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Hashimoto, Wataru

Graduate School of Agriculture, Division of Food Science and Biotechnology Professor

Hashimoto, Wataru
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    Last Updated :2022/07/02

    Basic Information

    Faculty

    • 農学部

    Professional Memberships

    • 日本細菌学会
    • 日本ビタミン学会
    • 日本応用糖質科学会
    • アメリカ微生物学会(American society for microbiology)
    • 日本生物工学会
    • 日本農芸化学会

    Academic Degree

    • 修士(農学)(京都大学)
    • 博士(農学)(京都大学)

    Academic Resume (Graduate Schools)

    • 京都大学, 大学院農学研究科修士課程食品工学専攻, 修了
    • 京都大学, 大学院農学研究科博士後期課程食品工学専攻, 修了

    Academic Resume (Undergraduate School/Majors)

    • 京都大学, 農学部食品工学科, 卒業

    Research History

    • From 2015, To Present
      Kyoto University, Graduate School of Agriculture, 教授
    • From 2007, To 2015
      Kyoto University, Graduate School of Agriculture, 准教授
    • From 2001, To 2007
      Kyoto University, Graduate School of Agriculture, 助教授
    • From 2000, To 2001
      Kyoto University, 食糧科学研究所, 助教授
    • From 1995, To 2000
      Kyoto University, 食糧科学研究所, 助手

    Language of Instruction

    • Japanese

    ID,URL

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      Last Updated :2022/07/02

      Research

      Research Topics, Overview of the research

      • Research Topics

        Studies on microbial mechanisms for interaction with animal, plant or microbe and their application to food/environmental/medical fields
      • Overview of the research

        Microbial interactions with host animal, plant, or microbe are focused on. Based on the interaction mode, bacteria are classified into three groups such as pathogenic, saprophytic, and symbiotic bacteria. The adhesion of the bacteria to host cells may be a primary mechanism of bacterial interactions. Bacterial mechanisms of the recognition, degradation, transport, and metabolism of host cell surface components are structurally and functionally analyzed through molecular, structural, and cellular biology. For example, intestinal microbiota targeting host extracellular matrix glycosaminoglycans such as hyaluronan, chondroitin sulfate, and heparin is analyzed and a novel bacterial import system (ABC transporter) of glycosaminoglycans is identified in the pathogenic bacterium.

      Research Interests

      • 腸内細菌叢
      • 環境微生物
      • X線結晶構造解析
      • 輸送体
      • 糖質関連酵素
      • 植物細胞壁
      • 動物細胞外マトリックス
      • 膜ダイナミクス
      • 生物間相互作用
      • 発酵食品

      Research Areas

      • Life sciences, Applied microbiology
      • Life sciences, Applied molecular and cellular biology
      • Life sciences, Structural biochemistry
      • Life sciences, Food sciences
      • Life sciences, Applied biochemistry

      Papers

      • 4-Deoxy-l-erythro-5-hexoseulose Uronate (DEH) and DEH Reductase: Key Molecule and Enzyme for the Metabolism and Utilization of Alginate.
        Shigeyuki Kawai; Wataru Hashimoto
        Molecules (Basel, Switzerland), 06 Jan. 2022
      • 大豆と納豆菌のせめぎ合い−細菌と植物との相互作用の多様性に新たな知見
        橋本 渉
        化学, Jun. 2021, Peer-reviewed, Invited, Lead author, Corresponding author
      • 細菌が高分子多糖に走化性を示す分子機構
        髙瀬隆一; 村田幸作; 河井重幸; 橋本 渉
        生化学, Apr. 2021, Peer-reviewed, Invited, Last author, Corresponding author
      • Bacterial inducible expression of plant cell wall-binding protein YesO through conflict between Glycine max and saprophytic Bacillus subtilis
        Haruka Sugiura; Ayumi Nagase; Sayoko Oiki; Bunzo Mikami; Daisuke Watanabe; Wataru Hashimoto
        Scientific Reports, Oct. 2020, Peer-reviewed, Corresponding author
      • Novel Hyaluronate Lyase Involved in Pathogenicity of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis
        Van An Nguyen; Kohei Ogura; Miki Matsue; Norihiko Takemoto; Kanae Mukai; Yukari Nakajima; Thuy Linh Hoang; Yasunori Iwata; Norihiko Sakai; Takashi Wada; Wataru Hashimoto; Shigefumi Okamoto; Hiroshi Ichimura
        Frontiers in Microbiology, 24 Sep. 2020, Peer-reviewed
      • 褐藻の主要多糖類アルギン酸の分解物が示す特定アミノ基との反応性
        河井重幸; 橋本 渉
        バイオサイエンスとインダストリー, Sep. 2020, Peer-reviewed, Last author
      • Polyunsaturated fatty acids-enriched lipid from reduced sugar alcohol mannitol by marine yeast Rhodosporidiobolus fluvialis Y2.
        Shota Nakata; Mamoru Hio; Ryuichi Takase; Shigeyuki Kawai; Daisuke Watanabe; Wataru Hashimoto
        Biochemical and biophysical research communications, 11 Jun. 2020, Peer-reviewed
      • Bacterial chemotaxis towards polysaccharide pectin by pectin-binding protein
        Hidenori Konishi; Mamoru Hio; Masahiro Kobayashi; Ryuichi Takase; Wataru Hashimoto
        Scientific Reports, Mar. 2020, Peer-reviewed
      • Hsp104-dependent ability to assimilate mannitol and sorbitol conferred by a truncated Cyc8 with a C-terminal polyglutamine in Saccharomyces cerevisiae.
        Hideki Tanaka; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto; Shigeyuki Kawai
        PloS one, 2020
      • Uncovering the reactive nature of 4-deoxy-L-erythro-5-hexoseulose uronate for the utilization of alginate, a promising marine biopolymer.
        Shota Nakata; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto; Shigeyuki Kawai
        Scientific reports, 20 Nov. 2019, Peer-reviewed
      • Streptococcal phosphotransferase system imports unsaturated hyaluronan disaccharide derived from host extracellular matrices
        Sayoko Oiki; Yusuke Nakamichi; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        PLOS ONE, 07 Nov. 2019, Peer-reviewed
      • Substrate recognition by bacterial solute-binding protein is responsible for import of extracellular hyaluronan and chondroitin sulfate from the animal host.
        Sayoko Oiki; Masahiro Sato; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, Oct. 2019, Peer-reviewed
      • Structural studies on bacterial system used in the recognition and uptake of the macromolecule alginate
        Yukie Maruyama; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        Bioscience Biotechnology and Biochemistry, May 2019, Peer-reviewed
      • Creation of haemoglobin A1c direct oxidase from fructosyl peptide oxidase by combined structure-based site specific mutagenesis and random mutagenesis
        Noriyuki Ogawa; Takehide Kimura; Fumi Umehara; Yuki Katayama; Go Nagai; Keiko Suzuki; Kazuo Aisaka; Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata; Michio Ichimura
        Scientific Reports, Jan. 2019, Peer-reviewed
      • Probiotics in human gut microbiota can degrade host glycosaminoglycans
        Keigo Kawai; Reiko Kamochi; Sayoko Oiki; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        Scientific Reports, Jul. 2018, Peer-reviewed
      • 多糖リアーゼ
        橋本 渉
        生化学, 2018, Peer-reviewed
      • 病原細菌による宿主細胞外グリコサミノグリカンの断片化・輸送・分解・代謝に関わる分子機構
        老木紗予子; 中道優介; 丸山如江; 村田幸作; 橋本 渉
        生化学, Dec. 2017, Peer-reviewed, Invited
      • Alternative substrate-bound conformation of bacterial solute-binding protein involved in the import of mammalian host glycosaminoglycans
        Sayoko Oiki; Reiko Kamochi; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        SCIENTIFIC REPORTS, Dec. 2017, Peer-reviewed
      • Binding mode of metal ions to the bacterial iron import protein EfeO
        Kanate Temtrirath; Kenji Okumura; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Nov. 2017, Peer-reviewed
      • A solute-binding protein in the closed conformation induces ATP hydrolysis in a bacterial ATP-binding cassette transporter involved in the import of alginate
        Ai Kaneko; Kasumi Uenishi; Yukie Maruyama; Nobuhiro Mizuno; Seiki Baba; Takashi Kumasaka; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Sep. 2017, Peer-reviewed
      • Crucial role of 4-deoxy-L-erythro-5-hexoseulose uronate reductase for alginate utilization revealed by adaptive evolution in engineered Saccharomyces cerevisiae
        Fumiya Matsuoka; Makoto Hirayama; Takayuki Kashihara; Hideki Tanaka; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata; Shigeyuki Kawai
        SCIENTIFIC REPORTS, Jun. 2017, Peer-reviewed
      • A bacterial ABC transporter enables import of mammalian host glycosaminoglycans
        Sayoko Oiki; Bunzo Mikami; Yukie Maruyama; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        SCIENTIFIC REPORTS, Apr. 2017, Peer-reviewed
      • Lateral-typed flagellin responsible for formation of a polar flagellum but not of lateral flagella in Sphingomonas sp strain A1
        Masahiro Kobayashi; Hidenori Konishi; Yukie Maruyama; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        MICROBIOLOGY-SGM, Dec. 2016, Peer-reviewed
      • Conformational Change in the Active Site of Streptococcal Unsaturated Glucuronyl Hydrolase Through Site-Directed Mutagenesis at Asp-115
        Yusuke Nakamichi; Sayoko Oiki; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        PROTEIN JOURNAL, Aug. 2016, Peer-reviewed
      • Structural determinants in bacterial 2-keto-3-deoxy-D-gluconate dehydrogenase KduD for dual-coenzyme specificity
        Ryuichi Takase; Yukie Maruyama; Sayoko Oiki; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, Jul. 2016, Peer-reviewed
      • Comparative characterization of three bacterial exo-type alginate lyases
        Makoto Hirayama; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata; Shigeyuki Kawai
        INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES, May 2016, Peer-reviewed
      • Structural Basis of Bacterial Supramolecules for Import of Heteropolysaccharide
        Wataru HASHIMOTO; Yukie MARUYAMA; Takafumi ITOH; Ryuichi TAKASE; Kousaku MURATA
        KAGAKU TO SEIBUTSU, 2016, Peer-reviewed, Invited
      • Structure of a Bacterial ABC Transporter Involved in the Import of an Acidic Polysaccharide Alginate
        Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Ai Kaneko; Yu Nishitani; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        STRUCTURE, Sep. 2015, Peer-reviewed
      • Formation of a single polar flagellum by two distinct flagellar gene sets in Sphingomonas sp strain A1
        Yukie Maruyama; Masahiro Kobayashi; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        MICROBIOLOGY-SGM, Aug. 2015, Peer-reviewed
      • Production of polyhydroxybutyrate and alginate from glycerol by Azotobacter vinelandii under nitrogen-free conditions
        Fuminori Yoneyama; Mayumi Yamamoto; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        BIOENGINEERED, Jul. 2015, Peer-reviewed
      • Structural studies on Laz, a promiscuous anticancer Neisserial protein
        Wataru Hashimoto; Akihito Ochiai; Chang Soo Hong; Kousaku Murata; Ananda M. Chakrabarty
        BIOENGINEERED, May 2015, Peer-reviewed
      • Structural insights into alginate binding by bacterial cell-surface protein
        Kanate Temtrirath; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        CARBOHYDRATE RESEARCH, Mar. 2015, Peer-reviewed
      • Metabolic Fate of Unsaturated Glucuronic/Iduronic Acids from Glycosaminoglycans MOLECULAR IDENTIFICATION AND STRUCTURE DETERMINATION OF STREPTOCOCCAL ISOMERASE AND DEHYDROGENASE
        Yukie Maruyama; Sayoko Oiki; Ryuichi Takase; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Mar. 2015, Peer-reviewed
      • Structure-based Conversion of the Coenzyme Requirement of a Short-chain Dehydrogenase/Reductase Involved in Bacterial Alginate Metabolism
        Ryuichi Takase; Bunzo Mikami; Shigeyuki Kawai; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Nov. 2014, Peer-reviewed
      • Alginate-Dependent Gene Expression Mechanism in Sphingomonas sp Strain A1
        Chie Hayashi; Ryuichi Takase; Keiko Momma; Yukie Maruyama; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        JOURNAL OF BACTERIOLOGY, Jul. 2014, Peer-reviewed
      • Crystal Structure of a Bacterial Unsaturated Glucuronyl Hydrolase with Specificity for Heparin*
        Yusuke Nakamichi; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Feb. 2014, Peer-reviewed
      • Crystal Structure of Pedobacter heparinus Heparin Lyase Hep III with the Active Site in a Deep Cleft
        Wataru Hashimoto; Yukie Maruyama; Yusuke Nakamichi; Bunzo Mikami; Kousaku Murata
        BIOCHEMISTRY, Feb. 2014, Peer-reviewed
      • A novel bleb-dependent polysaccharide export system in nitrogen-fixing Azotobacter vinelandii subjected to low nitrogen gas levels
        Wataru Hashimoto; Yukiko Miyamoto; Mayumi Yamamoto; Fuminori Yoneyama; Kousaku Murata
        International Microbiology, 2013, Peer-reviewed
      • Induced-fit motion of a lid loop involved in catalysis in alginate lyase A1-III
        Bunzo Mikami; Mizuho Ban; Sachiko Suzuki; Hye-Jin Yoon; Osamu Miyake; Masayuki Yamasaki; Kohei Ogura; Yukie Maruyama; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-STRUCTURAL BIOLOGY, Sep. 2012, Peer-reviewed
      • Recognition of Heteropolysaccharide Alginate by Periplasmic Solute-Binding Proteins of a Bacterial ABC Transporter
        Yu Nishitani; Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        BIOCHEMISTRY, May 2012, Peer-reviewed
      • Crystallization and preliminary X-ray analysis of alginate importer from Sphingomonas sp A1
        Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Yu Nishitani; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS, Mar. 2012, Peer-reviewed
      • Azotobacter vinelandii gene clusters for two types of peptidic and catechol siderophores produced in response to molybdenum
        F. Yoneyama; M. Yamamoto; W. Hashimoto; K. Murata
        JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY, Oct. 2011, Peer-reviewed
      • Bioethanol production from marine biomass alginate by metabolically engineered bacteria
        Hiroyuki Takeda; Fuminori Yoneyama; Shigeyuki Kawai; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        ENERGY & ENVIRONMENTAL SCIENCE, Jul. 2011, Peer-reviewed
      • Heterosubunit Composition and Crystal Structures of a Novel Bacterial M16B Metallopeptidase
        Yukie Maruyama; Asako Chuma; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Mar. 2011, Peer-reviewed
      • Structural Determinants in Streptococcal Unsaturated Glucuronyl Hydrolase for Recognition of Glycosaminoglycan Sulfate Groups
        Yusuke Nakamichi; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Feb. 2011, Peer-reviewed
      • Crystal structure of bacterial cell-surface alginate-binding protein with an M75 peptidase motif
        Yukie Maruyama; Akihito Ochiai; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Feb. 2011, Peer-reviewed
      • アルギン酸代謝酵素の構造と機能
        落合秋人; 高瀬隆一; 三上文三; 橋本渉; 村田幸作
        ビタミン, 25 Nov. 2010, Peer-reviewed
      • Molecular identification of unsaturated uronate reductase prerequisite for alginate metabolism in Sphingomonas sp A1
        Ryuichi Takase; Akihito Ochiai; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, Sep. 2010, Peer-reviewed
      • Crystal Structure of Exotype Alginate Lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens
        Akihito Ochiai; Masayuki Yamasaki; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Aug. 2010, Peer-reviewed
      • Mutational studies of the peptidoglycan hydrolase FlgJ of Sphingomonas sp strain A1
        Yukie Maruyama; Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        JOURNAL OF BASIC MICROBIOLOGY, Aug. 2010, Peer-reviewed
      • Transformation of Saccharomyces cerevisiae and other fungi: methods and possible underlying mechanism.
        S. Kawai; W. Hashimoto; K. Murata
        Bioengineered bugs, 2010, Peer-reviewed
      • Bacterial supersystem for alginate import/metabolism and its environmental and bioenergy applications
        Wataru Hashimoto; Shigeyuki Kawai; Kousaku Murata
        Bioengineered Bugs, 2010, Peer-reviewed
      • Crystal Structure of Family 14 Polysaccharide Lyase with pH-dependent Modes of Action
        Kohei Ogura; Masayuki Yamasaki; Takashi Yamada; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Dec. 2009, Peer-reviewed
      • Substrate Specificity of Streptococcal Unsaturated Glucuronyl Hydrolases for Sulfated Glycosaminoglycan
        Yukie Maruyama; Yusuke Nakamichi; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Jul. 2009, Peer-reviewed
      • Crystallization and preliminary crystallographic analysis of the cell-surface alginate-binding protein Algp7 isolated from Sphingomonas sp A1
        Wataru Hashimoto; Akihito Ochiai; Jinshan He; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Kousaku Murata
        ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS, May 2009, Peer-reviewed
      • Structural determinants responsible for substrate recognition and mode of action in family 11 polysaccharide lyases
        Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        Journal of Biological Chemistry, 10 Apr. 2009, Peer-reviewed
      • Crystal structure of the glycosidase family 73 peptidoglycan hydrolase FlgJ
        Wataru Hashimoto; Akihito Ochiai; Keiko Momma; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Yukie Maruyama; Kousaku Murata
        BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Mar. 2009, Peer-reviewed
      • A putative lipoprotein of Sphingomonas sp strain A1 binds alginate rather than a lipid moiety
        Jinshan He; Akihito Ochiai; Yasuki Fukuda; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, Nov. 2008, Peer-reviewed
      • Substrate recognition by family 7 alginate lyase from Sphingomonas sp A1
        Kohei Ogura; Masayuki Yamasaki; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Jul. 2008, Peer-reviewed
      • Crystal structure of YihS in complex with D-mannose: Structural annotation of Escherichia coli and Salmonella enterica yihS-encoded proteins to an aldose-ketose isomerase
        Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Apr. 2008, Peer-reviewed
      • Crystal structure of a novel bacterial cell-surface flagellin binding to a polysaccharide
        Yukie Maruyama; Misato Momma; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        BIOCHEMISTRY, Feb. 2008, Peer-reviewed
      • Superchannel of bacteria: Biological significance and new horizons
        Kousaku Murata; Shigeyuki Kawai; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto
        BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Feb. 2008, Peer-reviewed
      • Paenibacillus sp strain HC1 xylanases responsible for degradation of rice bran hemicellulose
        Karen Mine Harada; Keiko Tanaka; Yasuki Fukuda; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        MICROBIOLOGICAL RESEARCH, 2008, Peer-reviewed
      • A novel structural fold in polysaccharide lyases - Bacillus subtilis family 11 rhamnogalacturonan lyase YesW with an eight-bladed beta-propeller
        Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Akiko Kawamata; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Dec. 2007, Peer-reviewed
      • Hydration of vinyl ether groups by unsaturated glycoside hydrolases and their role in bacterial pathogenesis
        Wataru Hashimoto; Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Kousaku Murata
        INTERNATIONAL MICROBIOLOGY, Dec. 2007, Peer-reviewed
      • Crystal structure of glycoside hydrolase family 78 alpha-L-rhamnosidase from Bacillus sp GL1
        Zhongli Cui; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Nov. 2007, Peer-reviewed
      • Plant cell wall degradation by saprophytic Bacillus subtilis strains: Gene clusters responsible for rhamnogalacturonan depolymerization
        Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Akiko Kawamata; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Jun. 2007, Peer-reviewed
      • 細菌器官の分子移植と環境浄化
        橋本 渉; 丸山如江; 麻生祐司; 村田幸作
        化学と生物, 01 May 2007, Peer-reviewed
      • Cupredoxin-cancer interrelationship: Azurin binding with EphB2, interference in EphB2 tyrosine phosphorylation, and inhibition of cancer growth
        Anita Chaudhari; Magdy Mahfouz; Arsenio M. Fialho; Tohru Yamada; Ana Teresa Granja; Yonghua Zhu; Wataru Hashimoto; Beatrix Schlarb-Ridley; Wonhwa Cho; Tapas K. Das Gupta; Ananda M. Chakrabarty
        BIOCHEMISTRY, Feb. 2007, Peer-reviewed
      • A structural factor responsible for substrate recognition by Bacillus sp GL1 xanthan lyase that acts specifically on pyruvated side chains of Xanthan
        Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        BIOCHEMISTRY, Jan. 2007, Peer-reviewed
      • Bacterial proteins and CpG-rich extrachromosomal DNA in potential cancer therapy
        Magdy Mahfouz; Wataru Hashimoto; Tapas K. Das Gupta; Ananda M. Chakrabarty
        PLASMID, Jan. 2007, Peer-reviewed
      • Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase complexed with substrate
        Takafumi Itoh; Wataru Hashimoto; Bunzo Mikami; Kousaku Murata
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Oct. 2006, Peer-reviewed
      • Structure of unsaturated rhamnogalacturonyl hydrolase complexed with substrate
        Takafumi Toh; Akihito Ochiai; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Sep. 2006, Peer-reviewed
      • A biosystem for alginate metabolism in Agrobacterium tumefaciens strain C58: Molecular identification of Atu3025 as an exotype family PL-15 alginate lyase
        Akihito Ochiai; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        RESEARCH IN MICROBIOLOGY, Sep. 2006, Peer-reviewed
      • Disrupting the entry barrier and attacking brain tumors - The role of the Neisseria H.8 epitope and the Laz protein
        Chang Soo Hong; Tohru Yamada; Wataru Hashimoto; Arsenio M. Fialho; Tapas K. Das Gupta; Ananda M. Chakrabarty
        CELL CYCLE, Aug. 2006, Peer-reviewed
      • A novel glycoside hydrolase family 105: The structure of family 105 unsaturated rhamnogalacturonyl hydrolase complexed with a disaccharide in comparison with family 88 enzyme complexed with the disaccharide
        Takafumi Itoh; Akihito Ochiai; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Jul. 2006, Peer-reviewed
      • テクノ・トレンド 「スーパー細菌」の創成とバイオレメディエーションへの応用
        宮本 裕希子; 橋本 渉; 村田 幸作
        バイオテクノロジージャーナル, Jul. 2006
      • Crystallization and preliminary crystallographic analysis of the family GH78 alpha-L-rhamnosidase RhaB from Bacillus sp GL1
        ZL Cui; Y Maruyama; B Mikami; W Hashimoto; K Murata
        ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS, Jul. 2006, Peer-reviewed
      • Sequence and analysis of the 46.6-kb plasmid pA1 from Sphingomonas sp A1 that corresponds to the typical IncP-1 beta plasmid backbone without any accessory gene
        KM Harada; Y Aso; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        PLASMID, Jul. 2006, Peer-reviewed
      • スーパー細菌の創成とバイオレメディエーションへの利用
        麻生祐司; 宮本裕希子; 橋本渉; 村田幸作
        月刊資源環境対策, 15 May 2006
      • 超チャネルの分子移植による環境浄化型「スーパー細菌」の創成
        宮本裕希子; 麻生祐司; 橋本渉; 村田幸作
        ブレインテクノニュース, 15 May 2006
      • Substrate recognition by unsaturated glucuronyl hydrolase from Bacillus sp GLI
        T Toh; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, May 2006, Peer-reviewed
      • Crystallization and preliminary X-ray analysis of an exotype alginate lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens strain C58, a member of polysaccharide lyase family 15
        A Ochiai; M Yamasaki; B Mikami; W Hashimoto; K Murata
        ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, May 2006, Peer-reviewed
      • Crystallization and preliminary X-ray analysis of the rhamnogalacturonan lyase YesW from Bacillus subtilis strain 168, a member of polysaccharide lyase family 11
        A Ochiai; M Yamasaki; T Itoh; B Mikami; W Hashimoto; K Murata
        ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS, May 2006, Peer-reviewed
      • Crystallization and preliminary X-ray analysis of an exotype alginate lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens strain C58, a member of polysaccharide lyase family 15
        Akihito Ochiai; Masayuki Yamasaki; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications, May 2006, Peer-reviewed
      • Overexpression, purification and preliminary X-ray analysis of pullulanase from Bacillus subtilis strain 168
        D Malle; T Itoh; W Hashimoto; K Murata; S Utsumi; B Mikami
        ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, Apr. 2006, Peer-reviewed
      • Overexpression, purification and preliminary X-ray analysis of pullulanase from Bacillus subtilis strain 168
        Dominggus Malle; Takafumi Itoh; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata; Shigeru Utsumi; Bunzo Mikami
        Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications, Apr. 2006, Peer-reviewed
      • Engineered membrane superchannel improves bioremediation potential of dioxin-degrading bacteria
        Y Aso; Y Miyamoto; KM Harada; K Momma; S Kawai; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        NATURE BIOTECHNOLOGY, Feb. 2006, Peer-reviewed
      • 巨大な口を開けるスーパー細菌−超チャネルの移植
        宮本裕希子; 橋本 渉; 村田幸作
        バイオニクス, No. 4, 70-71, 2006
      • Degradation of rice bran hemicellulose by Paenibacillus sp strain HC1: gene cloning, characterization and function of beta-D-glucosidase as an enzyme involved in degradation
        KM Harada; K Tanaka; Y Fukuda; W Hashimoto; K Murata
        ARCHIVES OF MICROBIOLOGY, Dec. 2005, Peer-reviewed
      • Proteomics-based identification of outer-membrane proteins responsible for import of macromolecules in Sphingonionas sp A1: Alginate-binding flagellin on the cell surface
        W Hashimoto; JS He; Y Wada; H Nankai; B Mikami; K Murata
        BIOCHEMISTRY, Oct. 2005, Peer-reviewed
      • A structural basis for depolymerization of alginate by polysaccharide lyase family-7
        M Yamasaki; K Ogura; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Sep. 2005, Peer-reviewed
      • Crystal structure of Bacillus sp GL1 xanthan lyase complexed with a substrate: Insights into the enzyme reaction mechanism
        Y Maruyama; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Jul. 2005, Peer-reviewed
      • Direct evidence for Sphingomonas sp A1 periplasmic proteins as macromolecule-binding proteins associated with the ABC transporter: Molecular insights into alginate transport in the periplasm
        K Momma; Y Mishima; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        BIOCHEMISTRY, Apr. 2005, Peer-reviewed
      • Structure and function of bacterial super-biosystem responsible for import and depolymerization of macromolecules
        W Hashimoto; K Momma; Y Maruyama; M Yamasaki; B Mikami; K Murata
        BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Apr. 2005, Peer-reviewed
      • Crystallization and preliminary X-ray analysis of alginate lyases A1-II and A1-II ' from Sphingomonas sp A1
        M Yamasaki; K Ogura; S Moriwaki; W Hashimoto; K Murata; B Mikami
        ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS, Mar. 2005, Peer-reviewed
      • NAD-binding mode and the significance of intersubunit contact revealed by the crystal structure of Mycobacterium tuberculosis NAD kinase-NAD complex
        S Mori; M Yamasaki; Y Maruyama; K Momma; S Kawai; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Feb. 2005, Peer-reviewed
      • Molecular identification of Sphingomonas sp A1 alginate lyase (A1-IV ') as a member of novel polysaccharide lyase family 15 and implications in alginate lyase evolution
        W Hashimoto; O Miyake; A Ochiai; K Murata
        JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, Jan. 2005, Peer-reviewed
      • NADキナーゼのリン酸受容体特異性と構造との相関
        森 茂太郎; 河井重幸; 橋本 渉; 三上文三; 村田幸作
        応用微生物学研究, 3(2), 183-189, 2005
      • 原核型グルコキナーゼと真核型ヘキソキナーゼの進化相関
        向井貴子; 河井重幸; 森 茂太郎; 橋本 渉; 三上文三; 村田幸作
        応用微生物学研究, 3(1), 149-157, 2005
      • Super-channel in bacteria: Structural and functional aspects of a novel biosystem for the import and depolymerization of macromolecules
        W Hashimoto; M Yamasaki; T Itoh; K Momma; B Mikami; K Murata
        JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, Dec. 2004, Peer-reviewed
      • Molecular identification and characterization of an alginate-binding protein on the cell surface of Sphingomonas sp A1
        JS He; H Nankai; W Hashimoto; K Murata
        BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Sep. 2004, Peer-reviewed
      • Structure and function of a hypothetical Pseudomonas aeruginosa protein PA1167 classified into family PL-7 - A novel alginate lyase with a beta-sandwich fold
        M Yamasaki; S Moriwaki; O Miyake; W Hashimoto; K Murata; B Mikami
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Jul. 2004, Peer-reviewed
      • Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase, responsible for the degradation of glycosaminoglycan, from Bacillus sp GL1 at 1.8 angstrom resolution
        T Itoh; S Akao; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Jul. 2004, Peer-reviewed
      • Origin and diversity of alginate lyases of families PL-5 and-7 in Sphingomonas sp strain A1
        O Miyake; A Ochiai; W Hashimoto; K Murata
        JOURNAL OF BACTERIOLOGY, May 2004, Peer-reviewed
      • Posttranslational processing of polysaccharide lyase: maturation route for gellan lyase in Bacillus sp GL1
        O Miyake; E Kobayashi; H Nankai; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Feb. 2004, Peer-reviewed
      • Crystallographic studies of Mycobacterium tuberculosis polyphosphate/ATP- NAD kinase complexed with NAD
        Shigetarou Mori; Masayuki Yamasaki; Yukie Maruyama; Keiko Momma; Shigeyuki Kawai; Wataru Hashimoto; Bunzo Mikami; Kousaku Murata
        Journal of Bioscience and Bioengineering, 2004, Peer-reviewed
      • 細菌アルギン酸リアーゼの分子多様性、進化、およびX線結晶構造に関する研究
        三宅 統; 山崎正幸; 河井重幸; 橋本 渉; 三上文三; 村田幸作
        応用微生物学研究, 2 (2), 103-111, 2004
      • ブタ腎臓由来N-アシル-D-グルコサミン 2-エピメラーゼの構造、機能及び工業的利用に関する研究
        丸 勇史; 大西 淳; 太田泰弘; 伊藤貴文; 橋本 渉; 三上文三; 村田幸作
        応用微生物学研究, 2 (1), 12-21, 2004
      • 細菌の形態形成制御と高分子物質の輸送・分解機構に関する構造生物学的研究
        橋本 渉
        日本農藝化學會誌 = Journal of the Agricultural Chemical Society of Japan, 01 Dec. 2003
      • Crystallization and preliminary X-ray analysis of alginate lyase, a member of family PL-7, from Pseudomonas aeruginosa
        M Yamasaki; S Moriwaki; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY, Aug. 2003, Peer-reviewed
      • Molecular identification of an alpha-L-rhamnosidase from Bacillus sp strain GL1 as an enzyme involved in complete metabolism of gellan
        W Hashimoto; O Miyake; H Nankai; K Murata
        ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Jul. 2003, Peer-reviewed
      • A novel member of glycoside hydrolase family 88: overexpression, purification, and characterization of unsaturated beta-glucuronyl hydrolase of Bacillus sp GL1
        S Mori; S Akao; H Nankai; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION, May 2003, Peer-reviewed
      • An exotype alginate lyase in Sphingomonas sp Al: overexpression in Escherichia coli, purification, and characterization of alginate lyase IV (A1-IV)
        O Miyake; W Hashimoto; K Murata
        PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION, May 2003, Peer-reviewed
      • Crystallization and preliminary X-ray analysis of a novel unsaturated glucuronyl hydrolase from Bacillus sp GL1
        S Mori; S Akao; O Miyake; H Nankai; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY, May 2003, Peer-reviewed
      • 微生物の「超チャネル」 : 細胞の高分子利用戦略
        橋本 渉; 三上 文三; 村田 幸作
        バイオサイエンスとインダストリー = Bioscience & industry, 01 Apr. 2003
      • 細菌における巨大分子利用の高次バイオシステム
        橋本 渉; 三上文三; 村田幸作
        バイオサイエンスとインダストリー = Bioscience & industry, 01 Apr. 2003
      • Crystal structure of Bacillus sp GL1 xanthan lyase, which acts on the side chains of xanthan
        W Hashimoto; H Nankai; B Mikami; K Murata
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Feb. 2003, Peer-reviewed
      • Crystal structure of AlgQ2, a macromolecule (alginate)-binding protein of Sphingomonas sp A1, complexed with an alginate tetrasaccharide at 1.6-A resolution
        Y Mishima; K Momma; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Feb. 2003, Peer-reviewed
      • Structural and biological studies on the regulation of cell morphology and macromolecule import/depolymerization systems of bacteria
        W Hashimoto
        NIPPON NOGEIKAGAKU KAISHI-JOURNAL OF THE JAPAN SOCIETY FOR BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND AGROCHEMISTRY, 2003, Peer-reviewed
      • Sphingomonas sp. A1 株由来アルギン酸結合タンパク質の構造生物学的研究
        三島由美子; 門間敬子; 河井重幸; 橋本 渉; 三上文三; 村田幸作
        応用微生物学研究, 1 (2), 115-122, 2003
      • Bacillus sp. GL1におけるキサンタン分解系の酵素学的・遺伝学的解析、及びキサンタンリアーゼのX線結晶構造解析
        南海浩一; 河井重幸; 橋本 渉; 三上文三; 村田幸作
        応用微生物学研究, 1 (1), 26-34, 2003
      • 微生物のポリリン酸/ATP-NADキナーゼとATP-NADキナーゼ
        河井重幸; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        応用微生物学研究, 1 (1), 18-25, 2003
      • グルタチオンと対数期初期細胞を用いる酵母Saccharomyces cerevisiaeの簡便、迅速、高効率形質転換法
        葉山善幸; 福田泰樹; 河井重幸; 橋本渉; 村田幸作
        ビタミン, 2003
      • Extremely simple, rapid, and highly efficient transformation method for the yeast Saccharomyces cerevisiae using glutathione and early log phase cells
        Y Hayama; Y Fukuda; S Kawai; W Hashimoto; K Murata
        JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, Aug. 2002, Peer-reviewed
      • 細菌『超チャネル』の構造と高分子輸送機能
        橋本 渉; 三上文三; 村田幸作
        生化学, 25 Jul. 2002, Peer-reviewed
      • Structure and function of bacterial "Super-channel" for macromolecule import
        W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        SEIKAGAKU, Jul. 2002, Peer-reviewed
      • Molecular identification of family 38 alpha-mannosidase of Bacillus sp strain GL1, responsible for complete depolymerization of xanthan
        H Nankai; W Hashimoto; K Murata
        APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Jun. 2002, Peer-reviewed
      • Crystal structure of AlgQ2, a macromolecule (alginate)-binding protein of Sphingomonas sp A1 at 2.0 angstrom resolution
        K Momma; B Mikami; Y Mishima; W Hashimoto; K Murata
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Mar. 2002, Peer-reviewed
      • A super-channel in bacteria: Macromolecule uptake and depolymerization systems of Sphingomonas sp A1 with a special cell surface structure
        Y Mishima; K Momma; O Miyake; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        BIOTECHNOLOGY & GENETIC ENGINEERING REVIEWS, VOL 19, 2002, Peer-reviewed
      • Super-channel in bacteria: function and structure of the macromolecule import system mediated by a pit-dependent ABC transporter
        Y Mishima; K Momma; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, Nov. 2001, Peer-reviewed
      • Super-channel in bacteria: Function and structure of a macromolecule import system mediated by a pit-dependent ABC transporter
        W Hashimoto; K Momma; Y Mishima; B Mikami; K Murata
        BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Sep. 2001, Peer-reviewed
      • Molecular characterization of Escherichia coli NAD kinase
        S Kawai; S Mori; T Mukai; W Hashimoto; K Murata
        EUROPEAN JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, Aug. 2001, Peer-reviewed
      • Crystallization and preliminary X-ray analysis of AlgS, a bacterial ATP-binding cassette (ABC) protein specific to macromolecule import
        Y Mishima; K Momma; W Hashimoto; B Mikami; K Murata
        ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY, Jun. 2001, Peer-reviewed
      • Crystal structure of alginate lyase A1-III complexed with trisaccharide product at 2.0 angstrom resolution
        HJ Yoon; W Hashimoto; O Miyake; K Murata; B Mikami
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Mar. 2001, Peer-reviewed
      • 食研講演会要旨 超チャネルの構造と高分子輸送機能
        橋本 渉
        京都大学食糧科学研究所報告, Mar. 2001
      • Effect of His192 mutation on the activity of alginate lyase A1-III from Sphingomonas species A1
        HJ Yoon; YJ Choi; O Miyake; W Hashimoto; K Murata; B Mikami
        JOURNAL OF MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, Feb. 2001, Peer-reviewed
      • Polysaccharide lyase: Molecular cloning, sequencing, and overexpression of the xanthan lyase gene of Bacillus sp strain GL1
        W Hashimoto; H Miki; N Tsuchiya; H Nankai; K Murata
        APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Feb. 2001, Peer-reviewed
      • Identification of an antifungal substance derived from the oil-based extract of licorice
        J. Sato; S. Kawai; W. Hashimoto; K. Murata; K. Goto; F. Nanjo
        Biocontrol Science, 2001, Peer-reviewed
      • Crystal structure of N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase from porcine kidney at 2.0 angstrom resolution
        T Itoh; B Mikami; Maru, I; Y Ohta; W Hashimoto; K Murata
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Nov. 2000, Peer-reviewed
      • Inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase of Micrococcus flavus and Mycobacterium tuberculosis H37Rv
        S Kawai; S Mori; T Mukai; S Suzuki; T Yamada; W Hashimoto; K Murata
        BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Sep. 2000, Peer-reviewed
      • Safety assessment of rice genetically modified with soybean glycinin by feeding studies on rats
        K Momma; W Hashimoto; HJ Yoon; S Ozawa; Y Fukuda; S Kawai; F Takaiwa; S Utsumi; K Murata
        BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Sep. 2000, Peer-reviewed
      • Molecular identification of oligoalginate lyase of Sphingomonas sp strain A1 as one of the enzymes required for complete depolymerization of alginate
        W Hashimoto; O Miyake; K Momma; S Kawai; K Murata
        JOURNAL OF BACTERIOLOGY, Aug. 2000, Peer-reviewed
      • A novel bacterial ATP-binding cassette transporter system that allows uptake of macromolecules
        K Momma; M Okamoto; Y Mishima; S Mori; W Hashimoto; K Murata
        JOURNAL OF BACTERIOLOGY, Jul. 2000, Peer-reviewed
      • Overexpression in Escherichia coli, purification, and characterization of Sphingomonas sp A1 alginate lyases
        HJ Yoon; W Hashimoto; O Miyake; M Okamoto; B Mikami; K Murata
        PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION, Jun. 2000, Peer-reviewed
      • Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of alginate lyase A1-II from Sphingomonas species A1.
        H J Yoon; W Hashimoto; Y Katsuya; Y Mezaki; K Murata; B Mikami
        Biochimica et biophysica acta, 09 Feb. 2000
      • Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of alginate lyase Al-II from Sphingomonas species Al
        HJ Yoon; W Hashimoto; Y Katsuya; Y Mezaki; K Murata; B Mikami
        BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEIN STRUCTURE AND MOLECULAR ENZYMOLOGY, Feb. 2000, Peer-reviewed
      • 高分子を鵜呑みにする細菌-体腔依存高分子取り込みABCトランスポーターの構造と機能-
        橋本 渉; 村田幸作
        Bull. Res. Inst. Food Sci. Kyoto University, No.63, 64-65, 2000
      • Polyphosphate kinase, polyphosphate-glucokinase, and polyphosphate-NAD kinase in microorganisms and their applications.
        S. Kawai; T. Mukai; S. Mori; S. Suzuki; W. Hashimoto; K. Murata
        Research Advances in Bioscience and Bioengineering, 2000, Peer-reviewed
      • Safety assessment of transgenic potatoes with soybean glycinin by feeding studies in rats
        W Hashimoto; K Momma; HJ Yoon; S Ozawa; Y Ohkawa; T Ishige; M Kito; S Utsumi; K Murata
        BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Nov. 1999, Peer-reviewed
      • Special cell surface structure, and novel macromolecule transport/depolymerization system of Sphingomonas sp A1
        K Momma; W Hashimoto; O Miyake; HJ Yoon; S Kawai; Y Mishima; B Mikami; K Murata
        JOURNAL OF INDUSTRIAL MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, Oct. 1999, Peer-reviewed
      • Safety assessment of genetically engineered potatoes with designed soybean glycinin: compositional analyses of the potato tubers and digestibility of the newly expressed protein in transgenic potatoes
        W Hashimoto; K Momma; T Katsube; Y Ohkawa; T Ishige; M Kito; S Utsumi; K Murata
        JOURNAL OF THE SCIENCE OF FOOD AND AGRICULTURE, Sep. 1999, Peer-reviewed
      • Unsaturated glucuronyl hydrolase of Bacillus sp GL1: Novel enzyme prerequisite for metabolism of unsaturated oligosaccharides produced by polysaccharide lyases
        W Hashimoto; E Kobayashi; H Nankai; N Sato; T Miya; S Kawai; K Murata
        ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Aug. 1999, Peer-reviewed
      • Characterization of alpha-L-rhamnosidase of Bacillus sp GL1 responsible for the complete depolymerization of gellan
        W Hashimoto; H Nankai; N Sato; S Kawai; K Murata
        ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Aug. 1999, Peer-reviewed
      • Crystal structure of alginate lyase A1-III from Sphingomonas species A1 at 1.78 angstrom resolution
        HJ Yoon; B Mikami; W Hashimoto; K Murata
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Jul. 1999, Peer-reviewed
      • Microbial system for polysaccharide depolymerization: enzymatic route for xanthan depolymerization by Bacillus sp strain GL1
        H Nankai; W Hashimoto; H Miki; S Kawai; K Murata
        APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Jun. 1999, Peer-reviewed
      • 細菌における多糖の取り込みと資化
        橋本渉; 村田幸作
        京都大学食糧科学研究所報告, 31 Mar. 1999
      • Glutathione metabolism in Escherichia coli
        H Suzuki; W Hashimoto; H Kumagai
        JOURNAL OF MOLECULAR CATALYSIS B-ENZYMATIC, Mar. 1999, Peer-reviewed
      • 遺伝子組換え食品の安全性
        門間敬子; 橋本 渉; 村田幸作
        日本醸造協会誌, Feb. 1999
      • Enzymatic and genetic bases on assimilation, depolymerization, and transport of heteropolysaccharides in bacteria
        W Hashimoto; K Momma; H Miki; Y Mishima; E Kobayashi; O Miyake; S Kawai; H Nankai; B Mikami; K Murata
        JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, Feb. 1999, Peer-reviewed
      • Quality and safety evaluation of genetically engineered rice with soybean glycinin: Analyses of the grain composition and digestibility of glycinin in transgenic rice
        K Momma; W Hashimoto; S Ozawa; S Kawai; T Katsube; F Takaiwa; M Kito; S Utsumi; K Murata
        BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Feb. 1999, Peer-reviewed
      • 体腔形成細菌:高分子物質の巧妙な食べ方
        橋本 渉; 門間敬子; 南海浩一; 村田幸作
        人間環境科学, 1999
      • Molecular cloning of two genes for beta-D-glucosidase in Bacillus sp. GL1 and identification of one as a gellan-degrading enzyme
        W Hashimoto; H Miki; H Nankai; N Sato; S Kawai; K Murata
        ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Dec. 1998, Peer-reviewed
      • ヘテロ多糖を食べる細菌
        橋本 渉; 門間敬子; 村田幸作
        化学と生物, 25 Nov. 1998, Peer-reviewed
      • 遺伝子組み換え食品の品質と安全性
        橋本渉; 小沢祥子; 門間敬子; 村田幸作
        日本調理科学会誌, Nov. 1998, Peer-reviewed
      • Xanthan lyase of Bacillus sp. strain GL1 liberates pyruvylated mannose from xanthan side chains
        W Hashimoto; H Miki; N Tsuchiya; H Nankai; K Murata
        APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Oct. 1998, Peer-reviewed
      • Safety assessment of genetically engineered food: Detection and monitoring of glyphosate-tolerant soybeans
        N Shirai; K Momma; S Ozawa; W Hashimoto; M Kito; S Utsumi; K Murata
        BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Jul. 1998, Peer-reviewed
      • Polysaccharide lyase: Molecular cloning of gellan lyase gene and formation of the lyase from a huge precursor protein in Bacillus sp. GL1
        W Hashimoto; N Sato; S Kimura; K Murata
        ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Jun. 1998, Peer-reviewed
      • alpha-L-rhamnosidase of Sphingomonas sp. R1 producing an unusual exopolysaccharide of sphingan
        W Hashimoto; K Murata
        BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Jun. 1998, Peer-reviewed
      • Sphingomonas sp. A1 lyase active on both poly-beta-D-mannuronate and heteropolymeric regions in alginate
        W Hashimoto; M Okamoto; T Hisano; K Momma; K Murata
        JOURNAL OF FERMENTATION AND BIOENGINEERING, 1998, Peer-reviewed
      • Safety assessment of genetically engineered yeast: elimination of mutagenicity of the yeast Saccharomyces cerevisiae by decreasing the activity of methylglyoxal synthase
        W Hashimoto; T Inose; K Masuda; K Murata
        INTERNATIONAL JOURNAL OF FOOD SCIENCE AND TECHNOLOGY, Dec. 1997, Peer-reviewed
      • Microbial system for polysaccharide depolymerization: Enzymatic route for gellan depolymerization by Bacillus sp. GL1
        W Hashimoto; K Maesaka; N Sato; S Kimura; K Yamamoto; H Kumagai; K Murata
        ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Mar. 1997, Peer-reviewed
      • Analysis of low temperature inducible mechanism of gamma-glutamyltranspeptidase of Escherichia coli K-12
        W Hashimoto; H Suzuki; K Yamamoto; H Kumagai
        BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, Jan. 1997, Peer-reviewed
      • 酵素2-エピメラーゼの生物学的機能
        橋本 渉; 村田幸作
        Bull. Res. Inst. Food Sci. Kyoto University, No.60, 126-128, 1997
      • 21世紀の農業の期待と社会的受容(遺伝子組み換え食品の現状と安全性)
        橋本 渉; 村田幸作
        デイリーフード. 春季号(大豆と技術), 4, 14-19, 1997
      • Growth repression of yeast and fungus by bacterial DNAs: A possible physiological function of DNA other than as a carriage of genetic information
        K Matsutani; Y Fukuda; N Yajima; W Hashimoto; K Murata
        JOURNAL OF FERMENTATION AND BIOENGINEERING, 1997, Peer-reviewed
      • Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase from porcine kidney
        Maru, I; J Ohnishi; Y Ohta; W Hashimoto; Y Tsukada; K Murata; B Mikami
        JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, Sep. 1996, Peer-reviewed
      • A preliminary description of the crystal structure of gamma-glutamyltranspeptidase from E-coli K-12
        H Sakai; N Sakabe; K Sasaki; W Hashimoto; H Suzuki; H Tachi; H Kumagai; K Sakabe
        JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, Jul. 1996, Peer-reviewed
      • Purification and characterization of microbial gellan lyase
        W Hashimoto; T Inose; H Nakajima; N Sato; S Kimura; K Murata
        APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, Apr. 1996, Peer-reviewed
      • Pit structure on bacterial cell surface
        T Hisano; N Kimura; W Hashimoto; K Murata
        BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Mar. 1996, Peer-reviewed
      • 細菌の多糖リアーゼ:酵素学的,遺伝学的側面と医薬への応用
        村田幸作; 橋本渉
        日本応用酵素協会誌, 1996
      • Mapping, cloning, and DNA sequencing of pepB which encodes peptidase B of Escherichia coli K-12
        H Suzuki; ES Kim; N Yamamoto; W Hashimoto; K Yamamoto; H Kumagai
        JOURNAL OF FERMENTATION AND BIOENGINEERING, 1996, Peer-reviewed
      • EFFECT OF SITE-DIRECTED MUTATIONS ON PROCESSING AND ACTIVITY OF GAMMA-GLUTAMYL-TRANSPEPTIDASE OF ESCHERICHIA-COLI K-12
        W HASHIMOTO; H SUZUKI; K YAMAMOTO; H KUMAGAI
        JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, Jul. 1995, Peer-reviewed
      • BOTH LARGE AND SMALL SUBUNITS ARE ESSENTIAL FOR THE ENZYMATIC-ACTIVITY OF GAMMA-GLUTAMYL-TRANSPEPTIDASE OF ESCHERICHIA-COLI K-12
        H SUZUKI; W HASHIMOTO; S NOHARA; H TACHI; T MONJI; K YAMAMOTO; H KUMAGAI
        FASEB JOURNAL, Apr. 1995, Peer-reviewed
      • Subunit association of -glutamyltranspeptidase of ┣DBEscherichia coli(/)-┫DB
        Wataru Hashimoto; Hideyuki Suzuki; Satoko Nohara; Hiromi Tachi; Kenji Yamamoto; Hidehiko Kumagai
        Journal of Biochemistry,118/6,1216-1223, 1995, Peer-reviewed
      • CRYSTALLIZATION AND PRELIMINARY-X-RAY ANALYSIS OF GAMMA-GLUTAMYL-TRANSPEPTIDASE FROM ESCHERICHIA-COLI K-12
        H KUMAGAI; S NOHARA; H SUZUKI; W HASHIMOTO; K YAMAMOTO; H SAKAI; K SAKABE; K FUKUYAMA; N SAKABE
        JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, Dec. 1993, Peer-reviewed
      • ESCHERICHIA-COLI K-12 CAN UTILIZE AN EXOGENOUS GAMMA-GLUTAMYL PEPTIDE AS AN AMINO-ACID SOURCE, FOR WHICH GAMMA-GLUTAMYL-TRANSPEPTIDASE IS ESSENTIAL
        H SUZUKI; W HASHIMOTO; H KUMAGAI
        JOURNAL OF BACTERIOLOGY, Sep. 1993, Peer-reviewed
      • ESCHERICHIA-COLI GAMMA-GLUTAMYL-TRANSPEPTIDASE MUTANTS DEFICIENT IN PROCESSING TO SUBUNITS
        W HASHIMOTO; H SUZUKI; S NOHARA; H KUMAGAI
        BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, Nov. 1992, Peer-reviewed
      • Molecular cloning and DNA sequence of Escherichia coli K-12 .GAMMA.-glutamyltranspeptidase gene, ggt, and excretion of .GAMMA.-glutamyltranspeptidase.
        SUZUKI H; KUMAGAI H; HASHIMOTO W; CLAUDIO J O; TOCHIKURA T
        Front New Horiz Amino Acid Res, 1992, Peer-reviewed

      Misc.

      • 海洋酵母と細菌の共生による海藻多糖アルギン酸の利用
        中田翔太; 高瀬隆一; 河井重幸; 渡辺大輔; 橋本渉
        日本農芸化学会西日本支部大会およびシンポジウム講演要旨集, 2021
      • 2B17-2 Molecular conversion of rhamnogalacturonan lyase with exo-type into endo-type
        OCHIAI Akihito; MIKAMI Bunzo; HASHIMOTO Wataru; MURATA Kousaku
        日本生物工学会大会講演要旨集, 2007
      • 2C14-5 Crystallization of alginate lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens C58
        OCHIAI Akihito; HASHIMOTO Wataru; MIKAMI Bunzo; MURATA Kousaku
        日本生物工学会大会講演要旨集, 2005
      • 2C15-1 Structural basis of depolymerization of alginate by PL-7
        OGURA Kohei; YAMASAKI Masayuki; HASHIMOTO Wataru; MIKAMI Bunzo; MURATA Kousaku
        日本生物工学会大会講演要旨集, 2005
      • 2C15-2 Structural Basis for Catalytic Mechanism in Unsaturated Glucuronyl Hydrolase
        ITOH Takafumi; HASHIMOTO Wataru; MIKAMI Bunzo; MURATA Kousaku
        日本生物工学会大会講演要旨集, 2005
      • 3A11-3 Creation of a bioremediative super-bug by transplantation of the super-channel
        MIYAMOTO Yukiko; ASO Yuji; HASHIMOTO Wataru; MURATA Kousaku
        日本生物工学会大会講演要旨集, 2005
      • 1pC14-2 Super channel in bacteria : Functional analysis of alginate granule binding protein expressed on cell surface
        HE Jinshan; NANKAI Hirokazu; HASHIMOTO Wataru; MURATA Kosaku
        日本生物工学会大会講演要旨集, 2004
      • 1pC14-3 Super-channel in bacteria : functional analysis of peptidoglycan hydrolase
        MOMMA Keiko; HIRONAKA Keiichirou; HASHIMOTO Wataru; MURATA Kousaku
        日本生物工学会大会講演要旨集, 2004
      • 1pC14-1 "Super-channel" in bacteria : localization and novel function of flagellin
        HASHIMOTO Wataru; HE Jinshan; MIKAMI Bunzo; MURATA Kousaku
        日本生物工学会大会講演要旨集, 2004
      • 1pC14-4 Diversity of alginate lyases in "super-channel"-forming bacteria and a novel polysaccharide lyase family PL-15
        MIYAKE Osamu; HASHIMOTO Wataru; MURATA Kousaku
        日本生物工学会大会講演要旨集, 2004
      • 536 ABC transporter for macromolecule (alginate) import : function and X-ray structural analysis of substrate-binding protein
        Mishima Yumiko; Momma Keiko; Hashimoto Wataru; Mikami Bunzo; Murata Kousaku
        日本生物工学会大会講演要旨集, 2002
      • 535 Structure and function of polysaccharide lyases : structure of active cleft of xanthan lyase from Bacillus sp. GL1
        Hashimoto Wataru; Nankai Hirokazu; Mikami Bunzo; Murata Kousaku
        日本生物工学会大会講演要旨集, 2002
      • 窒素固定細菌の細胞外膜由来膜小胞に関するプロテオーム解析
        髙瀬 隆一; 吉田 暢広; 橋本 渉
        第67回日本生化学会近畿支部例会, May 2021, Last author, Corresponding author
      • 動物宿主多糖由来不飽和ウロン酸を代謝する腸内優占菌 酵素の構造と機能
        髙瀬 隆一; 幸田 有希渚; 渡辺 大輔; 橋本 渉
        第21回関西グライコサイエンスフォーラム, May 2021, Last author, Corresponding author
      • Novel hyaluronate lyase involved in pathogenicity of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis
        Van An Nguyen; Kohei Ogura; Miki Matsue; Norihiko Takemoto; Wataru Hashimoto; Shigefumi Okamoto; Hiroshi Ichimura
        第94回日本細菌学会総会, Mar. 2021
      • ヒト腸内優占Bacteroides属細菌による動物宿主グリコサミノグリカン由来不飽和ウロン酸の代謝
        高瀬 隆一; 幸田 有希渚; 渡辺 大輔; 橋本 渉
        日本農芸化学会2021年度大会, Mar. 2021, Last author, Corresponding author
      • 大豆発芽時の植物-微生物間生存競争における種子からの抗菌性酢酸の生成
        長瀬 鮎美; 杉浦 春香; 渡辺 大輔; 橋本 渉
        日本農芸化学会2021年度大会, Mar. 2021, Last author, Corresponding author
      • ブドウ果皮共生菌によるワインの自然発酵促進
        渡辺 大輔; 橋本 渉
        日本農芸化学会2021年度大会, Mar. 2021, Last author, Corresponding author
      • 走化性発現に関わる細菌由来ペクチン結合タンパク質のドメインダイナミクス
        穴水 康太郎; 髙瀬 隆一; 日尾 守; 渡辺 大輔; 三上 文三; 橋本 渉
        日本農芸化学会2021年度大会, Mar. 2021, Last author, Corresponding author
      • ヒアルロン酸サプリメントに応答するヒト口腔内細菌叢の動態と病原性優占菌の新規な遺伝子クラスター
        藪内 駿; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部第514回講演会, Feb. 2021, Last author, Corresponding author
      • ヒト腸内細菌叢による海藻多糖アルギン酸の分解と単離菌のゲノム構造
        宮本 侑季; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部第514回講演会, Feb. 2021, Last author, Corresponding author
      • 食事非依存的環境における腸内細菌叢の動態シミュレーション
        梶川 幹太; 佐藤 賢宏; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部第513回講演会, Nov. 2020, Last author, Corresponding author
      • プロバイオティクス性乳酸菌由来不飽和ウロン酸代謝の初発酵素KduIのX線結晶構造解析
        山本 雄大; 髙瀬 隆一; 岩瀬 久夢; 渡辺 大輔; 三上 文三; 橋本 渉
        日本応用糖質科学会第46回近畿支部会, Nov. 2020, Last author, Corresponding author
      • 走化性発現に関わる細菌由来ペクチン認識タンパク質の立体構造
        穴水 康太郎; 髙瀬 隆一; 日尾 守; 渡辺 大輔; 三上 文三; 橋本 渉
        第93回日本生化学会大会, Sep. 2020, Last author, Corresponding author
      • 動物宿主由来多糖を資化する腸内優占菌の膜小胞形成
        幸田 有希渚; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 野村 暢彦; 橋本 渉
        第93回日本生化学会大会, Sep. 2020, Last author, Corresponding author
      • ブドウ果皮に由来する酵母様真菌Aureobasidium pullulans の炭素代謝特性
        渡辺 大輔; 橋本 渉
        第53回酵母遺伝学フォーラム研究報告会, Sep. 2020, Last author, Corresponding author
      • 海洋由来酵母による褐藻類主要成分マンニトールからの油脂生産
        中田 翔太; 日尾 守; 髙瀬 隆一; 河井 重幸; 渡辺 大輔; 橋本 渉
        日本農芸化学会2020年度大会, Mar. 2020
      • 生大豆が納豆菌に応答して抗菌物質を生産・分泌する
        長瀬 鮎美; 杉浦 春香; 渡辺 大輔; 橋本 渉
        日本農芸化学会2020年度大会, Mar. 2020
      • アルコール発酵に適した酵母とは:醸造用酵母から得られる学び
        渡辺 大輔; 橋本 渉
        日本農芸化学会2020年度大会, Mar. 2020
      • ブドウ果皮常在酵母の同定とワイン醸造における役割
        渡辺 大輔; 橋本 渉
        日本農芸化学会2020年度大会, Mar. 2020
      • 宿主細胞外多糖ヒアルロン酸の分解によるヒト口腔内常在細菌叢の形成
        藪内 駿; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部第512回講演会, Feb. 2020
      • 子宮内無菌仮説の例外としてのB群連鎖球菌による宿主細胞外多糖の資化
        佐藤 賢宏; 老木 紗予子; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部第512回講演会, Feb. 2020
      • プロバイオティクス性Bacteroides属細菌による次世代発酵乳
        山本 雄大; 佐藤 賢宏; 髙瀬 隆一; 渡辺 大輔; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部第511回講演会, Dec. 2019
      • 海洋微生物コミュニティによる褐藻類の利用
        中田 翔太; 日尾 守; 髙瀬 隆一; 河井 重幸; 渡辺 大輔; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西・中部支部2019年度合同大会(第510回記念講演会), Sep. 2019
      • 動物細胞外粘性物質を窒素源として利用する腸内優占菌とそのプロバイオティクスへの応用
        梶川 幹太; 佐藤 賢宏; 髙瀬 隆一; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西・中部支部2019年度合同大会(第510回記念講演会), Sep. 2019
      • フソバクテリアによる宿主動物由来細胞外グリコサミノグリカンの認識
        老木 紗予子; 藪内 駿; 三上 文三; 高瀬 隆一; 橋本 渉
        第92回日本生化学会大会, Sep. 2019
      • Uncovering the Crucial Property of 4-Deoxy-L-erythro-5-hexoseulose Uronate for the Utilization of Alginate, a Promising Marine Biomass
        Shigeyuki Kawai; Shota Nakata; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        the 29th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology, Aug. 2019
      • 大豆上で納豆菌の細胞極に生じる巨大な洞穴の発見とその形成に関わる遺伝子の同定
        長瀬 鮎美; 杉浦 春香; 南部 優子; 髙瀬 隆一; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部第509回講演会, Jul. 2019
      • 腸内細菌叢による食品添加物多糖の分解と分解菌の性状
        宮本 侑季; 髙瀬 隆一; 橋本 渉
        日本生化学会66回近畿支部例会, May 2019
      • 褐藻類多糖アルギン酸を資化する海洋微生物のエコシステム
        日尾 守; 中田 翔太; 髙瀬 隆一; 橋本 渉
        第20回関西グライコサイエンスフォーラム, May 2019
      • 細菌由来金属輸送EfeUOB系構成アルギン酸結合タンパク質のレアメタル結合性
        奥村 憲史; 三上 文三; 村田 幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2019年度大会, Mar. 2019
      • 次世代プロバイオティクスBacteroides属細菌による動物宿主由来粘液物質の資化と腸内優占性
        佐藤 賢宏; 久門 知也; 梶川 幹太; 村田 幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2019年度大会, Mar. 2019
      • 代謝改変酵母における転写コリプレッサーTup1-Cyc8とアルギン酸由来モノウロン酸DEHの代謝
        松岡 史也; 柏原 貴幸; 中田 翔太; 村田 幸作; 橋本 渉; 河井 重幸
        日本農芸化学会2019年度大会, Mar. 2019
      • SDGsにおける微生物の貢献〜エネルギー・環境保全対策を中心に〜
        橋本 渉; 河井 重幸; 村田 幸作
        日本農芸化学会2019年度大会, Mar. 2019, Invited
      • 腸内日和見菌Clostridium perfringensにおける網羅的な遺伝子発現解析と病原因子ヒアルロン酸分解酵素の分子同定
        久門 知也; 老木 紗予子; 村田 幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部第507回講演会, Feb. 2019
      • Sphingomonas属細菌A1株の多糖を介した海藻への走化性と藻体からのバイオエタノール生産
        日尾 守; 小西 英仁; 奥村 憲史; 村田 幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部第507回講演会, Feb. 2019
      • 代謝改変出芽酵母によるアルギン酸由来モノウロン酸DEHの代謝
        松岡 史也; 柏原 貴幸; 中田 翔太; 村田 幸作; 橋本 渉; 河井 重幸
        第6回リン化合物討論会, Dec. 2018
      • 褐藻主要炭素源アルギン酸のモノマー化戦略
        中田 翔太; 平山 誠; 村田 幸作; 橋本 渉; 河井 重幸
        日本農芸化学会関西支部第506回講演会, Dec. 2018
      • Sphingomonas属細菌A1株由来アルギン酸結合タンパク質:EFハンド様モチーフに結合するカルシウムが構造を安定化する
        奥村 憲史; 丸山 如江; 三上 文三; 村田 幸作; 橋本 渉
        第91回日本生化学会大会, Sep. 2018, Peer-reviewed
      • ヒト細胞外マトリックス由来断片化ヒアルロン酸を取り込む連鎖球菌ホスホトランスフェラーゼ系
        老木 紗予子; 村田 幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部大会(第505回講演会), Sep. 2018
      • 窒素固定細菌Azotobacter vinelandiiによる「廃グリセロール」からの有用ポリマー生産
        吉田 暢広; 菅原 良実; 南部 優子; 村田 幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部大会(第505回講演会), Sep. 2018
      • 多糖を取り込む細菌ABCトランスポーター
        丸山 如江; 村田 幸作; 橋本 渉
        蛋白研セミナー& SPring-8 先端利用技術ワークショップ「第2回 SPring-8 における蛋白質構造生物学研究の現状と将来」, Aug. 2018, Invited
      • グリコサミノグリカンの輸送に関わる細菌タンパク質は二種類の基質結合型closed構造をとる
        老木紗予子; 佐藤賢宏; 蒲地玲子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2018年度大会, Mar. 2018
      • エキソ型アルギン酸リアーゼによる多糖アルギン酸の分解物DEHはアミノ基と非酵素的に反応する
        中田翔太; 松岡史也; 柏原貴幸; 村田幸作; 橋本 渉; 河井重幸
        日本農芸化学会2018年度大会, Mar. 2018
      • 発芽能のある大豆は納豆菌の増殖を抑制する
        杉浦春香; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2018年度大会, Mar. 2018
      • ヘパリンの分解と代謝に関わる乳酸菌酵素系の構造・機能解析
        岩瀬久夢; 山田章文; 河合桂吾; 老木 紗予子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部第502回講演会, Feb. 2018
      • 代謝改変酵母によるアルギン酸由来モノウロン酸DEHの代謝の機構と転写コリプレッサーTup1-Cyc8との関連
        松岡史也; 柏原貴幸; 中田翔太; 村田幸作; 橋本 渉; 河井重幸
        日本農芸化学会関西支部第502回講演会, Feb. 2018
      • 酸性多糖の輸送に関わる基質結合タンパク質とABCトランスポーターとの相互作用様式
        金子あい; 老木紗予子; 丸山如江; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉
        2017年度生命科学系学会合同年次大会(第90回日本生化学会大会), Dec. 2017
      • ヘテロなフラジェリンから構成されるSphingomonas属細菌A1株のべん毛形成と多糖ペクチン資化・走化性発現
        小西英仁; 小林将大; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部第501回講演会, Dec. 2017
      • 日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部2017年度合同大阪大会
        奥村憲史; Kanate Temtrirath; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部2017年度合同大阪大会, Sep. 2017
      • 大豆と納豆菌との相互作用:納豆菌の大豆発芽能に対する感受性と大豆細胞壁多糖の取り込み
        杉浦春香; 老木紗予子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部2017年度合同大阪大会, Sep. 2017
      • Sphingomonas属細菌A1株の多糖ペクチン走化性に関わる遺伝子解析
        小西英仁; 小林将大; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部2017年度合同大阪大会, Sep. 2017
      • ヒト分泌物であるヒアルロン酸の取り込みに関わる腸内細菌の新規なホスホトランスフェラーゼ系
        老木紗予子; 中道優介; 村田幸作; 橋本 渉
        日本応用糖質科学会平成29年度大会(第66回), Sep. 2017
      • グリコサミノグリカンの輸送に関わる細菌由来基質結合タンパク質のドメインダイナミクス
        老木紗予子; 蒲地玲子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2017年度大会, Mar. 2017
      • 細菌による多糖輸送:アルギン酸取り込み細菌と分泌細菌の特異な細胞表層構造
        橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2017年度大会, Mar. 2017
      • 「大気窒素」を活用する次世代型発酵:窒素固定細菌による「廃グリセロール」の再資源化
        吉田暢広; 菅原良実; 南部優子; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2017年度大会, Mar. 2017
      • 腸内細菌における宿主多糖グリコサミノグリカン分解菌の多様性
        河合桂吾; 蒲地玲子; 老木紗予子; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部第498回講演会, Feb. 2017
      • 病原性連鎖桿菌による動物細胞外マトリックス(グリコサミノグリカン)の分解
        老木紗予子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉
        第89回日本生化学会2016年度大会, Sep. 2016
      • 腸内細菌による宿主多糖グリコサミノグリカンの分解に関するメタゲノム解析
        中道優介; 河合桂吾; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2016年度関西支部大会, Sep. 2016
      • 大豆細胞壁多糖の輸送に関わるBacillus subtilis由来タンパク質YesOの結晶構造
        杉浦春香; 老木紗予子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2016年度関西支部大会, Sep. 2016
      • 酸性多糖の代謝に関わる還元酵素の補酵素要求性に関わる構造要因
        高瀬隆一; 丸山如江; 老木紗予子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2016年度大会, Mar. 2016
      • 構造情報に基づく部位特異的変異及びランダム変異導入に依るヘモグロビンA1cダイレクトオキシダーゼの造成
        小川徳之; 木村豪秀; 益成利幸; 天野芙美; 片山有基; 永井 豪; 市村通朗; 丸山如江; 伊藤貴文; 橋本 渉; 村田幸作; 相阪和夫
        日本農芸化学会2016年度大会, Mar. 2016
      • 動物細胞外マトリックス(グリコサミノグリカン)を基質とする病原性細菌ABCトランスポーター
        老木紗予子; 丸山如江; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2016年度大会, Mar. 2016
      • 細菌ABCトランスポーターのATP加水分解は、closed型の基質結合タンパク質との相互作用によって惹起される
        上西加純; 金子あい; 丸山如江; 水野伸宏; 馬場清貴; 熊坂 崇; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部第493回講演会, Feb. 2016
      • グリコサミノグリカン輸送に関わる連鎖桿菌由来基質結合タンパク質のX線結晶構造解析
        老木紗予子; 丸山如江; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2015年度中部・関西支部合同大会, Sep. 2015
      • 窒素固定細菌の膜小胞による多糖輸送
        橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2015年度大会, Mar. 2015, Invited
      • 基質結合タンパク質依存的 ABCトランスポーターによる多糖認識
        丸山如江; 立石 彬; 金子あい; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2015年度大会, Mar. 2015
      • 連鎖球菌による哺乳類細胞外マトリクス(グリコサミノグリカン)の分解:不飽和グルクロニルヒドロラーゼの反応機構
        中道優介; 老木紗予子; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2015年度大会, Mar. 2015
      • Sphingomonas属細菌A1株は高分子多糖アルギン酸に走化性を示す
        小林将大; 丸山如江; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会関西支部第488回講演会, Jan. 2015
      • Functional analysis of ABC transporter involved in import of alginate based on its crystal structure
        A. Kaneko; Y. Maruyama; B. Mikami; K. Murata; W. Hashimoto
        日本生化学会2014年度大会, Oct. 2014
      • Streptobacillus genetic cluster acting on host extracellular matrices, glycosaminoglycans
        S. Oiki; Y. Nakamichi; Y. Maruyama; K. Murata; W. Hashimoto
        日本生化学会2014年度大会, Oct. 2014
      • Streptococcal isomerase involved in metabolism of host extracellular matrices, glycosaminoglycans
        Y. Maruyama; S. Oiki; B. Mikami; K. Murata; W. Hashimoto
        日本生化学会2014年度大会, Oct. 2014
      • ヒト腸内細菌における褐藻類多糖アルギン酸の資化性
        木下舞花; 村田 幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2014年度関西支部大会, Sep. 2014
      • 細菌による側毛型フラジェリンを構成因子とする新規な極単べん毛の形成機構
        小林将大; 丸山如江; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2014年度関西支部大会, Sep. 2014
      • A single polar flagellum formation by lateral and non-lateral flagellar gene sets in Sphingomonas sp. strain A1
        Y. Maruyama; M. Kobayashi; K. Murata; W. Hashimoto
        日本農芸化学会2014年度大会, Mar. 2014
      • Streptococcal metabolic mechanism of host extracellular matrices, glycosaminoglycans
        橋本 渉; 丸山如江; 高瀬隆一; 中道優介; 三上文三; 村田幸作
        日本農芸化学会2014年度大会, Mar. 2014
      • Structural and functional analysis of bacterial cell-surface protein involved in alginate import
        K. Temtrirath; K. Murata; W. Hashimoto
        日本農芸化学会関西支部第482回講演会, Dec. 2013
      • Sphingomonas属細菌A1株の側毛フラジェリンによる極単べん毛の形成
        小林将大; 丸山 如江; 橋本 渉; 村田 幸作
        日本生物工学会2013年度大会, Sep. 2013
      • 細菌のアルギン酸代謝に関わる新規なNADH要求性α-ケト酸還元酵素
        高瀬隆一; 河井重幸; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2013年度関西・中四国・西日本支部合同大会, Sep. 2013
      • 細菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼのヘパリン二糖認識機構
        中道優介; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉
        日本農芸化学会2013年度関西・中四国・西日本支部合同大会, Sep. 2013
      • アルギン酸資化性細菌Sphingomonas sp. A1の転写因子AlgOの作用機構
        林 智恵; 丸山如江; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2013年度関西・中四国・西日本支部合同大会, Sep. 2013
      • Functional analysis of ABC transporter involved in import of acidic polysaccharide alginate
        金子あい; 丸山如江; 橋本 渉; 村田幸作
        日本生化学会2013年度大会, Sep. 2013
      • 体腔依存多糖取り込みABCトランスポーターの構造機能相関とその応用
        橋本 渉; 丸山如江; 三上文三; 村田幸作
        日本農芸化学会2013年度大会, 27 Mar. 2013
      • ヘパリン分解細菌由来ヘパラン硫酸リアーゼHepCの結晶構造と活性部位
        橋本 渉; 丸山如江; 中道優介; 村田幸作
        日本農芸化学会2013年度大会, 25 Mar. 2013
      • 細菌由来アルギン酸ABCトランスポーターの立体構造と基質輸送
        丸山如江; 金子あい; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2013年度大会, 25 Mar. 2013
      • 酸性多糖の分解に関わる不飽和グルクロニルヒドロラーゼのクラスター分析
        中道優介; 丸山如江; 橋本 渉; 村田幸作
        日本生化学会2012年度大会, 16 Dec. 2012
      • ファミリーGH-73ペプチドグリカン分解酵素の活性クレフト構造
        丸山如江; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本生化学会2012年度大会, 16 Dec. 2012
      • 「超チャネル」形成細菌Sphingomonas sp. A1のアルギン酸依存的遺伝子発現機構
        林 智恵; 丸山如江; 橋本 渉; 村田幸作
        日本生物工学会2012年度大会, 16 Oct. 2012
      • 細菌ABCトランスポーターと連携する基質結合タンパク質によるヘテロ多糖アルギン酸の認識機構
        西谷 悠; 丸山如江; 伊藤貴文; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2012年度関西支部大会, 29 Sep. 2012
      • グリコサミノグリカン分解に関わる細菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼの基質認識機構
        中道優介; 丸山如江; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2012年度大会, 25 Mar. 2012
      • ヒト関連細菌由来グリコサミノグリカン分解遺伝子クラスターにおけるヘパラン硫酸リアーゼ
        橋本 渉; 丸山如江; 中道優介; 三上文三; 村田幸作
        日本農芸化学会2012年度大会, 25 Mar. 2012
      • 酸性多糖の代謝に関わる細菌由来α-ケト酸還元酵素のX線結晶構造解析
        高瀬隆一; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2012年度大会, 25 Mar. 2012
      • 多糖アルギン酸の取り込みに関わる細菌由来ABCトランスポーターのX線結晶構造解析
        丸山如江; 伊藤貴文; 西谷 悠; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2012年度大会, 24 Mar. 2012
      • 4Ip04 Construction of NAD(H)-dependent ethanol producing bacterium, Sphingomonas sp. A1.
        Takase Ryuichi; Hashimoto Wataru; Kawai Shigeyuki; Murata Kousaku
        日本生物工学会大会講演要旨集, 2012
      • 連鎖球菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼのヘパリン二糖認識機構
        中道優介; 丸山如江; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会 2011年度 関西・中部支部合同大会, 02 Oct. 2011
      • ポリウロン酸の代謝に関わる細菌由来α−ケト酸還元酵素の構造機能相関
        高瀬隆一; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会 2011年度 関西・中部支部合同大会, 02 Oct. 2011
      • 多糖アルギン酸を取り込む細菌由来ABCトランスポーターと基質結合タンパク質の相互作用に関する構造機能解析
        西谷 悠; 丸山如江; 伊藤貴文; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会 2011年度 関西・中部支部合同大会, 02 Oct. 2011
      • アルギン酸で誘導発現するSphingomoans属細菌由来鉄輸送オペロンタンパク質の構造と機能
        橋本 渉; 丸山如江; 三上文三; 村田幸作
        日本農芸化学会 20011年度 関西・中部支部合同大会, 02 Oct. 2011
      • M75メタロペプチダーゼモチーフをもつSphingomonas属細菌由来細胞表層アルギン酸結合タンパク質のX線結晶構造解析
        橋本 渉; 丸山如江; 三上文三; 村田幸作
        日本生化学会2011年度大会, 22 Sep. 2011
      • 連鎖球菌におけるグリコサミノグリカン分解・輸送・代謝に関わる遺伝子クラスター
        橋本渉; 丸山如江; 中道優介; 村田幸作
        日本農芸化学会大会講演要旨集, 05 Mar. 2011
      • 連鎖球菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼのグリコサミノグリカン二糖に対する硫酸基認識
        中道優介; 丸山如江; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2011年度大会, Mar. 2011
      • 体腔形成細菌の分子育種による海洋バイオマスアルギン酸からのエタノール生産
        竹田浩之; 米山史紀; 河井重幸; 橋本 渉; 佐藤信行; 村田幸作
        日本農芸化学会2011年度大会, Mar. 2011, Peer-reviewed
      • アルギン酸代謝における細菌由来α‐ケト酸還元酵素の生理機能と活性中心構造
        落合秋人; 高瀬隆一; 橋本渉; 村田幸作
        日本農芸化学会大会講演要旨集, 05 Mar. 2010
      • 窒素固定細菌Azotobacter vinelandiiのシデロフォア生合成遺伝子クラスター
        米山史紀; 山本真由美; 橋本渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2010年度大会, 2010
      • 細菌由来メタロペプチダーゼファミリーM16酵素のX線結晶構造
        丸山如江; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2010年度大会, 2010
      • アルギン酸輸送ABCトランスポーターの機能解析と予備的X線結晶構造解析
        伊藤貴文; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2010年度大会, 2010
      • 細菌由来推定リポタンパク質の脂質結合性評価とその予備的X線結晶構造解析
        橋本 渉; 落合秋人; 何 金山; 村田幸作
        日本農芸化学会2010年度大会, 2010
      • 硫酸化グリコサミノグリカンに作用する連鎖球菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼの基質認識機構
        中道優介; 丸山如江; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2010年度関西支部大会, 2010
      • Sphingomonas属細菌A1株由来ペプチドグリカン分解酵素の立体構造に基づく触媒機構解析析
        丸山如江; 落合秋人; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2010年度関西支部大会, 2010
      • Sphingomoans属細菌A1株の細胞表層に局在するアルギン酸結合タンパク質の遺伝子発現とX線結晶構造解析
        橋本 渉; 丸山如江; 落合秋人; 三上文三; 村田幸作
        日本農芸化学会2010年度関西支部大会, 2010
      • Structural Determinants Responsible for Substrate Recognition and Mode of Action in Family 11 Polysaccharide Lyases
        Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Apr. 2009
      • 細菌によるアルギン酸からのバイオ燃料生産:エタノール生産菌の分子育種
        竹田浩之; 落合秋人; 橋本渉; 村田幸作
        日本農芸化学会大会講演要旨集, 05 Mar. 2009
      • ファミリーPL-14多糖リアーゼvAL-1(S)の構造・機能相関
        小倉康平; 山崎正幸; 橋爪貴也; 山田 隆; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2009年度大会, 2009
      • ファミリーGH73ペプチドグリカン分解酵素のX線結晶構造
        橋本 渉; 落合秋人; 門間敬子; 丸山如江; 伊藤貴文; 三上文三; 村田幸作
        日本農芸化学会2009年度大会, 2009
      • 褐藻アルギン酸の糖化に関わる細菌由来エキソ型リアーゼの構造・機能相関
        落合秋人; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2009年度大会, 2009
      • アルギン酸代謝に関わる NADPH 依存α- ケト酸還元酵素の構造機能相関
        落合秋人; 高瀬隆一; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本ビタミン学会第61回大会, 2009
      • アルギン酸リアーゼvAL-1(S)は反応pHにより異なる作用様式(エンド/エキソ型)を示す
        小倉康平; 山崎正幸; 橋爪貴也; 山田 隆; 三上文三; 橋本 渉; 村田 幸作
        日本生物工学会2009年度大会, 2009
      • 多糖の輸送・分解に関わる細菌由来超分子の構造と機能
        橋本 渉; 伊藤貴文; 三上文三; 村田幸作
        日本生化学会2009年度大会, 2009
      • Expression and function analysis of Sphingomonas alginate ABC transporter
        伊藤貴文; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本生化学会2009年度大会, 2009
      • A novel streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase specific for sulfated glycosaminoglycans
        中道優介; 丸山如江; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本生化学会2009年度大会, 2009
      • Coenzyme-binding mode in α-keto acid reductase responsible for alginate metabolism
        高瀬隆一; 落合秋人; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本生化学会2009年度大会, 2009
      • Structural determinants responsible for mode of action in polysaccharide lyases for biofuel production
        落合秋人; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本生化学会2009年度大会, 2009
      • 細菌におけるATP加水分解エネルギーによる高分子多糖の取り込み
        伊藤貴文; 西谷 悠; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        リン化合物討論会, 2009
      • 細菌によるアルギン酸からのエタノール生産:アルギン酸糖化酵素エキソ型リアーゼのX線結晶構造,
        落合秋人; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会関西支部第454回講演会, 2008
      • サルモネラ菌由来マンノースイソメラーゼYihSの機能と立体構造
        伊藤貴文; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会関西支部第454回講演会, 2008
      • アルギン酸単糖(α-ケト酸)を無毒化するレダクターゼの分子同定
        落合秋人; 高瀬隆一; 橋本 渉; 村田幸作
        日本生物工学会2008年度大会, 2008
      • クロレラウイルスCVK-1由来ファミリー14多糖リアーゼのX線結晶構造
        小倉康平; 山崎正幸; 橋爪貴也; 山田 隆; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作
        日本農芸化学会2008年度関西支部大会, 2008
      • 細菌によるアルギン酸からのエタノール生産:アルギン酸糖化産物(α‐ケト酸)還元酵素の分子同定
        高瀬隆一; 落合秋人; 橋本渉; 村田幸作
        日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集, 2008
      • 新規グリコサミノグリカン分解酵素のX線結晶構造解析
        伊藤貴文; 森茂太郎; 赤尾沙絵; 橋本渉; 村田幸作; 三上文三
        日本農芸化学会大会講演要旨集, 05 Mar. 2004
      • ポリリン酸はATPに代わり得るか? Micrococcus flavusの新規NADキナーゼについて
        河井重幸; 森茂太郎; 橋本渉; 村田幸作
        ビタミン, 25 Apr. 2000

      Presentations

      • 細胞外マトリックスを標的とするレンサ球菌の分子機構とその病原性
        小倉 康平; 橋本 渉
        第94回日本細菌学会総会, 24 Mar. 2021, Invited
      • 宿主粘液物質を標的とするヒト常在細菌の分子機構とその多様性
        橋本 渉
        日本DNA多型学会第29回学術集会, 26 Nov. 2020, Invited
      • 動物細胞外多糖を標的とする常在菌の分子機構
        橋本 渉
        日本応用糖質科学会第45回近畿支部会, 08 Nov. 2019, Invited
      • 食品多糖類に作用する微生物の発酵力とその活用技術
        橋本 渉
        日本調理食品研究会(第25回)年次大会, 04 Jun. 2019, Invited
      • 細菌細胞膜のダイナミクスと有用物質生産
        橋本 渉
        平成28年度3研究会合同講演会(発酵と代謝研究会、アルコール・バイオマス研究会、新資源生物変換研究会), 27 Mar. 2017, Invited
      • 細菌由来多糖分解酵素の構造と機能
        第11回関西グライコサイエンスフォーラム, 2010, 関西グライコサイエンスフォーラム, Invited
      • 細菌における多糖の輸送と分解—構造・機能・移植—
        日本応用糖質科学会第28回近畿支部会, 2008, 日本応用糖質科学会, Invited

      Books and Other Publications

      • 遺伝子・細胞から見た応用微生物学
        河井重幸; 橋本 渉; 村田幸作, Joint work, 第3章 遺伝子から見た微生物の進化と細胞構造
        朝倉書店, Apr. 2020
      • 遺伝子・細胞から見た応用微生物学
        麻生祐司; 橋本 渉; 村田幸作, Joint work, 第9章 微生物の分離と増殖
        朝倉書店, Apr. 2020
      • 海洋由来酵母による褐藻類主要成分マンニトールからの油脂生産
        中田翔太; 日尾 守; 髙瀬隆一; 河井重幸; 渡辺大輔; 橋本 渉, Joint work
        日本農芸化学会2020年度大会 一般講演トピックス集, Mar. 2020
      • Crystal structure of bacterial substrate-binding protein involved in chemotaxis toward polysaccharide pectin
        Ryuichi Takase; Kotaro Anamizu; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto
        SPring-8 User Experiment Report, 2020A2577, 2020
      • ヒト細胞外マトリックスを標的とするプロバイオティクスの分子機構
        橋本 渉, Single work
        ヤクルト・バイオサイエンス研究財団, Oct. 2019
      • 納豆菌による大豆成分の認識
        杉浦春香; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉, Joint work
        大豆たん白質研究, Jun. 2019
      • 細菌由来金属輸送EfeUOB系構成アルギン酸結合タンパク質のレアメタル結合性
        奥村憲史; 三上文三; 村田幸作; 橋本 渉, Joint work
        日本農芸化学会2019年度大会 一般講演トピックス集, Mar. 2019, Not refereed
      • 次世代プロバイオティクスBacteroides属細菌による動物宿主由来粘液物質の資化と腸内優占性
        佐藤賢宏; 久門知也; 梶川幹太; 村田幸作; 橋本 渉, Joint work
        日本農芸化学会2019年度大会 一般講演トピックス集, Mar. 2019, Not refereed
      • Crystal structure of Lactobacillus rhamnosus 5-keto-4-deoxyuronate isomerase KduI involved in metabolism of host glycosaminoglycans
        Yuuta Yamamoto; Hisamu Iwase; Ryuichi Takase; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto, Joint work
        SPring-8 User Experiment Report, 2019B2557, 2019
      • 多糖リアーゼ
        橋本 渉, Contributor
        日本生化学会, Jun. 2018, Not refereed
      • Studies on novel enzymes for degradation of fragmented glycosaminoglycans
        HASHIMOTO Wataru, Single work
        Glycoscience 2013-2017 In Commemoration of the 25th Anniversary of Mizutani Foundation for Glycoscience, Nov. 2017, Not refereed
      • 食と微生物の事典
        橋本 渉, Contributor, 微生物がつくる多様な増粘安定剤
        朝倉書店, Jul. 2017, Not refereed
      • 酸性多糖の代謝に関わる還元酵素の立体構造に基づく補酵素特異性変換とそのバイオ燃料生産への応用
        橋本 渉, Single work
        「野田産研研究助成」研究成果報告会概要集(公益財団法人野田産業科学研究所2015年度研究助成), May 2017, Not refereed
      • Crystal structure of alginate/metal-binding protein Algp7 from Sphingomonas strain sp. A1 at higher resolution
        Kenji Okumura; Sayoko Oiki; Hisamu Iwase; Masahiro Sato; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto, Joint work
        SPring-8 User Experiment Report, 2017B2592, 2017, Not refereed
      • 宿主細胞外マトリックスを介したプロバイオティクスとヒト腸管との相互作用
        橋本 渉, Single work
        ダノン学術研究助成金 研究報告集 平成27年度(2015年度), Oct. 2016, Not refereed
      • Conformational change of bacterial solute-binding protein involved in import of glycosaminoglycans
        Sayoko Oiki; Reiko Kamochi; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto, Joint work
        SPring-8 User Experiment Report, 2016B2574, 2016, Not refereed
      • 予期せぬ国際交流
        橋本 渉, Single work
        京大広報, Dec. 2015, Not refereed
      • 基質結合タンパク質依存的ABCトランスポーターによる多糖認識
        丸山如江; 立石 彬; 金子あい; 三上文三; 橋本 渉; 村田幸作, Joint work
        日本農芸化学会2015年度大会トピックス集, Mar. 2015, Not refereed
      • 窒素固定細菌によるグリセリンからのバイオポリマー発酵生産
        橋本 渉, Single work
        日本石鹸洗剤工業会 平成26年度グリセリン新規用途開発研究助成金 研究成果報告書, 2015, Not refereed
      • 断片化グリコサミノグリカンの分解に関わる新規酵素の構造機能相関とその医薬への応用
        橋本 渉, Single work
        公益財団法人水谷糖質科学振興財団 第21回研究助成 研究成果報告書, 2015, Not refereed
      • Crystal structure of Streptobacillus solute-binding protein involved in import of glycosaminoglycans
        Sayoko Oiki; Kasumi Uenishi; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto
        SPring-8 User Experiment Report, 2015B2058, 2015, Not refereed
      • Crystal structure of bacterial alginate ABC transporter in complex with periplasmic binding protein with longer oligoalginate
        Ai Kaneko; Yukie Maruyama; Sayoko Oiki; Kasumi Uenishi; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto, Joint work
        SPring-8 User Experiment Report, 2014B1137, 2014, Not refereed
      • X-ray crystallographic analysis of bacterial alginate ABC transporter through Humid Air and Glue-coating method
        Ai Kaneko; Yukie Maruyama; Sayoko Oiki; Yusuke Nakamichi; Ryuichi Takase; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto, Joint work
        SPring-8 User Experiment Report, 2014A1148, 2014, Not refereed
      • Crystal structure of heparan sulfate lyase HepC from Pedobacter heparinus
        Yukie Maruyama; Yusuke Nakamichi; Ai Kaneko; Ryuichi Takase; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto, Joint work
        SPring-8 User Experiment Report, 2013A1106, 2013, Not refereed
      • Structural determinants in bacterial unsaturated glucuronyl hydrolase for degradation of heparin disaccharides
        Yusuke Nakamichi; Ai Kaneko; Kanate Temtrirath; Ryuichi Takase; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Kousaku Murata; Wataru Hashimoto, Joint work
        SPring-8 User Experiment Report, 2013B1260, 2013, Not refereed
      • Crystal structure of Sphingomonas sp. strain A1 alginate-binding protein Algp7 in complex with metal ion
        Wataru Hashimoto; Yukie Maruyama; Kanate Temtrirath; Yusuke Nakamichi; Ryuichi Takase; Bunzo Mikami; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2012B1265, 2012, Not refereed
      • Crystal structure of peptidoglycan hydrolase FlgJ mutant from Sphingomonas sp. strain A1
        Yukie Maruyama; Yusuke Nakamichi; Ryuichi Takase; Kanate Temtrirath; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2012A1317, 2012, Not refereed
      • Binding mode to heteropolysaccharide alginate by Sphingomonas sp. A1 periplasmic protein associated with ABC transporter
        Yu Nishitani; Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Yusuke Nakamichi; Ryuichi Takase; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2011B1108, 2011, Not refereed
      • Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of ATP-binding cassette transporter from Sphingomonas sp. strain A1
        Yu Nishitani; Yukie Maruyama; Yusuke Nakamichi; Ryuichi Takase; Kazuto Ohashi; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2011A1186, 2011, Not refereed
      • Crystal structure of streptococcal α-keto acid reductase involved in metabolism of glycosaminoglycans
        Wataru Hashimoto; Yukie Maruyama; Ryuichi Takase; Yusuke Nakamichi; Bunzo Mikami; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2011B2055, 2011, Not refereed
      • Loop movement over the active cleft in streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase
        Yusuke Nakamichi; Yukie Maruyama; Ryuichi Takase; Yu Nishitani; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2010A1279, 2010, Not refereed
      • The flexible catalytic residues prerequisite for activity expression in bacterial glycosaminoglycan-degrading enzyme
        Yusuke Nakamichi; Yukie Maruyama; Ryuichi Takase; Yu Nishitani; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2010B1149, 2010, Not refereed
      • Crystal structure of the metallopeptidase family M16 enzyme from Sphingomonas sp. strain A1
        Yukie Maruyama; Asako Chuma; Takafumi Itoh; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2009B1192, 2009, Not refereed
      • X-ray structural analysis of the metallopeptidase family M16 enzyme
        Yukie Maruyama; Asako Chuma; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Yusuke Nakamichi; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2009A1329, 2009, Not refereed
      • X-ray crystal structure of Sphingomonas sp. A1 α-keto acid reductase for alginate metabolism
        Ryuichi Takase; Akihito Ochiai; Yusuke Nakamichi; Takafumi Itoh; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2009A1179, 2009, Not refereed
      • Crystal structure of streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase in complex with sulfated substrate
        Yusuke Nakamichi; Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2009B1201, 2009, Not refereed
      • Bacterial system for alginate uptake and degradation
        Wataru Hashimoto; Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Kousaku Murata
        In "Alginates: Biology & Applications" Microbiology Monographs 13: (Ed. Bernd Rehm), Springer, pp73-94, 2009, Not refereed
      • Crystal structure of NADP-bound α-keto acid reductase prerequisite for alginate metabolism in Sphingomonas sp. A1
        Ryuichi Takase; Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2009B1177, 2009, Not refereed
      • Bacterial proteins in potential cancer therapy
        Magdy Mahfouz; Wataru Hashimoto; Tapas K. Das Gupta; Ananda M. Chakrabarty, Joint work, In “Applied Biotechnology”, (Eds. Sudhir U. Meshram and Gangadhar Bangadhar Shinde)
        I. K. International Publishing House Pvt Ltd, 2009, Not refereed
      • Unsaturated glycoside hydrolases trigger hydration of vinyl ether groups but not of glycoside bond
        Wataru Hashimoto; Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Kousaku Murata
        Abstract papers of The 5th open workshop “Chemistry of Biological processes created by water and biomolecules”, p201, January 24-25, 2008. Nara prefectural new public hall, Nara, Japan. Supported by the Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Ar, 2008, Not refereed
      • Crystal structure of alginate-binding protein (AlgQ1) in complex with unsaturated mannuronic acid trisaccharide
        Takafumi Itoh; Kohei Ogura; Yusuke Nakamichi; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2008B1191, 2008, Not refereed
      • 4章 微生物の細胞構造
        橋本 渉; 村田幸作
        遺伝子から見た応用微生物学. 熊谷英彦、加藤暢夫、村田幸作、阪井康能編, 朝倉出版, pp55-68, 2008, Not refereed
      • スーパー細菌の創成とダイオキシン分解の高効率化技術
        橋本 渉; 村田幸作
        『土壌・地下水汚染の浄化・修復技術』、ブッカーズ、株式会社エヌ・ティー・エス(NTS), pp137-147, 2008, Not refereed
      • Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of peptidoglycan hydrolase from Sphingomonas sp. strain A1
        Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2008A1322, 2008, Not refereed
      • X-ray crystal structure of Sphingomonas sp. A1 peptidoglycan hydrolase categorized to family GH-73
        Wataru Hashimoto; Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Yukie Maruyama; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2008B1112, 2008, Not refereed
      • Structural insights into the reaction mechanism of coenzyme-independent mannose isomerase
        Takafumi Itoh; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2008A1119, 2008, Not refereed
      • Crystal structure of exotype rhamnogalacturonan lyase YesX from Bacillus subtilis strain 168: structural factors responsible for mode of action
        Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2007B1268, 2007, Not refereed
      • X-ray crystallographic study on Sphingomonas sp. A1 cell surface protein associating with alginate-binding flagellin homologue
        Yukie Maruyama; Misato Momma; Takafumi Itoh; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2007B1624, 2007, Not refereed
      • Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase from Streptococcus agalactiae
        Yukie Maruyama; Takafumi Itoh; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2007A1407, 2007, Not refereed
      • Structural analysis of N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase superfamily
        Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2007A1154, 2007, Not refereed
      • Structural identification of bacterial yihS-encoded proteins to an aldose-ketose isomerase
        Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2007B1176, 2007, Not refereed
      • Alginate recognition by cell surface flagellin homologous proteins of Sphingomonas sp. A1
        Yukie Maruyama; Misato Momma; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2007A1330, 2007, Not refereed
      • Crystal structure of unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase complexed with substrate
        Takafumi Itoh; Akihito Ochiai; Bunzo Mikami; Aiko Tanabe; Kimihiko Mizutani; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2006A1405, 2006, Not refereed
      • 「小胞状構造体」の形成に関わる細菌細胞膜のダイナミクス
        村田幸作; 橋本 渉
        特定領域研究研究成果報告書 (2000年度〜2004年度科学研究費補助金) 細胞システム解明に向けたゲノム生物学の新展開(略称:ゲノム生物学), p432-433, 2006, Not refereed
      • Crystal structure of rhamnogalacturonan lyase from Bacillus subtilis strain 168
        Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2006B1214, 2006, Not refereed
      • Analysis of alginate recognition system on cell surface of Sphingomonas sp. A1
        Yukie Maruyama; Misato Momma; Kohei Ogura; Malle Dominggus; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2006A1150, 2006, Not refereed
      • Structural analysis of flagellin homologous protein on cell surface of Sphingomonas sp. A1
        Yukie Maruyama; Misato Momma; Akihito Ochiai; Takafumi Itoh; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2006B1126, 2006, Not refereed
      • Crystal structure of unsaturated galacturonyl hydrolase in complex with unsaturated galacturonic acid
        Takafumi Itoh; Kimihiko Mizutani; Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2006A1103, 2006, Not refereed
      • Structural analysis for the substrate specificity of a novel glycosidase, unsaturated galacturonyl hydrolase, responsible for the degradation plant cell walls
        Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Kohei Ogura; Malle Dominggus; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2006B1067, 2006, Not refereed
      • 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発
        村田幸作; 橋本 渉; 河井重幸
        厚生労働科学研究費補助金、難政治性疾患克服研究事業、「特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究」、平成16年度総括・分担研究報告書:53-57, 2005, Not refereed
      • X-ray analysis of exotype alginate lyase from Agrobacterium tumefaciens C58
        Akihito Ochiai; Masayuki Yamasaki; Takafumi Itoh; Yukie Maruyama; Aiko Tanabe; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 2005B0351, 2005, Not refereed
      • Polysaccharide lyase: Crystal structure of Bacillus sp. GL1 xanthan lyase complexed with pyruvate mannose
        Yukie Maruyama; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 14(2004B), pp295, 2005, Not refereed
      • Polysaccharide lyase: Crystal structure of Bacillus sp. GL1 xanthan lyase complexed with substrate
        Yukie Maruyama; Masayuki Yamasaki; Takafumi Itoh; Akihito Ochiai; Kohei Ogura; Bunzo Mikami; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 14(2004B), pp173, 2005, Not refereed
      • Preliminary X-ray study of an alginate lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens C58, a member of polysaccharide lyase family 15
        Akihito Ochiai; Masayuki Yamasaki; Wataru Hashimoto; Bunzo Mikami; Kousaku Murata
        SPring-8 User Experiment Report, 15(2005A), pp298, 2005, Not refereed
      • 細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明
        村田幸作; 橋本 渉
        文部科学省 科学研究費 特定領域研究[ゲノム]4領域 2003年度報告書:275, 2005, Not refereed
      • Crystal structure of family PL-7 alginate lyase PA1167 from Pseudomonas aeruginosa
        Masayuki Yamasaki; Satoko Moriwaki; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata; Kimihiko Mizutani; Bunzo Mikami
        SPring-8 user experiment report, 12(2003B), p211, 2004, Not refereed
      • Insight into the catalytic mechanism of family PL-7 alginate lyase PA1167 from Pseudomonas aeruginosa
        Masayuki Yamasaki; Satoko Moriwaki; Kimihiko Mizutani; Takafumi Itoh; Akira Hirata; You-Na Kang; Mizuho Ban; Wataru Hashimoto; Bunzo Mikami; Kousaku Murata
        SPring-8 user experiment report, 13(2004A), p199, 2004, Not refereed
      • 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発
        村田幸作; 橋本 渉; 河井重幸
        厚生労働科学研究費補助金 難治性疾患克服研究事業 特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究 平成 15年度 総括・分担研究報告書, 55-59, 2004, Not refereed
      • 細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明
        村田幸作; 橋本 渉
        文部科学省科学研究費特定領域研究「ゲノム」4領域2003年度合同班会議, B120, 2003, Not refereed
      • 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発
        村田幸作; 橋本 渉; 河井重幸
        厚生労働科学研究費補助金 特定疾患対策研究事業 特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究 平成14年度 総括・分担研究報告書, 36-41, 2003, Not refereed
      • Biodegradation of alginate, xanthan, and gellan
        Wataru Hashimoto; Yumiko Mishima; Osamu Miyake; Hirokazu Nankai; Keiko Momma; Kousaku Murata
        In "Biopolymers" volume 9: Polysaccharides I (Ed. A. Steinb�chel), Wiley-VCH, pp175-199, 2002, Not refereed
      • 細菌『超チャネル』の高次構造と巨大分子輸送機能
        橋本 渉
        平成13年度新世代研究所研究助成成果報告書、pp75-80, 2002, Not refereed
      • 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発
        橋本 渉; 村田幸作
        厚生科学研究費補助金 特定疾患対策研究事業 特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究 平成13年度 総括・分担研究報告書, 95-103, 2002, Not refereed
      • Safety assessment of genetically modified rice and potatoes with soybean glycinin
        Keiko Momma; Wataru Hashimoto; Shigeru Utsumi; Kousaku Murata
        In "Testing for genetic manipulation in plants", Molecular Methods of Plant Analysis, vol. 22, pp139-152 (Eds. J. F. Jackson, H. F. Linskens, and R. B. Inman), Springer-Verlag, Berlin Heidelberg, 2002, Not refereed
      • 細菌細胞表層における体腔の高次空間構造と高分子輸送機構
        村田幸作; 橋本 渉; 門間敬子
        文部省科学研究費補助金 特定領域研究(A)(1). バイオターゲティングのための生体分子デザイン 平成12年度 研究報告書, 304-309, 2001, Not refereed
      • 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発
        村田幸作; 橋本 渉
        厚生科学研究費補助金 特定疾患対策研究事業 特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究 平成12年度 総括・分担研究報告書, 53-55, 2001, Not refereed
      • 細菌細胞表層における体腔形成機構と体腔の高分子輸送機構
        村田幸作; 門間敬子; 橋本 渉
        文部省科学研究費補助金 特定領域研究(A)(1). バイオターゲティングのための生体分子デザイン 平成11年度 研究報告書, 324-329, 2000, Not refereed
      • Polyphosphate kinase, polyphosphate-glucokinase, and polyphosphate-NAD kinase in microorganisms and their applications
        Shigeyuki Kawai; Takako Mukai; Shigetarou Mori; Sachiko Suzuki; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        Res. Adv. Biosci. Bioeng., 1, 19-31, 2000, Not refereed
      • Special apparatus for assimilation, transport, and depolymerization of alginate in Sphingomonas sp. A1
        Wataru Hashimoto; Keiko Momma; Hye-Jin Yoon; Yumiko Mishima; Osamu Miyake; Shigeyuki Kawai; Bunzo Mikami; Kousaku Murata
        Abstract for Fifth International Symposium on Environmental Biotechnology, p916-919, Kyoto, July 9-13, 2000, Not refereed
      • 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発
        村田幸作; 橋本 渉
        厚生省調査研究班基盤研究部門(特定疾患に関する微生物研究班)平成11年度 研究報告書, 49-50, 2000, Not refereed
      • Identification and characterization of a novel enzyme: inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase of Micrococcus flavus
        Shigeyuki Kawai; Shigetarou Mori; Wataru Hashimoto; Kousaku Murata
        Abstract for Fifth International Symposium on Environmental Biotechnology, p63-66, Kyoto, July 9-13, 2000, Not refereed
      • 健康と環境への安全性
        橋本 渉; 門間敬子; 村田幸作
        「遺伝子組換え植物の光と影」(山田康之、佐野 浩編集) 学会出版センター, pp91-103, 1999, Not refereed
      • 細菌アルギン酸リアーゼのバイオフィルム感染症治療への応用-高次構造と抗原性部位の除去-
        村田幸作; 橋本 渉
        厚生省特定疾患調査研究班(特定疾患に関する微生物研究班)平成10年度 研究報告書, 49-52, 1999, Not refereed
      • 細菌細胞表層への体腔提示と体腔へのターゲッティング
        門間敬子; 橋本 渉; 村田幸作
        文部省科学研究費補助金 特定領域研究(A)(1). バイオターゲティングのための生体分子デザイン 平成10年度 研究報告書, 284-289, 1999, Not refereed
      • Genetically modified foods: potential problems for safety assessment and monitoring
        Wataru Hashimoto; Sachiko Ozawa; Nobuaki Shirai; Keiko Momma; Shigeyuki Kawai; Shigeru Utsumi; Kousaku Murata
        In Recent Res. Devel. in Agricultural & Food Chem., Research Signpost, 3, 277-293, 1999, Not refereed
      • Bacterial exo(hetero)polysaccharide lyases: enzymatic and genetic aspects of lyases, and their applications
        Wataru Hashimoto; Hikaru Miki; Masako Okamoto; Tomohiro Hisano; Keiko Momma; Kousaku Murata
        In Recent Res. Devel. in Fermentation & Bioeng., 1, 77-108, Research Signpost, 1998, Not refereed
      • 細菌多糖リアーゼのバイオフィルム感染症治療への応用:化学修飾アルギン酸リアーゼの酵素学的・免疫学的特性
        村田幸作; 橋本 渉
        厚生省特定疾患調査研究班(特定疾患に関する微生物研究班)平成9年度 研究報告書, 42-48, 1998, Not refereed
      • 細菌多糖リアーゼのバイオフィルム感染症治療への応用
        村田幸作; 橋本 渉
        厚生省特定疾患調査研究班(特定疾患に関する微生物研究班)平成8年度 研究報告書, 51-55, 1997, Not refereed
      • Both large and small subunits are essential for the enzymatic activity of γ-glutamyltranspeptidase of Escherichia coli K-12
        Hideyuki Suzuki; Wataru Hashimoto; Satoko Nohara; Hiromi Tachi; Tetsuya Monji; Kenji Yamamoto; Hidehiko Kumagai
        The FASEB Journal ASBMB/Annual meeting, 9 (6), May, 1995, Not refereed
      • γ-Glutamyltranspeptidase is essential for Escherichia coli K-12 to utilize as exogenous γ-glutamyl peptide as an amino acid source
        Hidehiko Kumagai; Hideyuki Suzuki; Wataru Hashimoto
        Annual reports of IC Biotech, 16, 556-559, 1993, Not refereed
      • Structure-function relationship and regulation of biosynthesis of γ-glutamyltranspeptidase of Escherichia coli K-12
        Hidehiko Kumagai; Hideyuki Suzuki; Wataru Hashimoto; Satoko Nohara
        長瀬科学技術振興財団研究報告集, 4, 97-107, 1992, Not refereed
      • γ-Glutamyltranspeptidase mutants of E. coli deficient in processing to subunits
        Wataru Hashimoto; Hideyuki Suzuki; Satoko Nohara; Hidehiko Kumagai
        Annual reports of IC Biotech, 15, 460-464, 1992, Not refereed
      • Molecular cloning and DNA sequence of Escherichia coli K-12 γ-glutamyltranspeptidase gene, ggt, and excretion of γ-glutamyl-transpeptidase
        Hideyuki Suzuki; Hidehiko Kumagai; Wataru Hashimoto; Jaime O. Claudio; Tatsurokuro Tochikura
        Frontiers and new horizons in amino acid research, pp.589-593., Ed. by K. Takai, Elsevier Science Publishers B. V., 1992, Not refereed

      Industrial Property Rights

      • 特開WO2015/005258, 糖化ヘキサペプチドオキシダーゼとその利用
        小川徳之; 楳原芙美; 木村豪秀; 村田幸作; 橋本 渉
      • 特開WO2015/005257, 糖化ヘモグロビンの測定方法
        小川徳之; 楳原芙美; 木村豪秀; 村田幸作; 橋本 渉
      • 特開WO2011/024858, 海洋バイオマスからのエタノール生産
        村田幸作; 橋本 渉; 河井重幸; 織田浩司; 庵原啓司; 三上文三; 竹田浩之; 米山史紀; 落合秋人
      • 特開特許公開2003-250542, 酵母の形質転換方法
        村田幸作; 橋本 渉; 河井重幸; 葉山善幸; 福田泰樹
      • 特開特許公開平11-79922, 真核微生物用抗菌剤およびそれを用いる真核微生物の増殖抑制方法
        松谷恵子; 福田泰樹; 矢嶋瑞夫; 橋本 渉; 村田幸作
      • 特開特許公開平9-234065, 新規なゲラン分解酵素とオリゴ糖
        佐藤信行; 中島 浩; 森山 茂; 橋本 渉; 村田幸作

      Awards

      • 31 Jan. 2020
        日本農芸化学会, 日本農芸化学会2020年度大会トピックス
      • 08 Apr. 2019
        日本農芸化学会, 日本農芸化学会2019年度大会トピックス賞
      • 08 Apr. 2019
        日本農芸化学会, 日本農芸化学会2019年度大会トピックス賞
      • 26 Apr. 2018
        公益財団法人長瀬科学技術振興財団, 長瀬研究振興賞
      • 07 Apr. 2015
        日本農芸化学会, 日本農芸化学会2015年度大会 トピックス賞(丸山先生、村田先生らとの共同受賞)
      • 2011
        日本農芸化学会, 日本農芸化学会2011年度大会 トピックス賞(竹田先生、米山先生、河井先生、佐藤先生、村田先生との共同受賞)
      • 2003
        日本農芸化学会, 日本農芸化学奨励賞(日本農芸化学会)Award for Young Scientist, Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry

      External funds: Kakenhi

      • 細菌走化性を活用した食品廃棄物の資源化
        Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
        Medium-sized Section 41:Agricultural economics and rural sociology, agricultural engineering, and related fields
        Kyoto University
        橋本 渉
        From 09 Jul. 2021, To 31 Mar. 2023, Granted
        細菌走化性;アルギン酸;ペクチン;バイオ燃料
      • 動物細胞外粘液物質を介した腸内優占菌と宿主との相利共生機構の解明
        Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
        Basic Section 38060:Applied molecular and cellular biology-related
        Kyoto University
        橋本 渉
        From 01 Apr. 2021, To 31 Mar. 2024, Granted
        腸内細菌叢;動物宿主;相利共生;ムチン;グリコサミノグリカン
      • 「大気窒素」活用型次世代発酵技術の基盤開発と循環型社会の構築
        Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
        Medium-sized Section 64:Environmental conservation measure and related fields
        Kyoto University
        橋本 渉
        From 28 Jun. 2019, To 31 Mar. 2021, Granted
        大気窒素;窒素固定細菌;バイオリファイナリー;生分解性プラスチック;廃グリセロール;ブルーカーボン;SDGs;低炭素社会;発酵
      • テルペノイドと油脂を高生産する海藻(褐藻)バイオリファイナリー
        Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
        Basic Section 38020:Applied microbiology-related
        Ishikawa Prefectural University
        河井 重幸
        From 01 Apr. 2019, To 31 Mar. 2022, Granted
        油脂蓄積酵母;Yarrowoa lipolytica;バレリアノール;油脂;褐藻;アルギン酸;DEH;HMG-CoAレダクターゼ;テルペノイド;ゲノム編集
      • Elucidation of dynamics and colonization mechanisms of microbiota targeting animal extracellular matrices and their application development
        Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
        Basic Section 38060:Applied molecular and cellular biology-related
        Kyoto University
        Wataru Hashimoto
        From 01 Apr. 2018, To 31 Mar. 2021, Project Closed
        微生物叢;グリコサミノグリカン;常在機構;感染機構;プロバイオティクス;X線結晶構造解析;ムチン
      • Novel and innovative mechanism of ATP biosynthesis based on the plasmolysis as a proton-driven force in alkalophilic bacteria
        Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
        Setsunan University
        Kousaku Murata
        From 01 Apr. 2016, To 31 Mar. 2018, Project Closed
        好アルカリ性細菌;原形質分離;ATP合成機構;プロトン勾配;細菌内膜動的構造;プロトン駆動力;F0F1ATPase;pHジャンプ;Aeromonas属細菌;内膜皺構造;細胞膜機能;廃グリセロール;アエロモナス属細菌;窒素固定細菌;有機酸生産
      • Construction of transport systems by analysis and modification of molecular mechanism of macromolecule-importing ABC transporter
        Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
        Setsunan University
        Yukie Maruyama
        From 01 Apr. 2016, To 31 Mar. 2019, Project Closed
        ABCトランスポーター;アルギン酸;スフィンゴモナス属細菌;ABC輸送体;結晶構造解析;スフィンゴモナス;共免疫沈降;タンパク質;多糖
      • Structural life science of pathogenic bacterial systems targeting animal host extracellular matrix for colonization and infection
        Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
        Kyoto University
        Wataru HASHIMOTO
        From 01 Apr. 2015, To 31 Mar. 2018, Project Closed
        病原性細菌;細胞外マトリクス;グリコサミノグリカン;フォスフォトランスフェラーゼ系;ABCトランスポーター;分解・代謝酵素;遺伝子クラスター;X線結晶構造解析;連鎖球菌;連鎖桿菌;細胞外マトリックス;細菌;分解系;輸送系;宿主細胞外マトリクス;代謝酵素;動物細胞外マトリクス;酵素;輸送体;分解酵素
      • A novel metal-import system in the pit-forming bacterium and its application for recovery of radioactive compounds and rare metals
        Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
        Kyoto University
        Wataru Hashimoto
        From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2016, Project Closed
        細菌;アルギン酸;レアメタル;輸送体;電子顕微鏡;原子間力顕微鏡;X線結晶構造解析;示差走査型蛍光定量法;金属結合タンパク質;Sphingomonas属細菌;体腔形成細菌
      • Three-dimensional structure and functionof ABC transporter responsible for macromolecule transport in bacteria
        Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
        Setsunan University
        Kousaku Murata
        From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2017, Project Closed
        ABCトランスポーター;X線結晶構造;基質結合タンパク質;ABCタンパク質;アルギン酸;体腔;スフィンゴモナス属細菌;ABCタンパク質;透過酵素;X線結晶構造;酸性多糖輸送;Sphingomonas;輸送体分子進化;Spingomonas;X線結晶構造解析;フラジェリン;鉄輸送体
      • Metabolic mechanism of host extracellular matrices, glycosaminoglycans, in streptococci
        Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
        Kyoto University
        Wataru HASHIMOTO
        From 28 Apr. 2011, To 31 Mar. 2014, Project Closed
        連鎖球菌;宿主細胞外マトリックス;グリコサミノグリカン;代謝機構;イソメラーゼ;還元酵素;X線結晶構造解析;不飽和グルクロニルヒドロラーゼ;応用微生物学;微生物代謝;構造生物学;代謝酵素;遺伝子クラスター;構造機能相関;異性化酵素;細胞外マトリックス;感染症
      • Structure and function of complex of substrate-binding protein and macromolecule-specific ABC transpoter
        Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
        Setsunan University;Kyoto University
        Kousaku MURATA
        From 01 Apr. 2011, To 31 Mar. 2014, Project Closed
        ABCトランスポーター;酸性多糖輸送;Sphingomonas属細菌;X線結晶構造;輸送体分子進化;X線結晶構造;基質結合タンパク質;アルギン酸;スフィンゴモナス属細菌;X線結晶構造解析;プロテオリポソーム再構成系;ヘテロ多糖;高分子輸送;アルギン酸結合タンパク質;ABCタンパク質
      • Structure and function of streptococcal system for heparin degradation/import and its involvement in infectious diseases
        Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
        Kyoto University
        Wataru HASHIMOTO
        Project Closed
        連鎖球菌;宿主細胞外マトリックス;グリコサミノグリカン;多糖リアーゼ;不飽和グルクロニルヒドロラーゼ;侵入・感染;X線結晶構造解析;コンドロイチン二糖;硫酸化糖;部位特異的変異;ファスフォトランスフェラーゼ系;アミノ糖;αケトグルコン酸;DNAマイクロアレイ
      • Structure/function relationship and cell surface localization mechanism of bacterial flagelin
        Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
        Kyoto University
        Kousaku MURATA
        Project Closed
        フラジェリン;鞭毛;ペプチドグリカン加水分解酵素;メタロペプチダーゼ;X線結晶構造解析;体腔形成細菌;細菌細胞表層構造;アルギン酸;ペプチドグリカン加水分解楮;スフィンゴモナス属細菌;超チャネル;ペプチドグリカン構造;ペプチドグリカン分解酵素;X線結晶構造;フラジェリン進化
      • 体腔器官の分子移植による細菌の構造と機能の大規模改変とその応用
        Grant-in-Aid for Exploratory Research
        Kyoto University
        村田 幸作
        Project Closed
        体腔;器官分子移植;環境浄化;巨大分子輸送;細胞表層構造;フラジェリン;アルギン酸;ダイオキシン;Sphingomonas属細菌;分子移殖;膜輸送機構;bioremediation
      • Molecular and structural biostudies on streptococcalinyasion/infection mechanisms to host cells through degradation of extracellular matrices glyoceaminoglycans
        Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
        Kyoto University
        Wataru HASHIMOTO
        Project Closed
        連鎖球菌;グリコサミノグリカン;多糖リアーゼ;不飽和グルクロニルヒドロラーゼ;侵入・感染機構;X線結晶構造解析;硫酸化糖;宿主細胞外マトリクス;細胞外マトリックス;コンドロイチン;ヒアルロン酸リアーゼ;遺伝子クラスター, Streptococcus;Glycosaminoalycan;Polysaccharide lyase;Unsaturated glucuronyl hydrolase;Invasion;infection mechanism;X-ray crystallography;Sulfated saccharide;Extracellular matrix
      • タンパク質の「揺らぎ」と機能発現における水分子の役割
        Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
        Science and Engineering
        Kyoto University
        村田 幸作
        Project Closed
        枯草菌;X線結晶構造解析;植物細胞壁;侵入・感染機構;不飽和ガラクツロニルヒドロラーゼ;ラムノガラクツロナン;水和;ビニルエーテル結合;連鎖球菌;細胞外マトリックス;グリコサミノグリカン;ヒアルロン酸リアーゼ;不飽和グルクロニルヒドロラーゼ;水和反応;反応機構
      • Molecular basis for cell surface architecture and evolution of bacterial flagellin by structure and unction analysis of the protein
        Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
        Kyoto University
        Kousaku MURATA
        Project Closed
        Sphingomonas;アルギン酸;フラジェリン;鞭毛;レセプター;X線結晶構造解析;体腔;T4ファージ;フィンガードメイン;鞭毛タンパク質;細菌細胞表層構造;Sphingomonas属細菌;鞭毛進化;細胞表層;襞構造, Sphingomonas;Alginate;Flagellin;Flagellum;Receptor;X-ray crystallography;Pit;T4 phage
      • 「小胞状構造体」の形成に関わる細菌細胞膜のダイナミクス
        Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
        Biological Sciences
        Kyoto University
        村田 幸作
        Project Closed
        スフィンゴモナス属細菌;体腔;プロテオミクス;細胞外膜タンパク質;鞭毛;フラジェリン;アルギン酸顆粒結合;レセプター
      • 高分子物質の結合と分解に関わるタンパク質・酵素の機能を規定する動的高次構造の解析
        Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
        Kyoto University
        橋本 渉
        Project Closed
        Bacillus;キサンタンリアーゼ;X線結晶構造解析;多糖リアーゼファミリー;ヒアルロン酸リアーゼ;コンドロイチンリアーゼ;反応機構;動的構造;スフィンゴモナス属細菌;高分子物質;アルギン酸結合タンパク質;アルギン酸リアーゼ;動的高次構造;ドメイン開閉;ループ開閉
      • 細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明
        Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
        Biological Sciences
        Kyoto University
        村田 幸作
        Project Closed
        スフィンゴモナス属細菌;枯草菌;体腔;メソソーム;プロテオミクス;鉄イオントランスポーター;フラジェリン;外膜タンパク質
      • Biochemical significance of the non-common amino acid sequences specifying the common functions of enzymes, polysaccharide lyases
        Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
        Kyoto University
        Kousaku MURATA
        Project Closed
        多糖リアーゼ;構造生物学;X線結晶構造解析;タンパク質構造機能相関;Sphingomonas属細菌;Bacillus属細菌;糖質加水分解酵素;糖質エピメラーゼ;翻訳後修飾機構;ヒドロラーゼ;エピメラーゼ;Sphingomonas;Bacillus;アルギン酸リアーゼ;翻訳後修飾;X線結晶構造;オートプロセシング;タンパク質・遺伝子の進化;キサンタンリアーゼ, Polysaccharide lyase;Structural biology;X-ray crystallography;Structure;function relationship of protein;Sphingomonas;Bacillus;Primary structure;Protein module
      • 緑膿菌エコーシステムにおけるバイオフィルムの酵素・遺伝学的特性解析とその応用
        Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
        Kyoto University
        橋本 渉
        Project Closed
        エコーシステム;バイオフィルム;緑膿菌;アルギン酸;アルギン酸リアーゼ;ポリリン酸キナーゼ;運動性;Sphingomonas属細菌
      • 難治性細菌感染症における細菌の増殖、潜伏及び感染持続機構の解析と新規治療法の確立
        Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
        Biological Sciences
        Kyoto University
        橋本 渉
        Project Closed
        細菌感染症;バイオフィルム;緑膿菌;アルギン酸;アルギン酸リアーゼ;抗原性;ポリエチレングリコール;アナフィラキシー
      • DNA分子の戦略的生存システムの解析とその応用
        Grant-in-Aid for Exploratory Research
        Kyoto University
        村田 幸作
        Project Closed
        DNA生理機能;増殖阻害;CpGモチーフ;防腐剤;DNA生存戦略;細菌感染症;DNA;発芽阻害;ジベレリン;アミラーゼ;細胞増殖制御;遺伝情報
      • X線結晶構造解析による多糖リアーゼの構造・機能相関と構造的一般則
        Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
        Kyoto University
        橋本 渉
        Project Closed
        多糖リアーゼ;X線結晶構造解析;構造・機能相関;アルギン酸;ゲラン;キサンタン;エンド型;エキソ型
      • Structure/function analysis of abundance and transmission mechanism of genetic information invlolved in the biosynthesis of multi-catalytic site enzyme
        Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
        KYOTO UNIVERSITY
        Kousaku MURATA
        Project Closed
        スフィンゴモナス属細菌;アルギン酸リアーゼ;自己プロセッシング;プロテアーゼ;X線結晶構造;β-脱離反応機構;遺伝情報多重性;プロテオーム;遺伝情報量;多触媒中心酵素;翻訳後修飾;X線結晶構造解析;アルギン酸;Shingomonas属細菌;プロテオーム解析, sphingomonas;alginate lyase;autoprocessing;protease;x-ray crystallography;β-elimination mechanism
      • 細菌細胞表層における体腔形成機構と体腔の高分子輸送機構
        Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
        Kyoto University
        村田 幸作
        Project Closed
        アルギン酸;Shingomonas属細菌;体腔(ピット);高分子物質取り込み機構;膜透過機構;細胞表層構造;ABCトランスポーター;細胞表層工学
      • Function and safety of bacterial alginate lyase for the therapy of biofilm-dependent infection of Pseudomonas aeruginosa
        Grant-in-Aid for Scientific Research (B).
        KYOTO UNIVERSITY
        Kousaku MURATA
        Project Closed
        アルギン酸リアーゼ;バイオフィルム;バイオフィルム感染症;抗原性エピトープ;酵素療法;部位特異的変異;アルギン酸;緑膿菌感染症;Shingomonas属細菌;バイオフィルム細菌感染症;緑膿菌;X線結晶構造解析;嚢胞性線維症;抗原性;細菌感染症;ヘテロ多糖;緑濃菌, alginate lyase;biofilm;biofilm-infection;antigenic epitope;enzyme therapy;site-directed mutagenesis;alginate;Pseudomonas aeruginosa
      • 細菌細胞表層への体腔提示と体腔への高分子ターゲッティング機構
        Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
        Kyoto University
        村田 幸作
        Project Closed
        分子標的;スフィンゴモナス;体腔構造;ABCトランスポーター;細菌細胞表層構造;ピット;細胞表層工学;高分子膜輸送
      • 細菌多糖リアーゼの多面的機能・構造相関解析と医薬・食品領域への応用
        Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
        Kyoto University
        橋本 渉
        Project Closed
        細菌多糖;多糖リアーゼ;オリゴ糖;酵素科学;遺伝子工学;食品工学
      • 多糖の合成と分解に関わるスヒンゴモナス属細菌表層の穴構造と新規高分子取り込み機構
        Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
        Kyoto University
        橋本 渉
        Project Closed
        スヒンゴモナス属細菌;細菌の細胞表層構造;細菌多糖;酵素科学;遺伝子工学
      • 油糧酵母を用いて褐藻から油脂への新しい炭素の流れを創造するための基盤研究
        Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
        Basic Section 38020:Applied microbiology-related
        Ishikawa Prefectural University
        河井 重幸
        From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2025, Granted
        褐藻;油糧酵母;Yarrowia lipolytica;アルギン酸;油脂

      External funds: others

      • 微生物による未利用ブルーカーボン(褐藻類)の高度利用
        東洋水産財団
        From 26 May 2021, To 31 Mar. 2022
        橋本 渉
      • 納豆菌による新しい発酵豆の創製
        タカノ農芸化学研究助成財団
        From 01 May 2021, To 30 Apr. 2022
        橋本 渉
      • 植物関連細菌を制御する大豆由来抗菌物質
        不二たん白質研究振興財団
        From 01 Apr. 2021, To 31 Mar. 2022
        橋本 渉
      • 腸内細菌の宿主動物多糖グリコサミノグリカンの代謝機構とその常在性との相関
        日本応用酵素協会酵素研究助成
        From 18 Apr. 2019, To 30 Jun. 2020
        橋本 渉
      • 多糖認識依存的細菌走化性の解析とそのホワイトバイオテクノロジーへの応用
        公益財団法人長瀬科学技術振興財団 研究助成金
        From 01 Apr. 2018, To 31 Mar. 2019
        橋本 渉
      • 微生物による水産資源からのレアメタル回収とバイオ燃料生産
        一般社団法人ヤンマー資源循環支援機構研究助成金
        From 01 Apr. 2018, To 31 Mar. 2019
        橋本 渉
      • 宿主細胞外マトリックスを標的とする常在細菌と病原細菌の定着・共生・感染に関わる分子機構の解明
        公益財団法人 ヤクルト・バイオサイエンス研究財団 一般研究助成
        From 01 Apr. 2018, To 31 Mar. 2019
        橋本 渉
      • 納豆菌による大豆成分の認識
        公益財団法人 不二たん白質研究振興財団
        From 01 Apr. 2017, To 31 Mar. 2018
        橋本 渉
      • 宿主細胞外マトリックスを介したプロバイオティクスとヒト腸管との相互作用
        公益財団法人ダノン健康栄養財団 ダノン学術研究助成金
        From 01 Jan. 2015, To 31 Dec. 2015
        橋本 渉
      • 酸性多糖の代謝に関わる還元酵素の立体構造に基づく補酵素特異性変換とそのバイオ燃料生産への応用
        公益財団法人野田産業科学研究所研究助成
        From 01 Apr. 2015, To 31 Mar. 2016
        橋本 渉
      • 断片化グリコサミノグリカンの分解に関わる新規酵素の構造機能相関とその医薬への応用
        公益財団法人水谷糖質科学振興財団研究助成
        From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2015
        橋本 渉
      • 窒素固定細菌によるグリセリンからのバイオポリマー発酵生産
        日本石鹸洗剤工業会 グリセリン新規用途開発研究助成金
        From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2015
        橋本 渉
      • 細菌細胞壁ペプチドグリカンの分解に関する研究
        (財)昭和報公会研究助成金
        From 01 Apr. 2008, To 31 Mar. 2009
        橋本 渉
      • 多糖の輸送・分解に関わる細菌由来超分子の構造生物学とその食品・環境分野への応用
        文部科学省 キーテクノロジー研究開発の推進「ターゲットタンパク研究プログラム」
        From 01 Jul. 2007, To 31 Mar. 2012
        橋本 渉
      • Establishment of common structural rules for polysaccharide lyases and their application to medical areas
        ノボザイムズ研究奨励金
        From 01 Apr. 2002, To 31 Mar. 2003
        橋本 渉
      • 細菌『超チャネル』の高次構造と巨大分子輸送機能
        (財)新世代研究所研究奨励金
        From 01 Apr. 2001, To 31 Mar. 2002
        橋本 渉
      • Cell physiology of N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase responsible for synthesis of sialic acid and regulation of blood pressure
        (財)稲盛財団研究助成金
        From 01 Apr. 2001, To 31 Mar. 2002
        橋本 渉
      • 細菌体腔依存型高分子物質特異的ABCトランスポーターの構造と機能
        (財)日本バイオインダストリー協会研究奨励金
        From 01 Apr. 2000, To 31 Mar. 2001
        橋本 渉
      • 細菌細胞表層のダイナミクスと高分子物質の新規取り込み機構
        京都大学学術奨励金
        From 01 Apr. 1997, To 31 Mar. 1998
        橋本 渉
      list
        Last Updated :2022/07/02

        Education

        Teaching subject(s)

        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Seminar on Biochemistry and Microbiology
          7317, Fall, Faculty of Agriculture, 1
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Laboratory Course in Applied Microbiology
          3167, Fall, Faculty of Agriculture, 3
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Introduction to Food Bioscience
          7215, Spring, Faculty of Agriculture, 2
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Microbiological Technology
          7243, Fall, Faculty of Agriculture, 2
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Molecular Biotechnology Seminar1
          GB23, Year-long, Graduate School of Agriculture, 3
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Outline of Agricultural Science II
          5003, Fall, Faculty of Agriculture, 2
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Basic Microbiology
          7307, Fall, Faculty of Agriculture, 2
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Advanced Course of Synthetic Biology
          GA33, Spring, Graduate School of Agriculture, 1
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Applied Microbiology I
          5639, Fall, Faculty of Agriculture, 2
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Molecular Biotechnology Seminar2
          GB24, Year-long, Graduate School of Agriculture, 3
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Microbial Genetics
          7240, Spring, Faculty of Agriculture, 2
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Experimental Course in Molecular Biotechnology1
          GC23, Year-long, Graduate School of Agriculture, 6
        • From 01 Apr. 2022, To 31 Mar. 2023
          Experimental Course in Molecular Biotechnology2
          GC24, Year-long, Graduate School of Agriculture, 6
        • From Apr. 2011, To Mar. 2012
          微生物学実験及び実験法
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2011, To Mar. 2012
          専門外国書講読II
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2011, To Mar. 2012
          生物機能変換学
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2011, To Mar. 2012
          生物機能変換学専攻演習
          農学研究科
        • From Apr. 2012, To Mar. 2013
          Introduction to Foreign Literature in Food Science and Biotechnology II
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2012, To Mar. 2013
          Laboratory Course in Applied Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2012, To Mar. 2013
          Molecular Biotechnology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2013, To Mar. 2014
          Food Microbiology
          Spring, 農学部
        • From Apr. 2013, To Mar. 2014
          Molecular Biotechnology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2013, To Mar. 2014
          Introduction to Foreign Literature in Food Science and Biotechnology II
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2013, To Mar. 2014
          Laboratory Course in Applied Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2013, To Mar. 2014
          Molecular Biotechnology Seminar
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2013, To Mar. 2014
          Experimental Course in Molecular Biotechnology
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2013, To Mar. 2014
          Practice of Basic Informatics(Faculty of Agriculture)
          Fall, 全学共通科目
        • From Apr. 2014, To Mar. 2015
          Food Microbiology
          Spring, 農学部
        • From Apr. 2014, To Mar. 2015
          Molecular Biotechnology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2014, To Mar. 2015
          Introduction to Foreign Literature in Food Science and Biotechnology II
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2014, To Mar. 2015
          Laboratory Course in Applied Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2014, To Mar. 2015
          Molecular Biotechnology (Advanced Course)
          Fall, 農学研究科
        • From Apr. 2014, To Mar. 2015
          Molecular Biotechnology Seminar
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2014, To Mar. 2015
          Experimental Course in Molecular Biotechnology
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2015, To Mar. 2016
          Introduction to Foreign Literature in Food Science and Biotechnology II
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2015, To Mar. 2016
          Laboratory Course in Applied Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2015, To Mar. 2016
          Practice of Basic Informatics(Faculty of Agriculture)
          Fall, 全学共通科目
        • From Apr. 2015, To Mar. 2016
          Molecular Biotechnology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2015, To Mar. 2016
          Experimental Course in Molecular Biotechnology1
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2015, To Mar. 2016
          Experimental Course in Molecular Biotechnology
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2015, To Mar. 2016
          Molecular Biotechnology Seminar1
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2015, To Mar. 2016
          Molecular Biotechnology Seminar
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2015, To Mar. 2016
          Food Microbiology
          Spring, 農学部
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Basic Microbiology
          Spring, 農学部
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Basic Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Microbiological Technology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Microbial Genetics
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Laboratory Course in Applied Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Experimental Course in Molecular Biotechnology1
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Experimental Course in Molecular Biotechnology2
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Experimental Course in Molecular Biotechnology
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Molecular Biotechnology Seminar1
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Molecular Biotechnology Seminar2
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Molecular Biotechnology Seminar
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2016, To Mar. 2017
          Molecular Biotechnology (Advanced Course)
          Fall, 農学研究科
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Basic Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Microbiological Technology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Microbial Genetics
          Spring, 農学部
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Laboratory Course in Applied Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Advanced Course of Applied Microbiology
          Spring, 農学研究科
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Experimental Course in Molecular Biotechnology1
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Experimental Course in Molecular Biotechnology2
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Molecular Biotechnology Seminar1
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2017, To Mar. 2018
          Molecular Biotechnology Seminar2
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          ILAS Seminar
          Spring, 全学共通科目
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Advanced Course of Synthetic Biology
          Spring, 農学研究科
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Basic Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Microbiological Technology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Microbial Genetics
          Spring, 農学部
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Laboratory Course in Applied Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Experimental Course in Molecular Biotechnology1
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Experimental Course in Molecular Biotechnology2
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Molecular Biotechnology Seminar1
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Molecular Biotechnology Seminar2
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2018, To Mar. 2019
          Food Science and Production Technology
          Spring, 農学部
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          ILAS Seminar
          Spring, 全学共通科目
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Basic Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Microbiological Technology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Microbial Genetics
          Spring, 農学部
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Laboratory Course in Applied Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Advanced Course of Applied Microbiology
          Spring, 農学研究科
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Seminar on Biochemistry and Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Experimental Course in Molecular Biotechnology1
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Experimental Course in Molecular Biotechnology2
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Molecular Biotechnology Seminar1
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Molecular Biotechnology Seminar2
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Food Science and Production Technology
          Spring, 農学部
        • From Apr. 2019, To Mar. 2020
          Food Industries
          Spring, 農学部
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Advanced Course of Synthetic Biology
          Spring, 農学研究科
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Basic Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Microbiological Technology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Microbial Genetics
          Spring, 農学部
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Laboratory Course in Applied Microbiology
          Year-long, 農学部
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Seminar on Biochemistry and Microbiology
          Spring, 農学部
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Experimental Course in Molecular Biotechnology1
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Experimental Course in Molecular Biotechnology2
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Molecular Biotechnology Seminar1
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Molecular Biotechnology Seminar2
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2020, To Mar. 2021
          Thesis
          Year-long, 農学部
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Basic Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Microbiological Technology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Microbial Genetics
          Spring, 農学部
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Applied Microbiology I
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Laboratory Course in Applied Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Advanced Course of Applied Microbiology
          Spring, 農学研究科
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Seminar on Biochemistry and Microbiology
          Fall, 農学部
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Experimental Course in Molecular Biotechnology1
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Experimental Course in Molecular Biotechnology2
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Molecular Biotechnology Seminar1
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Molecular Biotechnology Seminar2
          Year-long, 農学研究科
        • From Apr. 2021, To Mar. 2022
          Introduction to Food Bioscience
          Spring, 農学部

        Participation in PhD Defense

        • Studies on the activities of serine proteases from Ficus carica
          NISHIMURA KOSAKU, Graduate School of Agriculture, Sub-chief Examiner
          26 Jul. 2021
        list
          Last Updated :2022/07/02

          Administration

          School management (title, position)

          • From 01 Oct. 2021, To 30 Sep. 2023
            設備整備・共用促進委員会 委員
          • From 01 Jan. 2022, To 31 Dec. 2023
            オープンキャンパス委員会 委員長
          • From 01 Jan. 2013, To 31 Dec. 2013
            宇治キャンパス公開2013実行委員会 委員
          • From 01 Apr. 2012, To 31 Mar. 2014
            宇治地区宇治事業所省エネルギー推進委員会 委員
          • From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2018
            宇治地区宇治事業所省エネルギー推進委員会 委員
          • From 01 Apr. 2010, To 31 Mar. 2012
            宇治地区宇治事業所省エネルギー推進委員会 委員
          • From 01 Dec. 2017, To 31 Mar. 2019
            教職教育委員会 委員
          • From 01 Jan. 2021, To 31 Dec. 2021
            オープンキャンパス委員会 委員(委員長代行)
          • From 01 Apr. 2019, To 31 Mar. 2021
            インキュベーションプログラム小委員会 委員
          • From 01 Jan. 2020, To 31 Dec. 2020
            宇治キャンパス公開2020実行委員会
          • From 01 Apr. 2018
            宇治キャンパス危機管理委員会防火防災ワーキンググループ
          • From 01 Apr. 2018, To 31 Mar. 2020
            宇治地区宇治事業所省エネルギー推進委員会 委員
          • From 01 Apr. 2020, To 31 Mar. 2022
            宇治地区宇治事業所省エネルギー推進委員会 委員
          • From 01 Apr. 2018, To 31 Mar. 2020
            宇治地区施設整備・将来計画委員会 委員
          • From 01 Apr. 2020, To 31 Mar. 2022
            宇治地区施設整備・将来計画委員会 委員

          Faculty management (title, position)

          • From 01 Jan. 2013, To 31 Dec. 2013
            京都大学宇治キャンパス公開2013実行委員会
          • From 01 Apr. 2012, To 31 Mar. 2014
            宇治事業所省エネルギー推進委員会
          • From 01 Apr. 2014, To 31 Mar. 2016
            宇治事業所省エネルギー推進委員会
          • From 01 Apr. 2013, To 31 Mar. 2015
            図書委員会 委員
          • From 01 Apr. 2015, To 31 Mar. 2017
            国際交流委員会 委員
          • From 01 Apr. 2016, To 31 Mar. 2018
            学部教務委員会 委員
          • From 01 Apr. 2017, To 31 Mar. 2021
            制度・組織等検討委員会 委員
          • From 01 Apr. 2020, To 31 Mar. 2022
            評価委員会 委員
          • From 01 Apr. 2018, To 31 Mar. 2020
            食品生物科学科長
          • From 01 Apr. 2020, To 30 Sep. 2020
            食品生物科学専攻長
          • From 01 Apr. 2020, To 31 Mar. 2022
            防火・防災委員会 委員
          • From 01 Apr. 2020, To 31 Mar. 2022
            人権問題対策委員会 委員
          • From 01 Oct. 2020, To 31 Mar. 2022
            副研究科長
          • From 01 Oct. 2020, To 31 Mar. 2022
            将来構想検討委員会 委員
          • From 01 Oct. 2020, To 31 Mar. 2022
            広報委員会 委員長
          • From 01 Oct. 2020, To 31 Mar. 2022
            研究活動推進委員会 委員長
          • From 01 Oct. 2020, To 31 Mar. 2022
            情報セキュリティ・システム委員会 委員
          • From 01 Oct. 2020, To 31 Mar. 2022
            兼業審査員会 委員

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