Basic Information

Faculty

• 農学部

Professional Memberships

• 日本細菌学会
• 日本ビタミン学会
• 日本応用糖質科学会
• アメリカ微生物学会(American society for microbiology)
• 日本生物工学会
• 日本農芸化学会

Academic Degree

• 修士（農学）(京都大学)
• 博士（農学）(京都大学)

Academic Resume (Graduate Schools)

• 京都大学, 大学院農学研究科修士課程食品工学専攻, 修了
• 京都大学, 大学院農学研究科博士後期課程食品工学専攻, 修了

Academic Resume (Undergraduate School/Majors)

• 京都大学, 農学部食品工学科, 卒業

Research History

• From 2024, To Present

  Kyoto University, 国際高等教育院生物学教室, 教授
• From 2015, To Present

  Kyoto University, Graduate School of Agriculture, 教授
• From 2007, To 2015

  Kyoto University, Graduate School of Agriculture, 准教授
• From 2001, To 2007

  Kyoto University, Graduate School of Agriculture, 助教授
• From 2000, To 2001

  Kyoto University, 食糧科学研究所, 助教授
• From 1995, To 2000

  Kyoto University, 食糧科学研究所, 助手

Language of Instruction

• Japanese

ID,URL

• J-Global ID

  200901044713228147

• External link

  http://www.molbiotech.kais.kyoto-u.ac.jp/

Research

Research Topics, Overview of the research

• Research Topics

  Studies on microbial mechanisms for interaction with animal, plant or microbe and their application to food/environmental/medical fields

• Overview of the research

  Microbial interactions with host animal, plant, or microbe are focused on. Based on the interaction mode, microbes are classified into three groups such as pathogenic, saprophytic, and symbiotic microbes. The adhesion of microbes to host cells may be a primary mechanism of microbial interactions. Microbial mechanisms of the recognition, degradation, transport, and metabolism of host cell surface components are structurally and functionally analyzed through molecular, structural, and cellular biology. For example, intestinal microbiota targeting host extracellular matrix glycosaminoglycans such as hyaluronan, chondroitin sulfate, and heparin is analyzed and a novel microbial import system (ABC transporter) of glycosaminoglycans is identified in the pathogenic bacterium.

Research Interests

• 腸内細菌叢
• 環境微生物
• X線結晶構造解析
• 輸送体
• 糖質関連酵素
• 植物細胞壁
• 動物細胞外マトリックス
• 膜ダイナミクス
• 生物間相互作用
• 発酵食品

Research Areas

• Life sciences, Applied microbiology
• Life sciences, Applied molecular and cellular biology
• Life sciences, Structural biochemistry
• Life sciences, Food sciences
• Life sciences, Applied biochemistry

Papers

• Molecular identification of hyaluronate lyase, not hyaluronidase, as an intrinsic hyaluronan-degrading enzyme in Clostridium perfringens strain ATCC 13124

  Tomoya Kumon; Sayoko Oiki; Wataru Hashimoto

  Scientific Reports, 22 Oct. 2024, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

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• Potential role of alginate in marine bacteria-yeast interactions

  Shota Nakata; Ryuichi Takase; Shigeyuki Kawai; Kohei Ogura; Wataru Hashimoto

  Applied and Environmental Microbiology, 18 Dec. 2024, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  
• Decomposition of brown algae in the ocean by microbiota: biological insights for recycling blue carbon

  Natsuko Katsuhiro; Kanomi Sato; Ryuichi Takase; Shigeyuki Kawai; Kohei Ogura; Wataru Hashimoto

  Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 05 Sep. 2024, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  
• Expression, purification and preliminary crystallographic analysis of bacterial transmembrane protein EfeU for iron import

  Kenji Okumura; Bunzo Mikami; Sayoko Oiki; Kohei Ogura; Wataru Hashimoto

  Protein Expression and Purification, Jul. 2024, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  
• The True Habitats of Brewing Microorganisms: Based on Wine Yeast Research

  渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本醸造協会誌, Apr. 2024, Peer-reviewed, Invited, Last author

  
• Crystal Structures of <i>Lacticaseibacillus</i> 4-Deoxy-L-<i>threo-</i>5-hexosulose-uronate Ketol-isomerase KduI in Complex with Substrate Analogs

  Hisamu Iwase; Yuta Yamamoto; Akifumi Yamada; Keigo Kawai; Sayoko Oiki; Daisuke Watanabe; Bunzo Mikami; Ryuichi Takase; Wataru Hashimoto

  Journal of Applied Glycoscience, 20 Dec. 2023, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  
• Adaptation of yeast Saccharomyces cerevisiae to grape-skin environment

  Daisuke Watanabe; Wataru Hashimoto

  Scientific Reports, 20 Jun. 2023, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

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• 廃グリセリンからバイオプラスチック素材へ 大気窒素活用型微生物発酵システムの基盤技術の開発

  吉田暢広; 橋本 渉

  クリーンエネルギー, Dec. 2022, Invited, Corresponding author

  
• Bacteria with a mouth: Discovery and new insights into cell surface structure and macromolecule transport

  Kousaku MURATA; Shigeyuki KAWAI; Wataru HASHIMOTO

  Proceedings of the Japan Academy, Series B, 09 Dec. 2022, Peer-reviewed

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• Substrate size-dependent conformational changes of bacterial pectin-binding protein crucial for chemotaxis and assimilation

  Kotaro Anamizu; Ryuichi Takase; Mamoru Hio; Daisuke Watanabe; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto

  Scientific Reports, 25 Jul. 2022, Peer-reviewed, Corresponding author

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• Direct production of polyhydroxybutyrate and alginate from crude glycerol by Azotobacter vinelandii using atmospheric nitrogen

  Nobuhiro Yoshida; Ryuichi Takase; Yoshimi Sugahara; Yuko Nambu; Wataru Hashimoto

  Scientific Reports, 07 Jun. 2022, Peer-reviewed, Corresponding author

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• Crystal structures of EfeB and EfeO in a bacterial siderophore-independent iron transport system.

  Sakiko Nakatsuji; Kenji Okumura; Ryuichi Takase; Daisuke Watanabe; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto

  Biochemical and biophysical research communications, 26 Feb. 2022, Peer-reviewed, Corresponding author

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• Enhanced propagation of Granulicatella adiacens from human oral microbiota by hyaluronan.

  Shun Yabuuchi; Sayoko Oiki; Shuma Minami; Ryuichi Takase; Daisuke Watanabe; Wataru Hashimoto

  Scientific reports, 29 Jun. 2022, Peer-reviewed, Corresponding author

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• 4-Deoxy-l-erythro-5-hexoseulose Uronate (DEH) and DEH Reductase: Key Molecule and Enzyme for the Metabolism and Utilization of Alginate.

  Shigeyuki Kawai; Wataru Hashimoto

  Molecules (Basel, Switzerland), 06 Jan. 2022

  
• 大豆と納豆菌のせめぎ合い−細菌と植物との相互作用の多様性に新たな知見

  橋本 渉

  化学, Jun. 2021, Peer-reviewed, Invited, Lead author, Corresponding author

  
• 細菌が高分子多糖に走化性を示す分子機構

  髙瀬隆一; 村田幸作; 河井重幸; 橋本 渉

  生化学, Apr. 2021, Peer-reviewed, Invited, Last author, Corresponding author

  
• Bacterial inducible expression of plant cell wall-binding protein YesO through conflict between Glycine max and saprophytic Bacillus subtilis

  Haruka Sugiura; Ayumi Nagase; Sayoko Oiki; Bunzo Mikami; Daisuke Watanabe; Wataru Hashimoto

  Scientific Reports, Oct. 2020, Peer-reviewed, Corresponding author

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• Novel Hyaluronate Lyase Involved in Pathogenicity of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis

  Van An Nguyen; Kohei Ogura; Miki Matsue; Norihiko Takemoto; Kanae Mukai; Yukari Nakajima; Thuy Linh Hoang; Yasunori Iwata; Norihiko Sakai; Takashi Wada; Wataru Hashimoto; Shigefumi Okamoto; Hiroshi Ichimura

  Frontiers in Microbiology, 24 Sep. 2020, Peer-reviewed

  
• 褐藻の主要多糖類アルギン酸の分解物が示す特定アミノ基との反応性

  河井重幸; 橋本 渉

  バイオサイエンスとインダストリー, Sep. 2020, Peer-reviewed, Last author

  
• Polyunsaturated fatty acids-enriched lipid from reduced sugar alcohol mannitol by marine yeast Rhodosporidiobolus fluvialis Y2.

  Shota Nakata; Mamoru Hio; Ryuichi Takase; Shigeyuki Kawai; Daisuke Watanabe; Wataru Hashimoto

  Biochemical and biophysical research communications, 11 Jun. 2020, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

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• Bacterial chemotaxis towards polysaccharide pectin by pectin-binding protein

  Hidenori Konishi; Mamoru Hio; Masahiro Kobayashi; Ryuichi Takase; Wataru Hashimoto

  Scientific Reports, Mar. 2020, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

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• Hsp104-dependent ability to assimilate mannitol and sorbitol conferred by a truncated Cyc8 with a C-terminal polyglutamine in Saccharomyces cerevisiae.

  Hideki Tanaka; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto; Shigeyuki Kawai

  PloS one, 2020

  
• Uncovering the reactive nature of 4-deoxy-L-erythro-5-hexoseulose uronate for the utilization of alginate, a promising marine biopolymer.

  Shota Nakata; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto; Shigeyuki Kawai

  Scientific reports, 20 Nov. 2019, Peer-reviewed

  
• Streptococcal phosphotransferase system imports unsaturated hyaluronan disaccharide derived from host extracellular matrices

  Sayoko Oiki; Yusuke Nakamichi; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  PLOS ONE, 07 Nov. 2019, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  
• Substrate recognition by bacterial solute-binding protein is responsible for import of extracellular hyaluronan and chondroitin sulfate from the animal host.

  Sayoko Oiki; Masahiro Sato; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, Oct. 2019, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  
• Structural studies on bacterial system used in the recognition and uptake of the macromolecule alginate

  Yukie Maruyama; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  Bioscience Biotechnology and Biochemistry, May 2019, Peer-reviewed

  
• Creation of haemoglobin A1c direct oxidase from fructosyl peptide oxidase by combined structure-based site specific mutagenesis and random mutagenesis

  Noriyuki Ogawa; Takehide Kimura; Fumi Umehara; Yuki Katayama; Go Nagai; Keiko Suzuki; Kazuo Aisaka; Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata; Michio Ichimura

  Scientific Reports, Jan. 2019, Peer-reviewed

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• Probiotics in human gut microbiota can degrade host glycosaminoglycans

  Keigo Kawai; Reiko Kamochi; Sayoko Oiki; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  Scientific Reports, Jul. 2018, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

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• 多糖リアーゼ

  橋本 渉

  生化学, 2018, Peer-reviewed

  
• 病原細菌による宿主細胞外グリコサミノグリカンの断片化・輸送・分解・代謝に関わる分子機構

  老木紗予子; 中道優介; 丸山如江; 村田幸作; 橋本 渉

  生化学, Dec. 2017, Peer-reviewed, Invited, Last author, Corresponding author

  
• Alternative substrate-bound conformation of bacterial solute-binding protein involved in the import of mammalian host glycosaminoglycans

  Sayoko Oiki; Reiko Kamochi; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  SCIENTIFIC REPORTS, Dec. 2017, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

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• Binding mode of metal ions to the bacterial iron import protein EfeO

  Kanate Temtrirath; Kenji Okumura; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Nov. 2017, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  
• A solute-binding protein in the closed conformation induces ATP hydrolysis in a bacterial ATP-binding cassette transporter involved in the import of alginate

  Ai Kaneko; Kasumi Uenishi; Yukie Maruyama; Nobuhiro Mizuno; Seiki Baba; Takashi Kumasaka; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Sep. 2017, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  
• Crucial role of 4-deoxy-L-erythro-5-hexoseulose uronate reductase for alginate utilization revealed by adaptive evolution in engineered Saccharomyces cerevisiae

  Fumiya Matsuoka; Makoto Hirayama; Takayuki Kashihara; Hideki Tanaka; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata; Shigeyuki Kawai

  SCIENTIFIC REPORTS, Jun. 2017, Peer-reviewed

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• A bacterial ABC transporter enables import of mammalian host glycosaminoglycans

  Sayoko Oiki; Bunzo Mikami; Yukie Maruyama; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  SCIENTIFIC REPORTS, Apr. 2017, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

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• Lateral-typed flagellin responsible for formation of a polar flagellum but not of lateral flagella in Sphingomonas sp strain A1

  Masahiro Kobayashi; Hidenori Konishi; Yukie Maruyama; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  MICROBIOLOGY-SGM, Dec. 2016, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  
• Conformational Change in the Active Site of Streptococcal Unsaturated Glucuronyl Hydrolase Through Site-Directed Mutagenesis at Asp-115

  Yusuke Nakamichi; Sayoko Oiki; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  PROTEIN JOURNAL, Aug. 2016, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  
• Structural determinants in bacterial 2-keto-3-deoxy-D-gluconate dehydrogenase KduD for dual-coenzyme specificity

  Ryuichi Takase; Yukie Maruyama; Sayoko Oiki; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, Jul. 2016, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  
• Comparative characterization of three bacterial exo-type alginate lyases

  Makoto Hirayama; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata; Shigeyuki Kawai

  INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES, May 2016, Peer-reviewed

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• Structural Basis of Bacterial Supramolecules for Import of Heteropolysaccharide

  Wataru HASHIMOTO; Yukie MARUYAMA; Takafumi ITOH; Ryuichi TAKASE; Kousaku MURATA

  KAGAKU TO SEIBUTSU, 2016, Peer-reviewed, Invited, Lead author

  
• Structure of a Bacterial ABC Transporter Involved in the Import of an Acidic Polysaccharide Alginate

  Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Ai Kaneko; Yu Nishitani; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  STRUCTURE, Sep. 2015, Peer-reviewed, Corresponding author

  Access this paper :

  
• Formation of a single polar flagellum by two distinct flagellar gene sets in Sphingomonas sp strain A1

  Yukie Maruyama; Masahiro Kobayashi; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  MICROBIOLOGY-SGM, Aug. 2015, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  Access this paper :

  
• Production of polyhydroxybutyrate and alginate from glycerol by Azotobacter vinelandii under nitrogen-free conditions

  Fuminori Yoneyama; Mayumi Yamamoto; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  BIOENGINEERED, Jul. 2015, Peer-reviewed

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• Structural studies on Laz, a promiscuous anticancer Neisserial protein

  Wataru Hashimoto; Akihito Ochiai; Chang Soo Hong; Kousaku Murata; Ananda M. Chakrabarty

  BIOENGINEERED, May 2015, Peer-reviewed, Lead author

  
• Structural insights into alginate binding by bacterial cell-surface protein

  Kanate Temtrirath; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  CARBOHYDRATE RESEARCH, Mar. 2015, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  Access this paper :

  
• Metabolic Fate of Unsaturated Glucuronic/Iduronic Acids from Glycosaminoglycans MOLECULAR IDENTIFICATION AND STRUCTURE DETERMINATION OF STREPTOCOCCAL ISOMERASE AND DEHYDROGENASE

  Yukie Maruyama; Sayoko Oiki; Ryuichi Takase; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Mar. 2015, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  
• Structure-based Conversion of the Coenzyme Requirement of a Short-chain Dehydrogenase/Reductase Involved in Bacterial Alginate Metabolism

  Ryuichi Takase; Bunzo Mikami; Shigeyuki Kawai; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Nov. 2014, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

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• Alginate-Dependent Gene Expression Mechanism in Sphingomonas sp Strain A1

  Chie Hayashi; Ryuichi Takase; Keiko Momma; Yukie Maruyama; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  JOURNAL OF BACTERIOLOGY, Jul. 2014, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  
• Crystal Structure of a Bacterial Unsaturated Glucuronyl Hydrolase with Specificity for Heparin*

  Yusuke Nakamichi; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Feb. 2014, Peer-reviewed, Last author, Corresponding author

  Access this paper :

  
• Crystal Structure of Pedobacter heparinus Heparin Lyase Hep III with the Active Site in a Deep Cleft

  Wataru Hashimoto; Yukie Maruyama; Yusuke Nakamichi; Bunzo Mikami; Kousaku Murata

  BIOCHEMISTRY, Feb. 2014, Peer-reviewed, Lead author

  
• A novel bleb-dependent polysaccharide export system in nitrogen-fixing Azotobacter vinelandii subjected to low nitrogen gas levels

  Wataru Hashimoto; Yukiko Miyamoto; Mayumi Yamamoto; Fuminori Yoneyama; Kousaku Murata

  International Microbiology, 2013, Peer-reviewed, Lead author

  Access this paper :

  
• Induced-fit motion of a lid loop involved in catalysis in alginate lyase A1-III

  Bunzo Mikami; Mizuho Ban; Sachiko Suzuki; Hye-Jin Yoon; Osamu Miyake; Masayuki Yamasaki; Kohei Ogura; Yukie Maruyama; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-STRUCTURAL BIOLOGY, Sep. 2012, Peer-reviewed

  Access this paper :

  
• Recognition of Heteropolysaccharide Alginate by Periplasmic Solute-Binding Proteins of a Bacterial ABC Transporter

  Yu Nishitani; Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  BIOCHEMISTRY, May 2012, Peer-reviewed

  
• Crystallization and preliminary X-ray analysis of alginate importer from Sphingomonas sp A1

  Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Yu Nishitani; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS, Mar. 2012, Peer-reviewed

  Access this paper :

  
• Azotobacter vinelandii gene clusters for two types of peptidic and catechol siderophores produced in response to molybdenum

  F. Yoneyama; M. Yamamoto; W. Hashimoto; K. Murata

  JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY, Oct. 2011, Peer-reviewed

  
• Bioethanol production from marine biomass alginate by metabolically engineered bacteria

  Hiroyuki Takeda; Fuminori Yoneyama; Shigeyuki Kawai; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  ENERGY & ENVIRONMENTAL SCIENCE, Jul. 2011, Peer-reviewed

  
• Heterosubunit Composition and Crystal Structures of a Novel Bacterial M16B Metallopeptidase

  Yukie Maruyama; Asako Chuma; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Mar. 2011, Peer-reviewed

  
• Structural Determinants in Streptococcal Unsaturated Glucuronyl Hydrolase for Recognition of Glycosaminoglycan Sulfate Groups

  Yusuke Nakamichi; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Feb. 2011, Peer-reviewed

  
• Crystal structure of bacterial cell-surface alginate-binding protein with an M75 peptidase motif

  Yukie Maruyama; Akihito Ochiai; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Feb. 2011, Peer-reviewed

  
• Structure and function of alginate-metabolizing enzymes

  Ochiai Akihito; Takase Ryuichi; Mikami Bunzo; Hashimoto Wataru; Murata Kousaku

  VITAMINS, 25 Nov. 2010, Peer-reviewed

  
• Molecular identification of unsaturated uronate reductase prerequisite for alginate metabolism in Sphingomonas sp A1

  Ryuichi Takase; Akihito Ochiai; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, Sep. 2010, Peer-reviewed

  
• Crystal Structure of Exotype Alginate Lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens

  Akihito Ochiai; Masayuki Yamasaki; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Aug. 2010, Peer-reviewed

  
• Mutational studies of the peptidoglycan hydrolase FlgJ of Sphingomonas sp strain A1

  Yukie Maruyama; Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  JOURNAL OF BASIC MICROBIOLOGY, Aug. 2010, Peer-reviewed

  
• Transformation of Saccharomyces cerevisiae and other fungi: methods and possible underlying mechanism.

  S. Kawai; W. Hashimoto; K. Murata

  Bioengineered bugs, 2010, Peer-reviewed

  
• Bacterial supersystem for alginate import/metabolism and its environmental and bioenergy applications

  Wataru Hashimoto; Shigeyuki Kawai; Kousaku Murata

  Bioengineered Bugs, 2010, Peer-reviewed

  
• Crystal Structure of Family 14 Polysaccharide Lyase with pH-dependent Modes of Action

  Kohei Ogura; Masayuki Yamasaki; Takashi Yamada; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Dec. 2009, Peer-reviewed

  
• Substrate Specificity of Streptococcal Unsaturated Glucuronyl Hydrolases for Sulfated Glycosaminoglycan

  Yukie Maruyama; Yusuke Nakamichi; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Jul. 2009, Peer-reviewed

  
• Crystallization and preliminary crystallographic analysis of the cell-surface alginate-binding protein Algp7 isolated from Sphingomonas sp A1

  Wataru Hashimoto; Akihito Ochiai; Jinshan He; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Kousaku Murata

  ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS, May 2009, Peer-reviewed

  
• Structural determinants responsible for substrate recognition and mode of action in family 11 polysaccharide lyases

  Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  Journal of Biological Chemistry, 10 Apr. 2009, Peer-reviewed

  
• Crystal structure of the glycosidase family 73 peptidoglycan hydrolase FlgJ

  Wataru Hashimoto; Akihito Ochiai; Keiko Momma; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Yukie Maruyama; Kousaku Murata

  BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Mar. 2009, Peer-reviewed

  
• A putative lipoprotein of Sphingomonas sp strain A1 binds alginate rather than a lipid moiety

  Jinshan He; Akihito Ochiai; Yasuki Fukuda; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, Nov. 2008, Peer-reviewed

  
• Substrate recognition by family 7 alginate lyase from Sphingomonas sp A1

  Kohei Ogura; Masayuki Yamasaki; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Jul. 2008, Peer-reviewed

  
• Crystal structure of YihS in complex with D-mannose: Structural annotation of Escherichia coli and Salmonella enterica yihS-encoded proteins to an aldose-ketose isomerase

  Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Apr. 2008, Peer-reviewed

  
• Crystal structure of a novel bacterial cell-surface flagellin binding to a polysaccharide

  Yukie Maruyama; Misato Momma; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  BIOCHEMISTRY, Feb. 2008, Peer-reviewed

  
• Superchannel of bacteria: Biological significance and new horizons

  Kousaku Murata; Shigeyuki Kawai; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto

  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Feb. 2008, Peer-reviewed

  
• Paenibacillus sp strain HC1 xylanases responsible for degradation of rice bran hemicellulose

  Karen Mine Harada; Keiko Tanaka; Yasuki Fukuda; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  MICROBIOLOGICAL RESEARCH, 2008, Peer-reviewed

  
• A novel structural fold in polysaccharide lyases - Bacillus subtilis family 11 rhamnogalacturonan lyase YesW with an eight-bladed beta-propeller

  Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Akiko Kawamata; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Dec. 2007, Peer-reviewed

  
• Hydration of vinyl ether groups by unsaturated glycoside hydrolases and their role in bacterial pathogenesis

  Wataru Hashimoto; Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Kousaku Murata

  INTERNATIONAL MICROBIOLOGY, Dec. 2007, Peer-reviewed

  
• Crystal structure of glycoside hydrolase family 78 alpha-L-rhamnosidase from Bacillus sp GL1

  Zhongli Cui; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Nov. 2007, Peer-reviewed

  
• Plant cell wall degradation by saprophytic Bacillus subtilis strains: Gene clusters responsible for rhamnogalacturonan depolymerization

  Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Akiko Kawamata; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Jun. 2007, Peer-reviewed

  
• Molecular Transplantation of Bacterial Organ and Bioremediation

  HASHIMOTO Wataru; MARUYAMA Yukie; ASO Yuji; MURATA Kousaku

  KAGAKU TO SEIBUTSU, 01 May 2007, Peer-reviewed

  
• Cupredoxin-cancer interrelationship: Azurin binding with EphB2, interference in EphB2 tyrosine phosphorylation, and inhibition of cancer growth

  Anita Chaudhari; Magdy Mahfouz; Arsenio M. Fialho; Tohru Yamada; Ana Teresa Granja; Yonghua Zhu; Wataru Hashimoto; Beatrix Schlarb-Ridley; Wonhwa Cho; Tapas K. Das Gupta; Ananda M. Chakrabarty

  BIOCHEMISTRY, Feb. 2007, Peer-reviewed

  
• A structural factor responsible for substrate recognition by Bacillus sp GL1 xanthan lyase that acts specifically on pyruvated side chains of Xanthan

  Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  BIOCHEMISTRY, Jan. 2007, Peer-reviewed

  
• Bacterial proteins and CpG-rich extrachromosomal DNA in potential cancer therapy

  Magdy Mahfouz; Wataru Hashimoto; Tapas K. Das Gupta; Ananda M. Chakrabarty

  PLASMID, Jan. 2007, Peer-reviewed

  
• Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase complexed with substrate

  Takafumi Itoh; Wataru Hashimoto; Bunzo Mikami; Kousaku Murata

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Oct. 2006, Peer-reviewed

  
• Structure of unsaturated rhamnogalacturonyl hydrolase complexed with substrate

  Takafumi Toh; Akihito Ochiai; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Sep. 2006, Peer-reviewed

  
• A biosystem for alginate metabolism in Agrobacterium tumefaciens strain C58: Molecular identification of Atu3025 as an exotype family PL-15 alginate lyase

  Akihito Ochiai; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  RESEARCH IN MICROBIOLOGY, Sep. 2006, Peer-reviewed

  
• Disrupting the entry barrier and attacking brain tumors - The role of the Neisseria H.8 epitope and the Laz protein

  Chang Soo Hong; Tohru Yamada; Wataru Hashimoto; Arsenio M. Fialho; Tapas K. Das Gupta; Ananda M. Chakrabarty

  CELL CYCLE, Aug. 2006, Peer-reviewed

  
• A novel glycoside hydrolase family 105: The structure of family 105 unsaturated rhamnogalacturonyl hydrolase complexed with a disaccharide in comparison with family 88 enzyme complexed with the disaccharide

  Takafumi Itoh; Akihito Ochiai; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Jul. 2006, Peer-reviewed

  
• テクノ・トレンド 「スーパー細菌」の創成とバイオレメディエーションへの応用

  宮本 裕希子; 橋本 渉; 村田 幸作

  バイオテクノロジージャーナル, Jul. 2006

  
• Crystallization and preliminary crystallographic analysis of the family GH78 alpha-L-rhamnosidase RhaB from Bacillus sp GL1

  ZL Cui; Y Maruyama; B Mikami; W Hashimoto; K Murata

  ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS, Jul. 2006, Peer-reviewed

  
• Sequence and analysis of the 46.6-kb plasmid pA1 from Sphingomonas sp A1 that corresponds to the typical IncP-1 beta plasmid backbone without any accessory gene

  KM Harada; Y Aso; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  PLASMID, Jul. 2006, Peer-reviewed

  
• スーパー細菌の創成とバイオレメディエーションへの利用

  麻生祐司; 宮本裕希子; 橋本渉; 村田幸作

  月刊資源環境対策, 15 May 2006

  
• 超チャネルの分子移植による環境浄化型「スーパー細菌」の創成

  宮本裕希子; 麻生祐司; 橋本渉; 村田幸作

  ブレインテクノニュース, 15 May 2006

  
• Substrate recognition by unsaturated glucuronyl hydrolase from Bacillus sp GLI

  T Toh; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, May 2006, Peer-reviewed

  
• Crystallization and preliminary X-ray analysis of the rhamnogalacturonan lyase YesW from Bacillus subtilis strain 168, a member of polysaccharide lyase family 11

  A Ochiai; M Yamasaki; T Itoh; B Mikami; W Hashimoto; K Murata

  ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS, May 2006, Peer-reviewed

  
• Crystallization and preliminary X-ray analysis of an exotype alginate lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens strain C58, a member of polysaccharide lyase family 15

  Akihito Ochiai; Masayuki Yamasaki; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications, May 2006, Peer-reviewed

  
• Overexpression, purification and preliminary X-ray analysis of pullulanase from Bacillus subtilis strain 168

  Dominggus Malle; Takafumi Itoh; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata; Shigeru Utsumi; Bunzo Mikami

  Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications, Apr. 2006, Peer-reviewed

  
• Engineered membrane superchannel improves bioremediation potential of dioxin-degrading bacteria

  Y Aso; Y Miyamoto; KM Harada; K Momma; S Kawai; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  NATURE BIOTECHNOLOGY, Feb. 2006, Peer-reviewed

  
• 巨大な口を開けるスーパー細菌−超チャネルの移植

  宮本裕希子; 橋本 渉; 村田幸作

  バイオニクス, No. 4, 70-71, 2006

  
• Degradation of rice bran hemicellulose by Paenibacillus sp strain HC1: gene cloning, characterization and function of beta-D-glucosidase as an enzyme involved in degradation

  KM Harada; K Tanaka; Y Fukuda; W Hashimoto; K Murata

  ARCHIVES OF MICROBIOLOGY, Dec. 2005, Peer-reviewed

  
• Proteomics-based identification of outer-membrane proteins responsible for import of macromolecules in Sphingonionas sp A1: Alginate-binding flagellin on the cell surface

  W Hashimoto; JS He; Y Wada; H Nankai; B Mikami; K Murata

  BIOCHEMISTRY, Oct. 2005, Peer-reviewed

  
• A structural basis for depolymerization of alginate by polysaccharide lyase family-7

  M Yamasaki; K Ogura; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Sep. 2005, Peer-reviewed

  
• Crystal structure of Bacillus sp GL1 xanthan lyase complexed with a substrate: Insights into the enzyme reaction mechanism

  Y Maruyama; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Jul. 2005, Peer-reviewed

  
• Direct evidence for Sphingomonas sp A1 periplasmic proteins as macromolecule-binding proteins associated with the ABC transporter: Molecular insights into alginate transport in the periplasm

  K Momma; Y Mishima; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  BIOCHEMISTRY, Apr. 2005, Peer-reviewed

  
• Structure and function of bacterial super-biosystem responsible for import and depolymerization of macromolecules

  W Hashimoto; K Momma; Y Maruyama; M Yamasaki; B Mikami; K Murata

  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Apr. 2005, Peer-reviewed

  
• Crystallization and preliminary X-ray analysis of alginate lyases A1-II and A1-II ' from Sphingomonas sp A1

  M Yamasaki; K Ogura; S Moriwaki; W Hashimoto; K Murata; B Mikami

  ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS, Mar. 2005, Peer-reviewed

  
• NAD-binding mode and the significance of intersubunit contact revealed by the crystal structure of Mycobacterium tuberculosis NAD kinase-NAD complex

  S Mori; M Yamasaki; Y Maruyama; K Momma; S Kawai; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Feb. 2005, Peer-reviewed

  
• Molecular identification of Sphingomonas sp A1 alginate lyase (A1-IV ') as a member of novel polysaccharide lyase family 15 and implications in alginate lyase evolution

  W Hashimoto; O Miyake; A Ochiai; K Murata

  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, Jan. 2005, Peer-reviewed

  
• NADキナーゼのリン酸受容体特異性と構造との相関

  森 茂太郎; 河井重幸; 橋本 渉; 三上文三; 村田幸作

  応用微生物学研究, 3(2), 183-189, 2005

  
• 原核型グルコキナーゼと真核型ヘキソキナーゼの進化相関

  向井貴子; 河井重幸; 森 茂太郎; 橋本 渉; 三上文三; 村田幸作

  応用微生物学研究, 3(1), 149-157, 2005

  
• Super-channel in bacteria: Structural and functional aspects of a novel biosystem for the import and depolymerization of macromolecules

  W Hashimoto; M Yamasaki; T Itoh; K Momma; B Mikami; K Murata

  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, Dec. 2004, Peer-reviewed

  
• Molecular identification and characterization of an alginate-binding protein on the cell surface of Sphingomonas sp A1

  JS He; H Nankai; W Hashimoto; K Murata

  BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Sep. 2004, Peer-reviewed

  
• Structure and function of a hypothetical Pseudomonas aeruginosa protein PA1167 classified into family PL-7 - A novel alginate lyase with a beta-sandwich fold

  M Yamasaki; S Moriwaki; O Miyake; W Hashimoto; K Murata; B Mikami

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Jul. 2004, Peer-reviewed

  
• Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase, responsible for the degradation of glycosaminoglycan, from Bacillus sp GL1 at 1.8 angstrom resolution

  T Itoh; S Akao; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Jul. 2004, Peer-reviewed

  
• Origin and diversity of alginate lyases of families PL-5 and-7 in Sphingomonas sp strain A1

  O Miyake; A Ochiai; W Hashimoto; K Murata

  JOURNAL OF BACTERIOLOGY, May 2004, Peer-reviewed

  
• Posttranslational processing of polysaccharide lyase: maturation route for gellan lyase in Bacillus sp GL1

  O Miyake; E Kobayashi; H Nankai; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Feb. 2004, Peer-reviewed

  
• Crystallographic studies of Mycobacterium tuberculosis polyphosphate/ATP- NAD kinase complexed with NAD

  Shigetarou Mori; Masayuki Yamasaki; Yukie Maruyama; Keiko Momma; Shigeyuki Kawai; Wataru Hashimoto; Bunzo Mikami; Kousaku Murata

  Journal of Bioscience and Bioengineering, 2004, Peer-reviewed

  
• 細菌アルギン酸リアーゼの分子多様性、進化、およびＸ線結晶構造に関する研究

  三宅 統; 山崎正幸; 河井重幸; 橋本 渉; 三上文三; 村田幸作

  応用微生物学研究, 2 (2), 103-111, 2004

  
• ブタ腎臓由来N-アシル-D-グルコサミン 2-エピメラーゼの構造、機能及び工業的利用に関する研究

  丸 勇史; 大西 淳; 太田泰弘; 伊藤貴文; 橋本 渉; 三上文三; 村田幸作

  応用微生物学研究, 2 (1), 12-21, 2004

  
• 細菌の形態形成制御と高分子物質の輸送・分解機構に関する構造生物学的研究

  橋本 渉

  日本農藝化學會誌 = Journal of the Agricultural Chemical Society of Japan, 01 Dec. 2003

  
• Crystallization and preliminary X-ray analysis of alginate lyase, a member of family PL-7, from Pseudomonas aeruginosa

  M Yamasaki; S Moriwaki; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY, Aug. 2003, Peer-reviewed

  
• Molecular identification of an alpha-L-rhamnosidase from Bacillus sp strain GL1 as an enzyme involved in complete metabolism of gellan

  W Hashimoto; O Miyake; H Nankai; K Murata

  ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Jul. 2003, Peer-reviewed

  
• A novel member of glycoside hydrolase family 88: overexpression, purification, and characterization of unsaturated beta-glucuronyl hydrolase of Bacillus sp GL1

  S Mori; S Akao; H Nankai; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION, May 2003, Peer-reviewed

  
• An exotype alginate lyase in Sphingomonas sp Al: overexpression in Escherichia coli, purification, and characterization of alginate lyase IV (A1-IV)

  O Miyake; W Hashimoto; K Murata

  PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION, May 2003, Peer-reviewed

  
• Crystallization and preliminary X-ray analysis of a novel unsaturated glucuronyl hydrolase from Bacillus sp GL1

  S Mori; S Akao; O Miyake; H Nankai; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY, May 2003, Peer-reviewed

  
• 微生物の「超チャネル」 : 細胞の高分子利用戦略

  橋本 渉; 三上 文三; 村田 幸作

  バイオサイエンスとインダストリー = Bioscience & industry, 01 Apr. 2003

  
• Super-biosystem for macromolecule utilization in bacteria

  HASHIMOTO Wataru; MIKAMI Bunzo; MURATA Kousaku

  Bioscience & industry, 01 Apr. 2003

  
• Crystal structure of Bacillus sp GL1 xanthan lyase, which acts on the side chains of xanthan

  W Hashimoto; H Nankai; B Mikami; K Murata

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Feb. 2003, Peer-reviewed

  
• Crystal structure of AlgQ2, a macromolecule (alginate)-binding protein of Sphingomonas sp A1, complexed with an alginate tetrasaccharide at 1.6-A resolution

  Y Mishima; K Momma; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Feb. 2003, Peer-reviewed

  
• Structural and biological studies on the regulation of cell morphology and macromolecule import/depolymerization systems of bacteria

  W Hashimoto

  NIPPON NOGEIKAGAKU KAISHI-JOURNAL OF THE JAPAN SOCIETY FOR BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND AGROCHEMISTRY, 2003, Peer-reviewed

  
• Sphingomonas sp. A1 株由来アルギン酸結合タンパク質の構造生物学的研究

  三島由美子; 門間敬子; 河井重幸; 橋本 渉; 三上文三; 村田幸作

  応用微生物学研究, 1 (2), 115-122, 2003

  
• Bacillus sp. GL1におけるキサンタン分解系の酵素学的・遺伝学的解析、及びキサンタンリアーゼのＸ線結晶構造解析

  南海浩一; 河井重幸; 橋本 渉; 三上文三; 村田幸作

  応用微生物学研究, 1 (1), 26-34, 2003

  
• 微生物のポリリン酸/ATP-NADキナーゼとATP-NADキナーゼ

  河井重幸; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  応用微生物学研究, 1 (1), 18-25, 2003

  
• Extremely Simple, Rapid, and Highly Efficient Transformation Method for a Yeast, Saccharomyces cerevisiae, by the Use of Glutathione and Early Log-phase Cells

  HAYAMA Yoshiyuki; FUKUDA Yasuki; KAWAI Shigeyuki; HASHIMOTO Wataru; MURATA Kousaku

  Vitamins, 2003

  
• Extremely simple, rapid, and highly efficient transformation method for the yeast Saccharomyces cerevisiae using glutathione and early log phase cells

  Y Hayama; Y Fukuda; S Kawai; W Hashimoto; K Murata

  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, Aug. 2002, Peer-reviewed

  
• Structure and function of bacterial "Super-chennel" for macromolecule import

  HASHIMOTO Wataru; MIKAMI Bunzo; MURATA Kousaku

  生化学, 25 Jul. 2002, Peer-reviewed

  
• Structure and function of bacterial "Super-channel" for macromolecule import

  W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  SEIKAGAKU, Jul. 2002, Peer-reviewed

  
• Molecular identification of family 38 alpha-mannosidase of Bacillus sp strain GL1, responsible for complete depolymerization of xanthan

  H Nankai; W Hashimoto; K Murata

  APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Jun. 2002, Peer-reviewed

  
• Crystal structure of AlgQ2, a macromolecule (alginate)-binding protein of Sphingomonas sp A1 at 2.0 angstrom resolution

  K Momma; B Mikami; Y Mishima; W Hashimoto; K Murata

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Mar. 2002, Peer-reviewed

  
• A super-channel in bacteria: Macromolecule uptake and depolymerization systems of Sphingomonas sp A1 with a special cell surface structure

  Y Mishima; K Momma; O Miyake; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  BIOTECHNOLOGY & GENETIC ENGINEERING REVIEWS, VOL 19, 2002, Peer-reviewed

  
• Super-channel in bacteria: function and structure of the macromolecule import system mediated by a pit-dependent ABC transporter

  Y Mishima; K Momma; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, Nov. 2001, Peer-reviewed

  
• Super-channel in bacteria: Function and structure of a macromolecule import system mediated by a pit-dependent ABC transporter

  W Hashimoto; K Momma; Y Mishima; B Mikami; K Murata

  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Sep. 2001, Peer-reviewed

  
• Molecular characterization of Escherichia coli NAD kinase

  S Kawai; S Mori; T Mukai; W Hashimoto; K Murata

  EUROPEAN JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, Aug. 2001, Peer-reviewed

  
• Crystallization and preliminary X-ray analysis of AlgS, a bacterial ATP-binding cassette (ABC) protein specific to macromolecule import

  Y Mishima; K Momma; W Hashimoto; B Mikami; K Murata

  ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY, Jun. 2001, Peer-reviewed

  
• Crystal structure of alginate lyase A1-III complexed with trisaccharide product at 2.0 angstrom resolution

  HJ Yoon; W Hashimoto; O Miyake; K Murata; B Mikami

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Mar. 2001, Peer-reviewed

  
• 食研講演会要旨 超チャネルの構造と高分子輸送機能

  橋本 渉

  京都大学食糧科学研究所報告, Mar. 2001

  
• Effect of His192 mutation on the activity of alginate lyase A1-III from Sphingomonas species A1

  HJ Yoon; YJ Choi; O Miyake; W Hashimoto; K Murata; B Mikami

  JOURNAL OF MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, Feb. 2001, Peer-reviewed

  
• Polysaccharide lyase: Molecular cloning, sequencing, and overexpression of the xanthan lyase gene of Bacillus sp strain GL1

  W Hashimoto; H Miki; N Tsuchiya; H Nankai; K Murata

  APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Feb. 2001, Peer-reviewed

  
• Identification of an antifungal substance derived from the oil-based extract of licorice

  J. Sato; S. Kawai; W. Hashimoto; K. Murata; K. Goto; F. Nanjo

  Biocontrol Science, 2001, Peer-reviewed

  
• Crystal structure of N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase from porcine kidney at 2.0 angstrom resolution

  T Itoh; B Mikami; Maru, I; Y Ohta; W Hashimoto; K Murata

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Nov. 2000, Peer-reviewed

  
• Inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase of Micrococcus flavus and Mycobacterium tuberculosis H37Rv

  S Kawai; S Mori; T Mukai; S Suzuki; T Yamada; W Hashimoto; K Murata

  BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Sep. 2000, Peer-reviewed

  
• Safety assessment of rice genetically modified with soybean glycinin by feeding studies on rats

  K Momma; W Hashimoto; HJ Yoon; S Ozawa; Y Fukuda; S Kawai; F Takaiwa; S Utsumi; K Murata

  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Sep. 2000, Peer-reviewed

  
• Molecular identification of oligoalginate lyase of Sphingomonas sp strain A1 as one of the enzymes required for complete depolymerization of alginate

  W Hashimoto; O Miyake; K Momma; S Kawai; K Murata

  JOURNAL OF BACTERIOLOGY, Aug. 2000, Peer-reviewed

  
• A novel bacterial ATP-binding cassette transporter system that allows uptake of macromolecules

  K Momma; M Okamoto; Y Mishima; S Mori; W Hashimoto; K Murata

  JOURNAL OF BACTERIOLOGY, Jul. 2000, Peer-reviewed

  
• Overexpression in Escherichia coli, purification, and characterization of Sphingomonas sp A1 alginate lyases

  HJ Yoon; W Hashimoto; O Miyake; M Okamoto; B Mikami; K Murata

  PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION, Jun. 2000, Peer-reviewed

  
• Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of alginate lyase A1-II from Sphingomonas species A1.

  H J Yoon; W Hashimoto; Y Katsuya; Y Mezaki; K Murata; B Mikami

  Biochimica et biophysica acta, 09 Feb. 2000

  
• Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of alginate lyase Al-II from Sphingomonas species Al

  HJ Yoon; W Hashimoto; Y Katsuya; Y Mezaki; K Murata; B Mikami

  BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEIN STRUCTURE AND MOLECULAR ENZYMOLOGY, Feb. 2000, Peer-reviewed

  
• 高分子を鵜呑みにする細菌-体腔依存高分子取り込みABCトランスポーターの構造と機能-

  橋本 渉; 村田幸作

  Bull. Res. Inst. Food Sci. Kyoto University, No.63, 64-65, 2000

  
• Polyphosphate kinase, polyphosphate-glucokinase, and polyphosphate-NAD kinase in microorganisms and their applications.

  S. Kawai; T. Mukai; S. Mori; S. Suzuki; W. Hashimoto; K. Murata

  Research Advances in Bioscience and Bioengineering, 2000, Peer-reviewed

  
• Safety assessment of transgenic potatoes with soybean glycinin by feeding studies in rats

  W Hashimoto; K Momma; HJ Yoon; S Ozawa; Y Ohkawa; T Ishige; M Kito; S Utsumi; K Murata

  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Nov. 1999, Peer-reviewed

  
• Special cell surface structure, and novel macromolecule transport/depolymerization system of Sphingomonas sp A1

  K Momma; W Hashimoto; O Miyake; HJ Yoon; S Kawai; Y Mishima; B Mikami; K Murata

  JOURNAL OF INDUSTRIAL MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, Oct. 1999, Peer-reviewed

  
• Safety assessment of genetically engineered potatoes with designed soybean glycinin: compositional analyses of the potato tubers and digestibility of the newly expressed protein in transgenic potatoes

  W Hashimoto; K Momma; T Katsube; Y Ohkawa; T Ishige; M Kito; S Utsumi; K Murata

  JOURNAL OF THE SCIENCE OF FOOD AND AGRICULTURE, Sep. 1999, Peer-reviewed

  
• Unsaturated glucuronyl hydrolase of Bacillus sp GL1: Novel enzyme prerequisite for metabolism of unsaturated oligosaccharides produced by polysaccharide lyases

  W Hashimoto; E Kobayashi; H Nankai; N Sato; T Miya; S Kawai; K Murata

  ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Aug. 1999, Peer-reviewed

  
• Characterization of alpha-L-rhamnosidase of Bacillus sp GL1 responsible for the complete depolymerization of gellan

  W Hashimoto; H Nankai; N Sato; S Kawai; K Murata

  ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Aug. 1999, Peer-reviewed

  
• Crystal structure of alginate lyase A1-III from Sphingomonas species A1 at 1.78 angstrom resolution

  HJ Yoon; B Mikami; W Hashimoto; K Murata

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Jul. 1999, Peer-reviewed

  
• Microbial system for polysaccharide depolymerization: enzymatic route for xanthan depolymerization by Bacillus sp strain GL1

  H Nankai; W Hashimoto; H Miki; S Kawai; K Murata

  APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Jun. 1999, Peer-reviewed

  
• 細菌における多糖の取り込みと資化

  橋本渉; 村田幸作

  京都大学食糧科学研究所報告, 31 Mar. 1999

  
• Glutathione metabolism in Escherichia coli

  H Suzuki; W Hashimoto; H Kumagai

  JOURNAL OF MOLECULAR CATALYSIS B-ENZYMATIC, Mar. 1999, Peer-reviewed

  
• 遺伝子組換え食品の安全性

  門間敬子; 橋本 渉; 村田幸作

  日本醸造協会誌, Feb. 1999

  
• Enzymatic and genetic bases on assimilation, depolymerization, and transport of heteropolysaccharides in bacteria

  W Hashimoto; K Momma; H Miki; Y Mishima; E Kobayashi; O Miyake; S Kawai; H Nankai; B Mikami; K Murata

  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, Feb. 1999, Peer-reviewed

  
• Quality and safety evaluation of genetically engineered rice with soybean glycinin: Analyses of the grain composition and digestibility of glycinin in transgenic rice

  K Momma; W Hashimoto; S Ozawa; S Kawai; T Katsube; F Takaiwa; M Kito; S Utsumi; K Murata

  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Feb. 1999, Peer-reviewed

  
• 体腔形成細菌:高分子物質の巧妙な食べ方

  橋本 渉; 門間敬子; 南海浩一; 村田幸作

  人間環境科学, 1999

  
• Molecular cloning of two genes for beta-D-glucosidase in Bacillus sp. GL1 and identification of one as a gellan-degrading enzyme

  W Hashimoto; H Miki; H Nankai; N Sato; S Kawai; K Murata

  ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Dec. 1998, Peer-reviewed

  
• Cooking Manner of Bacteria for Heteropolysaccharide Assimilation

  HASHIMOTO Wataru; MOMMA Keiko; MURATA Kousaku

  KAGAKU TO SEIBUTSU, 25 Nov. 1998, Peer-reviewed

  
• 遺伝子組み換え食品の品質と安全性

  橋本渉; 小沢祥子; 門間敬子; 村田幸作

  日本調理科学会誌, Nov. 1998, Peer-reviewed

  
• Xanthan lyase of Bacillus sp. strain GL1 liberates pyruvylated mannose from xanthan side chains

  W Hashimoto; H Miki; N Tsuchiya; H Nankai; K Murata

  APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Oct. 1998, Peer-reviewed

  
• Safety assessment of genetically engineered food: Detection and monitoring of glyphosate-tolerant soybeans

  N Shirai; K Momma; S Ozawa; W Hashimoto; M Kito; S Utsumi; K Murata

  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Jul. 1998, Peer-reviewed

  
• Polysaccharide lyase: Molecular cloning of gellan lyase gene and formation of the lyase from a huge precursor protein in Bacillus sp. GL1

  W Hashimoto; N Sato; S Kimura; K Murata

  ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Jun. 1998, Peer-reviewed

  
• alpha-L-rhamnosidase of Sphingomonas sp. R1 producing an unusual exopolysaccharide of sphingan

  W Hashimoto; K Murata

  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Jun. 1998, Peer-reviewed

  
• Sphingomonas sp. A1 lyase active on both poly-beta-D-mannuronate and heteropolymeric regions in alginate

  W Hashimoto; M Okamoto; T Hisano; K Momma; K Murata

  JOURNAL OF FERMENTATION AND BIOENGINEERING, 1998, Peer-reviewed

  
• Safety assessment of genetically engineered yeast: elimination of mutagenicity of the yeast Saccharomyces cerevisiae by decreasing the activity of methylglyoxal synthase

  W Hashimoto; T Inose; K Masuda; K Murata

  INTERNATIONAL JOURNAL OF FOOD SCIENCE AND TECHNOLOGY, Dec. 1997, Peer-reviewed

  
• Microbial system for polysaccharide depolymerization: Enzymatic route for gellan depolymerization by Bacillus sp. GL1

  W Hashimoto; K Maesaka; N Sato; S Kimura; K Yamamoto; H Kumagai; K Murata

  ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Mar. 1997, Peer-reviewed

  
• Analysis of low temperature inducible mechanism of gamma-glutamyltranspeptidase of Escherichia coli K-12

  W Hashimoto; H Suzuki; K Yamamoto; H Kumagai

  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Jan. 1997, Peer-reviewed

  
• 酵素2-エピメラーゼの生物学的機能

  橋本 渉; 村田幸作

  Bull. Res. Inst. Food Sci. Kyoto University, No.60, 126-128, 1997

  
• 21世紀の農業の期待と社会的受容（遺伝子組み換え食品の現状と安全性）

  橋本 渉; 村田幸作

  デイリーフード. 春季号（大豆と技術）, 4, 14-19, 1997

  
• Growth repression of yeast and fungus by bacterial DNAs: A possible physiological function of DNA other than as a carriage of genetic information

  K Matsutani; Y Fukuda; N Yajima; W Hashimoto; K Murata

  JOURNAL OF FERMENTATION AND BIOENGINEERING, 1997, Peer-reviewed

  
• Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase from porcine kidney

  Maru, I; J Ohnishi; Y Ohta; W Hashimoto; Y Tsukada; K Murata; B Mikami

  JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, Sep. 1996, Peer-reviewed

  
• A preliminary description of the crystal structure of gamma-glutamyltranspeptidase from E-coli K-12

  H Sakai; N Sakabe; K Sasaki; W Hashimoto; H Suzuki; H Tachi; H Kumagai; K Sakabe

  JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, Jul. 1996, Peer-reviewed

  
• Purification and characterization of microbial gellan lyase

  W Hashimoto; T Inose; H Nakajima; N Sato; S Kimura; K Murata

  APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Apr. 1996, Peer-reviewed

  
• Pit structure on bacterial cell surface

  T Hisano; N Kimura; W Hashimoto; K Murata

  BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Mar. 1996, Peer-reviewed

  
• 細菌の多糖リアーゼ：酵素学的，遺伝学的側面と医薬への応用

  村田幸作; 橋本渉

  日本応用酵素協会誌, 1996

  
• Mapping, cloning, and DNA sequencing of pepB which encodes peptidase B of Escherichia coli K-12

  H Suzuki; ES Kim; N Yamamoto; W Hashimoto; K Yamamoto; H Kumagai

  JOURNAL OF FERMENTATION AND BIOENGINEERING, 1996, Peer-reviewed

  
• EFFECT OF SITE-DIRECTED MUTATIONS ON PROCESSING AND ACTIVITY OF GAMMA-GLUTAMYL-TRANSPEPTIDASE OF ESCHERICHIA-COLI K-12

  W HASHIMOTO; H SUZUKI; K YAMAMOTO; H KUMAGAI

  JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, Jul. 1995, Peer-reviewed

  
• BOTH LARGE AND SMALL SUBUNITS ARE ESSENTIAL FOR THE ENZYMATIC-ACTIVITY OF GAMMA-GLUTAMYL-TRANSPEPTIDASE OF ESCHERICHIA-COLI K-12

  H SUZUKI; W HASHIMOTO; S NOHARA; H TACHI; T MONJI; K YAMAMOTO; H KUMAGAI

  FASEB JOURNAL, Apr. 1995, Peer-reviewed

  
• Subunit association of -glutamyltranspeptidase of ┣DBEscherichia coli(/)-┫DB

  Wataru Hashimoto; Hideyuki Suzuki; Satoko Nohara; Hiromi Tachi; Kenji Yamamoto; Hidehiko Kumagai

  Journal of Biochemistry,118/6,1216-1223, 1995, Peer-reviewed

  
• CRYSTALLIZATION AND PRELIMINARY-X-RAY ANALYSIS OF GAMMA-GLUTAMYL-TRANSPEPTIDASE FROM ESCHERICHIA-COLI K-12

  H KUMAGAI; S NOHARA; H SUZUKI; W HASHIMOTO; K YAMAMOTO; H SAKAI; K SAKABE; K FUKUYAMA; N SAKABE

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Dec. 1993, Peer-reviewed

  
• ESCHERICHIA-COLI K-12 CAN UTILIZE AN EXOGENOUS GAMMA-GLUTAMYL PEPTIDE AS AN AMINO-ACID SOURCE, FOR WHICH GAMMA-GLUTAMYL-TRANSPEPTIDASE IS ESSENTIAL

  H SUZUKI; W HASHIMOTO; H KUMAGAI

  JOURNAL OF BACTERIOLOGY, Sep. 1993, Peer-reviewed

  
• ESCHERICHIA-COLI GAMMA-GLUTAMYL-TRANSPEPTIDASE MUTANTS DEFICIENT IN PROCESSING TO SUBUNITS

  W HASHIMOTO; H SUZUKI; S NOHARA; H KUMAGAI

  BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Nov. 1992, Peer-reviewed

  
• Molecular cloning and DNA sequence of Escherichia coli K-12 .GAMMA.-glutamyltranspeptidase gene, ggt, and excretion of .GAMMA.-glutamyltranspeptidase.

  SUZUKI H; KUMAGAI H; HASHIMOTO W; CLAUDIO J O; TOCHIKURA T

  Front New Horiz Amino Acid Res, 1992, Peer-reviewed

  

Misc.

• Pseudomonas属細菌における環境適応性に関わる鉄輸送系遺伝子の多様性

  奥村 憲史; 小倉 康平; 橋本 渉

  日本農芸化学会2025年度大会, 08 Mar. 2025

  
• バナナ自然発酵：昆虫誘引を介した植物拡散戦略の洞察

  若山 龍大; 小倉 康平; 橋本 渉

  日本農芸化学会2025年度大会, 05 Mar. 2025

  
• 玄米由来酵母Solicoccozyma zizaniaeのイネとの共生と性状

  中谷 優花; 髙瀬 隆一; 小倉 康平; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第534回講演会, 08 Feb. 2025

  
• Pseudoalteromonas属細菌L1株による褐藻類由来多糖の分解

  佐藤 かのみ; 勝弘 夏子; 小倉 康平; 橋本 渉

  日本応用糖質科学会第50回近畿支部会, 22 Nov. 2024

  
• Bacillus subtilisの細胞空洞化に関与するペプチドグリカン分解酵素CwlO

  中根 摩耶; 中本 博; 南部 優子; 髙瀬 隆一; 小倉 康平; 橋本 渉

  日本農芸化学会2024年度関西支部大会 関西支部第532回講演会, 29 Sep. 2024

  
• 動物グリコサミノグリカンの代謝に関わるオペロン保有細菌の系統分布

  西村 優; 老木 紗予子; 小倉 康平; 橋本 渉

  第73回日本応用糖質科学会2024年度大会, 26 Sep. 2024

  
• 窒素固定細菌Azotobacter tropicalisによるマンニトールからの有用ポリマー生産

  足立 真奈; 吉岡 智志; 髙瀬 隆一; 小倉 康平; 橋本 渉

  第73回日本応用糖質科学会2024年度大会, 25 Sep. 2024

  
• 鼠咬症起因菌Streptobacillus moniliformis由来二種類のヒアルロン酸リアーゼ

  澤田 廣大; 老木 紗予子; 小倉 康平; 橋本 渉

  第24回関西グライコサイエンスフォーラム, 11 May 2024

  
• レーズンと水からワインができる仕組み

  日尾 守; 村田 憲亮; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 小倉 康平; 橋本 渉

  日本農芸化学会2024年度大会, 26 Mar. 2024

  
• 褐藻主要多糖アルギン酸からの油脂生産を目指した油糧酵母Yarrowia lipolyticaにおけるエキソ型アルギン酸リアーゼの細胞外発現

  村 友香; 橋本 渉; 河井 重幸

  日本農芸化学会2024年度大会, 25 Mar. 2024

  
• ミカン青カビ・緑カビ病を惹起するPenicillium属由来病原因子の解析

  加古 有宜子; 髙瀬 隆一; 老木 紗予子; 小倉 康平; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第529回講演会, 10 Feb. 2024

  
• アルギン酸多糖への走化性発現に関わるSphingomonas属細菌A1株のトリガー分子

  日尾 守; 髙瀬 隆一; 小倉 康平; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第529回講演会, 10 Feb. 2024

  
• 溶血性レンサ球菌におけるB群菌に特異的なヒト膣内常在性要因

  勝弘 夏子; 髙瀬 隆一; 老木 紗予子; 小倉 康平; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第529回講演会, 10 Feb. 2024

  
• 大豆発酵過程でBacillus subtilisから産生されるベタインの合成とそれに伴う凝集体の形成

  加古 有宜子; 髙瀬 隆一; 老木 紗予子; 小倉 康平; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第528回講演会, 02 Dec. 2023

  
• リンゴ果実に常在する酵母によるアルコール自然発酵

  敦賀 和輝; 老木 紗予子; 小倉 康平; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第528回講演会, 02 Dec. 2023

  
• グリコサミノグリカン輸送に関わる口腔内常在Fusobacteriales目細菌の遺伝子クラスター

  魚住 桃加; 生駒 諒; 繁竹 永美花; 髙瀬 隆一; 老木 紗予子; 小倉 康平; 橋本 渉

  日本応用糖質科学会第47回近畿支部会, 01 Dec. 2023

  
• 腸内優占Bacteroides属細菌由来BT3106スルファターゼ

  南 秀磨; 老木 紗予子; 渡辺 大輔; 髙瀬 隆一; 小倉 康平; 橋本 渉

  第76回日本細菌学会関西支部総会, 08 Nov. 2023

  
• バナナのアルコール自然発酵に関わる果実内在酵母

  若山 龍大; 髙瀬 隆一; 老木 紗予子; 小倉 康平; 橋本 渉

  日本農芸化学会中部・関西支部合同大会関西支部第527回講演会, 01 Oct. 2023

  
• 植物由来Pseudomonas属細菌はEfe-Fe2+輸送系遺伝子を高度に保存する

  奥村 憲史; 髙瀬 隆一; 中辻 早希子; 小倉 康平; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第525回講演会, 27 May 2023

  
• 宿主動物由来グリコサミノグリカンの代謝に関わる細菌オペロンの形成

  西村 優; 老木 紗予子; 橋本 渉

  第69回生化学会近畿支部例会, 27 May 2023

  
• レーズン酵母によるワイン様レーズン水のアルコール発酵における微生物動態

  日尾 守; 村田 憲亮; 髙瀬 隆一; 老木 紗予子; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会2023年度大会, 15 Mar. 2023

  
• 油糧酵母Yarrowia lipolyticaにおけるアルギン酸リアーゼの細胞外発現とマンニトール資化性

  高波 聖花、橋本 渉、河井 重幸

  日本農芸化学会2023年度大会, 15 Mar. 2023

  
• 宿主動物由来グリコサミノグリカンに作用する腸内優占菌の代謝酵素系の新規な局在性と立体構造

  髙瀬 隆一; 西村 優; 老木 紗予子; 橋本 渉

  日本応用糖質科学会第48回近畿支部会, 02 Dec. 2022

  
• 納豆菌の豆類発酵におけるマルチオミクス

  加古 有宜子; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  2022年度日本農芸化学会関西支部大会 日本農芸化学会関西支部第522回講演会, 16 Sep. 2022

  
• ヒト腸内優占Bacteroides属細菌による宿主細胞外粘液物質の利活用とγ-アミノ酪酸（GABA）の生産を介した生存戦略

  南 秀磨; 老木 紗予子; 渡辺 大輔; 髙瀬 隆一; 橋本 渉

  2022年度日本農芸化学会関西支部大会 日本農芸化学会関西支部第522回講演会, 16 Sep. 2022

  
• 褐藻類多糖を標的とする海洋微生物叢

  勝弘 夏子; 中田 翔太; 渡辺 大輔; 髙瀬 隆一; 橋本 渉

  第22回関西グライコサイエンスフォーラム, 21 May 2022

  
• ヒト腸管細胞と腸内優占Bacteroides属細菌との宿主粘液物質を介した接着と相利共生

  幸田 有希渚; 梶川 幹太; 佐藤 賢宏; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会2022年度大会, 16 Mar. 2022

  
• 細菌によるブルーカーボン・レアメタル含有褐藻類の高度利用

  中辻 早希子; 日尾 守; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会2022年度大会, 16 Mar. 2022

  
• 代謝改変した油糧酵母Yarrowia lipolyticaによるブルーカーボンアルギン酸からの油脂生産

  森 大輔; 橋本 渉; 河井 重幸

  代謝改変した油糧酵母Yarrowia lipolyticaによるブルーカーボンアルギン酸からの油脂生産, 16 Mar. 2022

  
• 米糠を単一栄養源とするヒト腸内優占菌Bacteroidesとその次世代発酵乳への応用

  丸田 草太; 山本 雄大; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第519回講演会, 05 Feb. 2022

  
• 大気窒素活用型発酵生産によるSDGs達成への挑戦

  吉岡 智志; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第518回講演会, 04 Dec. 2021

  
• 学生も社会人も，迷ったら博士課程に！

  橋本 渉

  化学と生物, Dec. 2021, Lead author, Corresponding author

  
• 多糖ペクチン結合タンパク質の基質サイズ依存的な構造変化

  穴水 康太郎; 髙瀬 隆一; 日尾 守; 渡辺 大輔; 三上 文三; 橋本 渉

  日本応用糖質科学会第47回近畿支部会, 26 Nov. 2021

  
• 細菌鉄輸送Efe系の金属結合タンパク質EfeOの立体構造

  中辻 早希子; 髙瀬 隆一; 橋本 渉

  第94回日本生化学会大会, Nov. 2021

  
• 定常期におけるBacillus subtilisの細胞空洞化現象とその意義

  中本 博; 長瀬 鮎美; 南部 優子; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会西日本・中四国・関西支部2021年度合同鹿児島大会 日本農芸化学会関西支部第571回講演会, 25 Sep. 2021

  
• 1P080 Bacterial Unsaturated Glycoside Hydrolases as Virulent Factors : Novel Catalytic Reaction Mechanism(2. Protein function (I),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

  Itoh Takafumi; Ochiai Akihito; Mikami Bunzo; Hashimoto Wataru; Murata Kousaku

  Seibutsu Butsuri, 2006

  
• 434 Novel transformation method for yeast, Saccharomyces cerevisiae

  Kawai Shigeyuki; Hayama Yoshiyuki; Fukuda Yasuki; Nankai Hirokazu; Hashimoto Wataru; Murata Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2002

  
• 多糖ゲランの分解に関わる酵素の作用機作 : 酵素

  橋本 渉; 中島 浩; 田中 哲基; 山本 憲二; 熊谷 英彦; 村田 幸作

  日本農藝化學會誌, 05 Mar. 1996

  
• Microbial polysaccharide lyase : Microbes and enzymes for gellan depolymerization

  Hashimoto Wataru; Nakajima Hiroshi; Yamamoto Kenji; Kumagai Hidehiko; Murata Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 1996

  
• 大腸菌γ-グルタミルトランスペプチダーゼのアルギニン残基-114の部位特異的変異体に関する研究 : 酵素

  橋本 渉; 鈴木 秀之; 山本 憲二; 熊谷 英彦

  日本農藝化學會誌, 05 Jul. 1995

  
• 多糖の潜在的機能の解析 : Gellan分解微生物と分解酵素の性質 : 微生物

  中島 浩; 猪瀬 智子; 橋本 渉; 村田 幸作

  日本農藝化學會誌, 05 Jul. 1995

  
• Properties and chemical modification of recombinant alginate lyase

  Nishimura M.; Hisano T.; Yamashita T.; Imanaka T.; Hashimoto W.; Murata K.

  日本生物工学会大会講演要旨集, 1995

  
• Proteome analysis of Sphingomonas sp. A1 : Identification of outer membrane proteins responsible for macromolecule import

  Nankai Hirokazu; Wada Yushin; He Jin shan; Hashimoto Wataru; Murata Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2003

  
• Crystal structure of a bifunctional enzyme, N-acyl-D-glucosamaine 2-epimerase (Renin-binding protein) from porcine kidney

  Itoh Takafumi; Mikami Bunzo; Maru Isafumi; Ohta Yasuhiro; Hashimoto Wataru; Murata Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2000

  
• Analysis of enzymes and genes responsible for complete degradation of gellan in Bacillus sp. GL1.

  Hashimoto Wataru; Kobayashi Eiko; Sato Nobuyuki; Kawai Shigeyuki; Murata Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 1998

  
• Polysaccharide lyase : Enzyme (gellan lyase) and its gene, responsible for degradation of bacterial heteropolysaccharide-gellan-.

  Hashimoto Wataru; Sato Nobuyuki; Murata Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 1997

  
• Polysaccharide lyase : Bacillus sp. GL1 producing two kinds of polysaccharide lyases and xanthan lyase.

  Hashimoto Wataru; Miki Hikaru; Murata Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 1997

  
• Properties and X-ray crystal structure analysis of acyl-glucosamine 2-epimerase from porcine kidney

  Maru Isafumi; Ohnishi Jun; Ohta Yasuhiro; Sasaki Kahori; Hashimoto Wataru; Tsukada Yoji; Murata Kousaku; Mikami Bunzo

  日本生物工学会大会講演要旨集, 1996

  
• 海洋酵母と細菌の共生による海藻多糖アルギン酸の利用

  中田 翔太; 髙瀬 隆一; 河井 重幸; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会西日本・中四国・関西支部2021年度合同鹿児島大会 日本農芸化学会関西支部第571回講演会, 25 Sep. 2021

  
• 2B17-2 Molecular conversion of rhamnogalacturonan lyase with exo-type into endo-type

  OCHIAI Akihito; MIKAMI Bunzo; HASHIMOTO Wataru; MURATA Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2007

  
• 2C14-5 Crystallization of alginate lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens C58

  OCHIAI Akihito; HASHIMOTO Wataru; MIKAMI Bunzo; MURATA Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2005

  
• 2C15-1 Structural basis of depolymerization of alginate by PL-7

  OGURA Kohei; YAMASAKI Masayuki; HASHIMOTO Wataru; MIKAMI Bunzo; MURATA Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2005

  
• 2C15-2 Structural Basis for Catalytic Mechanism in Unsaturated Glucuronyl Hydrolase

  ITOH Takafumi; HASHIMOTO Wataru; MIKAMI Bunzo; MURATA Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2005

  
• 3A11-3 Creation of a bioremediative super-bug by transplantation of the super-channel

  MIYAMOTO Yukiko; ASO Yuji; HASHIMOTO Wataru; MURATA Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2005

  
• 1pC14-2 Super channel in bacteria : Functional analysis of alginate granule binding protein expressed on cell surface

  HE Jinshan; NANKAI Hirokazu; HASHIMOTO Wataru; MURATA Kosaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2004

  
• 1pC14-3 Super-channel in bacteria : functional analysis of peptidoglycan hydrolase

  MOMMA Keiko; HIRONAKA Keiichirou; HASHIMOTO Wataru; MURATA Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2004

  
• 1pC14-1 "Super-channel" in bacteria : localization and novel function of flagellin

  HASHIMOTO Wataru; HE Jinshan; MIKAMI Bunzo; MURATA Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2004

  
• 1pC14-4 Diversity of alginate lyases in "super-channel"-forming bacteria and a novel polysaccharide lyase family PL-15

  MIYAKE Osamu; HASHIMOTO Wataru; MURATA Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2004

  
• 536 ABC transporter for macromolecule (alginate) import : function and X-ray structural analysis of substrate-binding protein

  Mishima Yumiko; Momma Keiko; Hashimoto Wataru; Mikami Bunzo; Murata Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2002

  
• 535 Structure and function of polysaccharide lyases : structure of active cleft of xanthan lyase from Bacillus sp. GL1

  Hashimoto Wataru; Nankai Hirokazu; Mikami Bunzo; Murata Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2002

  
• 窒素固定細菌の細胞外膜由来膜小胞に関するプロテオーム解析

  髙瀬 隆一; 吉田 暢広; 橋本 渉

  第67回日本生化学会近畿支部例会, May 2021, Last author, Corresponding author

  
• 動物宿主多糖由来不飽和ウロン酸を代謝する腸内優占菌 酵素の構造と機能

  髙瀬 隆一; 幸田 有希渚; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  第21回関西グライコサイエンスフォーラム, May 2021, Last author, Corresponding author

  
• Novel hyaluronate lyase involved in pathogenicity of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis

  Van An Nguyen; Kohei Ogura; Miki Matsue; Norihiko Takemoto; Wataru Hashimoto; Shigefumi Okamoto; Hiroshi Ichimura

  第94回日本細菌学会総会, Mar. 2021

  
• ヒト腸内優占Bacteroides属細菌による動物宿主グリコサミノグリカン由来不飽和ウロン酸の代謝

  高瀬 隆一; 幸田 有希渚; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会2021年度大会, Mar. 2021, Last author, Corresponding author

  
• 大豆発芽時の植物－微生物間生存競争における種子からの抗菌性酢酸の生成

  長瀬 鮎美; 杉浦 春香; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会2021年度大会, Mar. 2021, Last author, Corresponding author

  
• ブドウ果皮共生菌によるワインの自然発酵促進

  渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会2021年度大会, Mar. 2021, Last author, Corresponding author

  
• 走化性発現に関わる細菌由来ペクチン結合タンパク質のドメインダイナミクス

  穴水 康太郎; 髙瀬 隆一; 日尾 守; 渡辺 大輔; 三上 文三; 橋本 渉

  日本農芸化学会2021年度大会, Mar. 2021, Last author, Corresponding author

  
• ヒアルロン酸サプリメントに応答するヒト口腔内細菌叢の動態と病原性優占菌の新規な遺伝子クラスター

  藪内 駿; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第514回講演会, Feb. 2021, Last author, Corresponding author

  
• ヒト腸内細菌叢による海藻多糖アルギン酸の分解と単離菌のゲノム構造

  宮本 侑季; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第514回講演会, Feb. 2021, Last author, Corresponding author

  
• 食事非依存的環境における腸内細菌叢の動態シミュレーション

  梶川 幹太; 佐藤 賢宏; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第513回講演会, Nov. 2020, Last author, Corresponding author

  
• プロバイオティクス性乳酸菌由来不飽和ウロン酸代謝の初発酵素KduIのX線結晶構造解析

  山本 雄大; 髙瀬 隆一; 岩瀬 久夢; 渡辺 大輔; 三上 文三; 橋本 渉

  日本応用糖質科学会第46回近畿支部会, Nov. 2020, Last author, Corresponding author

  
• 走化性発現に関わる細菌由来ペクチン認識タンパク質の立体構造

  穴水 康太郎; 髙瀬 隆一; 日尾 守; 渡辺 大輔; 三上 文三; 橋本 渉

  第93回日本生化学会大会, Sep. 2020, Last author, Corresponding author

  
• 動物宿主由来多糖を資化する腸内優占菌の膜小胞形成

  幸田 有希渚; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 野村 暢彦; 橋本 渉

  第93回日本生化学会大会, Sep. 2020, Last author, Corresponding author

  
• ブドウ果皮に由来する酵母様真菌Aureobasidium pullulans の炭素代謝特性

  渡辺 大輔; 橋本 渉

  第53回酵母遺伝学フォーラム研究報告会, Sep. 2020, Last author, Corresponding author

  
• 海洋由来酵母による褐藻類主要成分マンニトールからの油脂生産

  中田 翔太; 日尾 守; 髙瀬 隆一; 河井 重幸; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会2020年度大会, Mar. 2020

  
• 生大豆が納豆菌に応答して抗菌物質を生産・分泌する

  長瀬 鮎美; 杉浦 春香; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会2020年度大会, Mar. 2020

  
• アルコール発酵に適した酵母とは：醸造用酵母から得られる学び

  渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会2020年度大会, Mar. 2020

  
• ブドウ果皮常在酵母の同定とワイン醸造における役割

  渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会2020年度大会, Mar. 2020

  
• 宿主細胞外多糖ヒアルロン酸の分解によるヒト口腔内常在細菌叢の形成

  藪内 駿; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第512回講演会, Feb. 2020

  
• 子宮内無菌仮説の例外としてのB群連鎖球菌による宿主細胞外多糖の資化

  佐藤 賢宏; 老木 紗予子; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第512回講演会, Feb. 2020

  
• プロバイオティクス性Bacteroides属細菌による次世代発酵乳

  山本 雄大; 佐藤 賢宏; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第511回講演会, Dec. 2019

  
• 海洋微生物コミュニティによる褐藻類の利用

  中田 翔太; 日尾 守; 髙瀬 隆一; 河井 重幸; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西・中部支部2019年度合同大会（第510回記念講演会）, Sep. 2019

  
• 動物細胞外粘性物質を窒素源として利用する腸内優占菌とそのプロバイオティクスへの応用

  梶川 幹太; 佐藤 賢宏; 髙瀬 隆一; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西・中部支部2019年度合同大会（第510回記念講演会）, Sep. 2019

  
• フソバクテリアによる宿主動物由来細胞外グリコサミノグリカンの認識

  老木 紗予子; 藪内 駿; 三上 文三; 高瀬 隆一; 橋本 渉

  第92回日本生化学会大会, Sep. 2019

  
• Uncovering the Crucial Property of 4-Deoxy-L-erythro-5-hexoseulose Uronate for the Utilization of Alginate, a Promising Marine Biomass

  Shigeyuki Kawai; Shota Nakata; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  the 29th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology, Aug. 2019

  
• 大豆上で納豆菌の細胞極に生じる巨大な洞穴の発見とその形成に関わる遺伝子の同定

  長瀬 鮎美; 杉浦 春香; 南部 優子; 髙瀬 隆一; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第509回講演会, Jul. 2019

  
• 腸内細菌叢による食品添加物多糖の分解と分解菌の性状

  宮本 侑季; 髙瀬 隆一; 橋本 渉

  日本生化学会66回近畿支部例会, May 2019

  
• 褐藻類多糖アルギン酸を資化する海洋微生物のエコシステム

  日尾 守; 中田 翔太; 髙瀬 隆一; 橋本 渉

  第20回関西グライコサイエンスフォーラム, May 2019

  
• 細菌由来金属輸送EfeUOB系構成アルギン酸結合タンパク質のレアメタル結合性

  奥村 憲史; 三上 文三; 村田 幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2019年度大会, Mar. 2019

  
• 次世代プロバイオティクスBacteroides属細菌による動物宿主由来粘液物質の資化と腸内優占性

  佐藤 賢宏; 久門 知也; 梶川 幹太; 村田 幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2019年度大会, Mar. 2019

  
• 代謝改変酵母における転写コリプレッサーTup1-Cyc8とアルギン酸由来モノウロン酸DEHの代謝

  松岡 史也; 柏原 貴幸; 中田 翔太; 村田 幸作; 橋本 渉; 河井 重幸

  日本農芸化学会2019年度大会, Mar. 2019

  
• SDGsにおける微生物の貢献〜エネルギー・環境保全対策を中心に〜

  橋本 渉; 河井 重幸; 村田 幸作

  日本農芸化学会2019年度大会, Mar. 2019, Invited

  
• 腸内日和見菌Clostridium perfringensにおける網羅的な遺伝子発現解析と病原因子ヒアルロン酸分解酵素の分子同定

  久門 知也; 老木 紗予子; 村田 幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第507回講演会, Feb. 2019

  
• Sphingomonas属細菌A1株の多糖を介した海藻への走化性と藻体からのバイオエタノール生産

  日尾 守; 小西 英仁; 奥村 憲史; 村田 幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第507回講演会, Feb. 2019

  
• 代謝改変出芽酵母によるアルギン酸由来モノウロン酸DEHの代謝

  松岡 史也; 柏原 貴幸; 中田 翔太; 村田 幸作; 橋本 渉; 河井 重幸

  第6回リン化合物討論会, Dec. 2018

  
• 褐藻主要炭素源アルギン酸のモノマー化戦略

  中田 翔太; 平山 誠; 村田 幸作; 橋本 渉; 河井 重幸

  日本農芸化学会関西支部第506回講演会, Dec. 2018

  
• Sphingomonas属細菌A1株由来アルギン酸結合タンパク質：EFハンド様モチーフに結合するカルシウムが構造を安定化する

  奥村 憲史; 丸山 如江; 三上 文三; 村田 幸作; 橋本 渉

  第91回日本生化学会大会, Sep. 2018, Peer-reviewed

  
• ヒト細胞外マトリックス由来断片化ヒアルロン酸を取り込む連鎖球菌ホスホトランスフェラーゼ系

  老木 紗予子; 村田 幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部大会（第505回講演会）, Sep. 2018

  
• 窒素固定細菌Azotobacter vinelandiiによる「廃グリセロール」からの有用ポリマー生産

  吉田 暢広; 菅原 良実; 南部 優子; 村田 幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部大会（第505回講演会）, Sep. 2018

  
• 多糖を取り込む細菌ABCトランスポーター

  丸山 如江; 村田 幸作; 橋本 渉

  蛋白研セミナー＆ SPring-8 先端利用技術ワークショップ「第2回 SPring-8 における蛋白質構造生物学研究の現状と将来」, Aug. 2018, Invited

  
• グリコサミノグリカンの輸送に関わる細菌タンパク質は二種類の基質結合型closed構造をとる

  老木紗予子; 佐藤賢宏; 蒲地玲子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2018年度大会, Mar. 2018

  
• エキソ型アルギン酸リアーゼによる多糖アルギン酸の分解物DEHはアミノ基と非酵素的に反応する

  中田翔太; 松岡史也; 柏原貴幸; 村田幸作; 橋本 渉; 河井重幸

  日本農芸化学会2018年度大会, Mar. 2018

  
• 発芽能のある大豆は納豆菌の増殖を抑制する

  杉浦春香; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2018年度大会, Mar. 2018

  
• ヘパリンの分解と代謝に関わる乳酸菌酵素系の構造・機能解析

  岩瀬久夢; 山田章文; 河合桂吾; 老木 紗予子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第502回講演会, Feb. 2018

  
• 代謝改変酵母によるアルギン酸由来モノウロン酸DEHの代謝の機構と転写コリプレッサーTup1-Cyc8との関連

  松岡史也; 柏原貴幸; 中田翔太; 村田幸作; 橋本 渉; 河井重幸

  日本農芸化学会関西支部第502回講演会, Feb. 2018

  
• 酸性多糖の輸送に関わる基質結合タンパク質とABCトランスポーターとの相互作用様式

  金子あい; 老木紗予子; 丸山如江; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉

  2017年度生命科学系学会合同年次大会（第90回日本生化学会大会）, Dec. 2017

  
• ヘテロなフラジェリンから構成されるSphingomonas属細菌A1株のべん毛形成と多糖ペクチン資化・走化性発現

  小西英仁; 小林将大; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第501回講演会, Dec. 2017

  
• 日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部2017年度合同大阪大会

  奥村憲史; Kanate Temtrirath; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部2017年度合同大阪大会, Sep. 2017

  
• 大豆と納豆菌との相互作用：納豆菌の大豆発芽能に対する感受性と大豆細胞壁多糖の取り込み

  杉浦春香; 老木紗予子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部2017年度合同大阪大会, Sep. 2017

  
• Sphingomonas属細菌A1株の多糖ペクチン走化性に関わる遺伝子解析

  小西英仁; 小林将大; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部2017年度合同大阪大会, Sep. 2017

  
• ヒト分泌物であるヒアルロン酸の取り込みに関わる腸内細菌の新規なホスホトランスフェラーゼ系

  老木紗予子; 中道優介; 村田幸作; 橋本 渉

  日本応用糖質科学会平成29年度大会（第66回）, Sep. 2017

  
• グリコサミノグリカンの輸送に関わる細菌由来基質結合タンパク質のドメインダイナミクス

  老木紗予子; 蒲地玲子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2017年度大会, Mar. 2017

  
• 細菌による多糖輸送：アルギン酸取り込み細菌と分泌細菌の特異な細胞表層構造

  橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2017年度大会, Mar. 2017

  
• 「大気窒素」を活用する次世代型発酵：窒素固定細菌による「廃グリセロール」の再資源化

  吉田暢広; 菅原良実; 南部優子; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2017年度大会, Mar. 2017

  
• 腸内細菌における宿主多糖グリコサミノグリカン分解菌の多様性

  河合桂吾; 蒲地玲子; 老木紗予子; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第498回講演会, Feb. 2017

  
• 病原性連鎖桿菌による動物細胞外マトリックス（グリコサミノグリカン）の分解

  老木紗予子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉

  第89回日本生化学会2016年度大会, Sep. 2016

  
• 腸内細菌による宿主多糖グリコサミノグリカンの分解に関するメタゲノム解析

  中道優介; 河合桂吾; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2016年度関西支部大会, Sep. 2016

  
• 大豆細胞壁多糖の輸送に関わるBacillus subtilis由来タンパク質YesOの結晶構造

  杉浦春香; 老木紗予子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2016年度関西支部大会, Sep. 2016

  
• 酸性多糖の代謝に関わる還元酵素の補酵素要求性に関わる構造要因

  高瀬隆一; 丸山如江; 老木紗予子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2016年度大会, Mar. 2016

  
• 構造情報に基づく部位特異的変異及びランダム変異導入に依るヘモグロビンA1cダイレクトオキシダーゼの造成

  小川徳之; 木村豪秀; 益成利幸; 天野芙美; 片山有基; 永井 豪; 市村通朗; 丸山如江; 伊藤貴文; 橋本 渉; 村田幸作; 相阪和夫

  日本農芸化学会2016年度大会, Mar. 2016

  
• 動物細胞外マトリックス（グリコサミノグリカン）を基質とする病原性細菌ABCトランスポーター

  老木紗予子; 丸山如江; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2016年度大会, Mar. 2016

  
• 細菌ABCトランスポーターのATP加水分解は、closed型の基質結合タンパク質との相互作用によって惹起される

  上西加純; 金子あい; 丸山如江; 水野伸宏; 馬場清貴; 熊坂 崇; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第493回講演会, Feb. 2016

  
• グリコサミノグリカン輸送に関わる連鎖桿菌由来基質結合タンパク質のX線結晶構造解析

  老木紗予子; 丸山如江; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2015年度中部・関西支部合同大会, Sep. 2015

  
• 窒素固定細菌の膜小胞による多糖輸送

  橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2015年度大会, Mar. 2015, Invited

  
• 基質結合タンパク質依存的 ABCトランスポーターによる多糖認識

  丸山如江; 立石 彬; 金子あい; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2015年度大会, Mar. 2015

  
• 連鎖球菌による哺乳類細胞外マトリクス（グリコサミノグリカン）の分解：不飽和グルクロニルヒドロラーゼの反応機構

  中道優介; 老木紗予子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2015年度大会, Mar. 2015

  
• Sphingomonas属細菌A1株は高分子多糖アルギン酸に走化性を示す

  小林将大; 丸山如江; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会関西支部第488回講演会, Jan. 2015

  
• Functional analysis of ABC transporter involved in import of alginate based on its crystal structure

  A. Kaneko; Y. Maruyama; B. Mikami; K. Murata; W. Hashimoto

  日本生化学会2014年度大会, Oct. 2014

  
• Streptobacillus genetic cluster acting on host extracellular matrices, glycosaminoglycans

  S. Oiki; Y. Nakamichi; Y. Maruyama; K. Murata; W. Hashimoto

  日本生化学会2014年度大会, Oct. 2014

  
• Streptococcal isomerase involved in metabolism of host extracellular matrices, glycosaminoglycans

  Y. Maruyama; S. Oiki; B. Mikami; K. Murata; W. Hashimoto

  日本生化学会2014年度大会, Oct. 2014

  
• ヒト腸内細菌における褐藻類多糖アルギン酸の資化性

  木下舞花; 村田 幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2014年度関西支部大会, Sep. 2014

  
• 細菌による側毛型フラジェリンを構成因子とする新規な極単べん毛の形成機構

  小林将大; 丸山如江; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2014年度関西支部大会, Sep. 2014

  
• A single polar flagellum formation by lateral and non-lateral flagellar gene sets in Sphingomonas sp. strain A1

  Y. Maruyama; M. Kobayashi; K. Murata; W. Hashimoto

  日本農芸化学会2014年度大会, Mar. 2014

  
• Streptococcal metabolic mechanism of host extracellular matrices, glycosaminoglycans

  橋本 渉; 丸山如江; 高瀬隆一; 中道優介; 三上文三; 村田幸作

  日本農芸化学会2014年度大会, Mar. 2014

  
• Structural and functional analysis of bacterial cell-surface protein involved in alginate import

  K. Temtrirath; K. Murata; W. Hashimoto

  日本農芸化学会関西支部第482回講演会, Dec. 2013

  
• 2P-004 A polar flagellum formation by lateral flagellin in Sphingomonas sp. A1

  Kobayashi Masahiro; Maruyama Yukie; Hashimoto Wataru; Murata Kousaku

  日本生物工学会2013年度大会, Sep. 2013

  
• 細菌のアルギン酸代謝に関わる新規なNADH要求性α-ケト酸還元酵素

  高瀬隆一; 河井重幸; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2013年度関西・中四国・西日本支部合同大会, Sep. 2013

  
• 細菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼのヘパリン二糖認識機構

  中道優介; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉

  日本農芸化学会2013年度関西・中四国・西日本支部合同大会, Sep. 2013

  
• アルギン酸資化性細菌Sphingomonas sp. A1の転写因子AlgOの作用機構

  林 智恵; 丸山如江; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2013年度関西・中四国・西日本支部合同大会, Sep. 2013

  
• Functional analysis of ABC transporter involved in import of acidic polysaccharide alginate

  金子あい; 丸山如江; 橋本 渉; 村田幸作

  日本生化学会2013年度大会, Sep. 2013

  
• 体腔依存多糖取り込みABCトランスポーターの構造機能相関とその応用

  橋本 渉; 丸山如江; 三上文三; 村田幸作

  日本農芸化学会2013年度大会, 27 Mar. 2013

  
• ヘパリン分解細菌由来ヘパラン硫酸リアーゼHepCの結晶構造と活性部位

  橋本 渉; 丸山如江; 中道優介; 村田幸作

  日本農芸化学会2013年度大会, 25 Mar. 2013

  
• 細菌由来アルギン酸ABCトランスポーターの立体構造と基質輸送

  丸山如江; 金子あい; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2013年度大会, 25 Mar. 2013

  
• 酸性多糖の分解に関わる不飽和グルクロニルヒドロラーゼのクラスター分析

  中道優介; 丸山如江; 橋本 渉; 村田幸作

  日本生化学会2012年度大会, 16 Dec. 2012

  
• ファミリーGH-73ペプチドグリカン分解酵素の活性クレフト構造

  丸山如江; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本生化学会2012年度大会, 16 Dec. 2012

  
• 「超チャネル」形成細菌Sphingomonas sp. A1のアルギン酸依存的遺伝子発現機構

  林 智恵; 丸山如江; 橋本 渉; 村田幸作

  日本生物工学会2012年度大会, 16 Oct. 2012

  
• 細菌ABCトランスポーターと連携する基質結合タンパク質によるヘテロ多糖アルギン酸の認識機構

  西谷 悠; 丸山如江; 伊藤貴文; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2012年度関西支部大会, 29 Sep. 2012

  
• グリコサミノグリカン分解に関わる細菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼの基質認識機構

  中道優介; 丸山如江; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2012年度大会, 25 Mar. 2012

  
• ヒト関連細菌由来グリコサミノグリカン分解遺伝子クラスターにおけるヘパラン硫酸リアーゼ

  橋本 渉; 丸山如江; 中道優介; 三上文三; 村田幸作

  日本農芸化学会2012年度大会, 25 Mar. 2012

  
• 酸性多糖の代謝に関わる細菌由来α-ケト酸還元酵素のX線結晶構造解析

  高瀬隆一; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2012年度大会, 25 Mar. 2012

  
• 多糖アルギン酸の取り込みに関わる細菌由来ABCトランスポーターのX線結晶構造解析

  丸山如江; 伊藤貴文; 西谷 悠; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2012年度大会, 24 Mar. 2012

  
• 4Ip04 Construction of NAD(H)-dependent ethanol producing bacterium, Sphingomonas sp. A1.

  Takase Ryuichi; Hashimoto Wataru; Kawai Shigeyuki; Murata Kousaku

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2012

  
• 連鎖球菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼのヘパリン二糖認識機構

  中道優介; 丸山如江; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会 2011年度 関西・中部支部合同大会, 02 Oct. 2011

  
• ポリウロン酸の代謝に関わる細菌由来α−ケト酸還元酵素の構造機能相関

  高瀬隆一; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会 2011年度 関西・中部支部合同大会, 02 Oct. 2011

  
• 多糖アルギン酸を取り込む細菌由来ABCトランスポーターと基質結合タンパク質の相互作用に関する構造機能解析

  西谷 悠; 丸山如江; 伊藤貴文; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会 2011年度 関西・中部支部合同大会, 02 Oct. 2011

  
• アルギン酸で誘導発現するSphingomoans属細菌由来鉄輸送オペロンタンパク質の構造と機能

  橋本 渉; 丸山如江; 三上文三; 村田幸作

  日本農芸化学会 20011年度 関西・中部支部合同大会, 02 Oct. 2011

  
• M75メタロペプチダーゼモチーフをもつSphingomonas属細菌由来細胞表層アルギン酸結合タンパク質のX線結晶構造解析

  橋本 渉; 丸山如江; 三上文三; 村田幸作

  日本生化学会2011年度大会, 22 Sep. 2011

  
• 連鎖球菌におけるグリコサミノグリカン分解・輸送・代謝に関わる遺伝子クラスター

  橋本渉; 丸山如江; 中道優介; 村田幸作

  日本農芸化学会大会講演要旨集, 05 Mar. 2011

  
• 連鎖球菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼのグリコサミノグリカン二糖に対する硫酸基認識

  中道優介; 丸山如江; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2011年度大会, Mar. 2011

  
• 体腔形成細菌の分子育種による海洋バイオマスアルギン酸からのエタノール生産

  竹田浩之; 米山史紀; 河井重幸; 橋本 渉; 佐藤信行; 村田幸作

  日本農芸化学会2011年度大会, Mar. 2011, Peer-reviewed

  
• アルギン酸代謝における細菌由来α‐ケト酸還元酵素の生理機能と活性中心構造

  落合秋人; 高瀬隆一; 橋本渉; 村田幸作

  日本農芸化学会大会講演要旨集, 05 Mar. 2010

  
• 窒素固定細菌Azotobacter vinelandiiのシデロフォア生合成遺伝子クラスター

  米山史紀; 山本真由美; 橋本渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2010年度大会, 2010

  
• 細菌由来メタロペプチダーゼファミリーM16酵素のX線結晶構造

  丸山如江; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2010年度大会, 2010

  
• アルギン酸輸送ABCトランスポーターの機能解析と予備的X線結晶構造解析

  伊藤貴文; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2010年度大会, 2010

  
• 細菌由来推定リポタンパク質の脂質結合性評価とその予備的X線結晶構造解析

  橋本 渉; 落合秋人; 何 金山; 村田幸作

  日本農芸化学会2010年度大会, 2010

  
• 硫酸化グリコサミノグリカンに作用する連鎖球菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼの基質認識機構

  中道優介; 丸山如江; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2010年度関西支部大会, 2010

  
• Sphingomonas属細菌A1株由来ペプチドグリカン分解酵素の立体構造に基づく触媒機構解析析

  丸山如江; 落合秋人; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2010年度関西支部大会, 2010

  
• Sphingomoans属細菌A1株の細胞表層に局在するアルギン酸結合タンパク質の遺伝子発現とX線結晶構造解析

  橋本 渉; 丸山如江; 落合秋人; 三上文三; 村田幸作

  日本農芸化学会2010年度関西支部大会, 2010

  
• Structural Determinants Responsible for Substrate Recognition and Mode of Action in Family 11 Polysaccharide Lyases

  Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Apr. 2009

  
• 細菌によるアルギン酸からのバイオ燃料生産：エタノール生産菌の分子育種

  竹田浩之; 落合秋人; 橋本渉; 村田幸作

  日本農芸化学会大会講演要旨集, 05 Mar. 2009

  
• ファミリーPL-14多糖リアーゼvAL-1(S)の構造・機能相関

  小倉康平; 山崎正幸; 橋爪貴也; 山田 隆; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2009年度大会, 2009

  
• ファミリーGH73ペプチドグリカン分解酵素のX線結晶構造

  橋本 渉; 落合秋人; 門間敬子; 丸山如江; 伊藤貴文; 三上文三; 村田幸作

  日本農芸化学会2009年度大会, 2009

  
• 褐藻アルギン酸の糖化に関わる細菌由来エキソ型リアーゼの構造・機能相関

  落合秋人; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2009年度大会, 2009

  
• アルギン酸代謝に関わる NADPH 依存α- ケト酸還元酵素の構造機能相関

  落合秋人; 高瀬隆一; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本ビタミン学会第61回大会, 2009

  
• 2Da14 Alginate lyase vAL-1(S) shows different modes of action (endo/exotype) in neutral and alkaline pH

  OGURA Kohei; YAMASAKI Masayuki; HASHIDUME Takaya; YAMADA Takashi; MIKAMI Bunzo; HASHIMOTO Wataru; MURATA Kousaku

  日本生物工学会2009年度大会, 2009

  
• 多糖の輸送・分解に関わる細菌由来超分子の構造と機能

  橋本 渉; 伊藤貴文; 三上文三; 村田幸作

  日本生化学会2009年度大会, 2009

  
• Expression and function analysis of Sphingomonas alginate ABC transporter

  伊藤貴文; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本生化学会2009年度大会, 2009

  
• A novel streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase specific for sulfated glycosaminoglycans

  中道優介; 丸山如江; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本生化学会2009年度大会, 2009

  
• Coenzyme-binding mode in α-keto acid reductase responsible for alginate metabolism

  高瀬隆一; 落合秋人; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本生化学会2009年度大会, 2009

  
• Structural determinants responsible for mode of action in polysaccharide lyases for biofuel production

  落合秋人; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本生化学会2009年度大会, 2009

  
• 細菌におけるATP加水分解エネルギーによる高分子多糖の取り込み

  伊藤貴文; 西谷 悠; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  リン化合物討論会, 2009

  
• 細菌によるアルギン酸からのエタノール生産：アルギン酸糖化酵素エキソ型リアーゼのX線結晶構造,

  落合秋人; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会関西支部第454回講演会, 2008

  
• サルモネラ菌由来マンノースイソメラーゼYihSの機能と立体構造

  伊藤貴文; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会関西支部第454回講演会, 2008

  
• 2Gp09 Molecular identification of reductase involved in detoxifying alpha-keto acid derived from alginate mononsaccharide

  OCHIAI Akihito; TAAKSE Ryuichi; HASHIMOTO Wataru; MURATA Kousaku

  日本生物工学会2008年度大会, 2008

  
• クロレラウイルスCVK-1由来ファミリー14多糖リアーゼのX線結晶構造

  小倉康平; 山崎正幸; 橋爪貴也; 山田 隆; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作

  日本農芸化学会2008年度関西支部大会, 2008

  
• 細菌によるアルギン酸からのエタノール生産：アルギン酸糖化産物（α‐ケト酸）還元酵素の分子同定

  高瀬隆一; 落合秋人; 橋本渉; 村田幸作

  日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集, 2008

  
• 新規グリコサミノグリカン分解酵素のX線結晶構造解析

  伊藤貴文; 森茂太郎; 赤尾沙絵; 橋本渉; 村田幸作; 三上文三

  日本農芸化学会大会講演要旨集, 05 Mar. 2004

  
• ポリリン酸はATPに代わり得るか? Micrococcus flavusの新規NADキナーゼについて

  河井重幸; 森茂太郎; 橋本渉; 村田幸作

  ビタミン, 25 Apr. 2000

  

Presentations

• ペクチンを標的とする細菌の分子機構

  橋本 渉

  第15回多糖の未来フォーラム, 12 Nov. 2021, Invited

  
• 常在細菌による動物宿主由来多糖グリコサミノグリカンの取り込み機構

  橋本 渉

  第1回トランスポーター研究会関西部会, 30 Oct. 2021, Invited

  
• 細胞外マトリックスを標的とするレンサ球菌の分子機構とその病原性

  小倉 康平; 橋本 渉

  第94回日本細菌学会総会, 24 Mar. 2021, Invited

  
• 宿主粘液物質を標的とするヒト常在細菌の分子機構とその多様性

  橋本 渉

  日本DNA多型学会第29回学術集会, 26 Nov. 2020, Invited

  
• 動物細胞外多糖を標的とする常在菌の分子機構

  橋本 渉

  日本応用糖質科学会第45回近畿支部会, 08 Nov. 2019, Invited

  
• 食品多糖類に作用する微生物の発酵力とその活用技術

  橋本 渉

  日本調理食品研究会（第25回）年次大会, 04 Jun. 2019, Invited

  
• 細菌細胞膜のダイナミクスと有用物質生産

  橋本 渉

  平成28年度3研究会合同講演会（発酵と代謝研究会、アルコール・バイオマス研究会、新資源生物変換研究会）, 27 Mar. 2017, Invited

  
• 細菌由来多糖分解酵素の構造と機能

  第11回関西グライコサイエンスフォーラム, 2010, 関西グライコサイエンスフォーラム, Invited

  
• 細菌における多糖の輸送と分解—構造・機能・移植—

  日本応用糖質科学会第28回近畿支部会, 2008, 日本応用糖質科学会, Invited

  

Books and Other Publications

• レーズンと水からワインができる仕組み

  日尾 守; 村田 憲亮; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 小倉 康平; 橋本 渉, Joint work

  日本農芸化学会2024年度大会 一般講演トピックス集, Mar. 2024

  
• 植物関連細菌を制御する大豆由来抗菌物質

  長瀬 鮎美; 加古 有宜子; 渡辺 大輔; 橋本 渉

  大豆たん白質研究, Jun. 2023

  
• 微生物による未利用ブルーカーボン（褐藻類）の高度利用

  橋本 渉

  一般財団法人東洋水産財団 2021年度奨励研究報告書, Dec. 2022

  
• 納豆菌による新しい発酵豆の創製

  橋本 渉

  公益財団法人タカノ農芸化学研究助成財団 2021年度助成研究報告書, Oct. 2022

  
• 遺伝子・細胞から見た応用微生物学

  河井重幸; 橋本 渉; 村田幸作, Joint work, 第3章 遺伝子から見た微生物の進化と細胞構造

  朝倉書店, Apr. 2020

  
• 遺伝子・細胞から見た応用微生物学

  麻生祐司; 橋本 渉; 村田幸作, Joint work, 第9章 微生物の分離と増殖

  朝倉書店, Apr. 2020

  
• 海洋由来酵母による褐藻類主要成分マンニトールからの油脂生産

  中田翔太; 日尾 守; 髙瀬隆一; 河井重幸; 渡辺大輔; 橋本 渉, Joint work

  日本農芸化学会2020年度大会 一般講演トピックス集, Mar. 2020

  
• Crystal structure of bacterial substrate-binding protein involved in chemotaxis toward polysaccharide pectin

  Ryuichi Takase; Kotaro Anamizu; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto

  SPring-8 User Experiment Report, 2020A2577, 2020

  
• ヒト細胞外マトリックスを標的とするプロバイオティクスの分子機構

  橋本 渉, Single work

  ヤクルト・バイオサイエンス研究財団, Oct. 2019

  
• 納豆菌による大豆成分の認識

  杉浦春香; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉, Joint work

  大豆たん白質研究, Jun. 2019

  
• 細菌由来金属輸送EfeUOB系構成アルギン酸結合タンパク質のレアメタル結合性

  奥村憲史; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉, Joint work

  日本農芸化学会2019年度大会 一般講演トピックス集, Mar. 2019, Not refereed

  
• 次世代プロバイオティクスBacteroides属細菌による動物宿主由来粘液物質の資化と腸内優占性

  佐藤賢宏; 久門知也; 梶川幹太; 村田幸作; 橋本 渉, Joint work

  日本農芸化学会2019年度大会 一般講演トピックス集, Mar. 2019, Not refereed

  
• Crystal structure of Lactobacillus rhamnosus 5-keto-4-deoxyuronate isomerase KduI involved in metabolism of host glycosaminoglycans

  Yuuta Yamamoto; Hisamu Iwase; Ryuichi Takase; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto, Joint work

  SPring-8 User Experiment Report, 2019B2557, 2019

  
• 多糖リアーゼ

  橋本 渉, Contributor

  日本生化学会, Jun. 2018, Not refereed

  
• Studies on novel enzymes for degradation of fragmented glycosaminoglycans

  HASHIMOTO Wataru, Single work

  Glycoscience 2013-2017 In Commemoration of the 25th Anniversary of Mizutani Foundation for Glycoscience, Nov. 2017, Not refereed

  
• 食と微生物の事典

  橋本 渉, Contributor, 微生物がつくる多様な増粘安定剤

  朝倉書店, Jul. 2017, Not refereed

  
• 酸性多糖の代謝に関わる還元酵素の立体構造に基づく補酵素特異性変換とそのバイオ燃料生産への応用

  橋本 渉, Single work

  「野田産研研究助成」研究成果報告会概要集（公益財団法人野田産業科学研究所2015年度研究助成）, May 2017, Not refereed

  
• Crystal structure of alginate/metal-binding protein Algp7 from Sphingomonas strain sp. A1 at higher resolution

  Kenji Okumura; Sayoko Oiki; Hisamu Iwase; Masahiro Sato; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto, Joint work

  SPring-8 User Experiment Report, 2017B2592, 2017, Not refereed

  
• 宿主細胞外マトリックスを介したプロバイオティクスとヒト腸管との相互作用

  橋本 渉, Single work

  ダノン学術研究助成金 研究報告集 平成27年度（2015年度）, Oct. 2016, Not refereed

  
• Conformational change of bacterial solute-binding protein involved in import of glycosaminoglycans

  Sayoko Oiki; Reiko Kamochi; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto, Joint work

  SPring-8 User Experiment Report, 2016B2574, 2016, Not refereed

  
• 予期せぬ国際交流

  橋本 渉, Single work

  京大広報, Dec. 2015, Not refereed

  
• 基質結合タンパク質依存的ABCトランスポーターによる多糖認識

  丸山如江; 立石 彬; 金子あい; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作, Joint work

  日本農芸化学会2015年度大会トピックス集, Mar. 2015, Not refereed

  
• 窒素固定細菌によるグリセリンからのバイオポリマー発酵生産

  橋本 渉, Single work

  日本石鹸洗剤工業会 平成26年度グリセリン新規用途開発研究助成金 研究成果報告書, 2015, Not refereed

  
• 断片化グリコサミノグリカンの分解に関わる新規酵素の構造機能相関とその医薬への応用

  橋本 渉, Single work

  公益財団法人水谷糖質科学振興財団 第21回研究助成 研究成果報告書, 2015, Not refereed

  
• Crystal structure of Streptobacillus solute-binding protein involved in import of glycosaminoglycans

  Sayoko Oiki; Kasumi Uenishi; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto

  SPring-8 User Experiment Report, 2015B2058, 2015, Not refereed

  
• Crystal structure of bacterial alginate ABC transporter in complex with periplasmic binding protein with longer oligoalginate

  Ai Kaneko; Yukie Maruyama; Sayoko Oiki; Kasumi Uenishi; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto, Joint work

  SPring-8 User Experiment Report, 2014B1137, 2014, Not refereed

  
• X-ray crystallographic analysis of bacterial alginate ABC transporter through Humid Air and Glue-coating method

  Ai Kaneko; Yukie Maruyama; Sayoko Oiki; Yusuke Nakamichi; Ryuichi Takase; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto, Joint work

  SPring-8 User Experiment Report, 2014A1148, 2014, Not refereed

  
• Crystal structure of heparan sulfate lyase HepC from Pedobacter heparinus

  Yukie Maruyama; Yusuke Nakamichi; Ai Kaneko; Ryuichi Takase; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto, Joint work

  SPring-8 User Experiment Report, 2013A1106, 2013, Not refereed

  
• Structural determinants in bacterial unsaturated glucuronyl hydrolase for degradation of heparin disaccharides

  Yusuke Nakamichi; Ai Kaneko; Kanate Temtrirath; Ryuichi Takase; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto, Joint work

  SPring-8 User Experiment Report, 2013B1260, 2013, Not refereed

  
• Crystal structure of Sphingomonas sp. strain A1 alginate-binding protein Algp7 in complex with metal ion

  Wataru Hashimoto; Yukie Maruyama; Kanate Temtrirath; Yusuke Nakamichi; Ryuichi Takase; Bunzo Mikami; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2012B1265, 2012, Not refereed

  
• Crystal structure of peptidoglycan hydrolase FlgJ mutant from Sphingomonas sp. strain A1

  Yukie Maruyama; Yusuke Nakamichi; Ryuichi Takase; Kanate Temtrirath; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2012A1317, 2012, Not refereed

  
• Binding mode to heteropolysaccharide alginate by Sphingomonas sp. A1 periplasmic protein associated with ABC transporter

  Yu Nishitani; Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Yusuke Nakamichi; Ryuichi Takase; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2011B1108, 2011, Not refereed

  
• Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of ATP-binding cassette transporter from Sphingomonas sp. strain A1

  Yu Nishitani; Yukie Maruyama; Yusuke Nakamichi; Ryuichi Takase; Kazuto Ohashi; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2011A1186, 2011, Not refereed

  
• Crystal structure of streptococcal α-keto acid reductase involved in metabolism of glycosaminoglycans

  Wataru Hashimoto; Yukie Maruyama; Ryuichi Takase; Yusuke Nakamichi; Bunzo Mikami; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2011B2055, 2011, Not refereed

  
• Loop movement over the active cleft in streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase

  Yusuke Nakamichi; Yukie Maruyama; Ryuichi Takase; Yu Nishitani; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2010A1279, 2010, Not refereed

  
• The flexible catalytic residues prerequisite for activity expression in bacterial glycosaminoglycan-degrading enzyme

  Yusuke Nakamichi; Yukie Maruyama; Ryuichi Takase; Yu Nishitani; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2010B1149, 2010, Not refereed

  
• Crystal structure of the metallopeptidase family M16 enzyme from Sphingomonas sp. strain A1

  Yukie Maruyama; Asako Chuma; Takafumi Itoh; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2009B1192, 2009, Not refereed

  
• X-ray structural analysis of the metallopeptidase family M16 enzyme

  Yukie Maruyama; Asako Chuma; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Yusuke Nakamichi; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2009A1329, 2009, Not refereed

  
• X-ray crystal structure of Sphingomonas sp. A1 α-keto acid reductase for alginate metabolism

  Ryuichi Takase; Akihito Ochiai; Yusuke Nakamichi; Takafumi Itoh; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2009A1179, 2009, Not refereed

  
• Crystal structure of streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase in complex with sulfated substrate

  Yusuke Nakamichi; Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2009B1201, 2009, Not refereed

  
• Bacterial system for alginate uptake and degradation

  Wataru Hashimoto; Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Kousaku Murata

  In "Alginates: Biology & Applications" Microbiology Monographs 13: (Ed. Bernd Rehm), Springer, pp73-94, 2009, Not refereed

  
• Crystal structure of NADP-bound α-keto acid reductase prerequisite for alginate metabolism in Sphingomonas sp. A1

  Ryuichi Takase; Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2009B1177, 2009, Not refereed

  
• Bacterial proteins in potential cancer therapy

  Magdy Mahfouz; Wataru Hashimoto; Tapas K. Das Gupta; Ananda M. Chakrabarty, Joint work, In “Applied Biotechnology”, (Eds. Sudhir U. Meshram and Gangadhar Bangadhar Shinde)

  I. K. International Publishing House Pvt Ltd, 2009, Not refereed

  
• Unsaturated glycoside hydrolases trigger hydration of vinyl ether groups but not of glycoside bond

  Wataru Hashimoto; Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Kousaku Murata

  Abstract papers of The 5th open workshop “Chemistry of Biological processes created by water and biomolecules”, p201, January 24-25, 2008. Nara prefectural new public hall, Nara, Japan. Supported by the Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Ar, 2008, Not refereed

  
• Crystal structure of alginate-binding protein (AlgQ1) in complex with unsaturated mannuronic acid trisaccharide

  Takafumi Itoh; Kohei Ogura; Yusuke Nakamichi; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2008B1191, 2008, Not refereed

  
• ４章 微生物の細胞構造

  橋本 渉; 村田幸作

  遺伝子から見た応用微生物学. 熊谷英彦、加藤暢夫、村田幸作、阪井康能編, 朝倉出版, pp55-68, 2008, Not refereed

  
• スーパー細菌の創成とダイオキシン分解の高効率化技術

  橋本 渉; 村田幸作

  『土壌・地下水汚染の浄化・修復技術』、ブッカーズ、株式会社エヌ・ティー・エス(NTS), pp137-147, 2008, Not refereed

  
• Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of peptidoglycan hydrolase from Sphingomonas sp. strain A1

  Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2008A1322, 2008, Not refereed

  
• X-ray crystal structure of Sphingomonas sp. A1 peptidoglycan hydrolase categorized to family GH-73

  Wataru Hashimoto; Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Yukie Maruyama; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2008B1112, 2008, Not refereed

  
• Structural insights into the reaction mechanism of coenzyme-independent mannose isomerase

  Takafumi Itoh; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2008A1119, 2008, Not refereed

  
• Crystal structure of exotype rhamnogalacturonan lyase YesX from Bacillus subtilis strain 168: structural factors responsible for mode of action

  Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2007B1268, 2007, Not refereed

  
• X-ray crystallographic study on Sphingomonas sp. A1 cell surface protein associating with alginate-binding flagellin homologue

  Yukie Maruyama; Misato Momma; Takafumi Itoh; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2007B1624, 2007, Not refereed

  
• Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase from Streptococcus agalactiae

  Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2007A1407, 2007, Not refereed

  
• Structural analysis of N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase superfamily

  Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2007A1154, 2007, Not refereed

  
• Structural identification of bacterial yihS-encoded proteins to an aldose-ketose isomerase

  Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2007B1176, 2007, Not refereed

  
• Alginate recognition by cell surface flagellin homologous proteins of Sphingomonas sp. A1

  Yukie Maruyama; Misato Momma; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2007A1330, 2007, Not refereed

  
• Crystal structure of unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase complexed with substrate

  Takafumi Itoh; Akihito Ochiai; Bunzo Mikami; Aiko Tanabe; Kimihiko Mizutani; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2006A1405, 2006, Not refereed

  
• 「小胞状構造体」の形成に関わる細菌細胞膜のダイナミクス

  村田幸作; 橋本 渉

  特定領域研究研究成果報告書 (2000年度〜2004年度科学研究費補助金) 細胞システム解明に向けたゲノム生物学の新展開(略称：ゲノム生物学), p432-433, 2006, Not refereed

  
• Crystal structure of rhamnogalacturonan lyase from Bacillus subtilis strain 168

  Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2006B1214, 2006, Not refereed

  
• Analysis of alginate recognition system on cell surface of Sphingomonas sp. A1

  Yukie Maruyama; Misato Momma; Kohei Ogura; Malle Dominggus; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2006A1150, 2006, Not refereed

  
• Structural analysis of flagellin homologous protein on cell surface of Sphingomonas sp. A1

  Yukie Maruyama; Misato Momma; Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2006B1126, 2006, Not refereed

  
• Crystal structure of unsaturated galacturonyl hydrolase in complex with unsaturated galacturonic acid

  Takafumi Itoh; Kimihiko Mizutani; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2006A1103, 2006, Not refereed

  
• Structural analysis for the substrate specificity of a novel glycosidase, unsaturated galacturonyl hydrolase, responsible for the degradation plant cell walls

  Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Kohei Ogura; Malle Dominggus; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2006B1067, 2006, Not refereed

  
• 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発

  村田幸作; 橋本 渉; 河井重幸

  厚生労働科学研究費補助金、難政治性疾患克服研究事業、「特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究」、平成16年度総括・分担研究報告書:53-57, 2005, Not refereed

  
• X-ray analysis of exotype alginate lyase from Agrobacterium tumefaciens C58

  Akihito Ochiai; Masayuki Yamasaki; Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Aiko Tanabe; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 2005B0351, 2005, Not refereed

  
• Polysaccharide lyase: Crystal structure of Bacillus sp. GL1 xanthan lyase complexed with pyruvate mannose

  Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 14(2004B), pp295, 2005, Not refereed

  
• Polysaccharide lyase: Crystal structure of Bacillus sp. GL1 xanthan lyase complexed with substrate

  Yukie Maruyama; Masayuki Yamasaki; Takafumi Itoh; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 14(2004B), pp173, 2005, Not refereed

  
• Preliminary X-ray study of an alginate lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens C58, a member of polysaccharide lyase family 15

  Akihito Ochiai; Masayuki Yamasaki; Wataru Hashimoto; Bunzo Mikami; Kousaku Murata

  SPring-8 User Experiment Report, 15(2005A), pp298, 2005, Not refereed

  
• 細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明

  村田幸作; 橋本 渉

  文部科学省 科学研究費 特定領域研究[ゲノム]4領域 2003年度報告書:275, 2005, Not refereed

  
• Crystal structure of family PL-7 alginate lyase PA1167 from Pseudomonas aeruginosa

  Masayuki Yamasaki; Satoko Moriwaki; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata; Kimihiko Mizutani; Bunzo Mikami

  SPring-8 user experiment report, 12(2003B), p211, 2004, Not refereed

  
• Insight into the catalytic mechanism of family PL-7 alginate lyase PA1167 from Pseudomonas aeruginosa

  Masayuki Yamasaki; Satoko Moriwaki; Kimihiko Mizutani; Takafumi Itoh; Akira Hirata; You-Na Kang; Mizuho Ban; Wataru Hashimoto; Bunzo Mikami; Kousaku Murata

  SPring-8 user experiment report, 13(2004A), p199, 2004, Not refereed

  
• 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発

  村田幸作; 橋本 渉; 河井重幸

  厚生労働科学研究費補助金 難治性疾患克服研究事業 特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究 平成 15年度 総括・分担研究報告書, 55-59, 2004, Not refereed

  
• 細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明

  村田幸作; 橋本 渉

  文部科学省科学研究費特定領域研究「ゲノム」４領域2003年度合同班会議, B120, 2003, Not refereed

  
• 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発

  村田幸作; 橋本 渉; 河井重幸

  厚生労働科学研究費補助金 特定疾患対策研究事業 特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究 平成14年度 総括・分担研究報告書, 36-41, 2003, Not refereed

  
• Biodegradation of alginate, xanthan, and gellan

  Wataru Hashimoto; Yumiko Mishima; Osamu Miyake; Hirokazu Nankai; Keiko Momma; Kousaku Murata

  In "Biopolymers" volume 9: Polysaccharides I (Ed. A. Steinb�chel), Wiley-VCH, pp175-199, 2002, Not refereed

  
• 細菌『超チャネル』の高次構造と巨大分子輸送機能

  橋本 渉

  平成13年度新世代研究所研究助成成果報告書、pp75-80, 2002, Not refereed

  
• 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発

  橋本 渉; 村田幸作

  厚生科学研究費補助金 特定疾患対策研究事業 特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究 平成13年度 総括・分担研究報告書, 95-103, 2002, Not refereed

  
• Safety assessment of genetically modified rice and potatoes with soybean glycinin

  Keiko Momma; Wataru Hashimoto; Shigeru Utsumi; Kousaku Murata

  In "Testing for genetic manipulation in plants", Molecular Methods of Plant Analysis, vol. 22, pp139-152 (Eds. J. F. Jackson, H. F. Linskens, and R. B. Inman), Springer-Verlag, Berlin Heidelberg, 2002, Not refereed

  
• 細菌細胞表層における体腔の高次空間構造と高分子輸送機構

  村田幸作; 橋本 渉; 門間敬子

  文部省科学研究費補助金 特定領域研究(A)(1). バイオターゲティングのための生体分子デザイン 平成１２年度 研究報告書, 304-309, 2001, Not refereed

  
• 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発

  村田幸作; 橋本 渉

  厚生科学研究費補助金 特定疾患対策研究事業 特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究 平成１２年度 総括・分担研究報告書, 53-55, 2001, Not refereed

  
• 細菌細胞表層における体腔形成機構と体腔の高分子輸送機構

  村田幸作; 門間敬子; 橋本 渉

  文部省科学研究費補助金 特定領域研究(A)(1). バイオターゲティングのための生体分子デザイン 平成１１年度 研究報告書, 324-329, 2000, Not refereed

  
• Polyphosphate kinase, polyphosphate-glucokinase, and polyphosphate-NAD kinase in microorganisms and their applications

  Shigeyuki Kawai; Takako Mukai; Shigetarou Mori; Sachiko Suzuki; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  Res. Adv. Biosci. Bioeng., 1, 19-31, 2000, Not refereed

  
• Special apparatus for assimilation, transport, and depolymerization of alginate in Sphingomonas sp. A1

  Wataru Hashimoto; Keiko Momma; Hye-Jin Yoon; Yumiko Mishima; Osamu Miyake; Shigeyuki Kawai; Bunzo Mikami; Kousaku Murata

  Abstract for Fifth International Symposium on Environmental Biotechnology, p916-919, Kyoto, July 9-13, 2000, Not refereed

  
• 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発

  村田幸作; 橋本 渉

  厚生省調査研究班基盤研究部門（特定疾患に関する微生物研究班）平成１１年度 研究報告書, 49-50, 2000, Not refereed

  
• Identification and characterization of a novel enzyme: inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase of Micrococcus flavus

  Shigeyuki Kawai; Shigetarou Mori; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata

  Abstract for Fifth International Symposium on Environmental Biotechnology, p63-66, Kyoto, July 9-13, 2000, Not refereed

  
• 健康と環境への安全性

  橋本 渉; 門間敬子; 村田幸作

  「遺伝子組換え植物の光と影」(山田康之、佐野 浩編集) 学会出版センター, pp91-103, 1999, Not refereed

  
• 細菌アルギン酸リアーゼのバイオフィルム感染症治療への応用-高次構造と抗原性部位の除去-

  村田幸作; 橋本 渉

  厚生省特定疾患調査研究班（特定疾患に関する微生物研究班）平成１０年度 研究報告書, 49-52, 1999, Not refereed

  
• 細菌細胞表層への体腔提示と体腔へのターゲッティング

  門間敬子; 橋本 渉; 村田幸作

  文部省科学研究費補助金 特定領域研究(A)(1). バイオターゲティングのための生体分子デザイン 平成１０年度 研究報告書, 284-289, 1999, Not refereed

  
• Genetically modified foods: potential problems for safety assessment and monitoring

  Wataru Hashimoto; Sachiko Ozawa; Nobuaki Shirai; Keiko Momma; Shigeyuki Kawai; Shigeru Utsumi; Kousaku Murata

  In Recent Res. Devel. in Agricultural & Food Chem., Research Signpost, 3, 277-293, 1999, Not refereed

  
• Bacterial exo(hetero)polysaccharide lyases: enzymatic and genetic aspects of lyases, and their applications

  Wataru Hashimoto; Hikaru Miki; Masako Okamoto; Tomohiro Hisano; Keiko Momma; Kousaku Murata

  In Recent Res. Devel. in Fermentation & Bioeng., 1, 77-108, Research Signpost, 1998, Not refereed

  
• 細菌多糖リアーゼのバイオフィルム感染症治療への応用：化学修飾アルギン酸リアーゼの酵素学的・免疫学的特性

  村田幸作; 橋本 渉

  厚生省特定疾患調査研究班（特定疾患に関する微生物研究班）平成９年度 研究報告書, 42-48, 1998, Not refereed

  
• 細菌多糖リアーゼのバイオフィルム感染症治療への応用

  村田幸作; 橋本 渉

  厚生省特定疾患調査研究班（特定疾患に関する微生物研究班）平成８年度 研究報告書, 51-55, 1997, Not refereed

  
• Both large and small subunits are essential for the enzymatic activity of γ-glutamyltranspeptidase of Escherichia coli K-12

  Hideyuki Suzuki; Wataru Hashimoto; Satoko Nohara; Hiromi Tachi; Tetsuya Monji; Kenji Yamamoto; Hidehiko Kumagai

  The FASEB Journal ASBMB/Annual meeting, 9 (6), May, 1995, Not refereed

  
• γ-Glutamyltranspeptidase is essential for Escherichia coli K-12 to utilize as exogenous γ-glutamyl peptide as an amino acid source

  Hidehiko Kumagai; Hideyuki Suzuki; Wataru Hashimoto

  Annual reports of IC Biotech, 16, 556-559, 1993, Not refereed

  
• Structure-function relationship and regulation of biosynthesis of γ-glutamyltranspeptidase of Escherichia coli K-12

  Hidehiko Kumagai; Hideyuki Suzuki; Wataru Hashimoto; Satoko Nohara

  長瀬科学技術振興財団研究報告集, 4, 97-107, 1992, Not refereed

  
• γ-Glutamyltranspeptidase mutants of E. coli deficient in processing to subunits

  Wataru Hashimoto; Hideyuki Suzuki; Satoko Nohara; Hidehiko Kumagai

  Annual reports of IC Biotech, 15, 460-464, 1992, Not refereed

  
• Molecular cloning and DNA sequence of Escherichia coli K-12 γ-glutamyltranspeptidase gene, ggt, and excretion of γ-glutamyl-transpeptidase

  Hideyuki Suzuki; Hidehiko Kumagai; Wataru Hashimoto; Jaime O. Claudio; Tatsurokuro Tochikura

  Frontiers and new horizons in amino acid research, pp.589-593., Ed. by K. Takai, Elsevier Science Publishers B. V., 1992, Not refereed

  

Industrial Property Rights

• 特開WO2015/005258, 糖化ヘキサペプチドオキシダーゼとその利用

  小川徳之; 楳原芙美; 木村豪秀; 村田幸作; 橋本 渉

  
• 特開WO2015/005257, 糖化ヘモグロビンの測定方法

  小川徳之; 楳原芙美; 木村豪秀; 村田幸作; 橋本 渉

  
• 特開WO2011/024858, 海洋バイオマスからのエタノール生産

  村田幸作; 橋本 渉; 河井重幸; 織田浩司; 庵原啓司; 三上文三; 竹田浩之; 米山史紀; 落合秋人

  
• 特開特許公開2003-250542, 酵母の形質転換方法

  村田幸作; 橋本 渉; 河井重幸; 葉山善幸; 福田泰樹

  
• 特開特許公開平11-79922, 真核微生物用抗菌剤およびそれを用いる真核微生物の増殖抑制方法

  松谷恵子; 福田泰樹; 矢嶋瑞夫; 橋本 渉; 村田幸作

  
• 特開特許公開平9-234065, 新規なゲラン分解酵素とオリゴ糖

  佐藤信行; 中島 浩; 森山 茂; 橋本 渉; 村田幸作

  

Awards

• Mar. 2025

  日本農芸化学会, 日本農芸化学会BBB論文賞

  Decomposition of brown algae in the ocean by microbiota: biological insights for recycling blue carbon, Official journal

  Natsuko Katsuhiro, Kanomi Sato, Ryuichi Takase, Shigeyuki Kawai, Kohei Ogura, Wataru Hashimoto
• 05 Apr. 2024

  日本農芸化学会2024年度大会トピックス賞

  日尾 守、村田 憲亮、髙瀬 隆一、渡辺 大輔、小倉 康平、橋本 渉
• 31 Jan. 2020

  日本農芸化学会, 日本農芸化学会2020年度大会トピックス

  中田 翔太、日尾 守、髙瀬 隆一、河井重幸、渡辺 大輔、橋本 渉
• 08 Apr. 2019

  日本農芸化学会, 日本農芸化学会2019年度大会トピックス賞

  奥村 憲史, 三上 文三, 村田 幸作, 橋本 渉
• 08 Apr. 2019

  日本農芸化学会, 日本農芸化学会2019年度大会トピックス賞

  佐藤 賢宏, 久門 知也, 梶川 幹太, 村田 幸作, 橋本 渉
• 26 Apr. 2018

  公益財団法人長瀬科学技術振興財団, 長瀬研究振興賞
• 07 Apr. 2015

  日本農芸化学会, 日本農芸化学会2015年度大会トピックス賞

  丸山 如江, 立石 彬, 金子 あい, 三上 文三, 橋本 渉, 村田 幸作
• 2011

  日本農芸化学会, 日本農芸化学会2011年度大会トピックス賞

  竹田 浩之, 米山 史紀, 河井 重幸, 橋本 渉, 佐藤 信行, 村田幸作
• 2003

  日本農芸化学会, 日本農芸化学奨励賞(日本農芸化学会)Award for Young Scientist, Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry

External funds: Kakenhi

• Recycling of food wastes using bacterial chemotaxis

  Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

  Medium-sized Section 41:Agricultural economics and rural sociology, agricultural engineering, and related fields

  Kyoto University

  Wataru Hashimoto

  From 09 Jul. 2021, To 31 Mar. 2023, Project Closed

  アルギン酸;細菌;資源化;食品廃棄物;走化性;多糖;ペクチン;X線結晶構造解析;細菌走化性;バイオ燃料

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K19167/
• 動物細胞外粘液物質を介した腸内優占菌と宿主との相利共生機構の解明

  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

  Basic Section 38060:Applied molecular and cellular biology-related

  Kyoto University

  橋本 渉

  From 01 Apr. 2021, To 31 Mar. 2024, Granted

  腸内細菌叢;動物宿主;相利共生;ムチン;グリコサミノグリカン;微生物叢;常在機構;膜小胞;プロバイオティクス;Bacteroides;γ-アミノ酪酸

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02156/
• Development of bases on next-generation fermentation technology using atmospheric nitrogen and construction of sustainable society

  Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

  Medium-sized Section 64:Environmental conservation measure and related fields

  Kyoto University

  Wataru Hashimoto

  From 28 Jun. 2019, To 31 Mar. 2022, Project Closed

  アルギン酸;大気窒素;窒素固定細菌;バイオディーゼル;廃グリセロール;ポリヒドロキシ酪酸;バイオリファイナリー;生分解性プラスチック;ブルーカーボン;SDGs;低炭素社会;発酵

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19K22928/
• Construction of the brown macroalgae-based biorefinery system for the high production of terpenoid and lipids

  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

  Basic Section 38020:Applied microbiology-related

  Ishikawa Prefectural University

  Shigeyuki Kawai

  From 01 Apr. 2019, To 31 Mar. 2022, Project Closed

  酵母;テルペノイド;褐藻;海藻;アルギン酸;油脂;アルギン酸リアーゼ;DEH;Yarrowoa lipolytica;バレリアノール;油脂蓄積酵母;HMG-CoAレダクターゼ;ゲノム編集

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19K05796/
• Elucidation of dynamics and colonization mechanisms of microbiota targeting animal extracellular matrices and their application development

  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

  Basic Section 38060:Applied molecular and cellular biology-related

  Kyoto University

  Wataru Hashimoto

  From 01 Apr. 2018, To 31 Mar. 2021, Project Closed

  微生物叢;グリコサミノグリカン;常在機構;感染機構;プロバイオティクス;X線結晶構造解析;ムチン

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18H02166/
• Novel and innovative mechanism of ATP biosynthesis based on the plasmolysis as a proton-driven force in alkalophilic bacteria

  Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

  Setsunan University

  Kousaku Murata

  From 01 Apr. 2016, To 31 Mar. 2018, Project Closed

  好アルカリ性細菌;原形質分離;ATP合成機構;プロトン勾配;細菌内膜動的構造;プロトン駆動力;F0F1ATPase;pHジャンプ;Aeromonas属細菌;内膜皺構造;細胞膜機能;廃グリセロール;アエロモナス属細菌;窒素固定細菌;有機酸生産

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16K14893/
• Construction of transport systems by analysis and modification of molecular mechanism of macromolecule-importing ABC transporter

  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

  Setsunan University

  Yukie Maruyama

  From 01 Apr. 2016, To 31 Mar. 2019, Project Closed

  ABCトランスポーター;アルギン酸;スフィンゴモナス属細菌;ABC輸送体;結晶構造解析;スフィンゴモナス;共免疫沈降;タンパク質;多糖

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16K07701/
• Structural life science of pathogenic bacterial systems targeting animal host extracellular matrix for colonization and infection

  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

  Kyoto University

  Wataru HASHIMOTO

  From 01 Apr. 2015, To 31 Mar. 2018, Project Closed

  病原性細菌;細胞外マトリクス;グリコサミノグリカン;フォスフォトランスフェラーゼ系;ABCトランスポーター;分解・代謝酵素;遺伝子クラスター;X線結晶構造解析;連鎖球菌;連鎖桿菌;細胞外マトリックス;細菌;分解系;輸送系;宿主細胞外マトリクス;代謝酵素;動物細胞外マトリクス;酵素;輸送体;分解酵素

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15H04629/
• A novel metal-import system in the pit-forming bacterium and its application for recovery of radioactive compounds and rare metals

  Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

  Kyoto University

  Wataru Hashimoto

  From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2016, Project Closed

  細菌;アルギン酸;レアメタル;輸送体;電子顕微鏡;原子間力顕微鏡;X線結晶構造解析;示差走査型蛍光定量法;金属結合タンパク質;Sphingomonas属細菌;体腔形成細菌

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26660062/
• Three-dimensional structure and functionof ABC transporter responsible for macromolecule transport in bacteria

  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

  Setsunan University

  Kousaku Murata

  From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2017, Project Closed

  ABCトランスポーター;X線結晶構造;基質結合タンパク質;ＡＢＣタンパク質;アルギン酸;体腔;スフィンゴモナス属細菌;ABCタンパク質;透過酵素;Ｘ線結晶構造;酸性多糖輸送;Sphingomonas;輸送体分子進化;Spingomonas;X線結晶構造解析;フラジェリン;鉄輸送体

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26292044/
• Metabolic mechanism of host extracellular matrices, glycosaminoglycans, in streptococci

  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

  Kyoto University

  Wataru HASHIMOTO

  From 01 Apr. 2011, To 31 Mar. 2014, Project Closed

  連鎖球菌;宿主細胞外マトリックス;グリコサミノグリカン;代謝機構;イソメラーゼ;還元酵素;X線結晶構造解析;不飽和グルクロニルヒドロラーゼ;応用微生物学;微生物代謝;構造生物学;代謝酵素;遺伝子クラスター;構造機能相関;異性化酵素;細胞外マトリックス;感染症

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23580112/
• Structure and function of complex of substrate-binding protein and macromolecule-specific ABC transpoter

  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

  Setsunan University;Kyoto University

  Kousaku MURATA

  From 01 Apr. 2011, To 31 Mar. 2014, Project Closed

  ABCトランスポーター;酸性多糖輸送;Sphingomonas属細菌;Ｘ線結晶構造;輸送体分子進化;X線結晶構造;基質結合タンパク質;アルギン酸;スフィンゴモナス属細菌;X線結晶構造解析;プロテオリポソーム再構成系;ヘテロ多糖;高分子輸送;アルギン酸結合タンパク質;ABCタンパク質

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23380049/
• Structure and function of streptococcal system for heparin degradation/import and its involvement in infectious diseases

  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

  Kyoto University

  Wataru HASHIMOTO

  From 01 Apr. 2008, To 31 Mar. 2011, Project Closed

  連鎖球菌;宿主細胞外マトリックス;グリコサミノグリカン;多糖リアーゼ;不飽和グルクロニルヒドロラーゼ;侵入・感染;X線結晶構造解析;コンドロイチン二糖;硫酸化糖;部位特異的変異;ファスフォトランスフェラーゼ系;アミノ糖;αケトグルコン酸;DNAマイクロアレイ

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20580078/
• Structure/function relationship and cell surface localization mechanism of bacterial flagelin

  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

  Kyoto University

  Kousaku MURATA

  From 01 Apr. 2008, To 31 Mar. 2011, Project Closed

  フラジェリン;鞭毛;ペプチドグリカン加水分解酵素;メタロペプチダーゼ;X線結晶構造解析;体腔形成細菌;細菌細胞表層構造;アルギン酸;ペプチドグリカン加水分解楮;スフィンゴモナス属細菌;超チャネル;ペプチドグリカン構造;ペプチドグリカン分解酵素;X線結晶構造;フラジェリン進化

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20380049/
• 体腔器官の分子移植による細菌の構造と機能の大規模改変とその応用

  Grant-in-Aid for Exploratory Research

  Kyoto University

  村田 幸作

  From 01 Apr. 2006, To 31 Mar. 2008, Project Closed

  体腔;器官分子移植;環境浄化;巨大分子輸送;細胞表層構造;フラジェリン;アルギン酸;ダイオキシン;Sphingomonas属細菌;分子移殖;膜輸送機構;bioremediation

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18658033/
• Molecular and structural biostudies on streptococcalinyasion/infection mechanisms to host cells through degradation of extracellular matrices glyoceaminoglycans

  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

  Kyoto University

  Wataru HASHIMOTO

  From 01 Apr. 2006, To 31 Mar. 2008, Project Closed

  連鎖球菌;グリコサミノグリカン;多糖リアーゼ;不飽和グルクロニルヒドロラーゼ;侵入・感染機構;X線結晶構造解析;硫酸化糖;宿主細胞外マトリクス;細胞外マトリックス;コンドロイチン;ヒアルロン酸リアーゼ;遺伝子クラスター, Streptococcus;Glycosaminoalycan;Polysaccharide lyase;Unsaturated glucuronyl hydrolase;Invasion;infection mechanism;X-ray crystallography;Sulfated saccharide;Extracellular matrix

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18580075/
• タンパク質の「揺らぎ」と機能発現における水分子の役割

  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

  Science and Engineering

  Kyoto University

  村田 幸作

  From 01 Apr. 2006, To 31 Mar. 2008, Project Closed

  枯草菌;X線結晶構造解析;植物細胞壁;侵入・感染機構;不飽和ガラクツロニルヒドロラーゼ;ラムノガラクツロナン;水和;ビニルエーテル結合;連鎖球菌;細胞外マトリックス;グリコサミノグリカン;ヒアルロン酸リアーゼ;不飽和グルクロニルヒドロラーゼ;水和反応;反応機構

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18031018/
• Molecular basis for cell surface architecture and evolution of bacterial flagellin by structure and unction analysis of the protein

  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

  Kyoto University

  Kousaku MURATA

  From 01 Apr. 2005, To 31 Mar. 2008, Project Closed

  Sphingomonas;アルギン酸;フラジェリン;鞭毛;レセプター;X線結晶構造解析;体腔;T4ファージ;フィンガードメイン;鞭毛タンパク質;細菌細胞表層構造;Sphingomonas属細菌;鞭毛進化;細胞表層;襞構造, Sphingomonas;Alginate;Flagellin;Flagellum;Receptor;X-ray crystallography;Pit;T4 phage

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17380053/
• 「小胞状構造体」の形成に関わる細菌細胞膜のダイナミクス

  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

  Biological Sciences

  Kyoto University

  村田 幸作

  From 01 Apr. 2004, To 31 Mar. 2005, Project Closed

  スフィンゴモナス属細菌;体腔;プロテオミクス;細胞外膜タンパク質;鞭毛;フラジェリン;アルギン酸顆粒結合;レセプター

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16013221/
• 高分子物質の結合と分解に関わるタンパク質・酵素の機能を規定する動的高次構造の解析

  Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

  Kyoto University

  橋本 渉

  From 01 Apr. 2003, To 31 Mar. 2006, Project Closed

  Bacillus;キサンタンリアーゼ;X線結晶構造解析;多糖リアーゼファミリー;ヒアルロン酸リアーゼ;コンドロイチンリアーゼ;反応機構;動的構造;スフィンゴモナス属細菌;高分子物質;アルギン酸結合タンパク質;アルギン酸リアーゼ;動的高次構造;ドメイン開閉;ループ開閉

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15780053/
• 細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明

  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

  Biological Sciences

  Kyoto University

  村田 幸作

  From 01 Apr. 2003, To 31 Mar. 2004, Project Closed

  スフィンゴモナス属細菌;枯草菌;体腔;メソソーム;プロテオミクス;鉄イオントランスポーター;フラジェリン;外膜タンパク質

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15013228/
• Biochemical significance of the non-common amino acid sequences specifying the common functions of enzymes, polysaccharide lyases

  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

  Kyoto University

  Kousaku MURATA

  From 01 Apr. 2002, To 31 Mar. 2005, Project Closed

  多糖リアーゼ;構造生物学;X線結晶構造解析;タンパク質構造機能相関;Sphingomonas属細菌;Bacillus属細菌;糖質加水分解酵素;糖質エピメラーゼ;翻訳後修飾機構;ヒドロラーゼ;エピメラーゼ;Sphingomonas;Bacillus;アルギン酸リアーゼ;翻訳後修飾;X線結晶構造;オートプロセシング;タンパク質・遺伝子の進化;キサンタンリアーゼ, Polysaccharide lyase;Structural biology;X-ray crystallography;Structure;function relationship of protein;Sphingomonas;Bacillus;Primary structure;Protein module

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-14360052/
• 緑膿菌エコーシステムにおけるバイオフィルムの酵素・遺伝学的特性解析とその応用

  Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

  Kyoto University

  橋本 渉

  From 01 Apr. 2001, To 31 Mar. 2003, Project Closed

  エコーシステム;バイオフィルム;緑膿菌;アルギン酸;アルギン酸リアーゼ;ポリリン酸キナーゼ;運動性;Sphingomonas属細菌

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13760067/
• 難治性細菌感染症における細菌の増殖、潜伏及び感染持続機構の解析と新規治療法の確立

  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)

  Biological Sciences

  Kyoto University

  橋本 渉

  From 01 Apr. 2001, To 31 Mar. 2002, Project Closed

  細菌感染症;バイオフィルム;緑膿菌;アルギン酸;アルギン酸リアーゼ;抗原性;ポリエチレングリコール;アナフィラキシー

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13226049/
• DNA分子の戦略的生存システムの解析とその応用

  Grant-in-Aid for Exploratory Research

  Kyoto University

  村田 幸作

  From 01 Apr. 2000, To 31 Mar. 2002, Project Closed

  DNA生理機能;増殖阻害;CpGモチーフ;防腐剤;DNA生存戦略;細菌感染症;DNA;発芽阻害;ジベレリン;アミラーゼ;細胞増殖制御;遺伝情報

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12876020/
• X線結晶構造解析による多糖リアーゼの構造・機能相関と構造的一般則

  Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

  Kyoto University

  橋本 渉

  From 01 Apr. 1999, To 31 Mar. 2001, Project Closed

  多糖リアーゼ;X線結晶構造解析;構造・機能相関;アルギン酸;ゲラン;キサンタン;エンド型;エキソ型

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11760062/
• Structure/function analysis of abundance and transmission mechanism of genetic information invlolved in the biosynthesis of multi-catalytic site enzyme

  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

  KYOTO UNIVERSITY

  Kousaku MURATA

  From 01 Apr. 1999, To 31 Mar. 2002, Project Closed

  スフィンゴモナス属細菌;アルギン酸リアーゼ;自己プロセッシング;プロテアーゼ;X線結晶構造;β-脱離反応機構;遺伝情報多重性;プロテオーム;遺伝情報量;多触媒中心酵素;翻訳後修飾;X線結晶構造解析;アルギン酸;Shingomonas属細菌;プロテオーム解析, sphingomonas;alginate lyase;autoprocessing;protease;x-ray crystallography;β-elimination mechanism

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11460039/
• 細菌細胞表層における体腔形成機構と体腔の高分子輸送機構

  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)

  Kyoto University

  村田 幸作

  From 01 Apr. 1999, To 31 Mar. 2000, Project Closed

  アルギン酸;Shingomonas属細菌;体腔(ピット);高分子物質取り込み機構;膜透過機構;細胞表層構造;ABCトランスポーター;細胞表層工学

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11132237/
• Function and safety of bacterial alginate lyase for the therapy of biofilm-dependent infection of Pseudomonas aeruginosa

  Grant-in-Aid for Scientific Research (B).

  KYOTO UNIVERSITY

  Kousaku MURATA

  From 01 Apr. 1998, To 31 Mar. 2001, Project Closed

  アルギン酸リアーゼ;バイオフィルム;バイオフィルム感染症;抗原性エピトープ;酵素療法;部位特異的変異;アルギン酸;緑膿菌感染症;Shingomonas属細菌;バイオフィルム細菌感染症;緑膿菌;X線結晶構造解析;嚢胞性線維症;抗原性;細菌感染症;ヘテロ多糖;緑濃菌, alginate lyase;biofilm;biofilm-infection;antigenic epitope;enzyme therapy;site-directed mutagenesis;alginate;Pseudomonas aeruginosa

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10556017/
• 細菌細胞表層への体腔提示と体腔への高分子ターゲッティング機構

  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)

  Kyoto University

  村田 幸作

  From 01 Apr. 1998, To 31 Mar. 1999, Project Closed

  分子標的;スフィンゴモナス;体腔構造;ABCトランスポーター;細菌細胞表層構造;ピット;細胞表層工学;高分子膜輸送

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10145229/
• 細菌多糖リアーゼの多面的機能・構造相関解析と医薬・食品領域への応用

  Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

  Kyoto University

  橋本 渉

  From 01 Apr. 1997, To 31 Mar. 1999, Project Closed

  細菌多糖;多糖リアーゼ;オリゴ糖;酵素科学;遺伝子工学;食品工学

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-09760085/
• 多糖の合成と分解に関わるスヒンゴモナス属細菌表層の穴構造と新規高分子取り込み機構

  Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

  Kyoto University

  橋本 渉

  From 01 Apr. 1996, To 31 Mar. 1997, Project Closed

  スヒンゴモナス属細菌;細菌の細胞表層構造;細菌多糖;酵素科学;遺伝子工学

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08760083/
• 油糧酵母を用いて褐藻から油脂への新しい炭素の流れを創造するための基盤研究

  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

  Basic Section 38020:Applied microbiology-related

  Ishikawa Prefectural University

  河井 重幸

  From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2025, Granted

  褐藻;アルギン酸;マンニトール;油糧酵母;Yarrowia lipolytica;アルギン酸リアーゼ;油脂;モノウロン酸

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K05411/
• Molecular basis and significance of yeast symbiosis in traditional food fermentation processes

  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

  Basic Section 38060:Applied molecular and cellular biology-related

  Nara Institute of Science and Technology;Kyoto University

  Daisuke Watanabe

  From 01 Apr. 2020, To 31 Mar. 2023, Project Closed

  発酵食品;微生物共生;酵母;アルコール発酵;ブドウ果皮常在菌;ω-ヒドロキシ脂肪酸;生もと乳酸菌;Cyc8p-Tup1p複合体;Rhodotorula属酵母;Tup1-Cyc8複合体;Saccharomyces cerevisiae;Aureobasidium pullulans;Tup1p-Cyc8p複合体

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20K05958/
• 微生物によるブルーカーボンの利活用とレアメタル回収の基盤技術の確立

  Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

  Medium-sized Section 41:Agricultural economics and rural sociology, agricultural engineering, and related fields

  Kyoto University

  橋本 渉

  From 30 Jun. 2023, To 31 Mar. 2025, Granted

  ブルーカーボン;アルギン酸;ラミナリン;マンニトール;レアメタル;海洋微生物叢;バイオ燃料;バイオプラスチック;窒素固定;生分解性プラスチック

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23K18062/
• 常在菌によるヒト組織内優占化機構の解明

  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

  Basic Section 38060:Applied molecular and cellular biology-related

  Kyoto University

  橋本 渉

  From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2028, Adopted

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25K01979/

External funds: others

• 窒素固定細菌によるブルーカーボンからの生分解性プラスチック生産の開発

  岩谷直治記念財団, 第５１回（２０２４年度）岩谷科学技術研究助成

  From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  橋本　渉

  小倉康平
• 常在菌によるヒト組織内優占化機構の解明

  京都大学教育研究振興財団, 令和６年度研究活動推進助成

  From 07 Jun. 2024, To 31 Mar. 2025

  橋本　渉
• 果実常在微生物叢の性状解析とその発酵力による廃棄果実の有効活用

  東洋食品研究所, 2023 年度　法人設定テーマ研究助成

  From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2027

  橋本　渉
• Bacillus subtilisの膜変形を伴う膜⼩胞と洞⽳の形成機構の解明

  公益財団法人発酵研究所

  From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2025

  橋本　渉
• 次世代プロバイオティクスによる発酵乳の開発

  一般財団法人日本環境・有機農法振興財団

  From 05 Nov. 2020, To 31 Mar. 2021

  橋本　渉
• 微生物による未利用ブルーカーボン（褐藻類）の高度利用

  東洋水産財団

  From 26 May 2021, To 31 Mar. 2022

  橋本　渉
• 納豆菌による新しい発酵豆の創製

  タカノ農芸化学研究助成財団

  From 01 May 2021, To 30 Apr. 2022

  橋本　渉
• 植物関連細菌を制御する大豆由来抗菌物質

  不二たん白質研究振興財団

  From 01 Apr. 2021, To 31 Mar. 2022

  橋本　渉
• 腸内細菌の宿主動物多糖グリコサミノグリカンの代謝機構とその常在性との相関

  日本応用酵素協会酵素研究助成

  From 18 Apr. 2019, To 30 Jun. 2020

  橋本　渉
• 多糖認識依存的細菌走化性の解析とそのホワイトバイオテクノロジーへの応用

  公益財団法人長瀬科学技術振興財団 研究助成金

  From 01 Apr. 2018, To 31 Mar. 2019

  橋本　渉
• 微生物による水産資源からのレアメタル回収とバイオ燃料生産

  一般社団法人ヤンマー資源循環支援機構研究助成金

  From 01 Apr. 2018, To 31 Mar. 2019

  橋本　渉
• 宿主細胞外マトリックスを標的とする常在細菌と病原細菌の定着・共生・感染に関わる分子機構の解明

  公益財団法人 ヤクルト・バイオサイエンス研究財団 一般研究助成

  From 01 Apr. 2018, To 31 Mar. 2019

  橋本　渉
• 納豆菌による大豆成分の認識

  公益財団法人 不二たん白質研究振興財団

  From 01 Apr. 2017, To 31 Mar. 2018

  橋本　渉
• 宿主細胞外マトリックスを介したプロバイオティクスとヒト腸管との相互作用

  公益財団法人ダノン健康栄養財団 ダノン学術研究助成金

  From 01 Jan. 2015, To 31 Dec. 2015

  橋本　渉
• 酸性多糖の代謝に関わる還元酵素の立体構造に基づく補酵素特異性変換とそのバイオ燃料生産への応用

  公益財団法人野田産業科学研究所研究助成

  From 01 Apr. 2015, To 31 Mar. 2016

  橋本　渉
• 断片化グリコサミノグリカンの分解に関わる新規酵素の構造機能相関とその医薬への応用

  公益財団法人水谷糖質科学振興財団研究助成

  From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2015

  橋本　渉
• 窒素固定細菌によるグリセリンからのバイオポリマー発酵生産

  日本石鹸洗剤工業会 グリセリン新規用途開発研究助成金

  From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2015

  橋本　渉
• 細菌細胞壁ペプチドグリカンの分解に関する研究

  （財）昭和報公会研究助成金

  From 01 Apr. 2008, To 31 Mar. 2009

  橋本　渉
• 多糖の輸送・分解に関わる細菌由来超分子の構造生物学とその食品・環境分野への応用

  文部科学省 キーテクノロジー研究開発の推進「ターゲットタンパク研究プログラム」

  From 01 Jul. 2007, To 31 Mar. 2012

  橋本　渉
• Establishment of common structural rules for polysaccharide lyases and their application to medical areas

  ノボザイムズ研究奨励金

  From 01 Apr. 2002, To 31 Mar. 2003

  橋本　渉
• 細菌『超チャネル』の高次構造と巨大分子輸送機能

  （財）新世代研究所研究奨励金

  From 01 Apr. 2001, To 31 Mar. 2002

  橋本　渉
• Cell physiology of N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase responsible for synthesis of sialic acid and regulation of blood pressure

  （財）稲盛財団研究助成金

  From 01 Apr. 2001, To 31 Mar. 2002

  橋本　渉
• 細菌体腔依存型高分子物質特異的ABCトランスポーターの構造と機能

  （財）日本バイオインダストリー協会研究奨励金

  From 01 Apr. 2000, To 31 Mar. 2001

  橋本　渉
• 細菌細胞表層のダイナミクスと高分子物質の新規取り込み機構

  京都大学学術奨励金

  From 01 Apr. 1997, To 31 Mar. 1998

  橋本　渉

Education

Teaching subject(s)

• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  ILAS Seminar

  Z001, Spring, Institute for Liberal Arts and Sciences, 2
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Overseas Field Seminars

  W409, Spring, Institute for Liberal Arts and Sciences, 2
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Introduction to Food Bioscience

  7329, Spring, Faculty of Agriculture, 1
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Seminar on Biochemistry and Microbiology

  7317, Fall, Faculty of Agriculture, 1
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Advanced Course of Applied Microbiology

  GA32, Spring, Graduate School of Agriculture, 1
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Molecular Biotechnology Seminar

  GF08, Spring, Graduate School of Agriculture, 1.5
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Molecular Biotechnology Seminar

  GF08, Fall, Graduate School of Agriculture, 1.5
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Experimental Course in Molecular Biotechnology

  GG08, Spring, Graduate School of Agriculture, 3
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Experimental Course in Molecular Biotechnology

  GG08, Fall, Graduate School of Agriculture, 3
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Laboratory Course in Applied Microbiology

  3167, Fall, Faculty of Agriculture, 3
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Microbial Genetics

  7240, Spring, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Outline of microbiology

  5640, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Structural biology

  7331, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2025, To 31 Mar. 2026

  Microbiological Technology

  7243, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Introduction to Food Bioscience

  7329, Spring, Faculty of Agriculture, 1
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Seminar on Biochemistry and Microbiology

  7317, Fall, Faculty of Agriculture, 1
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Advanced Course of Synthetic Biology

  GA33, Spring, Graduate School of Agriculture, 1
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Molecular Biotechnology Seminar

  GF08, Spring, Graduate School of Agriculture, 1.5
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Molecular Biotechnology Seminar

  GF08, Fall, Graduate School of Agriculture, 1.5
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Experimental Course in Molecular Biotechnology

  GG08, Spring, Graduate School of Agriculture, 3
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Experimental Course in Molecular Biotechnology

  GG08, Fall, Graduate School of Agriculture, 3
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Laboratory Course in Applied Microbiology

  3167, Fall, Faculty of Agriculture, 3
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Outline of microbiology

  5640, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Microbiological Technology

  7243, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2024, To 31 Mar. 2025

  Microbial Genetics

  7240, Spring, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Food Science and Biotechnology I

  GA14, Spring, Graduate School of Agriculture, 1
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Advanced Course of Applied Microbiology

  GA32, Spring, Graduate School of Agriculture, 1
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Seminar on Biochemistry and Microbiology

  7317, Fall, Faculty of Agriculture, 1
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Laboratory Course in Applied Microbiology

  3167, Fall, Faculty of Agriculture, 3
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Molecular Biotechnology Seminar2

  GB24, Year-long, Graduate School of Agriculture, 3
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Molecular Biotechnology Seminar1

  GB23, Year-long, Graduate School of Agriculture, 3
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Experimental Course in Molecular Biotechnology2

  GC24, Year-long, Graduate School of Agriculture, 6
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Experimental Course in Molecular Biotechnology1

  GC23, Year-long, Graduate School of Agriculture, 6
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Microbial Genetics

  7240, Spring, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Introduction to Food Bioscience

  7215, Spring, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Outline of microbiology

  5640, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2023, To 31 Mar. 2024

  Microbiological Technology

  7243, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Seminar on Biochemistry and Microbiology

  7317, Fall, Faculty of Agriculture, 1
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Laboratory Course in Applied Microbiology

  3167, Fall, Faculty of Agriculture, 3
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Introduction to Food Bioscience

  7215, Spring, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Microbiological Technology

  7243, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Molecular Biotechnology Seminar1

  GB23, Year-long, Graduate School of Agriculture, 3
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Outline of Agricultural Science II

  5003, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Basic Microbiology

  7307, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Advanced Course of Synthetic Biology

  GA33, Spring, Graduate School of Agriculture, 1
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Applied Microbiology I

  5639, Fall, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Molecular Biotechnology Seminar2

  GB24, Year-long, Graduate School of Agriculture, 3
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Microbial Genetics

  7240, Spring, Faculty of Agriculture, 2
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Experimental Course in Molecular Biotechnology1

  GC23, Year-long, Graduate School of Agriculture, 6
• From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023

  Experimental Course in Molecular Biotechnology2

  GC24, Year-long, Graduate School of Agriculture, 6
• From Apr. 2011, To Mar. 2012

  微生物学実験及び実験法

  Fall, 農学部
• From Apr. 2011, To Mar. 2012

  専門外国書講読II

  Fall, 農学部
• From Apr. 2011, To Mar. 2012

  生物機能変換学

  Fall, 農学部
• From Apr. 2011, To Mar. 2012

  生物機能変換学専攻演習

  農学研究科
• From Apr. 2012, To Mar. 2013

  Introduction to Foreign Literature in Food Science and Biotechnology II

  Fall, 農学部
• From Apr. 2012, To Mar. 2013

  Laboratory Course in Applied Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2012, To Mar. 2013

  Molecular Biotechnology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2013, To Mar. 2014

  Food Microbiology

  Spring, 農学部
• From Apr. 2013, To Mar. 2014

  Molecular Biotechnology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2013, To Mar. 2014

  Introduction to Foreign Literature in Food Science and Biotechnology II

  Fall, 農学部
• From Apr. 2013, To Mar. 2014

  Laboratory Course in Applied Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2013, To Mar. 2014

  Molecular Biotechnology Seminar

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2013, To Mar. 2014

  Experimental Course in Molecular Biotechnology

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2013, To Mar. 2014

  Practice of Basic Informatics(Faculty of Agriculture)

  Fall, 全学共通科目
• From Apr. 2014, To Mar. 2015

  Food Microbiology

  Spring, 農学部
• From Apr. 2014, To Mar. 2015

  Molecular Biotechnology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2014, To Mar. 2015

  Introduction to Foreign Literature in Food Science and Biotechnology II

  Fall, 農学部
• From Apr. 2014, To Mar. 2015

  Laboratory Course in Applied Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2014, To Mar. 2015

  Molecular Biotechnology (Advanced Course)

  Fall, 農学研究科
• From Apr. 2014, To Mar. 2015

  Molecular Biotechnology Seminar

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2014, To Mar. 2015

  Experimental Course in Molecular Biotechnology

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2015, To Mar. 2016

  Introduction to Foreign Literature in Food Science and Biotechnology II

  Fall, 農学部
• From Apr. 2015, To Mar. 2016

  Laboratory Course in Applied Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2015, To Mar. 2016

  Practice of Basic Informatics(Faculty of Agriculture)

  Fall, 全学共通科目
• From Apr. 2015, To Mar. 2016

  Molecular Biotechnology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2015, To Mar. 2016

  Experimental Course in Molecular Biotechnology1

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2015, To Mar. 2016

  Experimental Course in Molecular Biotechnology

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2015, To Mar. 2016

  Molecular Biotechnology Seminar1

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2015, To Mar. 2016

  Molecular Biotechnology Seminar

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2015, To Mar. 2016

  Food Microbiology

  Spring, 農学部
• From Apr. 2016, To Mar. 2017

  Basic Microbiology

  Spring, 農学部
• From Apr. 2016, To Mar. 2017

  Basic Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2016, To Mar. 2017

  Microbiological Technology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2016, To Mar. 2017

  Microbial Genetics

  Fall, 農学部
• From Apr. 2016, To Mar. 2017

  Laboratory Course in Applied Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2016, To Mar. 2017

  Experimental Course in Molecular Biotechnology1

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2016, To Mar. 2017

  Experimental Course in Molecular Biotechnology2

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2016, To Mar. 2017

  Experimental Course in Molecular Biotechnology

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2016, To Mar. 2017

  Molecular Biotechnology Seminar1

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2016, To Mar. 2017

  Molecular Biotechnology Seminar2

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2016, To Mar. 2017

  Molecular Biotechnology Seminar

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2016, To Mar. 2017

  Molecular Biotechnology (Advanced Course)

  Fall, 農学研究科
• From Apr. 2017, To Mar. 2018

  Basic Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2017, To Mar. 2018

  Microbiological Technology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2017, To Mar. 2018

  Microbial Genetics

  Spring, 農学部
• From Apr. 2017, To Mar. 2018

  Laboratory Course in Applied Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2017, To Mar. 2018

  Advanced Course of Applied Microbiology

  Spring, 農学研究科
• From Apr. 2017, To Mar. 2018

  Experimental Course in Molecular Biotechnology1

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2017, To Mar. 2018

  Experimental Course in Molecular Biotechnology2

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2017, To Mar. 2018

  Molecular Biotechnology Seminar1

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2017, To Mar. 2018

  Molecular Biotechnology Seminar2

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2018, To Mar. 2019

  ILAS Seminar

  Spring, 全学共通科目
• From Apr. 2018, To Mar. 2019

  Advanced Course of Synthetic Biology

  Spring, 農学研究科
• From Apr. 2018, To Mar. 2019

  Basic Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2018, To Mar. 2019

  Microbiological Technology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2018, To Mar. 2019

  Microbial Genetics

  Spring, 農学部
• From Apr. 2018, To Mar. 2019

  Laboratory Course in Applied Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2018, To Mar. 2019

  Experimental Course in Molecular Biotechnology1

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2018, To Mar. 2019

  Experimental Course in Molecular Biotechnology2

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2018, To Mar. 2019

  Molecular Biotechnology Seminar1

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2018, To Mar. 2019

  Molecular Biotechnology Seminar2

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2018, To Mar. 2019

  Food Science and Production Technology

  Spring, 農学部
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  ILAS Seminar

  Spring, 全学共通科目
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Basic Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Microbiological Technology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Microbial Genetics

  Spring, 農学部
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Laboratory Course in Applied Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Advanced Course of Applied Microbiology

  Spring, 農学研究科
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Seminar on Biochemistry and Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Experimental Course in Molecular Biotechnology1

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Experimental Course in Molecular Biotechnology2

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Molecular Biotechnology Seminar1

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Molecular Biotechnology Seminar2

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Food Science and Production Technology

  Spring, 農学部
• From Apr. 2019, To Mar. 2020

  Food Industries

  Spring, 農学部
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Advanced Course of Synthetic Biology

  Spring, 農学研究科
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Basic Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Microbiological Technology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Microbial Genetics

  Spring, 農学部
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Laboratory Course in Applied Microbiology

  Year-long, 農学部
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Seminar on Biochemistry and Microbiology

  Spring, 農学部
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Experimental Course in Molecular Biotechnology1

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Experimental Course in Molecular Biotechnology2

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Molecular Biotechnology Seminar1

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Molecular Biotechnology Seminar2

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2020, To Mar. 2021

  Thesis

  Year-long, 農学部
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Basic Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Microbiological Technology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Microbial Genetics

  Spring, 農学部
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Applied Microbiology I

  Fall, 農学部
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Laboratory Course in Applied Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Advanced Course of Applied Microbiology

  Spring, 農学研究科
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Seminar on Biochemistry and Microbiology

  Fall, 農学部
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Experimental Course in Molecular Biotechnology1

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Experimental Course in Molecular Biotechnology2

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Molecular Biotechnology Seminar1

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Molecular Biotechnology Seminar2

  Year-long, 農学研究科
• From Apr. 2021, To Mar. 2022

  Introduction to Food Bioscience

  Spring, 農学部