基本情報

学位

• 修士（地球環境科学）(北海道大学)
• 博士（地球環境科学）(北海道大学)

ID,URL

• J-Global ID

  201401090445083892

researchmap URL

• https://researchmap.jp/7000009233

研究

研究テーマ・研究概要

• 研究テーマ

  霊長類におけるX染色体の遺伝子量補正

• 研究概要

  ヒトを含む哺乳類の雌（XX）では、雄（XY）との間のX染色体遺伝子産物量を補正する為に、発生初期に２本のX染色体のうちの１本上の遺伝子発現が協調的に不活性化される。この哺乳類特有の現象はX染色体の不活性化 (X-chromosome inactivation; XCI) と呼ばれる。 我々はカニクイザルの初期胚や胚性幹細胞を用いて、霊長類XCIのダイナミクスやメカニズムについて研究を行っている。

研究分野

• ライフサイエンス, 分子生物学

論文

• Generation of functional oocytes from male mice in vitro.

  Kenta Murakami; Nobuhiko Hamazaki; Norio Hamada; Go Nagamatsu; Ikuhiro Okamoto; Hiroshi Ohta; Yoshiaki Nosaka; Yukiko Ishikura; Tomoya S Kitajima; Yuichiro Semba; Yuya Kunisaki; Fumio Arai; Koichi Akashi; Mitinori Saitou; Kiyoko Kato; Katsuhiko Hayashi

  Nature, 2023年03月15日, 査読有り

  
• ヒト多能性幹細胞を用いた始原生殖細胞様細胞の試験管内誘導

  横林 しほり; 佐々木 恒太郎; 中村 友紀; 岡本 郁弘; 薮田 幸宏; 栗本 一基; 大田 浩; 守時 良演; 佐々木 裕子; 中川 誠人; 斎藤 通紀

  日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集, 2015年12月

  
• Induction of fetal meiotic oocytes from embryonic stem cells in cynomolgus monkeys

  Sayuri Gyobu‐Motani; Yukihiro Yabuta; Ken Mizuta; Yoshitaka Katou; Ikuhiro Okamoto; Masanori Kawasaki; Ayaka Kitamura; Tomoyuki Tsukiyama; Chizuru Iwatani; Hideaki Tsuchiya; Taro Tsujimura; Takuya Yamamoto; Tomonori Nakamura; Mitinori Saitou

  The EMBO Journal, 2023年03月16日, 査読有り

  
• Nucleome programming is required for the foundation of totipotency in mammalian germline development

  Masahiro Nagano; Bo Hu; Shihori Yokobayashi; Akitoshi Yamamura; Fumiya Umemura; Mariel Coradin; Hiroshi Ohta; Yukihiro Yabuta; Yukiko Ishikura; Ikuhiro Okamoto; Hiroki Ikeda; Naofumi Kawahira; Yoshiaki Nosaka; Sakura Shimizu; Yoji Kojima; Ken Mizuta; Tomoko Kasahara; Yusuke Imoto; Killian Meehan; Roman Stocsits; Gordana Wutz; Yasuaki Hiraoka; Yasuhiro Murakawa; Takuya Yamamoto; Kikue Tachibana; Jan‐Michel Peters; Leonid A Mirny; Benjamin A Garcia; Jacek Majewski; Mitinori Saitou

  The EMBO Journal, 2022年07月04日, 査読有り

  
• The embryonic ontogeny of the gonadal somatic cells in mice and monkeys.

  Kotaro Sasaki; Akiko Oguchi; Keren Cheng; Yasuhiro Murakawa; Ikuhiro Okamoto; Hiroshi Ohta; Yukihiro Yabuta; Chizuru Iwatani; Hideaki Tsuchiya; Takuya Yamamoto; Yasunari Seita; Mitinori Saitou

  Cell reports, 2021年05月04日, 査読有り

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• GATA transcription factors, SOX17 and TFAP2C, drive the human germ-cell specification program.

  Yoji Kojima; Chika Yamashiro; Yusuke Murase; Yukihiro Yabuta; Ikuhiro Okamoto; Chizuru Iwatani; Hideaki Tsuchiya; Masataka Nakaya; Tomoyuki Tsukiyama; Tomonori Nakamura; Takuya Yamamoto; Mitinori Saitou

  Life science alliance, 2021年05月, 査読有り

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• Capturing Human Trophoblast Development with Naive Pluripotent Stem Cells In Vitro

  Shingo Io; Mio Kabata; Yoshiki Iemura; Katsunori Semi; Nobuhiro Morone; Ikuhiro Okamoto; Tomonori Nakamura; Yoji Kojima; Chizuru Iwatani; Hideaki Tsuchiya; Belinda Kaswandy; Eiji Kondoh; Mitinori Saitou; Takuya Yamamoto; Masaki Mandai; Yasuhiro Takashima

  2020年12月18日, 査読有り

  
• Induction of the Germ-Cell Fate from Pluripotent Stem Cells in Cynomolgus Monkeys.

  Sakai Y; Nakamura T; Okamoto I; Gyobu-Motani S; Ohta H; Yabuta Y; Tsukiyama T; Iwatani C; Tsuchiya H; Ema M; Morizane A; Takahashi J; Yamamoto T; Saitou M

  Biology of reproduction, 2019年11月, 査読有り

  
• A symmetric toggle switch explains the onset of random X inactivation in different mammals.

  Mutzel V; Okamoto I; Dunkel I; Saitou M; Giorgetti L; Heard E; Schulz EG

  Nature structural & molecular biology, 2019年05月, 査読有り

  
• Generation of human oogonia from induced pluripotent stem cells in vitro.

  Yamashiro C; Sasaki K; Yabuta Y; Kojima Y; Nakamura T; Okamoto I; Yokobayashi S; Murase Y; Ishikura Y; Shirane K; Sasaki H; Yamamoto T; Saitou M

  Science (New York, N.Y.), 2018年10月, 査読有り

  
• Combined Immunofluorescence, RNA FISH, and DNA FISH in Preimplantation Mouse Embryos.

  Okamoto I

  Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2018年, 査読有り, 筆頭著者, 最終著者, 責任著者

  
• Contribution of epigenetic landscapes and transcription factors to X-chromosome reactivation in the inner cell mass

  Maud Borensztein; Ikuhiro Okamoto; Laurene Syx; Guillaume Guilbaud; Christel Picard; Katia Ancelin; Rafael Galupa; Patricia Diabangouaya; Nicolas Servant; Emmanuel Barillot; Azim Surani; Mitinori Saitou; Chong-Jian Chen; Konstantinos Anastassiadis; Edith Heard

  NATURE COMMUNICATIONS, 2017年11月, 査読有り

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• Single-cell transcriptome of early embryos and cultured embryonic stem cells of cynomolgus monkeys

  Tomonori Nakamura; Yukihiro Yabuta; Ikuhiro Okamoto; Kotaro Sasaki; Chizuru Iwatani; Hideaki Tsuchiya; Mitinori Saitou

  Scientific Data, 2017年06月, 査読有り

  
• In vitro expansion of mouse primordial germ cell-like cells recapitulates an epigenetic blank slate.

  Ohta H; Kurimoto K; Okamoto I; Nakamura T; Yabuta Y; Miyauchi H; Yamamoto T; Okuno Y; Hagiwara M; Shirane K; Sasaki H; Saitou M

  The EMBO journal, 2017年05月, 査読有り

  
• RNA FISH to study zygotic genome activation in early mouse embryos

  Noémie Ranisavljevic; Ikuhiro Okamoto; Edith Heard; Katia Ancelin

  Methods in Molecular Biology, 2017年, 査読有り

  
• In Vitro Derivation and Propagation of Spermatogonial Stem Cell Activity from Mouse Pluripotent Stem Cells.

  Ishikura Y; Yabuta Y; Ohta H; Hayashi K; Nakamura T; Okamoto I; Yamamoto T; Kurimoto K; Shirane K; Sasaki H; Saitou M

  Cell reports, 2016年12月, 査読有り

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• The Germ Cell Fate of Cynomolgus Monkeys Is Specified in the Nascent Amnion.

  Sasaki K; Nakamura T; Okamoto I; Yabuta Y; Iwatani C; Tsuchiya H; Seita Y; Nakamura S; Shiraki N; Takakuwa T; Yamamoto T; Saitou M

  Developmental cell, 2016年10月, 査読有り

  
• A developmental coordinate of pluripotency among mice, monkeys and humans.

  Nakamura T; Okamoto I; Sasaki K; Yabuta Y; Iwatani C; Tsuchiya H; Seita Y; Nakamura S; Yamamoto T; Saitou M

  Nature, 2016年08月, 査読有り

  
• Robust In Vitro Induction of Human Germ Cell Fate from Pluripotent Stem Cells.

  Sasaki K; Yokobayashi S; Nakamura T; Okamoto I; Yabuta Y; Kurimoto K; Ohta H; Moritoki Y; Iwatani C; Tsuchiya H; Nakamura S; Sekiguchi K; Sakuma T; Yamamoto T; Mori T; Woltjen K; Nakagawa M; Yamamoto T; Takahashi K; Yamanaka S

  Cell stem cell, 2015年08月, 査読有り

  
• SC3-seq: a method for highly parallel and quantitative measurement of single-cell gene expression.

  Nakamura T; Yabuta Y; Okamoto I; Aramaki S; Yokobayashi S; Kurimoto K; Sekiguchi K; Nakagawa M; Yamamoto T; Saitou M

  Nucleic acids research, 2015年05月, 査読有り

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• The Gpr1/Zdbf2 locus provides new paradigms for transient and dynamic genomic imprinting in mammals

  Rachel Duffie; Sophie Ajjan; Maxim V. Greenberg; Natasha Zamudio; Martin Escamilla del Arenal; Julian Iranzo; Ikuhiro Okamoto; Sandrine Barbaux; Patricia Fauque; Deborah Bourc'his

  GENES & DEVELOPMENT, 2014年03月, 査読有り

  
• The two active X chromosomes in female ESCs block exit from the pluripotent state by modulating the ESC signaling network.

  Schulz EG; Meisig J; Nakamura T; Okamoto I; Sieber A; Picard C; Borensztein M; Saitou M; Blüthgen N; Heard E

  Cell Stem Cell, 2014年02月, 査読有り

  
• RNAi-Dependent and Independent Control of LINE1 Accumulation and Mobility in Mouse Embryonic Stem Cells (Retracted article. See vol. 9, e1005519, 2015)

  Constance Ciaudo; Florence Jay; Ikuhiro Okamoto; Chong-Jian Chen; Alexis Sarazin; Nicolas Servant; Emmanuel Barillot; Edith Heard; Olivier Voinnet

  PLOS GENETICS, 2013年11月, 査読有り

  
• Initiation of X chromosome inactivation during early embryogenesis in mice and in humans

  Catherine Patrat; Ikuhiro Okamoto; Edith Heard

  BULLETIN DE L ACADEMIE NATIONALE DE MEDECINE, 2013年03月, 査読有り

  
• Spatial partitioning of the regulatory landscape of the X-inactivation centre

  Elphege P. Nora; Bryan R. Lajoie; Edda G. Schulz; Luca Giorgetti; Ikuhiro Okamoto; Nicolas Servant; Tristan Piolot; Nynke L. van Berkum; Johannes Meisig; John Sedat; Joost Gribnau; Emmanuel Barillot; Nils Bluethgen; Job Dekker; Edith Heard

  NATURE, 2012年05月, 査読有り

  
• Eutherian mammals use diverse strategies to initiate X-chromosome inactivation during development (vol 472, pg 370, 2011)

  Ikuhiro Okamoto; Catherine Patrat; Dominique Thepot; Nathalie Peynot; Patricia Fauque; Nathalie Daniel; Patricia Diabangouaya; Jean-Philippe Wolf; Jean-Paul Renard; Veronique Duranthon; Edith Heard

  NATURE, 2011年06月, 査読有り

  
• Eutherian mammals use diverse strategies to initiate X-chromosome inactivation during development

  Ikuhiro Okamoto; Catherine Patrat; Dominique Thepot; Nathalie Peynot; Patricia Fauque; Nathalie Daniel; Patricia Diabangouaya; Jean-Philippe Wolf; Jean-Paul Renard; Veronique Duranthon; Edith Heard

  NATURE, 2011年04月, 査読有り

  
• A Strand-Specific Burst in Transcription of Pericentric Satellites Is Required for Chromocenter Formation and Early Mouse Development

  Aline V. Probst; Ikuhiro Okamoto; Miguel Casanova; Fatima El Marjou; Patricia Le Baccon; Genevieve Almouzni

  DEVELOPMENTAL CELL, 2010年10月, 査読有り

  
• Lessons from comparative analysis of X-chromosome inactivation in mammals

  Ikuhiro Okamoto; Edith Heard

  CHROMOSOME RESEARCH, 2009年07月, 査読有り

  
• Monomethylation of Histone H4-Lysine 20 Is Involved in Chromosome Structure and Stability and Is Essential for Mouse Development

  Hisanobu Oda; Ikuhiro Okamoto; Niall Murphy; Jianhua Chu; Sandy M. Price; Michael M. Shen; Maria Elena Torres-Padilla; Edith Heard; Danny Reinberg

  MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY, 2009年04月, 査読有り

  
• The dynamics of imprinted X inactivation during preimplantation development in mice

  I. Okamoto; E. Heard

  CYTOGENETIC AND GENOME RESEARCH, 2006年, 査読有り

  
• Evidence for de novo imprinted X-chromosome inactivation independent of meiotic inactivation in mice

  Okamoto, I; D Arnaud; P Le Baccon; AP Otte; CM Disteche; P Avner; E Heard

  NATURE, 2005年11月, 査読有り

  
• Initiation of epigenetic reprogramming of the X chromosome in somatic nuclei transplanted to a mouse oocyte

  SQ Bao; N Miyoshi; Okamoto, I; T Jenuwein; E Heard; MA Surani

  EMBO REPORTS, 2005年08月, 査読有り

  
• Imprinted X-inactivation in extra-embryonic endoderm cell lines from mouse blastocysts

  T Kunath; D Arnaud; GD Uy; L Okamoto; C Chureau; Y Yamanaka; E Heard; RL Gardner; P Avner; J Rossant

  DEVELOPMENT, 2005年04月, 査読有り

  
• Mammalian X-chromosome inactivation: An epigenetics paradigm

  E Heard; J Chaumeil; O Masui; Okamoto, I

  COLD SPRING HARBOR SYMPOSIA ON QUANTITATIVE BIOLOGY, 2004年, 査読有り

  
• X-chromosome inactivation in mouse embryonic stem cells: Analysis of histone modifications and transcriptional activity using immunofluorescence and FISH

  J Chaumeil; Okamoto, I; E Heard

  CHROMATIN AND CHROMATIN REMODELING ENZYMES, PT B, 2004年, 査読有り

  
• Epigenetic dynamics of imprinted X inactivation during early mouse development

  Okamoto, I; AP Otte; CD Allis; D Reinberg; E Heard

  SCIENCE, 2004年01月, 査読有り

  
• Developmental abnormalities in mouse embryos tetrasomic for chromosome 11: Apparent similarity to embryos functionally disomic for the X chromosome

  H Mizuno; Okamoto, I; N Takagi

  GENES & GENETIC SYSTEMS, 2002年08月, 査読有り

  
• Integrated kinetics of X chromosome inactivation in differentiating embryonic stem cells

  J Chaumeil; Okamoto, I; M Guggiari; E Heard

  CYTOGENETIC AND GENOME RESEARCH, 2002年, 査読有り

  
• X-chromosome inactivation in XX androgenetic mouse embryos surviving implantation

  Okamoto, I; SS Tan; N Takagi

  DEVELOPMENT, 2000年10月, 査読有り

  
• The X chromosome dosage compensation program during the development of cynomolgus monkeys.

  Ikuhiro Okamoto; Tomonori Nakamura; Kotaro Sasaki; Yukihiro Yabuta; Chizuru Iwatani; Hideaki Tsuchiya; Shin-Ichiro Nakamura; Masatsugu Ema; Takuya Yamamoto; Mitinori Saitou

  Science (New York, N.Y.), 2021年11月19日, 査読有り, 筆頭著者, 責任著者

  

MISC

• Generation of human oogonia from induced pluripotent stem cells in vitro

  Chika Yamashiro; Kotaro Sasaki; Yukihiro Yabuta; Yoji Kojima; Tomonori Nakamura; Ikuhiro Okamoto; Shihori Yokobayashi; Yusuke Murase; Yukiko Ishikura; Kenjiro Shirane; Hiroyuki Sasaki; Takuya Yamamoto; Mitinori Saitou

  Obstetrical and Gynecological Survey, 2019年03月01日

  
• Establishment of macaque trophoblast stem cell lines derived from cynomolgus monkey blastocysts.

  Shoma Matsumoto; Christopher J Porter; Naomi Ogasawara; Chizuru Iwatani; Hideaki Tsuchiya; Yasunari Seita; Yu-Wei Chang; Ikuhiro Okamoto; Mitinori Saitou; Masatsugu Ema; Theodore J Perkins; William L Stanford; Satoshi Tanaka

  Scientific reports, 2020年04月22日

  このMISCにアクセスする：

  

講演・口頭発表等

• The X-chromosome dosage compensation program during the development of cynomolgus monkeys

  Ikuhiro Okamoto

  X-chromosome inactivation: New insights on its 60th anniversary

  
• カニクイザルの発生過程におけるX染色体遺伝子量補正プログラム

  岡本郁弘

  日本人類遺伝学会第６７大会, 2022年12月16日, 招待有り

  
• カニクイザルの発生過程におけるX染色体遺伝子量補正プログラム

  岡本郁弘

  第45回日本分子生物学会年会, 2022年12月01日, 招待有り

  

書籍等出版物

• X染色体不活化と疾患ー新たな展開

  共著, 霊長類におけるX染色体遺伝子量補正

  医歯薬出版株式会社, 2022年11月

  

外部資金：科学研究費補助金

• 臓器形成期までの生体内情報取得と生理的Ex vivo culture法の確立

  学術変革領域研究(B)

  学術変革領域研究区分(Ⅲ)

  京都大学

  中村 友紀

  自 2020年10月02日, 至 2023年03月31日, 完了

  霊長類;発生学;scRNA-seq;着床後胚発生;次元の呪い;カニクイザル

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PLANNED-20H05761/
• 霊長類におけるX染色体不活性化機構の解明

  基盤研究(C)

  小区分42040:実験動物学関連

  京都大学

  岡本 郁弘

  自 2018年04月01日, 至 2021年03月31日, 完了

  カニクイザル;X染色体の不活性化;ゲノム編集;ノックアウト細胞;X染色体不活性化;XIST RNA;X染色体の再活性化;初期胚;始原生殖細胞

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18K06030/
• 始原生殖細胞における不活性X染色体再活性化メカニズムの解明

  基盤研究(B)

  京都大学

  岡本 郁弘

  自 2013年04月01日, 至 2017年03月31日, 完了

  マウス;X染色体;再活性化;始原生殖細胞;始源生殖細胞;不活性X染色体の再活性化;不活性X染色体;リプログラミング;ゲノムリプログラミング

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25291076/
• 霊長類のX染色体不活性化維持機構の解明

  基盤研究(B)

  小区分42040:実験動物学関連

  京都大学

  岡本 郁弘

  自 2022年04月01日, 至 2027年03月31日, 交付

  X染色体の不活性化;霊長類;カニクイザル;XIST;SmcHD1

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02539/
• 霊長類のX染色体不活性化維持機構の解明

  基盤研究(B)

  小区分42040:実験動物学関連

  京都大学

  岡本 郁弘

  自 2022年04月01日, 至 2027年03月31日, 交付

  X inactivation;XIST;カニクイザル;X染色体の不活性化;SmcHD1;霊長類

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23K23804/

教育

非常勤講師

• 自 2013年06月21日, 至 2013年06月21日

  分子生物学特論

  前期, 北海道大学, 大学院生命科学院
• 自 2018年10月01日, 至 2018年10月01日

  大学院特別セミナー　医学特論

  後期, 富山大学, 医学薬学教育部