcription Factors Required for Germ Cell Differentiation in Land Plants

  Shohei Yamaoka; Ryuichi Nishihama; Yoshihiro Yoshitake; Sakiko Ishida; Keisuke Inoue; Misaki Saito; Keitaro Okahashi; Haonan Bao; Hiroyuki Nishida; Katsushi Yamaguchi; Shuji Shigenobu; Kimitsune Ishizaki; Katsuyuki T. Yamato; Takayuki Kohchi

  The 25th International Congress on Sexual Plant Reproduction, 2018, Lead author

  
• BONOBO–LRL/DROP heterodimer regulates germ cell differentiation in the gametophytes of land plants

  Shohei Yamaoka; Misaki Saito; Ryosuke Momiki; Kazuo Ebine; Yoshihiro Yoshitake; Yoshimi Nakano; Ryuichi Nishihama; Takuya Miyakawa; Takeshi Nakano; Nobutaka Mitsuda; Takashi Araki; Takayuki Kohchi

  The 27th International Congress on Sexual Plant Reproduction, Jul. 2024, Peer-reviewed, Lead author, Corresponding author

  
• An evolutionarily conserved heterodimer of the bHLH proteins BNB and LRL/DROP regulates germ cell differentiation in land plants

  Shohei Yamaoka; Misaki Saito; Ryosuke Momiki; Kazuo Ebine; Yoshihiro Yoshitake; Yoshimi Nakano; Ryuichi Nishihama; Takuya Miyakawa; Takeshi Nakano; Nobutaka Mitsuda; Takashi Araki; Takayuki Kohchi

  日本発生生物学会第57回大会, Jun. 2024, Lead author, Corresponding author

  
• Transcriptional regulatory network for male gametogenesis in the liverwort Marchantia polymorpha

  井上佳祐; 井上佳祐; 小谷莞太; 穴田小恵; 肥後あすか; 山岡尚平; 荒木崇

  日本植物生理学会年会(Web), 2024

  
• Role of male gamete-specific small RNA pathways on spermatogenesis in Marchantia polymorpha

  穴田小恵; PAN Zhao-Jun; SHEN Bing-Nan; 小谷莞太; 肥後あすか; 山岡尚平; 井上佳祐; LIN Shih-Shun; 荒木崇

  日本植物生理学会年会(Web), 2024

  
• Single-nucleus RNA-seq analysis of a germline cell-like cell induction system in the liverwort Marchantia polymorpha

  梶原智明; 熊谷健隆; 吉竹良洋; 岩野恵; 川村昇吾; 安居佑季子; 山岡尚平; 河内孝之

  日本植物生理学会年会(Web), 2024

  
• Evolution of the photoperiod-dependent growth phase transition mechanisms in land plants

  吉竹良洋; 川村昇吾; 梶原智明; 西浜竜一; 西浜竜一; 山岡尚平; 河内孝之

  日本植物生理学会年会(Web), 2024

  
• Exploration of gibberellin-related bioactive molecules in the liverwort Marchantia polymorpha

  岡部麻衣子; SUN Rui; 吉竹良洋; 川村昇吾; 鈴木かおり; 下川瑛太; 安居佑季子; 山岡尚平; 石田俊晃; 増口潔; 山口信次郎; 河内孝之

  日本植物生理学会年会(Web), 2024

  
• Development of new vector series for detection of protein-protein interaction in living plant cells: towards application to novel chemical compound discovery

  山岡尚平; 冨田由妃; 荒木崇

  日本植物生理学会年会(Web), 2024

  
• Live imaging of pollen development and the mechanism of germ cell differentiation by inducing cell division

  永原史織; 永原史織; 丸山大輔; 山岡尚平; 水多陽子; 水多陽子

  日本植物生理学会年会(Web), 2024

  
• Co-option of Stomatal Transcription Factors for the Differentiation of Idioblast Myrosin Cells in Arabidopsis

  中西辰慶; 白川一; 白川一; 小黒友輝; 菅野茂夫; 山岡尚平; 相良真由; 谷田舞; 須沼京子; 石見拓也; 堀内恵大; 熊石妃恵; 吉田颯馬; 渡邉むつみ; 峠隆之; 鈴木考征; 市橋泰範; 市橋泰範; 武宮淳史; 山口暢俊; 河内孝之; 伊藤寿朗

  日本植物生理学会年会(Web), 2024

  
• Molecular mechanism of generative cell differentiation and the search for pollen fertility control chemicals

  山岡尚平

  旭硝子財団助成研究成果報告(Web), 2023

  
• Autophagic cell death in leukemia cells regulated by ceramide and sphingosine-1-phosphate through mammalian target of rapamycin.

  N Harakawa; K Murata; S Yamaoka; T Hori; N Domae; Y Igarashi; H Umehara; T Okazaki

  BLOOD, Nov. 2005

  
• A novel sphingomyelin synthase gene, SMS1-regulated sphingomyelin/ceramide-rich microdomain plays a crucial role in Fas-mediated apoptosis.

  M Miyaji; S Yamaoka; JZ Xiong; R Amakawa; T Mimori; S Fukuhara; H Umehara; T Okazaki

  BLOOD, Nov. 2004

  
• 苔類ゼニゴケで生理活性を示すカウレン酸およびジベレリンの類縁体の探索

  岡部麻衣子; 吉竹良洋; SUN Rui; 川村昇吾; 鈴木かおり; 下川瑛太; 安居佑季子; 山岡尚平; 石田俊晃; 増口潔; 山口信次郎; 河内孝之

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), 2023

  
• ゼニゴケにおける生殖を介したDNAメチル化の伝達機構

  池田陽子; 池田陽子; 中村光希; 十川太輔; 西浜竜一; 山岡尚平; 荒木崇; 河内孝之; MATHIEU Olivier; 大和勝幸

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), 2023

  
• Day-length-dependent chromatin dynamics in the locus of MpBONOBO, a regulator gene for germ cell differentiation in the bryophyte Marchantia polymorpha

  田中健太; 吉竹良洋; 梶原智明; BAO Haonan; 安居佑季子; 山岡尚平; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2023

  
• Molecular mechanisms of environment-dependent germline determination in Marchantia polymorpha

  吉竹良洋; 山岡尚平; 川村昇吾; 梶原智明; 西浜竜一; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2023

  
• Functional analysis of GEX1 homolog in the reproduction of the liverwort Marchantia polymorpha

  永塚さくら; 山岡尚平; 南野尚紀; 上田貴志; 西川周一

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2023

  
• Regulation of the expression of MpBONOBO, a key regulator for germline differentiation, by a transcription factor PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR (PIF) in the bryophyte Marchantia polymorpha

  岡本晴喜; 吉竹良洋; 田中健太; 梶原智明; BAO Haonan; 安居佑季子; 山岡尚平; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2023

  
• アンチセンス長鎖非翻訳RNA SUFの転写は苔類ゼニゴケ雌性化遺伝子FGMYBの発現抑制に重要である

  梶原智明; 宮崎基; 岩崎美雪; 山岡尚平; 吉竹良洋; 安居佑季子; 西浜竜一; 西浜竜一; 河内孝之

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), 2022

  
• ゼニゴケ配偶子器の発生におけるMpBZR3の役割

  古谷朋之; 古谷朋之; 三枝菜摘; 山岡尚平; 島津舜治; 島津舜治; 山本千愛; 石崎公庸; 西浜竜一; 河内孝之; 福田裕穂; 福田裕穂; 笠原賢洋; 荒木崇; 近藤侑貴

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), 2022

  
• ゼニゴケの生活環において多面的に機能する転写因子MpLRLの発現解析

  樅木亮介; 齊藤美咲; 吉竹良洋; 井上佳祐; 河内孝之; 荒木崇; 山岡尚平

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), 2022

  
• ゼニゴケの生活環におけるMpMS1の機能解析

  三枝菜摘; 國本完; 肥後あすか; 神原泉; 冨田由妃; 井上佳祐; 山岡尚平; 荒木崇

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), 2022

  
• コケ配偶体と花粉における生殖細胞分化の理解と制御に向けて

  山岡尚平; 海老根一生; 海老根一生; 齊藤美咲; 樅木亮介; 吉竹良洋; 上田貴志; 上田貴志; 光田展隆; 西浜竜一; 西浜竜一; 荒木崇; 河内孝之

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), 2022

  
• ゼニゴケMpROS1a,MpROS1xによるDNA脱メチル化制御

  池田陽子; 中村光希; 十川太輔; 西浜竜一; 山岡尚平; 荒木崇; 河内孝之; 大和勝幸

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), 2022

  
• ゼニゴケの新規DNAメチル化制御機構:植物と動物の狭間で

  池田陽子; 十川太輔; 西浜竜一; 山岡尚平; 荒木崇; 河内孝之; 平山隆志; 大和勝幸

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), 2020

  
• シロイヌナズナの雄原細胞形成に関わるGH17メンバーの解析

  海老根一生; 海老根一生; 山岡尚平; 上田貴志; 上田貴志

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), 2020

  
• ゼニゴケ器官形成におけるR2R3-MYB転写因子SHOTGLASSの機能

  酒井友希; 高見英幸; 山岡尚平; 近藤侑貴; 深城英弘; 三村徹郎; 三村徹郎; 石崎公庸

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), 2021

  
• ゼニゴケ側生器官形成を制御するMYB転写因子GCAM2の機能解析

  酒井友希; 高見英幸; 塚本成幸; 山岡尚平; 増田晃秀; 深城英弘; 三村徹郎; 河内孝之; 石崎公庸

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), 2020

  
• 苔類ゼニゴケの性染色体上の性決定因子の同定

  岩崎美雪; 梶原智明; 安居佑季子; 吉竹良洋; 宮崎基; 川村昇吾; 末次憲之; 末次憲之; 西浜竜一; 西浜竜一; 山岡尚平; WANKE Dierk; 橋本研志; 朽津和幸; MONTGOMERY Sean A.; SINGH Shilpi; 谷澤靖洋; 矢倉勝; 望月孝子; 坂本美佳; 中村保一; LIU Chang; BERGER Frederic; 大和勝幸; BOWMAN John L.; 河内孝之

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), 2022

  
• MarpolBase Expression(MBEX):苔類ゼニゴケにおけるトランスクリプトームの可視化・解析データベース

  川村昇吾; ROMANI Facundo; 矢倉勝; 望月孝子; 坂本美佳; 山岡尚平; 西浜竜一; 中村保一; 大和勝幸; BOWMAN John; 河内孝之; 谷澤靖洋

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), 2022

  
• Evolutionally origin of photoperiod dependent germline cells formation pathway in land plants.

  吉竹良洋; 山岡尚平; 川村省吾; 梶原智明; 西浜竜一; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2022

  
• Genetic screen for suppressors of a gibberellin-related mutation in the liverwort Marchantia polymorpha

  下川瑛太; 川村昇吾; RUI Sun; 鈴木かおり; 岡部麻衣子; 吉竹良洋; 安居佑季子; 西浜竜一; 山岡尚平; 増口潔; 山口信次郎; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2022

  
• A possible molecular mechanism for directional growth of pollen tubes devoid of the nuclei from the apical cytoplasm

  元村一基; 元村一基; 杉直也; 竹田篤史; 山岡尚平; 丸山大輔

  日本植物生理学会年会(Web), 2023

  
• Marpolbase: development of the genome and expression database for the liverwort Marchantia polymorpha

  谷澤靖洋; 川村省吾; ROMANI Facundo; 矢倉勝; 望月孝子; 坂本美佳; 山岡尚平; 西浜竜一; 中村保一; 大和勝幸; BOWMAN John; 河内孝之

  日本植物生理学会年会(Web), 2023

  
• MarpolBase Expression: A web-based, comprehensive platform for visualization and insight acquisition out of publicly available transcriptomes of the liverwort Marchantia polymorpha

  川村昇吾; FACUNDO Romani; 矢倉勝; 望月孝子; 坂本美佳; 山岡尚平; 西浜竜一; 中村保一; 大和勝幸; BOWMAN John; 河内孝之; 谷澤靖洋

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2022

  
• A bHLH transcription factor complex required for land plant germ cell differentiation

  山岡尚平; 齊藤美咲; 樅木亮介; 吉竹良洋; 光田展隆; 海老根一生; 海老根一生; 西浜竜一; 西浜竜一; 荒木崇; 河内孝之

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), Mar. 2022, Lead author

  
• ゼニゴケの配偶子器発生制御におけるMpBZR3の機能解析

  古谷 朋之; 山岡 尚平; 石崎 公庸; 西浜 竜一; 荒木 崇; 河内 孝之; 福田 裕穂; 近藤 侑貴

  第63回日本植物生理学会年会, Mar. 2022

  
• ゼニゴケにおけるジベレリンに関連したメチル基転移酵素機能に影響する新規変異体選抜

  下川 瑛太; 川村 昇吾; Rui Sun; 鈴木 かおり; 吉竹 良洋; 安居 佑季子; 西浜 竜一; 山岡 尚平; 増口 潔; 山口 信次郎; 河内 孝之

  第63回日本植物生理学会年会, Mar. 2022

  
• シロイヌナズナ花粉管は先端から核を排除した状態でも伸長制御能力を保持している

  元村 一基; 杉 直也; 松本 歩; 武内 秀憲; 野田口 理孝; 東山 哲也; 木下 哲; 山岡 尚平; 竹田 篤史; 丸山 大輔

  第63回日本植物生理学会年会, Mar. 2022

  
• 苔類ゼニゴケの成長相転換制御における日長認識機構の解析

  金坂侑紀; 井上佳祐; 山岡尚平; 荒木崇

  日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM), Sep. 2021

  
• ゼニゴケ配偶子器の発生を制御する非典型BZR転写因子

  古谷朋之; 山岡尚平; 石崎公庸; 西浜竜一; 荒木崇; 河内孝之; 福田裕穂; 近藤侑貴

  日本植物学会第85回大会, Sep. 2021

  
• Feedback regulation of sexual organ formation by a methyltransferase via the gibberellin-related pathway in the liverwort Marchantia polymorpha

  川村昇吾; SUN Rui; 吉竹吉洋; 楠龍之介; 西浜竜一; 山岡尚平; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2021

  
• Transcription of antisense long non-coding RNA SUF is important for the suppression of female differentiation in the liverwort Marchantia polymorpha

  梶原智明; 宮崎基; 岩崎美雪; 山岡尚平; 吉竹良洋; 安居佑季子; 西浜竜一; 西浜竜一; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2021

  
• Evolution of environment-dependent sexual reproduction mechanism in land plants.

  吉竹良洋; 山岡尚平; 川村昇吾; 西浜竜一; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2021

  
• 陸上植物進化から探る環境依存的な有性生殖プログラムの起動原理

  吉竹良洋; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2020

  
• アンチセンス長鎖非コードRNA SUFを介した苔類ゼニゴケの性分化制御機構の解析

  梶原智明; 宮崎基; 岩崎美雪; 山岡尚平; 吉竹良洋; 安居佑季子; 西浜竜一; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2020

  
• The role of germ cell-specific histone H1 variants during spermiogenesis in Marchantia polymorpha

  KOTANI Kanta; NISHIDA Ruri; HIGO Asuka; YAMAOKA Shohei; INOUE Keisuke; ARAKI Takashi

  日本植物生理学会年会(Web), 2021

  
• Molecular mechanism for far-red light- and photoperiod-dependent growth phase transition in Marchantia polymorpha

  KANESAKA Yuki; INOUE Keisuke; YAMAOKA Shohei; ARAKI Takashi

  日本植物生理学会年会(Web), 2021

  
• Gibberellin-mediated feedback regulation of sexual organ formation in the liverwort Marchantia polymorpha

  KAWAMURA Shogo; SUN Rui; WANG Ran; YOSHITAKE Yoshihiro; KUSUNOKI Ryunosuke; NISHIHAMA Ryuichi; YAMAOKA Shohei; KOHCHI Takayuki

  日本植物生理学会年会(Web), 2021

  
• The roles of plant specific BZR transcription factors in Marchantia polymorpha

  FURUYA Tomoyuki; YAMAOKA Shohei; ISHIZAKI Kimitsune; NISHIHAMA Ryuichi; ARAKI Takashi; KOHCHI Takayuki; FUKUDA Hiroo; KONDO Yuki

  日本植物生理学会年会(Web), 2021

  
• Functional analysis of a R2R3-MYB transcription factor SHOTGLASS in Marchantia polymorpha

  酒井友希; 高見英幸; 塚本成幸; 山岡尚平; 近藤侑貴; 深城英弘; 三村徹郎; 三村徹郎; 石崎公庸

  日本植物生理学会年会(Web), 2021

  
• Analysis of GH17 members regulating generative cell engulfment by the vegetative cell in Arabidopsis

  海老根一生; 海老根一生; 山岡尚平; 上田貴志; 上田貴志

  日本植物生理学会年会(Web), 2021

  
• Marpolbase: development of the genome and expression database for the liverwort Marchantia polymorpha

  谷澤靖洋; 川村昇吾; 矢倉勝; 望月孝子; 坂本美佳; 山岡尚平; 西浜竜一; 大和勝幸; 河内孝之; LIU Chang; BERGER Frederic; 中村保一

  日本植物生理学会年会(Web), 2021

  
• Analysis of GH17 members regulating engulfment of the generative cell into the vegetative cell in Arabidopsis

  海老根一生; 海老根一生; 山岡尚平; 上田貴志; 上田貴志

  日本植物生理学会年会(Web), 2020

  
• Regulation of growth by gibberellin-related compounds methylation in the liverwort Marchantia polymorpha

  川村昇吾; SUN Rui; 山岡尚平; 鈴木かおり; 吉竹吉洋; 西浜竜一; 河内孝之

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2020

  
• Molecular Mechanism For Day-length Perception In The Basal Land Plant Marchantia polymorpha

  INOUE Keisuke; KANESAKA Yuki; YAMAOKA Shohei; NISHIHAMA Ryuichi; KOHCHI Takayuki; ARAKI Takashi

  日本植物生理学会年会(Web), 2020

  
• Analysis of germ cell-specific histone H1 variants involved in spermiogenesis in Marchantia

  KOTANI Kanta; NISHIDA Ruri; HIGO Asuka; INOUE Keisuke; YAMAOKA Shohei; ARAKI Takashi

  日本植物生理学会年会(Web), 2020

  
• ゼニゴケ・高密度な実験情報の集約によるモデル植物化の加速

  中村保一; 谷澤靖洋; 望月孝子; 矢倉勝; 坂本美佳; 大和勝幸; 上田貴志; 金澤健彦; 西浜竜一; 山岡尚平; 河内孝之

  日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集, 2019

  
• ゼニゴケの生殖器官形成における光質と日長の役割

  金坂侑紀; 井上佳祐; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之; 荒木崇

  日本植物学会大会研究発表記録, 2019

  
• メチル基転移酵素SABATHファミリーによるジベレリン関連経路を介した生殖成長の制御

  川村昇吾; 河内孝之; 西浜竜一; 山岡尚平; SUN Rui; 吉竹良洋

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2019

  
• SABATHファミリー遺伝子を介した生殖器官形成の抑制

  川村昇吾; 山岡尚平; SUN Rui; 楠龍之介; 西浜竜一; 河内孝之

  日本植物学会大会研究発表記録, 2019

  
• アンチセンス長鎖ノンコーディングRNA SUFによる苔類ゼニゴケ雌性化因子MpFGMYBの発現抑制メカニズムの解析

  梶原智明; 岡橋啓太郎; 久永哲也; 久永哲也; 宮崎基; 岩崎美雪; 山岡尚平; 西浜竜一; 嶋村正樹; 大和勝幸; 中島敬二; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2019

  
• アンチセンスlong non-coding RNA SUFによる苔類ゼニゴケ雌性化因子MpFGMYBの発現抑制メカニズムの解明

  梶原智明; 岡橋啓太郎; 久永哲也; 岩崎美雪; 宮崎基; 山岡尚平; 西浜竜一; 嶋村正樹; 大和勝幸; 中島敬二; 河内孝之

  日本植物学会大会研究発表記録, 2019

  
• A histidine kinase MpCKI1 plays a role in female sexual development in Marchantia polymorpha

  包昊南; 吉竹良洋; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之

  日本植物学会大会研究発表記録, 2019

  
• フィトクロムを介した遠赤色光シグナルはゼニゴケの生殖器官形成を制御する

  井上佳祐; 金坂侑紀; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之; 荒木崇

  日本植物学会大会研究発表記録, 2019

  
• 緑色植物における葉緑体DNAリガーゼのバクテリア型から真核生物型への機能移譲

  浜地貴志; 小林優介; 山岡尚平; 鹿内利治; 西村芳樹

  日本植物学会大会研究発表記録, 2019

  
• 陸上植物進化から探る環境依存的な有性生殖プログラムの起動メカニズム

  吉竹良洋; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2019

  
• A methyltransferase family gene involved in sexual organ formation in the liverwort Marchantia polymorpha

  KAWAMURA Shogo; YAMAOKA Shohei; KUSUNOKI Ryunosuke; SUN Rui; NISHIHAMA Ryuichi; KOHCHI Takayuki

  日本植物生理学会年会(Web), 2019

  
• Gibberellin Precursor Is Involved in Sexual Organ Formation in the Liverwort Marchantia polymorpha

  SUN Rui; WANG Ran; KUSUNOKI Ryunosuke; INOUE Keisuke; NISHIHAMA Ryuichi; YAMAOKA Shohei; KOHCHI Takayuki

  日本植物生理学会年会(Web), 2019

  
• Genome analysis for the liverwort Marchantia polymorpha and the diatom Nitzschia sp. NIES4239

  MOCHIZUKI Takako; TANIZAWA Yasuhiro; YAMAOKA Shohei; NISHIHAMA Ryuichi; KANAZAWA Takehiko; MONTGOMERY Sean A; LIU Chang; GALIK Bence; BERGER Frederic; UEDA Takashi; YAMATO Katsuyuki T; KOHCHI Takayuki; TANIFUJI Goro; KAMIKAWA Ryoma; NAKAMURA Yasukazu

  日本植物生理学会年会(Web), 2019

  
• MpBONOBO転写複合体による苔類ゼニゴケの生殖器官形成の制御

  齊藤美咲; 山岡尚平; 吉竹良洋; 光田展隆; 西浜竜一; 河内孝之

  日本植物生理学会年会(Web), 2019

  
• 異所的な分裂組織を形成するゼニゴケeda1変異体の解析

  毛利遊野; 大谷健人; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之; 高橋卓; 本瀬宏康

  日本植物生理学会年会(Web), 2019

  
• 苔類ゼニゴケにおけるX染色体上の性決定遺伝子の探索

  岩崎美雪; 山岡尚平; 梶原智明; 宮崎基; 末次憲之; 吉竹良洋; 西浜竜一; 大和勝幸; 河内孝之

  日本植物生理学会年会(Web), 2019

  
• クローナル解析で究明する苔類ゼニゴケの無性芽発生パターンとオーキシン受容体MpTIR1の役割

  鈴木秀政; HARRISON Jill; 嶋村正樹; 山岡尚平; 河内孝之; 西浜竜一

  日本植物学会大会研究発表記録, 01 Sep. 2018

  
• 転写因子BONOBOの機能に必要な相互作用因子の同定

  齊藤美咲; 山岡尚平; 吉竹良洋; 光田展隆; 西浜竜一; 河内孝之

  日本植物学会大会研究発表記録, 01 Sep. 2018

  
• 母性遺伝メカニズムの解明に向けたクラミドモナス有性生殖のゲノム編集アプローチ

  浜地貴志; 山岡尚平; 鹿内利治; 西村芳樹

  日本植物学会大会研究発表記録, 01 Sep. 2018

  
• ゼニゴケにおけるDNAメチル化制御

  池田陽子; 西浜竜一; 山岡尚平; ARTEAGA‐VAZQUEZ Mario. A; GRIMANELLI Daniel; MARTIENSSEN Robert A; POGORELCNIK Romain; MATHIEU Olivier; 大和勝幸; 河内孝之; 平山隆志

  日本植物学会大会研究発表記録, 01 Sep. 2018

  
• 陸上植物の生殖細胞分化に必要な転写因子BONOBOの同定と標的遺伝子の探索

  山岡尚平; 西浜竜一; 吉竹良洋; 石田咲子; 井上佳祐; 齋藤美咲; 岡橋啓太郎; 包昊南; 西田浩之; 山口勝司; 重信秀治; 石崎公庸; 大和勝幸; 河内孝之

  日本植物学会大会研究発表記録, 01 Sep. 2018

  
• ゼニゴケ・ゲノムにおける植物ホルモン生合成・シグナル伝達系遺伝子

  山岡尚平; 西浜竜一; 石崎公庸; 大和勝幸; 河内孝之

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 05 Mar. 2018

  
• ゼニゴケで唯一のオーキシン受容体遺伝子MpTIR1は発生に必要であるが細胞の生存には必須ではない

  鈴木秀政; 加藤大貴; 加藤大貴; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 05 Mar. 2018

  
• ゼニゴケのサーモスペルミン合成酵素遺伝子MpACL5機能欠損変異株の解析

  古本拓也; 大谷健人; 石崎公庸; 山岡尚平; 河内孝之; 本瀬宏康

  日本ポリアミン学会年会プログラム及び抄録集, 19 Jan. 2018

  
• Gibberellin-independent functional conservation of DELLA protein in the basal land plant Marchantia polymorpha

  SUN Rui; INOUE Keisuke; KUSUNOKI Ryunosuke; NISHIHAMA Ryuichi; YAMAOKA Shohei; KOHCHI Takayuki

  日本植物生理学会年会(Web), 2018

  
• メチル基転移酵素ファミリー遺伝子による苔類ゼニゴケの生殖器官形成の制御

  川村昇吾; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2018

  
• 苔類ゼニゴケ再生過程におけるMpESRの機能解析

  石田咲子; 山岡尚平; 山口勝司; 重信秀治; 小嶋美紀子; 竹林裕美子; 榊原均; 河内孝之; 西浜竜一

  日本植物生理学会年会(Web), 2018

  
• 枝状突起を形成する新奇ゼニゴケ変異体eda1の解析

  毛利遊野; 大谷健人; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之; 高橋卓; 本瀬宏康

  日本植物生理学会年会(Web), 2018

  
• 転写因子BONOBOは陸上植物の生殖系列細胞の分化に必要である

  山岡尚平; 西浜竜一; 吉竹良洋; 石田咲子; 井上佳祐; 齊藤美咲; 岡橋啓太郎; BAO Haonan; 西田浩之; 山口勝司; 重信秀治; 石崎公庸; 大和勝幸; 河内孝之

  日本植物生理学会年会(Web), 2018

  
• 苔類ゼニゴケの生殖器官形成はMpCDFとMpTPLの相互作用を介して抑制される

  吉竹良洋; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2018

  
• 苔類ゼニゴケにおける雌性化因子MpFGMYBとアンチセンスlncRNA SUFからなる性分化モジュールの解析

  梶原智明; 岡橋啓太郎; 山岡尚平; 久永哲也; 中島敬二; 西浜竜一; 河内孝之

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2018

  
• MpFGMYBはゼニゴケの雌性分化を制御する

  久永哲也; 岡橋啓太郎; 山岡尚平; 西浜竜一; 郷達明; 河内孝之; 中島敬二

  日本植物学会大会研究発表記録, 01 Sep. 2017

  
• ノンコーディングRNAを介したゼニゴケの性分化制御

  岡橋啓太郎; 久永哲也; 山岡尚平; 西浜竜一; 中島敬二; 河内孝之

  日本植物学会大会研究発表記録, 01 Sep. 2017

  
• 核オーキシンシグナリングによるゼニゴケ幹細胞機能調節

  鈴木秀政; 加藤大貴; 加藤大貴; 片山みなみ; 灰庭瑛実; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之

  日本植物学会大会研究発表記録, 01 Sep. 2017

  
• ゼニゴケのPARNはミトコンドリアmRNAポリA鎖長を制御する

  金澤まい; 池田陽子; 西浜竜一; 山岡尚平; 大和勝幸; 河内孝之; 平山隆志; 平山隆志

  日本RNA学会年会要旨集, 19 Jul. 2017

  
• The transcription factor BONOBO controls sexual organ development in the basal land plant Marchantia polymorpha

  Shohei Yamaoka; Keisuke Inoue; Ryuichi Nishihama; Katsushi Yamaguchi; Shuji Shigenobu; Kimitsune Ishizaki; Katsuyuki T. Yamato; Takayuki Kohchi

  50th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists, May 2017

  
• 苔類ゼニゴケにおけるMpTIR1を介したオーキシン受容機構と生理機能の解析

  鈴木秀政; 加藤大貴; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 05 Mar. 2017

  
• 陸上植物の進化過程と桂皮酸モノリグノール生合成能の獲得に関する研究

  古畑美帆; 杉山結郁; 西浜竜一; 山岡尚平; 河内孝之; 岡澤敦司; 太田大策

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 05 Mar. 2017

  
• 苔類ゼニゴケのAMP1およびCYP78ホモログは関連した発生調節機能を持つ

  池田敬登; 桐田啓如; 桧原健一郎; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 05 Mar. 2017

  
• CYCLING DOF FACTOR ホモログはゼニゴケの生殖器の発達を抑制する

  吉竹良洋; 山岡尚平; 永山啓太郎; 久保田茜; 西浜竜一; 河内孝之

  第58回日本植物生理学会年会, Mar. 2017

  
• Exploring the biological functions of gibberellin-related diterpenes in the basal land plant Marchantia polymorpha

  Rui Sun; Keisuke Inoue; Ryunosuke Kusunoki; Ryuichi Nishihama; Shohei Yamaoka; Takayuki Kohchi

  第58回日本植物生理学会年会, Mar. 2017

  
• Phytohormonal regulation of tissue dedifferentiation and cell-cycle re-entry during regeneration in the liverwort Marchantia polymorpha

  Sakiko Ishida; Shohei Yamaoka; Ryuichi Nishihama; Takayuki Kohchi

  Auxin 2016, Oct. 2016

  
• The single-copy auxin receptor gene MpTIR1 regulates various development and differentiation in the liverwort Marchantia polymorpha

  Hidemasa Suzuki; Hirotaka Kato; Shohei Yamaoka; Ryuichi Nishihama; Takayuki Kohchi

  Auxin 2016, Oct. 2016

  
• シロイヌナズナにおいてクラスリンアダプタータンパク質複合体AP2に依存したエンドサイトーシスはホウ酸輸送体の偏在とホウ素欠乏条件下での生育に必須である

  吉成晃; 吉成晃; 西村浩二; 天野太郎; 藤本優; 山岡尚平; 嶋田知生; 上田貴志; 上田貴志; 西村いくこ; 稲田のりこ; 高野順平

  日本土壌肥料学会講演要旨集, 2016

  
• The transcription factor BONOBO plays a central role in transition from vegetative to reproductive growth in the liverwort Marchantia polymorpha

  Shohei Yamaoka; Keisuke Inoue; Ryuichi Nishihama; Katsushi Yamaguchi; Shuji Shigenobu; Kimitsune Ishizaki; Katsuyuki T. Yamato; Takayuki Kohchi

  EMBO Workshop New model systems for early land plant evolution, Jun. 2016

  
• 苔類ゼニゴケの成長相制御因子BONOBOの日長・光質による発現制御

  山岡尚平; 井上佳祐; 友金寛和; 西浜竜一; 山口勝司; 重信秀治; 石崎公庸; 大和勝幸; 河内孝之

  第57回日本植物生理学会年会, Mar. 2016

  
• 苔類ゼニゴケにおいて遺伝的に保存されたGI-FKF-CDF経路は光周期性成長相転換を決定する

  永山啓太郎; 吉竹良洋; 久保田茜; 西浜竜一; 山岡尚平; 河内孝之

  第57回日本植物生理学会年会, Mar. 2016

  
• 苔類ゼニゴケおける単一のオーキシン受容体遺伝子MpTIR1による 多面的な生長調節の解析

  鈴木秀政; 加藤大貴; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之

  第57回日本植物生理学会年会, Mar. 2016

  
• PARN and PAP regulate the poly(A) status of mitochondrial mRNA in liverwort.

  KANAZAWA Mai; IKEDA Yoko; NISHIHAMA Ryuichi; YAMAOKA Shohei; KOCHI Takayuki; HIRAYAMA Takashi

  日本RNA学会年会要旨集, 2016

  
• Functional Analysis of the GA-GID1-DELLA Signaling Module in the Liverwort Marchantia polymorpha

  SUN Rui; INOUE Keisuke; KUSUNOKI Ryunosuke; NISHIHAMA Ryuichi; YAMAOKA Shohei; KOHCHI Takayuki

  日本植物生理学会年会要旨集, 2016

  
• 植物におけるミトコンドリアと外膜のダイナミクス

  山下晃弘; 藤本優; 片山健太; 山岡尚平; 堤伸浩; 有村慎一

  日本細胞生物学会大会(Web), 2016

  
• ゼニゴケのPARNはミトコンドリアmRNAのpoly(A)を制御する

  金澤まい; 池田陽子; 西浜竜一; 山岡尚平; 河内孝之; 平山隆志; 平山隆志

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2016

  
• シロイヌナズナのホウ酸輸送体BOR1の偏在と分解を制御するエンドサイトーシス機構

  吉成晃; 吉成晃; 藤本優; 天野太郎; 山岡尚平; 嶋田知生; 上田貴志; 稲田のりこ; 西村いくこ; 内藤哲; 内藤哲; 高野順平

  トランスポーター研究会年会抄録集, 2016

  
• ゼニゴケの暗誘導老化 II.変異体shr1の表現型の解析

  石井優太; 山田如都実; 佐藤友哉; 児玉豊; 山岡尚平; 石崎公庸; 河内孝之; 井上悠子; 森安裕二

  日本植物学会大会研究発表記録, 01 Sep. 2015

  
• 葉緑体核様体コア因子の多様性と進化

  小林優介; 田草川真理; 田草川真理; 原田尚実; 深尾陽一朗; 深尾陽一朗; 山岡尚平; 河内孝之; 堀孝一; 太田啓之; 太田啓之; 鹿内利治; 西村芳樹

  日本植物学会大会研究発表記録, 01 Sep. 2015

  
• Transcriptional activities and protein interactions of AUXIN RESPONSE FACTORs from Marchantia polymorpha

  加藤大貴; 鈴木秀政; 山岡尚平; 西浜竜一; 石崎公庸; 河内孝之

  48th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists, Jun. 2015

  
• 転写因子BONOBOは苔類ゼニゴケの有性生殖器官形成を制御する

  山岡尚平; 友金寛和; 西浜竜一; 山口勝司; 重信秀治; 石崎公庸; 大和勝幸; 河内孝之

  第56回日本植物生理学会年会, Mar. 2015

  
• 苔類ゼニゴケにおけるオーキシン受容メカニズムの解析

  加藤大貴; 鈴木秀政; 山岡尚平; 西浜竜一; 石崎公庸; 河内孝之

  第56回日本植物生理学会年会, Mar. 2015

  
• Isolation of a mutant showing accelerated senescence in darkness in Marchantia polymorpha L.

  Yuya Sato; Yutaka Kodama; Shohei Yamaoka; Kimitsune Ishizaki; Takayuki Kohchi; Yuko Inoue; Yuji Moriyasu

  第56回日本植物生理学会年会, Mar. 2015

  
• 苔類ゼニゴケにおけるオーキシン受容体MpTIR1の生理機能の解析

  鈴木秀政; 加藤大貴; 山岡尚平; 西浜竜一; 河内孝之

  第56回日本植物生理学会年会, Mar. 2015

  
• シロイヌナズナAP-2複合体の生理機能の解明

  門脇千穂; 髙木純平; 山岡尚平; 白川一; 上田晴子; 田村謙太郎; 小嶋美紀子; 榊原均; 嶋田知生; 西村いくこ

  第56回日本植物生理学会年会, Mar. 2015

  
• The transcription factor BONOBO regulates sexual organ development in the liverwort Marchantia polymorpha.

  Shohei Yamaoka; Hirokazu Tomogane; Ryuichi Nishihama; Katsushi Yamaguchi; Shuji Shigenobu; Kimitsune Ishizaki; Katsuyuki T. Yamato; Takayuki Kohchi

  The 2nd International Symposium on Plant Environmental Sensing, Mar. 2015

  
• The transcription factor BONOBO appears to regulate gametangiophore formation in Marchantia polymorpha.

  Shohei Yamaoka; Kimitsune Ishizaki; Katsuyuki T. Yamato; Ryuichi Nishihama; Takayuki Kohchi

  Marchantia Workshop 2014, Dec. 2014, Invited

  
• 基部陸上植物ゼニゴケにおけるGI‐FKF複合体を介した光周性生長相制御機構

  久保田茜; 喜多祥吾; 永山啓太郎; 山岡尚平; 西浜竜一; 石崎公庸; 河内孝之

  日本植物学会大会研究発表記録, 01 Sep. 2014

  
• 苔類ゼニゴケにおいてCYCLING DOF FACTORは光周性成長相転換を抑制する

  永山啓太郎; 久保田茜; 喜多祥吾; 山岡尚平; 西浜竜一; 石崎公庸; 河内孝之

  日本植物学会, Sep. 2014

  
• Molecular dynamics of Arabidopsis AP-2 complex and its involvement in floral organ development.

  Shohei Yamaoka; Yuki Shimono; Makoto Shirakawa; Yoichiro Fukao; Takashi Kawase; Noriyuki Hatsugai; Kentaro Tamura; Tomoo Shimada; Ikuko Hara-Nishimura

  East Asia Cell Biology Conference 2014, Apr. 2014

  
• シロイヌナズナAP-2アダプター複合体のダイナミクス

  山岡尚平; 下野裕貴; 白川一; 深尾陽一朗; 川瀬貴士; 初谷紀幸; 田村謙太郎; 嶋田知生; 西村いくこ

  第55回日本植物生理学会年会, Mar. 2014

  
• A Miro GTPase influences mitochondrial morphology in Arabidopsis.

  Yamaoka, S; Nakajima, M; Fujimoto, M; Tsutsumi, N; Leaver, C.J; Hara-Nishimura, I

  The 4th International Symposium on Dynamics of Mitochondria (DynaMito 2013), Mar. 2013

  
• シロイヌナズナAP-2アダプチン複合体は花器官形成に関与する

  山岡尚平; 下野裕貴; 白川一; 深尾陽一朗; 初谷紀幸; 田村謙太郎; 嶋田知生; 西村いくこ

  第54回日本植物生理学会年会, Mar. 2013

  
• Mitochondrial dynamics during enabryogenesis and pollen tube growth in Arabidopsis

  Shohei Yamaoka; Masaki Nakajima; Masaru Fujimoto; Christopher J. Leaver; Nobuhiro Tsutsumi

  GENES & GENETIC SYSTEMS, Dec. 2012

  
• An Arabidopsis Miro GTPase maintains mitochondrial morphology during pollen tube growth and embryogenesis.

  Yamaoka S; Hara-Nishimura I

  The 4th NIBB-MPIPZ-TLL Symposium, Nov. 2012

  
• シロイヌナズナの胚発生と花粉管伸張におけるミトコンドリア・ダイナミクス

  山岡尚平; 中島将貴; 藤本優; LEAVER Christopher J; 堤伸浩

  日本遺伝学会大会プログラム・予稿集, 31 Aug. 2012

  
• 植物の発生におけるミトコンドリア・ダイナミクス

  山岡尚平; 中島将貴; 藤本優; LEAVER Christopher J; 堤伸浩

  生化学, 2011

  
• MIRO1は花粉管伸長と胚発生におけるミトコンドリアの形態と分配の制御に関わる

  山岡尚平; 中島将貴; 藤本優; LEAVER Christopher J; 堤伸浩

  育種学研究, 24 Sep. 2010

  
• シロイヌナズナのMiro GTPaseであるMIRO1は胚発生におけるミトコンドリアの形態と分配の制御に必要である

  山岡尚平; 中島将貴; 藤本優; 堤伸浩

  日本植物生理学会年会要旨集, 12 Mar. 2010

  
• ゼニゴケを用いた有用物質生産システムの開発(2)

  金本浩介; 山岡尚平; 竹村美保; 大山莞爾

  日本農芸化学会大会講演要旨集, 2009

  
• ゼニゴケを用いた有用物質生産システムの開発(3)

  八反順一郎; 吉田雅昭; 山岡尚平; 竹村美保; 大山莞爾

  日本農芸化学会大会講演要旨集, 2009

  
• ゼニゴケを用いた有用物質生産システムの開発(1)

  小日向務; 山岡尚平; 吉田雅昭; 竹村美保; 大山莞爾

  日本農芸化学会大会講演要旨集, 2009

  
• シロイヌナズナの胚発生と花粉管伸長におけるミトコンドリア局在型GTPase AtMIRO1の寄与

  山岡尚平; LEAVER Christopher J

  日本植物生理学会年会要旨集, 15 Mar. 2008

  
• 血球系細胞におけるスフィンゴミエリン生合成の主要酵素はSMS1である

  山岡尚平; 田口佳光; 岡崎俊朗

  脂質生化学研究, 2005

  
• 生殖器官を恒常的に形成するゼニゴケ変異体の単離と解析

  山岡尚平; 竹中瑞樹; 葉名尻勤; 清水(上田)木綿; 西田浩之; 大和勝幸; 福沢秀哉; 大山莞爾

  日本植物生理学会年会要旨集, 2004

  
• スフィンゴミエリン合成活性欠損細胞を用いたスフィンゴミエリン合成酵素遺伝子の発現クローニング

  山岡尚平; 宮地理彦; 北野俊行; 梅原久範; 岡崎俊朗

  脂質生化学研究, 2004

  
• ゼニゴケY染色体の構造解析 Y特異的反復配列の存在

  藤沢雅樹; 岡田祥子; 曽根岳史; 西山りえ; 中川菜子; 竹中瑞樹; 山岡尚平; 河野薫; 大山莞爾

  日本植物生理学会年会要旨集, 1999

  
• パーティクルガンを用いたゼニゴケ葉状体の形質転換系の確立

  竹中瑞樹; 山岡尚平; 葉名尻勤; 清水木綿; 大和勝幸; 福沢秀哉; 大山莞爾

  日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集, 1999

  

Books and Other Publications

• Hartl, Daniel L.著・中村千春・岡田清孝編訳「エッセンシャル遺伝学・ゲノム科学（原著第７版）」11章 発生の遺伝的制御

  大澤志津江; 山岡尚平, Joint translation

  化学同人, Jan. 2021

  Find Kyoto University's collection of books :

  
• SEIKAGAKU 91(6) "KOTOBA"

  Shohei Yamaoka, Single work

  The Japanese Biochemical Society, 2019, Not refereed

  
• 京都大学大学院生命科学研究科・編 「京大発！フロンティア生命科学」 13章 体を守るしくみ 動物と植物の生体防御機構 13.2節 植物の病害抵抗性の分子機構

  山岡 尚平, Joint work

  講談社サイエンティフィク, Mar. 2018, Not refereed

  
• 京都大学大学院生命科学研究科・編 「京大発！フロンティア生命科学」 12章 形づくりの不思議 動物・植物の発生 12.2節 植物の発生

  山岡 尚平, Joint work

  講談社サイエンティフィク, Mar. 2018, Not refereed

  
• 鈴木昭憲・荒井綜一編著 「農芸化学の辞典」 5.1.4 植物の形態形成の分子制御

  山岡 尚平; 大山莞爾, Joint work

  朝倉書店, Sep. 2003, Not refereed

  

External funds: Kakenhi

• Remodeling Pollen Gametogenesis System based on the Study of Model Bryophyte

  Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (B)

  Transformative Research Areas, Section (III)

  Kyoto University

  山岡 尚平

  From 02 Oct. 2020, To 31 Mar. 2023, Granted

  生殖細胞分化;配偶子形成;転写因子;花粉;ゼニゴケ

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PLANNED-20H05780/
• Remodeling plant reproduction system by cell fate manipulations.

  Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (B)

  Transformative Research Areas, Section (III)

  Yokohama City University

  Daisuke Maruyama

  From 02 Oct. 2020, To 31 Mar. 2023, Project Closed

  配偶体;重複受精;精細胞;卵細胞;中央細胞;シロイヌナズナ;ベンサミアナタバコ;ゼニゴケ;植物;細胞運命;被子植物;花粉;胚のう;受精;植物生殖;体細胞;配偶子

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-ORGANIZER-20H05778/
• 陸上植物の雌雄生殖細胞分化を担う鍵メカニズムの解析

  Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

  Biological Sciences

  Kyoto University

  山岡 尚平

  From 01 Apr. 2019, To 31 Mar. 2021, Discontinued

  生殖細胞;配偶子形成;転写因子;陸上植物;ゼニゴケ;生殖細胞分化

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-19H04860/
• Transcriptional and post-translational regulation of germ cell differentiation in land plants

  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

  Basic Section 44030:Plant molecular biology and physiology-related

  Kyoto University

  Shohei Yamaoka

  From 01 Apr. 2018, To 31 Mar. 2021, Project Closed

  生殖細胞分化;配偶子形成;転写因子;環境応答;陸上植物;ゼニゴケ;花粉;生殖細胞;発生・分化

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18K06285/
• Sex differentiation in land plant: mechanism of genetic robustness and plasticity

  Grant-in-Aid for Scientific Research (S)

  Kyoto University

  Takayuki Kohchi

  From 30 Oct. 2017, To 31 Mar. 2022, Project Closed

  有性生殖;性決定;性染色体;性分化;陸上植物進化;環境応答;半数体;性決定遺伝子;植物発生生物学;配偶子形成;配偶体世代;長鎖非翻訳RNA;Marchantia polymorpha;植物;発生;生殖細胞系列;配偶子分化;基部陸上植物;分化

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17H07424/
• 陸上植物における生殖細胞分化の鍵メカニズムの解明

  Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

  Biological Sciences

  Kyoto University

  山岡 尚平

  From 01 Apr. 2017, To 31 Mar. 2019, Project Closed

  生殖細胞;配偶子形成;転写因子;陸上植物;ゼニゴケ;bHLH;生殖器官;発生・分化;生殖系列

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-17H05841/
• Identification and analysis of a novel master transcription factor for sexual organ development in lant plants

  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

  Kyoto University

  Shohei Yamaoka

  From 01 Apr. 2015, To 31 Mar. 2018, Project Closed

  生殖細胞;発生・分化;転写因子;陸上植物;ゼニゴケ;花粉;造卵器;造精器;有性生殖;器官形成;環境応答;信号伝達

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15K07104/
• Genomic studies of transcription factors and experimental analysis of their functions by genome editing in Marchantia polymorpha

  Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

  Kyoto University

  Takayuki Kohchi

  From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2016, Project Closed

  植物発生学;植物環境応答;ゼニゴケ;ゲノム編集;ゲノミクス;CRISPR/Cas;植物分子遺伝学;転写制御;植物発生制御;転写因子;苔類ゼニゴケ

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26650095/
• Light-dependent reproductive induction in land plants

  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

  Kyoto University

  Takayuki KOHCHI

  From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2017, Project Closed

  植物発生学;ゼニゴケ;生殖成長;フィトクロム;成長相転換;有性生殖;植物;分子遺伝学;環境応答;植物分子遺伝学;陸上植物進化;植物発生;苔類ゼニゴケ;植物環境応答

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26291059/
• Identification of a novel regulatory mechanism of mitochondrial morphology in plants

  Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

  Kyoto University

  Shohei YAMAOKA

  From 01 Apr. 2013, To 31 Mar. 2015, Project Closed

  ミトコンドリア;ライブイメージング;Miro;シロイヌナズナ;オルガネラ;イメージング;GTPase;ライブ・イメージング

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25840108/
• 植物細胞の環境応答におけるミトコンドリアの動態と生理機能のイメージング解析

  Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

  Biological Sciences

  Kyoto University

  山岡 尚平

  From 01 Apr. 2013, To 31 Mar. 2015, Project Closed

  ミトコンドリア;オルガネラ;イメージング;シロイヌナズナ;ライブ・イメージング;amiRNA

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-25120715/
• Evolutionary and molecuar genetic studies to logics in plant development

  Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

  Biological Sciences

  Kyoto University

  Takayuki Kohchi

  From 28 Jun. 2013, To 31 Mar. 2018, Project Closed

  基部陸上植物;モデル生物;有性生殖;環境応答;ゼニゴケ;オーキシン;陸上植物進化;植物;発生分化;分子遺伝学;光受容体;発生制御;発生・分化;進化;植物発生生物学;苔類ゼニゴケ;植物発生;植物環境応答;植物発生制御;光形態形成;背腹性

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PLANNED-25113009/
• The role of mitochondrial dynamics in the interactions between organelles in plants

  Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

  Kyoto University

  Shohei YAMAOKA

  From 01 Apr. 2011, To 31 Mar. 2013, Project Closed

  ミトコンドリア;オルガネラ;ビオチン;ペルオキシソーム;オルガネラ間相互作用;Miro;ライブ･イメージング

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23770043/
• In planta screening of chamicals targeting the protein-protein interactions for plant reproduction

  Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

  Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields

  Kyoto University

  山岡 尚平

  From 30 Jun. 2023, To 31 Mar. 2026, Granted

  タンパク質間相互作用;化合物スクリーニング;植物;有性生殖

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23K17992/

Education

Teaching subject(s)

• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Global Frontier in Life Science B

  1033, Fall, Graduate School of Biostudies, 1
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Advanced Course in Plant Biology

  1028, Fall, Graduate School of Biostudies, 1
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Advanced Experiments in Integrated Life Sciences

  5012, Spring, Graduate School of Biostudies, 4
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Advanced Experiments in Integrated Life Sciences

  5012, Fall, Graduate School of Biostudies, 4
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Experimental Course and Seminar A

  2006, Fall, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Experimental Course and Seminar B

  2007, Spring, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Experimental Course and Seminar B

  2007, Fall, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Experimental Course and Seminar A

  2006, Spring, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Experimental Course and Seminar C

  2008, Fall, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Experimental Course and Seminar D

  2009, Spring, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Experimental Course and Seminar D

  2009, Fall, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Experimental Course and Seminar C

  2008, Spring, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Advanced Molecular and Cell Biology II

  1017, Fall, Graduate School of Biostudies, 2
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Seminar in Plant Resource Science

  5303, Year-long, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Plant Physiology II

  5137, Spring, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Plant Physiology I

  5128, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Introduction to Biology and Life Science

  N484, Spring, Institute for Liberal Arts and Sciences, 2
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Global Frontier in Life Science B

  1033, Fall, Graduate School of Biostudies, 1
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Advanced Course in Plant Biology

  1028, Spring, Graduate School of Biostudies, 1
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Experimental Course and Seminar A

  2006, Spring, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Experimental Course and Seminar A

  2006, Fall, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Experimental Course and Seminar C

  2008, Fall, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Experimental Course and Seminar B

  2007, Spring, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Experimental Course and Seminar B

  2007, Fall, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Experimental Course and Seminar C

  2008, Spring, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Experimental Course and Seminar D

  2009, Spring, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Experimental Course and Seminar D

  2009, Fall, Graduate School of Biostudies, 5
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Advanced Experiments in Integrated Life Sciences

  5012, Spring, Graduate School of Biostudies, 4
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Advanced Experiments in Integrated Life Sciences

  5012, Fall, Graduate School of Biostudies, 4
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Seminar in Plant Resource Science

  5303, Year-long, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Plant Physiology II

  5137, Spring, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Plant Physiology I

  5128, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Advanced Molecular and Cell Biology II

  1017, Fall, Graduate School of Biostudies, 2
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Advanced Moleculer and Cell Biology II

  1017, Fall, Graduate School of Biostudies, 2
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Seminar in Plant Resource Science

  5303, Year-long, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Introduction to Foreign Literature in Bioresource Science II

  5189, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Advanced Course in Plant Biology

  1028, Spring, Graduate School of Biostudies, 1
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Global Frontier in Life Science B

  1033, Fall, Graduate School of Biostudies, 1
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Plant Physiology II

  5137, Spring, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Plant Physiology I

  5128, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From Apr. 2014, To Mar. 2015

  Laboratory Course in Molecular Biology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2015, To Mar. 2016

  Laboratory Course in Molecular Biology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2016, To Mar. 2017

  Laboratory Course in Molecular Biology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2017, To Mar. 2018

  Laboratory Course in Molecular Biology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2018, To Mar. 2019

  ILAS Seminar

  Spring, 全学共通科目
• From Apr. 2018, To Mar. 2019

  Laboratory Course in Molecular Biology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Advanced Moleculer and Cell Biology II

  Fall, 生命科学研究科
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Global Frontier in Life Science B

  Fall, 生命科学研究科
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Plant Physiology II

  Spring, 農学部
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Plant Physiology I

  Fall, 農学部
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Introduction to Biology and Life Science

  Spring, 全学共通科目
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Advanced Moleculer and Cell Biology II

  Fall, 生命科学研究科
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Global Frontier in Life Science B

  Fall, 生命科学研究科
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Advanced Course in Plant Biology

  Fall, 生命科学研究科
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Plant Physiology II

  Spring, 農学部
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Plant Physiology I

  Fall, 農学部
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Seminar in Plant Resource Science

  Year-long, 農学部
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Introduction to Foreign Literature in Bioresource Science I

  Spring, 農学部
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Advanced Molecular and Cell Biology II

  Fall, 生命科学研究科
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Global Frontier in Life Science B

  Fall, 生命科学研究科
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Advanced Course in Plant Biology

  Fall, 生命科学研究科
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Plant Physiology II

  Spring, 農学部
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Plant Physiology I

  Fall, 農学部
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Introduction to Biology and Life Science

  Spring, 全学共通科目
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Seminar in Plant Resource Science

  Year-long, 農学部

Administration

School management (title, position)

• From 01 May 2014

  国際交流会館（修学院本館）主事
• From 01 Oct. 2018, To 30 Sep. 2020

  国際戦略本部運営協議会　国際環境整備専門部会 部会員

Faculty management (title, position)

• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2025

  北部構内実験排水系管理委員会　委員
• From 01 Apr. 2022

  情報セキュリティ委員会
• From 01 Apr. 2022

  教務委員会
• From 01 Apr. 2021

  農学研究科図書委員会　オブザーバー
• From 01 Apr. 2021

  安全・環境保全委員会
• From 01 Apr. 2020, To 31 Mar. 2022

  北部構内実験排水系管理委員会　委員