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遊佐 宏介

ユサ コウスケ

医生物学研究所 生命システム研究部門 教授

遊佐 宏介
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    Last Updated :2024/02/21

    基本情報

    協力講座

    • 医学研究科, 医学専攻 幹細胞遺伝学, 教授
    • 医学研究科, 医科学専攻 幹細胞遺伝学, 教授

    所属学協会

    • 日本ゲノム編集学会
    • 日本がん分子標的治療学会
    • 日本癌学会

    学位

    • 修士(農学)(東京大学)
    • 博士(医学)(大阪大学)

    出身大学院・研究科等

    • 東京大学, 大学院農学生命科学研究科修士課程生産環境生物学専攻, 修了
    • 大阪大学, 大学院医学系研究科博士課程社会医学専攻, 修了

    出身学校・専攻等

    • 大阪大学, 工学部応用自然科学科, 卒業

    経歴

    • 自 2022年04月, 至 現在
      京都大学, 医生物学研究所, 教授
    • 自 2018年10月, 至 2022年03月
      京都大学, ウイルス・再生医科学研究所, 教授
    • 自 2012年10月, 至 2018年09月
      英国ウェルカム サンガー研究所, グループリーダー
    • 自 2007年10月, 至 2012年09月
      英国ウェルカム サンガー研究所, 博士研究員
    • 自 2008年04月, 至 2010年03月
      独立行政法人日本学術振興会, 海外特別研究員
    • 自 2005年04月, 至 2008年03月
      独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員

    ID,URL

    researchmap URL

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      Last Updated :2024/02/21

      研究

      研究テーマ・研究概要

      • 研究テーマ

        これまでは、ほ乳類細胞において順遺伝学手法を適用し網羅的遺伝子スクリーニングを実施するための遺伝学的ツールの開発を行い、2014年にゲノム編集技術CRISPR-Cas9システムを応用したCRISPRスクリーニング法を確立した。現在はこの手法を用いて、ヒトES/iPS細胞の多能性維持や細胞分化の分子機構の解明、また、がん細胞の増殖必須遺伝子の探索と分子機能解析、またがん治療薬に対する耐性・感受性因子の探索と分子機能解析を主要な研究テーマとしている。

      研究分野

      • ライフサイエンス, 発生生物学
      • ライフサイエンス, 腫瘍生物学
      • ライフサイエンス, ゲノム生物学
      • ライフサイエンス, 分子生物学

      論文

      • Canonical BAF complex regulates the oncogenic program in human T-cell acute lymphoblastic leukemia.
        Kazunari Aoki; Mizuki Hyuga; Yusuke Tarumoto; Gohei Nishibuchi; Atsushi Ueda; Yotaro Ochi; Seiichi Sugino; Takashi Mikami; Hirokazu Kobushi; Itaru Kato; Koshi Akahane; Takeshi Inukai; Akifumi Takaori-Kondo; Junko Takita; Seishi Ogawa; Kosuke Yusa
        Blood, 2023年11月03日
      • Inference of gene regulatory networks using time-series single-cell RNA-seq data with CRISPR perturbations
        Masato Ishikawa; Seiichi Sugino; Yoshie Masuda; Yusuke Tarumoto; Yusuke Seto; Nobuko Taniyama; Fumi Wagai; Yuhei Yamauchi; Yasuhiro Kojima; Hisanori Kiryu; Kosuke Yusa; Mototsugu Eiraku; Atsushi Mochizuki
        2023年08月23日
      • B1 SINE-binding ZFP266 impedes reprogramming through suppression of chromatin opening by pioneering factors
        Daniel F Kaemena; Masahito Yoshihara; James Ashmore; Meryam Beniazza; Suling Zhao; Marten Bertenstam; Victor Olariu; Shintaro Katayama; Keisuke Okita; Simon Tomlinson; Kosuke Yusa; Keisuke Kaji
        bioRxiv, 2022年01月05日
      • Pharmacologic characterization of TBP1901, a prodrug form of aglycone curcumin, and CRISPR-Cas9 screen for therapeutic targets of aglycone curcumin.
        Tomoyuki Abe; Yoshihito Horisawa; Osamu Kikuchi; Hitomi Ozawa-Umeta; Atsuhiro Kishimoto; Yasuhiro Katsuura; Atsushi Imaizumi; Tadashi Hashimoto; Kotaro Shirakawa; Akifumi Takaori-Kondo; Kosuke Yusa; Tadashi Asakura; Hideaki Kakeya; Masashi Kanai
        European journal of pharmacology, 2022年11月15日
      • AKT-mTORC1 reactivation is the dominant resistance driver for PI3Kβ/AKT inhibitors in PTEN-null breast cancer and can be overcome by combining with Mcl-1 inhibitors.
        Shanade Dunn; Cath Eberlein; Jason Yu; Albert Gris-Oliver; Swee Hoe Ong; Urs Yelland; Natalie Cureton; Anna Staniszewska; Robert McEwen; Millie Fox; James Pilling; Philip Hopcroft; Elizabeth A Coker; Patricia Jaaks; Mathew J Garnett; Beverley Isherwood; Violeta Serra; Barry R Davies; Simon T Barry; James T Lynch; Kosuke Yusa
        Oncogene, 2022年11月
      • Peroxisomal membrane protein PMP34 is involved in the human papillomavirus infection pathway
        Rie Ito; Koji Kitamura; Hidenori Inohara; Kosuke Yusa; Yasufumi Kaneda; Keisuke Nimura
        Frontiers in Virology, 2022年05月06日, 査読有り
      • Genome-scale CRISPR‒Cas9 screen identifies novel host factors as potential therapeutic targets for SARS-CoV-2 infection
        Madoka Sakai; Yoshie Masuda; Yusuke Tarumoto; Naoyuki Aihara; Yugo Tsunoda; Michiko Iwata; Yumiko Kamiya; Ryo Komorizono; Takeshi Noda; Kosuke Yusa; Keizo Tomonaga; Akiko Makino
        2023年03月07日
      • B1 SINE-binding ZFP266 impedes mouse iPSC generation through suppression of chromatin opening mediated by reprogramming factors.
        Daniel F Kaemena; Masahito Yoshihara; Meryam Beniazza; James Ashmore; Suling Zhao; Mårten Bertenstam; Victor Olariu; Shintaro Katayama; Keisuke Okita; Simon R Tomlinson; Kosuke Yusa; Keisuke Kaji
        Nature communications, 2023年01月30日
      • Genome-wide screening identifies Polycomb repressive complex 1.3 as an essential regulator of human naïve pluripotent cell reprogramming.
        Amanda J Collier; Adam Bendall; Charlene Fabian; Andrew A Malcolm; Katarzyna Tilgner; Claudia I Semprich; Katarzyna Wojdyla; Paola Serena Nisi; Kamal Kishore; Valar Nila Roamio Franklin; Bahar Mirshekar-Syahkal; Clive D'Santos; Kathrin Plath; Kosuke Yusa; Peter J Rugg-Gunn
        Science advances, 2022年03月25日
      • Selective targeting of multiple myeloma cells with a monoclonal antibody recognizing the ubiquitous protein CD98 heavy chain.
        Kana Hasegawa; Shunya Ikeda; Moto Yaga; Kouki Watanabe; Rika Urakawa; Akie Iehara; Mai Iwai; Seishin Hashiguchi; Soyoko Morimoto; Fumihiro Fujiki; Hiroko Nakajima; Jun Nakata; Sumiyuki Nishida; Akihiro Tsuboi; Yoshihiro Oka; Satoshi Yoshihara; Masahiro Manabe; Hiroyoshi Ichihara; Atsuko Mugitani; Yasutaka Aoyama; Takafumi Nakao; Asao Hirose; Masayuki Hino; Shiho Ueda; Katsuto Takenaka; Takashi Masuko; Koichi Akashi; Takahiro Maruno; Susumu Uchiyama; Shinji Takamatsu; Naoki Wada; Eiichi Morii; Shushi Nagamori; Daisuke Motooka; Yoshikatsu Kanai; Yusuke Oji; Tomoyoshi Nakagawa; Noriyuki Kijima; Haruhiko Kishima; Atsuyo Ikeda; Takayuki Ogino; Yasushi Shintani; Tateki Kubo; Emiko Mihara; Kosuke Yusa; Haruo Sugiyama; Junichi Takagi; Eiji Miyoshi; Atsushi Kumanogoh; Naoki Hosen
        Science translational medicine, 2022年02月16日
      • The CADM1 tumor suppressor gene is a major candidate gene in MDS with deletion of the long arm of chromosome 11.
        Marina Lafage-Pochitaloff; Bastien Gerby; Véronique Baccini; Laetitia Largeaud; Vincent Fregona; Naïs Prade; Pierre-Yves Juvin; Laura Jamrog; Pierre Bories; Sylvie Hébrard; Stéphanie Lagarde; Véronique Mansat-De Mas; Oliver M Dovey; Kosuke Yusa; George S Vassiliou; Joop H Jansen; Tobias Tekath; David Rombaut; Geneviève Ameye; Carole Barin; Audrey Bidet; John Boudjarane; Marie-Agnès Collonge-Rame; Carine Gervais; Antoine Ittel; Christine Lefebvre; Isabelle Luquet; Lucienne Michaux; Nathalie Nadal; Hélène A Poirel; Isabelle Radford-Weiss; Bénédicte Ribourtout; Steven Richebourg; Stéphanie Struski; Christine Terré; Isabelle Tigaud; Dominique Penther; Virginie Eclache; Michaela Fontenay; Cyril Broccardo; Eric Delabesse
        Blood advances, 2022年01月25日
      • Measurement of the nuclear concentration of α-ketoglutarate during adipocyte differentiation by using a fluorescence resonance energy transfer-based biosensor with nuclear localization signals.
        Tomohiro Suzuki; Mayuko Hayashi; Tetsuro Komatsu; Akiko Tanioka; Masahiro Nagasawa; Kyoko Tanimura-Inagaki; Mohammad Sharifur Rahman; Shinnosuke Masuda; Kosuke Yusa; Juro Sakai; Hiroshi Shibata; Takeshi Inagaki
        Endocrine journal, 2021年12月28日
      • KAT7 is a genetic vulnerability of acute myeloid leukemias driven by MLL rearrangements.
        Yan Zi Au; Muxin Gu; Etienne De Braekeleer; Malgorzata Gozdecka; Demetrios Aspris; Yusuke Tarumoto; Jonathan Cooper; Jason Yu; Swee Hoe Ong; Xi Chen; Konstantinos Tzelepis; Brian J P Huntly; George Vassiliou; Kosuke Yusa
        Leukemia, 2021年04月, 査読有り
      • Minimal genome-wide human CRISPR-Cas9 library.
        Emanuel Gonçalves; Mark Thomas; Fiona M Behan; Gabriele Picco; Clare Pacini; Felicity Allen; Alessandro Vinceti; Mamta Sharma; David A Jackson; Stacey Price; Charlotte M Beaver; Oliver Dovey; David Parry-Smith; Francesco Iorio; Leopold Parts; Kosuke Yusa; Mathew J Garnett
        Genome biology, 2021年01月21日
      • Low rates of mutation in clinical grade human pluripotent stem cells under different culture conditions.
        Oliver Thompson; Ferdinand von Meyenn; Zoe Hewitt; John Alexander; Andrew Wood; Richard Weightman; Sian Gregory; Felix Krueger; Simon Andrews; Ivana Barbaric; Paul J Gokhale; Harry D Moore; Wolf Reik; Marta Milo; Serena Nik-Zainal; Kosuke Yusa; Peter W Andrews
        Nature communications, 2020年03月23日, 査読有り
      • ARID1A influences HDAC1/BRD4 activity, intrinsic proliferative capacity and breast cancer treatment response.
        Sankari Nagarajan; Shalini V Rao; Joseph Sutton; Danya Cheeseman; Shanade Dunn; Evangelia K Papachristou; Jose-Enrique Gonzalez Prada; Dominique-Laurent Couturier; Sanjeev Kumar; Kamal Kishore; Chandra Sekhar Reddy Chilamakuri; Silvia-Elena Glont; Emily Archer Goode; Cara Brodie; Naomi Guppy; Rachael Natrajan; Alejandra Bruna; Carlos Caldas; Alasdair Russell; Rasmus Siersbæk; Kosuke Yusa; Igor Chernukhin; Jason S Carroll
        Nature genetics, 2020年02月, 査読有り
      • Agreement between two large pan-cancer CRISPR-Cas9 gene dependency data sets.
        Joshua M Dempster; Clare Pacini; Sasha Pantel; Fiona M Behan; Thomas Green; John Krill-Burger; Charlotte M Beaver; Scott T Younger; Victor Zhivich; Hanna Najgebauer; Felicity Allen; Emanuel Gonçalves; Rebecca Shepherd; John G Doench; Kosuke Yusa; Francisca Vazquez; Leopold Parts; Jesse S Boehm; Todd R Golub; William C Hahn; David E Root; Mathew J Garnett; Aviad Tsherniak; Francesco Iorio
        Nature communications, 2019年12月20日, 査読有り
      • Genome-wide CRISPR-Cas9 screening in mammalian cells.
        Yu JSL; Yusa K
        Methods (San Diego, Calif.), 2019年07月15日, 査読有り
      • CRISPR-Knockout Screen Identifies Dmap1 as a Regulator of Chemically Induced Reprogramming and Differentiation of Cardiac Progenitors.
        Yu JSL; Palano G; Lim C; Moggio A; Drowley L; Plowright AT; Bohlooly-Y M; Rosen BS; Hansson EM; Wang QD; Yusa K
        Stem cells (Dayton, Ohio), 2019年07月, 査読有り
      • Functional linkage of gene fusions to cancer cell fitness assessed by pharmacological and CRISPR-Cas9 screening.
        Picco G; Chen ED; Alonso LG; Behan FM; Gonçalves E; Bignell G; Matchan A; Fu B; Banerjee R; Anderson E; Butler A; Benes CH; McDermott U; Dow D; Iorio F; Stronach E; Yang F; Yusa K; Saez-Rodriguez J; Garnett MJ
        Nature communications, 2019年05月16日, 査読有り
      • Prioritization of cancer therapeutic targets using CRISPR-Cas9 screens.
        Behan FM; Iorio F; Picco G; Gonçalves E; Beaver CM; Migliardi G; Santos R; Rao Y; Sassi F; Pinnelli M; Ansari R; Harper S; Jackson DA; McRae R; Pooley R; Wilkinson P; van der Meer D; Dow D; Buser-Doepner C; Bertotti A; Trusolino L; Stronach EA; Saez-Rodriguez J; Yusa K; Garnett MJ
        Nature, 2019年04月, 査読有り
      • JACKS: joint analysis of CRISPR/Cas9 knockout screens.
        Allen F; Behan F; Khodak A; Iorio F; Yusa K; Garnett M; Parts L
        Genome research, 2019年03月, 査読有り
      • Genome-wide CRISPR Screens in T Helper Cells Reveal Pervasive Crosstalk between Activation and Differentiation.
        Henriksson J; Chen X; Gomes T; Ullah U; Meyer KB; Miragaia R; Duddy G; Pramanik J; Yusa K; Lahesmaa R; Teichmann SA
        Cell, 2019年02月07日, 査読有り
      • Structural rearrangements generate cell-specific, gene-independent CRISPR-Cas9 loss of fitness effects.
        Gonçalves E; Behan FM; Louzada S; Arnol D; Stronach EA; Yang F; Yusa K; Stegle O; Iorio F; Garnett MJ
        Genome biology, 2019年02月05日, 査読有り
      • ATM orchestrates the DNA-damage response to counter toxic non-homologous end-joining at broken replication forks.
        Balmus G; Pilger D; Coates J; Demir M; Sczaniecka-Clift M; Barros AC; Woods M; Fu B; Yang F; Chen E; Ostermaier M; Stankovic T; Ponstingl H; Herzog M; Yusa K; Martinez FM; Durant ST; Galanty Y; Beli P; Adams DJ; Bradley A; Metzakopian E; Forment JV; Jackson SP
        Nature communications, 2019年01月08日, 査読有り
      • SRPK1 maintains acute myeloid leukemia through effects on isoform usage of epigenetic regulators including BRD4.
        Tzelepis K; De Braekeleer E; Aspris D; Barbieri I; Vijayabaskar MS; Liu WH; Gozdecka M; Metzakopian E; Toop HD; Dudek M; Robson SC; Hermida-Prado F; Yang YH; Babaei-Jadidi R; Garyfallos DA; Ponstingl H; Dias JML; Gallipoli P; Seiler M; Buonamici S; Vick B; Bannister AJ; Rad R; Prinjha RK; Marioni JC; Huntly B; Batson J; Morris JC; Pina C; Bradley A; Jeremias I; Bates DO; Yusa K; Kouzarides T; Vassiliou GS
        Nature communications, 2018年12月19日, 査読有り
      • Pooled extracellular receptor-ligand interaction screening using CRISPR activation.
        Chong ZS; Ohnishi S; Yusa K; Wright GJ
        Genome biology, 2018年11月26日, 査読有り
      • Genome-scale identification of cellular pathways required for cell surface recognition.
        Sharma S; Bartholdson SJ; Couch ACM; Yusa K; Wright GJ
        Genome research, 2018年09月, 査読有り
      • Unsupervised correction of gene-independent cell responses to CRISPR-Cas9 targeting.
        Iorio F; Behan FM; Gonçalves E; Bhosle SG; Chen E; Shepherd R; Beaver C; Ansari R; Pooley R; Wilkinson P; Harper S; Butler AP; Stronach EA; Saez-Rodriguez J; Yusa K; Garnett MJ
        BMC genomics, 2018年08月13日, 査読有り
      • Genome-wide CRISPR-KO Screen Uncovers mTORC1-Mediated Gsk3 Regulation in Naive Pluripotency Maintenance and Dissolution.
        Li M; Yu JSL; Tilgner K; Ong SH; Koike-Yusa H; Yusa K
        Cell reports, 2018年07月10日, 査読有り
      • A CRISPR knockout screen identifies SETDB1-target retroelement silencing factors in embryonic stem cells.
        Fukuda K; Okuda A; Yusa K; Shinkai Y
        Genome research, 2018年06月, 査読有り
      • Genome-wide and high-density CRISPR-Cas9 screens identify point mutations in PARP1 causing PARP inhibitor resistance.
        Pettitt SJ; Krastev DB; Brandsma I; Dréan A; Song F; Aleksandrov R; Harrell MI; Menon M; Brough R; Campbell J; Frankum J; Ranes M; Pemberton HN; Rafiq R; Fenwick K; Swain A; Guettler S; Lee JM; Swisher EM; Stoynov S; Yusa K; Ashworth A; Lord CJ
        Nature communications, 2018年05月10日, 査読有り
      • Constitutively Active SMAD2/3 Are Broad-Scope Potentiators of Transcription-Factor-Mediated Cellular Reprogramming.
        Ruetz T; Pfisterer U; Di Stefano B; Ashmore J; Beniazza M; Tian TV; Kaemena DF; Tosti L; Tan W; Manning JR; Chantzoura E; Ottosson DR; Collombet S; Johnsson A; Cohen E; Yusa K; Linnarsson S; Graf T; Parmar M; Kaji K
        Cell stem cell, 2017年12月07日, 査読有り
      • Molecular synergy underlies the co-occurrence patterns and phenotype of NPM1-mutant acute myeloid leukemia.
        Dovey OM; Cooper JL; Mupo A; Grove CS; Lynn C; Conte N; Andrews RM; Pacharne S; Tzelepis K; Vijayabaskar MS; Green P; Rad R; Arends M; Wright P; Yusa K; Bradley A; Varela I; Vassiliou GS
        Blood, 2017年10月26日, 査読有り
      • Optimised metrics for CRISPR-KO screens with second-generation gRNA libraries.
        Ong SH; Li Y; Koike-Yusa H; Yusa K
        Scientific reports, 2017年08月07日, 査読有り
      • Applications of CRISPR genome editing technology in drug target identification and validation.
        Lu Q; Livi GP; Modha S; Yusa K; Macarrón R; Dow DJ
        Expert opinion on drug discovery, 2017年06月, 査読有り
      • A CRISPR Dropout Screen Identifies Genetic Vulnerabilities and Therapeutic Targets in Acute Myeloid Leukemia.
        Konstantinos Tzelepis; Hiroko Koike-Yusa; Etienne De Braekeleer; Yilong Li; Emmanouil Metzakopian; Oliver M Dovey; Annalisa Mupo; Vera Grinkevich; Meng Li; Milena Mazan; Malgorzata Gozdecka; Shuhei Ohnishi; Jonathan Cooper; Miten Patel; Thomas McKerrell; Bin Chen; Ana Filipa Domingues; Paolo Gallipoli; Sarah Teichmann; Hannes Ponstingl; Ultan McDermott; Julio Saez-Rodriguez; Brian J P Huntly; Francesco Iorio; Cristina Pina; George S Vassiliou; Kosuke Yusa
        Cell reports, 2016年10月18日, 査読有り
      • Mutational History of a Human Cell Lineage from Somatic to Induced Pluripotent Stem Cells.
        Foad J Rouhani; Serena Nik-Zainal; Arthur Wuster; Yilong Li; Nathalie Conte; Hiroko Koike-Yusa; Natsuhiko Kumasaka; Ludovic Vallier; Kosuke Yusa; Allan Bradley
        PLoS genetics, 2016年04月, 査読有り
      • piggyBac Transposon.
        Kosuke Yusa
        Microbiology spectrum, 2015年04月, 査読有り
      • Off-target assessment of CRISPR-Cas9 guiding RNAs in human iPS and mouse ES cells.
        E-Pien Tan; Yilong Li; Martin Del Castillo Velasco-Herrera; Kosuke Yusa; Allan Bradley
        Genesis (New York, N.Y. : 2000), 2015年02月, 査読有り
      • piggyBac transposon-based insertional mutagenesis in mouse haploid embryonic stem cells.
        Stephen J Pettitt; E-Pien Tan; Kosuke Yusa
        Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2015年, 査読有り
      • Simulation and estimation of gene number in a biological pathway using almost complete saturation mutagenesis screening of haploid mouse cells.
        Masahiro Tokunaga; Chikara Kokubu; Yusuke Maeda; Jun Sese; Kyoji Horie; Nakaba Sugimoto; Taroh Kinoshita; Kosuke Yusa; Junji Takeda
        BMC genomics, 2014年11月24日, 査読有り
      • Removal of reprogramming transgenes improves the tissue reconstitution potential of keratinocytes generated from human induced pluripotent stem cells.
        Ken Igawa; Chikara Kokubu; Kosuke Yusa; Kyoji Horie; Yasuhide Yoshimura; Kaori Yamauchi; Hirofumi Suemori; Hiroo Yokozeki; Masashi Toyoda; Nobutaka Kiyokawa; Hajime Okita; Yoshitaka Miyagawa; Hidenori Akutsu; Akihiro Umezawa; Ichiro Katayama; Junji Takeda
        Stem cells translational medicine, 2014年09月, 査読有り
      • Genome-wide recessive genetic screening in mammalian cells with a lentiviral CRISPR-guide RNA library.
        Hiroko Koike-Yusa; Yilong Li; E-Pien Tan; Martin Del Castillo Velasco-Herrera; Kosuke Yusa
        Nature Biotechnology, 2014年03月, 査読有り
      • Seamless genome editing in human pluripotent stem cells using custom endonuclease-based gene targeting and the piggyBac transposon.
        Kosuke Yusa
        Nature protocols, 2013年10月, 査読有り
      • Enhancement of microhomology-mediated genomic rearrangements by transient loss of mouse Bloom syndrome helicase.
        Yamanishi A; Yusa K; Horie K; Tokunaga M; Kusano K; Kokubu C; Takeda J
        Genome research, 2013年09月, 査読有り
      • Nuclear Wave1 is required for reprogramming transcription in oocytes and for normal development.
        Kei Miyamoto; Marta Teperek; Kosuke Yusa; George E Allen; Charles R Bradshaw; J B Gurdon
        Science (New York, N.Y.), 2013年08月30日, 査読有り
      • A genetic progression model of Braf(V600E)-induced intestinal tumorigenesis reveals targets for therapeutic intervention.
        Rad R; Cadiñanos J; Rad L; Varela I; Strong A; Kriegl L; Constantino-Casas F; Eser S; Hieber M; Seidler B; Price S; Fraga MF; Calvanese V; Hoffman G; Ponstingl H; Schneider G; Yusa K; Grove C; Schmid RM; Wang W; Vassiliou G; Kirchner T; McDermott U; Liu P; Saur D; Bradley A
        Cancer cell, 2013年07月08日, 査読有り
      • The piggyBac transposon displays local and distant reintegration preferences and can cause mutations at noncanonical integration sites.
        Li MA; Pettitt SJ; Eckert S; Ning Z; Rice S; Cadiñanos J; Yusa K; Conte N; Bradley A
        Molecular and cellular biology, 2013年04月, 査読有り
      • Hyperactive piggyBac gene transfer in human cells and in vivo.
        Doherty JE; Huye LE; Yusa K; Zhou L; Craig NL; Wilson MH
        Human gene therapy, 2012年03月, 査読有り
      • The critical role of histone H2A-deubiquitinase Mysm1 in hematopoiesis and lymphocyte differentiation.
        Nijnik A; Clare S; Hale C; Raisen C; McIntyre RE; Yusa K; Everitt AR; Mottram L; Podrini C; Lucas M; Estabel J; Goulding D; Sanger Institute Microarray Facility; Sanger Mouse; Genetics Project; Adams N; Ramirez-Solis R; White JK; Adams DJ; Hancock RE; Dougan G
        Blood, 2012年02月09日, 査読有り
      • Mobilization of giant piggyBac transposons in the mouse genome.
        Li MA; Turner DJ; Ning Z; Yusa K; Liang Q; Eckert S; Rad L; Fitzgerald TW; Craig NL; Bradley A
        Nucleic acids research, 2011年12月, 査読有り
      • A homozygous mutant embryonic stem cell bank applicable for phenotype-driven genetic screening.
        Horie K; Kokubu C; Yoshida J; Akagi K; Isotani A; Oshitani A; Yusa K; Ikeda R; Huang Y; Bradley A; Takeda J
        Nature methods, 2011年10月23日, 査読有り
      • Targeted gene correction of α1-antitrypsin deficiency in induced pluripotent stem cells.
        Yusa K; Rashid ST; Strick-Marchand H; Varela I, Liu PQ; Paschon DE; Miranda E; Ordóñez A; Hannan NR; Rouhani FJ; Darche S; Alexander G; Marciniak SJ; Fusaki N; Hasegawa M; Holmes MC; Di Santo JP; Lomas DA; Bradley A; Vallier L
        Nature, 2011年10月12日, 査読有り
      • Interhomolog recombination and loss of heterozygosity in wild-type and Bloom syndrome helicase (BLM)-deficient mammalian cells.
        LaRocque JR; Stark JM; Oh J; Bojilova E; Yusa K; Horie K; Takeda J; Jasin M
        Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2011年07月19日, 査読有り
      • A hyperactive piggyBac transposase for mammalian applications.
        Yusa K; Zhou L; Li MA; Bradley A; Craig NL
        Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2011年01月25日, 査読有り
      • PiggyBac transposon mutagenesis: a tool for cancer gene discovery in mice.
        Rad R; Rad L; Wang W; Cadinanos J; Vassiliou G; Rice S; Campos LS; Yusa K; Banerjee R; Li MA; de la Rosa J; Strong A; Lu D; Ellis P; Conte N; Yang FT; Liu P; Bradley A
        Science (New York, N.Y.), 2010年11月19日, 査読有り
      • Butyrate greatly enhances derivation of human induced pluripotent stem cells by promoting epigenetic remodeling and the expression of pluripotency-associated genes.
        Mali P; Chou BK; Yen J; Ye Z; Zou J; Dowey S; Brodsky RA; Ohm JE; Yu W; Baylin SB; Yusa K; Bradley A; Meyers DJ; Mukherjee C; Cole PA; Cheng L
        Stem cells (Dayton, Ohio), 2010年04月, 査読有り
      • Genome-wide forward genetic screens in mouse ES cells.
        Li MA; Pettitt SJ; Yusa K; Bradley A
        Methods in enzymology, 2010年, 査読有り
      • Fezf1 is required for penetration of the basal lamina by olfactory axons to promote olfactory development.
        Watanabe Y; Inoue K; Okuyama-Yamamoto A; Nakai N; Nakatani J; Nibu K; Sato N; Iiboshi Y; Yusa K; Kondoh G; Takeda J; Terashima T; Takumi T
        The Journal of comparative neurology, 2009年08月10日, 査読有り
      • Generation of transgene-free induced pluripotent mouse stem cells by the piggyBac transposon.
        Yusa K; Rad R; Takeda J; Bradley A
        Nature methods, 2009年05月, 査読有り
      • Sleeping beauty transposase has an affinity for heterochromatin conformation.
        Ikeda R; Kokubu C; Yusa K; Keng VW; Horie K; Takeda J
        Molecular and cellular biology, 2007年03月, 査読有り
      • Rad54 is dispensable for the ALT pathway.
        Koichi Akiyama; Kosuke Yusa; Hideharu Hashimoto; Anuradha Poonepalli; Manoor Prakash Hande; Naoki Kakazu; Junji Takeda; Makoto Tachibana; Yoichi Shinkai
        Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms, 2006年11月, 査読有り
      • Sleeping beauty transposon-based phenotypic analysis of mice: lack of Arpc3 results in defective trophoblast outgrowth.
        Kojiro Yae; Vincent W Keng; Masato Koike; Kosuke Yusa; Michiyoshi Kouno; Yoshihiro Uno; Gen Kondoh; Takahiro Gotow; Yasuo Uchiyama; Kyoji Horie; Junji Takeda
        Molecular and cellular biology, 2006年08月, 査読有り
      • Bloom's syndrome gene-deficient phenotype in mouse primary cells induced by a modified tetracycline-controlled trans-silencer.
        Tomoko Hayakawa; Kosuke Yusa; Michiyoshi Kouno; Junji Takeda; Kyoji Horie
        Gene, 2006年03月15日, 査読有り
      • New strategy for comprehensive analysis of gene functions in embryonic stem cells
        J. Takeda; K. Horie; K. Yusa
        STEM CELLS IN REPRODUCTION AND IN THE BRAIN, 2006年, 査読有り
      • Region-specific saturation germline mutagenesis in mice using the Sleeping Beauty transposon system.
        Vincent W Keng; Kojiro Yae; Tomoko Hayakawa; Sumi Mizuno; Yoshihiro Uno; Kosuke Yusa; Chikara Kokubu; Taroh Kinoshita; Keiko Akagi; Nancy A Jenkins; Neal G Copeland; Kyoji Horie; Junji Takeda
        Nature methods, 2005年10月, 査読有り
      • Genome-wide phenotype analysis in ES cells by regulated disruption of Bloom's syndrome gene.
        Kosuke Yusa; Kyoji Horie; Gen Kondoh; Michiyoshi Kouno; Yusuke Maeda; Taroh Kinoshita; Junji Takeda
        Nature, 2004年06月24日, 査読有り
      • Enhancement of Sleeping Beauty transposition by CpG methylation: possible role of heterochromatin formation.
        Yusa K; Takeda J; Horie K
        Molecular and cellular biology, 2004年05月, 査読有り
      • Characterization of Sleeping Beauty transposition and its application to genetic screening in mice.
        Horie K; Yusa K; Yae K; Odajima J; Fischer SE; Keng VW; Hayakawa T; Mizuno S; Kondoh G; Ijiri T; Matsuda Y; Plasterk RH; Takeda J
        Molecular and cellular biology, 2003年12月, 査読有り

      MISC

      • ZFN/TALENとpiggyBacトランスポゾンを用いた高効率なヒトiPS細胞ゲノムの改変 (特集 ゲノム編集革命 : 遺伝子改変はZFN・TALEN・CRISPR/Cas三強時代へ)
        遊佐 宏介
        細胞工学, 2013年
      • ポストゲノムにおける遺伝子改変マウスの新たな展開
        遊佐 宏介; 堀江 恭二; 竹田 潤二
        蛋白質核酸酵素, 2003年03月
      • マウスにおけるトランスポゾン研究の進展 (特集 トランスポゾンによる進化,変異導入の生物学的意義)
        堀江 恭二; 遊佐 宏介; 竹田 潤二
        蛋白質核酸酵素, 2004年10月
      • CRISPR/Cas9による遺伝学的スクリーニングシステムの開発
        樽本雄介; 遊佐宏介
        生体の科学, 2020年
      • TOWARDS PERSONALISED REGENERATIVE MEDICINE: MUTATIONS IN HUMAN INDUCED PLURIPOTENT STEM CELLS
        Foad Rouhani; Serena Nik-Zainal; Ludovic Vallier; Kosuke Yusa; Allan Bradley
        TRANSPLANT INTERNATIONAL, 2017年09月
      • Identification of factors involved in provirus silencing by CRISPR-Cas9 system
        Kei Fukuda; Kosuke Yusa; Yoichi Shinkai
        GENES & GENETIC SYSTEMS, 2016年12月
      • A Crispr/Cas9 Drop-out Screen Identifies Genome-Wide Genetic Valnerubilities in Acute Myeloid Leukaemia
        Konstantinos Tzelepis; Hiroko Koike-Yusa; Etienne De Braekeleer; Yilong Li; Emmanouil Metzakopian; Oliver M. Dovey; Annalisa Mupo; Vera Grinkevich; Milena M. Mazan; Malgorzata Gozdecka; Jonathan L. Cooper; Miten Patel; Thomas David Hardman McKerrell; Bin Chen; Hannes Ponstingl; Brian J. P. Huntly; Ultan McDermott; Julio Saez-Rodriguez; Francesco Iorio; Kosuke Yusa; George S. Vassiliou
        BLOOD, 2015年12月
      • Genome-wide recessive genetic screening in mammalian cells with a lentiviral CRISPR-guide RNA library
        Kosuke Yusa
        HUMAN GENE THERAPY, 2015年09月
      • TOWARDS CELL BASED THERAPY FOR alpha 1-ANTITRYPSIN DEFICIENCY THROUGH TARGETED BI-ALLELIC GENE CORRECTION IN HUMAN IPS CELLS
        S. Tamir Rashid; Kosuke Yusa; Helene Strick-Marchand; Foad Rouhani; Elena Miranda; Nicholas R. Hannan; Stefan J. Marciniak; Graeme J. Alexander; James Di Santo; Allan Bradley; David A. Lomas; Ludovic Vallier
        HEPATOLOGY, 2011年10月
      • A trial of in vitro reconstitution of human skin using transgene-free induced pluripotent stem cells
        Ken Igawa; Jun Harada; Yukinobu Nakagawa; Kyoji Horie; Kosuke Yusa; Hiroo Yokozeki; Junji Takeda; Ichiro Katayama
        JOURNAL OF INVESTIGATIVE DERMATOLOGY, 2011年09月
      • [Recent progress in mouse transposon research].
        Horie K; Yusa K; Takeda J
        Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme, 2004年10月
      • [New perspectives on genetically engineered mice in post-genomic era].
        Yusa K; Horie K; Takeda J
        Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme, 2003年03月

      講演・口頭発表等

      • CRISPR-KOスクリーニングの開発と応用
        遊佐宏介
        中外製薬セミナー, 2023年04月12日, 招待有り
      • CRISPR-KO スクリーニングの開発と応用
        遊佐宏介
        第45回日本分子生物学会年会, 2022年11月30日, 招待有り
      • Development of CRISPR-KO Screening and its Applications in Cancer Research
        Kosuke Yusa
        International Academy for Advanced Oncology 2022, 2022年07月29日, 招待有り
      • Development and Applications of CRISPR-KO Screening
        Kosuke Yusa
        第31会日本がん転移学会学術集会・総会, 2022年07月07日, 招待有り
      • 大規模CRISPR遺伝子スクリーニングによる 創薬標的の探索と検証
        遊佐宏介
        理化学研究所DMP創薬セミナー, 2022年04月25日, 招待有り
      • CRISPR-KOスクリーニングの開発と応用
        遊佐宏介
        第21回日本再生医療学会総会, 2022年03月19日, 招待有り
      • ヒトES/iPS細胞に蓄積される変異
        遊佐宏介
        第一回京都大学ウイルス・再生医科学研究所附属ヒトES細胞研究センターシンポジウム, 2022年03月09日, 招待有り
      • Development and Applications of CRISPR-KO Screening
        Kosuke Yusa
        The 27th East Asia Joint Symposium, 2021年10月27日, 招待有り
      • CRISPR-KOスクリーニングの開発と応用
        遊佐宏介
        第80会日本癌学会学術総会, 2021年10月02日, 招待有り
      • CRISPR-KOスクリーニングの開発と応用
        遊佐宏介
        第73回日本細胞生物学会大会, 2021年06月30日, 招待有り
      • CRISPR-KOスクリーニングの開発と応用
        遊佐宏介
        日本生化学会北陸支部第39回大会, 2021年06月05日, 招待有り
      • Genetic Dissection of Pluripotency Maintenance using CRISPR-KO Screenning
        遊佐宏介
        第110回日本病理学会総会, 2021年04月22日, 招待有り
      • Development and Application of CRISPR-KO Screening
        遊佐宏介
        第43回日本分子生物学会年会, 2020年12月03日, 招待有り
      • CRISPR-KOスクリーニングの開発と創薬研究への応用
        遊佐宏介
        千里ライフサイエンスセミナー, 2020年11月04日, 招待有り
      • Development and Application of CRISPR-KO Screening
        遊佐宏介
        第79回日本癌学会学術総会, 2020年10月01日, 招待有り
      • Development and Application of CRISPR-KO Screening
        遊佐宏介
        熊本大学発生医学研究所, 2020年07月29日, 招待有り
      • Development and Application of Genome-Wide CRISPR-KO Screening
        遊佐宏介
        大阪大学微生物病研究所BRIDGEセミナー, 2020年02月07日, 招待有り
      • Development of CRISPR-KO screening and its application in oncology research
        遊佐宏介
        愛知県がんセンター, 2019年12月18日, 招待有り
      • Prioritization of cancer therapeutic targets using CRISRP-Cas9 screens
        遊佐宏介
        第8回Cancer Stem Cell Symposium, 2019年11月30日, 招待有り
      • Development and Application of CRISPR-KO Screening
        Frontiers in Genome Engineering 2019, 2019年11月25日, 招待有り
      • Development and Application of Genome-Wide CRISPR-KO Screening
        遊佐宏介
        和歌山県立医科大学, 2019年11月14日, 招待有り
      • Development and Application of CRISPR-KO Screening
        遊佐宏介
        第14回生命医科学研究所ネットワーク国際シンポジウム, 2019年10月02日, 招待有り
      • Development and application of genome-wide CRISPR-KO screening
        遊佐 宏介
        SULSA Disruptive technologies, 2019年09月26日, 招待有り
      • Development and application of genome-wide CRISPR-KO screening
        遊佐 宏介
        日本遺伝学会第91回大会, 2019年09月13日, 招待有り
      • Development and application of genome-wide CRISPR-KO screening
        遊佐 宏介
        東京大学先端科学技術研究センター, 2019年09月10日, 招待有り
      • Development and application of genome-wide CRISPR-KO screening
        遊佐 宏介
        高遠 分子細胞生物学シンポジウム, 2019年08月23日
      • ゲノム編集技術を使ったがん研究
        遊佐 宏介
        ウイルス・再生医科学研究所公開講演会, 2019年07月20日, 招待有り
      • Oncology drug candidates identified from a large-scale genome-wide CRISPR screen
        遊佐 宏介
        理化学研究所 和光, 2019年01月21日
      • CRISPR-KOスクリーニングの開発と応用
        遊佐宏介
        最新のゲノム編集技術と用途展開, 2020年
      • 医療・創薬に向けたCRISPRスクリーニング
        遊佐宏介
        遺伝子医学, 2020年
      • CRISPR/Cas9に遺伝学スクリーニングシステムの開発
        樽本雄介; 遊佐宏介
        生体の科学, 2020年
      • CRISPR-Cas9システムの遺伝学スクリーニングへの応用
        遊佐宏介
        医学のあゆみ, 2020年
      • CRIPSRスクリーニングによる幹細胞制御因子の網羅的探索
        遊佐宏介
        医学のあゆみ, 2020年
      • CRISPR-KOスクリーニングによるがん治療候補の優先化
        遊佐宏介
        医学のあゆみ, 2020年
      • CRISPRライブラリーを用いた遺伝子スクリーニング法
        遊佐宏介
        実験医学別冊 ゲノム編集実験スタンダード, 2019年

      外部資金:その他

      • 脂肪分化を制御する代謝エピゲノム因子のCRISPRスクリーニング
        群馬大学生体調節研究所「内分秘・代謝学共同研究拠点」
        自 2021年04月01日, 至 2022年03月31日
        遊佐宏介
      • 完全無細 AAV ベクター合成技術 発
        東京大学医科学研究所国内共同研究
        自 2021年04月01日, 至 2022年03月31日
        遊佐宏介
      list
        Last Updated :2024/02/21

        教育

        担当科目

        • 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日
          分子遺伝学II
          3726, 前期, 理学部, 2
        • 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日
          分子遺伝学II
          3726, 前期, 理学部, 2
        • 自 2019年04月, 至 2020年03月
          分子遺伝学II
          前期, 理学部
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          ILASセミナー:発生再生ゼミナール
          前期, 全学共通科目
        • 自 2020年04月, 至 2021年03月
          分子遺伝学II
          前期, 理学部
        • 自 2021年04月, 至 2022年03月
          分子遺伝学II
          前期, 理学部

        博士学位審査

        • Differentiation of Hypertrophic Chondrocytes from Human iPSCs for the In Vitro Modeling of Chondrodysplasias(ヒトiPSCから肥大軟骨細胞への分化誘導法の確立と軟骨異形成症のin vitroモデリング)
          PRETEMER YANN, 医学研究科, 副査
          2023年03月23日
        • Enhancement of Regnase-1 expression with stem loop-targeting antisense oligonucleotides alleviates inflammatory diseases(mRNAステムループ構造標的アンチセンスオリゴ核酸を用いたRegnase-1発現増強による炎症抑制法の開発)
          Tse Ka Man Carman, 医学研究科, 副査
          2022年09月26日
        • Essential role of Notch/Hes1 signaling in postnatal pancreatic exocrine development(Notch/Hes1シグナルは生後の膵外分泌組織形成に不可欠な役割を果たす)
          栗山 勝利, 医学研究科, 副査
          2023年03月23日
        • Tracing the evolutionary history of blood cells to the unicellular ancestor of animals(血液細胞の進化の足跡を単細胞生物にまで遡る)
          長畑 洋佑, 医学研究科, 副査
          2023年01月23日
        • Comprehensive genomics in androgen receptor-dependent castration-resistant prostate cancer identifies an adaptation pathway mediated by opioid receptor kappa 1(アンドロゲン受容体依存性去勢抵抗性前立腺癌における opioid receptor kappa 1 を介した適応応答経路の同定)
          牧野 雄樹, 医学研究科, 主査
          2022年11月24日
        • Systemic Supplementation of Collagen VI by Neonatal Transplantation of iPSC-Derived MSCs Improves Histological Phenotype and Function of Col6-Deficient Model Mice (iPS細胞由来間葉系間質細胞の新生仔投与による全身性の6型コラーゲン補充は、6型コラーゲン欠損モデルマウスの組織学的特徴および運動機能を改善する)
          原田 文, 医学研究科, 副査
          2022年03月23日
        • CDH18 is a fetal epicardial biomarker regulating differentiation towards vascular smooth muscle cells (CDH18は血管平滑筋細胞への分化を制御する胎児心外膜バイオマーカーである)
          Junghof Julia, 医学研究科, 副査
          2022年03月23日
        • DMRT1-mediated reprogramming drives development of cancer resembling human germ cell tumors with features of totipotency (DMRT1を介した生体内での細胞初期化は全能性の特徴を持つヒト胚細胞腫瘍に類似したがんを形成する)
          田口 純平, 医学研究科, 主査
          2022年01月24日
        • Extracellular vesicles synchronize cellular phenotypes of differentiating cells (細胞外小胞が分化中の細胞同士の形質を同調させる)
          皆川 朋皓, 医学研究科, 副査
          2022年03月23日
        list
          Last Updated :2024/02/21

          大学運営

          部局運営(役職等)

          • 自 2023年04月01日
            男女共同参画推進委員会
          • 自 2021年05月01日
            再生実験動物施設飼育室施設運営委員会 委員
          • 自 2019年04月01日
            人権委員会 委員
          • 自 2020年04月
            医の倫理委員会 委員長
          • 自 2018年10月01日, 至 2021年06月30日
            再生医科学動物実験専門委員会 委員
          • 自 2018年10月01日, 至 2020年03月31日
            化学物質管理委員会
          • 自 2019年10月01日, 至 2021年09月30日
            医学研究科運営委員会
          • 自 2023年04月01日, 至 2025年03月31日
            医学図書館運営委員会
          • 自 2019年08月, 至 2020年01月
            医学研究科論文調査委員会 委員
          • 自 2020年02月, 至 2020年07月
            学研究科論文調査委員会 委員長
          • 自 2019年04月, 至 2022年03月
            医学研究科大学院入試委員会 委員

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