基本情報

学部兼担

• 工学部

全学メールアドレス

• 全学メールアドレス

  numata.keiji.3nkyoto-u.ac.jp

学位

• 修士（工学）(東京工業大学)
• 博士（工学)(東京工業大学)

出身大学院・研究科等

• 東京工業大学, 大学院総合理工学研究科修士課程物質科学創造専攻, 修了
• 東京工業大学, 大学院総合理工学研究科博士課程物質科学創造専攻, 修了

出身学校・専攻等

• 東京工業大学, 工学部高分子工学科, 卒業

出身高等学校

• 出身高等学校

  東京学芸大学附属高等学校

経歴

• 自 2020年04月, 至 現在

  京都大学, 材料化学専攻, 教授

ID,URL

• J-Global ID

  201601010345623000

関連Webサイト

• http://pixy.polym.kyoto-u.ac.jp/index.html

researchmap URL

• https://researchmap.jp/keijinumata_biopoly

研究

研究テーマ・研究概要

• 研究テーマ

  バイオ高分子に関する研究

• 研究概要

  バイオ高分子に関する研究

研究分野

• ナノテク・材料, 高分子材料

論文

• Development of a Versatile Plant-Derived Mitochondrial Targeting Sequence Based on a Reporter Protein Sorting Analysis and Biological Information.

  Naoya Abe; Masaki Odahara; Shamitha Rao Morey; Keiji Numata

  ACS chemical biology, 2024年12月20日

  
• Analysis of enzymatic degradation process for poly[(R)-3-hydroxybutyric acid] crystals revealed by AFM

  Keiji Numata; Yoshihiro Kikkawa; Tadahisa Iwata; Yoshiharu Doi; Hideki Abe

  Polymer Preprints, Japan, 2005年

  
• A Chimeric Peptide for Shielding Plant Photosynthetic Systems against Excess Light Stress via Chloroplast-Targeted ROS Quenching

  Takaaki Miyamoto; Shamitha Rao Morey-Yagi; Keiji Numata

  JACS Au, 2024年12月23日, 査読有り

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• Poly(A) Tail Length of Messenger RNA Regulates Translational Efficiency of the Mitochondria-Targeting Delivery System

  Naoto Yoshinaga; Keiji Numata

  ACS Biomaterials Science & Engineering, 2024年09月04日, 査読有り, 招待有り

  
• Construction of peptide/plasmid DNA complexes for plant gene transfection via the basic leucine zipper domain

  Kota Nomura; Seiya Fujita; Yuki Shimatani; Taichi Kurita; Chonprakun Thagun; Naoya Abe; Kazusato Oikawa; Kousuke Tsuchiya; Hirotaka Uji; Keiji Numata

  Polymer Journal, 2024年07月

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• Identification of a highly efficient chloroplast-targeting peptide for plastid engineering

  Chonprakun Thagun; Masaki Odahara; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  PLOS Biology, 2024年09月19日

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• Spider Silk: Rapid, Bottom‐Up Self‐Assembly of MaSp1 into Hierarchically Structured Fibers Through Biomimetic Processing

  Ali D. Malay; Nur Alia Oktaviani; Jianming Chen; Keiji Numata

  Advanced Functional Materials, 2024年08月27日

  
• Phenylboronic Acid-Functionalized Micelles Dual-Targeting Boronic Acid Transporter and Polysaccharides for siRNA Delivery into Brown Algae

  Naoto Yoshinaga; Takaaki Miyamoto; Mami Goto; Atsuko Tanaka; Keiji Numata

  JACS Au, 2024年03月22日

  
• Acetate-inducing metabolic states enhance polyhydroxyalkanoate production in marine purple non-sulfur bacteria under aerobic conditions

  Mieko Higuchi-Takeuchi; Keiji Numata

  Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2019年

  
• Protease-catalyzed polymerization of tripeptide esters containing unnatural amino acids: α,α-disubstituted and n-alkylated amino acids

  Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  ACS Symposium Series, 2018年

  
• Crystal structure and physical properties of Antheraea yamamai silk fibers: Long poly(alanine) sequences are partially in the crystalline region

  Keiji Numata; Ryota Sato; Kenjiro Yazawa; Takaaki Hikima; Hiroyasu Masunaga

  Polymer, 2015年10月23日

  
• Chemo-Enzymatic Synthesis of Linear and Branched Cationic Peptides: Evaluation as Gene Carriers

  Jose Manuel Ageitos; Jo-Ann Chuah; Keiji Numata

  Macromolecular Bioscience, 2015年07月01日

  
• Engineering peptide-based carriers for drug and gene delivery

  Jo-Ann Chuah; David L. Kaplan; Keiji Numata

  Engineering in Translational Medicine, 2014年05月01日

  
• Screening of marine bacteria to synthesize polyhydroxyalkanoate from lignin: Contribution of lignin derivatives to biosynthesis by oceanimonas doudoroffii

  Keiji Numata; Kumiko Morisaki

  ACS Sustainable Chemistry and Engineering, 2015年04月06日

  
• Cross-linking polybutadiene rubber via a thiol-ene reaction with polycysteine as a degradable cross-linker

  Kousuke Tsuchiya; Kayo Terada; Yui Tsuji; Simon Sau Yin Law; hiroyasu masunaga; Takuya Katashima; Takamasa Sakai; Keiji Numata

  Polymer Journal, 2023年12月15日

  
• Replicating shear-mediated self-assembly of spider silk through microfluidics

  Jianming Chen; Arata Tsuchida; Ali D. Malay; Kousuke Tsuchiya; Hiroyasu Masunaga; Yui Tsuji; Mako Kuzumoto; Kenji Urayama; Hirofumi Shintaku; Keiji Numata

  Nature Communications, 2024年01月15日

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• Effects of polycaprolactone degradation products on the water flea, Daphnia magna: Carbodiimide additives have acute and chronic toxicity

  M Matsumoto; H Ito; A Tateishi; Y Kobayashi; K Satoh; K Numata; H Miyakawa

  JOURNAL OF APPLIED TOXICOLOGY, 2023年07月, 査読有り

  
• Micrometer-Scale Optical Web Made of Spider Dragline Fibers with Optical Gate Operations

  Hendra; H Yamagishi; WY Heah; AD Malay; K Numata; Y Yamamoto

  ADVANCED OPTICAL MATERIALS, 2023年07月, 査読有り

  
• Composition of Minor Ampullate Silk Makes Its Properties Different from Those of Major Ampullate Silk

  H Nakamura; N Kono; M Mori; H Masunaga; K Numata; K Arakawa

  BIOMACROMOLECULES, 2023年05月, 査読有り

  
• 24.高分子合成・反応における最近の進歩(10)酵素重合における最近の進歩

  土屋 康佑; 沼田 圭司

  日本接着学会誌 = Journal of the Adhesion Society of Japan : adhesion, 2023年, 査読有り

  
• クモの糸を人工的に創製

  沼田 圭司

  化学と教育, 2022年07月, 査読有り

  
• 第5回バイオインダストリー奨励賞受賞者インタビュー

  有泉 亨; 太田 禎生; 大谷 美沙都; 佐藤 和秀; 清水 一憲; 武田 朱公; 樽野 陽幸; 長瀬 健一; 沼田 圭司; 野田口 理孝; 藤田 敏次; 細川 正人

  バイオサイエンスとインダストリー / バイオサイエンスとインダストリー編集委員会 編, 2022年, 査読有り

  
• ペプチドをキャリアとしたスプレー法による植物改変

  小田原 真樹; Thagun Chonprakun; 沼田 圭司

  植物の生長調節 = Regulation of plant growth & development, 2022年, 査読有り

  
• Optimal glycan density for interactions between Siglec-8 and sialyl sulfo oligosaccharides

  Risa Naka; Simon Sau Yin Law; Ayaka Tateishi; Keiji Numata; Masashi Ohmae

  Polymer Journal, 2023年08月30日

  
• Restructuring the Interface of Silk–Polycaprolactone Biocomposites Using Rigid-Flexible Agents

  Yan Zhao; Zihong Wu; Lei Chen; Xiong Shu; Juan Guan; Kang Yang; Ruya Shi; Yibin Li; Keiji Numata; Zhengzhong Shao

  Biomacromolecules, 2023年01月09日

  
• Molecular dynamics simulation of complexation between plasmid DNA and cationic peptides

  Kousuke Tsuchiya; Joan Gimenez-Dejoz; Keiji Numata

  Polymer Journal, 2023年06月09日

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• Cell Wall‐Denaturing Molecules for Plant Gene Modification

  Risa Naka; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  ChemBioChem, 2023年05月16日

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• Pexophagy suppresses ROS-induced damage in leaf cells under high-intensity light.

  Kazusato Oikawa; Shino Goto-Yamada; Yasuko Hayashi; Daisuke Takahashi; Yoshitaka Kimori; Michitaro Shibata; Kohki Yoshimoto; Atsushi Takemiya; Maki Kondo; Kazumi Hikino; Akira Kato; Keisuke Shimoda; Haruko Ueda; Matsuo Uemura; Keiji Numata; Yoshinori Ohsumi; Ikuko Hara-Nishimura; Shoji Mano; Kenji Yamada; Mikio Nishimura

  Nature communications, 2022年12月05日

  
• Optimization of Poly(N-isopropylacrylamide) as an Artificial Amidase

  Yoke-Ming Wong; Yu Hoshino; Kumar Sudesh; Yoshiko Miura; Keiji Numata

  BIOMACROMOLECULES, 2015年01月, 査読有り

  
• Design of an Artificial Peptide Inspired by Transmembrane Mitochondrial Protein for Escorting Exogenous DNA into the Mitochondria to Restore their Functions by Simultaneous Multiple Gene Expression

  Naoto Yoshinaga; Takaaki Miyamoto; Masaki Odahara; Noriko Takeda‐Kamiya; Kiminori Toyooka; Seia Nara; Haruna Nishimura; Feng Ling; Masayuki Su'etsugu; Minoru Yoshida; Keiji Numata

  Advanced Functional Materials, 2023年11月

  
• Advancing Biomolecule Delivery in Plants: Harnessing Synthetic Nanocarriers to Overcome Multiscale Barriers for Cutting-Edge Plant Bioengineering

  Takaaki Miyamoto; Keiji Numata

  Bulletin of the Chemical Society of Japan, 2023年09月15日

  
• Ongoing gene transfer from chloroplasts to mitochondria in tobacco

  Masaki Odahara; Maai Mori; Keiji Numata

  2023年06月30日

  
• A multiple shoot induction system for peptide-mediated gene delivery into plastids in <i>Arabidopsis thaliana</i>, <i>Nicotiana benthamiana</i>, and <i>Fragaria</i>×<i>ananassa</i>

  Masaki Odahara; Most Tanziman Ara; Remi Nakagawa; Yoko Horii; Shougo Ishio; Shinjiro Ogita; Keiji Numata

  Plant Biotechnology, 2023年

  
• NMR assignment and dynamics of the dimeric form of soluble C-terminal domain major ampullate spidroin 2 from Latrodectus hesperus

  Nur Alia Oktaviani; Ali D. Malay; Mami Goto; Toshio Nagashima; Fumiaki Hayashi; Keiji Numata

  Biomolecular NMR Assignments, 2023年09月05日

  
• C-Terminal Domain Controls Protein Quality and Secretion of Spider Silk in Tobacco Cells.

  Chonprakun Thagun; Tomohiro Suzuki; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  Advanced biology, 2023年07月06日

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• Organelle-targeted gene delivery in plants by nanomaterials

  Simon Sau Yin Law; Takaaki Miyamoto; Keiji Numata

  Chemical Communications, 2023年, 査読有り

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• Peroxisomes undergo morphological changes in a light‐dependent manner with proximity to the nucleus

  Keiko Midorikawa; Keiji Numata; Yutaka Kodama

  FEBS Letters, 2023年07月12日

  
• Plant Mitochondrial-Targeted Gene Delivery by Peptide/DNA Micelles Quantitatively Surface-Modified with Mitochondrial Targeting and Membrane-Penetrating Peptides.

  Naoya Abe; Seiya Fujita; Takaaki Miyamoto; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2023年06月29日

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• Bilirubin is produced nonenzymatically in plants to maintain chloroplast redox status.

  Kazuya Ishikawa; Xiaonan Xie; Yasuhide Osaki; Atsushi Miyawaki; Keiji Numata; Yutaka Kodama

  Science advances, 2023年06月09日

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• Deuterium- and Alkyne-Based Bioorthogonal Raman Probes for In Situ Quantitative Metabolic Imaging of Lipids within Plants

  Simon Sau Yin Law; Masato Asanuma; Jingwen Shou; Yasuyuki Ozeki; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  JACS Au, 2023年05月15日

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• Binding of Tau-derived peptide-fused GFP to plant microtubules in Arabidopsis thaliana

  Hiroshi Inaba; Kazusato Oikawa; Kazuya Ishikawa; Yutaka Kodama; Kazunori Matsuura; Keiji Numata

  PLOS ONE, 2023年06月02日

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• Effect of Oligomers Derived from Biodegradable Polyesters on Eco- and Neurotoxicity

  Naoto Yoshinaga; Ayaka Tateishi; Yasuaki Kobayashi; Tomohiro Kubo; Hitoshi Miyakawa; Kotaro Satoh; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2023年04月21日

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• Papain-Catalyzed, Sequence-Dependent Polymerization Yields Polypeptides Containing Periodic Histidine Residues

  Kayo Terada; Taichi Kurita; Joan Gimenez-Dejoz; Hiroyasu Masunaga; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  Macromolecules, 2022年08月23日

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• Unusual pKa Values Mediate the Self-Assembly of Spider Dragline Silk Proteins.

  Nur Alia Oktaviani; Ali D Malay; Akimasa Matsugami; Fumiaki Hayashi; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2023年04月10日

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• Using the organelle glue technique to engineer the plant cell metabolome

  Kazuya Ishikawa; Makoto Kobayashi; Miyako Kusano; Keiji Numata; Yutaka Kodama

  Plant Cell Reports, 2023年01月27日

  
• Efficient 3-Hydroxybutyrate Production by Quiescent Escherichia coli Microbial Cell Factories is Facilitated by Indole-Induced Proteomic and Metabolomic Changes

  Nicholas M. Thomson; Tomokazu Shirai; Marco Chiapello; Akihiko Kondo; Krishna J. Mukherjee; Easan Sivaniah; Keiji Numata; David K. Summers

  Biotechnology Journal, 2018年05月01日, 査読有り

  
• A high-throughput quantitative method to evaluate peroxisome-chloroplast interactions in Arabidopsis thaliana

  Kazusato Oikawa; Keiko Midorikawa; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  Frontiers in Plant Science, 2022年10月20日

  
• Organellar Glue: A Molecular Tool to Artificially Control Chloroplast–Chloroplast Interactions

  Shintaro Ichikawa; Shota Kato; Yuta Fujii; Kazuya Ishikawa; Keiji Numata; Yutaka Kodama

  ACS Synthetic Biology, 2022年09月30日

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• 1000 spider silkomes: Linking sequences to silk physical properties

  Kazuharu Arakawa; Nobuaki Kono; Ali D. Malay; Ayaka Tateishi; Nao Ifuku; Hiroyasu Masunaga; Ryota Sato; Kousuke Tsuchiya; Rintaro Ohtoshi; Daniel Pedrazzoli; Asaka Shinohara; Yusuke Ito; Hiroyuki Nakamura; Akio Tanikawa; Yuya Suzuki; Takeaki Ichikawa; Shohei Fujita; Masayuki Fujiwara; Masaru Tomita; Sean J. Blamires; Jo-Ann Chuah; Hamish Craig; Choon P. Foong; Gabriele Greco; Juan Guan; Chris Holland; David L. Kaplan; Kumar Sudesh; Biman B. Mandal; Y. Norma-Rashid; Nur A. Oktaviani; Rucsanda C. Preda; Nicola M. Pugno; Rangam Rajkhowa; Xiaoqin Wang; Kenjiro Yazawa; Zhaozhu Zheng; Keiji Numata

  Science Advances, 2022年10月14日

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• Three-dimensional nanoscale analysis of light-dependent organelle changes in Arabidopsis mesophyll cells

  Keiko Midorikawa; Ayaka Tateishi; Kiminori Toyooka; Mayuko Sato; Takuto Imai; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  PNAS Nexus, 2022年10月04日

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• Microbial autotrophic biorefineries: Perspectives for biopolymer production

  Pisanee Srisawat; Mieko Higuchi-Takeuchi; Keiji Numata

  POLYMER JOURNAL, 2022年07月, 査読有り

  
• Computational study of the interaction between natural rubber α-terminal groups and l-quebrachitol, one of the major components of natural rubber

  Joan Gimenez-Dejoz; Katsuhiko Tsunoda; Yasuo Fukushima; 沼田 圭司

  Polymer Journal, 2022年02月, 査読有り

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• バイオ高分子が守る資源と環境 : 自然界に存在する材料の理解と利用を目指して

  沼田 圭司

  化学 = Chemistry, 2022年01月, 査読有り

  
• Molecular dynamics study of the internalization of cell-penetrating peptides containing unnatural amino acids across membranes

  Joan Gimenez-Dejoz; Keiji Numata

  NANOSCALE ADVANCES, 2022年01月, 査読有り

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• Chemoenzymatic Synthesis of Sialyl Sulfo-Oligosaccharides as Potent Siglec-8 Ligands via Transglycosylation Catalyzed by Keratanase II

  Shiori Yuge; Ayaka Tateishi; Keiji Numata; Masashi Ohmae

  BIOMACROMOLECULES, 2022年01月, 査読有り

  
• タンパク質モチーフを利用した機能材料の創出

  沼田 圭司; 大前 仁; 宇治 広隆; 土屋 康佑; 及川 和聡; 藤田 聖矢; Foong Choon Pin; Yagi Shamitha Rao; Thagun Chonprakun; 寺田 佳世

  日本化学繊維研究所講演集 Annual report of the Research Institute for Chemical Fibers, Japan, 2022年, 査読有り

  
• クモ糸の階層構造と材料設計

  沼田 圭司

  繊維学会誌, 2021年08月, 査読有り

  
• クモ糸の階層構造を模倣した人工シルクの創出に向けて

  沼田 圭司

  高分子 = High polymers, Japan : polymers, 2021年07月, 査読有り

  
• クモ糸の階層構造がはじめて再現された! : 人工クモ糸の誕生に向けての新たな一歩

  沼田 圭司

  化学 = Chemistry, 2021年04月, 査読有り

  
• ペプチドの自己組織化によるナノキャリア創生

  沼田 圭司; 大前 仁; 宇治 広隆; 土屋 康佑; 及川 和聡; 藤田 聖矢; Choon Pin Foong; 寺田 佳世

  日本化学繊維研究所講演集 Annual report of the Research Institute for Chemical Fibers, Japan, 2021年, 査読有り

  
• Functional peptide-mediated plastid transformation in tobacco, rice, and kenaf

  Masaki Odahara; Yoko Horii; Jun Itami; Kenta Watanabe; Keiji Numata

  Frontiers in Plant Science, 2022年09月23日

  
• Chemical modification and biosynthesis of silk-like polymers

  Takuya Katashima; Ali D. Malay; Keiji Numata

  CURRENT OPINION IN CHEMICAL ENGINEERING, 2019年06月, 査読有り

  
• Chemoenzymatic Synthesis of Polypeptides for Use as Functional and Structural Materials

  Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  MACROMOLECULAR BIOSCIENCE, 2017年11月, 査読有り

  
• Chemoenzymatic synthesis of polypeptides containing the unnatural amino acid 2-aminoisobutyric acid

  Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  CHEMICAL COMMUNICATIONS, 2017年07月, 査読有り

  
• Chemical Synthesis of Multiblock Copolypeptides Inspired by Spider Dragline Silk Proteins

  Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  ACS MACRO LETTERS, 2017年02月, 査読有り

  
• Papain-Catalyzed Chemoenzymatic Synthesis of Telechelic Polypeptides Using Bis(Leucine Ethyl Ester) Initiator

  Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  MACROMOLECULAR BIOSCIENCE, 2016年07月, 査読有り

  
• The Benzyl Ester Group of Amino Acid Monomers Enhances Substrate Affinity and Broadens the Substrate Specificity of the Enzyme Catalyst in Chemoenzymatic Copolymerization

  Jose Manuel Ageitos; Kenjiro Yazawa; Ayaka Tateishi; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  BIOMACROMOLECULES, 2016年01月, 査読有り

  
• Chemoenzymatic modification of silk fibroin with poly(2,6-dimethyl-1,5-phenylene ether) using horseradish peroxidase

  Leo Simmons; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  RSC ADVANCES, 2016年, 査読有り

  
• Atomic resolution structure of serine protease proteinase K at ambient temperature.

  Masuda Tetsuya; Suzuki Mamoru; Inoue Shigeyuki; Song Changyong; Nakane Takanori; Nango Eriko; Tanaka Rie; Tono Kensuke; Joti Yasumasa; Kameshima Takashi; Hatsui Takaki; Yabashi Makina; Mikami Bunzo; Nureki Osamu; Numata Keiji; Iwata So; Sugahara Michihiro

  Scientific reports, 2017年03月31日

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• Sucrose supplementation suppressed the growth inhibition in polyhydroxyalkanoate-producing plants.

  Takeshi Yoshizumi; Miwa Yamada; Mieko Higuchi-Takeuchi; Ken'ichiro Matsumoto; Seiichi Taguchi; Minami Matsui; Keiji Numata

  Plant biotechnology (Tokyo, Japan), 2017年

  
• Use of extension-deformation-based crystallisation of silk fibres to differentiate their functions in nature

  Keiji Numata; Hiroyasu Masunaga; Takaaki Hikima; Sono Sasaki; Kazuhide Sekiyama; Masaki Takata

  Soft Matter, 2015年08月21日, 査読有り

  
• Chemoenzymatic Polymerization of L-Serine Ethyl Ester in Aqueous Media without Side-Group Protection

  Takumi Watanabe; Kayo Terada; Shogo Takemura; Hiroyasu Masunaga; Kousuke Tsuchiya; Alexandros Lamprou; Keiji Numata

  ACS POLYMERS AU, 2022年06月

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• Engineered Mutants of a Marine Photosynthetic Purple Nonsulfur Bacterium with Increased Volumetric Productivity of Polyhydroxyalkanoate Bioplastics.

  Choon Pin Foong; Mieko Higuchi-Takeuchi; Kenji Ohtawa; Takuya Asai; Hanqin Liu; Yasuyuki Ozeki; Keiji Numata

  ACS synthetic biology, 2022年02月18日

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• A centrifugation-assisted peptide-mediated gene transfer method for high-throughput analyses.

  Mitsuhiro Kimura; Takeshi Yoshizumi; Keiji Numata

  Plant biotechnology (Tokyo, Japan), 2019年, 査読有り

  
• A Screening Method for the Isolation of Polyhydroxyalkanoate-Producing Purple Non-sulfur Photosynthetic Bacteria from Natural Seawater

  Mieko Higuchi-Takeuchi; Kumiko Morisaki; Keiji Numata

  FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2016年09月, 査読有り

  
• Double-stranded DNA introduction into intact plants using peptide–DNA complexes

  Manoj Lakshmanan; Takeshi Yoshizumi; Kumar Sudesh; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  Plant Biotechnology, 2015年, 査読有り

  
• Gene introduction into the mitochondria of Arabidopsis thaliana via peptide-based carriers

  Jo-Ann Chuah; Takeshi Yoshizumi; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  SCIENTIFIC REPORTS, 2015年01月, 査読有り

  
• Synthesis of High-Molecular-Weight Polyhydroxyalkanoates by Marine Photosynthetic Purple Bacteria

  Mieko Higuchi-Takeuchi; Kumiko Morisaki; Kiminori Toyooka; Keiji Numata

  PLOS ONE, 2016年08月, 査読有り

  
• Intracellular Delivery of Proteins via Fusion Peptides in Intact Plants

  Kiaw Kiaw Ng; Yoko Motoda; Satoru Watanabe; Ahmad Sofiman Othman; Takanori Kigawa; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  PLOS ONE, 2016年04月, 査読有り

  
• Relaxation of the Plant Cell Wall Barrier via Zwitterionic Liquid Pretreatment for Micelle‐Complex‐Mediated DNA Delivery to Specific Plant Organelles

  Takaaki Miyamoto; Kousuke Tsuchiya; Kiminori Toyooka; Yumi Goto; Ayaka Tateishi; Keiji Numata

  Angewandte Chemie International Edition, 2022年06月07日

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• Polymer-coated carbon nanotube hybrids with functional peptides for gene delivery into plant mitochondria.

  Simon Sau Yin Law; Geoffrey Liou; Yukiko Nagai; Joan Giménez-Dejoz; Ayaka Tateishi; Kousuke Tsuchiya; Yutaka Kodama; Tsuyohiko Fujigaya; Keiji Numata

  Nature communications, 2022年05月16日

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• A silk composite fiber reinforced by telechelic-type polyalanine and its strengthening mechanism

  Jianming Chen; Kousuke Tsuchiya; Hiroyasu Masunaga; Ali D. Malay; Keiji Numata

  POLYMER CHEMISTRY, 2022年03月

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• Rational Designs at the Forefront of Mitochondria-Targeted Gene Delivery: Recent Progress and Future Perspectives

  Naoto Yoshinaga; Keiji Numata

  ACS Biomaterials Science & Engineering, 2022年02月14日

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• Engineered Nanogel Particles Enhance the Photoautotrophic Biosynthesis of Polyhydroxyalkanoate in Marine Photosynthetic Bacteria

  Pisanee Srisawat; Mieko Higuchi-Takeuchi; Ryutaro Honda; Tomokazu Shirai; Akihiko Kondo; Yu Hoshino; Keiji Numata

  ACS Sustainable Chemistry & Engineering, 2022年04月04日

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• Complexity of Spider Dragline Silk

  Ali D. Malay; Hamish C. Craig; Jianming Chen; Nur Alia Oktaviani; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2022年04月04日

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• Non-transgenic Gene Modulation via Spray Delivery of Nucleic Acid/Peptide Complexes into Plant Nuclei and Chloroplasts.

  Chonprakun Thagun; Yoko Horii; Maai Mori; Seiya Fujita; Misato Ohtani; Kousuke Tsuchiya; Yutaka Kodama; Masaki Odahara; Keiji Numata

  ACS nano, 2022年03月22日

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• An oomycete NLP cytolysin forms transient small pores in lipid membranes

  Katja Pirc; Luke A. Clifton; Neval Yilmaz; Andrea Saltalamacchia; Mojca Mally; Tina Snoj; Nada Žnidaršič; Marija Srnko; Jure Borišek; Petteri Parkkila; Isabell Albert; Marjetka Podobnik; Keiji Numata; Thorsten Nürnberger; Tapani Viitala; Jure Derganc; Alessandra Magistrato; Jeremy H. Lakey; Gregor Anderluh

  Science Advances, 2022年03月11日

  
• A Synthetic Multidomain Peptide That Drives a Macropinocytosis-Like Mechanism for Cytosolic Transport of Exogenous Proteins into Plants

  Takaaki Miyamoto; Kiminori Toyooka; Jo-Ann Chuah; Masaki Odahara; Mieko Higchi-Takeuchi; Yumi Goto; Yoko Motoda; Takanori Kigawa; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  JACS Au, 2022年01月24日

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• Darwin's bark spider shares a spidroin repertoire with Caerostris extrusa but achieves extraordinary silk toughness through gene expression

  Nobuaki Kono; Rintaro Ohtoshi; Ali D. Malay; Masaru Mori; Hiroyasu Masunaga; Yuki Yoshida; Hiroyuki Nakamura; Keiji Numata; Kazuharu Arakawa

  Open Biology, 2021年12月

  
• Imaging of the Entry Pathway of a Cell-Penetrating Peptide-DNA Complex From the Extracellular Space to Chloroplast Nucleoids Across Multiple Membranes in Arabidopsis Leaves.

  Kazusato Oikawa; Ayaka Tateishi; Masaki Odahara; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  Frontiers in plant science, 2021年

  
• Plastics to fertilizers: chemical recycling of a bio-based polycarbonate as a fertilizer source

  Takumi Abe; Rikito Takashima; Takehiro Kamiya; Choon Pin Foong; Keiji Numata; Daisuke Aoki; Hideyuki Otsuka

  Green Chemistry, 2021年

  
• Direct introduction of neomycin phosphotransferase Ⅱ protein into apple leaves to confer kanamycin resistance

  Numata Keiji; Horii Yoko; Motoda Yoko; Hirai Narumi; Nishitani Chikako; Watanabe Satoru; Kigawa Takanori; Kodama Yutaka

  Ｐｌａｎｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ, 2016年

  
• The balance of crystalline and amorphous regions in the fibroin structure underpins the tensile strength of bagworm silk

  Nobuaki Kono; Hiroyuki Nakamura; Ayaka Tateishi; Keiji Numata; Kazuharu Arakawa

  Zoological Letters, 2021年12月

  
• Crystallization-induced mechanofluorescence for visualization of polymer crystallization

  Sota Kato; Shigeki Furukawa; Daisuke Aoki; Raita Goseki; Kazusato Oikawa; Kousuke Tsuchiya; Naohiko Shimada; Atsushi Maruyama; Keiji Numata; Hideyuki Otsuka

  Nature Communications, 2021年12月

  
• Mitochondrial movement during its association with chloroplasts in Arabidopsis thaliana

  Kazusato Oikawa; Takuto Imai; Chonprakun Thagun; Kiminori Toyooka; Takeshi Yoshizumi; Kazuya Ishikawa; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  Communications Biology, 2021年12月

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• Multicomponent nature underlies the extraordinary mechanical properties of spider dragline silk

  Nobuaki Kono; Hiroyuki Nakamura; Masaru Mori; Yuki Yoshida; Rintaro Ohtoshi; Ali D. Malay; Daniel A. Pedrazzoli Moran; Masaru Tomita; Keiji Numata; Kazuharu Arakawa

  Proceedings of the National Academy of Sciences, 2021年08月03日

  
• Draft whole-genome sequence of Bacillus paramycoides LB_RP2, a putative polyhydroxyalkanoate-producing bacterium isolated from an Amazonian blackwater river

  Lorena Mota de Castro; Choon Pin Foong; Mieko Higuchi-Takeuchi; Eraldo Ferreira Lopes; Keiji Numata; Suelen Dias da Silva; Luana da Silva Nonato; Adolfo José da Mota; José Odair Pereira

  MICROBIOLOGY, 2021年07月, 査読有り

  
• Nanoscale Polyion Complex Vesicles for Delivery of Cargo Proteins and Cas9 Ribonucleoprotein Complexes to Plant Cells

  Masaki Odahara; Kenta Watanabe; Riku Kawasaki; Kousuke Tsuchiya; Ayaka Tateishi; Yoko Motoda; Takanori Kigawa; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  ACS Applied Nano Materials, 2021年06月03日

  
• All-peptide-based polyion complex vesicles: Facile preparation and encapsulation of the protein in active form

  Seiya Fujita; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  ACS POLYMERS, 2021年06月, 査読有り

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• Visualization of the Necking Initiation and Propagation Processes during Uniaxial Tensile Deformation of Crystalline Polymer Films via the Generation of Fluorescent Radicals

  Sota Kato; Daisuke Aoki; Kazusato Oikawa; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata; Hideyuki Otsuka

  ACS Macro Letters, 2021年05月18日

  
• Construction and Piezoelectric Properties of a Single-Peptide Nanotube Composed of Cyclic β-peptides with Helical Peptides on the Side Chains

  Taichi Kurita; Tomoaki Terabayashi; Shunsaku Kimura; Keiji Numata; Hirotaka Uji

  Biomacromolecules, 2021年05月17日

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• Fusion Peptide-Based Biomacromolecule Delivery System for Plant Cells

  Kenta Watanabe; Masaki Odahara; Takaaki Miyamoto; Keiji Numata

  ACS Biomaterials Science & Engineering, 2021年04月26日

  
• Synthetic Mitochondria-Targeting Peptides Incorporating α-Aminoisobutyric Acid with a Stable Amphiphilic Helix Conformation in Plant Cells

  Kayo Terada; Joan Gimenez-Dejoz; Taichi Kurita; Kazusato Oikawa; Hirotaka Uji; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  ACS Biomaterials Science & Engineering, 2021年04月12日

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• Xanthurenic Acid Is the Main Pigment of Trichonephila clavata Gold Dragline Silk

  Masayuki Fujiwara; Nobuaki Kono; Akiyoshi Hirayama; Ali D. Malay; Hiroyuki Nakamura; Rintaro Ohtoshi; Keiji Numata; Masaru Tomita; Kazuharu Arakawa

  Biomolecules, 2021年04月12日

  
• Lipid Membrane Interaction of Peptide/DNA Complexes Designed for Gene Delivery

  Neval Yilmaz; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  Langmuir, 2021年02月09日

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• Reconsidering the “glass transition” hypothesis of intrinsically unstructured CAHS proteins in desiccation tolerance of tardigrades

  Kazuharu Arakawa; Keiji Numata

  Molecular Cell, 2021年02月

  
• Microbial prospection of an Amazonian blackwater lake and whole-genome sequencing of bacteria capable of polyhydroxyalkanoate synthesis

  Lorena M. Castro; Choon Pin Foong; Mieko Higuchi-Takeuchi; Kumiko Morisaki; Eraldo F. Lopes; Keiji Numata; Adolfo J. Mota

  Polymer Journal, 2021年01月08日

  
• Special issue: CO2: capture of, utilization of, and degradation into

  Koji Nakano; Yu Hoshino; Keiji Numata; Keiji Tanaka

  POLYMER JOURNAL, 2021年01月, 査読有り

  
• Effects of mitochondria-selective fluorescent probes on mitochondrial movement in arabidopsis mesophyll cells evaluated by using the quantification

  Kazusato Oikawa; Takuto Imai; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  Plant Biotechnology, 2021年

  
• Endosome-escaping micelle complexes dually equipped with cell-penetrating and endosome-disrupting peptides for efficient DNA delivery into intact plants

  Takaaki Miyamoto; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  Nanoscale, 2021年

  
• Aqueous spinning system with a citrate buffer for highly extensible silk fibers

  Jianming Chen; Yoshinori Ohta; Hiroyuki Nakamura; Hiroyasu Masunaga; Keiji Numata

  Polymer Journal, 2021年01月01日

  
• Peptide-Based Polyion Complex Vesicles That Deliver Enzymes into Intact Plants To Provide Antibiotic Resistance without Genetic Modification

  Seiya Fujita; Yoko Motoda; Takanori Kigawa; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2020年12月14日

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• Simultaneous effect of strain rate and humidity on the structure and mechanical behavior of spider silk

  Kenjiro Yazawa; Ali D. Malay; Hiroyasu Masunaga; Y. Norma-Rashid; Keiji Numata

  Communications Materials, 2020年12月

  
• Viscosity-adjustable grease matrices for serial nanocrystallography

  Michihiro Sugahara; Koji Motomura; Mamoru Suzuki; Tetsuya Masuda; Yasumasa Joti; Keiji Numata; Kensuke Tono; Makina Yabashi; Tetsuya Ishikawa

  Scientific Reports, 2020年12月

  
• A marine photosynthetic microbial cell factory as a platform for spider silk production

  Choon Pin Foong; Mieko Higuchi-Takeuchi; Ali D. Malay; Nur Alia Oktaviani; Chonprakun Thagun; Keiji Numata

  Communications Biology, 2020年12月, 査読有り

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• Peptide-Mediated Gene Transfer into Marine Purple Photosynthetic Bacteria

  Mieko Higuchi-Takeuchi; Takaaki Miyamoto; Choon Pin Foong; Mami Goto; Kumiko Morisaki; Keiji Numata

  International Journal of Molecular Sciences, 2020年11月

  
• Spider silk self-assembly via modular liquid-liquid phase separation and nanofibrillation

  Ali D. Malay; Takehiro Suzuki; Takuya Katashima; Nobuaki Kono; Kazuharu Arakawa; Keiji Numata

  Science Advances, 2020年11月

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• Development of Reactive Oxygen Species-Triggered Degradable Nanoparticles Using Oligoproline-Containing Peptides

  Riku Kawasaki; Kousuke Tsuchiya; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2020年10月12日, 査読有り

  
• Nearly complete 1H, 13C and 15N chemical shift assignment of monomeric form of N-terminal domain of Nephila clavipes major ampullate spidroin 2

  Nur Alia Oktaviani; Ali D. Malay; Akimasa Matsugami; Fumiaki Hayashi; Keiji Numata

  Biomolecular NMR Assignments, 2020年10月06日, 査読有り

  
• How to define and study structural proteins as biopolymer materials

  Keiji Numata

  Polymer Journal, 2020年09月22日, 査読有り

  
• Dual Peptide-Based Gene Delivery System for the Efficient Transfection of Plant Callus Cells

  Takaaki Miyamoto; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2020年07月13日, 査読有り

  
• High Capacity Functionalized Protein Superabsorbents from an Agricultural Co-Product: A Cradle-to-Cradle Approach

  Antonio Jose Capezza; Yuxiao Cui; Keiji Numata; Malin Lundman; William Roy Newson; Richard Tobias Olsson; Eva Johansson; Mikael Stefan Hedenqvist

  ADVANCED SUSTAINABLE SYSTEMS, 2020年07月, 査読有り

  
• Raman image-activated cell sorting

  Nao Nitta; Takanori Iino; Akihiro Isozaki; Mai Yamagishi; Yasutaka Kitahama; Shinya Sakuma; Yuta Suzuki; Hiroshi Tezuka; Minoru Oikawa; Fumihito Arai; Takuya Asai; Dinghuan Deng; Hideya Fukuzawa; Misa Hase; Tomohisa Hasunuma; Takeshi Hayakawa; Kei Hiraki; Kotaro Hiramatsu; Yu Hoshino; Mary Inaba; Yuki Inoue; Takuro Ito; Masataka Kajikawa; Hiroshi Karakawa; Yusuke Kasai; Yuichi Kato; Hirofumi Kobayashi; Cheng Lei; Satoshi Matsusaka; Hideharu Mikami; Atsuhiro Nakagawa; Keiji Numata; Tadataka Ota; Takeichiro Sekiya; Kiyotaka Shiba; Yoshitaka Shirasaki; Nobutake Suzuki; Shunji Tanaka; Shunnosuke Ueno; Hiroshi Watarai; Takashi Yamano; Masayuki Yazawa; Yusuke Yonamine; Dino Di Carlo; Yoichiroh Hosokawa; Sotaro Uemura; Takeaki Sugimura; Yasuyuki Ozeki; Keisuke Goda

  NATURE COMMUNICATIONS, 2020年07月, 査読有り

  
• Artificial cell-penetrating peptide containing periodic α-aminoisobutyric acid with long-term internalization efficiency in human and plant cells

  Kayo Terada; Joan Gimenez-Dejoz; Yu Miyagi; Kazusato Oikawa; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  ACS Biomaterials Science and Engineering, 2020年06月08日, 査読有り

  
• Zwitterionic Polypeptides: Chemoenzymatic Synthesis and Loosening Function for Cellulose Crystals

  Kousuke Tsuchiya; Neval Yilmaz; Takaaki Miyamoto; Hiroyasu Masunaga; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2020年05月11日

  
• Efficient callus induction and a temperature condition for flowering and seed setting in kenaf Hibiscus cannabinus.

  Masaki Odahara; Yoko Horii; Mitsuhiro Kimura; Keiji Numata

  Plant biotechnology (Tokyo, Japan), 2020年03月25日

  
• Surface Analysis of Native Spider Draglines by FE-SEM and XPS

  Hiromitsu Sogawa; Kyohei Nakano; Ayaka Tateishi; Keisuke Tajima; Keiji Numata

  Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2020年03月20日

  
• Carotenoids in the eyespot apparatus are required for triggering phototaxis in Euglena gracilis

  Shota Kato; Kazunari Ozasa; Mizuo Maeda; Yuri Tanno; Shun Tamaki; Mieko Higuchi-Takeuchi; Keiji Numata; Yutaka Kodama; Mayuko Sato; Kiminori Toyooka; Tomoko Shinomura

  PLANT JOURNAL, 2020年03月

  
• Method for the facile transformation of marine purple photosynthetic bacteria using chemically competent cells

  Mieko Higuchi‐Takeuchi; Kumiko Morisaki; Keiji Numata

  MicrobiologyOpen, 2020年01月22日

  
• Revealing the Architecture of the Cell Wall in Living Plant Cells by Bioimaging and Enzymatic Degradation

  Neval Yilmaz; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2020年01月13日

  
• Facile terminal functionalization of peptides by protease-catalyzed chemoenzymatic polymerization toward synthesis of polymeric architectures consisting of peptides

  Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  Polymer Chemistry, 2020年

  
• Silk/Natural Rubber (NR) and 3,4-Dihydroxyphenylalanine (DOPA)-Modified Silk/NR Composites: Synthesis, Secondary Structure, and Mechanical Properties

  Hiromitsu Sogawa; Korawit Treratanakulwongs; Hiroyasu Masunaga; Keiji Numata

  Molecules, 2020年01月

  
• Poly(alanine-nylon-alanine) as a bioplastic: chemoenzymatic synthesis, thermal properties and biological degradation effects

  Prashant G. Gudeangadi; Kei Uchida; Ayaka Tateishi; Kayo Terada; Hiroyasu Masunaga; Kousuke Tsuchiya; Hitoshi Miyakawa; Keiji Numata

  Polymer Chemistry, 2020年, 査読有り

  
• Computational study on the polymerization reaction of d-aminopeptidase for the synthesis of d-peptides

  Joan Gimenez-Dejoz; Kousuke Tsuchiya; Ayaka Tateishi; Yoko Motoda; Takanori Kigawa; Yasuhisa Asano; Keiji Numata

  RSC Advances, 2020年, 査読有り

  
• A covalently crosslinked silk fibroin hydrogel using enzymatic oxidation and chemoenzymatically synthesized copolypeptide crosslinkers consisting of a GPG tripeptide motif and tyrosine: control of gelation and resilience

  Hiromitsu Sogawa; Takuya Katashima; Keiji Numata

  Polymer Chemistry, 2020年, 査読有り

  
• Cellular internalization mechanism of novel Raman probes designed for plant cells

  Keiko Midorikawa; Kousuke Tsuchiya; Simon Sau Yin Law; Yu Miyagi; Takuya Asai; Takanori Iino; Yasuyuki Ozeki; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  RSC Chemical Biology, 2020年, 査読有り

  
• Simultaneous introduction of multiple biomacromolecules into plant cells using a cell-penetrating peptide nanocarrier

  Chonprakun Thagun; Yoko Motoda; Takanori Kigawa; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  Nanoscale, 2020年, 査読有り

  
• Targeted Gene Delivery into Various Plastids Mediated by Clustered Cell‐Penetrating and Chloroplast‐Targeting Peptides

  Chonprakun Thagun; Jo‐Ann Chuah; Keiji Numata

  Advanced Science, 2019年12月23日

  
• Integrating tough Antheraea pernyi silk and strong carbon fibres for impact-critical structural composites

  Kang Yang; Juan Guan; Keiji Numata; Change Wu; Sujun Wu; Zhengzhong Shao; Robert O. Ritchie

  Nature Communications, 2019年12月

  
• Periodic introduction of aromatic units in polypeptides via chemoenzymatic polymerization to yield specific secondary structures with high thermal stability

  Kousuke Tsuchiya; Naruki Kurokawa; Joan Gimenez-Dejoz; Prashant G. Gudeangadi; Hiroyasu Masunaga; Keiji Numata

  Polymer Journal, 2019年12月01日

  
• The bagworm genome reveals a unique fibroin gene that provides high tensile strength

  Nobuaki Kono; Hiroyuki Nakamura; Rintaro Ohtoshi; Masaru Tomita; Keiji Numata; Kazuharu Arakawa

  Communications Biology, 2019年12月

  
• Vacuum/Compression Infiltration-mediated Permeation Pathway of a Peptide-pDNA Complex as a Non-Viral Carrier for Gene Delivery in Planta

  Keiko Midorikawa; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  Scientific Reports, 2019年12月

  
• Biomaterials Science and Engineering in Japan: Attractive, Multidisciplinary, and Essential Research Field in Japan

  Akira Matsumoto; Keiji Numata

  ACS Biomaterials Science & Engineering, 2019年11月11日

  
• Mechanistic Insights into Silk Fibroin’s Adhesive Properties via Chemical Functionalization of Serine Side Chains

  Cooper J. Love; Bogdan A. Serban; Takuya Katashima; Keiji Numata; Monica A. Serban

  ACS Biomaterials Science & Engineering, 2019年11月11日

  
• 3,4-Dihydroxyphenylalanine (DOPA)-Containing Silk Fibroin: Its Enzymatic Synthesis and Adhesion Properties

  Hiromitsu Sogawa; Nao Ifuku; Keiji Numata

  ACS Biomaterials Science & Engineering, 2019年11月11日

  
• Native protein delivery into rice callus using ionic complexes of protein and cell-penetrating peptides

  Boyang Guo; Maria Gasset; Jun Itami; Kazusato Oikawa; Yoko Motoda; Takanori Kigawa; Keiji Numata

  PLOS ONE, 2019年07月30日

  
• Insights into the Stereospecificity in Papain-Mediated Chemoenzymatic Polymerization from Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Simulations

  Joan Gimenez-Dejoz; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  ACS Chemical Biology, 2019年06月21日

  
• Molecular Interactions and Toughening Mechanisms in Silk Fibroin–Epoxy Resin Blend Films

  Kang Yang; Kenjiro Yazawa; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata; Juan Guan

  Biomacromolecules, 2019年06月10日

  
• Cell-Penetrating Peptide-Mediated Transformation of Large Plasmid DNA into Escherichia coli

  Md Monirul Islam; Masaki Odahara; Takeshi Yoshizumi; Kazusato Oikawa; Mitsuhiro Kimura; Masayuki Su’etsugu; Keiji Numata

  ACS Synthetic Biology, 2019年05月17日

  
• Optimal iron concentrations for growth-associated polyhydroxyalkanoate biosynthesis in the marine photosynthetic purple bacterium Rhodovulum sulfidophilum under photoheterotrophic condition

  Choon Pin Foong; Martin Koller; Mieko Higuchi-Takeuchi; Keiji Numata

  PLOS ONE, 2019年04月29日

  
• Role of Skin Layers on Mechanical Properties and Supercontraction of Spider Dragline Silk Fiber

  Kenjiro Yazawa; Ali D. Malay; Hiroyasu Masunaga; Keiji Numata

  Macromolecular Bioscience, 2019年03月19日

  
• Block Copolymer/Plasmid DNA Micelles Postmodified with Functional Peptides via Thiol–Maleimide Conjugation for Efficient Gene Delivery into Plants

  Takaaki Miyamoto; Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2019年02月11日

  
• Development of regenerated silk films coated with fluorinated polypeptides to achieve high water repellency and biodegradability in seawater

  Kousuke Tsuchiya; Nao Ifuku; Yasuhito Koyama; Keiji Numata

  Polymer Degradation and Stability, 2019年02月

  
• Ion effects on the conformation and dynamics of repetitive domains of a spider silk protein: implications for solubility and β-sheet formation

  Nur Alia Oktaviani; Akimasa Matsugami; Fumiaki Hayashi; Keiji Numata

  Chemical Communications, 2019年

  
• Screening of a Cell-Penetrating Peptide Library in Escherichia coli: Relationship between Cell Penetration Efficiency and Cytotoxicity

  Kazusato Oikawa; Md Monirul Islam; Yoko Horii; Takeshi Yoshizumi; Keiji Numata

  ACS Omega, 2018年12月31日

  
• Library screening of cell-penetrating peptide for BY-2 cells, leaves of Arabidopsis, tobacco, tomato, poplar, and rice callus

  Keiji Numata; Yoko Horii; Kazusato Oikawa; Yu Miyagi; Taku Demura; Misato Ohtani

  Scientific Reports, 2018年12月

  
• Conformation and dynamics of soluble repetitive domain elucidates the initial β-sheet formation of spider silk

  Nur Alia Oktaviani; Akimasa Matsugami; Ali D. Malay; Fumiaki Hayashi; David L. Kaplan; Keiji Numata

  Nature Communications, 2018年12月

  
• Spider dragline silk composite films doped with linear and telechelic polyalanine: Effect of polyalanine on the structure and mechanical properties

  Kousuke Tsuchiya; Takaoki Ishii; Hiroyasu Masunaga; Keiji Numata

  Scientific Reports, 2018年12月

  
• Two Birds with One Stone: Spontaneous Size Separation and Growth Inhibition of Femtosecond Laser-Generated Surfactant-Free Metallic Nanoparticles via ex Situ SU-8 Functionalization

  Dongshi Zhang; Wonsuk Choi; Kenjiro Yazawa; Keiji Numata; Ayaka Tateishi; Sung-Hak Cho; Hsiu-Pen Lin; Yaw Kuen Li; Yoshihiro Ito; Koji Sugioka

  ACS Omega, 2018年09月30日

  
• Interplay between Silk Fibroin’s Structure and Its Adhesive Properties

  Erik R. Johnston; Yu Miyagi; Jo-Ann Chuah; Keiji Numata; Monica A. Serban

  ACS Biomaterials Science & Engineering, 2018年08月13日

  
• Combination of Amorphous Silk Fiber Spinning and Postspinning Crystallization for Tough Regenerated Silk Fibers

  Kenjiro Yazawa; Ali D. Malay; Nao Ifuku; Takaoki Ishii; Hiroyasu Masunaga; Takaaki Hikima; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2018年06月11日

  
• Selective Gene Delivery for Integrating Exogenous DNA into Plastid and Mitochondrial Genomes Using Peptide–DNA Complexes

  Takeshi Yoshizumi; Kazusato Oikawa; Jo-Ann Chuah; Yutaka Kodama; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2018年05月14日

  
• Stimulus-Responsive Peptide for Effective Delivery and Release of DNA in Plants

  Jo-Ann Chuah; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2018年04月09日

  
• Silk Composite with a Fluoropolymer as a Water-Resistant Protein-Based Material

  Keiji Numata

  Polymers, 2018年04月

  
• Chemoenzymatic synthesis of polypeptides consisting of periodic di- and tri-peptide motifs similar to elastin

  Prashant G. Gudeangadi; Kousuke Tsuchiya; Takamasa Sakai; Keiji Numata

  Polymer Chemistry, 2018年

  
• Class I Polyhydroxyalkanoate Synthase from the Purple Photosynthetic Bacterium Rhodovulum sulfidophilum Predominantly Exists as a Functional Dimer in the Absence of a Substrate

  Mieko Higuchi-Takeuchi; Yoko Motoda; Takanori Kigawa; Keiji Numata

  ACS Omega, 2017年08月31日

  
• Silk Resin with Hydrated Dual Chemical-Physical Cross-Links Achieves High Strength and Toughness

  Keiji Numata; Nao Ifuku; Hiroyasu Masunaga; Takaaki Hikima; Takamasa Sakai

  Biomacromolecules, 2017年06月12日

  
• Liquid Crystalline Granules Align in a Hierarchical Structure To Produce Spider Dragline Microfibrils

  Ting-Yu Lin; Hiroyasu Masunaga; Ryota Sato; Ali D. Malay; Kiminori Toyooka; Takaaki Hikima; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2017年04月10日

  
• Hydroxyethyl cellulose matrix applied to serial crystallography

  Michihiro Sugahara; Takanori Nakane; Tetsuya Masuda; Mamoru Suzuki; Shigeyuki Inoue; Changyong Song; Rie Tanaka; Toru Nakatsu; Eiichi Mizohata; Fumiaki Yumoto; Kensuke Tono; Yasumasa Joti; Takashi Kameshima; Takaki Hatsui; Makina Yabashi; Osamu Nureki; Keiji Numata; Eriko Nango; So Iwata

  SCIENTIFIC REPORTS, 2017年04月, 査読有り

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• Tensile Reinforcement of Silk Films by the Addition of Telechelic-Type Polyalanine

  Kousuke Tsuchiya; Hiroyasu Masunaga; Keiji Numata

  Biomacromolecules, 2017年03月13日

  
• Analysis of repetitive amino acid motifs reveals the essential features of spider dragline silk proteins.

  Ali D Malay; Kazuharu Arakawa; Keiji Numata

  PloS one, 2017年

  
• Chemoenzymatic synthesis of a peptide containing nylon monomer units for thermally processable peptide material application

  Kenjiro Yazawa; Joan Gimenez-Dejoz; Hiroyasu Masunaga; Takaaki Hikima; Keiji Numata

  Polymer Chemistry, 2017年

  
• Relationships between physical properties and sequence in silkworm silks.

  Ali D Malay; Ryota Sato; Kenjiro Yazawa; Hiroe Watanabe; Nao Ifuku; Hiroyasu Masunaga; Takaaki Hikima; Juan Guan; Biman B Mandal; Siriporn Damrongsakkul; Keiji Numata

  Scientific reports, 2016年06月09日

  
• Oil-free hyaluronic acid matrix for serial femtosecond crystallography.

  Michihiro Sugahara; Changyong Song; Mamoru Suzuki; Tetsuya Masuda; Shigeyuki Inoue; Takanori Nakane; Fumiaki Yumoto; Eriko Nango; Rie Tanaka; Kensuke Tono; Yasumasa Joti; Takashi Kameshima; Takaki Hatsui; Makina Yabashi; Osamu Nureki; Keiji Numata; So Iwata

  Scientific reports, 2016年04月18日

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• Co-expression of Two Polyhydroxyalkanoate Synthase Subunits from Synechocystis sp PCC 6803 by Cell-Free Synthesis and Their Specific Activity for Polymerization of 3-Hydroxybutyryl-Coenzyme A

  Keiji Numata; Yoko Motoda; Satoru Watanabe; Takashi Osanai; Takanori Kigawa

  BIOCHEMISTRY, 2015年02月

  
• Understanding the Limitations in the Biosynthesis of Polyhydroxyalkanoate (PHA) from Lignin Derivatives

  Tomizawa, Satoshi; Chuah, Jo-Ann; Matsumoto, Keiji; Doi, Yoshiharu; Numata, Keiji

  Acs Sustainable Chemistry & Engineering, 2014年

  
• Synthesis of Homopolypeptides by Aminolysis Mediated by Proteases Encapsulated in Silica Nanospheres

  Baker, Peter J.; Patwardhan, Siddharth V.; Numata, Keiji

  Macromolecular Bioscience, 2014年

  
• Synthesis of Adhesive Peptides Similar to Those Found in Blue Mussel (Mytilus edulis) Using Papain and Tyrosinase

  Numata, Keiji; Baker, Peter James

  Biomacromolecules, 2014年

  
• Silk-Pectin Hydrogel with Superior Mechanical Properties, Biodegradability, and Biocompatibility

  Numata, Keiji; Yamazaki, Shoya; Katashima, Takuya; Chuah, Jo-Ann; Naga, Naofumi; Sakai, Takamasa

  Macromolecular Bioscience, 2014年

  
• Short One-Pot Chemo-Enzymatic Synthesis of L-Lysine and L-Alanine Diblock Co-Oligopeptides

  Fagerland, Jenny; Finne-Wistrand, Anna; Numata, Keiji

  Biomacromolecules, 2014年

  
• Recent Advances in Chemoenzymatic Peptide Syntheses

  Yazawa, Kenjiro; Numata, Keiji

  Molecules, 2014年

  
• Phasin Proteins Activate Aeromonas caviae Polyhydroxyalkanoate (PHA) Synthase but Not Ralstonia eutropha PHA Synthase

  Ushimaru, Kazunori; Motoda, Yoko; Numata, Keiji; Tsuge, Takeharu

  Applied and Environmental Microbiology, 2014年

  
• Pathway-Level Acceleration of Glycogen Catabolism by a Response Regulator in the Cyanobacterium Synechocystis Species PCC 6803

  Osanai, Takashi; Oikawa, Akira; Numata, Keiji; Kuwahara, Ayuko; Iijima, Hiroko; Doi, Yoshiharu; Saito, Kazuki; Hirai, Masami Yokota

  Plant Physiology, 2014年

  
• Modification of β-oxidation pathway in Ralstonia eutropha for production of poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyhexanoate) from soybean oil

  Insomphun Chayatip; Mifune Jun; Orita Izumi; Numata Keiji; Nakamura Satoshi; Fukui Toshiaki

  Journal of bioscience and bioengineering, 2014年

  
• Local gene silencing in plants via synthetic dsRNA and carrier peptide

  Numata, Keiji; Ohtani, Misato; Yoshizumi, Takeshi; Demura, Taku; Kodama, Yutaka

  Plant Biotechnology Journal, 2014年

  
• Biosynthesis of Polyhydroxyalkanoate by a Marine Bacterium Vibrio sp Strain Using Sugars, Plant Oil, and Unsaturated Fatty Acids as Sole Carbon Sources

  Satoshi Tomizawa; Jo-Ann Chuah; Misato Ohtani; Taku Demura; Keiji Numata

  GREEN POLYMER CHEMISTRY: BIOCATALYSIS AND MATERIALS II, 2013年

  
• Synthesis of poly- and oligo (hydroxyalkanoate)s by deep-sea bacteria, Colwellia spp., Moritella spp., and Shewanella spp

  Numata Keiji; Morisaki Kumiko; Tomizawa Satoshi; OHTANI Misato; DEMURA Taku; MIYAZAKI Masayuki; NOGI Yuichi; DEGUCHI Shigeru; DOI Yoshiharu

  Polymer journal, 2013年

  
• Rapid and Efficient Gene Delivery into Plant Cells Using Designed Peptide Carriers

  Lakshmanan, Manoj; Kodama, Yutaka; Yoshizumi, Takeshi; Sudesh, Kumar; Numata, Keiji

  Biomacromolecules, 2013年

  
• Proteinase K-Catalyzed Synthesis of Linear and Star Oligo(L-phenylalanine) Conjugates

  Ageitos, Jose M.; Baker, Peter J.; Sugahara, Michihiro; Numata, Keiji

  Biomacromolecules, 2013年

  
• Monitoring and kinetic analysis of the molecular interactions by which a repressor protein, PhaR, binds to target DNAs and poly[(R)-3-hydroxybutyrate]

  Yamada Miwa; Takahashi Shuntaro; Okahata Yoshio; Doi Yoshiharu; Numata Keiji

  AMB Express, 2013年

  
• Increased Bioplastic Production with an RNA Polymerase Sigma Factor SigE during Nitrogen Starvation in Synechocystis sp PCC 6803

  Osanai, Takashi; Numata, Keiji; Oikawa, Akira; Kuwahara, Ayuko; Iijima, Hiroko; Doi, Yoshiharu; Tanaka, Kan; Saito, Kazuki; Hirai, Masami Yokota

  DNA Research, 2013年

  
• Characterization of Site-Specific Mutations in a Short-Chain-Length/Medium-Chain-Length Polyhydroxyalkanoate Synthase: In Vivo and In Vitro Studies of Enzymatic Activity and Substrate Specificity

  Chuah, Jo-Ann; Tomizaw, Satoshi; Yamad, Miwa; Tsuge, Takeharu; Doi, Yoshiharu; Sudesh, Kumar; Numata, Keiji

  Applied and Environmental Microbiology, 2013年

  
• Biosynthesis and characterization of polyhydroxyalkanoate containing 5-hydroxyvalerate units: Effects of 5HV units on biodegradability, cytotoxicity, mechanical and thermal properties

  Chuah, Jo-Ann; Yamada, Miwa; Taguchi, Seiichi; Sudesh, Kumar; Doi, Yoshiharu; Numata, Keiji

  Polymer Degradation and Stability, 2013年

  
• Biopolymer-Based Nanoparticles for Drug/Gene Delivery and Tissue Engineering

  Nitta, Sachiko Kaihara; Numata, Keiji

  International Journal of Molecular Sciences, 2013年

  
• Biodegradability of nylon 4 film in a marine environment

  Tachibana, Koichiro; Urano, Yuichi; Numata, Keiji

  Polymer Degradation and Stability, 2013年

  
• Silk-Based Nanocomplexes with Tumor-Homing Peptides for Tumor-Specific Gene Delivery

  Numata, Keiji; Mieszawska-Czajkowska, Aneta J.; Kvenvold, Laura A.; Kaplan, David L.

  Macromolecular Bioscience, 2012年

  
• Chemoenzymatic Synthesis of Poly(L-alanine) in Aqueous Environment

  Baker, Peter James; Numata, Keiji

  Biomacromolecules, 2012年

  
• Chemo-enzymatic synthesis of peptide polymers and their application for gene delivery

  Numata, Keiji

  Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 2012年

  
• Biosynthesis of polyhydroxyal kanaotes by a novel facultatively anaerobic Vibrio sp. under marine conditions

  NUMATA K.

  Mar. Biotechnol., 2012年

  
• Biocompatible and Biodegradable Dual-Drug Release System Based on Silk Hydrogel Containing Silk Nanoparticles

  Numata, Keiji; Yamazaki, Shoya; Naga, Naofumi

  Biomacromolecules, 2012年

  
• Active Intermediates of Polyhydroxyalkanoate Synthase from Aeromonas caviae in Polymerization Reaction

  Numata, Keiji; Motoda, Yoko; Watanabe, Satoru; Tochio, Naoya; Kigawa, Takanori; Doi, Yoshiharu

  Biomacromolecules, 2012年

  
• State of Water, Molecular Structure, and Cytotoxicity of Silk Hydrogels

  Numata, Keiji; Katashima, Takuya; Sakai, Takamasa

  Biomacromolecules, 2011年

  
• Spider Silk-Based Gene Carriers for Tumor Cell-Specific Delivery

  Numata, Keiji; Reagan, Michaela R.; Goldstein, Robert H.; Rosenblatt, Michael; Kaplan, David L.

  Bioconjugate Chemistry, 2011年

  
• Dual biosyntheses of poly[(R)-3-hydroxybutyric acid] and silk protein for the fabrication of biofunctional bioplastic

  Numata, Keiji; Doi, Yoshiharu

  Polymer Journal, 2011年

  
• Differences in cytotoxicity of beta-sheet peptides originated from silk and amyloid beta

  NUMATA K.

  Macromol. Biosci., 2011年

  
• AFM Study of Morphology and Mechanical Properties of a Chimeric Spider Silk and Bone Sialoprotein Protein for Bone Regeneration

  Gomes, Silvia; Numata, Keiji; Leonor, Isabel B.; Mano, Joao F.; Reis, Rui L.; Kapan, David L.

  Biomacromolecules, 2011年

  
• Surface-patterned electrode bioreactor for electrical stimulation

  Tandon, Nina; Marsano, Anna; Maidhof, Robert; Numata, Keiji; Montouri-Sorrentino, Chrystina; Cannizzaro, Christopher; Voldman, Joel; Vunjak-Novakovic, Gordana

  Lab on a Chip, 2010年

  
• Silk-based gene carriers with cell membrane destabilizing peptides

  NUMATA K.

  Biomacromolecules, 2010年

  
• Reinforcing Silk Scaffolds with Silk Particles

  Rajkhowa, Rangam; Gil, Eun Seok; Kluge, Jonathan; Numata, Keiji; Wang, Lijing; Wang, Xungai; Kaplan, David L.

  Macromolecular Bioscience, 2010年

  
• Quantifying Osteogenic Cell Degradation of Silk Biomaterials

  Sengupta, Sejuti; Park, Sang-Hyug; Seok, Gil Eun; Patel, Atur; Numata, Keiji; Lu, Chia-Li; Kaplan, David L.

  Biomacromolecules, 2010年

  
• Mechanisms of enzymatic degradation of amyloid beta microfibrils generating nanofilaments and nanospheres related to cytotoxicity

  NUMATA K.

  Biochemistry, 2010年

  
• Mechanism of enzymatic degradation of beta-sheet crystals

  Numata, Keiji; Cebe, Peggy; Kaplan, David L.

  Biomaterials, 2010年

  
• Gene delivery mediated by recombinant silk proteins containing cationic and cell binding motifs

  NUMATA K.

  J. Control Release, 2010年

  
• Expression, Cross-Linking, and Characterization of Recombinant Chitin Binding Resilin

  Qin, Guokui; Lapidot, Shaul; Numata, Keiji; Hu, Xiao; Meirovitch, Sigal; Dekel, Mara; Podoler, Itai; Shoseyov, Oded; Kaplan, David L.

  Biomacromolecules, 2009年

  
• Bioengineered silk protein-based gene delivery systems

  NUMATA K.

  Biomaterials, 2009年

  
• Biodegradability of Poly(hydroxyalkanoate) Materials

  Numata, Keiji; Abe, Hideki; Iwata, Tadahisa

  Materials, 2009年

  
• Enzymatic processes for biodegradation of poly(hydroxyalkanoate)s crystals

  Numata, Keiji; Abe, Hideki; Doi, Yoshiharu

  Canadian Journal of Chemistry-Revue Canadienne De Chimie, 2008年

  
• Enzymatic degradation of monolayer for poly(lactide) revealed by real-time atomic force microscopy: Effects of stereochemical structure, molecular weight, and molecular branches on hydrolysis rates

  Numata, Keiji; Finne-Wistrand, Anna; Albertsson, Ann-Christine; Doi, Yoshiharu; Abe, Hideki

  Biomacromolecules, 2008年

  
• Branched Poly(lactide) synthesized by enzymatic polymerization : effects of molecular branches and stereochemistry on enzymatic degradation and alkaline hydrolysis

  NUMATA K.

  Biomacromolecules, 2007年

  
• Adsorption effects of poly (hydroxybutyric acid) depolymerase on chain-folding surface of polyester single crystals revealed by mutant enzyme and frictional force microscopy

  Numata, Keiji; Sato, Shun; Fujita, Masahiro; Tsuge, Takeharu; Iwata, Tadahisa; Doi, Yoshiharu; Abe, Hideki

  Polymer Degradation and Stability, 2007年

  
• Adsorption and hydrolysis reactions of poly(hydroxybutyric acid) depolymerases secreted from Ralstonia pickettii T1 and Penicillium funiculosum onto poly[(R)-3-hydroxybutyric acid]

  Numata, Keiji; Yamashita, Koichi; Fujita, Masahiro; Tsuge, Takeharu; Kasuya, Ken-ichi; Iwata, Tadahisa; Doi, Yoshiharu; Abe, Hideki

  Biomacromolecules, 2007年

  
• Adsorption of biopolyester depolymerase on silicon wafer and poly[(R)-3-hydroxybutyric acid] single crystal revealed by real-time AFM

  Numata, K; Kikkawa, Y; Tsuge, T; Iwata, T; Doi, Y; Abe, H

  Macromolecular Bioscience, 2006年

  
• Nonspecific hydrophobic interactions of a repressor protein, PhaR, with poly[(R)-3-hydroxybutyrate] film studied with a quartz crystal microbalance

  Yamashita, Koichi; Yamada, Miwa; Numata, Keiji; Taguchi, Seiichi

  Biomacromolecules, 2006年

  
• Enzymatic degradation processes of poly[(R)-3-hydroxybutyric acid] and poly[(R)-3-hydroxybutyric acid-co-(R)-3-hydroxyvaleric acid] single crystals revealed by atomic force microscopy: Effects of molecular weight and second-monomer composition on erosion rates

  Numata, K; Kikkawa, Y; Tsuge, T; Iwata, T; Doi, Y; Abe, H

  Biomacromolecules, 2005年

  
• Biosynthesis of polyhydroxyalkanoate (PHA) copolymer from fructose using wild-type and laboratory-evolved PHA synthases

  Tsuge, T; Yano, K; Imazu, S; Numata, K; Kikkawa, Y; Abe, H; Taguchi, S; Doi, Y

  Macromolecular Bioscience, 2005年

  
• In-situ atomic force microscopy observation of enzymatic degradation in poly(hydroxyalkanoic acid) thin films: Normal and constrained conditions

  Kikkawa, Y; Hirota, T; Numata, K; Tsuge, T; Abe, H; Iwata, T; Doi, Y

  Macromolecular Bioscience, 2004年

  
• Enzymatic degradation processes of lamellar crystals in thin films for poly[(R)-3-hydroxybutyric acid] and its copolymers revealed by real-time atomic force microscopy

  Numata, K; Hirota, T; Kikkawa, Y; Tsuge, T; Iwata, T; Abe, H; Doi, Y

  Biomacromolecules, 2004年

  

MISC

• Marine Purple Photosynthetic Bacteria as Sustainable Microbial Production Hosts

  Mieko Higuchi-Takeuchi; Keiji Numata

  Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2019年10月11日

  
• Enzyme-like amidolytic catalysis from optimized poly(N-isopropylacrylamide) microgel

  Yoke Ming Wong; Yu Hoshino; Kumar Sudesh; Yoshiko Miura; Keiji Numata

  ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, 2014年08月

  
• Macromol. Biosci. 7/2016

  Kousuke Tsuchiya; Keiji Numata

  Macromolecular Bioscience, 2016年07月01日

  
• XFEL施設SACLAでの連続フェムト秒結晶構造解析における微結晶輸送媒体の利用

  菅原道泰; 菅原道泰; 南後恵理子; 南後恵理子; 田中智之; 田中智之; 山下鮎美; 山下鮎美; 有馬登志; 有馬登志; 田中里枝; 田中里枝; 沼田圭司; 岩田想; 岩田想

  日本結晶学会年会講演要旨集, 2017年

  
• Synthesis of peptides with narrow molecular weight distributions via exopeptidase-catalyzed aminolysis of hydrophobic amino-acid alkyl esters

  Nitta Sachiko; Komatsu Ayaka; Ishii Taisei; Iwamoto Hiroyuki; Numata Keiji

  Polymer journal, 2016年09月

  
• Aeromonas caviae由来ポリヒドロキシアルカン酸合成酵素の活性中間体に関する研究

  元田容子; 渡部暁; 栃尾尚哉; 木川隆則; 土肥義治; 沼田圭司

  高分子学会予稿集(CD-ROM), 2012年

  
• ミトコンドリア-葉緑体間の相互作用解析

  及川和聡; 今井拓人; 児玉豊; 児玉豊; 沼田圭司

  日本植物生理学会年会(Web), 2019年

  
• ペプチド-DNA複合体を用いた葉緑体形質転換法効率化の試み

  及川和聡; 児玉豊; 沼田圭司

  日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集, 2018年

  
• 細胞内分解システム抑制による葉緑体形質転換効率化の試み

  及川和聡; 児玉豊; 児玉豊; 沼田圭司

  日本植物生理学会年会(Web), 2018年

  
• 化学酵素重合による天然を模倣したポリペプチド材料の合成 (特集 生体に優しく,賢い未来材料"生体適合材料")

  土屋 康佑; 沼田 圭司

  化学と工業 = Chemistry & chemical industry, 2017年06月

  
• ペプチド-DNA複合体のオルガネラへの輸送過程を視る

  及川和聡; 児玉豊; 沼田圭司

  日本植物学会大会研究発表記録, 2017年

  
• Poly(amino acid)s/polypeptides as potential functional and structural materials

  Numata Keiji

  Polymer journal, 2015年08月

  
• 2P-121 窒素関連レスポンスレギュレーターを用いたラン藻の糖代謝改変(代謝工学,一般講演)

  小山内 崇; 及川 彰; 沼田 圭司; 桑原 亜由子; 飯嶋 寛子; 斉藤 和季; 平井 優美

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2013年

  
• 2Ga08 シグマ因子SigE過剰発現によるシアノバクテリアバイオプラスチックの増産(代謝工学,一般講演)

  小山内 崇; 及川 彰; 沼田 圭司; 豊岡 公徳; 佐藤 繭子; 桑原 亜由子; 飯嶋 寛子; 土肥 義治; 斉藤 和季; 平井 優美

  日本生物工学会大会講演要旨集, 2012年

  
• Silk-based delivery systems of bioactive molecules

  Numata, Keiji; Kaplan, David L.

  Advanced Drug Delivery Reviews, 2010年

  

書籍等出版物

• Biopolymer science for proteins and peptides

  沼田, 圭司, 単著

  Elsevier, 2021年

  京大の蔵書を調べる：

  

受賞

• 2024年06月06日

  高分子学会, 高分子学会学術賞

  国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  沼田圭司
• 2024年03月07日

  日本学術振興会, 第２０回（令和５年度）日本学術振興会賞

  日本国, 国内外の国際的学術賞

  沼田圭司
• 2023年

  内閣府, 第5回日本オープンイノベーション大賞 科学技術政策担当大臣賞

  その他の賞

  沼田圭司
• 2022年

  一般財団法人フロンティアサロン財団, 第12回フロンティアサロン永瀬賞

  出版社・新聞社・財団等の賞

  沼田圭司
• 2021年

  一般財団法人バイオインダストリー協会, 第5回バイオインダストリー奨励賞

  国内学会・会議・シンポジウム等の賞

  沼田圭司
• 2021年06月

  繊維学会, 繊維学会賞
• 2020年08月

  American Chemical Society, The 2020 ACS Macro Letters/ Biomacromolecules/Macromolecules Young Investigator Award
• 2019年09月

  高分子学会, 旭化成賞
• 2019年09月

  日本植物細胞分子生物学会, 日本植物細胞分子生物学会 奨励賞
• 2018年08月

  BEPS 25th Anniversary Meeting, Bio-Environmental Polymer Society (BEPS), USA, The BEPS Outstanding Young Scientist Award
• 2018年04月

  文部科学省, 文部科学大臣表彰若手科学者賞
• 2017年

  Royal Society of Chemistry, UK, ChemComm Emerging Investigators
• 2016年

  American Chemical Society,, The most highly prolific authors for Biomacromolecules
• 2015年

  高分子学会 バイオ・高分子研究会, バイオ・高分子研究会 若手研究者奨励講演賞
• 2015年

  高分子学会 関西支部, 第61回高分子研究発表会 ヤングサイエンティスト講演賞
• 2014年05月

  高分子学会, Polymer Journal 論文賞-日本ゼオン賞
• 2014年05月

  高分子学会, 高分子研究奨励賞
• 2012年

  理化学研究所, 平成23年度 理化学研究所 研究奨励賞
• 2009年

  JSPS, リンダウノーベル賞受賞者会議（化学）派遣

外部資金：科学研究費補助金

• 分解産物の精密解析と生物環境への影響評価

  学術変革領域研究(B)

  学術変革領域研究区分(Ⅱ)

  京都大学

  沼田 圭司

  自 2020年10月02日, 至 2023年03月31日, 完了

  生分解性高分子;オリゴマー;細胞毒性;環境毒性;高分子精密分解;生分解性ポリエステル;高分子の生分解

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PLANNED-20H05735/
• 精密高分子分解を志向した高分子解析基盤

  学術変革領域研究(B)

  学術変革領域研究区分(Ⅱ)

  京都大学

  沼田 圭司

  自 2020年10月02日, 至 2023年03月31日, 完了

  生分解性高分子;オリゴマー;細胞毒性;環境毒性;高分子精密分解;生分解性ポリエステル;高分子の精密分解

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-ORGANIZER-20H05732/
• 高分子材料と高分子鎖の精密分解科学

  学術変革領域研究(B)

  自 2020年10月02日, 至 2023年03月31日

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-AREA-20B203/
• 植物細胞壁を模倣したシルク-ペクチンハイドロゲルの創成とサンゴ再生基盤への利用

  若手研究(B)

  国立研究開発法人理化学研究所

  沼田 圭司

  自 2013年04月01日, 至 2016年03月31日, 完了

  シルク;ネットワーク構造;サンゴ;ゲル;ベータシート構造;高分子材料;ペクチン

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25810110/
• 乳癌細胞をターゲットとした複数の機能性ペプチドから成る遺伝子ベクターの開発

  若手研究(B)

  独立行政法人理化学研究所

  沼田 圭司

  自 2011年04月01日, 至 2013年03月31日, 完了

  ペプチド;シルク;遺伝子デリバリー;癌細胞

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23750264/
• いつ、どこで、どのように、核酸の高次構造は形成し機能するのかを予測する

  基盤研究(S)

  大区分E

  甲南大学

  杉本 直己

  自 2022年04月27日, 至 2027年03月31日, 交付

  核酸構造;細胞内環境;エネルギーデータベース;熱安定性予測;遺伝子発現

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22H04975/
• オルガネラへの核酸および生理活性分子導入

  学術変革領域研究(A)

  学術変革領域研究区分(Ⅲ)

  京都大学

  沼田 圭司

  自 2024年04月01日, 至 2029年03月31日, 交付

  ナノキャリア;ミトコンドリア

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PLANNED-24H02272/
• 細胞内共生オルガネラのゲノム制御：技術革新から生命現象の理解と応用へ

  学術変革領域研究(A)

  学術変革領域研究区分(Ⅲ)

  東京大学

  有村 慎一

  自 2024年04月01日, 至 2029年03月31日, 交付

  オルガネラゲノム;葉緑体ゲノム;ミトコンドリアゲノム;細胞内共生;ゲノム編集

  https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-ORGANIZER-24H02270/

外部資金：その他

• ひずみ誘起結晶化機構の解明と最大化による エラストマーの革新的強靭化

  JST, CREST

  自 2020年11月01日, 至 2025年03月31日

  浦山健治

  沼田圭司
• 極限アスペクト比（EXAR）ナノ材料の学際的研究

  JST, 先端国際共同研究推進事業ASPIRE

  自 2024年02月01日, 至 2029年03月31日

  塩見淳一郎

  沼田圭司
• ゼロカーボンバイオ産業創出による資源循環共創拠点

  JST, COI-NEXT 共創の場形成支援プログラム

  自 2021年07月01日, 至 2031年03月31日

  沼田圭司
• 京都大学拠点（バイオ・高分子マテリアル／高度循環マテリアル領域）

  文部科学省, データ創出・活用型マテリアル研究開発プロジェクト

  自 2021年11月01日, 至 2031年03月31日

  沼田圭司

教育

担当科目

• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  生命化学基礎

  7107, 前期, 工学部, 2
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  理工化学概論

  7501, 前期, 工学部, 2
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  化学のフロンティア（創成化学）

  7127, 前期, 工学部, 2
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  生体関連物質化学（創成化学）

  7118, 前期, 工学部, 2
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  高分子材料合成特論

  S022, 後期, 工学研究科, 2
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  バイオ・高分子マテリアルDX論

  H036, 後期, 工学研究科, 1.5
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  高分子材料化学

  H007, 前期, 工学研究科, 1.5
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  分子機能と複合・集積機能

  H404, 前期, 工学研究科, 1.5
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  工業化学概論

  7405, 前期, 工学部, 2
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  化学のフロンティア（創成化学）

  7127, 前期, 工学部, 2
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  生体関連物質化学（創成化学）

  7118, 前期, 工学部, 2
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  生命化学基礎

  7107, 前期, 工学部, 2
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  高分子材料合成特論

  S022, 後期, 工学研究科, 2
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  化学から生物へ生物から化学へ

  H409, 後期, 工学研究科, 1.5
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  分子機能と複合・集積機能

  H404, 前期, 工学研究科, 1.5
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  生体材料化学

  H031, 後期, 工学研究科, 1.5
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  高分子材料化学

  H007, 前期, 工学研究科, 1.5
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  高分子材料化学

  H007, 前期, 工学研究科, 1.5
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  材料化学特論第二

  P056, 後期集中, 工学研究科, 0.5
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  材料化学特論第一

  P055, 前期集中, 工学研究科, 0.5
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  研究論文

  D099, 通年集中, 工学研究科, 0
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  材料化学総論

  P110, 前期集中, 工学研究科, 0.5
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  工業化学概論

  7405, 前期, 工学部, 2
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  材料化学特別実験及演習

  D037, 通年集中, 工学研究科, 8
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  ディメンジョンの制御とナノ・マイクロ化学

  H403, 後期, 工学研究科, 1.5
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  化学産業特論

  P111, 前期集中, 工学研究科, 0.5
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  高分子材料合成特論

  S022, 後期, 工学研究科, 2
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  化学のフロンティア（創成化学）

  7127, 前期, 工学部, 2
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  生体関連物質化学（創成化学）

  7118, 前期, 工学部, 2
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  分子機能と複合・集積機能

  H404, 前期, 工学研究科, 1.5
• 自 2021年04月, 至 2022年03月

  化学のフロンティア（創成化学）

  前期, 工学部
• 自 2021年04月, 至 2022年03月

  化学から生物へ生物から化学へ

  後期, 工学研究科
• 自 2021年04月, 至 2022年03月

  工学序論

  前期集中, 工学部
• 自 2021年04月, 至 2022年03月

  生体材料化学

  後期, 工学研究科
• 自 2021年04月, 至 2022年03月

  生体関連物質化学（創成化学）

  前期, 工学部
• 自 2021年04月, 至 2022年03月

  高分子材料化学

  前期, 工学研究科
• 自 2021年04月, 至 2022年03月

  高分子材料合成特論

  後期, 工学研究科

博士学位審査

• Development of analytical techniques for biomedical applications toward point-of-care testing devices(ポイントオブケア検査装置に向けた生物医学的応用のための分析技術の開発)

  Manmana Yanawut, 工学研究科, 副査

  2022年09月26日

指導学生の業績：受賞

• 京都大学教育研究振興財団 在外研究助成

  栗田太一, 京都大学教育研究振興財団, 2024年06月07日
• 大学院教育支援機構（DoGS）海外渡航助成金

  栗田太一, 京都大学大学院, 2024年06月05日
• ACS Young Scientist Poster Award

  栗田太一, 文科省マテリアルDx拠点事業京大拠点シンポジウム, 2024年03月05日
• 優秀ポスター賞

  栗田太一, 文科省マテリアルDx拠点事業京大拠点 若手研究者 WORKSHOP2023 OSAKA, 2023年10月12日
• JSPS HOPE Fellow

  栗田太一, JSPS, 2023年02月27日
• 第12回CSJ化学フェスタ2022 CSJ Poster Presentation Award 2022 for Excellent Research

  栗田太一, 第12回CSJ化学フェスタ2022, 2022年12月02日
• ACS Biomaterials Science and Engineering award

  栗田太一, JST ERATOシンポジウム, 2022年03月25日
• 令和6年度第1回資源循環共創会議優秀ポスター賞

  阿部直哉, JST COI-Nextシンポジウム, 2024年06月17日
• Science and Technology of Advanced Materials YOUNG SCIENTIST AWARD 2024

  阿部直哉, 文科省マテリアルDx拠点事業京大拠点シンポジウム, 2024年03月05日
• 令和5年度京都大学大学院工学研究科馬詰研究奨励賞

  阿部直哉, 京都大学大学院工学研究科, 2023年05月31日
• CSJ Poster Presentation Award 2022 for Excellent Research

  阿部直哉, 第12回CSJ化学フェスタ2022, 2022年11月30日
• 優秀ポスター賞

  阿部直哉, ERATO沼田オルガネラ反応クラスタープロジェクト成果報告会, 2022年03月17日
• 第70回高分子学会年次大会優秀ポスター賞

  阿部直哉, 高分子学会年次大会優秀ポスター賞, 2021年05月28日
• Science and Technology of Advanced Materials YOUNG SCIENTIST AWARD 2024

  古市晃崇, 文科省マテリアルDx拠点事業京大拠点シンポジウム, 2024年03月04日
• ERATOシンポジウムポスター賞

  古市晃崇, JST ERATOプロジェクトシンポジウム, 2023年03月03日
• 令和6年度京都大学大学院工学研究科馬詰研究奨励賞

  中理沙, 京都大学大学院工学研究科, 2024年07月08日
• Science and Technology of Advanced Materials YOUNG SCIENTIST AWARD 2024

  中理沙, 文科省マテリアルDx拠点事業シンポジウム, 2024年03月04日
• CSJ Poster Presentation Award 2023 for Excellent Research

  中理沙, 第13回CSJ化学フェスタ2023, 2023年12月01日
• ERATOシンポジウムポスター賞

  中理沙, ERATOシンポジウム, 2023年03月03日
• 国際ソロプチミスト京都大学院女子学生・大学女子学生奨学金

  中理沙, 2023年01月01日
• CSJ Poster Presentation Award 2022 for Excellent Research

  中理沙, 第12回CSJ化学フェスタ2022, 2022年12月02日
• 京都大学工学研究科海外派遣プログラム

  中理沙, 2022年05月13日
• 令和4年度吉田卒業研究・論文賞

  中理沙, 2022年07月08日
• ポスター賞

  武村翔吾, CSJ化学フェスタ
• 高分子学会ポスター賞

  葛本真子, 高分子学会, 2022年05月25日
• 高分子討論会ポスター賞

  西井洸太, 高分子討論会, 2022年09月05日

大学運営

全学運営(役職等)

• 自 2022年04月01日, 至 2024年03月31日

  利益相反審査委員会 委員

部局運営(役職等)

• 工学研究科附属情報センター運営委員会　委員
• 自 2022年04月01日, 至 2023年03月31日

  材料化学専攻長
• 自 2021年04月01日, 至 2023年03月31日

  工学研究科・工学部広報委員会　委員

学術・社会貢献

委員歴

• 自 2022年, 至 現在

  関西支部 幹事, 繊維学会
• 自 2021年, 至 現在

  ACS Polymers Au Editorial Advisory Board, American Chemical Society
• 自 2021年, 至 現在

  14. 羽ばたく女性研究者賞（マリア・スクウォドフスカ＝キュリー賞）（JST、ポーランド大使館） 選考委員, JST、ポーランド大使館
• 自 2020年, 至 現在

  CSJ化学フェスタ実行委員, 日本化学会
• 自 2019年, 至 現在

  Editorial Advisory Board of Biomacromolecules, American Chemical Society
• 自 2019年, 至 現在

  国際標準化委員会 委員, 一般社団法人 構造タンパク質素材産業推進協会
• 自 2018年, 至 現在

  バイオ高分子研究会 運営委員, 高分子学会
• 自 2017年, 至 現在

  Editorial Board of Scientific Reports, Springer-Nature
• 自 2021年, 至 2028年

  CREST研究領域「分解・劣化・安定化の精密材料科学」（研究総括：高原淳 九州大学特任教授）領域アドバイザー, JST
• 自 2022年, 至 2027年

  ACT-X研究領域「生命現象と機能性物質」（研究総括：豊島陽子 東京大学 教授）領域アドバイザー, JST
• 自 2021年, 至 2023年

  生体機能関連化学部会 幹事, 日本化学会
• 自 2021年, 至 2022年

  旭化成賞選考委員, 高分子学会