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坂本 清志

サカモト セイジ

工学研究科 合成・生物化学専攻生物化学講座 特定准教授

坂本 清志
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    Last Updated :2024/04/23

    基本情報

    所属学協会

    • 高分子学会
    • 日本ペプチド学会
    • 日本化学会

    経歴

    • 自 2001年, 至 2002年
      京都大学エネルギー理工学研究所 助手, Institute of Advanced Energy
    • 自 2000年, 至 2002年
      Research Associate, Institute of Advanced
    • 自 2002年
      - 東京大学生産技術研究所 助手
    • 自 2002年
      - Research Associate, Institute of Industrial
    • 東北大学 多元物質科学研究所 光機能設計研究分野, 助教
    • Science
    • Energy Kyoto University

    ID,URL

    researchmap URL

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      Last Updated :2024/04/23

      研究

      研究キーワード

      • ペプチド化学
      • タンパク質
      • Protrin and peptide chemistry

      研究分野

      • ナノテク・材料, 生物分子化学

      MISC

      • De Novo Design and Synthesis of Myoglobin-Peptide Conjugate
        Peptide Science 2002, 2003年
      • Biochemical Characterization of Flavodoxin-Like Protein from Hyper-Thermophilic Bacterium Aquifx aeolicus
        Peptide Sciene 2001, 2002年
      • Design and Synthesis of 3a-Helix Peptides Forming a Cavity for a Fluorescent Ligand
        Biopolymers, 2001年
      • Design and Synthesis of 3a-Helix Bundle Peptides Possessing a Hydrophobic
        Peptide Science 1999, 2000年
      • Transfer of Flavin-pendant a-Helical Peptides Self-Assembled on an Electrode
        Electrochemistry, 2000年
      • Design, Synthesis and Peroxidase-like Activity of 3a-Helix Proteins Covalently Bound to Heme
        Bioorg. Med. Chem. Lett., 2000年
      • Construction of a-Helix Peptides with b-Cyclodextrin and Dansyl Units and Their Conformational and Molecular Sensing Properties
        Chem. Eur. J., 2000年
      • Construction of Cyclodextrin-Peptide Conjugates and Their Molecular Sencing Properties
        Peptide Science-Present and Future, 1999年
      • Self-Asembly of Heme-Conjugated Two-a-Helix Peptides
        Peptide Science-Present and Future, 1999年
      • Design, Synthesis and Characterization of Heme-Conjugated Two-a-Helix Peptides
        Peptide Science-Present and Future, 1999年
      • De Novo Design, Synthesis and Characterization of Heme-Conjugated Two-a-Helix Peptides
        Peptide Science 1998, 1999年
      • Nanoparticle Formation of Self-Assembled Two-a-Helix Peptide Induced by Heme-Binding
        Protein and Peptide Letters, 1999年
      • Regulation of a/b-Folding of a Designed Peptide by Haem Binding
        Chem. Commun., 1999年
      • Effects of Amino Acids Substitution of Hydrophobic Residues on Haem-Binding Properties of Designed Two-a-Helix Peptides
        J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2, 1999年
      • Supramolecular Assembly of a-Helix Peptide Conjugated with Porphyrins
        Peptides 1996, 1998年
      • Annealing of Two-a-Helix Structure by Metal Ion Binding Regulated with Trifluoroethanol
        Chem. Lett., 1998年
      • Molecular Assembly of Two-a-Helix Peptide Induced by Haem Binding
        Chem. Commun., 1998年
      • Design and Synthesis of Haem-Binding Peptides. Relationship between Haem-Binding Properties and Catalytic Activities
        J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2, 1998年
      • Construction of Heme-Binding Two-a-Helix Peptides and Regulation of Binding Property by Peptide Conformation
        J. Inorg. Chem., 1997年
      • Design and Synthesis of Haem-Binding Molecular Forceps Composed of Two-a-Helix Peptide
        Peptide Chemistry 1996, 1997年
      • Haem Binding and Catalytic Activity of Two-a-Helix Peptide Annealed by Trifluoroethanol
        Chem. Commun., 1997年

      外部資金:科学研究費補助金

      • 特異的化学修飾を基軸とする内存性GABA(A)受容体のバイオセンサー化
        基盤研究(C)
        小区分37030:ケミカルバイオロジー関連
        京都大学
        坂本 清志
        自 2020年04月01日, 至 2023年03月31日, 完了
        GABA(A)受容体;リガンド指向性化学;タンパク質ラベル化;バイオセンサー;イメージングプローブ;蛍光イメージング;内在性受容体;分子夾雑化学;スクリーニング;脳化学;神経化学;ケミカルラベル;イメージング;タンパク質化学修飾
      • 一分子選択による人工タンパク質の新規デザイン戦略の創製
        基盤研究(B)
        東北大学
        高橋 聡
        自 2014年04月01日, 至 2017年03月31日, 完了
        タンパク質デザイン;ファージ;一分子蛍光観察;ファージディスプレイ;一分子ソーター;GFP;タンパク質;生物・生体工学;生物物理;一分子計測;蛍光タンパク質;一分子選別装置;ファージディスプレイ実験;分割型GFP
      • ヒストン翻訳後修飾パターンの複数同時検出を可能とするタンパク質プローブ分子の創成
        挑戦的萌芽研究
        東北大学
        坂本 清志
        自 2013年04月01日, 至 2015年03月31日, 完了
        エピジェネティクス;ヒストンテール;翻訳後修飾;分割型タンパク質;GFP;ルシフェラーゼ;バイオプローブ;ヒストン;分割型緑色蛍光タンパク質
      • テーラーメイド生体高分子をキラル反応場とする環境調和型超分子不斉光反応系の創製
        基盤研究(A)
        東北大学
        和田 健彦
        自 2012年04月01日, 至 2015年03月31日, 完了
        生体高分子;血清アルブミン;キラル反応場;不斉合成;光反応;超分子;超分子不斉光反応;PEG;合成坑体;不斉光反応;超分子不斉光化学;人工坑体;2-アントラセンカルボン酸;ファージディスプレイ法;キラルソフト界面
      • 生体内プロテアーゼ活性の複数同時観測を可能とする新規タンパク質プローブ分子の創成
        挑戦的萌芽研究
        東北大学
        坂本 清志
        自 2011年04月01日, 至 2013年03月31日, 完了
        プロテアーゼ;蛍光タンパク質;発光タンパク質;バイオプローブ;バイオセンサー;分割型タンパク質;分割型蛍光タンパク質;分割型インテイン;カスパーゼ;アポトーシス
      • エピジェネティクス制御を指向したヒストンテールペプチドライブラリの構築
        若手研究(B)
        東北大学;東京大学
        坂本 清志
        自 2007年04月01日, 至 2009年03月31日, 完了
        生体機能関連物質;ポリペプチド;ライブラリ;エピジェネティクス;ヒストンテール;ライブリ;分割型GFP
      • タンパク質活性中心近傍における特異的基質認識部位・機能制御部位の人工構築
        若手研究(B)
        東京大学
        坂本 清志
        自 2005年04月01日, 至 2007年03月31日, 完了
        タンパク質;ポリペプチド;ライブラリ;人工酵素;補因子;ヘムタンパク質;コンビナトリアル化学;電子移動
      • 特異的糖鎖構造認識能を有する機能性ペプチドアレイの構築
        若手研究(B)
        東京大学
        坂本 清志
        自 2003年04月01日, 至 2005年03月31日, 完了
        α-ヘリックス;β-ターン;ポリペプチド;ライブラリ;機能性アレイ;ボロン酸;糖認識;デノボ設計
      • 内在性GABA(A)受容体のケミカルラベルを基軸とする薬剤アッセイ系の構築
        基盤研究(C)
        小区分37030:ケミカルバイオロジー関連
        京都大学
        坂本 清志
        自 2023年04月01日, 至 2026年03月31日, 交付
        GABA(A)受容体;ケミカルラベリング;リガンド指向性化学;バイオセンサー;神経伝達物質受容体

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