Basic Information

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  hirano.rika.5wkyoto-u.ac.jp

Academic Degree

• 21 Mar. 2022

  石川県立大学博士（生物資源環境学）
• 21 Mar. 2019

  石川県立大学修士（生物資源環境学）

Academic Resume (Undergraduate School/Majors)

• 石川県立大学, 生物資源環境学部食品科学科, 卒業

Research History

• From Apr. 2026, To Present

  Kyoto University, Graduate School of Medicine Institute of Laboratory Animals, 特定助教
• From Apr. 2023, To Mar. 2026

  Japan Society for the Promotion of Science, 日本学術振興会特別研究員（PD）
• From Apr. 2022, To Mar. 2023

  Japan Society for the Promotion of Science, 日本学術振興会特別研究員（PD（資格変更））
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Japan Society for the Promotion of Science, 日本学術振興会特別研究員 （DC2）

ID,URL

• J-Global ID

  202001020790261264

researchmap URL

• https://researchmap.jp/rkhirano

Research

Research Areas

• Life sciences, Laboratory animal science
• Life sciences, Applied microbiology

Papers

• 培養温度がヒト腸内常在菌叢最優勢種と腸内病原性細菌の増殖に与える影響

  網 優太; 下川 ひろみ; 榊原 輝; 平野 里佳; 栗原 新

  日本乳酸菌学会誌, Oct. 2025

  
• PstSCAB and SapBCDF are putrescine exporters in Proteus mirabilis

  Yuta Sugiyama; Atsuo Nakamura; Hirokazu Ohta; Tsuyoshi Fujita; Yuki Kontani; Hiromi Shimokawa; Rika Hirano; Yuta Ami; Mikiyasu Sakanaka; Mitsuharu Matsumoto; Shin Kurihara

  Microbiology Spectrum, 06 Jan. 2026, Peer-reviewed

  
• Sustainable and portable CRISPR-based diagnostics for high-sensitivity Mpox detection

  Rika Hirano; Kazuto Yoshimi; Koji Asano; Kohei Takeshita; Ken J. Ishii; Kei Sato; Tomoji Mashimo

  npj Biosensing, 01 Dec. 2025, Peer-reviewed, Lead author

  
• The effect of culturing temperature on the growth of the most dominant bacterial species of human gut microbiota and harmful bacterial species.

  Hiromi Shimokawa; Hikaru Sakakibara; Yuta Ami; Rika Hirano; Shin Kurihara

  Bioscience of microbiota, food and health, Feb. 2025

  
• Sustainable and portable CRISPR-based diagnostics for high-sensitivity Mpox detection

  Rika Hirano; Kazuto Yoshimi; Koji Asano; Kohei Takeshita; Ken J. Ishii; Kei Sato; Tomoji Mashimo

  23 Nov. 2024

  
• CRISPR Diagnostics for Quantification and Rapid Diagnosis of Myotonic Dystrophy Type 1 Repeat Expansion Disorders.

  Koji Asano; Kazuto Yoshimi; Kohei Takeshita; Satomi Mitsuhashi; Yuta Kochi; Rika Hirano; Zong Tingyu; Saeko Ishida; Tomoji Mashimo

  ACS synthetic biology, 20 Nov. 2024

  
• Development of culture methods capable of culturing a wide range of predominant species of intestinal bacteria

  Rika Hirano; Izumi Nishita; Riho Nakai; Ayaka Bito; Ryunosuke Sasabe; Shin Kurihara

  Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 13 Jul. 2023, Peer-reviewed, Lead author

  
• Gut bacterial aromatic amine production: aromatic amino acid decarboxylase and its effects on peripheral serotonin production

  Yuta Sugiyama; Yumiko Mori; Misaki Nara; Yusuke Kotani; Emiko Nagai; Hiroki Kawada; Mayu Kitamura; Rika Hirano; Hiromi Shimokawa; Akira Nakagawa; Hiromichi Minami; Aina Gotoh; Mikiyasu Sakanaka; Noriho Iida; Takashi Koyanagi; Takane Katayama; Shigefumi Okamoto; Shin Kurihara

  Gut Microbes, 31 Dec. 2022, Peer-reviewed

  
• Putrescine Production by Latilactobacillus curvatus KP 3-4 Isolated from Fermented Foods

  Rika Hirano; Aiko Kume; Chisato Nishiyama; Ryosuke Honda; Hideto Shirasawa; Yiwei Ling; Yuta Sugiyama; Misaki Nara; Hiromi Shimokawa; Hiroki Kawada; Takashi Koyanagi; Hisashi Ashida; Shujiro Okuda; Mitsuharu Matsumoto; Hiroki Takagi; Shin Kurihara

  Microorganisms, 24 Mar. 2022, Peer-reviewed, Lead author

  
• Isolation of the high polyamine-producing bacterium <i>Staphylococcus epidermidis</i> FB146 from fermented foods and identification of polyamine-related genes

  Hideto SHIRASAWA; Chisato NISHIYAMA; Rika HIRANO; Takashi KOYANAGI; Shujiro OKUDA; Hiroki TAKAGI; Shin KURIHARA

  Bioscience of Microbiota, Food and Health, 2022, Peer-reviewed

  
• Intestinal immunomodulatory activity of indigestible glucan in mice and its utilization by intestinal bacteria in vitro

  Ayumu Horinouchi; Hirokazu Hirai; Rika Hirano; Shin Kurihara; Hiroki Takagi; Kenji Matsumoto

  Journal of Functional Foods, Dec. 2021, Peer-reviewed

  
• Next-generation prebiotic promotes selective growth of bifidobacteria, suppressing Clostridioides difficile

  Rika Hirano; Mikiyasu Sakanaka; Kazuto Yoshimi; Naohisa Sugimoto; Syogo Eguchi; Yuko Yamauchi; Misaki Nara; Shingo Maeda; Yuta Ami; Aina Gotoh; Takane Katayama; Noriho Iida; Tamotsu Kato; Hiroshi Ohno; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Mamoru Nishimoto; Motomitsu Kitaoka; Hiroyuki Nakai; Shin Kurihara

  Gut Microbes, 23 Sep. 2021, Peer-reviewed, Lead author

  
• Bifidobacterium response to lactulose ingestion in the gut relies on a solute-binding protein-dependent ABC transporter

  Keisuke Yoshida; Rika Hirano; Yohei Sakai; Moonhak Choi; Mikiyasu Sakanaka; Shin Kurihara; Hisakazu Iino; Jin-zhong Xiao; Takane Katayama; Toshitaka Odamaki

  Communications Biology, May 2021, Peer-reviewed

  Access this paper :

  
• Health-Promoting Effects of Dietary Polyamines

  Rika Hirano; Hideto Shirasawa; Shin Kurihara

  Medical Sciences, 05 Feb. 2021, Peer-reviewed, Lead author

  
• Improved physicochemical and functional properties of okara, a soybean residue, by nanocellulose technologies for food development – A review

  Takao Nagano; Yuya Arai; Hiromi Yano; Takafumi Aoki; Shin Kurihara; Rika Hirano; Katsuyoshi Nishinari

  Food Hydrocolloids, Dec. 2020, Peer-reviewed

  
• Improved effects of okara atomized by a water jet system on α-amylase inhibition and butyrate production by Roseburia intestinalis

  Takao Nagano; Rika Hirano; Shin Kurihara; Katsuyoshi Nishinari

  Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 02 Jul. 2020, Peer-reviewed

  
• Development of a new chromogenic method for putrescine quantification using coupling reactions involving putrescine oxidase

  Yuta Sugiyama; Hirokazu Ohta; Rika Hirano; Hiromi Shimokawa; Mikiyasu Sakanaka; Takashi Koyanagi; Shin Kurihara

  Analytical Biochemistry, Mar. 2020, Peer-reviewed

  
• Measuring the Antimicrobial Activity of Lauric Acid against Various Bacteria in Human Gut Microbiota Using a New Method.

  Miki Matsue; Yumiko Mori; Satoshi Nagase; Yuta Sugiyama; Rika Hirano; Kazuhiro Ogai; Kohei Ogura; Shin Kurihara; Shigefumi Okamoto

  Cell transplantation, Dec. 2019, Peer-reviewed

  

Misc.

• Effect of existing prebiotics on the growth of the most dominant species of human intestinal commensal flora

  先山奏花; 加藤智也; 平野里佳; 網優太; 白澤秀斗; 栗原新

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2025

  
• Isolation and analysis of polyamine-producing bacteria for utilization as novel probiotics

  平野里佳; 網優太; 白澤秀斗; 小柳喬; 栗原新

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2025

  
• ビフィズス菌を選択的に増殖させるガラクトシル-β-1,4-ラムノースを用いた偽膜性腸炎原因菌の生育抑制効果

  平野里佳; 平野里佳; 阪中幹祥; 吉見一人; 吉見一人; 山内祐子; 山内祐子; 後藤愛那; 片山高嶺; 片山高嶺; 飯田宗穂; 加藤完; 大野博司; 吹谷智; 横田篤; 西本完; 北岡本光; 北岡本光; 中井博之; 栗原新; 栗原新

  日本実験動物学会総会講演要旨集(Web), 2023

  
• Development of a new culture medium capable of culturing a wide range of intestinal bacteria

  平野里佳; 平野里佳; 西田和; 中井梨歩; 加藤智也; 尾藤あやか; 雀部龍之介; 白澤秀斗; 栗原新; 栗原新

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2023

  
• Tamarind seed gum enzyme degradation products selectively promote the growth of Roseburia intestinalis and contributes to the increase of butyrate in the intestine

  尾藤あやか; 網優太; 山西健太; 山野上実希; 中谷操希; 中井梨歩; 平野里佳; 平野里佳; 栗原新

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2023

  
• 大豆由来難消化性ペプチドによるヒト腸内細菌叢の改善効果

  網優太; 平野里佳; 金倫基; 栗原新

  日本生化学会大会(Web), 2022

  
• ヒト腸内常在酪酸産生菌Roseburia intestinalisはタマリンドシードガム酵素分解物により特異的に増殖促進される

  尾藤あやか; 網優太; 山西健太; 山野上実希; 中谷操希; 中井梨歩; 平野里佳; 平野里佳; 栗原新

  日本生化学会大会(Web), 2022

  
• Identification of polyamine-related genes in the high polyamine-producing bacterium Staphylococcus epidermidis FB146 from fermented foods

  白澤秀斗; 西山知里; 平野里佳; 平野里佳; 小柳喬; 奥田修二郎; 高木宏樹; 栗原新

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2022

  
• Growth of human intestinal indigenous butyrate-producing Roseburia intestinalis is selectively promoted by enzymatic degradation product of tamarind seed gum

  尾藤あやか; 網優太; 山西健太; 中井梨歩; 平野里佳; 平野里佳; 宇野陽一郎; 栗原新

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2022

  
• Analysis of Improvement of Intestinal Microbiota by Soybean-derived Non-digestible Peptide

  網優太; 平野里佳; 平野里佳; KIM Yun-Gi; 栗原新

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2022

  
• Latilactobacillus curvatus KP 3-4, a lactic acid bacterium derived from a fermented food, synthesizes putrescine via ornithine decarboxylase

  平野里佳; 平野里佳; 久米愛子; 西山知里; 本田涼将; 白澤秀斗; 凌一葦; 杉山友太; 奈良未沙希; 下川ひろみ; 河田明輝; 小柳喬; 芦田久; 奥田修二郎; 松本光晴; 高木宏樹; 栗原新

  日本ポリアミン学会年会プログラム及び抄録集, 2021

  
• Whole-genome analysis to elucidate the mechanism of putrescine production in Staphylococcus epidermidis FB146, a high polyamine producer from fermented foods

  白澤秀斗; 西山知里; 平野里佳; 平野里佳; 小柳喬; 奥田修二郎; 高木宏樹; 栗原新

  日本ポリアミン学会年会プログラム及び抄録集, 2021

  
• Isolation of high-polyamine-producing bacteria derived from fermented foods

  白澤秀斗; 平野里佳; 平野里佳; 栗原新

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2021

  
• Isolation and whole genome analysis of Staphylococcus epidermidis, a polyamine-high-producing bacterium from fermented foods

  白澤秀斗; 西山知里; 平野里佳; 平野里佳; 小柳喬; 高木宏樹; 栗原新

  日本乳酸菌学会誌, 2021

  
• Bifidobacterium response to lactulose ingestion in the gut relies on a solute-binding protein

  吉田圭佑; 平野里佳; 平野里佳; 境洋平; 崔文鶴; 阪中幹祥; 阪中幹祥; 栗原新; 栗原新; 飯野久和; 清水(肖)金忠; 片山高嶺; 片山高嶺; 小田巻俊孝

  日本乳酸菌学会誌, 2021

  
• Selective growth promotion of butyrate-producing bacteria Roseburia intestinalis by tamarind seed gum

  網優太; 山西健太; 中井梨歩; 平野里佳; 平野里佳; 宇野陽一郎; 栗原新

  日本乳酸菌学会誌, 2021

  
• Isolation of putrescine-producing lactic acid bacteria Lactobacillus curvatus KP3-4 from Kabura sushi.

  本田涼将; 白澤秀斗; 河田明輝; 平野里佳; 平野里佳; 小柳喬; 芦田久; 栗原新

  日本乳酸菌学会誌, 2020

  

Presentations

• 腸管抗菌ペプチドREG3Gヒト化ラットの作製

  平野里佳; 瀧原速仁; 奥田修二郎; 真下知士; 吉見一人

  2025年度 先端モデル動物支援プラットフォーム（AdAMS）成果報告会, 20 Feb. 2026

  
• 使い捨てカイロとCRISPR-Cas3を用いたデバイスフリーなウイルス核酸検出法の構築

  平野 里佳

  2025 CRISPR-Dx研究会, 12 Sep. 2025

  
• Enhanced nucleic acid detection using CRISPR-Cas3 for widespread on-site testing during pandemics

  平野 里佳; 吉見 一人; 浅野 宏治; 竹下 浩平; 石井 健; 佐藤 佳; 真下 知士

  日本ゲノム編集学会第10回大会, 18 Jun. 2025

  
• Development of a device-free CRISPR diagnostic platform for emerging pandemics

  Rika Hirano; Kazuto Yoshimi; Koji Asano; Kohei Takeshita; Ken J. Ishii; Kei Sato; Tomoji Mashimo

  第2回 AMED SCARDA「ワクチン開発のための世界トップレベル研究開発拠点の形成事業」合同シンポジウム, 17 Mar. 2025

  
• Isolation and analysis of polyamine-producing bacteria for utilization as novel probiotics

  平野 里佳; 網 優太; 白澤 秀斗; 小栁 喬; 栗原 新

  日本農芸化学会 2025札幌大会 シンポジウム「社会実装に近づくポリアミン研究」, 06 Mar. 2025

  
• Development of a portable, device-free CRISPR diagnostic with Cas3 for Mpox

  Rika Hirano; Kazuto Yoshimi; Koji Asano; Kohei Takeshita; Ken J. Ishii; Kei Sato; Tomoji Mashimo

  CRISPR2025, 18 Feb. 2025

  
• CRISPR-Cas3を用いた高感度ウイルス核酸検出技術の開発

  平野里佳; 浅野宏治; 皆川慶嘉; 野地博行; 吉見一人; 真下知士

  奄美医科学研究シンポジウム, 03 Oct. 2024

  
• Improvement of CRISPR-Cas3-operated nucleic acid detection performance with digital bioassays

  平野里佳; 浅野宏治; 皆川慶嘉; 野地博行; 吉見一人; 真下知士

  ゲノム編集学会第9回大会, 19 Jun. 2024

  
• CRISPR-Cas3を用いたPCRフリー核酸検出法の開発

  平野里佳; 浅野宏治; 皆川慶嘉; 野地博行; 吉見一人; 真下知士

  2023年度先端モデル動物支援プラットフォーム AdAMS成果発表会, 09 Feb. 2024

  
• CRISPR-Cas3を用いたPCR増幅を必要としないウイルス核酸検出法の開発

  平野里佳; 浅野宏治; 皆川慶嘉; 野地博行; 吉見一人; 真下知士

  第1回AMED-SCARDA「ワクチン開発のための世界トップレベル研究開発拠点の形成事業」合同シンポジウム, 01 Feb. 2024

  
• Development of galactosyl-β-1,4-rhamnose, which is selectively utilized by bifidobacteria

  平野里佳; 阪中幹祥; 吉見一人; 杉本直久; 江口省吾; 山内祐子; 奈良未沙希; 前田信悟; 網優太; 後藤愛那; 片山高嶺; 飯田宗穂; 加藤完; 大野博司; 吹谷智; 横田篤; 西本完; 北岡本光; 中井博之; 栗原新

  東京大学医科学研究所 奄美病害動物研究施設 第3 棟改築記念シンポジウム, 06 Oct. 2023

  
• ビフィズス菌を選択的に増殖させるガラクトシル-β-1,4-ラムノースを用いた偽膜性腸炎原因菌の生育抑制効果

  平野里佳; 阪中幹祥; 吉見一人; 山内祐子; 後藤愛那; 片山高嶺; 飯田宗穂; 加藤完; 大野博司; 吹谷智; 横田篤; 西本完; 北岡本光; 中井博之; 栗原新

  第70回日本実験動物学会総会, 24 May 2023

  
• Development of a new culture medium capable of culturing a wide range of intestinal bacteria

  Rika HIRANO; Izumi NISHITA; Riho NAKAI; Tomoya KATO; Ayaka BITO; Ryunosuke SASABE; Hideto SHIRASAWA; Shin KURIHARA

  the 2023 Annual Meeting of the Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry, 14 Mar. 2023

  
• 単一の培地を用いた腸内細菌の糖質資化能の評価系の開発

  平野 里佳; 西田 和; 中井 梨歩; 加藤 智也; 尾藤 あやか; 雀部 龍之介; 栗原 新

  日本応用糖質科学会 第48回近畿支部会, 02 Dec. 2022

  
• Isolation and characterization of a new probiotic candidate lactic acid bacteria Latilactobacillus curvatus KP 3-4 that produces putrescine

  平野 里佳; 久米 愛子; 西山 知里; 本田 涼将; 白澤 秀斗; 凌 一葦; 杉山 友太; 奈良 未沙希; 下川 ひろみ; 河田 明輝; 小栁 喬; 芦田 久; 奥田 修二郎; 松本 光晴; 高木 宏樹; 栗原 新

  日本農芸化学会2022年度大会, 18 Mar. 2022

  
• Latilactobacillus curvatus KP 3-4, a lactic acid bacterium derived from a fermented food, synthesizes putrescine via ornithine decarboxylase

  平野里佳; 久米愛子; 西山知里; 本田涼将; 白澤秀斗; 凌一葦; 杉山友太; 奈良未沙希; 下川ひろみ; 河田明輝; 小栁喬; 芦田久; 奥田修二郎; 松本光晴; 高木宏樹; 栗原新

  日本ポリアミン学会 第12回年会, 08 Dec. 2021

  
• 次世代型プレバイオティクスによるビフィズス菌特異的な増殖促進とその応用

  平野里佳; 阪中幹祥; 吉見一人; 杉本直久; 江口省吾; 山内祐子; 奈良未沙希; 前田信悟; 網優太; 後藤愛那; 片山高嶺; 飯田宗穂; 加藤完; 大野博司; 吹谷智; 横田篤; 西本完; 北岡本光; 中井博之; 栗原新

  日本応用糖質科学会第47回近畿支部会, 26 Nov. 2021

  
• かぶらずし由来Latilactobacillus curvatus KP 3-4 のプトレッシン産生機構の解明を目的 とした全ゲノム解析

  平野 里佳; 本田 涼将; 西山 知里; 白澤 秀斗; 下川 ひろみ; 河田 明輝; 凌 一葦; 小栁 喬; 芦田 久; 奥田 修二郎; 高木 宏樹; 栗原 新

  日本乳酸菌学会 2021年度大会, 09 Jul. 2021

  
• Identification of the putrescine exporter PstSCAB of Proteus mirabilis

  平野 里佳; 太田 宏一; 杉山 友太; 紺谷 優季; 阪中 幹祥; 栗原 新

  日本農芸化学会2021年度大会, 19 Mar. 2021

  
• 次世代型プレバイオティクス・ガラクトシル-β-1,4-ラムノースのビフィズス菌特異的な増殖促進機構の解析

  平野里佳; 阪中幹祥; 杉本直久; 江口省吾; 奈良未沙希; 片山高嶺; 北岡本光; 中井博之; 栗原新

  日本農芸化学会2020年度大会, Mar. 2020

  
• ビフィズス菌を選択的に増殖させる次世代型プレバイオティクスを用いた偽膜性腸炎原因菌の生育抑制

  平野里佳, 阪中幹祥, 杉本直久, 江口省吾, 奈良未沙希, 片山高嶺, 北岡本光, 中井博之, 栗原新

  第12回北陸合同バイオシンポジウム2019, 25 Oct. 2019

  
• ビフィズス菌を特異的に増殖させる次世代型プレバイオティクスの開発と応用

  平野里佳; 阪中幹祥; 杉本直久; 江口省吾; 奈良未沙希; 片山高嶺; 北岡本光; 中井博之; 栗原新

  日本乳酸菌学会2019 年度大会, Jul. 2019

  
• 次世代型プレバイオティクス・ガラクトシル-β-1,4-ラムノースとビフィズス菌を用いたClostridium difficileの抑制

  平野里佳; 阪中幹祥; 杉本直久; 江口省吾; 奈良未沙希; 片山高嶺; 片山高嶺; 北岡本光; 中井博之; 栗原新

  第55回 日本細菌学会中部支部総会, 12 Oct. 2018

  
• 次世代型プレバイオティクスによるプロバイオティクス細菌特異的な増殖促進を用いた偽膜性腸炎原因菌の生育抑制効果

  平野里佳, 阪中幹祥, 杉本直久, 江口省吾, 奈良未沙希, 片山高嶺, 片山高嶺, 北岡本光, 中井博之, 栗原新

  第10回北陸合同バイオシンポジウム 2017年11月10日・11日 at 富県大 & in 婦負(ねい), 10 Nov. 2017

  
• 次世代型プレバイオティクスによるプロバイオティクス細菌特異的な増殖促進と偽膜性腸炎原因菌Clostridium difficileの生育に与える影響

  平野里佳; 阪中幹祥; 杉本直久; 江口省吾; 奈良未沙希; 片山高嶺; 片山高嶺; 北岡本光; 中井博之; 栗原新

  石川県立大学 腸内細菌共生機構学講座（IFO）シンポジウム「北陸の微生物研究」, 31 Aug. 2017

  
• 平野里佳, 阪中幹祥, 杉本直久, 江口省吾, 奈良未沙希, 片山高嶺, 片山高嶺, 北岡本光, 中井博之, 栗原新

  日本農芸化学会2017年度大会, Mar. 2017

  

External funds: Kakenhi

• 腸内細菌の生体内機能解明に寄与する腸管免疫ヒト化ラットの開発

  Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

  0601:Agricultural chemistry and related fields

  Kyoto University

  平野 里佳

  From 31 Jul. 2026, To 31 Mar. 2028, Adopted

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26K24810/