基本情報

所属学協会

• 自 2020年12月, 至 現在

  公益社団法人日本農芸化学会
• 自 2019年, 至 現在

  SPring-8ユーザー共同体(SPRUC)X線自由電子レーザーXFEL利用研究会会員
• 自 2012年08月, 至 現在

  SPring-8ユーザー共同体(SPRUC)放射光構造生物学研究会
• 自 2002年04月, 至 現在

  公益社団法人日本生化学会

学位

• 修士（農学）(京都大学)
• 博士（農学）(京都大学)

出身大学院・研究科等

• 京都大学, 大学院農学研究科博士後期課程応用生命科学専攻, Division of Applied Life Sciences, 修了
• 京都大学, 大学院農学研究科修士課程応用生命科学専攻, Division of Applied Life Sciences, 修了

ID,URL

• J-Global ID

  201401042230227449

researchmap URL

• https://researchmap.jp/2418

研究

研究テーマ・研究概要

• 研究テーマ

  ABC蛋白質の分子機構

• 研究概要

  ABC(ATP-Binding Cassette)蛋白質はよく保存されたATP結合領域を持つ膜蛋白質の総称であり、ヒトにおいては、48種類のABC蛋白質が我々の健康の維持に重要な役割を果たしています。ABC蛋白質は主に脂溶性の化合物を輸送し生体防御や脂質の恒常性維持を司ります。最近、私たちは代表的なABC蛋白質であるMDR1（P糖蛋白質）を対象とした立体構造と機能の研究によって、ATPが結合することにより引き起こされるATP結合ドメインの構造変化が膜貫通ドメインへと伝播し分子全体にダイナミックな構造変換をもたらすことで、脂溶性の化合物を絞り出すようにして細胞外へと排出するMDR1分子の巧妙な仕組みを明らかにしました。これまでにMDR1で確立した研究基盤に基づき、現在、生理学的に重要な他のヒトABC蛋白質（たとえば脂質輸送型ABC蛋白質）を研究対象とし、未だ謎とされているそれらの分子メカニズムを明らかにしようとしています。

研究キーワード

• 脂質代謝
• nascent HDL
• 創薬
• 分子機構
• 蛋白質立体構造変化
• 蛋白質立体構造活性相関
• 生体高分子

研究分野

• ライフサイエンス, 栄養学、健康科学, nascent HDL
• ライフサイエンス, 分子生物学
• ライフサイエンス, 細胞生物学
• ライフサイエンス, 薬理学
• ライフサイエンス, 構造生物化学
• ライフサイエンス, 応用生物化学

論文

• The role of ATP hydrolysis in conformational changes of human P-glycoprotein in living cells

  Ryota Futamata; Fumihiko Ogasawara; Takafumi Ichikawa; Atsushi Kodan; Yasuhisa Kimura; Noriyuki Kioka; Kazumitsu Ueda

  bioRxiv, 2019年11月

  
• 真核生物由来ABC多剤排出トランスポーターの構造と分子メカニズム

  小段 篤史; 山口 知宏; 中津 亨; 加藤 博章

  日本結晶学会誌, 2014年

  
• ABCB1/MDR1/P-gp employs an ATP-dependent twist-and-squeeze mechanism to export hydrophobic drugs.

  Atsushi Kodan; Ryota Futamata; Yasuhisa Kimura; Noriyuki Kioka; Toru Nakatsu; Hiroaki Kato; Kazumitsu Ueda

  FEBS letters, 2021年03月, 査読有り

  
• ABC proteins in evolution.

  Fumihiko Ogasawara; Atsushi Kodan; Kazumitsu Ueda

  FEBS letters, 2020年12月, 査読有り

  
• In vivo FRET analyses reveal a role of ATP hydrolysis–associated conformational changes in human P-glycoprotein

  Ryota Futamata; Fumihiko Ogasawara; Takafumi Ichikawa; Atsushi Kodan; Yasuhisa Kimura; Noriyuki Kioka; Kazumitsu Ueda

  Journal of Biological Chemistry, 2020年04月10日, 査読有り

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• Inward- and outward-facing X-ray crystal structures of homodimeric P-glycoprotein CmABCB1.

  Kodan A; Yamaguchi T; Nakatsu T; Matsuoka K; Kimura Y; Ueda K; Kato H

  Nature communications, 2019年01月, 査読有り

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• Experimental phase determination with selenomethionine or mercury-derivatization in serial femtosecond crystallography

  Keitaro Yamashita; Naoyuki Kuwabara; Takanori Nakane; Tomohiro Murai; Eiichi Mizohata; Michihiro Sugahara; Dongqing Pan; Tetsuya Masuda; Mamoru Suzuki; Tomomi Sato; Atsushi Kodan; Tomohiro Yamaguchi; Eriko Nango; Tomoyuki Tanaka; Kensuke Tono; Yasumasa Joti; Takashi Kameshima; Takaki Hatsui; Makina Yabashi; Hiroshi Manya; Tamao Endo; Ryuichi Kato; Toshiya Senda; Hiroaki Kato; So Iwata; Hideo Ago; Masaki Yamamoto; Fumiaki Yumoto; Toru Nakatsu

  IUCRJ, 2017年09月, 査読有り

  
• An isomorphous replacement method for efficient de novo phasing for serial femtosecond crystallography

  Keitaro Yamashita; Dongqing Pan; Tomohiko Okuda; Michihiro Sugahara; Atsushi Kodan; Tomohiro Yamaguchi; Tomohiro Murai; Keiko Gomi; Naoki Kajiyama; Eiichi Mizohata; Mamoru Suzuki; Eriko Nango; Kensuke Tono; Yasumasa Joti; Takashi Kameshima; Jaehyun Park; Changyong Song; Takaki Hatsui; Makina Yabashi; So Iwata; Hiroaki Kato; Hideo Ago; Masaki Yamamoto; Toru Nakatsu

  SCIENTIFIC REPORTS, 2015年09月, 査読有り

  この論文にアクセスする：

  
• Luciferin-regenerating enzyme solved by SIRAS using XFEL (refined against Hg derivative data)

  Yamashita K; Pan D; Okuda T; Sugahara M; Kodan A; Yamaguchi T; Murai T; Gomi K; Kajiyama N; Mizohata E; Suzuki M; Nango E; Tono K; Joti Y; Kameshima T; Park J; Song C; Hatsui T; Yabashi M; Iwata S; Kato H; Ago H; Yamamoto M; Nakatsu T

  Worldwide Protein Data Bank, 2015年, 査読有り

  
• Luciferin-regenerating enzyme solved by SAD using synchrotron radiation at room temperature

  Yamashita K; Pan D; Okuda T; Sugahara M; Kodan A; Yamaguchi T; Murai T; Gomi K; Kajiyama N; Mizohata E; Suzuki M; Nango E; Tono K; Joti Y; Kameshima T; Park J; Song C; Hatsui T; Yabashi M; Iwata S; Kato H; Ago H; Yamamoto M; Nakatsu T

  Worldwide Protein Data Bank, 2015年, 査読有り

  
• Structural basis for gating mechanisms of a eukaryotic P-glycoprotein homolog

  Atsushi Kodan; Tomohiro Yamaguchi; Toru Nakatsu; Keita Sakiyama; Christopher J. Hipolito; Akane Fujioka; Ryo Hirokane; Keiji Ikeguchi; Bunta Watanabe; Jun Hiratake; Yasuhisa Kimura; Hiroaki Suga; Kazumitsu Ueda; Hiroaki Kato

  PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2014年03月, 査読有り

  
• Deleting two C-terminal α-helices is effective to crystallize the bacterial ABC transporter Escherichia coli MsbA complexed with AMP-PNP

  K. Terakado; A. Kodan; H. Nakano; Y. Kimura; K. Ueda; T. Nakatsu; H. Kato

  Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography, 2010年03月, 査読有り

  
• Functional role of the linker region in purified human P-glycoprotein

  Tomomi Sato; Atsushi Kodan; Yasuhisa Kimura; Kazumitsu Ueda; Toru Nakatsu; Hiroaki Kato

  FEBS JOURNAL, 2009年07月, 査読有り

  
• Improved expression and purification of human multidrug resistance protein MDR1 from baculovirus-infected insect cells

  Atsushi Kodan; Hiroyuki Shibata; Takashi Matsumoto; Kanako Terakado; Keita Sakiyama; Michinori Matsuo; Kazumitsu Ueda; Hiroaki Kato

  PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION, 2009年07月, 査読有り

  
• Selective labeling of tag-fused protein by tryptophan-sensitized luminescence of a terbium complex

  Tasuku Hirayama; Masayasu Taki; Atsushi Kodan; Hiroaki Kato; Yukio Yamamoto

  CHEMICAL COMMUNICATIONS, 2009年, 査読有り

  
• Cholesterol fill-in model: mechanism for substrate recognition by ABC proteins

  Yasuhisa Kimura; Atsushi Kodan; Michinori Matsuo; Kazumitsu Ueda

  JOURNAL OF BIOENERGETICS AND BIOMEMBRANES, 2007年12月, 査読有り

  
• A stilbene synthase from Japanese red pine (Pinus densiflora): Implications for phytoalexin accumulation and down-regulation of flavonoid biosynthesis

  A Kodan; H Kuroda; F Sakai

  PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2002年03月, 査読有り

  
• Simultaneous expression of stilbene synthase genes in Japanese red pine (Pinus densiflora) seedlings

  A Kodan; H Kuroda; F Sakai

  JOURNAL OF WOOD SCIENCE, 2001年, 査読有り

  
• An O-Methyltransferase (OMT) cDNA Clone in Japanese Red Pine (Pinus densiflora) Seedlings

  ETOH Kazumi; KODAN Atsushi; SAKAI Fukumi; KURODA Hiroyuki

  Wood research : bulletin of the Wood Research Institute Kyoto University, 2000年, 査読有り

  この論文にアクセスする：

  
• Characterization of stilbene synthase genes in Japanese red pine (Pinus densiflora)

  Atsushi Kodan; Hiroyuki Kuroda; Fukumi Sakai

  Wood Research, 1999年, 査読有り, 筆頭著者

  
• Molecular Cloning and Expression of the Canine Metallothionein-III Gene

  S. Kojima; A. Shimada; A. Kodan; K. Kobayashi; T. Morita; Y. Yamano; T. Umemura

  Canadian Journal of Veterinary Research, 1998年, 査読有り

  

MISC

• Direct Visualization of ABCA1 Reconstituted in Nanodisc by High-Speed Atomic Force Microscopy (HS-AFM)

  Atsushi Kodan; Romain Amyo; Yasuhisa Kimura; Noriyuki Kodera; Kazumitsu Ueda

  ABC2023, the 9th FEBS Special Meeting “ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Disease”, 2023年02月26日, 筆頭著者

  
• Cryo-EM解析を目指した脂質輸送型ABC蛋白質の生産・調製基盤の構築

  小段篤史; 光岡薫; 木村泰久; 木岡紀幸; 植田和光

  日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2021年, 筆頭著者

  
• 多剤排出ポンプMDR1の薬剤絞り出しメカニズム

  小段篤史; 木村泰久; 植田和光

  トランスポーター研究会年会抄録集, 2020年, 筆頭著者

  
• 多剤排出ポンプMDR1の薬剤絞り出し機構

  小段篤史; 木村泰久; 植田和光

  ファルマシア(Web), 2020年, 筆頭著者

  
• X 線自由電子レーザーを用いたP糖タンパク質ホモログの連続フェムト秒X線結晶構造解析

  大山諒; 潘東青; 中津亨; 佐藤友美; 山口知宏; 小段篤史; 植田和光; 岩田想; 加藤博章

  第14回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム, 2016年08月28日

  
• 高分解能結晶構造に基づいたABCトランスポーターの分子機構

  小段篤史

  「多様性が切り拓く膜輸送研究の新時代」第11回トランスポーター研究会年会, 2016年07月03日, 招待有り, 筆頭著者

  
• Serial Femtosecond Crystallography of ABC Transporter

  大山諒; 潘東青; 中津亨; 佐藤友美; 山口知宏; 小段篤史; 植田和光; 岩田想; 加藤博章

  6th Special Meeting, ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Diseases (ABC2016), 2016年03月

  
• Crystallographic study of the ABC transporter CmABCB1 covalently bound to substrate derivatives

  松岡敬太; 廣兼諒; 小段篤史; 山口知宏; 中津亨; 植田和光; 加藤博章

  6th Special Meeting, ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Diseases (ABC2016), 2016年03月

  
• X線自由電子レーザーを用いた新規タンパク質の立体構造決定

  山下 恵太郎; 潘 東青; 奥田 智彦; 菅原 道泰; 小段 篤史; 山口 知宏; 村井 智洋; 溝端 栄一; 鈴木 守; 南後 恵理子; 登野 健介; 城地 保昌; 亀島 敬; 初井 宇記; 矢橋 牧名; 岩田 想; 加藤 博章; 吾郷 日出夫; 山本 雅貴; 中津 亨

  日本薬学会年会要旨集, 2016年03月

  
• 真核生物由来ABC輸送体の分子機構

  小段篤史; 植田和光; 加藤博章

  日本生化学会大会(Web), 2016年, 筆頭著者

  
• シリアル結晶学における重原子誘導体を用いた位相決定

  山下恵太郎; 潘東青; 長谷川和也; 菅原道泰; 村井智洋; 小段篤史; 溝端栄一; 鈴木守; 鈴木守; 桝田哲哉; 桝田哲哉; 平田邦生; 加藤博章; 吾郷日出夫; 熊坂崇; 山本雅貴; 中津亨

  日本結晶学会年会講演要旨集, 2015年10月

  
• X 線自由電子レーザーを用いたタンパク質 X 線結晶 構造解析

  潘東青; 中津亨; 山口知宏; 小段篤史; 小川和浩; 松嶌一樹; 山下恵太郎; 城地保昌; 登野健介; 矢橋牧名; 鈴木守; 南後恵理子; 岩田想; 加藤博章

  日本薬学会第135年会, 2015年03月27日

  
• 測定温度の違いがもたらすタンパク質X線結晶構造への影響

  村井智洋; 潘東青; 小段篤史; 山下恵太郎; 上野剛; 加藤博章

  日本薬学会近畿支部総会, 2015年03月25日

  
• SACLAによるABCトランスポーターおよびホタル・ルシフェラーゼのX線結晶構造解析(第2報)

  潘東青; 中津亨; 山口知宏; 小段篤史; 小川和浩; 松嶌一樹; 山下恵太郎; 城地保昌; 登野健介; 矢橋牧名; 鈴木守; 南後恵理子; 岩田想; 加藤博章

  平成26年度日本結晶学会年会, 2014年11月01日

  
• ABC多剤排出トランスポーターの立体構造の特徴

  山口知宏; 小段篤史; 中津亨; 植田和光; 加藤博章

  第87回日本生化学会大会, 2014年10月15日, 招待有り

  
• SACLAによるABCトランスポーターおよびホタル・ルシフェラーゼのX線結晶構造解析

  潘東青、中津亨、山口知宏、小段篤史、小川和浩、松嶌一樹、城地保昌、登野健介、矢橋牧名、鈴木守、南後恵理子、岩田想、加藤博章

  第１４回日本蛋白質科学会年会, 2014年06月25日

  
• SACLAおよびSPring-8において得られるタンパク質結晶構造の比較

  村井智洋; 潘東青; 山下恵太郎; 菅原道泰; 小段篤史; 山口知宏; 上野 剛; 南後恵理子; 登野健介; 城地保昌; 亀島敬; Changyong Song; 初井宇記; 矢橋牧名; 岩田想; 吾郷日出夫; 山本雅貴; 加藤博章; 中津 亨

  第15回日本蛋白質科学会年会, 2014年06月25日

  
• Crystal structure of an ABC multidrug exporter from Cyanidioschyzon merolae, a thermophilic unicellular eukaryote

  Atsushi Kodan; Tomohiro Yamaguchi; Toru Nakatsu; Keita Sakiyama; Christopher J. Hipolito; Akane Fujioka; Ryo Hirokane; Yasuhisa Kimura; Hiroaki Suga; Kazumitsu Ueda; Hiroaki Kato

  ABC2014, 5th FEBS Special Meeting, ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Diseases, 2014年03月, 招待有り, 筆頭著者

  
• Structure-based functional aspects of the ABC multidrug transporter, CmABCB1 from a thermophilic eukaryote

  Tomohiro Yamaguchi; Atsushi Kodan; Toru Nakatsu; Keita Sakiyama; Christopher J. Hipolito; Akane Fujioka; Ryo Hirokane; Yasuhisa Kimura; Hiroaki Suga; Kazumitsu Ueda; Hiroaki Kato

  ABC2014, 5th FEBS Special Meeting, ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Diseases, 2014年03月

  
• ABC多剤排出トランスポーターにおける基質取込の立体構造基盤

  山口知宏; 小段篤史; 中津亨; 植田和光; 加藤博章

  日本薬学会年会要旨集(CD-ROM),134th,ROMBUNNO.29PML-047, 2014年

  
• 好熱性真核生物のABC多剤排出トランスポーターのX線結晶構造解析

  廣兼諒; 小段篤史; 中津亨; 山口知宏; 植田和光; 加藤博章

  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集,13th,83, 2013年

  
• 創薬ターゲット蛋白質の迅速構造解析法の開発~SACLAにおけるシリアルフェムト秒X線結晶構造解析~

  南後恵理子; 鈴木守; 田中里枝; 登野健介; 城地保昌; 亀島敬; PARK Jaehyun; SONG Changyong; 初井宇記; 矢橋牧名; 潘東青; 小段篤史; 山口知宏; 中津亨; 加藤博章; 田中良樹; 寿野千代; 伊原健太郎; 豊田洋輔; 島村達郎; 溝端栄一; 北郷悠; 高木淳一; 石谷隆一郎; 濡木理; GALLAT Francois‐Xavier; 山田悠介; 松垣直宏; 湯本史明; CHAVAS Leonar; M. G; 岩田想

  日本結晶学会年会講演要旨集,2013,92, 2013年

  
• トランスポーターにおけるATP駆動力共役メカニズムの立体構造基盤

  山口知宏; 小段篤史; 中津亨; 藤岡あかね; 植田和光; 加藤博章

  公開シンポジウム「ゆらぎと水―生命のエネルギーと機能の分子機構を探る」, 2012年09月

  
• 結晶構造に基づく多剤排出型ABCトランスポーターメカニズムの解明

  藤岡あかね; 山口知宏; 小段篤史; 中津亨; 植田和光; 加藤博章

  次世代を担う若手ファーマ・バイオフォーラム講演要旨集,11th,49, 2012年09月

  
• X-ray crystallographic analysis of an exporter-type ABC transporter

  Atsushi Kodan; Tomohiro Yamaguchi; Toru Nakatsu; Keita Sakiyama; Akane Fujioka; Kazumitsu Ueda; Hiroaki Kato

  ABC2012, the 4th FEBS Special Meeting “ATP-Binding Cassette Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Disease” Hotel Grauer Bär (Innsbruck, Austria), 2012年03月, 筆頭著者

  
• 好熱性紅藻由来ABCトランスポーターの輸送基質特異性の検討

  山口知宏; 木村泰久; 小段篤史; 池口圭司; 渡辺文太; 平竹潤; 中津亨; 植田和光; 加藤博章

  生体膜と薬物の相互作用シンポジウム講演要旨集,34th,120-121, 2012年

  
• 好熱性真核生物由来の多剤排出ABCトランスポーターの機能解析

  山口知宏; 崎山慶太; 地主遼平; 佐藤友美; 小段篤史; 中津亨; 植田和光; 加藤博章

  日本薬学会年会要旨集,131st,3,116, 2011年

  
• 好熱性紅藻由来の基質排出型ABCトランスポーターの基質特異性の解析

  山口知宏; 崎山慶太; 佐藤友美; 小段篤史; 中津亨; 植田和光; 加藤博章

  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集,11th,134, 2011年

  
• Improved expression and purification of human multidrug resistance protein MDR1 from baculovirus-infected insect cells

  A. Kodan; K. Terakado; K. Sakiyama; M. Matsuo; K. Ueda; H. Kato

  ABC2010, the 3rd FEBS Special Meeting “ATP-Binding Cassette Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Disease”, 2010年03月, 筆頭著者

  
• Deleting two C-terminal α-helices is effective to crystallize the bacterial ABC transporter Escherichia coli MsbA complexed with AMP-PNP

  K. Terakado; A. Kodan; H. Nakano; Y Kimura; K. Ueda; T Nakatsu; H. Kato

  ABC2010, the 3rd FEBS Special Meeting “ATP-Binding Cassette Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Disease”, 2010年03月

  
• Functional role of the linker region in purified human P-glycoprotein

  T. Sato; A. Kodan; Y. Kimura; K. Ueda; T. Nakatsu; H. Kato

  ABC2010, the 3rd FEBS Special Meeting “ATP-Binding Cassette Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Disease”, 2010年03月

  
• 好熱性紅藻Cyanidioschyzon merolae由来のABCトランスポーターの発現,精製,及び機能解析

  崎山慶太; 山口知宏; 小段篤史; 中津亨; 佐藤友美; 植田和光; 加藤博章

  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集,10th,162, 2010年

  
• 好熱性紅藻由来ABCトランスポーターの多剤排出活性の特徴

  山口知宏; 崎山慶太; 池口圭司; 地主遼平; 佐藤友美; 渡辺文太; 小段篤史; 中津亨; 平竹潤; 植田和光; 加藤博章

  生体膜と薬物の相互作用シンポジウム講演要旨集,32nd,61-62, 2010年

  
• Isolation and biochemical characterization of an ABC transporter from a thermophilic red alga, Cyanidioschyzon merolae

  YAMAGUCHI Tomohiro; SAKIYAMA Keita; KODAN Atsushi; NAKATSU Toru; UEDA Kazumitsu; KATO Hiroaki

  第31回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム講演要旨集, 2009年11月

  
• Improved expression and purification of human multidrug resistance protein MDR1 from baculovirus-infected insect cells

  A. Kodan; K. Terakado; K. Sakiyama; M. Matsuo; K. Ueda; H. Kato

  The 5th iCeMS International Symposium, 2009年05月28日, 筆頭著者

  
• Improved expression and purification of human multidrug resistance protein MDR1 from baculovirus-infected insect cells

  A. Kodan; K. Terakado; K. Sakiyama; M. Matsuo; K. Ueda; H. Kato

  The 5th Takeda Science Foundation Symposium on PharmaSciences “Bioactive Lipid Molecules and Transporters”, 2009年05月25日, 筆頭著者

  
• 多剤排出トランスポーターP糖タンパク質のリンカー領域の薬物輸送における役割

  佐藤友美; 小段篤史; 木村泰久; 植田和光; 中津亨; 加藤博章

  日本薬学会年会要旨集,129th,4,256, 2009年

  
• メタノール資化性酵母Pichia pastorisを用いたABCタンパク質の大量生産

  小段篤史; 崎山慶太; 山口知宏; 中津亨; 植田和光; 加藤博章

  生化学,ROMBUNNO.2P-332, 2009年, 筆頭著者

  
• C末端の二本のαヘリックスの欠失による大腸菌由来ABCトランスポーターMsbA結晶の改良

  寺角香菜子; 小段篤史; 中野博明; 木村泰久; 中津亨; 植田和光; 加藤博章

  生化学,ROMBUNNO.2P-316, 2009年

  
• BIOFLO310を用いた大腸菌高密度培養による膜タンパク質の効率的生産系

  小段篤史; 寺角香菜子; 末上伸二; 久保武; 植田和光; 西川茂道; 加藤博章

  生化学, 2008年, 筆頭著者

  
• 構造解析に適した真核生物由来のABCトランスポーターのスクリーニング

  崎山慶太; 木村泰久; 小段篤史; 中津亨; 植田和光; 加藤博章

  日本薬学会年会要旨集,128th,4,65, 2008年

  
• 多剤排出トランスポーターP糖タンパク質におけるリンカー領域の役割

  佐藤友美; 小段篤史; 木村泰久; 中津亨; 加藤博章

  日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集,7th,131, 2007年

  
• ABC(ATP-binding cassette)タンパク質の構造解析が拓く創薬の未来

  小段篤史; 木村泰久; 加藤博章; 植田和光

  未来材料, 2006年10月, 査読有り, 筆頭著者

  
• 昆虫細胞Sf+を用いたヒトP 糖タンパク質の大量精製

  佐藤友美; 小段篤史; 寺角香菜子; 崎山慶太; 木村泰久; 中津 亨; 加藤博章

  第27回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム, 2005年11月28日

  
• 昆虫細胞Sf+を用いたヒトP糖タンパク質の大量精製

  寺角香菜子; 小段篤史; 佐藤友美; 柴田洋之; 植田和光; 加藤博章

  日本薬学会年会要旨集, 2005年03月05日

  
• 昆虫細胞Sf9・バキュロウィルス発現系を用いたヒトP糖蛋白質の大量精製

  小段篤史; 柴田洋之; 松本崇; 松尾道憲; 植田和光; 加藤博章

  第76回日本生化学大会, 2003年10月, 筆頭著者

  
• アカマツのスチルベン合成酵素群の性質 -スチルベノイド・フラボノイドの生合成制御

  小段篤史; 黒田宏之; 酒井富久美

  第52回日本木材学会大会, 2002年04月, 筆頭著者

  
• アカマツO-メチル基転移酵素cDNA群の性質

  下村文恵; 江藤和美; 小段篤史; 酒井富久美

  第52回日本木材学会大会, 2002年04月

  
• Stilbene Synthase from Japanese Red Pine – Its Role in Stilbenoid Biosynthesis –

  A. Kodan; H. Kuroda; F. Sakai

  The Third International Wood Science Symposium, 2001年11月02日, 招待有り, 筆頭著者

  
• アカマツのＣ末端配列欠失ピノシルビン合成酵素の性質

  小段篤史; 黒田宏之; 酒井富久美

  第51回日本木材学会大会, 2001年04月, 筆頭著者

  
• 大腸菌で発現させたアカマツ（Pinus densiflora）のスチルベン合成酵素

  小段篤史; 黒田宏之; 酒井富久美

  日本農芸化学大会, 2001年03月, 筆頭著者

  
• 大腸菌で発現させた３種類のスチルベン合成酵素の性質

  小段篤史; 黒田宏之; 酒井富久美

  植物細胞分子生物学大会, 2000年07月, 筆頭著者

  
• アカマツのスチルベン合成酵素 –大腸菌発現系による同定と性質解明-

  小段篤史; 黒田宏之; 酒井富久美

  第50回日本木材学会大会, 2000年04月, 筆頭著者

  
• アカマツのスチルベン合成酵素の大腸菌での発現

  小段篤史; 黒田宏之; 酒井富久美

  日本農芸化学大会, 2000年04月, 筆頭著者

  
• スチルベン合成酵素遺伝子の大腸菌における発現とその生育阻害

  小段篤史; 黒田宏之; 酒井富久美

  第49回日本木材学会大会, 1999年04月, 筆頭著者

  
• アカマツのスチルベン合成酵素群

  小段篤史; 黒田宏之; 酒井富久美

  日本農芸化学大会, 1999年04月, 筆頭著者

  
• スチルベン合成酵素遺伝子プローブによるアカマツ芽生えcDNAライブラリーのスクリーニング

  小段篤史; 黒田宏之; 酒井富久美

  第48回日本木材学会大会, 1998年04月, 筆頭著者

  
• アカマツのポリケチド合成酵素のcDNAクローニング

  小段篤史; 黒田宏之; 酒井富久美

  日本農芸化学大会, 1998年04月, 筆頭著者

  
• イヌの 脳におけるメタロチオネイン遺伝子の発現とその加齢における意義

  小嶋聖; 小段篤史; 小林欣滋; 森田剛仁; 島田章則; 山野好章; 梅村孝司

  第124 回日本 獣医学会, 1997年10月

  

講演・口頭発表等

• Direct Visualization of ABCA1 Reconstituted in Nanodisc by High-Speed Atomic Force Microscopy (HS-AFM)

  Atsushi Kodan; Romain Amyo; Yasuhisa Kimura; Noriyuki Kodera; Kazumitsu Ueda

  ABC2023, the 9th FEBS Special Meeting “ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Disease” Innsbruck, Austria, 2023年03月01日

  
• Cryo-EM解析を目指した脂質輸送型ABC蛋白質の生産・調製基盤の構築

  小段篤史; 光岡薫; 木村泰久; 木岡紀幸; 植田和光

  日本農芸化学大会2021年度大会 （オンライン開催）, 2021年03月20日

  
• 多剤排出ポンプMDR1の薬剤絞り出しメカニズム

  小段篤史; 木村泰久; 植田和光

  第15回トランスポーター研究会年会 （オンライン開催）, 2020年10月16日, 招待有り

  
• Structural basis for gating mechanisms of a eukaryotic ABC transporter

  Atsushi Kodan

  WPI–iCeMS Industry Advisory Committee Conference, 2014年10月14日, 招待有り

  
• High-resolution crystal structure of an ABC multidrug exporter from Cyanidioschyzon merolae, a thermophilic unicellular eukaryote

  Atsushi Kodan

  ABC2014, the 5th FEBS Special Meeting “ATP-Binding Cassette Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Disease”, 2014年03月08日, 招待有り

  
• X-ray crystallographic analysis of an exporter-type ABC transporter.

  Atsushi Kodan

  4th FEBS Special Meeting on ABC Proteins - ABC2012, 2012年03月03日

  
• X-ray crystallographic analysis of an exporter-type ABC transporter

  Atsushi Kodan

  Kakenhi Kiban (S)/iCeMS Joint International Symposium “ABC2011 in Kyoto -ABC Proteins/Membrane Meso-domains/ES-iPS cells”, 2011年11月11日

  
• Stilbene Synthase from Japanese Red Pine – Its Role in Stilbenoid Biosynthesis

  A. Kodan; H. Kuroda; F. Sakai

  The Third International Wood Science Symposium, 2001年11月02日, 招待有り

  

書籍等出版物

• B&I バイオサイエンスとインダストリー

  小段篤史; 植田和光, 共著, 脂溶性化合物を“絞り出す”多剤排出ポンプMDR1の分子機構 74(4), 280-283.

  一般財団法人バイオインダストリー協会, 2021年07月

  
• ファルマシア

  小段篤史; 木村泰久; 植田和光, 分担執筆, 多剤排出ポンプMDR1の薬剤絞り出し機構 56(6), 1-5.

  日本薬学会, 2020年06月01日

  
• 膜タンパク質工学ハンドブック

  監修 津本; 浩平; 浜窪; 隆雄 分担執筆; 木村泰久; 小段篤史; 植田和光, 分担執筆, 第2編膜タンパク質—医学・薬学への展開、第3章トランスポーター、第1節 多剤輸送体MDR1(ABCB1) p211-216

  エヌ・ティー・エス, 2020年04月

  京大の蔵書を調べる：

  
• 未来材料

  小段篤史; 木村泰久; 加藤博章; 植田和光, 共著, ABC (ATP-binding cassette) タンパク質の構造解析が拓く創薬の未来 6(10), 30-36

  エヌ・ティー・エス, 2006年10月10日, 査読無し

  
• ABC蛋白質

  編集 植田和光; 分担執筆 加藤博章、小段篤史、柴田洋之, 分担執筆, ABC蛋白質の立体構造研究—現状と課題 p245-274

  学会出版センター, 2005年05月

  京大の蔵書を調べる：

  

メディア報道

• 京大、多剤排出ポンプが薬を輸送するメカニズムを解明

  日本経済新聞電子版, 2019年01月10日, 新聞・雑誌

  
• 薬効かない再発がん、仕組み解明

  読売新聞, 17面, 2014年03月31日, 新聞・雑誌

  
• 京大グループ、抗がん剤働きを阻害、原因タンパク質を解明、薬剤開発に期待

  京都新聞, 27面, 2014年03月04日, 新聞・雑誌

  
• 「京大と東大、がん化学療法の阻害たんぱく質の類似分子構造を解明」

  日刊工業新聞, 19面, 2014年03月04日, 新聞・雑誌

  

外部資金：科学研究費補助金

• 細胞外基質による細胞機能制御機構の包括的理解とその応用基盤の研究

  基盤研究(A)

  中区分38:農芸化学およびその関連分野

  京都大学

  木岡 紀幸

  自 2021年04月05日, 至 2025年03月31日, 交付

  接着斑;細胞外マトリックス;細胞分化;メカノバイオロジー;コラーゲン;細胞接着

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21H04713/
• 脂質輸送型ABC蛋白質の分子構造と役割の解明

  基盤研究(B)

  小区分38030:応用生物化学関連

  京都大学

  小段 篤史

  自 2020年04月01日, 至 2023年03月31日, 完了

  脂質輸送型ABC蛋白質;新生HDL;善玉コレステロール;動脈硬化;輸送体;ATP;分子メカニズム;膜タンパク質;脂質輸送型ABCタンパク質;脂質代謝;アポA-I;ATP加水分解活性;脂質輸送;ABC蛋白質;立体構造;機能;分子機構;生体分子;膜蛋白質;機能ー構造相関;コレステロール;脂質;トランスポーター;細胞膜;構造

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20H02912/
• ABC輸送体の動作原理の解明と創薬への展開

  基盤研究(C)

  京都大学

  小段 篤史

  自 2017年04月01日, 至 2020年03月31日, 完了

  ABC輸送体;P糖蛋白質;膜蛋白質;分子メカニズム;機能-構造相関;ATP;生体分子;タンパク質;膜タンパク質;立体構造;機能;蛋白質;構造変化;バイオテクノロジー;薬理学;癌

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17K07306/
• ＡＢＣ輸送体の分子機構の解明

  若手研究(A)

  京都大学

  小段 篤史

  自 2012年04月01日, 至 2015年03月31日, 完了

  生体分子;膜タンパク質;癌;多剤耐性;立体構造解析;X線結晶構造解析;ABCタンパク質;P糖タンパク質;蛋白質;薬学

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24689029/
• ABC輸送体のX線結晶構造解析

  若手研究(B)

  京都大学

  小段 篤史

  自 2010年04月01日, 至 2012年03月31日, 完了

  生体分子;蛋白質;薬学;癌;ABC蛋白質;X線結晶構造解析;創薬

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22790512/
• トランスポーター膜タンパク質の構造生物学的研究

  基盤研究(B)

  京都大学

  加藤 博章

  自 2005年04月01日, 至 2008年03月31日, 完了

  ABCトランスポーター;P糖タンパク質;X線結晶解析;単粒子構造解析;膜タンパク質;トランスポーター;構造生物学;電子顕微鏡;多剤耐性;胆汁排出;糖尿病, ABC transporter;P-glycoprotein;X-ray crystalloqraphy;Single Particle Analysis;membrane proteins

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17380066/
• X線解析を目指した多剤耐性ポンプMDR1の大量発現系の構築と結晶化

  萌芽研究

  京都大学

  加藤 博章

  自 2004年04月01日, 至 2006年03月31日, 完了

  P糖タンパク質;多剤耐性;抗ガン剤;構造生物学;X線結晶学;構造薬理学;膜タンパク質;X線結晶解析;バキュロウイルス;MDR1;結晶化;昆虫細胞

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16659012/

外部資金：その他

• ABC輸送体による薬物輸送の構造基盤

  京都大学コアステージバックアップ研究費

  自 2015年04月01日, 至 2016年03月31日

  小段篤史
• Structure-based mechanism for recognition of ES cell specific probe KP-1 by MDR1 and ABCG2.

  京都大学iCeMS加速研究課題バックアップ研究費

  自 2012年04月01日, 至 2013年03月31日

  小段篤史
• Structure-based mechanism for recognition of ES/iPS cell specific probe KP-1 by MDR1.

  京都大学iCeMS加速研究課題バックアップ研究費

  自 2014年04月01日, 至 2015年03月31日

  小段篤史
• Atomic-resolution crystal structure-based molecular mechanism of a eukaryotic ABC multidrug transporter.

  京都大学iCeMS加速研究課題バックアップ研究費

  自 2015年04月01日, 至 2016年03月31日

  小段篤史

教育

担当科目

• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  細胞生化学専攻実験

  CG01, 前期, 農学研究科, 3
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  細胞生化学専攻実験

  CG01, 後期, 農学研究科, 3
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  生理化学概論

  X101, 後期集中, 農学研究科, 2
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  細胞生化学専攻演習

  CF01, 前期, 農学研究科, 1.5
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  細胞生化学専攻演習

  CF01, 後期, 農学研究科, 1.5
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  細胞生化学専攻実験

  CG01, 前期, 農学研究科, 3
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  細胞生化学専攻実験

  CG01, 後期, 農学研究科, 3
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  細胞生化学専攻演習２

  CB18, 通年, 農学研究科, 3
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  細胞生化学専攻演習１

  CB17, 通年, 農学研究科, 3
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  細胞生化学専攻実験２

  CC18, 通年, 農学研究科, 6
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  細胞生化学専攻実験１

  CC17, 通年, 農学研究科, 6
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  細胞生化学専攻演習２

  CB18, 通年, 農学研究科, 3
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  細胞生化学専攻演習１

  CB17, 通年, 農学研究科, 3
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  構造生物学

  5638, 前期集中, 農学部, 2
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  細胞生化学専攻実験２

  CC18, 通年, 農学研究科, 6
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  細胞生化学専攻実験１

  CC17, 通年, 農学研究科, 6
• 自 2015年04月, 至 2016年03月

  細胞生化学専攻実験１

  通年, 農学研究科
• 自 2015年04月, 至 2016年03月

  細胞生化学専攻実験

  通年, 農学研究科
• 自 2015年04月, 至 2016年03月

  細胞生化学専攻演習１

  通年, 農学研究科
• 自 2015年04月, 至 2016年03月

  細胞生化学専攻演習

  通年, 農学研究科
• 自 2016年04月, 至 2017年03月

  細胞生化学専攻実験１

  通年, 農学研究科
• 自 2016年04月, 至 2017年03月

  細胞生化学専攻実験２

  通年, 農学研究科
• 自 2016年04月, 至 2017年03月

  細胞生化学専攻実験

  通年, 農学研究科
• 自 2016年04月, 至 2017年03月

  細胞生化学専攻演習１

  通年, 農学研究科
• 自 2016年04月, 至 2017年03月

  細胞生化学専攻演習２

  通年, 農学研究科
• 自 2016年04月, 至 2017年03月

  細胞生化学専攻演習

  通年, 農学研究科
• 自 2017年04月, 至 2018年03月

  細胞生化学専攻実験１

  通年, 農学研究科
• 自 2017年04月, 至 2018年03月

  細胞生化学専攻実験２

  通年, 農学研究科
• 自 2017年04月, 至 2018年03月

  細胞生化学専攻実験

  通年, 農学研究科
• 自 2017年04月, 至 2018年03月

  細胞生化学専攻演習１

  通年, 農学研究科
• 自 2017年04月, 至 2018年03月

  細胞生化学専攻演習２

  通年, 農学研究科
• 自 2017年04月, 至 2018年03月

  細胞生化学専攻演習

  通年, 農学研究科
• 自 2018年04月, 至 2019年03月

  生理化学概論

  後期集中, 全学共通科目
• 自 2018年04月, 至 2019年03月

  細胞生化学専攻実験１

  通年, 農学研究科
• 自 2018年04月, 至 2019年03月

  細胞生化学専攻実験２

  通年, 農学研究科
• 自 2018年04月, 至 2019年03月

  細胞生化学専攻演習１

  通年, 農学研究科
• 自 2018年04月, 至 2019年03月

  細胞生化学専攻演習２

  通年, 農学研究科
• 自 2019年04月, 至 2020年03月

  細胞生化学専攻実験１

  通年, 農学研究科
• 自 2019年04月, 至 2020年03月

  細胞生化学専攻実験２

  通年, 農学研究科
• 自 2019年04月, 至 2020年03月

  細胞生化学専攻演習１

  通年, 農学研究科
• 自 2019年04月, 至 2020年03月

  細胞生化学専攻演習２

  通年, 農学研究科
• 自 2020年04月, 至 2021年03月

  構造生物学

  前期集中, 農学部
• 自 2020年04月, 至 2021年03月

  細胞生化学専攻実験１

  通年, 農学研究科
• 自 2020年04月, 至 2021年03月

  細胞生化学専攻実験２

  通年, 農学研究科
• 自 2020年04月, 至 2021年03月

  細胞生化学専攻演習１

  通年, 農学研究科
• 自 2020年04月, 至 2021年03月

  細胞生化学専攻演習２

  通年, 農学研究科
• 自 2021年04月, 至 2022年03月

  構造生物学

  前期集中, 農学部
• 自 2021年04月, 至 2022年03月

  細胞生化学専攻実験１

  通年, 農学研究科
• 自 2021年04月, 至 2022年03月

  細胞生化学専攻実験２

  通年, 農学研究科
• 自 2021年04月, 至 2022年03月

  細胞生化学専攻演習１

  通年, 農学研究科
• 自 2021年04月, 至 2022年03月

  細胞生化学専攻演習２

  通年, 農学研究科
• 自 2022年04月, 至 2023年03月

  構造生物学

  前期集中, 農学部
• 自 2022年04月, 至 2023年03月

  応用生命科学

  通年, 農学研究科

学術・社会貢献

学術貢献活動

• Nature Communications

  査読

  Springer Nature Ltd., 自 2023年11月21日, 至 2024年08月06日

  
• The Journal of Biochemistry

  査読

  The Japanese Biochemical Society, 自 2020年01月14日, 至 2020年01月29日

  

社会貢献活動

• 京都大学iCeMSサイエンスフェスティバル2019

  出演, パネリスト, 運営参加・支援, 実演

  京都大学, 京都大学iCeMSサイエンスフェスティバル2019, 京都大学iCeMS, 自 2019年11月08日, 至 2019年11月08日