基本情報

所属学協会

• 自 2019年12月, 至 現在

  日本メディカルAI学会
• 日本RNA学会

学位

• 2002年03月25日

  名古屋大学修士（理学）
• 2006年07月31日

  名古屋大学博士（理学）
• 修士（理学）(名古屋大学)
• 博士（理学）(名古屋大学)

出身大学院・研究科等

• 名古屋大学, 大学院理学研究科生命理学専攻博士前期課程, 修了

出身学校・専攻等

• 名古屋大学, 理学部生命理学科, 卒業

経歴

• 自 2024年04月, 至 現在

  京都大学, 医学研究科附属 がん免疫総合研究センター, 特定准教授（クロスアポイントメント）
• 自 2022年06月, 至 2024年03月

  京都大学 iPS細胞研究所, 研究員(非常勤)
• 自 2022年04月, 至 現在

  京都大学, 大学院医学研究科, 客員研究員
• 自 2022年04月, 至 現在

  近畿大学, 理工学部, 講師
• 自 2012年09月, 至 2022年03月

  京都大学, 医学研究科, 特定助教
• 自 2008年12月, 至 2012年08月

  理化学研究所, 生命情報基盤研究部門
• 自 2007年04月, 至 2008年11月

  University of California, Riverside
• 自 2004年04月, 至 2007年03月

  長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部
• 自 2002年04月, 至 2004年03月

  理化学研究所, ゲノム科学研究センター

ID,URL

• ORCID ID

  0000-0001-7130-8705

• J-Global ID

  200901087903479252

• 外部リンク

  https://keiiida.github.io/japanease/

関連Webサイト

• https://keiiida.github.io/

researchmap URL

• https://researchmap.jp/read0118609

研究

研究キーワード

• がん免疫
• 筋萎縮性側索硬化症（ALS）
• 一細胞RNA-seq
• RNA結合タンパク質
• エピトランスクリプトーム
• トランスクリプトーム
• 選択的スプライシング
• 情報生物学

研究分野

• ライフサイエンス, システムゲノム科学, データサイエンス

論文

• Invention of an oral medication for cardiac Fabry disease caused by RNA mis-splicing

  Tomonari Awaya; Teruo Sawada; Megumu Saito; Masatoshi Hagiwara; Masahiko Ajiro; Kei IIDA; Hiroko Kobayashi; Kentoku Gotanda; Toshiharu Noji; Naohiro Takemoto; Dau-Ming Niu

  Science Advances, 2025年04月09日

  
• Switching of OAS1 splicing isoforms overcomes SNP-derived vulnerability to SARS-CoV-2 infection

  Kei Iida; Masahiko Ajiro; Akiko Nakano-Kobayashi; Yukiko Muramoto; Toru Takenaga; Masatsugu Denawa; Ryo Kurosawa; Takeshi Noda; Masatoshi Hagiwara

  BMC Biology, 2025年03月03日

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• Arabidopsis whole genome expression profiling under abiotic stress conditions

  Seki, M; Ishida, J; Morosawa, T; Matsui, A; Kim, JM; Nakajima, M; Enju, A; To, T; Iida, K; Go, M; Mochizuki, Y; Hasegawa, Y; Toyoda, T; Shinozaki, K

  Plant and Cell Physiology, 2006年, 査読有り

  
• PDIVAS: Pathogenicity predictor for Deep-Intronic Variants causing Aberrant Splicing

  Ryo Kurosawa; Kei Iida; Masahiko Ajiro; Tomonari Awaya; Mamiko Yamada; Kenjiro Kosaki; Masatoshi Hagiwara

  BMC Genomics, 2023年10月10日

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• Switching of OAS1 splicing isoforms mitigates SARS-CoV-2 infection

  Kei Iida; Masahiko Ajiro; Yukiko Muramoto; Toru Takenaga; Masatsugu Denawa; Ryo Kurosawa; Takeshi Noda; Masatoshi Hagiwara

  2021年08月23日

  
• Secretory GFP reconstitution labeling of neighboring cells interrogates cell–cell interactions in metastatic niches

  Misa Minegishi; Takahiro Kuchimaru; Kaori Nishikawa; Takayuki Isagawa; Satoshi Iwano; Kei Iida; Hiromasa Hara; Shizuka Miura; Marika Sato; Shigeaki Watanabe; Akifumi Shiomi; Yo Mabuchi; Hiroshi Hamana; Hiroyuki Kishi; Tatsuyuki Sato; Daigo Sawaki; Shigeru Sato; Yutaka Hanazono; Atsushi Suzuki; Takahide Kohro; Tetsuya Kadonosono; Tomomi Shimogori; Atsushi Miyawaki; Norihiko Takeda; Hirofumi Shintaku; Shinae Kizaka-Kondoh; Satoshi Nishimura

  Nature Communications, 2023年12月05日

  
• Sfpq-KOマウスをモデルとした骨格筋代謝-筋量制御ネットワークの解析

  細川 元靖; 武内 章英; 谷端 淳; 飯田 慶; 武田 伸一; 萩原 正敏

  日本筋学会学術集会プログラム・抄録集, 2019年08月

  
• CCL21‐Ser expression in melanoma cells recruits CCR7+ naïve T cells to tumor tissues and promotes tumor growth

  Megumi Miyamoto; Yuki Kawato; Ryonosuke Fujie; Kaoru Kurowarabe; Kakeru Fujiwara; Reika Nobusawa; Ryota Hayashi; Kei Iida; Izumi Ohigashi; Haruko Hayasaka

  Cancer Science, 2023年07月08日, 査読有り

  
• Integrated-gut-liver-on-a-chip platform as an in vitro human model of non-alcoholic fatty liver disease

  Jiandong Yang; Yoshikazu Hirai; Kei Iida; Shinji Ito; Marika Trumm; Shiho Terada; Risako Sakai; Toshiyuki Tsuchiya; Osamu Tabata; Ken-ichiro Kamei

  Communications Biology, 2023年03月23日, 査読有り

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• Identification of the α2 chain of interleukin‐13 receptor as a potential biomarker for predicting castration resistance of prostate cancer using patient‐derived xenograft models

  Takahiro Nagai; Naoki Terada; Masato Fujii; Yasuhisa Nagata; Kozue Nakahara; Shoichiro Mukai; Kosuke Okasho; Yuki Kamiyama; Shusuke Akamatsu; Takashi Kobayashi; Kei Iida; Masatsugu Denawa; Masatoshi Hagiwara; Takahiro Inoue; Osamu Ogawa; Toshiyuki Kamoto

  Cancer Reports, 2022年08月09日

  
• Involvement of endothelins in neuroprotection of valosin-containing protein modulators against retinal ganglion cell damage

  Mami Kusaka; Tomoko Hasegawa; Hanako Ohashi Ikeda; Yumi Inoue; Sachiko Iwai; Kei Iida; Akitaka Tsujikawa

  Scientific Reports, 2022年09月28日

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• Chemical induction of splice-neoantigens attenuates tumor growth in a preclinical model of colorectal cancer

  Shingo Matsushima; Masahiko Ajiro; Kei Iida; Kenji Chamoto; Tasuku Honjo; Masatoshi Hagiwara

  Science Translational Medicine, 2022年11月30日

  
• Method for Identifying Sequence Motifs in Pre-miRNAs for Small-Molecule Binding

  Yusuke Takashima; Asako Murata; Kei Iida; Ayako Sugai; Masatoshi Hagiwara; Kazuhiko Nakatani

  ACS CHEMICAL BIOLOGY, 2022年09月

  
• 急性網膜神経節細胞障害モデルを用いたVCP ATPase阻害剤の神経保護メカニズム

  日下 真実; 長谷川 智子; 池田 華子; 岩井 祥子; 飯田 慶; 垣塚 彰; 辻川 明孝

  日本眼科学会雑誌, 2021年03月

  
• 3H1315 カルシウム、亜鉛、マグネシウムイオン配位子のモジュールへの局在

  飯田 慶; 松井 信彰; 由良 敬; 郷 通子

  生物物理, 2000年

  
• Versatility of RNA-Binding Proteins in Living Cells

  Riki Kurokawa; Akihide Takeuchi; Nobuyuki Shiina; Masato Katahira; Takefumi Yamashita; Yoko Matsuno; Keisuke Hitachi; Shinsuke Ishigaki; Nesreen Haamad; Ryoma Yoneda; Naomi Ueda; Kei Iida; Motoyasu Hosokawa; Masatoshi Hagiwara; Mamiko Iida; Tsukasa Mashima; Yudai Yamaoki; Masatomo So; Takashi Nagata; Gen Sobue; Keiko Kondo; Hiroki Watanabe; Takayuki Uchihashi

  Biomedical Sciences, 2019年, 査読有り

  
• 3P288 シロイヌナズナにおける低温ストレス下での選択的スプライシングの様相の変化(生命情報科学 B) 機能ゲノミクス)

  飯田 慶; 関 原明; 櫻井 哲也; 佐藤 将一; 秋山 顕治; 豊田 哲郎; 小長谷 明彦; 篠崎 一雄

  生物物理, 2004年

  
• Therapeutic manipulation of IKBKAP mis-splicing with a small molecule to cure familial dysautonomia.

  Masahiko Ajiro; Tomonari Awaya; Young Jin Kim; Kei Iida; Masatsugu Denawa; Nobuo Tanaka; Ryo Kurosawa; Shingo Matsushima; Saiko Shibata; Tetsunori Sakamoto; Rolenz Studer; Adrian R Krainer; Masatoshi Hagiwara

  Nature communications, 2021年07月23日

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• CDC2-like (CLK) protein kinase inhibition as a novel targeted therapeutic strategy in prostate cancer

  Simon Uzor; Sean R. Porazinski; Ling Li; Bethany Clark; Masahiko Ajiro; Kei Iida; Masatoshi Hagiwara; Abdullah A. Alqasem; Claire M. Perks; Ian D. Wilson; Sebastian Oltean; Michael R. Ladomery

  Scientific Reports, 2021年04月12日, 査読有り

  
• Improvement of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase thermostability by introducing a disulfide bridge in the ribonuclease H region

  Yutaro Narukawa; Mako Kandabashi; Tongyang Li; Misato Baba; Haruka Hara; Kenji Kojima; Kei Iida; Takayoshi Hiyama; Sho Yokoe; Tomomi Yamazaki; Teisuke Takita; Kiyoshi Yasukawa

  Protein Engineering, Design and Selection, 2021年02月15日, 査読有り

  
• S1PR3–G12-biased agonist ALESIA targets cancer metabolism and promotes glucose starvation

  Masayasu Toyomoto; Asuka Inoue; Kei Iida; Masatsugu Denawa; Isao Kii; Francois Marie Ngako Kadji; Takayuki Kishi; Dohyun Im; Tatsuro Shimamura; Hiroshi Onogi; Suguru Yoshida; So Iwata; Junken Aoki; Takamitsu Hosoya; Masatoshi Hagiwara

  Cell Chemical Biology, 2021年02月, 査読有り

  
• Identification of Qk as a Glial Precursor Cell Marker that Governs the Fate Specification of Neural Stem Cells to a Glial Cell Lineage

  Akihide Takeuchi; Yuji Takahashi; Kei Iida; Motoyasu Hosokawa; Koichiro Irie; Mikako Ito; J.B. Brown; Kinji Ohno; Kinichi Nakashima; Masatoshi Hagiwara

  Stem Cell Reports, 2020年10月, 査読有り

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• Multilateral Bioinformatics Analyses Reveal the Function-Oriented Target Specificities and Recognition of the RNA-Binding Protein SFPQ

  Kei Iida; Masatoshi Hagiwara; Akihide Takeuchi

  iScience, 2020年07月, 査読有り

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• Effect of VCP modulators on gene expression profiles of retinal ganglion cells in an acute injury mouse model.

  Tomoko Hasegawa; Hanako Ohashi Ikeda; Norimoto Gotoh; Kei Iida; Sachiko Iwai; Noriko Nakano; Akira Kakizuka; Akitaka Tsujikawa

  Scientific reports, 2020年03月06日, 査読有り

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• Integrative network analysis reveals biological pathways associated with Williams syndrome

  Ryo Kimura; Vivek Swarup; Kiyotaka Tomiwa; Michael J. Gandal; Neelroop N. Parikshak; Yasuko Funabiki; Masatoshi Nakata; Tomonari Awaya; Takeo Kato; Kei Iida; Shin Okazaki; Kanae Matsushima; Toshihiro Kato; Toshiya Murai; Toshio Heike; Daniel H. Geschwind; Masatoshi Hagiwara

  Journal of Child Psychology and Psychiatry, 2019年05月, 査読有り

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• Loss of RNA-Binding Protein Sfpq Causes Long-Gene Transcriptopathy in Skeletal Muscle and Severe Muscle Mass Reduction with Metabolic Myopathy

  Motoyasu Hosokawa; Akihide Takeuchi; Jun Tanihata; Kei Iida; Shin'ichi Takeda; Masatoshi Hagiwara

  iScience, 2019年03月, 査読有り

  
• Accurate fidelity analysis of the reverse transcriptase by a modified next-generation sequencing.

  Hiroyuki Okano; Misato Baba; Ryota Hidese; Kei Iida; Tongyang Li; Kenji Kojima; Teisuke Takita; Itaru Yanagihara; Shinsuke Fujiwara; Kiyoshi Yasukawa

  Enzyme and microbial technology, 2018年08月, 査読有り

  
• Synaptic N6-methyladenosine (m6A) epitranscriptome reveals functional partitioning of localized transcripts

  Daria Merkurjev; Wan-Ting Hong; Kei Iida; Ikumi Oomoto; Belinda J. Goldie; Hitoshi Yamaguti; Takayuki Ohara; Shin-ya Kawaguchi; Tomoo Hirano; Kelsey C. Martin; Matteo Pellegrini; Dan Ohtan Wang

  Nature Neuroscience, 2018年06月27日, 査読有り

  
• SINC-seq: correlation of transient gene expressions between nucleus and cytoplasm reflects single-cell physiology.

  Mahmoud N Abdelmoez; Kei Iida; Yusuke Oguchi; Hidekazu Nishikii; Ryuji Yokokawa; Hidetoshi Kotera; Sotaro Uemura; Juan G Santiago; Hirofumi Shintaku

  Genome biology, 2018年06月06日, 査読有り

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• Loss of Sfpq Causes Long-Gene Transcriptopathy in the Brain.

  Akihide Takeuchi; Kei Iida; Toshiaki Tsubota; Motoyasu Hosokawa; Masatsugu Denawa; J B Brown; Kensuke Ninomiya; Mikako Ito; Hiroshi Kimura; Takaya Abe; Hiroshi Kiyonari; Kinji Ohno; Masatoshi Hagiwara

  Cell reports, 2018年05月01日, 査読有り

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• Next-generation sequencing-based analysis of reverse transcriptase fidelity.

  Kiyoshi Yasukawa; Kei Iida; Hiroyuki Okano; Ryota Hidese; Misato Baba; Itaru Yanagihara; Kenji Kojima; Teisuke Takita; Shinsuke Fujiwara

  Biochemical and biophysical research communications, 2017年10月14日, 査読有り

  
• Novel Stress-Inducible Antisense RNAs of Protein-Coding Loci Are Synthesized by RNA-Dependent RNA Polymerase.

  Akihiro Matsui; Kei Iida; Maho Tanaka; Katsushi Yamaguchi; Kayoko Mizuhashi; Jong-Myong Kim; Satoshi Takahashi; Norio Kobayashi; Shuji Shigenobu; Kazuo Shinozaki; Motoaki Seki

  Plant physiology, 2017年09月, 査読有り

  
• DNA hypermethyation and silencing of PITX1 correlated with advanced stage and poor postoperative prognosis of esophageal squamous cell carcinoma.

  Otsubo T; Yamada K; Hagiwara T; Oshima K; Iida K; Nishikata K; Toyoda T; Igari T; Nohara K; Yamashita S; Hattori M; Dohi T; Kawamura YI

  Oncotarget, 2017年09月, 査読有り

  
• Retinoid derivative Tp80 exhibits anti-hepatitis C virus activity through restoration of GI-GPx expression

  Bao Ngoc Nguyen; Yukiko Okuno; Masahiko Ajiro; Kei Iida; Masatsugu Denawa; Makoto Yamamoto; Naoya Sakamoto; Hiroyuki Kagechika; Masatoshi Hagiwara

  Journal of Medical Virology, 2017年07月01日, 査読有り

  
• Synthetic ligand promotes gene expression by affecting GC sequence in promoter

  Saki Matsumoto; Kei Iida; Asako Murata; Masatsugu Denawa; Masatoshi Hagiwara; Kazuhiko Nakatani

  Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters, 2017年, 査読有り

  
• Sm-like protein-mediated RNA metabolism is required for heat stress tolerance in Arabidopsis

  Masanori Okamoto; Akihiro Matsui; Maho Tanaka; Taeko Morosawa; Junko Ishida; Kei Iida; Yoshiki Mochizuki; Tetsuro Toyoda; Motoaki Seki

  Frontiers in Plant Science, 2016年07月21日, 査読有り

  
• On-the-fly selection of cell-specific enhancers, genes, miRNAs and proteins across the human body using SlideBase

  Hans Ienasescu; Kang Li; Robin Andersson; Morana Vitezic; Sarah Rennie; Yun Chen; Kristoffer Vitting-Seerup; Emil Lagoni; Mette Boyd; Jette Bornholdt; Michiel J. L. De Hoon; Hideya Kawaji; Timo Lassmann; Yoshihide Hayashizaki; Alistair R. R. Forrest; Piero Carninci; Albin Sandelin

  Database, 2016年01月01日, 査読有り

  
• Next-generation sequencing-based comprehensive molecular analysis of 43 Japanese patients with cone and cone-rod dystrophies.

  Maho Oishi, Akio Oishi, Norimoto Gotoh, Ken Ogino, Koichiro Higasa, Kei Iida, Yukiko Makiyama, Satoshi Morooka, Fumihiko Matsuda, Nagahisa Yoshimura

  Molecular vision, 2016年, 査読有り

  
• The Constrained Maximal Expression Level Owing to Haploidy Shapes Gene Content on the Mammalian X Chromosome

  Laurence D. Hurst; Avazeh T. Ghanbarian; Alistair R. R. Forrest; FANTOM consortium; Lukasz Huminiecki; Michael Rehli; J. Kenneth Baillie; Michiel J. L. de Hoon; Vanja Haberle; Timo Lassmann; Ivan V. Kulakovskiy; Marina Lizio; Masayoshi Itoh; Robin Andersson; Christopher J. Mungall; Terrence F. Meehan; Sebastian Schmeier; Nicolas Bertin; Mette Jørgensen; Emmanuel Dimont; Erik Arner; Christian Schmidl; Ulf Schaefer; Yulia A. Medvedeva; Charles Plessy; Morana Vitezic; Jessica Severin; Colin A. Semple; Yuri Ishizu; Robert S. Young; Margherita Francescatto; Intikhab Alam; Davide Albanese; Gabriel M. Altschuler; Takahiro Arakawa; John A.C. Archer; Peter Arner; Magda Babina; Sarah Baker; Piotr J. Balwierz; Anthony G. Beckhouse; Swati-Bhatt Pradhan; Judith A. Blake; Antje Blumenthal; Beatrice Bodega; Alessandro Bonetti; James Briggs; Frank Brombacher; A. Maxwell Burroughs; Andrea Califano; Carlo V. Cannistraci; Daniel Carbajo; Yun Chen; Marco Chierici; Yari Ciani; Hans C. Clevers; Emiliano Dalla; Carrie A. Davis; Michael Detmar; Alexander D. Diehl; Taeko Dohi; Finn Drabløs; Albert S.B. Edge; Matthias Edinger; Karl Ekwall; Mitsuhiro Endoh; Hideki Enomoto; Michela Fagiolini; Lynsey Fairbairn; Hai Fang; Mary C. Farach-Carson; Geoffrey J. Faulkner; Alexander V. Favorov; Malcolm E. Fisher; Martin C. Frith; Rie Fujita; Shiro Fukuda; Cesare Furlanello; Masaaki Furuno; Jun-ichi Furusawa; Teunis B. Geijtenbeek; Andrew Gibson; Thomas Gingeras; Daniel Goldowitz; Julian Gough; Sven Guhl; Reto Guler; Stefano Gustincich; Thomas J. Ha; Masahide Hamaguchi; Mitsuko Hara; Matthias Harbers; Jayson Harshbarger; Akira Hasegawa; Yuki Hasegawa; Takehiro Hashimoto; Meenhard Herlyn; Kelly J. Hitchens; Shannan J. Ho Sui; Oliver M. Hofmann; Ilka Hoof; Fumi Hori; Lukasz Huminiecki; Kei Iida; Tomokatsu Ikawa; Boris R. Jankovic; Hui Jia; Anagha Joshi; Giuseppe Jurman; Bogumil Kaczkowski; Chieko Kai; Kaoru Kaida; Ai Kaiho; Kazuhiro Kajiyama; Mutsumi-Katayama Kanamori; Artem S. Kasianov; Takeya Kasukawa; Shintaro Katayama; Sachi Kato; Shuji Kawaguchi; Hiroshi Kawamoto; Yuki I. Kawamura; Tsugumi Kawashima; Judith S. Kempfle; Tony J. Kenna; Juha Kere; Levon M. Khachigian; Toshio Kitamura; S. Peter Klinken; Alan J. Knox; Miki Kojima; Soichi Kojima; Naoto Kondo; Haruhiko Koseki; Shigeo Koyasu; Sarah Krampitz; Atsutaka Kubosaki; Andrew T. Kwon; Jeroen F.J. Laros; Weonju Lee; Andreas Lennartsson; Kang Li; Berit Lilje; Leonard Lipovich; Alan-sim Mackay; Riichiroh Manabe; Jessica C. Mar; Benoit Marchand; Anthony Mathelier; Niklas Mejhert; Alison Meynert; Yosuke Mizuno; David A. de Lima Morais; Hiromasa Morikawa; Mitsuru Morimoto; Kazuyo Moro; Efthymios Motakis; Hozumi Motohashi; Christine L. Mummery; Mitsuyoshi Murata; Sayaka-Sato Nagao; Yutaka Nakachi; Fumio Nakahara; Toshiyuki Nakamura; Yukio Nakamura; Kenichi Nakazato; Erik van Nimwegen; Noriko Ninomiya; Hiromi Nishiyori; Shohei Noma; Tadasuke Nozaki; Soichi Ogishima; Naganari Ohkura; Hiroko Ohmiya; Hiroshi Ohno; Mitsuhiro Ohshima; Mariko-Hatakeyama Okada; Yasushi Okazaki; Valerio Orlando; Dmitry A. Ovchinnikov; Arnab Pain; Robert Passier; Margaret Patrikakis; Helena Persson; Silvano Piazza; James G.D. Prendergast; Owen J.L. Rackham; Jordan A. Ramilowski; Mamoon Rashid; Timothy Ravasi; Patrizia Rizzu; Marco Roncador; Sugata Roy; Morten B. Rye; Eri Saijyo; Antti Sajantila; Akiko Saka; Shimon Sakaguchi; Mizuho Sakai; Hiroki Sato; Hironori Satoh; Suzana Savvi; Alka Saxena; Claudio Schneider; Erik A. Schultes; Gundula G. Schulze-Tanzil; Anita Schwegmann; Thierry Sengstag; Guojun Sheng; Hisashi Shimoji; Yishai Shimoni; Jay W. Shin; Christophe Simon; Daisuke Sugiyama; Takaaki Sugiyama; Masanori Suzuki; Naoko Suzuki; Rolf K. Swoboda; Peter A.C. 't Hoen; Michihira Tagami; Naoko Takahashi; Jun Takai; Hiroshi Tanaka; Hideki Tatsukawa; Zuotian Tatum; Mark Thompson; Hiroo Toyoda; Tetsuro Toyoda; Eivind Valen; Marc van de Wetering; Linda M. van den Berg; Roberto Verardo; Dipti Vijayan; Ilya E. Vorontsov; Wyeth W. Wasserman; Shoko Watanabe; Christine A. Wells; Louise N. Winteringham; Ernst Wolvetang; Emily J. Wood; Yoko Yamaguchi; Masayuki Yamamoto; Misako Yoneda; Yohei Yonekura; Shigehiro Yoshida; Suzan E. Zabierowski; Peter G. Zhang; Xiaobei Zhao; Silvia Zucchelli; Kim M. Summers; Harukazu Suzuki; Carsten O. Daub; Jun Kawai; Peter Heutink; Winston Hide; Tom C. Freeman; Boris Lenhard; Vladimir B. Bajic; Martin S. Taylor; Vsevolod J. Makeev; Albin Sandelin; David A. Hume; Piero Carninci; Yoshihide Hayashizaki

  PLoS Biology, 2015年12月18日, 査読有り

  
• Deciphering targeting rules of splicing modulator compounds: Case of TG003

  Maki Sakuma; Kei Iida; Masatoshi Hagiwara

  BMC Molecular Biology, 2015年09月24日, 査読有り

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• Loss of Arabidopsis 5′–3′ Exoribonuclease AtXRN4 Function Enhances Heat Stress Tolerance of Plants Subjected to Severe Heat Stress

  Anh Hai Nguyen; Akihiro Matsui; Maho Tanaka; Kayoko Mizunashi; Kentaro Nakaminami; Makoto Hayashi; Kei Iida; Tetsuro Toyoda; Dong Van Nguyen; Motoaki Seki

  Plant and Cell Physiology, 2015年09月, 査読有り

  
• Rectifier of aberrant mRNA splicing recovers tRNA modification in familial dysautonomia

  Mayumi Yoshida; Naoyuki Kataoka; Kenjyo Miyauchi; Kenji Ohe; Kei Iida; Suguru Yoshida; Takayuki Nojima; Yukiko Okuno; Hiroshi Onogi; Tomomi Usui; Akihide Takeuchi; Takamitsu Hosoya; Tsutomu Suzuki; Masatoshi Hagiwara

  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015年03月03日, 査読有り

  
• Comprehensive Molecular Diagnosis of a Large Cohort of Japanese Retinitis Pigmentosa and Usher Syndrome Patients by Next-Generation Sequencing

  Maho Oishi; Akio Oishi; Norimoto Gotoh; Ken Ogino; Koichiro Higasa; Kei Iida; Yukiko Makiyama; Satoshi Morooka; Fumihiko Matsuda; Nagahisa Yoshimura

  Investigative Opthalmology & Visual Science, 2014年11月19日, 査読有り

  
• CDK9 inhibitor FIT-039 prevents replication of multiple DNA viruses

  Makoto Yamamoto; Hiroshi Onogi; Isao Kii; Suguru Yoshida; Kei Iida; Hiroyuki Sakai; Minako Abe; Toshiaki Tsubota; Nobutoshi Ito; Takamitsu Hosoya; Masatoshi Hagiwara

  Journal of Clinical Investigation, 2014年08月01日, 査読有り

  
• A promoter-level mammalian expression atlas.

  Alistair R R Forrest; Hideya Kawaji; Michael Rehli; J Kenneth Baillie; Michiel J L de Hoon; Vanja Haberle; Timo Lassmann; Ivan V Kulakovskiy; Marina Lizio; Masayoshi Itoh; Robin Andersson; Christopher J Mungall; Terrence F Meehan; Sebastian Schmeier; Nicolas Bertin; Mette Jørgensen; Emmanuel Dimont; Erik Arner; Christian Schmidl; Ulf Schaefer; Yulia A Medvedeva; Charles Plessy; Morana Vitezic; Jessica Severin; Colin A Semple; Yuri Ishizu; Robert S Young; Margherita Francescatto; Intikhab Alam; Davide Albanese; Gabriel M Altschuler; Takahiro Arakawa; John A C Archer; Peter Arner; Magda Babina; Sarah Rennie; Piotr J Balwierz; Anthony G Beckhouse; Swati Pradhan-Bhatt; Judith A Blake; Antje Blumenthal; Beatrice Bodega; Alessandro Bonetti; James Briggs; Frank Brombacher; A Maxwell Burroughs; Andrea Califano; Carlo V Cannistraci; Daniel Carbajo; Yun Chen; Marco Chierici; Yari Ciani; Hans C Clevers; Emiliano Dalla; Carrie A Davis; Michael Detmar; Alexander D Diehl; Taeko Dohi; Finn Drabløs; Albert S B Edge; Matthias Edinger; Karl Ekwall; Mitsuhiro Endoh; Hideki Enomoto; Michela Fagiolini; Lynsey Fairbairn; Hai Fang; Mary C Farach-Carson; Geoffrey J Faulkner; Alexander V Favorov; Malcolm E Fisher; Martin C Frith; Rie Fujita; Shiro Fukuda; Cesare Furlanello; Masaaki Furino; Jun-ichi Furusawa; Teunis B Geijtenbeek; Andrew P Gibson; Thomas Gingeras; Daniel Goldowitz; Julian Gough; Sven Guhl; Reto Guler; Stefano Gustincich; Thomas J Ha; Masahide Hamaguchi; Mitsuko Hara; Matthias Harbers; Jayson Harshbarger; Akira Hasegawa; Yuki Hasegawa; Takehiro Hashimoto; Meenhard Herlyn; Kelly J Hitchens; Shannan J Ho Sui; Oliver M Hofmann; Ilka Hoof; Furni Hori; Lukasz Huminiecki; Kei Iida; Tomokatsu Ikawa; Boris R Jankovic; Hui Jia; Anagha Joshi; Giuseppe Jurman; Bogumil Kaczkowski; Chieko Kai; Kaoru Kaida; Ai Kaiho; Kazuhiro Kajiyama; Mutsumi Kanamori-Katayama; Artem S Kasianov; Takeya Kasukawa; Shintaro Katayama; Sachi Kato; Shuji Kawaguchi; Hiroshi Kawamoto; Yuki I Kawamura; Tsugumi Kawashima; Judith S Kempfle; Tony J Kenna; Juha Kere; Levon M Khachigian; Toshio Kitamura; S Peter Klinken; Alan J Knox; Miki Kojima; Soichi Kojima; Naoto Kondo; Haruhiko Koseki; Shigeo Koyasu; Sarah Krampitz; Atsutaka Kubosaki; Andrew T Kwon; Jeroen F J Laros; Weonju Lee; Andreas Lennartsson; Kang Li; Berit Lilje; Leonard Lipovich; Alan Mackay-Sim; Ri-ichiroh Manabe; Jessica C Mar; Benoit Marchand; Anthony Mathelier; Niklas Mejhert; Alison Meynert; Yosuke Mizuno; David A de Lima Morais; Hiromasa Morikawa; Mitsuru Morimoto; Kazuyo Moro; Efthymios Motakis; Hozumi Motohashi; Christine L Mummery; Mitsuyoshi Murata; Sayaka Nagao-Sato; Yutaka Nakachi; Fumio Nakahara; Toshiyuki Nakamura; Yukio Nakamura; Kenichi Nakazato; Erik van Nimwegen; Noriko Ninomiya; Hiromi Nishiyori; Shohei Noma; Shohei Noma; Tadasuke Noazaki; Soichi Ogishima; Naganari Ohkura; Hiroko Ohimiya; Hiroshi Ohno; Mitsuhiro Ohshima; Mariko Okada-Hatakeyama; Yasushi Okazaki; Valerio Orlando; Dmitry A Ovchinnikov; Arnab Pain; Robert Passier; Margaret Patrikakis; Helena Persson; Silvano Piazza; James G D Prendergast; Owen J L Rackham; Jordan A Ramilowski; Mamoon Rashid; Timothy Ravasi; Patrizia Rizzu; Marco Roncador; Sugata Roy; Morten B Rye; Eri Saijyo; Antti Sajantila; Akiko Saka; Shimon Sakaguchi; Mizuho Sakai; Hiroki Sato; Suzana Savvi; Alka Saxena; Claudio Schneider; Erik A Schultes; Gundula G Schulze-Tanzil; Anita Schwegmann; Thierry Sengstag; Guojun Sheng; Hisashi Shimoji; Yishai Shimoni; Jay W Shin; Christophe Simon; Daisuke Sugiyama; Takaai Sugiyama; Masanori Suzuki; Naoko Suzuki; Rolf K Swoboda; Peter A C 't Hoen; Michihira Tagami; Naoko Takahashi; Jun Takai; Hiroshi Tanaka; Hideki Tatsukawa; Zuotian Tatum; Mark Thompson; Hiroo Toyodo; Tetsuro Toyoda; Elvind Valen; Marc van de Wetering; Linda M van den Berg; Roberto Verado; Dipti Vijayan; Ilya E Vorontsov; Wyeth W Wasserman; Shoko Watanabe; Christine A Wells; Louise N Winteringham; Ernst Wolvetang; Emily J Wood; Yoko Yamaguchi; Masayuki Yamamoto; Misako Yoneda; Yohei Yonekura; Shigehiro Yoshida; Susan E Zabierowski; Peter G Zhang; Xiaobei Zhao; Silvia Zucchelli; Kim M Summers; Harukazu Suzuki; Carsten O Daub; Jun Kawai; Peter Heutink; Winston Hide; Tom C Freeman; Boris Lenhard; Vladimir B Bajic; Martin S Taylor; Vsevolod J Makeev; Albin Sandelin; David A Hume; Piero Carninci; Yoshihide Hayashizaki

  Nature, 2014年03月27日, 査読有り

  
• An atlas of active enhancers across human cell types and tissues

  Robin Andersson; Claudia Gebhard; Irene Miguel-Escalada; Ilka Hoof; Jette Bornholdt; Mette Boyd; Yun Chen; Xiaobei Zhao; Christian Schmidl; Takahiro Suzuki; Evgenia Ntini; Erik Arner; Eivind Valen; Kang Li; Lucia Schwarzfischer; Dagmar Glatz; Johanna Raithel; Berit Lilje; Nicolas Rapin; Frederik Otzen Bagger; Mette Jorgensen; Peter Refsing Andersen; Nicolas Bertin; Owen Rackham; A. Maxwell Burroughs; J. Kenneth Baillie; Yuri Ishizu; Yuri Shimizu; Erina Furuhata; Shiori Maeda; Yutaka Negishi; Christopher J. Mungall; Terrence F. Meehan; Timo Lassmann; Masayoshi Itoh; Hideya Kawaji; Naoto Kondo; Jun Kawai; Andreas Lennartsson; Carsten O. Daub; Peter Heutink; David A. Hume; Torben Heick Jensen; Harukazu Suzuki; Yoshihide Hayashizaki; Ferenc Mueller; Alistair R. R. Forrest; Piero Carninci; Michael Rehli; Albin Sandelin

  NATURE, 2014年03月, 査読有り

  
• RARGE II: An integrated phenotype database of arabidopsis mutant traits using a controlled vocabulary

  Kenji Akiyama; Atsushi Kurotani; Kei Iida; Takashi Kuromori; Kazuo Shinozaki; Tetsuya Sakurai

  Plant and Cell Physiology, 2014年01月, 査読有り

  
• Small open reading frames associated with morphogenesis are hidden in plant genomes

  K. Hanada; M. Higuchi-Takeuchi; M. Okamoto; T. Yoshizumi; M. Shimizu; K. Nakaminami; R. Nishi; C. Ohashi; K. Iida; M. Tanaka; Y. Horii; M. Kawashima; K. Matsui; T. Toyoda; K. Shinozaki; M. Seki; M. Matsui

  Proceedings of the National Academy of Sciences, 2013年02月05日, 査読有り

  
• Positional correlation analysis improves reconstruction of full-length transcripts and alternative isoforms from noisy array signals or short reads

  Shuji Kawaguchi; Kei Iida; Erimi Harada; Kousuke Hanada; Akihiro Matsui; Masanori Okamoto; Kazuo Shinozaki; Motoaki Seki; Tetsuro Toyoda

  Bioinformatics, 2012年04月, 査読有り

  
• ARTADE2DB: Improved statistical inferences for arabidopsis gene functions and structure predictions by dynamic structure-based dynamic expression (DSDE) analyses

  Kei Iida; Shuji Kawaguchi; Norio Kobayashi; Yuko Yoshida; Manabu Ishii; Erimi Harada; Kousuke Hanada; Akihiro Matsui; Masanori Okamoto; Junko Ishida; Maho Tanaka; Taeko Morosawa; Motoaki Seki; Tetsuro Toyoda

  Plant and Cell Physiology, 2011年02月, 査読有り

  
• RAS1, a quantitative trait locus for salt tolerance and ABA sensitivity in Arabidopsis

  Z. Ren; Z. Zheng; V. Chinnusamy; J. Zhu; X. Cui; K. Iida; J.-K. Zhu

  Proceedings of the National Academy of Sciences, 2010年03月23日, 査読有り

  
• Posmed-plus: An intelligent search engine that inferentially integrates cross-species information resources for molecular breeding of plants

  Yuko Makita; Norio Kobayashi; Yoshiki Mochizuki; Yuko Yoshida; Satomi Asano; Naohiko Heida; Mrinalini Deshpande; Rinki Bhatia; Akihiro Matsushima; Manabu Ishii; Shuji Kawaguchi; Kei Iida; Kosuke Hanada; Takashi Kuromori; Motoaki Seki; Kazuo Shinozaki; Tetsuro Toyoda

  Plant and Cell Physiology, 2009年07月, 査読有り

  
• Analysis of multiple occurrences of alternative splicing events in arabidopsis thaliana using novel sequenced full-length cDNAs

  Kei Iida; Kaoru Fukami-Kobayashi; Atsushi Toyoda; Yoshiyuki Sakaki; Masatomo Kobayashi; Motoaki Seki; Kazuo Shinozaki

  DNA Research, 2009年06月, 査読有り

  
• Bioinformatics analysis suggests base modifications of tRNAs and miRNAs in Arabidopsis thaliana

  Kei Iida; Hailing Jin; Jian-Kang Zhu

  BMC Genomics, 2009年04月09日, 査読有り

  
• ROS3 is an RNA-binding protein required for DNA demethylation in Arabidopsis

  ZHENG X. W.

  Nature, 2008年10月, 査読有り

  
• The Arabidopsis NFYA5 transcription factor is regulated transcription ally and posttranscriptionally to promote drought resistance

  LI W.X.

  Plant Cell, 2008年08月, 査読有り

  
• On the expansion of the pentatricopeptide repeat gene family in plants

  Nicholas O'Toole; Mitsuru Hattori; Charles Andres; Kei Iida; Claire Lurin; Christian Schmitz-Linneweber; Mamoru Sugita; Ian Small

  Molecular Biology and Evolution, 2008年06月, 査読有り

  
• Alternative splicing at NAGNAG acceptor sites shares common properties in land plants and mammals

  Kei Iida; Masafumi Shionyu; Yasuhiro Suso

  MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, 2008年04月, 査読有り

  
• Genomic Analysis of Stress Respnse

  Motoaki Seki; Junko Ishida; Maiko Nakajima; Akiko Enju; Kei Iida; Masakazu Satou; Miki Fujita; Yoshihiro Narusaka; Mari Narusaka; Tetsuya Sakurai; Kenji Akiyama; Youko Oono; Ayako Kamei; Taishi Umezawa; Saho Mizukado; Kyonoshin Maruyama; Kazuko Yamaguchi-Shinozaki; Kazuo Shinozaki

  Plant Abiotic Stress, 2007年11月12日, 査読有り

  
• Assessing the monophyly of chlorophyll-c containing plastids by multi-gene phylogenies under the unlinked model conditions

  Kei Iida; Kiyotaka Takishita; Kazuhiko Ohshima; Yuji Inagaki

  MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2007年10月, 査読有り

  
• Monitoring expression profiles of Arabidopsis genes during cold acclimation and deacclimation using DNA microarrays.

  Youko Oono; Motoaki Seki; Masakazu Satou; Kei Iida; Kenji Akiyama; Tetsuya Sakurai; Miki Fujita; Kazuko Yamaguchi-Shinozaki; Kazuo Shinozaki

  Functional & integrative genomics, 2006年07月, 査読有り

  
• Survey of conserved alternative splicing events of mRNAs encoding SR proteins in land plants

  K Iida; M Go

  MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, 2006年05月, 査読有り

  
• A flexible representation of omic knowledge for thorough analysis of microarray data

  Yoshikazu Hasegawa; Motoaki Seki; Yoshiki Mochizuki; Naohiko Heida; Katsura Hirosawa; Naoki Okamoto; Tetsuya Sakurai; Masakazu Satou; Kenji Akiyama; Kei Iida; Kisik Lee; Shigehiko Kanaya; Taku Demura; Kazuo Shinozaki; Akihiko Konagaya; Tetsuro Toyoda

  PLANT METHODS, 2006年, 査読有り

  
• RARTF: Database and tools for complete sets of Arabidopsis transcription factors

  Kei Iida; Motoaki Seki; Tetsuya Sakurai; Masakazu Satou; Kenji Akiyama; Tetsuro Toyoda; Akihiko Konagaya; Kazuo Shinozaki

  DNA RESEARCH, 2005年08月, 査読有り

  
• RARGE: a large-scale database of RIKEN Arabidopsis resources ranging from transcriptome to phenome

  T Sakurai; M Satou; K Akiyama; K Iida; M Seki; T Kuromori; T Ito; A Konagaya; T Toyoda; K Shinozaki

  NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2005年01月, 査読有り

  
• Full-length cDNAs for the discovery and annotation of genes in A. thaliana.

  Seki, M; Satou, M; Sakurai, T; Akiyama, K; Iida, K; Ishida, J; Nakajima, M; Enju, A; Narusaka, M; Fujita, M; Oono, Y; Yamaguchi-Shinozaki, K; Carninci, P; Kawai, J; Hayashizaki, Y; Shinozaki, K

  "Plant Functional Genomics (edited by Dario Leister)" Haworth's Food Products Press, Binghamton, New York., 2004年, 査読有り

  
• RIKEN Arabidopsis full-length (RAFL) cDNA and its applications for expression profiling under abiotic stress conditions

  M Seki; M Satou; T Sakurai; K Akiyama; K Iida; J Ishida; M Nakajima; A Enju; M Narusaka; M Fujita; Y Oono; A Kamei; K Yamaguchi-Shinozaki; K Shinozaki

  JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY, 2004年01月, 査読有り

  
• Genome-wide analysis of alternative pre-mRNA splicing in Arabidopsis thaliana based on full-length cDNA sequences

  K Iida; M Seki; T Sakurai; M Satou; K Akiyama; T Toyoda; A Konagaya; K Shinozaki

  NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2004年, 査読有り

  
• Het-PDB Navi.: A database for protein-small molecule interactions

  A Yamaguchi; K Iida; N Matsui; S Tomoda; K Yura; M Go

  JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 2004年01月, 査読有り

  
• [Arabidopsis functional genomics using full-length cDNAs].

  Seki M; Shinozaki K; Ishida J; Nakajima M; Enju A; Sakurai T; Satou M; Akiyama K; Iida K; Oono Y

  Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme, 2003年11月, 査読有り

  
• Empirical analysis of transcriptional activity in the Arabidopsis genome

  K Yamada; J Lim; JM Dale; HM Chen; P Shinn; CJ Palm; AM Southwick; HC Wu; C Kim; M Nguyen; P Pham; R Cheuk; G Karlin-Newmann; SX Liu; B Lam; H Sakano; T Wu; GX Yu; M Miranda; HL Quach; M Tripp; CH Chang; JM Lee; M Toriumi; MMH Chan; CC Tang; CS Onodera; JM Deng; K Akiyama; Y Ansari; T Arakawa; J Banh; F Banno; L Bowser; S Brooks; P Carninci; QM Chao; N Choy; A Enju; AD Goldsmith; M Gurjal; NF Hansen; Y Hayashizaki; C Johnson-Hopson; VW Hsuan; K Iida; M Karnes; S Khan; E Koesema; J Ishida; PX Jiang; T Jones; J Kawai; A Kamiya; C Meyers; M Nakajima; M Narusaka; M Seki; T Sakurai; M Satou; R Tamse; M Vaysberg; EK Wallender; C Wong; Y Yamamura; SL Yuan; K Shinozaki; RW Davis; A Theologis; Ecker, JR

  SCIENCE, 2003年10月, 査読有り

  
• Monitoring expression profiles of Arabidopsis gene expression during rehydration process after dehydration using ca 7000 full-length cDNA microarray.

  Youko Oono; Motoaki Seki; Tokihiko Nanjo; Mari Narusaka; Miki Fujita; Rie Satoh; Masakazu Satou; Tetsuya Sakurai; Junko Ishida; Kenji Akiyama; Kei Iida; Kyonoshin Maruyama; Shinobu Satoh; Kazuko Yamaguchi-Shinozaki; Kazuo Shinozaki

  The Plant journal : for cell and molecular biology, 2003年06月, 査読有り

  

MISC

• Author Correction: Therapeutic manipulation of IKBKAP mis-splicing with a small molecule to cure familial dysautonomia.

  Masahiko Ajiro; Tomonari Awaya; Young Jin Kim; Kei Iida; Masatsugu Denawa; Nobuo Tanaka; Ryo Kurosawa; Shingo Matsushima; Saiko Shibata; Tetsunori Sakamoto; Lorenz Studer; Adrian R Krainer; Masatoshi Hagiwara

  Nature communications, 2021年10月12日

  
• DNAメチル化亢進によるPITX1遺伝子発現抑制は食道扁平上皮癌の予後不良と関連する

  河村 由紀; 大坪 武史; 山田 和彦; 萩原 輝記; 大島 健志朗; 飯田 慶; 西方 公郎; 豊田 哲郎; 猪狩 亨; 野原 京子; 服部 正平; 土肥 多惠子

  生命科学系学会合同年次大会, 2017年12月

  
• Dicer切断反応産物の次世代シークエンス解析を利用した低分子化合物の標的RNA配列モチーフの網羅的探索

  村田亜沙子; 高島裕介; 飯田慶; 須貝亜矢子; 萩原正敏; 中谷和彦

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2020年

  
• 食道癌のメチロームおよびトランスクリプトーム統合解析により見出されたホメオボックス遺伝子の発現低下

  河村 由紀; 大坪 武史; 山田 和彦; 萩原 輝記; 大島 健志朗; 飯田 慶; 西方 公郎; 豊田 哲郎; 猪狩 亨; 山田 純; 野原 京子; 服部 正平; 土肥 多惠子

  日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集, 2015年12月

  
• Monitoring transcriptomic changes in soil-grown roots and shoots of Arabidopsis thaliana subjected to a progressive drought stress

  Khurram Bashir; Sultana Rasheed; Akihiro Matsui; Kei Iida; Maho Tanaka; Motoaki Seki

  Methods in Molecular Biology, 2018年, 査読有り

  
• がん細胞の代謝がもたらす組織微小環境を標的にしたがん治療

  豊本 雅靖; 井上 飛鳥; 飯田 慶; 出縄 政嗣; 喜井 勲; 林 佳子; 岸 貴之; 小野木 博; 吉田 優; 細谷 孝充; 青木 淳賢; 萩原 正敏

  生命科学系学会合同年次大会, 2017年12月

  
• 抗C型肝炎ウイルス能をもつ低分子化合物の同定

  奥野友紀子; NGUYEN Bao Ngoc; NGUYEN Bao Ngoc; 飯田慶; 出縄政嗣; 坂本直哉; 影近弘之; 萩原正敏

  日本ウイルス学会学術集会プログラム・抄録集, 2013年

  
• 筋ジストロフィーに対するトランスレーショナル・リサーチ I.エクソン・スキップ ジストロフィンpre-mRNAのスプライシングを変化させる低分子化合物の探索

  萩原正敏; 松尾雅文; 片岡直行; 飯田慶; 西田篤史

  筋ジストロフィーに対するトランスレーショナル・リサーチ 平成22-24年度 総括研究報告書, 2013年

  
• 筋ジストロフィーに対するトランスクリプトーム創薬の試み

  飯田慶; 飯田慶; 片岡直行; 西田篤史; 川口修治; 豊田哲郎; 古野正朗; 松尾雅文; 林崎良英; 萩原正敏

  日本RNA学会年会要旨集, 2013年

  
• シロイヌナズナ完全長cDNAエンサイクロペディアの作製と遺伝子の機能・発現解析への利用.

  関 原明; 佐藤将一; 石田順子; 櫻井哲也; 中嶋舞子; 秋山顕治; 槐 亜希子; 飯田 慶; 篠崎一雄

  ゲノミクス・プロテオミクスの新展開（今中忠行 監修）. 株式会社 エヌ・ティー・エス., 2004年

  
• シロイヌナズナ完全長cDNAエンサイクロペディアの作製と遺伝子の機能・発現解析への利用

  関 原明; 鳴坂 真理; 大野 陽子; 藤田 美紀; 水門 佐保; 楠城 時彦; 梅澤 泰史; 亀井 綾子; 藤 泰子; 篠崎 和子; Ecker Joseph R; 石田 順子; Davis Ronald W; Theologis Athanasios; Carninci Piero; 河合 純; 林崎 良英; 澤崎 達也; 金 鍾明; 長谷川 嘉則; 遠藤 弥重太; 横山 茂之; 佐藤 将一; 篠崎 一雄; 櫻井 哲也; 中嶋 舞子; 槐 亜希子; 神谷 麻子; 秋山 顕治; 飯田 慶

  日本植物生理学会年会およびシンポジウム 講演要旨集, 2003年

  
• シロイヌナズナ完全長cDNAを用いた植物ゲノムの機能・発現解析.

  関 原明; 佐藤将一; 石田順子; 櫻井哲也; 中嶋舞子; 秋山顕治; 槐 亜希子; 飯田 慶; 大野陽子; 篠崎一雄

  蛋白質 核酸 酵素, 2003年

  

受賞

• 2006年12月20日

  Short-term Fellow Award (Human Frontier Science Program)

メディア報道

• RNAスプライシング制御による新規がん免疫療法―ネオ抗原を産生増強する治療薬候補の同定―

  京都大学, 2022年12月, インターネットメディア

  
• RNA結合タンパク質の標的分子探索手法を開発 －複雑なRNA制御のメカニズム解明に期待－

  京都大学, 2020年07月, インターネットメディア

  
• 神経ネットワークの可塑性を支えるRNAの機能に即した化学修飾を明らかにしました

  京都大学, 2018年07月, インターネットメディア

  
• 1細胞RNA分画解読法の開発に成功

  理化学研究所, 2018年06月, インターネットメディア

  
• 神経巨大遺伝子の発現制御メカニズムの発見

  京都大学, 2018年05月, インターネットメディア

  
• 植物の新しい環境ストレス適応機構の発見

  京都大学, 2017年08月

  
• 次世代シーケンサーのデータ解析精度を向上させる新手法を開発

  理化学研究所, 2012年02月, インターネットメディア

  

外部資金：科学研究費補助金

• 鳥類内耳有毛細胞再生初期過程の解明：哺乳類における有毛細胞再生効率化への応用

  基盤研究(C)

  小区分56050:耳鼻咽喉科学関連

  京都大学

  中川 隆之

  自 2020年04月01日, 至 2023年03月31日, 交付

  感音難聴;有毛細胞;再生;分化転換;鳥類

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20K09708/
• スプライシング病克服を目指すRNA制御特化機械学習によるスプライシングコード解明

  基盤研究(C)

  小区分48040:医化学関連

  京都大学

  飯田 慶

  自 2020年04月01日, 至 2023年03月31日, 交付

  RNAスプライシング;遺伝性疾患;バイオインフォマティクス;機械学習;ケミカルバイオロジー

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20K07310/
• 神経幹細胞分化を司るニューロエピジェネティクスとその制御機構の解明

  基盤研究(C)

  小区分46010:神経科学一般関連

  京都大学

  武内 章英

  自 2019年04月01日, 至 2022年03月31日, 交付

  Sfpq;RNA結合タンパク質;クロマチン・リモデリングファクター;ヒストン修飾;DNA修飾;RNA修飾;超長鎖遺伝子発現制御;免疫沈降・質量分析;長鎖遺伝子発現制御;免疫沈降;質量分析;神経エピジェネティックス;クロマチン制御因子;超長鎖遺伝子

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19K06907/
• 局所mRNAメチル化修飾による神経細胞遺伝情報「地方分権型」制御メカニズムの解明

  基盤研究(B)

  京都大学

  王 丹

  自 2017年04月01日, 至 2020年03月31日, 完了

  N6-adenosine methvlation;機能分画;シナブトソーム;翻訳制御;精神疾患;発達障害;N6-adenosine methylation;シナプトソーム;地方分権型遺伝子制御;局所翻訳;成長円錐;微小管;epitranscriptomics;local translation;dynamics;epitranscriptome;N6-adenosine;RNA lcoalization;synaptic plasticity;mRNA;chemical modification;methylation;synapse;localization

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17H03546/
• 種間比較トランスクリプトーム解析に立脚したスプライシング操作薬の作用機序の解明

  若手研究(B)

  京都大学

  飯田 慶

  自 2015年04月01日, 至 2018年03月31日, 完了

  スプライシング;ケミカルバイオロジー;比較ゲノム;比較トランスクリプトーム;筋ジストロフィー;バイオインフォマティクス;個別化医療

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15K18459/
• CRISPRによるRNA病モデルｉＰＳ細胞・動物の構築と病態解明・治療薬創製

  基盤研究(S)

  京都大学

  萩原 正敏

  自 2015年05月29日, 至 2020年03月31日, 完了

  遺伝性疾患;スプライシング制御;ポストゲノム創薬;遺伝子性疾患;スプライシング介入ルール;RNA病;トランスクリプトーム解析;モデルトランスクリプトーム解析;RNA病モデル;トランスクリプトーム;kibans

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15H05721/
• トランスクリプトームの人為的操作による遺伝病の治療

  基盤研究(A)

  京都大学

  萩原 正敏

  自 2015年04月01日, 至 2016年03月31日, 中途終了

  創薬;CRISPR;iPS;スプライシング

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15H02505/
• 新型分割イントロンの切り出し因子同定に基づく真核生物ｍＲＮＡ成熟機構進化の解明

  基盤研究(A)

  筑波大学

  橋本 哲男

  自 2011年11月18日, 至 2015年03月31日, 完了

  イントロン;トランススプライシング;スプライセオソーム;Giardia;分子進化;スプライソソーム;機能進化

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23247038/

教育

担当科目

• 自 2014年04月, 至 2015年03月

  医学研究技術実習

  通年不定, 医学研究科
• 自 2015年04月, 至 2016年03月

  医学研究技術実習

  通年不定, 医学研究科
• 自 2016年04月, 至 2017年03月

  医学研究技術実習

  通年不定, 医学研究科
• 自 2017年04月, 至 2018年03月

  医学研究技術実習

  通年不定, 医学研究科
• 自 2018年04月, 至 2019年03月

  医学研究技術実習

  通年不定, 医学研究科
• 自 2019年04月, 至 2020年03月

  医学研究技術実習

  通年不定, 医学研究科
• 自 2020年04月, 至 2021年03月

  医学研究技術実習

  通年不定, 医学研究科
• 自 2021年04月, 至 2022年03月

  医学研究技術実習

  通年不定, 医学研究科