基本情報

学位

• 博士（医学）(京都大学)

ID,URL

• J-Global ID

  201401073715067930

researchmap URL

• https://researchmap.jp/7000009493

研究

研究テーマ・研究概要

• 研究テーマ

  HIV-1感染症/AIDSおよびリンパ系造血器腫瘍の発症機序と新規治療法の開発に関する研究

• 研究概要

  当研究室は1) HIV-1の潜伏感染のメカニズムとそれを標的とした治療法の開発、2) シトシン脱アミノ化酵素APOBEC3によるゲノム変異と癌発症のメカニズムの解析、3)リンパ系造血器腫瘍におけるヒストン脱アセチル化酵素、ヒストンアセチル化酵素の役割についての基礎研究と臨床応用に関する研究を行っています。

研究分野

• ライフサイエンス, 血液、腫瘍内科学

論文

• SARS-CoV-2 B.1.617 mutations L452 and E484Q are not synergistic for antibody evasion

  Isabella Ferreira; Steven Kemp; Rawlings Datir; Akatsuki Saito; Bo Meng; Partha Rakshit; Akifumi Takaori-Kondo; Yusuke Kosugi; Keiya Uriu; Izumi Kimura; Kotaro Shirakawa; Adam Abdullahi; Anurag Agarwal; Seiya Ozono; Kenzo Tokunaga; Kei Sato; Ravindra K Gupta

  The Journal of Infectious Diseases, 2021年07月14日

  
• FRET-Based Detection and Quantification of HIV-1 Virion Maturation.

  Anamaria D. Sarca; Luca Sardo; Hirofumi Fukuda; Hiroyuki Matsui; Kotaro Shirakawa; Kazuki Horikawa; Akifumi Takaori-Kondo; Taisuke Izumi

  Frontiers in Microbiology, 2021年05月, 査読有り

  
• CAGE-Seq Reveals that HIV-1 Latent Infection Does Not Trigger Unique Cellular Responses in a Jurkat T Cell Model

  Hiroyuki Matsui; Kotaro Shirakawa; Yoshinobu Konishi; Shigeki Hirabayashi; Anamaria Daniela Sarca; Hirofumi Fukuda; Ryosuke Nomura; Emani Stanford; Yoshihito Horisawa; Yasuhiro Kazuma; Tadahiko Matsumoto; Hiroyuki Yamazaki; Yasuhiro Murakawa; Emilie Battivelli; Eric Verdin; Yoshio Koyanagi; Akifumi Takaori-Kondo; Frank Kirchhoff

  Journal of Virology, 2021年03月25日, 査読有り

  
• APOBEC3B is preferentially expressed at the G2/M phase of cell cycle

  Shigeki Hirabayashi; Kotaro Shirakawa; Yoshihito Horisawa; Tadahiko Matsumoto; Hiroyuki Matsui; Hiroyuki Yamazaki; Anamaria Daniela Sarca; Yasuhiro Kazuma; Ryosuke Nomura; Yoshinobu Konishi; Suguru Takeuchi; Emani Stanford; Hideya Kawaji; Yasuhiro Murakawa; Akifumi Takaori-Kondo

  Biochemical and Biophysical Research Communications, 2021年03月, 査読有り

  
• Alternative splicing of APOBEC3D generates functional diversity and its role as a DNA mutator

  Hisashi Takei; Hirofumi Fukuda; Gilbert Pan; Hiroyuki Yamazaki; Tadahiko Matsumoto; Yasuhiro Kazuma; Masanori Fujii; Sohei Nakayama; Ikei S Kobayashi; Keisuke Shindo; Riu Yamashita; Kotaro Shirakawa; Akifumi Takaori-Kondo; Susumu S Kobayashi

  2020年09月, 査読有り

  
• Critical role of PP2A-B56 family protein degradation in HIV-1 Vif mediated G2 cell cycle arrest

  Kayoko Nagata; Keisuke Shindo; Yusuke Matsui; Kotaro Shirakawa; Akifumi Takaori-Kondo

  2020年06月, 査読有り

  
• APOBEC3B reporter myeloma cell lines identify DNA damage response pathways leading to APOBEC3B expression

  Hiroyuki Yamazaki; Kotaro Shirakawa; Tadahiko Matsumoto; Yasuhiro Kazuma; Hiroyuki Matsui; Yoshihito Horisawa; Emani Stanford; Anamaria Daniela Sarca; Ryutaro Shirakawa; Keisuke Shindo; Akifumi Takaori-Kondo

  PLOS ONE, 2020年01月08日, 査読有り

  
• Endogenous APOBEC3B Overexpression Constitutively Generates DNA Substitutions and Deletions in Myeloma Cells

  Hiroyuki Yamazaki; Kotaro Shirakawa; Tadahiko Matsumoto; Shigeki Hirabayashi; Yasuhiro Murakawa; Masayuki Kobayashi; Anamaria Daniela Sarca; Yasuhiro Kazuma; Hiroyuki Matsui; Wataru Maruyama; Hirofumi Fukuda; Ryutaro Shirakawa; Keisuke Shindo; Masaki Ri; Shinsuke Iida; Akifumi Takaori-Kondo

  Scientific Reports, 2019年12月, 査読有り

  
• ワルファリン服用患者におけるダルナビル/リトナビルからラルテグラビルに変更した際のワルファリン投与量とPT(INR)の推移

  尾崎 淳子; 松村 勝之; 櫻井 香織; 米澤 淳; 白川 康太郎; 高折 晃史; 松原 和夫

  日本エイズ学会誌, 2019年11月

  
• ワルファリン服用患者におけるダルナビル/リトナビルからラルテグラビルに変更した際のワルファリン投与量とPT(INR)の推移

  尾崎 淳子; 松村 勝之; 櫻井 香織; 米澤 淳; 白川 康太郎; 高折 晃史; 松原 和夫

  日本エイズ学会誌, 2019年11月

  
• NET-CAGE characterizes the dynamics and topology of human transcribed cis-regulatory elements

  Shigeki Hirabayashi; Shruti Bhagat; Yu Matsuki; Yujiro Takegami; Takuya Uehata; Ai Kanemaru; Masayoshi Itoh; Kotaro Shirakawa; Akifumi Takaori-Kondo; Osamu Takeuchi; Piero Carninci; Shintaro Katayama; Yoshihide Hayashizaki; Juha Kere; Hideya Kawaji; Yasuhiro Murakawa

  Nature genetics, 2019年09月, 査読有り

  
• Protein kinase A inhibits tumor mutator APOBEC3B through phosphorylation.

  Matsumoto T; Shirakawa K; Yokoyama M; Fukuda H; Sarca AD; Koyabu S; Yamazaki H; Kazuma Y; Matsui H; Maruyama W; Nagata K; Tanabe F; Kobayashi M; Shindo K; Morishita R; Sato H; Takaori-Kondo A

  Sci Rep., 2019年06月, 査読有り

  
• A screening for DNA damage response molecules that affect HIV-1 infection

  Noriyoshi Yoshinaga; Keisuke Shindo; Yusuke Matsui; Yoko Takiuchi; Hirofumi Fukuda; Kayoko Nagata; Kotaro Shirakawa; Masayuki Kobayashi; Shunichi Takeda; Akifumi Takaori-Kondo

  Biochemical and Biophysical Research Communications, 2019年05月, 査読有り

  
• Structural Determinants of the APOBEC3G N-Terminal Domain for HIV-1 RNA Association.

  Hirofumi Fukuda; Songling Li; Luca Sardo; Jessica L Smith; Kazuo Yamashita; Anamaria D Sarca; Kotaro Shirakawa; Daron M Standley; Akifumi Takaori-Kondo; Taisuke Izumi

  Frontiers in cellular and infection microbiology, 2019年, 査読有り

  
• 選択的HDAC3阻害による蛋白アセチル化を介したアポトーシス誘導機構の検討(Selective HDAC3 inhibition induces apoptosis in B cell lymphoma through protein acetylation)

  松井 宏行; 白川 康太郎; Chang Hsin-Yi; Daniela Sarca. A.; 数馬 安浩; 福田 寛文; 山崎 寛章; 松本 忠彦; 石濱 泰; 高折 晃史

  臨床血液, 2018年09月, 査読有り

  
• Choledochoduodenal Fistula during Chemotherapy with Brentuximab Vedotin for Methotrexate-associated Lymphoproliferative Disorder.

  Eso Y; Uza N; Shirakawa K; Sawada K; Katsuragi K; Matsuura M; Seno H

  Intern Med., 2018年05月, 査読有り

  
• Dual inhibition of the mTORC1 and mTORC2 signaling pathways is a promising therapeutic target for adult T-cell leukemia

  Takahito Kawata; Kohei Tada; Masayuki Kobayashi; Takashi Sakamoto; Yoko Takiuchi; Fumie Iwai; Maki Sakurada; Masakatsu Hishizawa; Kotaro Shirakawa; Keisuke Shindo; Hironori Sato; Akifumi Takaori-Kondo

  Cancer Science, 2018年01月01日, 査読有り

  
• HTLV-1 bZIP factor suppresses TDP1 expression through inhibition of NRF-1 in adult T-cell leukemia

  Yoko Takiuchi; Masayuki Kobayashi; Kohei Tada; Fumie Iwai; Maki Sakurada; Shigeki Hirabayashi; Kayoko Nagata; Kotaro Shirakawa; Keisuke Shindo; Jun-ichirou Yasunaga; Yasuhiro Murakawa; Vinodh Rajapakse; Yves Pommier; Masao Matsuoka; Akifumi Takaori-Kondo

  SCIENTIFIC REPORTS, 2017年10月, 査読有り

  
• Expression of Tim-1 in primary CNS lymphoma

  Wataru Kishimoto; Momoko Nishikori; Hiroshi Arima; Hiroaki Miyoshi; Yuya Sasaki; Toshio Kitawaki; Kotaro Shirakawa; Takeharu Kato; Yoshitaka Imaizumi; Takayuki Ishikawa; Hitoshi Ohno; Hironori Haga; Koichi Ohshima; Akifumi Takaori-Kondo

  CANCER MEDICINE, 2016年11月, 査読有り

  
• Core Binding Factor β Protects HIV, Type 1 Accessory Protein Viral Infectivity Factor from MDM2-mediated Degradation.

  Matsui Y; Shindo K; Nagata K; Yoshinaga N; Shirakawa K; Kobayashi M; Takaori-Kondo A

  The Journal of biological chemistry, 2016年11月, 査読有り

  
• Classical NF-κB pathway is responsible for APOBEC3B expression in cancer cells.

  Maruyama W; Shirakawa K; Matsui H; Matsumoto T; Yamazaki H; Sarca AD; Kazuma Y; Kobayashi M; Shindo K; Takaori-Kondo A

  Biochemical and biophysical research communications, 2016年09月, 査読有り

  
• Salicylate, diflunisal and their metabolites inhibit CBP/p300 and exhibit anticancer activity

  Kotaro Shirakawa; Lan Wang; Na Man; Jasna Maksimoska; Alexander W. Sorum; Hyung W. Lim; Intelly S. Lee; Tadahiro Shimazu; John C. Newman; Sebastian Schroder; Melanie Ott; Ronen Marmorstein; Jordan Meier; Stephen Nimer; Eric Verdin

  ELIFE, 2016年05月, 査読有り

  
• Mitochondrial Dysfunction Induces Senescence with a Distinct Secretory Phenotype

  Christopher D. Wiley; Michael C. Velarde; Pacome Lecot; Su Liu; Ethan A. Sarnoski; Adam Freund; Kotaro Shirakawa; Hyung W. Lim; Sonnet S. Davis; Arvind Ramanathan; Akos A. Gerencser; Eric Verdin; Judith Campisi

  CELL METABOLISM, 2016年02月, 査読有り

  
• Critical role of acetylation in tau-mediated neurodegeneration and cognitive deficits

  Sang-Won Min; Xu Chen; Tara E. Tracy; Yaqiao Li; Yungui Zhou; Chao Wang; Kotaro Shirakawa; S. Sakura Minami; Erwin Defensor; Sue Ann Mok; Peter Dongmin Sohn; Birgit Schilling; Xin Cong; Lisa Ellerby; Bradford W. Gibson; Jeffrey Johnson; Nevan Krogan; Mehrdad Shamloo; Jason Gestwicki; Eliezer Masliah; Eric Verdin; Li Gan

  NATURE MEDICINE, 2015年10月, 査読有り

  
• SIRT1 deacetylates RORγt and enhances Th17 cell generation.

  Lim HW; Kang SG; Ryu JK; Schilling B; Fei M; Lee IS; Kehasse A; Shirakawa K; Yokoyama M; Schnölzer M; Kasler HG; Kwon HS; Gibson BW; Sato H; Akassoglou K; Xiao C; Littman DR; Ott M; Verdin E

  The Journal of experimental medicine, 2015年05月, 査読有り

  
• Abacavir, an anti-HIV-1 drug, targets TDP1-deficient adult T cell leukemia.

  Tada K; Kobayashi M; Takiuchi Y; Iwai F; Sakamoto T; Nagata K; Shinohara M; Io K; Shirakawa K; Hishizawa M; Shindo K; Kadowaki N; Hirota K; Yamamoto J; Iwai S; Sasanuma H; Takeda S; Takaori-Kondo A

  Science advances, 2015年04月, 査読有り

  
• Abacavir, an anti-HIV-1 drug, targets TDP1-deficient adult T cell leukemia.

  Tada K; Kobayashi M; Takiuchi Y; Iwai F; Sakamoto T; Nagata K; Shinohara M; Io K; Shirakawa K; Hishizawa M; Shindo K; Kadowaki N; Hirota K; Yamamoto J; Iwai S; Sasanuma H; Takeda S; Takaori-Kondo A

  Sci Adv., 2015年04月, 査読有り

  
• Successful treatment with recombinant thrombomodulin for disseminated intravascular coagulation complicated with hemophagocytic syndrome.

  Yamazaki H; Kondo T; Tatsumi G; Kotani S; Arai Y; Shirakawa K; Kitano T; Hishizawa M; Kadowaki N; Takaori-Kondo A

  [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology, 2015年, 査読有り

  
• Reactivation of latent HIV by histone deacetylase inhibitors

  Kotaro Shirakawa; Leonard Chavez; Shweta Hakre; Vincenzo Calvanese; Eric Verdin

  TRENDS IN MICROBIOLOGY, 2013年06月, 査読有り

  
• Suppression of oxidative stress by β-hydroxybutyrate, an endogenous histone deacetylase inhibitor.

  Shimazu T; Hirschey MD; Newman J; He W; Shirakawa K; Le Moan N; Grueter CA; Lim H; Saunders LR; Stevens RD; Newgard CB; Farese RV Jr; de Cabo R; Ulrich S; Akassoglou K; Verdin E

  Science (New York, N.Y.), 2013年01月, 査読有り

  
• An in-depth comparison of latent HIV-1 reactivation in multiple cell model systems and resting CD4+ T cells from aviremic patients.

  Spina CA; Anderson J; Archin NM; Bosque A; Chan J; Famiglietti M; Greene WC; Kashuba A; Lewin SR; Margolis DM; Mau M; Ruelas D; Saleh S; Shirakawa K; Siliciano RF; Singhania A; Soto PC; Terry VH; Verdin E; Woelk C; Wooden S; Xing S; Planelles V

  PLoS pathogens, 2013年, 査読有り

  
• HIV latency: experimental systems and molecular models

  Shweta Hakre; Leonard Chavez; Kotaro Shirakawa; Eric Verdin

  FEMS MICROBIOLOGY REVIEWS, 2012年05月, 査読有り

  
• Epigenetic regulation of HIV latency

  Shweta Hakre; Leonard Chavez; Kotaro Shirakawa; Eric Verdin

  CURRENT OPINION IN HIV AND AIDS, 2011年01月, 査読有り

  
• HIV-1 viral infectivity factor interacts with TP53 to induce G2 cell cycle arrest and positively regulate viral replication

  Taisuke Izumi; Katsuhiro Io; Masashi Matsui; Kotaro Shirakawa; Masanobu Shinohara; Yuya Nagai; Masahiro Kawahara; Masayuki Kobayashi; Hiroshi Kondoh; Naoko Misawa; Yoshio Koyanagi; Takashi Uchiyama; Akifumi Takaori-Kondo

  PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2010年11月, 査読有り

  
• MDM2 is a novel E3 ligase for HIV-1 Vif

  Taisuke Izumi; Akifumi Takaori-Kondo; Kotaro Shirakawa; Hiroaki Higashitsuji; Katsuhiko Itoh; Katsuhiro Io; Masashi Matsui; Kazuhiro Iwai; Hiroshi Kondoh; Toshihiro Sato; Mitsunori Tomonaga; Satoru Ikeda; Hirofumi Akari; Yoshio Koyanagi; Jun Fujita; Takashi Uchiyama

  RETROVIROLOGY, 2009年01月, 査読有り

  
• Phosphorylation of APOBEC3G by protein kinase A regulates its interaction with HIV-1 Vif

  Kotaro Shirakawa; Akifumi Takaori-Kondo; Masaru Yokoyama; Taisuke Izumi; Masashi Matsui; Katsuhiro Io; Toshihiro Sato; Hironori Sato; Takashi Uchiyama

  NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY, 2008年11月, 査読有り

  
• Cytidine deaminases as a weapon against retroviruses and a new target for antiviral therapy

  Taisuke Izumi; Kotaro Shirakawa; Akifumi Takaori-Kondo

  MINI-REVIEWS IN MEDICINAL CHEMISTRY, 2008年03月, 査読有り

  
• Dual effect of APOBEC3G on Hepatitis B virus

  Chiemi Noguchi; Nobuhiko Hiraga; Nami Mori; Masataka Tsuge; Michio Imamura; Shoichi Takahashi; Yoshifumi Fujimoto; Hidenori Ochi; Hiromi Abe; Toshiro Maekawa; Hiromi Yatsuji; Kotaro Shirakawa; Akifumi Takaori-Kondo; Kazuaki Chayama

  JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY, 2007年02月, 査読有り

  
• Murine retrovirus escapes from murine APOBEC3 via two distinct novel mechanisms

  Aierken Abudu; Akifumi Takaori-Kondo; Taisuke Izumi; Kotaro Shirakawa; Masayuki Kobayashi; Amane Sasada; Keiko Fukunaga; Takashi Uchiyama

  CURRENT BIOLOGY, 2006年08月, 査読有り

  
• Ubiquitination of APOBEC3 proteins by the Vif-Cullin5-ElonginB-ElonginC complex

  K Shirakawa; A Takaori-Kondo; M Kobayashi; M Tomonaga; T Izumi; K Fukunaga; A Sasada; A Abudu; Y Miyauchi; H Akari; K Iwai; T Uchiyama

  VIROLOGY, 2006年01月, 査読有り

  
• APOBEC3G targets human T-cell leukemia virus type 1

  A Sasada; A Takaori-Kondo; K Shirakawa; M Kobayashi; A Abudu; M Hishizawa; K Imada; Y Tanaka; T Uchiyama

  RETROVIROLOGY, 2005年05月, 査読有り

  
• [Analyses of the allogeneic stem cell transplantation outcome based on the new risk classification].

  Wake A; Shirakawa K; Kamio M; Yamasaki Y; Sawada H; Izumi Y

  Rinsho Ketsueki., 2004年01月, 査読有り

  
• ILF2 enhances the DNA cytosine deaminase activity of tumor mutator APOBEC3B in multiple myeloma cells

  Yasuhiro Kazuma; Kotaro Shirakawa; Yusuke Tashiro; Hiroyuki Yamazaki; Ryosuke Nomura; Yoshihito Horisawa; Suguru Takeuchi; Emani Stanford; Yoshinobu Konishi; Hiroyuki Matsui; Tadahiko Matsumoto; Fumiko Tanabe; Ryo Morishita; Shinji Ito; Akifumi Takaori-Kondo

  Scientific Reports, 2022年12月, 査読有り

  
• Characterization of the immune resistance of SARS-CoV-2 Mu variant and the robust immunity induced by Mu infection

  Keiya Uriu; Paúl Cárdenas; Erika Muñoz; Veronica Barragan; Yusuke Kosugi; Kotaro Shirakawa; Akifumi Takaori-Kondo; Kei Sato

  The Journal of Infectious Diseases, 2022年02月18日, 査読有り

  
• Enhanced fusogenicity and pathogenicity of SARS-CoV-2 Delta P681R mutation

  Akatsuki Saito; Takashi Irie; Rigel Suzuki; Tadashi Maemura; Hesham Nasser; Keiya Uriu; Yusuke Kosugi; Kotaro Shirakawa; Kenji Sadamasu; Izumi Kimura; Jumpei Ito; Jiaqi Wu; Kiyoko Iwatsuki-Horimoto; Mutsumi Ito; Seiya Yamayoshi; Samantha Loeber; Masumi Tsuda; Lei Wang; Seiya Ozono; Erika P. Butlertanaka; Yuri L. Tanaka; Ryo Shimizu; Kenta Shimizu; Kumiko Yoshimatsu; Ryoko Kawabata; Takemasa Sakaguchi; Kenzo Tokunaga; Isao Yoshida; Hiroyuki Asakura; Mami Nagashima; Yasuhiro Kazuma; Ryosuke Nomura; Yoshihito Horisawa; Kazuhisa Yoshimura; Akifumi Takaori-Kondo; Masaki Imai; Mika Chiba; Hirotake Furihata; Haruyo Hasebe; Kazuko Kitazato; Haruko Kubo; Naoko Misawa; Nanami Morizako; Kohei Noda; Akiko Oide; Mai Suganami; Miyoko Takahashi; Kana Tsushima; Miyabishara Yokoyama; Yue Yuan; Shinya Tanaka; So Nakagawa; Terumasa Ikeda; Takasuke Fukuhara; Yoshihiro Kawaoka; Kei Sato

  Nature, 2022年02月10日, 査読有り

  
• Altered TMPRSS2 usage by SARS-CoV-2 Omicron impacts tropism and fusogenicity

  Bo Meng; Adam Abdullahi; Isabella A. T. M. Ferreira; Niluka Goonawardane; Akatsuki Saito; Izumi Kimura; Daichi Yamasoba; Pehuén Pereyra Gerber; Saman Fatihi; Surabhi Rathore; Samantha K. Zepeda; Guido Papa; Steven A. Kemp; Terumasa Ikeda; Mako Toyoda; Toong Seng Tan; Jin Kuramochi; Shigeki Mitsunaga; Takamasa Ueno; Kotaro Shirakawa; Akifumi Takaori-Kondo; Teresa Brevini; Donna L. Mallery; Oscar J. Charles; Stephen Baker; Gordon Dougan; Christoph Hess; Nathalie Kingston; Paul J. Lehner; Paul A. Lyons; Nicholas J. Matheson; Willem H. Owehand; Caroline Saunders; Charlotte Summers; James E. D. Thaventhiran; Mark Toshner; Michael P. Weekes; Patrick Maxwell; Ashley Shaw; Ashlea Bucke; Jo Calder; Laura Canna; Jason Domingo; Anne Elmer; Stewart Fuller; Julie Harris; Sarah Hewitt; Jane Kennet; Sherly Jose; Jenny Kourampa; Anne Meadows; Criona O’Brien; Jane Price; Cherry Publico; Rebecca Rastall; Carla Ribeiro; Jane Rowlands; Valentina Ruffolo; Hugo Tordesillas; Ben Bullman; Benjamin J. Dunmore; Stuart Fawke; Stefan Gräf; Josh Hodgson; Christopher Huang; Kelvin Hunter; Emma Jones; Ekaterina Legchenko; Cecilia Matara; Jennifer Martin; Federica Mescia; Ciara O’Donnell; Linda Pointon; Joy Shih; Rachel Sutcliffe; Tobias Tilly; Carmen Treacy; Zhen Tong; Jennifer Wood; Marta Wylot; Ariana Betancourt; Georgie Bower; Chiara Cossetti; Aloka De Sa; Madeline Epping; Stuart Fawke; Nick Gleadall; Richard Grenfell; Andrew Hinch; Sarah Jackson; Isobel Jarvis; Ben Krishna; Francesca Nice; Ommar Omarjee; Marianne Perera; Martin Potts; Nathan Richoz; Veronika Romashova; Luca Stefanucci; Mateusz Strezlecki; Lori Turner; Eckart M. D. D. De Bie; Katherine Bunclark; Masa Josipovic; Michael Mackay; John Allison; Helen Butcher; Daniela Caputo; Debbie Clapham-Riley; Eleanor Dewhurst; Anita Furlong; Barbara Graves; Jennifer Gray; Tasmin Ivers; Emma Le Gresley; Rachel Linger; Sarah Meloy; Francesca Muldoon; Nigel Ovington; Sofia Papadia; Isabel Phelan; Hannah Stark; Kathleen E. Stirrups; Paul Townsend; Neil Walker; Jennifer Webster; Ingrid Scholtes; Sabine Hein; Rebecca King; Erika P. Butlertanaka; Yuri L. Tanaka; Terumasa Ikeda; Jumpei Ito; Keiya Uriu; Yusuke Kosugi; Mai Suganami; Akiko Oide; Miyabishara Yokoyama; Mika Chiba; Chihiro Motozono; Hesham Nasser; Ryo Shimizu; Yue Yuan; Kazuko Kitazato; Haruyo Hasebe; So Nakagawa; Jiaqi Wu; Miyoko Takahashi; Takasuke Fukuhara; Kenta Shimizu; Kana Tsushima; Haruko Kubo; Yasuhiro Kazuma; Ryosuke Nomura; Yoshihito Horisawa; Kayoko Nagata; Yugo Kawai; Yohei Yanagida; Yusuke Tashiro; Kenzo Tokunaga; Seiya Ozono; Ryoko Kawabata; Nanami Morizako; Kenji Sadamasu; Hiroyuki Asakura; Mami Nagashima; Kazuhisa Yoshimura; Paúl Cárdenas; Erika Muñoz; Veronica Barragan; Sully Márquez; Belén Prado-Vivar; Mónica Becerra-Wong; Mateo Caravajal; Gabriel Trueba; Patricio Rojas-Silva; Michelle Grunauer; Bernardo Gutierrez; Juan José Guadalupe; Juan Carlos Fernández-Cadena; Derly Andrade-Molina; Manuel Baldeon; Andrea Pinos; John E. Bowen; Anshu Joshi; Alexandra C. Walls; Laurelle Jackson; Darren Martin; Kenneth G. C. Smith; John Bradley; John A. G. Briggs; Jinwook Choi; Elo Madissoon; Kerstin Meyer; Petra Mlcochova; Lourdes Ceron-Gutierrez; Rainer Doffinger; Sarah A. Teichmann; Andrew J. Fisher; Matteo S. Pizzuto; Anna de Marco; Davide Corti; Myra Hosmillo; Joo Hyeon Lee; Leo C. James; Lipi Thukral; David Veesler; Alex Sigal; Fotios Sampaziotis; Ian G. Goodfellow; Nicholas J. Matheson; Kei Sato; Ravindra K. Gupta

  Nature, 2022年02月01日, 査読有り

  
• Attenuated fusogenicity and pathogenicity of SARS-CoV-2 Omicron variant

  Rigel Suzuki; Daichi Yamasoba; Izumi Kimura; Lei Wang; Mai Kishimoto; Jumpei Ito; Yuhei Morioka; Naganori Nao; Hesham Nasser; Keiya Uriu; Yusuke Kosugi; Masumi Tsuda; Yasuko Orba; Michihito Sasaki; Ryo Shimizu; Ryoko Kawabata; Kumiko Yoshimatsu; Hiroyuki Asakura; Mami Nagashima; Kenji Sadamasu; Kazuhisa Yoshimura; Mai Suganami; Akiko Oide; Mika Chiba; Hayato Ito; Tomokazu Tamura; Kana Tsushima; Haruko Kubo; Zannatul Ferdous; Hiromi Mouri; Miki Iida; Keiko Kasahara; Koshiro Tabata; Mariko Ishizuka; Asako Shigeno; Kenzo Tokunaga; Seiya Ozono; Isao Yoshida; So Nakagawa; Jiaqi Wu; Miyoko Takahashi; Atsushi Kaneda; Motoaki Seki; Ryoji Fujiki; Bahityar Rahmutulla Nawai; Yutaka Suzuki; Yukie Kashima; Kazumi Abe; Kiyomi Imamura; Kotaro Shirakawa; Akifumi Takaori-Kondo; Yasuhiro Kazuma; Ryosuke Nomura; Yoshihito Horisawa; Kayoko Nagata; Yugo Kawai; Yohei Yanagida; Yusuke Tashiro; Otowa Takahashi; Kazuko Kitazato; Haruyo Hasebe; Chihiro Motozono; Mako Toyoda; Toong Seng Tan; Isaac Ngare; Takamasa Ueno; Akatsuki Saito; Erika P. Butlertanaka; Yuri L. Tanaka; Nanami Morizako; Hirofumi Sawa; Terumasa Ikeda; Takashi Irie; Keita Matsuno; Shinya Tanaka; Takasuke Fukuhara; Kei Sato

  Nature, 2022年02月01日, 査読有り

  
• The SARS-CoV-2 Lambda variant exhibits enhanced infectivity and immune resistance

  Izumi Kimura; Yusuke Kosugi; Jiaqi Wu; Jiri Zahradnik; Daichi Yamasoba; Erika P. Butlertanaka; Yuri L. Tanaka; Keiya Uriu; Yafei Liu; Nanami Morizako; Kotaro Shirakawa; Yasuhiro Kazuma; Ryosuke Nomura; Yoshihito Horisawa; Kenzo Tokunaga; Takamasa Ueno; Akifumi Takaori-Kondo; Gideon Schreiber; Hisashi Arase; Chihiro Motozono; Akatsuki Saito; So Nakagawa; Kei Sato

  Cell Reports, 2022年01月, 査読有り

  
• Neutralization of the SARS-CoV-2 Mu Variant by Convalescent and Vaccine Serum

  Keiya Uriu; Izumi Kimura; Kotaro Shirakawa; Akifumi Takaori-Kondo; Taka-aki Nakada; Atsushi Kaneda; So Nakagawa; Kei Sato

  New England Journal of Medicine, 2021年12月16日, 査読有り

  
• SARS-CoV-2 B.1.617.2 Delta variant replication and immune evasion

  Petra Mlcochova; Steven A. Kemp; Mahesh Shanker Dhar; Guido Papa; Bo Meng; Isabella A. T. M. Ferreira; Rawlings Datir; Dami A. Collier; Anna Albecka; Sujeet Singh; Rajesh Pandey; Jonathan Brown; Jie Zhou; Niluka Goonawardane; Swapnil Mishra; Charles Whittaker; Thomas Mellan; Robin Marwal; Meena Datta; Shantanu Sengupta; Kalaiarasan Ponnusamy; Venkatraman Srinivasan Radhakrishnan; Adam Abdullahi; Oscar Charles; Partha Chattopadhyay; Priti Devi; Daniela Caputo; Tom Peacock; Chand Wattal; Neeraj Goel; Ambrish Satwik; Raju Vaishya; Meenakshi Agarwal; Himanshu Chauhan; Tanzin Dikid; Hema Gogia; Hemlata Lall; Kaptan Verma; Mahesh Shanker Dhar; Manoj K. Singh; Namita Soni; Namonarayan Meena; Preeti Madan; Priyanka Singh; Ramesh Sharma; Rajeev Sharma; Sandhya Kabra; Sattender Kumar; Swati Kumari; Uma Sharma; Urmila Chaudhary; Sridhar Sivasubbu; Vinod Scaria; J. K. Oberoi; Reena Raveendran; S. Datta; Saumitra Das; Arindam Maitra; Sreedhar Chinnaswamy; Nidhan Kumar Biswas; Ajay Parida; Sunil K. Raghav; Punit Prasad; Apurva Sarin; Satyajit Mayor; Uma Ramakrishnan; Dasaradhi Palakodeti; Aswin Sai Narain Seshasayee; K. Thangaraj; Murali Dharan Bashyam; Ashwin Dalal; Manoj Bhat; Yogesh Shouche; Ajay Pillai; Priya Abraham; Varsha Atul Potdar; Sarah S. Cherian; Anita Sudhir Desai; Chitra Pattabiraman; M. V. Manjunatha; Reeta S. Mani; Gautam Arunachal Udupi; Vinay Nandicoori; Karthik Bharadwaj Tallapaka; Divya Tej Sowpati; Ryoko Kawabata; Nanami Morizako; Kenji Sadamasu; Hiroyuki Asakura; Mami Nagashima; Kazuhisa Yoshimura; Jumpei Ito; Izumi Kimura; Keiya Uriu; Yusuke Kosugi; Mai Suganami; Akiko Oide; Miyabishara Yokoyama; Mika Chiba; Akatsuki Saito; Erika P. Butlertanaka; Yuri L. Tanaka; Terumasa Ikeda; Chihiro Motozono; Hesham Nasser; Ryo Shimizu; Yue Yuan; Kazuko Kitazato; Haruyo Hasebe; So Nakagawa; Jiaqi Wu; Miyoko Takahashi; Takasuke Fukuhara; Kenta Shimizu; Kana Tsushima; Haruko Kubo; Kotaro Shirakawa; Yasuhiro Kazuma; Ryosuke Nomura; Yoshihito Horisawa; Akifumi Takaori-Kondo; Kenzo Tokunaga; Seiya Ozono; Stephen Baker; Gordon Dougan; Christoph Hess; Nathalie Kingston; Paul J. Lehner; Paul A. Lyons; Nicholas J. Matheson; Willem H. Owehand; Caroline Saunders; Charlotte Summers; James E. D. Thaventhiran; Mark Toshner; Michael P. Weekes; Patrick Maxwell; Ashley Shaw; Ashlea Bucke; Jo Calder; Laura Canna; Jason Domingo; Anne Elmer; Stewart Fuller; Julie Harris; Sarah Hewitt; Jane Kennet; Sherly Jose; Jenny Kourampa; Anne Meadows; Criona O’Brien; Jane Price; Cherry Publico; Rebecca Rastall; Carla Ribeiro; Jane Rowlands; Valentina Ruffolo; Hugo Tordesillas; Ben Bullman; Benjamin J. Dunmore; Stuart Fawke; Stefan Gräf; Josh Hodgson; Christopher Huang; Kelvin Hunter; Emma Jones; Ekaterina Legchenko; Cecilia Matara; Jennifer Martin; Federica Mescia; Ciara O’Donnell; Linda Pointon; Nicole Pond; Joy Shih; Rachel Sutcliffe; Tobias Tilly; Carmen Treacy; Zhen Tong; Jennifer Wood; Marta Wylot; Laura Bergamaschi; Ariana Betancourt; Georgie Bower; Chiara Cossetti; Aloka De Sa; Madeline Epping; Stuart Fawke; Nick Gleadall; Richard Grenfell; Andrew Hinch; Oisin Huhn; Sarah Jackson; Isobel Jarvis; Ben Krishna; Daniel Lewis; Joe Marsden; Francesca Nice; Georgina Okecha; Ommar Omarjee; Marianne Perera; Martin Potts; Nathan Richoz; Veronika Romashova; Natalia Savinykh Yarkoni; Rahul Sharma; Luca Stefanucci; Jonathan Stephens; Mateusz Strezlecki; Lori Turner; Eckart M. D. D. De Bie; Katherine Bunclark; Masa Josipovic; Michael Mackay; Sabrina Rossi; Mayurun Selvan; Sarah Spencer; Cissy Yong; John Allison; Helen Butcher; Daniela Caputo; Debbie Clapham-Riley; Eleanor Dewhurst; Anita Furlong; Barbara Graves; Jennifer Gray; Tasmin Ivers; Mary Kasanicki; Emma Le Gresley; Rachel Linger; Sarah Meloy; Francesca Muldoon; Nigel Ovington; Sofia Papadia; Isabel Phelan; Hannah Stark; Kathleen E. Stirrups; Paul Townsend; Neil Walker; Jennifer Webster; Ingrid Scholtes; Sabine Hein; Rebecca King; Antranik Mavousian; Joo Hyeon Lee; Jessica Bassi; Chiara Silacci-Fegni; Christian Saliba; Dora Pinto; Takashi Irie; Isao Yoshida; William L. Hamilton; Kei Sato; Samir Bhatt; Seth Flaxman; Leo C. James; Davide Corti; Luca Piccoli; Wendy S. Barclay; Partha Rakshit; Anurag Agrawal; Ravindra K. Gupta

  Nature, 2021年11月04日, 査読有り

  

MISC

• Selective HDAC3 Inhibition Induces Apoptosis in B Cell Lymphoma through Protein Acetylation

  Hiroyuki Matsui; Kotaro Shirakawa; Hsin-Yi Chang; Anamaria Daniela Sarca; Yasuhiro Kazuma; Hirofumi Fukuda; Hiroyuki Yamazaki; Tadahiko Matsumoto; Yasushi Ishihama; Akifumi Takaori-Kondo

  BLOOD, 2018年11月

  
• PKA-Mediated Phosphorylation of APOBEC3B Suppresses Its DNA Mutagenic Potential in Myeloma Cells

  Tadahiko Matsumoto; Kotaro Shirakawa; Hiroyuki Matsui; Hiroyuki Yamazaki; Yasuhiro Kazuma; Anamaria Daniela Sarca; Hirofumi Fukuda; Wataru Maruyama; Akifumi Takaori-Kondo

  BLOOD, 2016年12月

  
• Alternative Splicing of APOBEC3D Generates Functional Diversity and Its Role As a DNA Mutator

  Hisashi Takei; Masanori Fujii; Sohei Nakayama; Ikei Kobayashi; Keisuke Shindo; Kotaro Shirakawa; Akifumi Takaori-Kondo; Susumu Kobayashi

  BLOOD, 2016年12月

  
• Aberrantly Expressed APOBEC3B Induces Mutations in Multiple Myeloma

  Hiroyuki Yamazaki; Kotaro Shirakawa; Tadahiko Matsumoto; Hiroyuki Matsui; Wataru Maruyama; Masayuki Kobayashi; Keisuke Shindo; Anamaria Daniela Sarca; Masaki Ri; Shinsuke Iida; Akifumi Takaori-Kondo

  BLOOD, 2016年12月

  
• APOBEC3GのN末端ドメインの構造的洞察による,RNA結合に重要なアミノ酸残基の同定

  福田寛文; SARCA Daniela; 山下和男; LI Songling; STANDLEY Daron; LI Songling; STANDLEY Daron; 白川康太郎; 高折晃史; 泉泰輔

  日本エイズ学会誌, 2016年11月20日

  
• リンパ腫合併症例に対する自家末梢血幹細胞移植のHIV‐1プロウイルス量および潜伏感染リザーバーサイズへの影響

  吉永則良; 白川康太郎; 福田寛文; 新堂啓祐; 小林正行; 高折晃史

  日本エイズ学会誌, 2016年11月20日

  
• PPP2R5DはVifユビキチンリガーゼの基質であり,Vifの誘導する細胞周期停止に関わっている

  永田佳代子; 新堂啓祐; 松井佑亮; 白川康太郎; 高折晃史

  日本エイズ学会誌, 2016年11月20日

  
• HDACiによるshock and kill

  白川康太郎

  日本エイズ学会誌, 2016年11月20日

  
• 極めて急速な臨床経過をたどったcMYC/IGH,BCL2/IGH,PAX5/IGH転座を有するtriple‐hit lymphomaの一例

  大塚泰幸; 白川康太郎; 錦織桃子; 菱澤方勝; 北野俊行; 羽賀博典; 高折晃史

  日本リンパ網内系学会会誌, 2016年08月05日

  
• Picture in Clinical Hematology No. 96

  松井佑亮; 新堂啓祐; 小林正行; 白川康太郎; 近藤忠一; 高折晃史

  臨床血液, 2016年

  
• βヒドロキシ酪酸は内在性のHDAC阻害剤として酸化ストレス抑制に関わる

  島津忠広; 白川康太郎; VERDIN Eric

  日本薬学会年会要旨集(CD-ROM), 2016年

  
• βヒドロキシ酪酸による酸化ストレス制御と疾患

  白川康太郎

  日本抗加齢医学会総会プログラム・抄録集, 2016年

  
• Vifの誘導する細胞周期G2停止機構の探求

  永田佳代子; 新堂啓祐; 松井佑亮; 白川康太郎; 小林正行; 高折晃史

  日本エイズ学会誌, 2015年11月20日

  
• APOBEC3Gのアセチル化修飾と機能調節

  福田寛文; 松井佑亮; 白川康太郎; 和田典也; 宮川敬; 梁明秀; 高折晃史

  日本エイズ学会誌, 2015年11月20日

  
• SIRT1 deacetylates ROR gamma t and enhances Th17 cell generation (vol 212, pg 607, 2015)

  Hyung W. Lim; Seung Goo Kang; Jae Kyu Ryu; Birgit Schilling; Mingjian Fei; Intelly S. Lee; Amanuel Kehasse; Kotaro Shirakawa; Masaru Yokoyama; Martina Schnlzer; Herbert G. Kasler; Hye-Sook Kwon; Bradford W. Gibson; Hironori Sato; Katerina Akassoglou; Changchun Xiao; Dan R. Littman; Melanie Ott; Eric Verdin

  JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE, 2015年06月

  
• ATLにおけるTDP1の発現低下は転写因子NRF1がHBZによって障害されていることに起因する

  小林正行; 瀧内曜子; 多田浩平; 岩井文絵; 櫻田麻希; 菱澤方勝; 白川康太郎; 新堂啓祐; 安永純一朗; 武田俊一; POMMIER Yves; 松岡雅雄; 高折晃史

  日本HTLV‐1学会学術集会, 2015年

  
• 遺伝子組み換え型ヒトトロンボモジュリン製剤が有効であった血球貪食症候群併発播種性血管内凝固

  山崎寛章; 近藤忠一; 辰巳剛一; 小谷槙一; 新井康之; 白川康太郎; 北野俊行; 菱澤方勝; 門脇則光; 高折晃史

  臨床血液, 2015年

  
• Expression of Tim-1 and Its Pathogenetic Role in Primary CNS Lymphoma

  Momoko Nishikori; Wataru Kishimoto; Hiroshi Arima; Kotaro Shirakawa; Toshio Kitawaki; Akifumi Takaori-Kondo

  BLOOD, 2014年12月

  
• CBFβはMDM2によるVifの分解を阻害することでVifを安定化する

  松井佑亮; 新堂啓祐; 永田佳代子; 吉永則良; 丸山亙; 白川康太郎; 小林正行; 高折晃史

  日本エイズ学会誌, 2014年11月20日

  
• HIV潜伏感染細胞の研究の最前線

  白川康太郎

  日本エイズ学会誌, 2014年11月20日

  
• HIVの潜伏感染とその根絶への仮説的戦略

  白川康太郎; 高折晃史

  HIV感染症とAIDSの治療, 2014年05月20日

  
• HIV感染症2013~現状と展望~3.潜伏感染とそれを標的とした新規治療について

  白川康太郎

  血液フロンティア, 2013年05月30日

  
• HIV‐1Vifはp53を介してその機能を発揮する

  泉泰輔; 白川康太郎; 松井道志; 井尾克宏; 篠原正信; 内山卓; 高折晃史

  日本エイズ学会誌, 2009年11月20日

  
• HIV‐1 Vifはp53を介してその機能を発揮する

  泉泰輔; 白川康太郎; 松井道志; 井尾克宏; 篠原正信; 内山卓; 高折晃史

  日本ウイルス学会学術集会プログラム・抄録集, 2009年10月01日

  
• 分子モデリングによるリン酸化APOBEC3Gの構造解析

  横山勝; 白川康太郎; 高折晃史; 佐藤裕徳

  日本エイズ学会誌, 2008年11月20日

  
• Protein Kinase Aによるリン酸化はAPOBEC3GとVifの相互作用を調節する

  白川康太郎; 高折晃史; 横山勝; 松井道志; 井尾克宏; 泉泰輔; 佐藤裕徳; 内山卓

  日本エイズ学会誌, 2008年11月20日

  
• HIV‐1 Vifはp53依存的経路で感染細胞の細胞周期をG2/M期に停止させる

  泉泰輔; 高折晃史; 白川康太郎; 松井道志; 井尾克宏; 内山卓

  日本エイズ学会誌, 2008年11月20日

  
• HLA一致同胞以外をドナーとしたミニ移植の検討

  白川 康太郎; 石川 隆之; 一戸 辰夫; 吉岡 聡; 鷹尾 珠美子; 門脇 則光; 高折 晃史; 今田 和典; 堀 利行; 岡崎 俊朗; 内山 卓

  日本血液学会・日本臨床血液学会総会プログラム・抄録集, 2004年09月

  

受賞

• 2010年05月02日

  京都大学大学院医学研究科, 京都大学医学部若手研究者優秀論文賞「KMYIA」

外部資金：科学研究費補助金

• HIV-1Vif/HDAC3複合体によるHIV-1潜伏感染転写ネットワークの制御

  基盤研究(C)

  小区分49060:ウイルス学関連

  京都大学

  白川 康太郎

  自 2019年04月01日, 至 2022年03月31日, 交付

  HIV-1;潜伏感染;CAGE法;トランスクリプトーム;CRISPRスクリーニング;HIV感染症;CRISPR/Cas9;トランスクリプトーム解析

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19K07591/
• APOBEC3によるゲノム変異導入と癌のクローン進化の病態解明

  基盤研究(B)

  小区分50010:腫瘍生物学関連

  京都大学

  高折 晃史

  自 2019年04月01日, 至 2022年03月31日, 交付

  APOBEC3;癌のクローン進化;癌の多様性;治療抵抗性;マウスモデル;APOBEC signature;CAGE法;シングルセル解析;ゲノム変異;クローン進化;癌の不均一性

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19H03502/
• 新規技術による白血病の包括的エンハンサー解析と分子病態解明

  基盤研究(A)

  中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野

  国立研究開発法人理化学研究所

  村川 泰裕

  自 2018年04月01日, 至 2021年03月31日, 完了

  白血病;エンハンサー;ゲノム解析技術;バイオマーカー;転写ネットワーク;NET-CAGE;造血器悪性腫瘍;ヒトゲノム科学;ノンコーディングゲノム・RNA;次世代シークエンシング;バイオインフォマティクス;ゲノム科学;遺伝子発現制御;次世代シークエンサー;造血器腫瘍;NET-CAGE法;腫瘍;ゲノム解析

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18H03992/
• HIV-1感染症におけるA3Gのアセチル化とVif/HDAC3複合体の役割

  基盤研究(C)

  京都大学

  白川 康太郎

  自 2016年04月01日, 至 2019年03月31日, 完了

  HIV-1;Vif;ヒストン脱アセチル化酵素;DNAシトシン脱アミノ化酵素APOBEC3G;潜伏感染;HIV感染症;HIV-1 Vif;APOBEC3G;アセチル化;HDAC3;シチジン脱アミノ化酵素

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16K08809/
• CRISPRスクリーンを用いたHIV-1潜伏感染分子メカニズムの解析

  基盤研究(C)

  小区分49060:ウイルス学関連

  京都大学

  白川 康太郎

  自 2022年04月01日, 至 2025年03月31日, 採択

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K07085/