基本情報

協力講座

• エネルギー科学研究科, エネルギー基礎科学専攻 エネルギー物質科学講座, 准教授

所属学協会

• 日本分光学会
• 日本生物物理学会
• 日本核磁気共鳴学会
• 日本RNA学会
• 日本蛋白質科学会
• 日本分子生物学会
• The Biophysical Society

学位

• 修士（工学）(横浜国立大学)
• 博士（工学）(横浜国立大学)

出身大学院・研究科等

• 横浜国立大学, 大学院工学研究科物質工学専攻博士課程後期, 修了
• 横浜国立大学, 大学院工学研究科物質工学専攻博士課程前期, 修了

出身学校・専攻等

• 横浜国立大学, 工学部物質工学科, 卒業

経歴

• 自 2013年06月, 至 現在

  京都大学, エネルギー理工学研究所, 准教授
• 自 2011年09月, 至 2013年05月

  京都大学, エネルギー理工学研究所, 助教
• 自 2009年04月, 至 2011年08月

  横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 助教
• 自 2008年04月, 至 2009年03月

  横浜市立大学, 国際総合科学部, 助教
• 自 2006年04月, 至 2008年03月

  横浜市立大学, 国際総合科学部, 助手
• 自 2004年04月, 至 2006年03月

  理化学研究所, ゲノム科学研究センター, 研究員
• 自 2002年08月, 至 2004年03月

  理化学研究所, ゲノム科学研究センター, リサーチアソシエイト
• 自 1998年08月, 至 2002年07月

  米ロックフェラー大学, 生物物理学研究室, リサーチアソシエイト
• 自 1992年04月, 至 1994年03月

  三菱化学生命科学研究所, 生物工学研究部門, 特別研究生

プロフィール

• プロフィール

  持続可能な開発目標(SDGs)を達成するため、構造生命科学的アプローチにより貢献したいと考えています。２つのテーマを設定しています。脱炭素社会実現に向けたテーマでは、木質バイオマスを解重合または変換する酵素の探索と構造機能相関解析、酵素の機能高度化、木質バイオマス由来の基幹物質の探索・効率の良い前処理方法の開発等を行っています。生命医科学のテーマでは、がん、白血病、神経疾患や感染症などに関わるタンパク質および核酸の構造機能相関解析を行い、疾病発症の分子機構の解明、さらには創薬開発に向けた分子基盤の確立を目指しています。日々、NMR実験と立体構造および分子運動の解析を楽しんでいます。また最近は、AI技術を使った各種モデリングやドッキングを個人のパソコンを使ってゲーム感覚で試しています。

使用言語

• 英語

ID,URL

• J-Global ID

  201201058893463242

researchmap URL

• https://researchmap.jp/nagatat81

研究

研究テーマ・研究概要

• 研究テーマ

  エネルギー科学と生命医科学の問題に分子レベルで挑む

• 研究概要

  持続可能な開発目標(SDG)を達成するため、構造生命科学的アプローチにより貢献したいと考えています。２つのテーマを設定しています。脱炭素社会実現に向けたテーマでは、草木バイオマスを分解する酵素の探索、構造機能相関解析、さらに高機能化を行い、エネルギーや化成品の原料の探索、それらを効率良く得るための分子基盤の確立を目指しています。生命医科学のテーマでは、癌やウィルス病などに関わるタンパク質や機能性核酸の構造機能相関解析を行い、病気発症の機構及び創薬開発に向けた分子基盤の確立を目指しています。2つのテーマは、共通のアプローチとして、NMR を主とした分光学にタンパク質工学、核酸化学、細胞工学などの手法を組み合わせて進めています（構造生命科学的アプローチ）。

研究キーワード

• 分子ドッキング
• ファーマコフォア
• HBV
• 酵母表面ディスプレイ
• X線回折
• FUS
• 三重鎖
• FAE
• フェルラ酸エステラーぜ
• 塩基対の開閉
• 核酸のダイナミクス
• in-cell NMR
• 溶解性多糖モノオキシゲナーゼ
• LPMO
• NMR
• 核磁気共鳴
• 液液相分離
• LLPS
• DNAオリガミ
• 蛋白質構造
• 核酸構造
• 立体構造
• 蛋白質-核酸相互作用
• 発現制御
• 翻訳制御
• 転写後調節
• 転写因子
• 天然変性
• 四重鎖
• グアニン四重鎖
• Gカルテット
• フォールディング
• スライディング
• HIV
• アミロイド
• Musashi
• APOBEC
• プリオン
• 進化分子工学
• ナノボディ
• VHH
• SELEX
• アプタマー
• 核酸医薬
• バイオマス
• 木質バイオマス
• 草本バイオマス
• リグニン多糖複合体
• LCC
• リグノセルロース
• リグニン
• ヘミセルロース
• きのこ
• グルクロニルエステラーゼ
• マンガンペルオキシダーゼ
• セルラーゼ
• 腐朽菌
• RNAアプタマー
• RNA工学
• 酵素
• 蛋白質工学
• 安定同位体
• ノンコーディングRNA
• 非コードRNA
• RNA結合蛋白質
• 蛋白質-蛋白質相互作用
• 核酸-蛋白質相互作用

研究分野

• ライフサイエンス, 機能生物化学
• ライフサイエンス, 薬系分析、物理化学
• ナノテク・材料, 生体化学
• ナノテク・材料, 生物分子化学
• ナノテク・材料, 分析化学
• ライフサイエンス, 生物物理学
• ライフサイエンス, 分子生物学
• ライフサイエンス, 構造生物化学

論文

• A physical picture of liquid-liquid phase separation of proteins

  Masahiro Kinoshita; Tomohiko Hyashi; Yuka Nakamura; Akira Yoshimori; Masato Katahira; Takashi Nagata

  Journal of Molecular Liquids, 2025年04月15日, 査読有り, 最終著者

  
• Recent progress of in-cell NMR of nucleic acids in living human cells.

  Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Tomoki Sakamoto; Masato Katahira

  Biophysical reviews, 2020年04月

  
• Observation of nucleic acids inside living human cells by in-cell NMR spectroscopy.

  Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Tomoki Sakamoto; Masato Katahira

  Biophysics and physicobiology, 2020年

  
• Selection and characterization of aptamers targeting the Vif-CBFβ-ELOB-ELOC-CUL5 complex

  Kazuyuki Kumagai; Keisuke Kamba; Takuya Suzuki; Yuto Sekikawa; Chisato Yuki; Michiaki Hamada; Kayoko Nagata; Akifumi Takaori-Kondo; Li Wan; Masato Katahira; Takashi Nagata; Taiichi Sakamoto

  The Journal of Biochemistry, 2024年05月13日, 査読有り, 責任著者

  
• ¹H, ¹³C, and ¹⁵N resonance assignments and solution structure of the N-terminal divergent caplonin homology (NN-CH) domain of human intraflagellar transport protein 54

  Kanako Kuwasako; Weirong Dang; Fahu He; Mari Takahashi; Kengo Tsuda; Takashi Nagata; Akiko Tanaka; Naohiro Kobayashi; Takanori Kigawa; Peter Gunter; Mikamo Shirouzu; Shigeyuki Yokoyama; Yutaka Muto

  Biomolecular NMR Assignments, 2024年03月29日, 査読有り

  
• Structure-based characterization and improvement of an enzymatic activity of Acremonium alcalophilum feruloyl esterase

  Apisan Phienluphon; Keiko Kondo; Bunzo Mikami; Kenneth Sze Kai Teo; Kaori Saito; Takashi Watanabe; Takashi Nagata; Masato Katahira

  ACS Sustainable Chemistry & Engineering, 2024年02月22日, 査読有り, 責任著者

  
• Structural insights into the interaction between the C-terminal-deleted BH3-like motif peptide of hepatitis B virus X protein and Bcl-xL

  Hideki Kusunoki; Taiichi Sakamoto; Naohiro Kobayashi; Toshiyuki Kohno; Kaori Wakamatsu; Takashi Nagata

  Biochemistry, 2024年03月05日, 査読有り, 責任著者

  
• Fluoride Ion in Alcohols: Isopropanol vs. Hexafluoroisopropanol

  Nozomi Yoneda; Haruka Iyama; Takashi Nagata; Masato Katahira; Yoshiki Ishii; Kohei Tada; Kazuhiko Matsumoto; Rika Hagiwara

  The Journal of Physical Chemistry Letters, 2024年02月05日, 査読有り

  
• Enhancing Bioethanol Production from Rice Straw through Environmentally Friendly Delignification Using Versatile Peroxidase

  Kenneth Sze Kai Teo; Keiko Kondo; Sadat Mohamed Rezk Khattab; Takashi Watanabe; Takashi Nagata; Masato Katahira

  Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2024年01月30日, 査読有り, 責任著者

  
• Boosting Sugarcane Trash Decomposition: Synergistic action and proximity effect of Xylanase and Feruloyl Esterase co-displayed on the cell surface of Pichia pastoris (Komagataella phaffi)

  Apisan Phienluphon; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  Sustainable Energy & Fuels, 2024年01月17日, 査読有り, 責任著者

  
• Understanding manganese peroxidase-catalyzed conversion of the lignin structure and its application for the polymerization of Kraft lignin

  Teo, Kenneth Sze Kai; Kondo, Keiko; Watanabe, Takashi; Nagata, Takashi; Katahira, Masato

  ACS Sustainable Chemistry & Engineering, 2024年01月, 査読有り, 責任著者

  
• Uniform¹³C/¹⁵N-labeling of DNA by tandem repeat amplification

  Werner, M.H.; Gupta, V.; Lambert, L.J.; Nagata, T.

  Methods in Enzymology, 2001年

  
• Direct inhibition of human APOBEC3 deaminases by HIV-1 Vif independent of the proteolysis pathway

  Keisuke Kamba; Li Wan; Satoru Unzai; Ryo Morishita; Akifumi Takaori-Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  Biophysical Journal, 2024年02月, 査読有り, 責任著者

  
• NMR characterization of the structure of the intrinsically disordered region of human origin recognition complex subunit 1, hORC1, and of its interaction with G-quadruplex DNAs

  Afaf Eladl; Yudai Yamaoki; Keisuke Kamba; Shoko Hoshina; Haruka Horinouchi; Keiko Kondo; Shou Waga; Takashi Nagata; Masato Katahira

  Biochemical and Biophysical Research Communications, 2023年10月, 査読有り

  
• Structural insights into the molecular mechanisms of substrate recognition and hydrolysis by feruloyl esterase from Aspergillus sydowii

  Apisan Phienluphon; Keiko Kondo; Bunzo Mikami; Takashi Nagata; Masato Katahira

  International Journal of Biological Macromolecules, 2023年09月30日, 査読有り, 責任著者

  
• Direct evidence of α ester linkages between lignin and glucuronoxylan that reveal the robust heteropolymeric complex in plant cell walls

  Hiroshi Nishimura; Kazuma Nagata; Takashi Nagata; Masato Katahira; Takashi Watanabe

  2022年02月08日

  
• Enhanced depolymerization of beech wood lignin and its removal with peroxidases through continuous separation of lignin fragments

  Kenneth Sze Kai Teo; Keiko Kondo; Kaori Saito; Yu Iseki; Takashi Watanabe; Takashi Nagata; Masato Katahira

  Green Chemistry, 2023年09月, 査読有り, 責任著者

  
• Complex Formation of an RNA Aptamer with a Part of HIV-1 Tat through Induction of Base Triples in Living Human Cells Proven by In-Cell NMR

  Omar Eladl; Yudai Yamaoki; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  International Journal of Molecular Sciences, 2023年05月22日, 査読有り

  
• Detection of interaction between an RNA aptamer and its target compound in living human cells using 2D in-cell NMR

  Eladl, O; Yamaoki, Y; Kondo, K; Nagata, T; Katahira, M

  Chemical Communications, 2022年11月29日, 査読有り, 責任著者

  
• Shedding light on the base-pair opening dynamics of nucleic acids in living human cells

  Yamaoki, Y; Nagata, T; Kondo, K; Sakamoto, T; Takami, S; Katahira, M

  Nature Communications, 2022年11月29日, 査読有り, 責任著者

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• Chemical shift assignments of a fusion protein comprising the C-terminal-deleted hepatitis B virus X protein BH3-like motif peptide and Bcl-xL

  Hideki Kusunoki; Isao Hamaguchi; Naohiro Kobayashi; Takashi Nagata

  Biomolecular NMR Assignments, 2022年08月31日, 査読有り, 責任著者

  
• Degradation of Lignin by Infrared Free Electron Laser

  Takayasu Kawasaki; Heishun Zen; Takeshi Sakai; Yoske Sumitomo; Kyoko Nogami; Ken Hayakawa; Toyonari Yaji; Toshiaki Ohta; Takashi Nagata; Yasushi Hayakawa

  Polymers, 2022年06月14日, 査読有り

  
• 1H, 13C, and 15N resonance assignments and solution structures of the KH domain of human ribosome binding factor A, mtRbfA, involved in mitochondrial ribosome biogenesis

  Kanako Kuwasako; Sakura Suzuki; Nobukazu Nameki; Masayuki Takizawa; Mari Takahashi; Kengo Tsuda; Takashi Nagata; Satoru Watanabe; Akiko Tanaka; Naohiro Kobayashi; Takanori Kigawa; Peter Güntert; Mikako Shirouzu; Shigeyuki Yokoyama; Yutaka Muto

  Biomolecular NMR Assignments, 2022年06月06日, 査読有り

  
• Functional and Structural Characterizations of Lytic Polysaccharide Monooxygenase, Which Cooperates Synergistically with Cellulases, from Ceriporiopsis subvermispora

  Huyen Nguyen; Keiko Kondo; Yusei Yagi; Yu Iseki; Nagi Okuoka; Takashi Watanabe; Bunzo Mikami; Takashi Nagata; Masato Katahira

  ACS Sustainable Chemistry & Engineering, 2022年01月04日, 査読有り, 責任著者

  
• 1H, 13C and 15N resonance assignments and solution structures of the two RRM domains of Matrin-3

  Fahu He; Kanako Kuwasako; Masayuki Takizawa; Mari Takahashi; Kengo Tsuda; Takashi Nagata; Satoru Watanabe; Akiko Tanaka; Naohiro Kobayashi; Takanori Kigawa; Peter Güntert; Mikako Shirouzu; Shigeyuki Yokoyama; Yutaka Muto

  Biomolecular NMR Assignments, 2021年11月16日, 査読有り

  
• Glyme-Lithium Bis(trifluoromethylsulfonyl)amide Super-concentrated Electrolytes: Salt Addition to Solvate Ionic Liquids Lowers Ionicity but Liberates Lithium Ions

  Kitada A; Koujin Y; Shimizu M; Kawata K; Yoshinaka C; Saimura M; Nagata T; Katahira M; Fukami K; Murase K

  Journal of The Electrochemical Society, 2021年09月03日, 査読有り

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• Detection of parallel and antiparallel DNA triplex structures in living human cells using in-cell NMR

  Sakamoto T; Yamaoki Y; Nagata T; Katahira M

  Chemical Communications, 2021年06月17日, 査読有り

  
• Non-coding RNA suppresses FUS aggregation caused by mechanistic shear stress on pipetting in a sequence-dependent manner

  Nesreen Hamad; Ryoma Yoneda; Masatomo So; Riki Kurokawa; Takashi Nagata; Masato Katahira

  Scientific Reports, 2021年05月04日, 査読有り

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• Investigation of the Interaction of Human Origin Recognition Complex Subunit 1 with G-Quadruplex DNAs of Human c-myc Promoter and Telomere Regions

  Afaf Eladl; Yudai Yamaoki; Shoko Hoshina; Haruka Horinouchi; Keiko Kondo; Shou Waga; Takashi Nagata; Masato Katahira

  International Journal of Molecular Sciences, 2021年03月27日, 査読有り

  
• An Ammonium Solvate Ionic Liquid

  Kio Kawata; Atsushi Kitada; Kazuhiro Fukami; Masayuki Saimura; Takashi Nagata; Masato Katahira; Kuniaki Murase

  Journal of The Electrochemical Society, 2021年02月17日, 査読有り

  
• Ligand Exchange Conduction of Lithium Ion in a Pentaglyme-Lithium Bis(trifluoromethylsulfonyl)amide Super-Concentrated Electrolyte

  Atsushi Kitada; Kio Kawata; Masahiro Shimizu; Masayuki Saimura; Takashi Nagata; Masato Katahira; Kazuhiro Fukami; Kuniaki Murase

  Journal of the Electrochemical Society, 2021年01月14日, 査読有り

  
• Nucleus accumbens-associated protein 1 binds DNA directly through the BEN domain in a sequence-specific manner

  Nakayama N; Sakashita G; Nagata T; Kobayashi N; Yoshida H; Park SY; Nariai Y; Kato H; Obayashi E; Nakayama K; Kyo S; Urano T

  Biomedicine, doi:10.3390/biomedicines8120608, 2020年12月14日, 査読有り

  
• Proton conduction in hydronium solvate ionic liquids affected by ligand shape

  Kio Kawata; Atsushi Kitada; Naoki Tsuchida; Masayuki Saimura; Takashi Nagata; Masato Katahira; Kazuhiro Fukami; Kuniaki Murase

  Physical Chemistry Chemical Physics, 2020年12月02日, 査読有り

  
• Development and structural determination of an anti-PrPC aptamer that blocks pathological conformational conversion of prion protein

  Tsukasa Mashima; Joon-Hwa Lee; Yuji O. Kamatari; Tomohiko Hayashi; Takashi Nagata; Fumiko Nishikawa; Satoshi Nishikawa; Masahiro Kinoshita; Kazuo Kuwata; Masato Katahira

  Scientific Reports, 2020年12月, 査読有り

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• NMR Elucidation of Nonproductive Binding Sites of Lignin Models with Carbohydrate-Binding Module of Cellobiohydrolase I

  Tokunaga Y; Nagata T; Kondo K; Katahira M; Watanabe T

  Biotechnology for Biofuels, 2020年10月07日, 査読有り

  
• Structural evaluation and protium-deuterium exchange in 1-ethyl-3-methylimidazolium halide-ethylene glycol mixtures

  Chen Z; Tonouchi Y; Matsumoto K; Tsuzuki S; Nagata T; Katahira M; Hagiwara R

  Journal of Fluorine Chemistry, 2020年10月, 査読有り

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• 1H, 13C and 15N resonance assignment of the YTH domain of YTHDC2

  Fahu He; Ryuta Endo; Kanako Kuwasako; Mari Takahashi; Kengo Tsuda; Takashi Nagata; Satoru Watanabe; Akiko Tanaka; Naohiro Kobayashi; Takanori Kigawa; Peter Güntert; Mikako Shirouzu; Shigeyuki Yokoyama; Yutaka Muto

  Biomolecular NMR Assignments, in press, 2020年09月15日, 査読有り

  
• Complete NMR assignment and analysis of molecular structural changes of β–O–4 lignin oligomer model compounds in organic media with different water content

  Yuki Tokunaga; Takashi Nagata; Keiko Kondo; Masato Katahira; Takashi Watanabe

  Holzforschung, 2020年08月28日, 査読有り

  
• Direct visualization of the conformational change of FUS/TLS upon binding to promoter-associated non-coding RNA

  Hamad N; Watanabe H; Uchihashi T; Kurokawa R; Nagata T; Katahira M

  Chemical Communications, 2020年07月, 査読有り

  
• Fluoride Ion Interactions in Alkali-Metal Fluoride–Diol Complexes

  Yuto Tonouchi; Kazuhiko Matsumoto; Takashi Nagata; Masato Katahira; Rika Hagiwara

  Inorganic Chemistry, 2020年05月04日, 査読有り

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• Suppression of Fast Proton Conduction by Dilution of a Hydronium Solvate Ionic Liquid: Localization of Ligand Exchange

  Kawata K; Kitada A; Tsuchida N; Saimura M; Nagata T; Katahira M; Fukami K; Murase K

  Journal of The Electrochemical Society, 2020年02月26日, 査読有り

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• RNA sequence and length contribute to RNA-induced conformational change of TLS/FUS

  Hamad N; Mashima T; Yamaoki Y; Kondo K; Yoneda R; Oyoshi T; Kurokawa R; Nagata T; Katahira M

  Scientific Reports, doi: 10.1038/s41598-020-59496-0, 2020年02月14日, 査読有り

  
• How Does the Recently Discovered Peptide MIP Exhibit Much Higher Binding Affinity than an Anticancer Protein p53 for an Oncoprotein MDM2?

  Tatsuya Yamada; Tomohiko Hayashi; Simon Hikiri; Naohiro Kobayashi; Hiroshi Yanagawa; Mitsunori Ikeguchi; Masato Katahira; Takashi Nagata; Masahiro Kinoshita

  Journal of Chemical Information and Modeling, 2019年08月26日, 査読有り

  
• An insight into the dependence of the deaminase rate of human APOBEC3F on the length of single-stranded DNA, which is affected by the concentrations of APOBEC3F and single-stranded DNA

  L. Wan; K. Kamba; T. Nagata; M. Katahira

  Biochimica et Biophysica Acta, 2019年04月, 査読有り, 招待有り, 責任著者

  
• Identification of key residues for activities of atypical glutathione S-transferase of Ceriporiopsis subvermispora, a selective degrader of lignin in woody biomass, by crystallography and functional mutagenesis

  O.W.H. Wan; B. Mikami; N. Saka; K. Kondo; M.I. Lin; T. Nagata; M. Katahira

  International Journal of Biological Macromolecules, 2019年03月, 査読有り, 責任著者

  
• The anti-prion RNA aptamer R12 disrupts the Alzheimer’s disease-related complex between prion and amyloid β

  M. Iida; T. Mashima; Y. Yamaoki; M. So; T. Nagata; M. Katahira

  FEBS J, doi: 10.1111/febs.14819, 2019年03月, 査読有り

  
• Structure of a serine-type glutathione S-transferase of Ceriporiopsis subvermispora and identification of the enzymatically important non-canonical residues by functional mutagenesis

  O.W.H. Wan; B. Mikami; N. Saka; K. Kondo; T. Nagata; M. Katahira

  Biochem. Biophys. Res. Commun., doi: 10.1016/j.bbrc.2019.01.076., 2019年02月, 査読有り, 責任著者

  
• NMR Analysis on Molecular Interaction of Lignin with Amino Acid Residues of Carbohydrate-Binding Module from Trichoderma reesei Cel7A

  Tokunaga, Y; Nagata, T; Suetomi, T; Oshiro, S; Kondo, K; Katahira, M; Watanabe, T

  Scientific Reports, doi: 10.1038/s41598-018-38410-9., 2019年02月, 査読有り

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• Versatility of RNA-Binding Proteins in Living Cells

  Riki Kurokawa; Akihide Takeuchi; Nobuyuki Shiina; Masato Katahira; Takefumi Yamashita; Yoko Matsuno; Keisuke Hitachi; Shinsuke Ishigaki; Nesreen Haamad; Ryoma Yoneda; Naomi Ueda; Kei Iida; Motoyasu Hosokawa; Masatoshi Hagiwara; Mamiko Iida; Tsukasa Mashima; Yudai Yamaoki; Masatomo So; Takashi Nagata; Gen Sobue; Keiko Kondo; Hiroki Watanabe; Takayuki Uchihashi

  Biomedical Sciences, 2019年, 査読有り

  
• Noise peak filtering in multi-dimensional NMR spectra using convolutional neural networks.

  Naohiro Kobayashi; Yoshikazu Hattori; Takashi Nagata; Shoko Shinya; Peter Güntert; Chojiro Kojima; Toshimichi Fujiwara

  Bioinformatics (Oxford, England), 2018年12月15日, 査読有り

  
• Classification of fungal glucuronoyl esterases (FGEs), and characterization of two new FGEs from Ceriporiopsis subvermispora and Pleurotus eryngii

  M.I. Lin; A. Hiyama; K. Kondo; T. Nagata; M. Katahira

  Applied Microbiology and Biotechnology, 2018年11月, 査読有り, 責任著者

  
• Paritally Naked Fluoride in Solvate Ionic Liquids

  Z. Chen; Y. Tonouchi; K. Matsumoto; M. Saimura; R. Atkin; T. Nagata; M. Katahira; R. Hagiwara

  The Journal of Physical Chemistry Letters, doi: 10.1021/acs.jpclett.8b03117., 2018年11月, 査読有り

  
• Characterization of the glutathione S-transferases that belong to the GSTFuA class in Ceriporiopsis subvermispora: Implications in intracellular detoxification and metabolism of wood-derived compounds

  Wan Hasnidah Wan Osman; Meng-I Lin; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  International Journal of Biological Macromolecules, 2018年07月01日, 査読有り, 責任著者

  
• High yield production of fungal manganese peroxidases by E. coli through soluble expression, and examination of the activities

  Meng-I Lin; Takashi Nagata; Masato Katahira

  Protein Expression and Purification, 2018年05月01日, 査読有り, 責任著者

  
• Utilizing NMR to study RNA- and compound-binding mechanisms of Musashi-1, a stem/progenitor cell marker in various normal and cancer cells

  T. Nagata

  Integrated Cancer Science and Therapeutics, 2018年04月, 査読有り, 招待有り, 責任著者

  
• Direct evidence for α ether linkage between lignin and carbohydrates in wood cell walls

  H. Nishimura; A. Kamiya; T. Nagata; M. Katahira; T. Watanabe

  Scientific Reports, doi: 10.1038/s41598-018-24328-9., 2018年04月, 査読有り

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• The first successful observation of in-cell NMR signals of DNA and RNA in living human cells

  Yudai Yamaoki; Ayaka Kiyoishi; Masayuki Miyake; Fumi Kano; Masayuki Murata; Takashi Nagata; Masato Katahira

  Physical Chemistry Chemical Physics, 2018年02月07日, 査読有り

  
• The C-terminal cytidine deaminase domain of APOBEC3G itself undergoes intersegmental transfer for a target search, as revealed by real-time NMR monitoring

  Keisuke Kamba; Takashi Nagata; Masato Katahira

  Physical Chemistry Chemical Physics, 2018年02月07日, 査読有り, 責任著者

  
• Influence of the DNA sequence/length and pH on deaminase activity, as well as the roles of the amino acid residues around the catalytic center of APOBEC3F

  Li Wan; Takashi Nagata; Masato Katahira

  Physical Chemistry Chemical Physics, 2018年02月07日, 査読有り

  
• Plastic roles of phenylalanine and tyrosine residues of TLS/FUS in complex formation with the G-quadruplexes of telomeric DNA and TERRA

  Keiko Kondo; Tsukasa Mashima; Takanori Oyoshi; Ryota Yagi; Riki Kurokawa; Naohiro Kobayashi; Takashi Nagata; Masato Katahira

  SCIENTIFIC REPORTS, 2018年02月, 査読有り

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• Multiplicity in Long Noncoding RNA in Living Cells

  Riki Kurokawa; Reina Komiya; Takanori Oyoshi; Yoko Matsuno; Hidenori Tani; Masato Katahira; Keisuke Hitachi; Yuji Iwashita; Takefumi Yamashita; Keiko Kondo; Ryoma Yoneda; Yudai Yamaoki; Naomi Ueda; Tsukasa Mashima; Naohiro Kobayashi; Takashi Nagata; Ayaka Kiyoishi; Masayuki Miyake; Fumi Kano; Masayuki Murata; Nesreen Hamad; Kohei Sasaki; Naoyuki Shoji

  Biomedical Sciences, 2018年, 査読有り

  
• Characterisation of an aptamer against Runt domain of AML1 (RUNX1) by NMR and mutational analyses

  K. Takada; R. Amano; Y. Nomura; Y. Tanaka; S. Sugiyama; T. Nagata; M. Katahira; Y. Nakamura; T. Kozu; T. Sakamoto

  FEBS Open Bio, 2018年01月, 査読有り

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• A hydronium solvate ionic liquid: Ligand exchange conduction driven by labile solvation

  Atsushi Kitada; Kohei Kintsu; Shun Takeoka; K. Fukami; Masayuki Saimura; Takashi Nagata; Masato Katahira; Kuniaki Murase

  Journal of the Electrochemical Society, 2018年, 査読有り

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• Mechanism of protein-RNA recognition: Analysis based on the statistical mechanics of hydration

  Tomohiko Hayashi; Tomoaki Matsuda; Takashi Nagata; Masato Katahira; Masahiro Kinoshita

  Physical Chemistry Chemical Physics, 2018年, 査読有り

  
• A Hydronium Solvate Ionic Liquid: Facile Synthesis of Air-Stable Ionic Liquid with Strong Brønsted Acidity

  Kitada A; Takeoka S; Kintsu K; Fukami K; Saimura M; Nagata T; Katahira M; Murase K

  Journal of The Electrochemical Society, 2018年, 査読有り

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• Conjugation of two RNA aptamers improves binding affinity to AML1 Runt domain

  Yusuke Nomura; Kaori Yamazaki; Ryo Amano; Kenta Takada; Takashi Nagata; Naohiro Kobayashi; Yoichiro Tanaka; Junichi Fukunaga; Masato Katahira; Tomoko Kozu; Yoshikazu Nakamura; Yuji Haishima; Hidetaka Torigoe; Taiichi Sakamoto

  JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 2017年12月, 査読有り

  
• Observation by real-time NMR, and interpretation of length- and location-dependent deamination activity of APOBEC3B

  L. Wan; T. Nagata; R. Morishita; A. Takaori-Kondo; M. Katahira

  ACS Chemical Biology, DOI: 10.1021/acschembio.7b00662, 2017年11月17日, 査読有り

  
• Backbone and side chain assignments of the second RNA-binding domain of Musashi-1 in its free form and in complex with 5-mer RNA

  Ryo Iwaoka; Takashi Nagata; Kengo Tsuda; Takao Imai; Hideyuki Okano; Naohiro Kobayashi; Masato Katahira

  BIOMOLECULAR NMR ASSIGNMENTS, 2017年10月, 査読有り, 責任著者

  
• Structural Insight into the Recognition of r(UAG) by Musashi-1 RBD2, and Construction of a Model of Musashi-1 RBD1-2 Bound to the Minimum Target RNA

  Ryo Iwaoka; Takashi Nagata; Kengo Tsuda; Takao Imai; Hideyuki Okano; Naohiro Kobayashi; Masato Katahira

  MOLECULES, 2017年07月, 査読有り, 責任著者

  この論文にアクセスする：

  
• Development of an RNA aptamer that acquires binding capacity against HIV-1 Tat protein via G-quadruplex formation in response to potassium ions

  Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Tsukasa Mashima; Masato Katahira

  CHEMICAL COMMUNICATIONS, 2017年07月, 査読有り, 責任著者

  
• Molecular Landscape of the Ribosome Pre-initiation Complex during mRNA Scanning: Structural Role for eIF3c and Its Control by eIF5

  Eiji Obayashi; Rafael E. Luna; Takashi Nagata; Pilar Martin-Marcos; Hiroyuki Hiraishi; Chingakham Ranjit Singh; Jan Peter Erzberger; Fan Zhang; Haribabu Arthanari; Jacob Morris; Riccardo Pellarin; Chelsea Moore; Ian Harmon; Evangelos Papadopoulos; Hisashi Yoshida; Mahmoud L. Nasr; Satoru Unzai; Brytteny Thompson; Eric Aube; Samantha Hustak; Florian Stengel; Eddie Dagraca; Asokan Ananbandam; Philip Gao; Takeshi Urano; Alan G. Hinnebusch; Gerhard Wagner; Katsura Asano

  CELL REPORTS, 2017年03月, 査読有り, 筆頭著者

  この論文にアクセスする：

  
• Structure, Dynamics, and Interaction of p54(nrb)/NonO RRM1 with 5 ' Splice Site RNA Sequence

  Jean-Baptiste Duvignaud; Mikael Bedard; Takashi Nagata; Yutaka Muto; Shigeyuki Yokoyama; Stephane M. Gagne; Michel Vincent

  BIOCHEMISTRY, 2016年05月, 査読有り

  
• Characterization of the Deamination Coupled with Sliding along DNA of Anti-HIV Factor APOBEC3G on the Basis of the pH-Dependence of Deamination Revealed by Real-Time NMR Monitoring

  Keisuke Kamba; Takashi Nagata; Masato Katahira

  FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2016年04月, 査読有り, 責任著者

  
• Accurate and molecular-size-tolerant NMR quantitation of diverse components in solution

  Hideyasu Okamura; Hiroshi Nishimura; Takashi Nagata; Takanori Kigawa; Takashi Watanabe; Masato Katahira

  SCIENTIFIC REPORTS, 2016年02月, 査読有り

  この論文にアクセスする：

  
• The binding specificity of Translocated in LipoSarcoma/FUsed in Sarcoma with lncRNA transcribed from the promoter region of cyclin D1

  Ryoma Yoneda; Shiho Suzuki; Tsukasa Mashima; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira; Riki Kurokawa

  CELL AND BIOSCIENCE, 2016年01月, 査読有り

  この論文にアクセスする：

  
• K+-responsive off-to-on switching of hammerhead ribozyme through dual G-quadruplex formation requiring no heating and cooling treatment

  Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Tsukasa Mashima; Masato Katahira

  BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 2015年12月, 査読有り, 責任著者

  この論文にアクセスする：

  
• Catalytic Analysis of APOBEC3G Involving Real-Time NMR Spectroscopy Reveals Nucleic Acid Determinants for Deamination

  Keisuke Kamba; Takashi Nagata; Masato Katahira

  PLOS ONE, 2015年04月, 査読有り, 責任著者

  この論文にアクセスする：

  
• Augmentation of multiple protein kinase activities associated with secondary imatinib resistance in gastrointestinal stromal tumors as revealed by quantitative phosphoproteome analysis

  Kayoko Nagata; Takao Kawakami; Yoichi Kurata; Yayoi Kimura; Yusuke Suzuki; Takashi Nagata; Yuji Sakuma; Yohei Miyagi; Hisashi Hirano

  JOURNAL OF PROTEOMICS, 2015年02月, 査読有り

  
• Boosting of activity enhancement of K+-responsive quadruplex hammerhead ribozyme

  Yudai Yamaoki; Tsukasa Mashima; Takashi Nagata; Masato Katahira

  CHEMICAL COMMUNICATIONS, 2015年, 査読有り, 責任著者

  この論文にアクセスする：

  
• Novel RNA recognition motif domain in the cytoplasmic polyadenylation element binding protein 3

  Kengo Tsuda; Kanako Kuwasako; Takashi Nagata; Mari Takahashi; Takanori Kigawa; Naohiro Kobayashi; Peter Guentert; Mikako Shirouzu; Shigeyuki Yokoyama; Yutaka Muto

  PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, 2014年10月, 査読有り

  
• Structural Basis for Inhibition of the MDM2:p53 Interaction by an Optimized MDM2-Binding Peptide Selected with mRNA Display

  Takashi Nagata; Kie Shirakawa; Naohiro Kobayashi; Hirokazu Shiheido; Noriko Tabata; Yuko Sakuma-Yonemura; Kenichi Horisawa; Masato Katahira; Nobuhide Doi; Hiroshi Yanagawa

  PLOS ONE, 2014年10月, 査読有り, 筆頭著者, 責任著者

  
• Quantitative Analysis of Location- and Sequence-Dependent Deamination by APOBEC3G Using Real-Time NMR Spectroscopy

  Ayako Furukawa; Kenji Sugase; Ryo Morishita; Takashi Nagata; Tsutomu Kodaki; Akifumi Takaori-Kondo; Akihide Ryo; Masato Katahira

  ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2014年02月, 査読有り

  この論文にアクセスする：

  
• Binding of an RNA aptamer and a partial peptide of a prion protein: crucial importance of water entropy in molecular recognition

  Tomohiko Hayashi; Hiraku Oshima; Tsukasa Mashima; Takashi Nagata; Masato Katahira; Masahiro Kinoshita

  NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2014年, 査読有り

  この論文にアクセスする：

  
• 1H, 13C, and 15N resonance assignments of the dsRBDs of mouse RNA helicase A

  Takashi Nagata; Kengo Tsuda; Naohiro Kobayashi; Peter Güntert; Shigeyuki Yokoyama; Yutaka Muto

  Biomolecular NMR Assignments, 2013年04月, 査読有り, 筆頭著者, 責任著者

  
• Anti-prion activity of an RNA aptamer and its structural basis.

  Tsukasa Mashima; Fumiko Nishikawa; Yuji O Kamatari; Hiromichi Fujiwara; Masayuki Saimura; Takashi Nagata; Tsutomu Kodaki; Satoshi Nishikawa; Kazuo Kuwata; Masato Katahira

  Nucleic acids research, 2013年01月, 査読有り

  
• NMR study of xenotropic murine leukemia virus-related virus protease in a complex with amprenavir

  Ayako Furukawa; Hideyasu Okamura; Ryo Morishita; Satoko Matsunaga; Naohiro Kobayashi; Takahisa Ikegami; Tsutomu Kodaki; Akifumi Takaori-Kondo; Akihide Ryo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 2012年08月, 査読有り, 責任著者

  この論文にアクセスする：

  
• Solution structures of the double-stranded RNA-binding domains from RNA helicase A

  Takashi Nagata; Kengo Tsuda; Naohiro Kobayashi; Mikako Shirouzu; Takanori Kigawa; Peter Guentert; Shigeyuki Yokoyama; Yutaka Muto

  PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, 2012年06月, 査読有り, 筆頭著者

  
• Structure of Musashi1 in a complex with target RNA: the role of aromatic stacking interactions

  Takako Ohyama; Takashi Nagata; Kengo Tsuda; Naohiro Kobayashi; Takao Imai; Hideyuki Okano; Toshio Yamazaki; Masato Katahira

  NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2012年04月, 査読有り, 責任著者

  
• Intelligent' ribozyme whose activity is altered in response to K plus as a result of quadruplex formation

  Takashi Nagata; Yu Sakurai; Yukari Hara; Tsukasa Mashima; Tsutomu Kodaki; Masato Katahira

  FEBS JOURNAL, 2012年04月, 査読有り, 筆頭著者

  
• Structures of the first and second double-stranded RNA-binding domains of human TAR RNA-binding protein

  Seisuke Yamashita; Takashi Nagata; Masahito Kawazoe; Chie Takemoto; Takanori Kigawa; Peter Guentert; Naohiro Kobayashi; Takaho Terada; Mikako Shirouzu; Motoaki Wakiyama; Yutaka Muto; Shigeyuki Yokoyama

  PROTEIN SCIENCE, 2011年01月, 査読有り, 筆頭著者

  
• Solution structures of the trihelix DNA-binding domains of the wild-type and a phosphomimetic mutant of Arabidopsis GT-1: Mechanism for an increase in DNA-binding affinity through phosphorylation

  Takashi Nagata; Emi Niyada; Natsuki Fujimoto; Yuuya Nagasaki; Kazuaki Noto; Youhei Miyanoiri; Jun Murata; Kazuyuki Hiratsuka; Masato Katahira

  PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, 2010年11月, 査読有り, 筆頭著者

  
• Unusual Thermal Disassembly of the SPFH Domain Oligomer from Pyrococcus horikoshii

  Yohta Kuwahara; Satoru Unzai; Takashi Nagata; Yoko Hiroaki; Hideshi Yokoyama; Ikuo Matsui; Takahisa Ikegami; Yoshinori Fujiyoshi; Hidekazu Hiroaki

  BIOPHYSICAL JOURNAL, 2009年10月, 査読有り

  
• Structure and real-time monitoring of the enzymatic reaction of APOBEC3G which is involved in anti-HIV activity.

  A. Furukawa; T. Nagata; A. Matsugami; Y. Habu; R. Sugiyama; F. Hayashi; N. Kobayashi; S. Yokoyama; H. Takaku; M. Katahira

  Nucleic acids symposium series, 2009年09月, 査読有り

  
• Structure, interaction and real-time monitoring of the enzymatic reaction of wild-type APOBEC3G

  Ayako Furukawa; Takashi Nagata; Akimasa Matsugami; Yuichirou Habu; Ryuichi Sugiyama; Fumiaki Hayashi; Naohiro Kobayashi; Shigeyuki Yokoyama; Hiroshi Takaku; Masato Katahira

  EMBO JOURNAL, 2009年02月, 査読有り

  
• Elucidation of the mode of interaction in the UP1telomerase RNAtelomeric DNA ternary complex which serves to recruit telomerase to telomeric DNA and to enhance the telomerase activity

  Takashi Nagata; Yusuke Takada; Asami Ono; Kayoko Nagata; Yuki Konishi; Takeshi Nukina; Manami Ono; Akimasa Matsugami; Ayako Furukawa; Natsuki Fujimoto; Hirokazu Fukuda; Hitoshi Nakagama; Masato Katahira

  NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2008年12月, 査読有り, 筆頭著者

  
• N- and C-terminal fragments of a globular protein constructed by elongation of modules as a units associated for functional complementation

  Toru Tsuji; Takashi Nagata; Hiroshi Yanagawa

  JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 2008年10月, 査読有り

  
• NMR assignments and the identification of the secondary structure of the anti-retroviral cytidine deaminase

  Furukawa A; Nagata T; Habu Y; Sugiyama R; Hayashi F; Yokoyama S; Takaku H; Katahira M

  Nucleic acids symposium series, 2008年09月, 査読有り

  
• Structural analysis of Musashi-RNA complex on the basis of long-range structural information.

  T. Ohyama; A. Furukawa; T. Mashima; T. Sugiyama; S. Ohgara; T. Yamazaki; T. Imai; H. Okano; T. Nagata; M. Katahira

  Nucleic acids symposium series, 2008年09月, 査読有り

  
• The RRM domain of poly(A)-specific ribonuclease has a noncanonical binding site for mRNA cap analog recognition

  Takashi Nagata; Sakura Suzuki; Ryuta Endo; Mikako Shirouzu; Takaho Terada; Makoto Inoue; Takanori Kigawa; Naohiro Kobayashi; Peter Guntert; Akiko Tanaka; Yoshihide Hayashizaki; Yutaka Muto; Shigeyuki Yokoyama

  NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2008年08月, 査読有り, 責任著者

  
• Interactions with RNA/DNA of proteins involved in the regulation of transcription, translation and telomere elongation.

  T. Ohyama; A. Furukawa; T. Miyoshi; Y. Takada; S. Ohgara; K. Hiratsuka; T. Imai; H. Okano; H. Nakagama; T. Nagata; M. Katahira

  Nucleic acids symposium series, 2007年11月, 査読有り

  
• Origin of higher affinity to RNA of the N-terminal RNA-binding domain than that of the C-terminal one of a mouse neural protein, Musashi1, as revealed by comparison of their structures, modes of interaction, surface electrostatic potentials, and backbone dynamics

  Y Miyanoiri; H Kobayashi; T Imai; M Watanabe; T Nagata; S Uesugi; H Okano; M Katahira

  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 2003年10月, 査読有り

  
• Structure of the C-terminal RNA-binding domain of hnRNP D0 (AUF1), its interactions with RNA and DNA, and change in backbone dynamics upon complex formation with DNA

  M Katahira; Y Miyanoiri; Y Enokizono; G Matsuda; T Nagata; F Ishikawa; S Uesugi

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, 2001年08月, 査読有り

  
• Functional mutagenesis of AML1/RUNX1 and PEBP2β/CBFβ define distinct, non-overlapping sites for DNA recognition and heterodimerization by the Runt domain

  T. Nagata; M.H. Werner

  Journal of Molecular Biology, 2001年04月, 査読有り, 筆頭著者

  
• Molecular insights into the origin of the acute human leukemias revealed from the three-dimensional structure and sub-cellular localization of AML1.

  MH Werner; T Nagata; V Gupta; M Goger; BT Chait; A Sali; WY Kim; K Shigesada; Y Ito

  CLINICAL CANCER RESEARCH, 1999年11月, 査読有り

  
• Immunoglobulin motif DNA recognition and heterodimerization of the PEBP2/CBF Runt domain

  T Nagata; V Gupta; D Sorce; WY Kim; A Sali; BT Chait; K Shigesada; Y Ito; MH Werner

  NATURE STRUCTURAL BIOLOGY, 1999年07月, 査読有り, 筆頭著者

  
• Structure, backbone dynamics and interactions with RNA of the C-terminal RNA-binding domain of a mouse neural RNA-binding protein, Musashi1

  T Nagata; R Kanno; Y Kurihara; S Uesugi; T Imai; S Sakakibara; H Okano; M Katahira

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, 1999年03月, 査読有り, 筆頭著者

  
• Structure and interactions with RNA of the N-terminal UUAG-specific RNA-binding domain of hnRNP D0

  T Nagata; Y Kurihara; G Matsuda; J Saeki; T Kohno; Y Yanagida; F Ishikawa; S Uesugi; M Katahira

  JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, 1999年03月, 査読有り, 筆頭著者

  
• Structural properties and RNA-binding activities of two RNA recognition motifs of a mouse neural RNA-binding protein, mouse-Musashi-1

  Y Kurihara; T Nagata; T Imai; A Hiwatashi; M Horiuchi; S Sakakibara; M Katahira; H Okano; S Uesugi

  GENE, 1997年02月, 査読有り, 筆頭著者

  
• Mouse-Musashi-1, a neural RNA-Binding protein highly enriched in the mammalian CNS stem cell

  S Sakakibara; T Imai; K Hamaguchi; M Okabe; J Aruga; K Nakajima; D Yasutomi; T Nagata; Y Kurihara; S Uesugi; T Miyata; M Ogawa; K Mikoshiba; H Okano

  DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 1996年06月, 査読有り

  
• MM2 MOLECULAR MECHANICS STUDIES OF PERIPLANONE-B AND NITROXIDES - EMPIRICAL-METHODS TO EVALUATE THE STRETCHING (K(S)) AND BENDING (K(B)) FORCE-CONSTANTS OF THE MM2 FORCE-FIELD

  K SAKAKIBARA; H KAWAMURA; T NAGATA; JZ REN; M HIROTA; K SHIMAZAKI; T CHUMAN

  BULLETIN OF THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN, 1994年10月, 査読有り

  

MISC

• HIV-1 Vif Protein Complex Inhibits Human APOBEC3 Deaminases Independent of the Ubiquitin-Proteasome Pathway

  K. Kamba; L. Wan; K. Tozawa; S. Unzai; R. Morishita; A. Kakaori-Kondo; T. Nagata; M. Katahira

  The 30th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems (ICMRBS 2024), Seoul, Republic of Korea, August 2024.8.18-23, 2024年08月

  
• Engineering Saccharomyces cerevisiae for Enhanced and Fast Ethanol Production through Co-Utilization of Acetic Acid and Glucose with Hypoxic Tolerance and Improved Flocculation

  Mohamed Oksh Mohamed Mousa; Sadat Mohamed; Rezk Khattab; Takashi Nagata; Takashi Watanabe; Masato Katahira

  第75回日本木材学会大会, 仙台国際センター, 2025.3.19-2025.3.21, 2025年03月

  
• Structural Insights into Feruloyl Esterases and Their Application in Lignocellulosic Biomass Deconstruction

  Apisan Phienluphon; Keiko Kondo; Bunzo Mikami; Kaori Saito; Takashi Watanabe; Takashi Nagata; Masato Katahira

  第75回日本木材学会大会, 仙台国際センター, 2025.3.19-2025.3.21, 2025年03月

  
• Enhancing Cellulose Degradation of Sugarcane Trash: The Boosting Effect of LPMO9 from Wood Rot Fungus on

  Y. Yagi; E. Oga; K. Kondo; S. M.; R. Khattab; H. Okano; T. Watanabe; T. Nagata; M. Katahira

  The 15th International Symposium of Advanced Energy Science, 宇治黄檗プラザ, 2024.12.10-13, 2024年12月

  
• The binding of human origin recognition complex subunit 1 to various G-quadruplex structure

  Shou Waga; Yudai Yamaoki; Kensei Horie; Tomoki Sakamoto; Chihiro Nakayama; Taisei Masunaga; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  The 15th International Symposium of Advanced Energy Science, 宇治黄檗プラザ, 2024.12.10-13, 2024年12月

  
• The analysis of translational and rotational motion of bio-molecules in nucleic acid condensates by NMR

  Riki Kurokawa; Yudai Yamaoki; Makoto Shimizu; Aika Kawakami; Keiko Kondo; Tomoki Sakamoto; Takashi Nagata; Masato Katahira

  The 15th International Symposium of Advanced Energy Science, 宇治黄檗プラザ, 2024.12.10-13, 2024年12月

  
• In-cell NMR study on structure, dynamics, and interaction with ligands of nucleic acids in living human cells

  Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Tomoki Sakamoto; Omar Eladl; Keiko Kondo; Masato Katahira

  4th Switzerland-Japan Biomolecular Chemistry Symposium (SJBCS2024), 2024.11.07-08, 2024年11月

  
• In-cell NMR法によるヒト生細胞内における核酸の構造、ダイナミクス、リガンド相互作用の解析

  山置佑大; 永田崇; 近藤敬子; 阪本知樹; Eladl Omar; 片平正人

  第47回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場, 2024.11.27-29, 2024年11月, 招待有り

  
• DNA-RNAハイブリッドグアニン四重鎖の構造およびリガンドとの相互作用の分光学的解析

  堀江健生; 増永泰成; 山置佑大; 近藤敬子; 中山千尋; 永田崇; 片平正人

  第24回若手NMR研究会, タカオネ（東京都八王子市）, 2024.09.02-04, 2024年09月

  
• Investigation of the structure and interaction of an RNA aptamer targeting α-synuclein using NMR

  Xiang Li; Yudai Yamaoki; Omar Eladl; Takashi Nagata; Kazuma Murakami; Masato Katahira

  第24回若手NMR研究会, タカオネ（東京都八王子市）, 2024.09.02-04, 2024年09月

  
• In-cell NMR study on structure, dynamics, and ligand interactions of nucleic acids in living human cells

  Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Tomoki Sakamoto; Omar Eladl; Keiko Kondo; Masato Katahira

  XXV International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (IRT2024),Katsushika Campus, Tokyo University of Science, 2024.09.03-06, 2024年09月

  
• In-cell NMR法によるヒト細胞内におけるHIV Tat捕捉RNAアプタマーと標的分子との相互作用の解析

  山置佑大; Eladl Omar; 近藤敬子; 永田崇; 片平正人

  第18回バイオ関連化学シンポジウム, つくば国際会議場, 2024.09.12-14, 2024年09月

  
• Structural characterization and utilization of fungal feruloyl esterases for potential degradation of the lignin-carbohydrate complex

  Apisan Phienluphon; Keiko Kondo; Bunzo Mikami; Kenneth Sze Kai Teo; Kaori Saito; Takashi Watanabe; Takashi Nagata; Masato Katahira

  2nd International Lignin Symposium, 京都府立京都学・歴彩館, 2024.9.8-10, 2024年09月

  
• Boosting peroxidase-catalyzed lignin decomposition by applying continuous membrane isolation of lignin fragments

  Keiko Kondo; Kenneth Sze Kai Teo; Kaori Saito; Yu Iseki; Sadat Mohamed; Rezk Khattab; Takashi Watanabe; Takashi Nagata; Masato Katahira

  2nd International Lignin Symposium, 京都府立京都学・歴彩館, 2024.9.8-10, 2024年09月

  
• Structural insight into the substrate specificity of fungal feruloyl esterases

  Apisan Phienluphon; Keiko Kondo; Bunzo Mikami; Kenneth Sze Kai Teo; Kaori Saito; Takashi Watanabe; Takashi Nagata; Masato Katahira

  第24回日本蛋白質科学会年会, 札幌コンベンションセンター, 2024.06.11-13, 2024年06月

  
• Structure, dynamics, and interaction with ligands of nucleic acids in living human cells analyzed by in-cell NMR

  Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Tomoki Sakamoto; Omar Eladl; Keiko Kondo; Masato Katahira

  the 3rd International Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC2024), Toyoda Auditorium, Nagoya University, Nagoya, Aichi, Japan, 2024.04.24-26, 2024年04月

  
• A DATA-DRIVEN APPROACH TO ANTIGEN-ANTIBODY COMPLEX STRUCTURE MODELING USING LABELED VHH ANTIBODIES

  Takashi Nagata; Hiroyuki Yamazaki; Ryota Maeda; Hirofumi Tsuruta; Ryotaro Tamura; Akihiro Imura

  International Conference on Learning Representations (ICLR) 2025, Singapore EXPO, 2025.4.24-28., 2025年04月27日, 査読有り, 筆頭著者

  
• Investigation of the structure and interaction of an RNA aptamer targeting α-synuclein using NMR

  X. Li; Y. Yamaoki; O. Eladl; T. Nagata; K. Murakami; M. Katahira

  The 15th International Symposium of Advanced Energy Science, 宇治黄檗プラザ, 2024.12.10-13, 2024年12月

  
• 液液相分離による核酸から成るコンデンセートのダイナミクスのNMR法を用いた解析

  清水まこと; 川上 愛加; 山置 佑大; 近藤 敬子; 阪本 知樹; 永田 崇; 片平 正人

  第47回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場, 2024.11.27-29 2024年11月27日 2024年11月27日, 2024年11月27日

  
• 抗HIV因子APOBEC3Cの基質嗜好性及びHIV-1 Vif-ヒトE3ユビキチンリガーゼ複合体がそ の活性におよぼす影響

  兎澤賢太郎; 神庭圭佑; 岩岡諒; 高折晃史; 永田崇; 片平正人

  第47回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場, 2024.11.27-29 2024年11月27日 2024年11月27日, 2024年11月27日

  
• NMRを用いたαシヌクレインを標的とするRNAアプタマーの構造と相互作用の解析

  Li Xiang; 山置 佑大; Eladl Omar; 永田 崇; 村上 一馬; 片平 正人

  第47回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場, 2024.11.27-29 2024年11月27日, 2024年11月27日

  
• HIV-1のGagタンパク質の二量化にS9残基近傍の運動性が影響を与える

  神庭圭佑; 森田泰基; 小谷治; 駒貴明; 横山勝; 野間口雅子; 佐藤裕徳; 永田崇; 片平正人

  第47回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場, 2024.11.27-29, 2024年11月27日

  
• VβBCC complexを標的としたaptamerの選別と特性解析

  熊谷 紀志; 神庭 圭佑; 鈴木 拓也; 関川 湧斗; 永田 佳代子; 高折 晃史; 万 里; 片平 正人; 永田 崇; 坂本 泰一

  2024年度 日本生化学会関東支部例会, 順天堂大学 本郷・お茶の水キャンパス, 2024年06月15日

  
• Highly efficient decomposition of beech wood lignin by lignin peroxidase using a membrane reactor

  Kenneth Sze Kai Teo; Keiko Kondo; Kaori Saito; Yu Iseki; Takashi Watanabe; Takashi Nagata; Masato Katahira

  The 7th International KBMSS Symposium / 521st Sustainable Humanosphere Symposium, Uji, 2024.1.30, 2024年01月30日

  
• Structure-function relationship of fungal feruloyl esterases towards destarched wheat bran

  Apisan Phienluphon; Keiko Kondo; Bunzo Mikami; Kenneth Sze Kai Teo; Kaori Saito; Takashi Watanabe; Takashi Nagata; Masato Katahira

  The 7th International KBMSS Symposium / 521st Sustainable Humanosphere Symposium, Uji, 2024.1.30, 2024年01月30日

  
• Unveiling Atomic-Level Insights into the Influence of Molecular Crowding Environments on Base-Pair Opening/Closing Dynamics in Parallel DNA Triplex Structures

  Tomoki Sakamoto; Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Masato; Katahira

  ISNAC 2023, Miyazaki Civic Plaza, 2023.11.1-3, 2023年11月

  
• HIV-1 Vif Directly Inhibits Human APOBEC3G Deaminase Independent of the Ubiquitin-Proteasome Pathway

  Keisuke Kamba; Li Wan; Satoru Unzai; Ryo Morishita, Akifumi; Takaori-Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  ISMAR 2023, Brisbane, 2023.8.20-25, 2023年08月

  
• Analyzing Dynamics of Base-Pair Opening in DNA Triplex Structures under Molecular Crowding Environment

  Tomoki Sakamoto; Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Masato Katahira

  ISMAR 2023, Brisbane, 2023.8.20-25, 2023年08月

  
• Direct inhibition of human APOBEC3 deaminases by HIV-1 Vif independent of the ubiquitination/degradation pathway

  Keisuke Kamba; Li Wan; Kentaro Tozawa; Satoru Unzai; Ryo Morishita; Akifumi Takaori-Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  2024 IUPAB CONGRESS + 62nd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, 2024.06.24-28, 2024年06月

  
• HIV-1 Vif-ヒトE3ユビキチンリガーゼ複合体がヒト抗ウイルス/がん関連因子APOBEC3の脱アミノ化活性に及ぼす影響

  兎澤 賢太郎; 神庭 圭佑; 岩岡 諒; 永田 崇; 片平 正人

  第24回日本蛋白質科学会年会, 札幌コンベンションセンター, 2024.06.11-13, 2024年06月

  
• 溶解性多糖モノオキシゲナーゼの基質結合面上のチロシン残基：セルロース分解促進効果に与える影響

  八木 勇成; 近藤 敬子; Huyen Nguyen; 渡辺 隆司; 三上 文三; 永田 崇; 片平 正人

  第24回日本蛋白質科学会年会, 札幌コンベンションセンター, 2024.06.11-13, 2024年06月

  
• 安定同位体標識したHBV X蛋白質由来ペプチドの簡便な調製法とNMRによる宿主蛋白質との弱い相互作用系への応用

  楠英樹; 小林直宏; 若松馨; 田中俊之; 永田崇

  第24回日本蛋白質科学会年会, 札幌コンベンションセンター, 2024.06.11-13, 2024年06月, 責任著者

  
• In-cell NMR analysis on base-pair opening dynamics and interactions with ligands of nucleic acids in living human cells

  Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Tomoki Sakamoto; Omar Eladl; Keiko Kondo; Masato Katahira

  2024 IUPAB CONGRESS + 62nd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, 2024.06.24-28, 2024年06月

  
• 選択的白色腐朽菌の溶解性多糖モノオキシゲナーゼを用いたサトウキビ収穫廃棄物パルプの分解

  八木 勇成; 近藤 敬子; Huyen Nguyen; 渡辺 隆司; 三上 文三; 永田 崇; 片平 正人

  日本農芸化学会2024年度大会, 東京農業大学, 2024.3.24-27, 2024年03月

  
• 抗体に結合するaptamerの改変体の結合能の解析

  遠藤朱梨; 関口真裕; 阪本智樹; 堀内正隆; 石川岳志; 片平正人; 永田崇; 山岸賢司; 坂本泰一

  第46回日本分子生物学会年会, 神戸ポートアイランド, 2023.12.6-8, 2023年12月

  
• IgGに対するRNA aptamerとChimera aptamerの構造特性の比較

  長谷川 拓矢; 阪本智樹; 関口真裕; 石川岳志; 片平正人; 永田崇; 山岸賢司; 坂本泰一

  第46回日本分子生物学会年会, 神戸ポートアイランド, 2023.12.6-8, 2023年12月

  
• 分子込み合い環境中における三重鎖構造DNAの塩基対開閉ダイナミクスのNMR法による解析

  阪本 知樹; 山置 佑大; 永田 崇; 片平 正人

  第46回日本分子生物学会年会, 神戸ポートアイランド, 2023.12.6-8, 2023年12月

  
• NMR法によるDNA-RNA;ハイブリッドグアニン四重鎖構造と特異性が予想される化合物との相互作用解析

  増永 泰成; 山置 佑大; 中山 千尋; 近藤 敬子; 永田 崇; 片平 正人

  第46回日本分子生物学会年会, 神戸ポートアイランド, 2023.12.6-8, 2023年12月

  
• HIV-1 Vif-ヒトE3ユビキチンリガーゼ複合体が APOBEC3A 及び APOBEC3C の脱アミノ化に及ぼす影響の解析

  兎澤 賢太郎; 神庭 圭佑; 岩岡 諒; 永田 崇; 片平 正人

  第46回日本分子生物学会年会, 神戸ポートアイランド, 2023.12.6-8, 2023年12月

  
• メンブレンリアクターを活用したリグニンペルオキシダーゼによる ブナリグニンの高効率分解

  ケンネ テオジカイ; 近藤 敬子; 齋藤 香織; 井関 優侑; 渡辺 隆司; 永田 崇; 片平 正人

  第68回リグニン討論会, シティ・ホールプラザ アオーレ長岡, 2023.11.9-10, 2023年11月

  
• In-cell NMR法によるヒト細胞内におけるHIV Tat捕捉RNAアプタマーと標的分子との相互作用の解析

  山置佑大; Eladl Omar; 近藤敬子; 永田崇; 片平正人

  第62回NMR討論会(2023), 横須賀芸術劇場, 2023.11.7-9, 2023年11月, 査読有り

  
• 分子込み合い環境がDNA三重鎖構造の塩基対の開閉ダイナミクスに及ぼす影響の解析

  阪本知樹; 山置佑大; 永田崇; 片平正人

  第62回NMR討論会(2023), 横須賀芸術劇場, 2023.11.7-9, 2023年11月, 査読有り

  
• DNA液滴の内部環境をNMRで調べる試み

  永田崇; 山置佑大; 川上愛加; 近藤敬子; 阪本知樹; 片平正人

  第62回NMR討論会(2023), 横須賀芸術劇場, 2023.11.7-9, 2023年11月, 査読有り, 筆頭著者

  
• In-cell NMR study of the structure and interaction of an RNA aptamer targeting HIV-1 Tat within living human cells

  Omar Eladl; Yudai Yamaoki; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  ISNAC 2023, Miyazaki Civic Plaza, 2023.11.1-3, 2023年11月

  
• NMR法によるDNA-RNA ハイブリッドグアニン四重鎖構造とペプチドの相互作用解析

  増永 泰成; 山置 佑大; 中山 千尋; 近藤 敬子; 永田 崇; 片平 正人

  第61回日本生物物理学会年会, 名古屋国際会議場, 2023.11.14-16, 2023年11月

  
• RGGYX から成る環状ペプチドの構造解析

  藤本和久; 山口朋也; 永田 崇; 片平正人; 深澤海斗; 大吉崇文

  第17回バイオ関連化学シンポジウム, 第38回生体機能関連化学シンポジウム, 第26回バイオテクノロジー部会シンポジウム, 東京理科大学野田キャンパス薬学部, 2023.9.8-10, 2023年09月

  
• ヒト生細胞内核酸の構造ダイナミクスの in-cell NMR法による解析

  山置 佑大; 永田 崇; 近藤 敬子; 阪本 知樹; Eladl Omar; 片平 正人

  第17回バイオ関連化学シンポジウム, 第38回生体機能関連化学シンポジウム, 第26回バイオテクノロジー部会シンポジウム, 東京理科大学野田キャンパス薬学部, 2023.9.8-10, 2023年09月

  
• 選択的白色腐朽菌の溶解性多糖モノオキシゲナーゼによる サトウキビ収穫廃棄物の糖化率促進効果

  大賀 恵利; 八木勇成; 近藤敬子; 岡野啓志; 渡邊隆司; 永田崇; 片平正人

  セルロース学会第30回年次大会, 広島国際会議場, 2023.9.28-29, 2023年09月

  
• 結晶性セルロースの分解におけるセルラーゼと選択的白色腐朽菌由来LPMO9のシナジー効果

  八木勇成; 近藤敬子; Huyen Nguyen; 井関優侑; 奥岡奈宜; 渡辺隆司; 三上文三; 永田崇; 片平正人

  セルロース学会第 29 回年次大会, 2022.7.20-22, 金沢市文化ホール, 2022年07月

  
• ヒト生細胞内におけるDNA三重鎖構造形成の初観測および分子込み合い環境下におけるDNA三重鎖構造の塩基対開閉ダイナミクスの解析

  阪本 知樹; 山置 佑大; 永田 崇; 片平 正人

  第103回日本化学会2023,東京理科大学野田キャンパス, 2023.3.22-25, 2023年03月

  
• The molecular level elucidation of a Ceriporiopsis subvermispora manganese peroxidase-catalyzed conversion of a phenolic lignin dimer

  Kenneth Sze Kai Teo; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  第73回日本木材学会大会, 2023.3.14-16, 福岡大学・九州大学病院キャンパス, 2023年03月

  
• Ceriporiopsis subvermispora 由来 溶解性多糖モノオキシゲナーゼのセルロース解重合反応の解析

  井関優侑; 奥岡奈宜; 橋爪知弘; 近藤敬子; 永田崇; 片平正人; 渡辺隆司

  第73回日本木材学会大会, 2023.3.14-16, 福岡大学・九州大学病院キャンパス, 2023年03月

  
• Trichoderma reesei Cel7Aのセルラーゼ糖質結合モジュールと 人工リグニンの相互作用解析

  内田 貴己; 徳永 有希; 永田 崇; 近藤 敬子; 片平 正人; 渡辺 隆司

  第73回日本木材学会大会, 2023.3.14-16, 福岡大学・九州大学病院キャンパス, 2023年03月

  
• Co-displaying of xylanase and feruloyl esterase on the Pichia pastoris cell surface

  Apisan Phienluphon; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  第73回日本木材学会大会, 2023.3.14-16, 福岡大学・九州大学病院キャンパス, 2023年03月

  
• 結晶性セルロースの分解におけるセルラーゼと 選択的白色腐朽菌由来LPMO9のシナジー効果

  八木 勇成; 近藤 敬子; Huyen Nguyen; 井関 侑; 奥岡 奈宜; 渡辺隆司; 三上 文三; 永田 崇; 片平 正人

  The 5th International Cellulose Conference [ICC2022+1](1st CIRCULAR),International Conference Center Hiroshima, Hiroshima, 2022.9.26-29, 2022年09月

  
• Investigation of the structural dynamics and interactions of RNAs in living human cells by in-cell NMR

  Yudai Yamaoki; Omar Eladl; Keiko Kondo; Tomoki Sakamoto; Takashi Nagata; Masato Katahira

  第23回日本RNA学会,みやこめっせ,京都, 2022.7.20-22, 2022年07月

  
• 2G1412 NMRによるXMRVプロテアーゼとその阻害剤との複合体の構造生物学的研究(蛋白質_構造2,第49回日本生物物理学会年会)

  Okamura Hideyasu; Matsunaga Tomoko; Furukawa Ayako; Sato Yusuke; Iwaoka Ryo; Nagata Takashi; Kobayashi Naohiro; Takaori Akifumi; Morishita Ryo; Ryo Akihide; Katahira Masato

  生物物理, 2011年

  
• HIV-1-Vif:E3ユビキチンリガーゼ複合体を構成するタンパク質とヒトAPOBEC3Gタンパク質の相互作用の加算効果が,脱アミノ化阻害をもたらし得る

  神庭圭佑; WAN Li; WAN Li; 雲財悟; 森下了; 高折晃史; 永田崇; 永田崇; 片平正人; 片平正人

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2022年

  
• HIV-1のRevペプチド変異体の調製とペプチド変異体とRRE RNAの相互作用のNMR解析

  渡邊なつき; 武田有未; COLIN Smith; 永田崇; 片平正人; 河野俊之; 坂本泰一

  日本生化学会大会(Web), 2017年

  
• テロメア配列RNA結合性蛋白質hnRNPDの構造及びRNAとの相互作用

  片平正人; 永田崇; 佐伯純一; 栗原靖之; 上杉晴一; 河野俊之; 梶田保子; 石川冬木

  日本生物物理学会年会講演予稿集, 1996年

  
• RNAi関連因子hTRBP2の構造生物学的解析

  山下征輔; 山下征輔; 川添将仁; 竹本千重; 赤坂領吾; 永田崇; 武藤裕; 木川隆則; 木川隆則; 滝元宏治; 脇山素明; 横山茂之

  日本分子生物学会年会講演要旨集, 2009年

  
• 核酸から成る液滴のNMR法を用いた物理化学的解析

  川上 愛加; 山置 佑大; 近藤 敬子; 阪本 知樹; 永田 崇; 片平 正人

  第45回日本分子生物学会年会日本生物物理学会共催, 幕張メッセ, 2022.11.30-12.2, 2022年12月

  
• In-cell NMR法によるヒト生細胞内における核酸構造の塩基対開閉ダイナミクスの解析

  山置佑大; 永田崇; 阪本知樹; Eladl Omar; 川上愛加; 近藤敬子; 片平正人

  第45回日本分子生物学会年会日本生物物理学会共催, 幕張メッセ, 2022.11.30-12.2, 2022年12月

  
• 分子込み合い環境下におけるDNA三重鎖構造の塩基対の開閉ダイナミクスの緩和分散法を用いた解析

  阪本 知樹; 山置 佑大; 永田 崇; 片平 正人

  第61回NMR討論会(2022), 高知県立県民文化ホール, 2022.11.8-10, 2022年11月, 査読有り

  
• B型肝炎ウイルスX蛋白質（HBx）のC末側欠失変異体ペプチドと抗アポトーシス蛋白質Bcl-xLの相互作用のNMR解析

  楠英樹; 坂本泰一; 河野俊之; 若松馨; 浜口功; 永田崇

  第61回NMR討論会(2022), 高知県立県民文化ホール, 2022.11.8-10, 2022年11月, 査読有り

  
• In-cell NMR法によるヒト生細胞内における核酸の塩基対開閉ダイナミクスの解析

  山置佑大; 永田崇; 近藤敬子; 阪本知樹; Eladl Omar; 片平正人

  第61回NMR討論会(2022), 高知県立県民文化ホール, 2022.11.8-10, 2022年11月, 査読有り

  
• Base-pair opening dynamics and interactions with ligands of nucleic acids in living human cells studied by in-cell NMR

  Yudai Yamaoki; Omar Eladl; Keiko Kondo; Tomoki Sakamoto; Takashi Nagata; Masato Katahira

  ISNAC 2022, Tokyo Univ. Sci., 2022.11.2-4, 2022年11月02日, 査読有り

  
• ヒト生細胞内環境における三重鎖DNA分子の構造及びダイナミクスの解析

  阪本 知樹; 山置 佑大; 永田 崇; 片平 正人

  第60回日本生物物理学会年会,2022.9.28-30, 函館アリーナ・函館市民会館、ハイブリッド, 2022年09月28日

  
• In silicoアプローチによるアプタマー-IgG結合の熱力学的プロファイルの解析

  山崎 凌司; 伊藤 愛純; 阪本 知樹; 古峰 真樹; 石川 岳志; 片平 正人; 永田 崇; 坂本 泰一; 山岸 賢司

  第60回日本生物物理学会年会,2022.9.28-30, 函館アリーナ・函館市民会館、ハイブリッド, 2022年09月27日

  
• 2P-107 Musashi-1が有する二つのRNA結合ドメインによるRNA認識機構の常磁性効果PRE、PCS、RDCを利用した解析(核酸結合蛋白質,第46回日本生物物理学会年会)

  Nagata Takashi; Ohyama Takako; Furukawa Ayako; Sugiyama Takashi; Mashima Tsukasa; Imai Takao; Okano Hideyuki; Yamazaki Toshio; Katahira Masato

  生物物理, 2008年

  
• 3PA144 Musashi1タンパク質の2つのRNA結合ドメインにおけるダイナミクスの比較

  渡邊 道直; 小林 央典; 市川 智則; 永田 崇; 菅野 玲介; 岡野 栄之; 上杉 晴一; 片平 正人

  生物物理, 1999年

  
• 神経系特異的RNA結合タンパク質マウスMusashi-1の2つのRNPモチーフのRNA結合能と二次構造

  栗原 靖之; 永田 崇; 樋渡 亜土; 今井 貴雄; 榊原 伸一; 岡野 栄之; 片平 正人; 上杉 晴一

  日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集, 1996年08月01日

  
• UUAGGG配列結合蛋白質hnRNP-Dの構造及びRNAとの相互作用のNMRによる研究

  永田 崇; 片平 正人; 佐伯 純一; 栗原 靖之; 上杉 晴一; 梶田 保子; 石川 冬木; 河野 俊之

  日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集, 1996年08月01日

  
• 神経系特異的RNA結合タンパク質Musashiの構造、運動性及びRNAとの相互作用

  小林 央典; 永田 崇; 菅野 玲介; 佐伯 純一; 栗原 靖之; 今井 貴雄; 榊原 伸一; 岡野 栄之; 上杉 晴一; 片平 正人

  生物物理, 1998年09月07日

  
• 神経系特異的RNA結合蛋白質Musashiの構造と安定性の研究

  菅野 玲介; 永田 崇; 佐伯 純一; 小林 央典; 樋渡 亜土; 栗原 靖之; 今井 貴雄; 榊原 伸一; 岡野 栄之; 河野 俊之; 片平 正人; 上杉 晴一

  生物物理, 1997年10月

  
• Vif複合体に結合するRNAアプタマーの開発

  熊谷紀志; 鈴木拓也; 関川湧斗; 神庭圭佑; 万里; 永田佳代子; 高折晃史; 片平正人; 永田崇; 坂本泰一

  日本核酸医薬学会第7回年会,2022.07.31-08.03,御茶ノ水ソラシティカンファレンスセンター, 2022年07月31日

  
• HIV-1 Vifと宿主タンパク質の五者複合体による抗ウイルス因子APOBEC3Gの脱アミノ化活性阻害の分子機構の解明

  神庭圭佑; 雲財悟; 森下了; 高折晃史; 永田崇; 片平正人

  第22回日本蛋白質科学会年会,2022.06.07-09, つくば国際会議場, 2022年06月07日

  
• Effect of site-directed mutagenesis of Aspergillus sydowii feruloyl esterase on substrate preference

  Apisan Phienluphon; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  日本農芸化学会2022年度京都大会, 2022.3.15-18, on-line, 2022年03月18日

  
• レーザーによるリグノセルロース分解への挑戦

  川崎 平康; 境 武志; 住友 洋介; 野上 杏子; 早川 建; 宍倉 文夫; 永田 崇; 全 炳俊; 早川 恭史

  日本農芸化学会2022年度京都大会, 2022.3.15-18, on-line, 2022年03月15日

  
• 木材腐朽菌Ceriporiopsis subvermispora由来LPMO9がセルロース分解に及ぼすシナジー効果

  八木勇成; 近藤敬子; Huyen Nguyen; 渡邊隆司; 三上文三; 永田崇; 片平正人

  日本農芸化学会2022年度京都大会, 2022.3.15-18, on-line, 2022年03月15日

  
• Cell surface display of fungal feruloyl esterase in Pichia pastoris

  Apisan Phienluphon; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  第72回日本木材学会大会, 2022.3.15-17, 名古屋-岐阜, on-line, 2022年03月15日

  
• Boost in beech wood’s lignin degradation by heterogeneously expressed manganese peroxidase by using a semi-continuous bioreactor system

  Sze Kai Kenneth Teo; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  第72回日本木材学会大会, 2022.3.15-17, 名古屋-岐阜, on-line, 2022年03月15日

  
• エステル型リグニン-多糖間結合の構造解析

  西村裕志; 永田一真; 永田崇; 片平正人; 渡辺隆司

  第72回日本木材学会大会, 2022.3.15-17, 名古屋-岐阜, on-line, 2022年03月15日

  
• The structure and dynamics of DNA and RNA in living human cells studied by in-cell NMR

  Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Tomoki Sakamoto; Shohei Takami; Masato Katahira

  Pacifichem 2021, virtual, 2021年12月16日, 査読有り

  
• Analysis of enzymatic cleavage of lignin-carbohydrate linkage in woody biomass by fungal glucuronoyl esterase

  Keiko Kondo; Yuta Sakurai; Yuka Yonezawa; Meng-I Lin; Takashi Nagata; Masato Katahira

  Pacifichem 2021, virtual, 2021年12月16日, 査読有り

  
• Structural and physical basis for anti-prion activity and destruction of the Alzheimer’s disease-related complex of an RNA-aptamer

  Takashi Nagata; Tsukasa Mashima; Joon-Hwa Lee; Yuji O. Kamatari; Tomohiko Hayashi; Masahiro Kinoshita; Kazuo Kuwata; Masato Katahira

  Pacifichem 2021, virtual, 2021年12月16日, 査読有り, 筆頭著者

  
• Vif複合体に結合するRNAアプタマーのNMR解析

  関上裕太; 熊谷紀志; 鈴木拓也; 関川湧斗; 神庭圭介; 万里; 永田佳代子; 高折晃史; 片平正人; 永田崇; 坂本泰一

  第 44 回日本分子生物学会年会, 2021.12.1-3, パシフィコ横浜, 2021年12月

  
• NMR法によるDNA-RNAハイブリッドグアニン四重鎖とアルギニンーグリシンリッチペプチドの相互作用解析

  中山千尋; 山置佑大; 近藤敬子; 永田崇; 片平正人

  第 44 回日本分子生物学会年会, 2021.12.1-3, パシフィコ横浜, 2021年12月

  
• 原子間力顕微鏡による機械学習を使用した簡便な四重鎖DNA判別法の開発

  田中 陽一郎; 永田 崇; 杉本 千佳; 荻野 俊郎

  第 44 回日本分子生物学会年会, 2021.12.1-3, パシフィコ横浜, 2021年12月

  
• HIV-1 VifによるAPOBEC3Gの阻害における荷電アミノ酸残基の影響

  神庭 圭佑; 万 里; 雲財 悟; 森下 了; 永田 崇; 片平 正人

  第 44 回日本分子生物学会年会, 2021.12.1-3, パシフィコ横浜, 2021年12月

  
• Musashi-1による標的RNA認識の構造基盤

  Tu WH; Kamba K; Imai T; Kobayashi N; Guntert P; Nagata T; Katahira M

  第 44 回日本分子生物学会年会, 2021.12.1-3, パシフィコ横浜, 2021年12月

  
• NMR Analysis of Interaction between Artificial Peptides and RNAs Derived from HIV-1 Rev and RRE RNA

  Sakamoto T; Nagata T; Koji R; Maeda T; Takeda Y; Kobayashi N; Guntert P; Katahira M; Smith CA; Harada K

  Joint Conference of ISMAR-APNMR-NMRSJ-SEST 2021, on-line, 21.08.23-27, 2021年08月22日, 査読有り

  
• Structural basis for Musashi-1-RNA complex formation

  Tu WH; Kamba K; Imai T; Kobayashi N; Guntert P; Nagata T; Katahira M

  Joint Conference of ISMAR-APNMR-NMRSJ-SEST 2021, on-line, 21.08.23-27, 2021年08月22日, 査読有り

  
• NMR spectroscopic analysis of enzymatic cleavage of lignin-carbohydrate linkage in woody biomass by fungal glucuronoyl esterase

  Kondo K; Sakai Y; Yonezawa Y; Meng-I, L; Nagata T; Katahira M

  Joint Conference of ISMAR-APNMR-NMRSJ-SEST 2021, on-line, 21.08.23-27, 2021年08月22日, 査読有り

  
• In-cell NMR analysis of the DNA triplex structures inside the living human cells

  Sakamoto T; Yamaoki Y; Nagata T; Katahira M

  Joint Conference of ISMAR-APNMR-NMRSJ-SEST 2021, on-line, 21.08.23-27, 2021年08月22日, 査読有り

  
• In-cell NMR Analysis of the Structure and Dynamics of Hairpin and G-quadruplex Structures in the Living Human Cells

  Yamaoki Y; Nagata T; Kondo K; Sakamoto T; Takami S; Katahira M

  Joint Conference of ISMAR-APNMR-NMRSJ-SEST 2021, on-line, 21.08.23-27, 2021年08月22日, 査読有り

  
• Catalytic analysis demonstrates that the inhibition of deamination reaction of A3G by Vif complex can be independent of A3G's ubiquitination

  Kamba K; Wan L; Unzai S; Morishita R; Nagata T; Katahira M

  Joint Conference of ISMAR-APNMR-NMRSJ-SEST 2021, on-line, 21.08.23-27, 2021年08月22日, 査読有り

  
• Study of the Interaction Between Human Origin Recognition Complex Subunit 1 and G-quadruplex Forming Nucleic Acids

  Afaf Eladl; Yudai Yamaoki; Shoko Hoshina; Haruka Horinouchi; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Shou Waga; Masato Katahira

  Joint Conference of ISMAR-APNMR-NMRSJ-SEST 2021, on-line, 21.08.23-27, 2021年08月22日, 査読有り

  
• 様々な合成条件で調製した Dehydrogenation polymer の性状解析

  德永有希; 永田崇; 近藤敬子; 片平正人; 渡辺隆司

  第71回日本木材学会大会, 2021.3.19-21, 東京農工大学府中キャンパス, on-line, 2021年03月

  
• 選択的白色腐朽菌由来の溶解性多糖モノオキシゲナーゼと セルラーゼのシナジー効果の検証

  八木勇成; 近藤敬子; 永田崇; 片平正人

  第71回日本木材学会大会, 2021.3.19-21, 東京農工大学府中キャンパス, on-line, 2021年03月

  
• Screening and heterologous expression of fungal feruloyl esterases, a lignin- carbohydrate complex degrading enzymes, in Pichia pastoris X-33

  Phienluphon A; Kondo K; Nagata T; Katahira M

  日本農芸化学会2021年度仙台大会, 2021.3.18-21, on-line, 2021年03月

  
• Analysis of the interaction between Msi1 RBD1-RBD2 and RNAs

  Tu. W. H; Kamba K; Nagata T; Katahira M

  第43回日本分子生物学会年会, 2020.12.2-4, オンライン, 2020年12月03日

  
• 腐朽菌由来グルクロノイルエステラーゼ による天然リグニン-多糖複合体の分解活性評価

  米沢柚香; 近藤敬子; 坂井勇太; 林孟宜; 永田崇; 片平正人

  第 43 回日本分子生物学会年会, 2020.12.2-4, オンライン開催, 2020年12月02日

  
• Investigation of the interaction between human origin recognition complex subunit 1 and G-rich DNAs

  A. Eladl; Y. Yamaoki; S. Hoshina; H. Horinouchi, K; Kondo; O. Eladl; T. Nagata; S. Waga

  第 43 回日本分子生物学会年会, 2020.12.2-4, オンライン開催, 2020年12月

  
• 好冷菌 Sclerotinia borealis 由来 β-グルコシダーゼの クローニングおよびキャラクタリゼーション

  堀内正隆; 国永史郎; 齋藤泉; 片平正人; 永田崇

  第 43 回日本分子生物学会年会, 2020.12.2-4, オンライン開催, 2020年12月

  
• In-cell NMR 法による非標準構造を形成する DNA のヒト生細胞 内観測

  阪本知樹; 山置佑大; 永田崇; 片平正人

  第 43 回日本分子生物学会年会, 2020.12.2-4, オンライン開催, 2020年12月

  
• Vif-CBFβ-CUL5-ELOB-ELOC複合体に結合するアプタマーのNMR解析

  熊谷紀志; 鈴木拓也; 関川湧斗; 神庭圭佑; 万里; 永田佳代子; 高折晃史; 片平正人; 永田崇; 坂本泰一

  第59回NMR討論会(2020), Gメッセ群馬(高崎), 2020.11.17-19, 2020年11月19日

  
• HIV Vif 5者複合体はAPOBEC3GとAPOBEC3Fの脱アミノ化を阻害する

  神庭 圭佑; 万 里; 雲財 悟; 森下 了; 永田 崇; 片平 正人

  第59回NMR討論会(2020), Gメッセ群馬(高崎), 2020.11.17-19, 2020年11月17日

  
• 有機溶媒-水系におけるb-O-4結合型リグニンオリゴマーモデルの2次元NMRスペクトルの帰属と高次構造の解析

  德永有希; 永田崇; 近藤敬子; 片平正人; 渡辺隆司

  第17回持続的生存圏創成のためのエネルギー循環シンポジウム・第10回先進素材開発解析システム（ADAM）シンポジウム, Kyoto Univ., Uji, 2020.10.30, 2020年10月

  
• Research and development of enzymatic activity control using VHH antibody

  A. Takaori-Kondo; T. Nagata

  The 11th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2020.9.15-16, 2020年09月15日

  
• NMR analysis for the development of artificial RNAs to control biomolecular functions

  K. Kumagai; T. Suzuki; Y. Sekikawa; K. Kamba; L. Wan; K. Nagata; A. Takaori-Kondo; M. Katahira; T. Nagata

  The 11th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2020.9.15-16, 2020年09月15日

  
• Elucidation of correlation between G-quadruplex-based gene expression regulation and their structure

  Y. Tanaka; T. Nagata; T. Ogino

  The 11th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2020.9.15-16, 2020年09月15日

  
• NMR analysis of the three-dimensional solution structure of the sequence-specific RNA-binding protein Musashi involved in translation control of the downstream target RNA

  W.-H. Tu; K. Kamba; T. Nagata; M. Katahira; T. Imai

  The 11th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2020.9.15-16, 2020年09月15日

  
• Development of the crystalline cellulose degradation system consisting of the psychrophilic fungus-type hybrid enzymes

  M. Horiuchi; S. Kuninaga; I. Saito; M. Katahira; T. Nagata

  The 11th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2020.9.15-16, 2020年09月15日

  
• Interaction analysis between cellulase carbohydrate-binding module and lignin by ultra-high sensitivity NMR for biorefinery

  Takashi Watanabe; Yuki Tokunaga; Takashi Nagata; Keiko Kondo; Masato Katahira

  The 11th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2020.9.15-16, 2020年09月

  
• Heterologous expression and oxidative activity of four fungal ligninolytic enzymes by Pichia pastoris

  Kenneth TSK; Kondo K; Nagata T; Katahira M

  日本農芸化学会2020年度大会, 2020.3.25-28, 九州大学伊都キャンパス, 2020年03月25日

  
• 選択的白色腐朽菌が産する溶解性多糖モノオキシゲナーゼの構造および活性の解析

  近藤 敬子; グエン フエン; ワンサミハルジャ アンドリー; 小瀧 努; 三上 文三; 渡辺 隆司; 永田 崇; 片平 正人

  日本農芸化学会2020年度大会, 2020.3.25-28, 九州大学伊都キャンパス, 2020年03月25日

  
• リグニン・多糖複合体分解に関与する白色腐朽菌由来グルクロノイルエステラーゼの速度論解析および添加剤耐性

  坂井勇太; 林孟宜; 檜山明穂; 米沢柚香; 近藤敬子; 永田崇; 片平正人

  日本農芸化学会2020年度大会, 2020.3.25-28, 九州大学伊都キャンパス, 2020年03月25日

  
• In-cell NMR法を用いた非標準構造を形成する核酸の構造安定性の解析

  阪本知樹; 山置佑大; 加納ふみ; 村田昌之; 永田崇; 片平正人

  第100回日本化学会年会, 2020.3.22-25, 東京理科大学, 2020年03月22日

  
• リグニンオリゴマーモデルとセルラーゼ糖質結合モジュール間の相互作用を原子・分子レベルで可視化するためのNMR解析

  徳永 有希; 永田 崇; 近藤 敬子; 片平 正人; 渡辺 隆司

  第70回日本木材学会大会, 2020.3.16-18, 鳥取大学, 2020年03月16日

  
• Oxidative activity of four heterologously expressed fungal ligninolytic enzymes by Pichia pastoris

  Kenneth TSK; Kondo K; Nagata T; Katahira M

  第70回日本木材学会大会, 2020.3.16-18, 鳥取大学, 2020年03月16日

  
• STRUCTURAL AND PHYSICAL BASIS FOR THE HIGHER AFFINITY TO ONCOPROTEIN MDM2 OF A PEPTIDE SELECTED WITH MRNA DISPLAY OVER TUMOR SUPPRESSOR P53

  永田崇; 山田達矢; 林智彦; 肥喜里志門; 小林直宏; 池口満徳; 片平正人; 木下正弘; 柳川弘志

  64th Annual Meeting of the Biophysical Society, San Diego, 2020.2.15-19, 2020年02月16日, 筆頭著者

  
• 安定同位体標識リグニンオリゴマーモデルを用いたセルラーゼ糖質結合モジュールとの相互作用解析

  徳永 有希; 永田 崇; 近藤 敬子; 片平 正人; 渡辺 隆司

  第402回生存圏シンポジウム 第16回持続的生存圏創成のためのエネルギー循環シンポジウム−マイクロ波高度利用と先端分析化学−・第9回先進素材開発解析システム（ADAM）シンポジウム−マイクロ波高度利用生存圏フラッグシップ共同研究−, 2019.12.18, 京都大学宇治キャンパス, 2019年12月18日

  
• AFMで測定したDNA粒子の特徴抽出と機械学習による四重鎖判別法の開発

  田中陽一郎; 永田崇; 萩野俊郎

  第42回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場(福岡)2019.12.3-6, 2019年12月

  
• NADPH再生系を内包するハイブリッド型アゾレダクターゼの開発

  堀内正隆; 永田崇; 片平正人; 小橋川敬博; 鈴木定彦; 落合正則

  第42回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場(福岡)2019.12.3-6, 2019年12月

  
• Promoter associated non-coding RNA, pncRNA, can diminish the aggregation of TLS caused by shearing stress

  Hamad NH; Mashima T; Yamaoki Y; Kondo K; Yoneda R; Kurokawa R; Nagata T; Katahira, M

  第42回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場(福岡)2019.12.3-6, 2019年12月

  
• HIV Vifによるユビキチン化を介さないヒトAOBEC3G活性の阻害

  神庭圭佑; 万里; 雲財悟; 森下了; 永田崇; 片平正人

  第42回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場(福岡)2019.12.3-6, 2019年12月

  
• Vif - CBFβ - CUL5 - ELOB - ELOC 複合体に結合するアプタマーの解析

  熊谷紀志; 鈴木拓也; 関川湧斗; 神庭圭介; 万里; 永田佳代子; 高折晃史; 片平正人; 永田崇; 坂本泰一

  第42回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場(福岡)2019.12.3-6, 2019年12月

  
• 選択的白色腐朽菌に由来するLytic polysaccharide monooxygenaseのX線結晶構造および活性の解析

  近藤敬子; Nuyen Nguyen; Andry Wangsamihardja; 小瀧努; 三上文三; 渡辺隆司; 永田崇; 片平正人

  第42回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場(福岡)2019.12.3-6, 2019年12月

  
• In-cell NMR法によるヒト生細胞内の核酸の構造およびダイナミクスの解析

  山置雄大; 永田崇; 阪本知樹; 高見昇平; 加納ふみ; 村田昌之; 片平正人

  第42回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場(福岡)2019.12.3-6, 2019年12月

  
• ヒト生細胞内における核酸の非標準構造および構造安定性のin-cell NMR法を用いた解析

  阪本知樹; 山置雄大; 加納ふみ; 村田昌之; 永田崇; 片平正人

  第42回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場(福岡)2019.12.3-6, 2019年12月

  
• In-cell NMR法によるヒト生細胞内における核酸‐リガンド相互作用の解析

  高見昇平; 山置雄大; 加納ふみ; 村田昌之; 坂本秦一; 原田和雄; 永田崇; 片平正人

  第42回日本分子生物学会年会, 福岡国際会議場(福岡)2019.12.3-6, 2019年12月

  
• In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内のDNAおよびRNAの構造安定性評価

  山置雄大, 永田崇, 高見昇平, 阪本知樹, 片平正人

  第58回NMR討論会(2019)(NMR討論会・SEST2019連合大会), 川崎市コンベンションホール(川崎)2019.11.7-9 2019年11月, 2019年11月09日

  
• 非常に高い活性を有する抗プリオンRNAアプタマーの構造機能相関

  永田崇; 真嶋司; Lee Joon-Hwa; 鎌足雄司; 林智彦; 木下正弘; 桑田一夫; 片平正人

  第58回NMR討論会(2019)(NMR討論会・SEST2019連合大会), 川崎市コンベンションホール(川崎)2019.11.7-9, 2019年11月

  
• In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内核酸の構造およびダイナミクスの評価

  山置佑大, 永田崇, 清石 彩華, 三宅 雅之, 加納ふみ, 村田昌之, 片平正人

  第57回日本生物物理学会年会, シーガイア(宮崎), 2019.9.24-26, 2019年09月

  
• Fractionation and analysis of lignin-carbohydrate complex using lignin-degrading enzymes

  Saho Kashima; Hiroshi Nishimura; Shizuka Sakon; Misato Yamada; Yasuhiro Shimane; Yukari Ohta; Keiko Kondo; Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Masato Katahira; Takashi Watanabe

  1st International Lignin Symposium (ILS), 20190914, Hokkaido Univ., 2019年09月

  
• Interaction analysis between cellulase carbohydrate-binding module and lignin by ultra-high sensitivity NMR for biorefinery

  Watanabe, T; Tokunaga, Y; Ohshiro S; Nishimura, H; Kishimoto, T; Nakamura, M; Kondo, K; Nagata, T; Katahira, M

  The 10th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2019.9.4-6, 2019年09月

  
• The observation of in-cell NMR signals of nucleic acids in living human cells

  Yamaoki Y; Kiyoishi A; Miyake M; Lin KH; Kano F; Murata M; Nagata T; Katahira M

  7th International Meeting of Quadruplex Nucleic Acids, Changchun, 2019.09.06-09, 2019年09月

  
• HIV Vif–ヒトE3ユビキチンリガーゼ複合体によるヒト抗ウイルス因子APOBEC3Gの脱アミノ化阻害の分子メカニズム

  神庭圭佑; 万里; 雲財悟; 森下了; 永田崇; 片平正人

  第57回日本生物物理学会年会, シーガイア(宮崎), 2019.9.24-26, 2019年09月

  
• The effect of the distance between the RNA sequences recognized by two RNA-binding domains on the affinity of the MSI1-RNA interaction

  杜溦洵; 神庭 圭佑; 永田 崇; 片平 正人

  第57回日本生物物理学会年会, シーガイア(宮崎), 2019.9.24-26, 2019年09月

  
• NMR Analysis for Molecular Insight into the Interaction between Lignin and Carbohydrate Binding Module of Cel7A from Trichoderma reesei

  Tokunaga, Y; Nagata, T; Kondo, K; Katahira, M; Watanabe, T

  The 20th International Symposium on Wood, Fiber and Pulping Chemistry, Univ. Tokyo, 2019.09.09-11, 2019年09月

  
• Structural analyses of covalent linkages between lignin and hemicellulose in wood cell walls

  H. Nishimura; K. Nagata; M. Yamada; T. Nagata; M. Katahira; T. Watanabe

  1st International Lignin Symposium, Sapporo. 2019.9.13-15, 2019年09月

  
• NMR study on Binding Sites of 13C-Lignin Oligomer Models with Carbohydrate Binding Module of Cel7A from Trichoderma reesei

  Tokunaga, Y; Nagata, T; Kondo, K; Katahira, M; Watanabe, T

  1st International Lignin Symposium, Sapporo. 2019.9.13-15, 2019年09月

  
• Strategy of lignocellulose conversion using catalysts with controlled affinity to lignin

  Watanabe, T; Tokunaga, Y; Oshiro, S; Saito, K; Okano, H; Nishimura, H; Nagata, T; Kondo, K; Katahira, M; Isozaki, K; Takaya, H; Nakamura, M

  1st International Lignin Symposium, Sapporo. 2019.9.13-15, 2019年09月

  
• セルラーゼ糖質結合モジュールに対するリグニンモデル吸着部位の解析

  德永有希; 永田崇; 近藤敬子; 片平正人; 渡辺隆司

  第33回セルラーゼ研究会, 佐久平プラザ（長野）, 2019.8.20-21, 2019年08月

  
• Disruption of the Alzheimer’s disease-related complex between prion and amyloid β by an anti-prion aptamer

  T. Mashima; Y. M. Iida; Yamaoki; M. So; T. Nagata; M. Katahira

  Commemorative International Symposium of the Japan Society of Nucleic Acids Chemistry (CISNAC) 2019, Konan University, 2019.07.22-24, 2019年07月

  
• In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内の核酸の構造と安定性の評価

  山置雄大; 永田崇; 清石彩華; 三宅雅之; Lin Kuan-Heng; 高見昇平; 加納ふみ; 村田昌之; 片平正人

  第21回日本RNA学会年会, 東京大学, 2019.07.17-19, 2019年07月

  
• プリオンタンパク質の構造変換を抑制するRNAアプタマーの開発と構造決定

  真嶋司; Lee Joon-Hwa; 鎌足雄司; 林智彦; 永田崇; 西川富美子; 西川諭; 木下正弘; 桑田一夫; 片平正人

  第21回日本RNA学会年会, 東京大学, 2019.07.17-19, 2019年07月

  
• An insight into the target search and HIV Vif-dependent inactivation of APOBEC3F and APOBEC3G elucidated by tracking the deamination events

  Kamba K; Wan L; Nagata T; Katahira M

  8th Asia-Pacific NMR Symposium, Nanyang Technol Univ (Singapore), 2019.07.03-06, 2019年07月, 査読有り

  
• APOBEC3FとAPOBEC3Gの脱アミノ化速度は、それら及びDNAの濃度、さらにDNAの長さに影響を受ける

  神庭圭佑; 万里; 永田崇; 片平正人

  第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会, 神戸国際会議場, 2019.06.24-26, 2019年06月

  
• 白色腐朽菌Pleurotus eryngii由来のリグニン・多糖複合体分解酵素グルクロノイルエステラーゼの発現・精製・活性検証と各種添加剤の活性への影響に関する速度論解析

  坂井勇太; 林孟宜; 檜山明穂; 近藤敬子; 永田崇; 片平正人

  第69回日本木材学会大会, 函館アリーナ(北海道) 2019.3.14-16, 2019年03月

  
• 13Cラベル化リグニンオリゴマーモデルを用いたセルラーゼ糖質結合モジュールとの相互作用解析

  徳永有希; 永田崇; 近藤敬子; 片平正人; 渡辺隆司

  第69回日本木材学会大会, 函館アリーナ(北海道) 2019.3.14-16, 2019年03月

  
• 選択的白色菌Ceriporiopsis subvermispora由来lytic polysaccharide monooxygenase (LPMO) の反応性の解析

  井関優侑; 大城理志; 永田崇; 近藤敬子; 片平正人; 渡辺隆司

  第385回生存圏シンポジウム 2018.11.26京都大学(宇治市), 2018年11月

  
• NMR化学シフト摂動法を用いたセルラーゼ糖質結合モジュールとリグニン間相互作用の解析

  徳永有希; 永田崇; 近藤敬子; 片平正人; 渡辺隆司

  第385回生存圏シンポジウム 2018.11.26京都大学(宇治市), 2018年11月

  
• Development of RNA Aptamer That Has High Anti-prion Activity and Its Structural Basis

  Mashima, M; Joon-Hwa, L; Kamatari, Y. O; Hayashi, T; Nishikawa, F; Nagata, T; Nishikawa, S; Kinoshita, M; Kuwata, K; Katahira, M

  Japan Society of Nucleic Acids Chemistry, 2018年11月

  
• In-cell NMR studies on structure and dynamics of DNA and RNA introduced inside the living human cells

  Yamaoki Y; Nagata T; Kiyoishi A; Miyake M; Lin K; Takami S; Kano F; Murata M; Katahira M

  ISNAC2018, Kyoto Univ (Kyoto), 2018.11.7-9, 2018年11月

  
• NMR法によるリグニン-セルラーゼ糖質結合モジュール間吸着の解析

  徳永有希; 永田崇; 近藤敬子; 片平正人; 渡辺隆司

  第63回リグニン討論会, 東京農工大学（東京）2018.11.1-2, 2018年11月

  
• Classification of a lignin-carbohydrate complex (LCC) degradation enzymes, fungal glucuronoyl esterases (FGEs), and expression/ characterization of two new FGEs of white rot fungi

  林孟宜; 檜山明穂; 近藤敬子; 坂井勇太; 永田崇; 片平正人

  第63回リグニン討論会, 東京農工大学（東京）2018.11.1-2, 2018年11月

  
• In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内の核酸の解析

  山置 佑大; 永田 崇; 清石 彩華; 三宅雅之; Lin Kuan-Heng; 高見昇平; 加納 ふみ; 村田 昌之; 片平 正人

  第41回日本分子生物学会年会, パシフィコ横浜(横浜)2018.11.28-30, 2018年11月

  
• HIV Vif– ヒトE3ユビキチンリガーゼ複合体はAPOBEC3Gの脱アミノ化を直接阻害する

  神庭圭佑; 汪 寧馨; 雲財 悟; 森下 了; 永田崇; 片平正人

  第41回日本分子生物学会年会, パシフィコ横浜(横浜)2018.11.28-30, 2018年11月

  
• Vif - CBFβ - CUL5 - ELOB - ELOC 複合体に結合する 2’F 化した aptamer の取得

  関川 湧斗; 水澤 果那; 神庭 圭介; 鈴木 拓也; 万 里; 片平 正人; 永田 崇; 坂本 泰一

  第41回日本分子生物学会年会, パシフィコ横浜(横浜)2018.11.28-30, 2018年11月

  
• Vif-CBFβ-CUL5-ELOB-ELOC複合体に対するアプタマーの取得と解析

  鈴木拓也; 万里; 関川湧斗; 田中陽一郎; 神庭圭介; 片平正人; 永田崇; 坂本泰一

  第41回日本分子生物学会年会, パシフィコ横浜(横浜)2018.11.28-30, 2018年11月

  
• 中分子アゴニスト創薬のロジカルデザイン

  高折晃史; 北脇年雄; 永田崇

  第２回モダリティ創薬デザイン研究会, グランフロント大阪(大阪) 2018.11.26, 2018年11月

  
• Fractionation and analysis of lignin-carbohydrate complex in wood cell wall

  Saho Kashima; Hiroshi Nishimura; Shizuka Sakon; Misato Yamada; Yukari Ohta; Keiko Kondo; Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Masato Katahira; Takashi Watanabe

  The 3rd Asia Research Node Symposium on Humanosphere Science, NCHU, Taiwan, 20180926: P19, 2018年09月

  
• Fractionation and structural analysis of enzyme-treated lignin-carbohydrate complexes

  Hiroshi Nishimura; Shizuka Sakon; Misato Yamada; Kazuma Nagata; Takashi Nagata; Masato Katahira; Yukari Ohta; Takashi Watanabe

  lignobiotech 2018, p17, 5th Symposium of Biotechnology Applied to Lignocelluloses, Helsinki, 2018年09月01日

  
• An RNA aptamer disrupts the interaction of prion protein with Amyloid β

  Iida M; Mashima T; Yamaoki Y; So M; Nagata T; Katahira M

  第56回日本生物物理学会年会、岡山大学 (岡山)、2018.9.15-17, 2018年09月

  
• Real-Time NMR Analysis of the Continuous Degradation Process of Azo Dyes using Azoreductase in Cooperation with the NADPH Regeneration System

  Horiuchi M; Nagata T; Katahira M; Kobashigawa Y; Suzuki Y; Ochiai M

  The 9th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2018.9.3-5, 2018年09月

  
• Development of Lignocellulose Degrading Saccharomyces Cerviciae via Cell-Surface Display of Lytic Polysaccharide Monooxygenase

  Mousa MOM; Kondo K; Khattab S; Nagata T; Abdul-Raouf UM; Watanabe T; Katahira M

  The 9th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2018.9.3-5, 2018年09月

  
• Development of Functional Peptides that Bind to RNA

  Watanabe N; Kinase T; Nomura Y; Nagata T; Katahira M; Sakamoto T

  The 9th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2018.9.3-5, 2018年09月

  
• Interaction Analysis Between Cellulase Carbohydrate-Binding Module and Lignin by Ultra-High Sensitivity NMR for Biorefinery

  Watanabe T; Tokunaga T; Ohshiro S; Nishimura H; Kishimoto T; Nakamura M; Kondo T; Nagata T; Katahira M

  The 9th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2018.9.3-5, 2018年09月

  
• Hopping Conduction in A Hydronium Solvate Ionic Liquid

  Kitada A; Fukami K; Saimura M; Nagata T; Katahira M

  The 9th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2018.9.3-5, 2018年09月

  
• Characteristics of the C-terminal domain of anti-viral factor APOBEC3G: mechanism behind a target search and inhibition by HIV-1 Vif protein

  Kamba K; Nagata T; Katahira M

  XXVIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems, Univ Col Dublin (Ireland), 2018.8.19-24, 2018年09月

  
• NMR analysis of Non-productive Binding of Carbohydrate Binding Module of Cellobiohydrolase with Lignin

  Tokunaga T; Nagata T; Kondo K; Katahira M; Watanabe T

  The 3rd Asia Research Node Symposium on Humanosphere Science, National Chung Hsing University (Taiwan) 2018.9.25-27, 2018年09月

  
• MDM2-p53NTDとMDM2-MIPの結合自由エネルギーに見られる大きな差の物理起源

  Yamada T; Hayashi T; Kobayashi N; Yanagawa H; Katahira M; Nagata T; Kinoshita M

  第56回日本生物物理学会年会、岡山大学（岡山）、2018.9.15-17, 2018年09月

  
• Deep-MagRO: 深層学習を応用した高速かつ高精度な統合的NMR解析システム

  小林直宏; 杉木俊彦; 永田崇; 古賀信康; Peter Güntert; 児嶋長次郎; 藤原敏道

  第57回NMR討論会 札幌コンベンションセンター（札幌市）, 2018.9.18-20, 2018年09月

  
• In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内のDNAおよびRNAの構造とダイナミクスの解析

  山置 佑大; 永田 崇; 清石 彩華; 三宅雅之; 加納 ふみ; 村田 昌之; 片平 正人

  第57回NMR討論会 札幌コンベンションセンター（札幌市）, 2018.9.18-20, 2018年09月

  
• 抗プリオン活性を有する四重鎖RNAの構造解析

  真嶋司; Lee Joon-Hwa; 林 智彦; 西川富美子; 鎌足雄司; 永田崇; 西川諭; 桑田一夫; 木下 正弘; 片平正人

  第57回NMR討論会 札幌コンベンションセンター（札幌市）, 2018.9.18-20, 2018年09月

  
• Approaches for valorization of lignovelluloses using microwave technology and lignin-binding catalysts

  Takashi Watanabe; Chen Qu; Satoshi Oshiro; Hiroshi Nishimura; Keiichiro Kashimura; Takashi Nagata; Masato Katahira; Katsuhiro Isozaki; Hikaru Takaya; Masaharu Nakamura

  lignobiotech 2018, p21, 5th Symposium of Biotechnology Applied to Lignocelluloses, Helsinki, 2018年08月31日

  
• Observation of imino proton signals of DNA and RNA introduced inside the living human cells by using in-cell NMR spectroscopy

  Yamaoki Y; Nagata T; Kiyoishi Y; Miyake M; Kano F; Murata M; Katahira M

  XXVIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems, Univ Col Dublin (Ireland), 2018.8.19-24, 2018年08月

  
• Structural and theoretical insights into the RNA-recognition mechanism by Musashi-1

  Nagata T; Iwaoka R; Hayashi T; Tsuda K; Kobayashi N; Kinoshita M; Katahira M

  XXVIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems, Univ Col Dublin (Ireland), 2018.8.19-24, 2018年08月

  
• Application of Deep Neural Networks for Highly Accurate NMR Structure Analysis by Deep-MagRO

  Kobayashi N; Sugiki T; Hattori Y; Nagata T; Shinya S; Wurz JM; Koga R; Koga N; Guntert P; Kojima C; Fujiwara T

  XXVIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems, Univ Col Dublin (Ireland), 2018.8.19-24, 2018年08月

  
• 白色腐朽菌Ceriporiopsis subvermispora由来lytic polysaccharide monooxygenase (LPMO) の反応性の解析

  井関優侑; 大城理志; 永田崇; 近藤敬子; 片平正人; 渡辺隆司

  第32回セルラーゼ研究会, 佐久平プラザ（長野）, 2018.7.13-14, 2018年07月

  
• Trichoderma reesei由来Cel7AのCBM1がリグニンに吸着するメカニズムの解析

  徳永有希; 永田崇; 近藤敬子; 片平正人; 渡辺隆司

  第32回セルラーゼ研究会, 佐久平プラザ（長野）, 2018.7.13-14, 2018年07月, 招待有り

  
• 抗プリオンアプタマーによるプリオンタンパク質とアミロイドβの相互作用の阻害

  飯田 真美子; 真嶋 司; 山置 佑大; 宗 正智; 永田 崇; 片平正人

  第20回日本RNA学会年会2018.7.9-11ホテルコスモスクエア国際交流センター(大阪), 2018年07月

  
• HIV-1 RRE由来のRNA断片と人工ペプチドの相互作用の解析

  野村祐介; 渡邊 なつき; 木名瀬智章; 永田崇; 片平正人; 原田和雄; 坂本泰一

  第20回日本RNA学会年会2018.7.9-11ホテルコスモスクエア国際交流センター(大阪), 2018年07月

  
• Vif-CBFβ-CUL5-ELOB-ELOC複合体に対するアプタマーの取得と解析

  鈴木拓也; 万里; 関川湧斗; 田中陽一郎; 神庭圭介; 片平正人; 永田崇; 坂本泰一

  平成30年度日本生化学会関東支部例会, 埼玉大学(埼玉), 2018.6.23, 2018年06月

  
• HIV Vif-E3ユビキチンリガーゼ複合体と核酸の相互作用

  神庭圭佑; 永田崇; 片平正人

  第18回日本蛋白質科学会年会2018.06.28-28, 朱鷺メッセ(新潟), 2018年06月

  
• Detection of different conformational changes of Translocated in liposarcoma, TLS, upon its binding to various nucleic acids

  Nesreen Hamad; Tsukasa Mashima; Yudai Yamaoki; Hiroki Watanabe; Takayuki Uchihashi; Riki Kurokawa; Takashi Nagata; Masato Katahira

  第18回日本蛋白質科学会年会2018.06.26-28, 朱鷺メッセ (新潟), 2018年06月

  
• セルラーゼ糖質結合モジュールとリグニン間相互作用部位のNMRによる解析

  徳永有希; 大城理志; 永田崇; 近藤敬子; 西村裕志; 片平正人; 渡辺隆司

  第68回日本木材学会, 京都大学(京都), 2018.3.14-16, 2018年03月

  
• NADPH再生系を伴ったアゾレダクターゼによるアゾ染料分解反応のNMR解析

  堀内正隆; 永田崇; 片平正人; 小橋川敬博; 鈴木定彦; 落合正則

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2018年

  
• Modeling of the tandem RNA-binding domains of a neural and oncogenic protein, Musashi1, engaging the minimum target RNA

  Ryo Iwaoka; Takashi Nagata; Kengo Tsuda; Takao Imai; Hideyuki Okano; Naohiro Kobayashi; Masato Katahira

  第40回日本分子生物学会年会(2017年度生命科学系学会合同年次大会)神戸ポートアイランド(神戸)2017.12.6-9, 2017年12月

  
• The effect of different target nucleic acids on the structural change of TLS

  Nesreen Hamad; Tsukasa Mashima; Hiroki Watanabe; Takayuki Uchihashi; Riki Kurokawa; Takashi Nagata; Masato Katahira

  ConBio2017, 神戸ポートアイランド(神戸)2017.12.6-9, 2017年12月

  
• Interaction between non-coding RNA and TLS/FUS protein, and structural change

  Mashima, T; Nagata, T; Hamad, N; Ozawa, S; Yamaoki, Y; Kondo, K; Watanabe, H; Yoneda, R; Uchihashi, T; Kurokawa, R; Katahira, M

  The 44th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry, 2017年11月

  
• Binding analysis of tandem dimer of lignin-binding peptide and design of artificial enzyme carrying the peptide for enhanced lignin degradation

  Satoshi Oshiro; Asako Yamaguchi; Hiroshi Nishimura; Takashi Nagata; Masato Katahira; Takashi Watanabe

  HSS2017 and 7th ISSH meeting, Bogor, Indonesia (oral), 2017年11月

  
• Studies on lytic polysaccharide monooxygenase (LPMO) from the selective white rot fungus, Ceriporiposis subvermispora

  Yuu Iseki; Satoshi Oshiro; Takashi Nagata; Keiko Kondo; Hiroshi Nishimura; Masato Katahira; Takashi Watanabe

  Humanosphere Science School 2017, Salak Tower (Bogor, Indonesia), 2017.11.1-2, 2017年11月

  
• Analysis of Adsorption Mechanism between Carbohydrate Binding Module of Cellulase and Lignin by NMR

  Yuki Tokunaga; Satoshi Oshiro; Takashi Nagata; Keiko Kondo; Hiroshi Nishimura; Masato Katahira; Takashi Watanabe

  Humanosphere Science School 2017, Salak Tower (Bogor, Indonesia), 2017.11.1-2, 2017年11月

  
• Analysis of Lignin-Carbohydrate Complexes in Woody Biomass by Using NMR

  Shizuka Sakon; Hiroshi Nishimura; Misato Yamada; Yukari Ohta; Keiko Kondo; Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Masato Katahira; Takashi Watanabe

  Humanosphere Science School 2017, Salak Tower (Bogor, Indonesia), 2017.11.1-2, 2017年11月

  
• 翻訳開始前複合体において形成される翻訳開始因子間の結合ネットワークの役割

  永田崇; 吉田尚志; 雲財悟; 浦野健; 浅野桂; 尾林栄治

  第56回NMR討論会 首都大学東京（八王子市）, 2017.11.14-16, 2017年11月

  
• In-cell NMR法によるヒト細胞内DNAおよびRNAの観測

  山置 佑大; 清石 彩華; 三宅雅之; 加納 ふみ; 村田 昌之; 永田 崇; 片平 正人

  第56回NMR討論会 首都大学東京（八王子市）, 2017.11.14-16, 2017年11月

  
• 深層学習により強化されたNMR立体構造解析

  小林直宏; 永田崇; 服部良一; 新家粧子; Julia M. Wurz; Peter Guntert; 児嶋長次郎; 藤原敏道

  第56回NMR討論会 首都大学東京（八王子市）, 2017.11.14-16, 2017年11月

  
• RNA結合タンパク質Musashi-1のRBD2:r(GUAGU)複合体溶液構造決定と標的RNA選択メカニズムの解明

  岩岡諒; 永田崇; 津田健吾; 今井貴雄; 岡野栄之; 小林直宏; 片平正人

  第56回NMR討論会 首都大学東京（八王子市）, 2017.11.14-16, 2017年11月

  
• Characterization of the cytidine deamination properties of human APOBEC3B by real-time NMR, which are quite different from those of APOBEC3G

  Li Wan; Takashi Nagata; Ryo Morishita; Akifumi Takaori-Kondo; Masato Katahira

  第44回国際核酸化学シンポジウム, 日本核酸化学会第1回年会, 東京理科大学（東京）2017.11.14-16, 2017年11月

  
• Sphingombium sp. YG1由来guaiacylglycerol-β-guaiacyl ether - Cα位酸化酵素の酵素学的解析と利用

  前田亜鈴悠; 宋晶; 西真郎; 黒澤佳奈子; 市川淳子; 塩谷美夏; 山置佑大; 永田崇; 片平正人; 山田美紗登; 西村裕志; 渡辺隆司; 大田ゆかり

  第62回リグニン討論会、名古屋大学, poster, 2017年10月

  
• Analysis of peroxidase activity, lignin model degradation of heterologous expressed soluble fungal ligninolytic enzymes

  Meng-I Lin; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  2017 Taiwan-Japan Biomedical Symposium on Magnetic Resonance, National Cheng Kung University (Tainan), 2017.10.15-17, 2017年10月

  
• Sphingombium sp. YG1由来guaiacylglycerol-β-guaiacyl ether - Cα位酸化酵素の酵素学的解析と利用

  前田亜鈴悠; 宋晶; 西真郎; 黒澤佳奈子; 市川淳子; 塩谷美夏; 山置佑大; 永田崇; 片平正人; 山田美沙登; 渡辺隆司; 大田ゆかり

  第62回リグニン討論会, 名古屋大学（名古屋）2017.10.26-27, 2017年10月

  
• フラグメント分子軌道法を活用したリグニンβ-O-4還元開裂酵素の機能改変

  嶋根康弘; 黒澤佳奈子; 市川淳子; 前田亜鈴悠; 布浦拓郎; 山置佑大; 永田崇; 片平正人; 高谷光; 吉田亮太; 中村正治; 渡辺隆司; 大田ゆかり

  第62回リグニン討論会, 名古屋大学（名古屋）2017.10.26-27, 2017年10月

  
• Kinetic studies of the two fungal glutathione-dependent enzymes and their potential roles in the intracellular detoxification and wood-derived compound metabolism

  Wan Hasnidah; Wan Osman; Meng-I Lin; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  第62回リグニン討論会, 名古屋大古屋）2017.10.26-27学（名, 2017年10月

  
• Structural analysis of lignocellulosic biomass by solution-state NMR for future biorefinery

  Takashi Watanabe; Hiroshi Nishimura; Chen Qu; Misato Yamada; Shizuka Sakon; Takao Kishimoto; Masaharu Nakamura; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Makoto Katahira

  The 8th International Symposium of Advanced Energy Science - Interdisciplinary Approach to Zero Emission Energy (poster), 2017年09月

  
• Development of the artificial multi-domain enzymes immobilized on the curdlan sheet at low cost.

  Masataka Horiuchi; Takashi Nagata; Masato Katahira; Yoshihiro Kobashigawa; Yasuhiko Suzuki; Masanori Ochiai

  The 8th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2017.9.5-6, 2017年09月

  
• Structure-function relationship of Epstein-Barr Virus EBNA3C NLS and transport receptor

  Go Matsuda; Takashi Nagata; Masato Katahira; Ken-ichi Imadome

  The 8th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2017.9.5-6, 2017年09月

  
• テロメア長短縮をもたらすTLS/FUS蛋白質とテロメアDNAおよびTERRAのグアニン四重鎖との複合体に関するNMR解析

  近藤 敬子; 真嶋 司; 大吉 崇文; 黒川 理樹; 小林直宏; 永田 崇; 片平 正人

  第55回生物物理学会、熊本大学（熊本市）、2017.9.19-21, 2017年09月

  
• 基質DNAの長さ、濃度、及び標的配列位置がAPOBEC3Fの脱アミノ活性に及ぼす影響

  万里; 永田崇; 片平正人

  第55回生物物理学会、熊本大学（熊本市）、2017.9.19-21, 2017年09月

  
• プリオンアプタマーはアルツハイマー病に関与するプリオン蛋白質とAβオリゴマーの複合体の形成を阻害する

  飯田 真美子; 真嶋 司; 山置 佑大; 永田 崇; 片平正人

  第55回生物物理学会、熊本大学（熊本市）、2017.9.19-21, 2017年09月

  
• 18-crown-6を用いるヒドロニウム溶媒和イオン液体の基礎物性

  北田敦; 竹岡駿; 近都康平; 深見一弘; 才村正幸; 永田崇; 片平正人; 邑瀬邦明

  2017年電気化学会秋季大会 2017.9.10-11、長崎大学文教地区キャンパス, 2017年09月

  
• Development of RNA binding peptides based on tertiary structural information

  Natsuki Watanabe; Tomoaki Kinase; Takashi Nagata; Masato Katahira; Kazuo Harada; Taiichi Sakamoto

  The 8th International Symposium of Advanced Energy Science, Kyoto Univ., Uji, 2017.9.5-6, 2017年09月

  
• TLS/FUSの非コードRNAの認識機構の構造学的研究

  真嶋司; 小澤 駿介; Nesreen Hamad; 米田竜馬; 黒川 理樹; 永田崇; 片平 正人

  第19回日本RNA学会年会2017.7.19-21富山国際会議場(富山), 2017年07月

  
• NMR法によるセルラーゼ糖質結合モジュール-リグニン間相互作用の解明

  徳永有希; 大城理志; 永田崇; 近藤敬子; 西村裕志; 片平正人; 渡辺隆司

  第３１回セルラーゼ研究会 長野 2017.7.7-8, 2017年07月

  
• Conformational change detection of translocated in liposarcoma, TLS, upon binding to various RNAs

  Nesreen Hamad; Tsukasa Mashima; Yudai Yamaoki; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  第19回日本RNA学会年会2017.7.19-21富山国際会議場(富山), 2017年07月

  
• NMR Analysis of Interaction Mechanism between Carbohydrate Binding Module of Cellulase and Lignin

  Yuki Tokunaga; Satoshi Oshiro; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Hiroshi Nishimura; Masato Katahira; Takashi Watanabe

  The 2nd Asia Research Node Symposium on Humanosphere Science.2017.7.19-21.Kyoto Univ. (Uji), 2017年07月

  
• HIV-1 RRE由来のRNA断片と人工ペプチドの相互作用の解析

  渡邊 なつき; 木名瀬智章; 永田崇; 片平正人; 原田和雄; 坂本泰一

  平成29年度日本生化学会関東支部例会, 東京医科歯科(東京), 2017.6.17, 2017年06月

  
• TLS/FUSのRNA認識機構と結合に伴うコンフォーメーション変化の研究

  真嶋 司; 小澤 駿介; Nesreen Hamad; 米田 竜馬; 黒川 理樹; 永田 崇; 片平 正人

  第17回日本蛋白質科学会年会 2017.6.20-22、仙台国際センター(仙台), 2017年06月

  
• Highly automated NMR signal assignments using peak-noise recognition assisted by Deep Neural Networks

  Kobayashi, N; Nagata, T; Kojima, C; Fujiwara, T

  Gordon Research Conference. Computational Aspects-Biomol NMR.2017.6.11-16.Grand Summit Hotel Sunday River.(Newy,ME,USA), 2017年06月

  
• High yield production, activity analysis, and homologous modeling of soluble fungal peroxidases expressed in E. coli

  Meng-I Lin; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  第17回日本蛋白質科学会年会 2017.6.20-22、仙台国際センター(仙台), 2017年06月

  
• APOBEC3Gのストランド間移動の実時間NMR法検出

  神庭圭佑; 永田崇; 片平正人

  第17回日本蛋白質科学会年会 2017.6.20-22、仙台国際センター(仙台), 2017年06月

  
• Invention of RNA aptamer and ribozyme whose activities switch on in response to K+ via G-quadruples formation

  Yamaoki, Y; Mashima, T; Nagata, T; Katahira, M

  6th International Meeting on Quadruplex Nucleic Acids, 2017年05月

  
• リグノセルロースの糖－リグニン複合体とその酵素反応の解析

  西村 裕志; 左近 静香; Jenny Arnling Baath; Amanda Ristinmaa; Johanna Nilsson; Gunnar Westman; Lisbeth Olsson; 永田 一真; 永田 崇; 片平 正人; 渡辺 隆司

  第67回日本木材学会大会、九州大学（福岡市）、2017.3.17-19, 2017年03月

  
• 安定同位体標識法を用いたセルラーゼ糖質結合モジュールとリグニン間相互作用のNMRによる解析

  徳永有希; 大城理志; 永田崇; 近藤敬子; 西村裕志; 片平正人; 渡辺隆司

  第67回日本木材学会大会、九州大学（福岡市）、2017.3.17-19, 2017年03月

  
• Characterization of Glutathione-Dependent Enzymes from White Rot Fungi

  Wan Hasnidah; Wan Osman; Meng-I Lin; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  日本農芸化学会、ウェスティン都ホテル京都（京都市）、2017.3.17-20, 2017年03月

  
• Heterologous expression of the ligninolytic enzymes from wood rotting fungi and analysis of peroxidase activity, lignin model degradation, and homologous modeling

  Meng-I Lin; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  日本農芸化学会、ウェスティン都ホテル京都（京都市）2017.3.17-20, 2017年03月

  
• Characterization of the deamination activity of APOBEC3B by real-time NMR, which is distinct from that of APOBEC3G

  Li Wan; Takashi Nagata; Ryo Morishita; Akifumi Takaori-Kondo; Masato Katahira

  7th Asia-Pacific NMR Symposium, Indian Institute of Science (Bangalore), 2017.02.16-19, 2017年02月

  
• Sliding and intersegmental transfer along DNA enhance the enzymatic activity of APOBEC3G as revealed by real-time NMR monitoring methods

  Keisuke Kamba; Takashi Nagata; Masato Katahira

  7th Asia-Pacific NMR Symposium, Indian Institute of Science (Bangalore), 2017.02.16-19, 2017年02月

  
• 木質バイオマス中の糖－リグニン複合体の解析と酵素による分解

  左近静香; 西村裕志; Arnling Baath Jenny; Ristinmaa Amanda; Nilsson Johanna; Westman Gunnar; Olsson Lisbeth; 永田一真; 永田 崇; 片平正人; 渡辺隆司

  第330回生存圏シンポジウム 第13回持続的生存圏創成のためのエネルギー循環シンポジウム—マイクロ波高度利用と先端分析化学—, poster, 2017.1.10, 2017年01月

  
• NMR study for the recognition of non-coding RNA and DNA by TLS/FUS, a key regulator of the transcriptional repression by cyclin D1 and telomere

  K. Kondo; T. Mashima; T. Oyoshi; R. Yoneda; R. Kurokawa; T. Nagata; M. Katahira

  International Symposium for NMR of Nucleic Acids,Gyeongsang National Univ. (Korea),2017.1.17, 2017年01月

  
• Development of K+-responsive RNA aptamer and ribozyme, and in-cell NMR of nucleic acids in human cells

  Y. Yamaoki; A. Kiyoishi; T. Mashima; F. Kano; M. Murata; T. Nagata; M. Katahira

  International Symposium for NMR of Nucleic Acids,Gyeongsang National Univ. (Korea),2017.1.17, 2017年01月

  
• リアルタイムNMRモニタリング法による酵素反応の定量解析及びヒト抗ウイルス因子ＡＰＯＢＥＣ３Ｇの脱アミノ化機構の解明

  神庭圭佑; 永田崇; 片平正人

  定量生物学の会年会、岡崎コンファレンスセンター（岡崎）、2017.1.8-1.9, 2017年01月

  
• Cyclin D1遺伝子転写制御やテロメア長制御に関わるTLS/FUSタンパク質と非コード核酸間の相互作用のNMR法による解析

  近藤 敬子; 真嶋 司; 大吉 崇文; 米田 竜馬; 黒川 理樹; 永田 崇; 片平 正人

  第55回NMR討論会 広島国際会議場, 広島国際会議（広島市）,2016.11.16-18, 2016年11月

  
• 木質バイオマスにおける超分子構造とステレオ選択的な酵素反応及び核酸のin-cell NMR

  山置佑大; 永田一真; 清石彩華; 西村裕志; 加納ふみ; 村田昌之; 大田ゆかり; 渡辺隆司; 永田崇; 片平正人

  第55回NMR討論会 広島国際会議場, 広島国際会議（広島市）,2016.11.16-18, 2016年11月

  
• 深層学習に支援されたNMRシグナルの自動解析

  小林直宏; 服部良一; 永田崇; 児嶋長次郎; 藤原敏道

  第55回NMR討論会 広島国際会議場, 広島国際会議（広島市）,2016.11.16-18, 2016年11月

  
• 非コードRNAと結合してcyclin D1転写を抑制するTLS/FUSのRNA認識機構の構造学的基盤

  真嶋司; 小澤 駿介; 近藤 敬子; Nesreen Hamad; 米田竜馬; 黒川 理樹; 永田崇; 片平 正人

  第39回日本分子生物学会年会、パシフィコ横浜（横浜市）、2016.11.30-12.2, 2016年11月

  
• プリオンタンパク質とプリオンタンパク質を標的とするRNA分子のAβ線維化への影響

  飯田 真美子; 真嶋 司; 山置 佑大; 永田 崇; 片平正人

  第54回日本生物物理学会年会、つくば国際会議場（つくば市）、2016.11.25-27, 2016年11月

  
• スライディングとストランド間移動を用いたヒト抗ウイルス因子APOBEC3Gの高効率なDNA配列探索：実時間NMRによる新知見

  神庭 圭佑; 永田 崇; 片平 正人

  第54回日本生物物理学会年会、つくば国際会議場（つくば市）、2016.11.25-27, 2016年11月

  
• Characterization of the deamination activity of APOBEC3B by real-time NMR, which is distinct from that of APOBEC3G

  Li Wan; Takashi Nagata; Ryo Morishita; Akifumi Takaori-Kondo; Masato Katahira

  第54回日本生物物理学会年会、つくば国際会議場（つくば市）、2016.11.25-27, 2016年11月

  
• 海洋性細菌に由来するリグニンβ-O-4還元開裂酵素GST4の解析

  嶋根康弘; 前田亜鈴悠; 塩谷美夏; 黒澤佳奈子; 市川淳子; 布浦拓郎; 山置佑大; 永田崇; 片平正人; 高谷光; 吉田亮太; 中村正治; 渡辺隆司; 大田ゆかり

  第61回リグニン討論会、京都大学（宇治市）、2016.10.27-28, 2016年10月

  
• Heterologous expression and structure-activity relationship analysis of the oxidative enzymes from wood rotting fungi that are involved in lignocellulose degradation

  Meng-I Lin; Keiko Kondo; Takashi Nagata; Masato Katahira

  第61回リグニン討論会、京都大学（宇治市）、2016.10.27-28, 2016年10月

  
• リグノセルロースバイオリファイナリーのためのリグニン・ペプチド間相互作用解析

  山口亜佐子; 末富高志; 大城理志; 徳永有希; 西村裕志; 永田崇; 真嶋司; 片平正人; 磯﨑勝弘; 高谷光; 中村正治; 渡辺隆司

  第61回リグニン討論会、京都大学（宇治市）、2016.10.27-28, 2016年10月

  
• Investigation of the interactions between eukaryotic initiation factors implicated during ribosomal scanning and start codon recognition

  永田 崇

  The 42nd Naito Conference on “In the Vanguard of Structural Biology: Revolutionizing Life Sciences” CHÂTERAISÉ Gateaux Kingdom SAPPORO, Sapporo, 2016.10.4-7, 2016年10月, 査読有り

  
• Integrating strategy for production of bioethanol and lignin derivatives from rice straw

  Khattab, S; Kondo, K; Lin, M. I; Mashima, T; Nagata, T; Katahira, M

  The 7th International Symposium of Advanced Energy Science -Frontier of Zero Emission Energy-, 2016年09月

  
• Low-cost degradation of azo dyes using the GRP-tagged azoreductase combined with NADPH regeneration enzymes immobilized on the curdlan sheet

  Masataka Horiuchi; Yasuhiko Suzuki; Masanori Ochiai; Takashi Nagata; Masato Katahira

  The 7th International Symposium of Advanced Energy Science.京都大学（宇治市）,2016.9.5-9.7, 2016年09月

  
• Development of artificial RNA and artificial peptide to control gene expression by using NMR

  Yumi Takeda; Takashi Nagata; Ryo Amano; Yusuke Nomura; Kazuo Harada; Colin A. Smith; Masato Katahira; Taiichi Sakamoto

  The 7th International Symposium of Advanced Energy Science.京都大学（宇治市）,2016.9.5-9.7, 2016年09月

  
• Non-coding RNA/DNA recognition by TLS/FUS that causes repression of cyclin D1 transcription and telomere elongation

  Kondo, K; Mashima, T; Oyoshi, T; Yoneda, R; Kurokawa, R; Nagata, T; Katahira, M

  The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry, 熊本大学（熊本市）, 2016.9.27-29, 2016年09月

  
• Invention of K+-responsive Tat-binding RNA aptamer and hammerhead ribozyme, and in-cell NMR of nucleic acids

  Yudai Yamaoki; Ayaka Kiyoishi; Tsukasa Mashima; Fumi Kano; Masayuki Murata; Takashi Nagata; Masato Katahira

  The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry, 熊本大学（熊本市）, 2016.9.27-29, 2016年09月

  
• カリウムイオン応答性Tat結合RNAアプタマーおよびハンマーヘッドリボザイムの創製およびin-cell NMR法による細胞内核酸の観測

  山置 佑大; 清石 彩華; 真嶋 司; 加納 ふみ; 村田 昌之; 永田 崇; 片平 正人

  第10回バイオ関連化学シンポジウム、第31回生体機能関連化学シンポジウム、第19回バイオテクノロジー部会シンポジウム、石川県立音楽堂（金沢市）、2016.9.7-9.9, 2016年09月

  
• NMR studies of non-coding RNA and DNA recognition by TLS/FUS which induces transcriptional repression of cyclin D1 and telomere shortenin

  Kondo, K; Mashima, T; Oyoshi, T; Yoneda, R; Kurokawa, R; Nagata, T; Katahira, M

  The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems, 2016年08月

  
• Deamination mechanism coupled with sliding along single-stranded DNA of anti-HIV factor APOBEC3G as investigated by real-time NMR spectroscopy

  Kamba, K; Nagata, T; Katahira M

  The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems, 2016年08月

  
• Accurate and molecular-size-tolerant NMR quantitation of diverse compounds, and real-time monitoring of enzymatic reaction

  Okamura, H; Kamba, K; Nishimura, H; Kigawa, T; Watanabe, T; Nagata, T; Katahira, M

  The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems, 国立京都国際会館（京都市）、2016.21-26, 2016年08月

  
• K+-responsive Activation of Ribozyme System via Structural Transition from Duplex to Dual-quadruplex Requiring no Heating and Cooling Treatment

  Yudai Yamaoki; Takashi Nagata; Tsukasa Mashima; Masato Katahira

  The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems, 国立京都国際会館（京都市）、2016.21-26, 2016年08月

  
• Analysis of molecular interaction of peptides with lignin for lignocellulosic biorefinery

  Watanabe, T; Yamaguchi, A; Oshiro, S; Suetomi, T; Nishimura, H; Nagata, T; Mashima, T; Katahira, M; Isozaki, K; Takaya, H; Nakamura, M

  4th Symposium on Biotechnology applied to Lignocelluloses. CSIC downtown Campus (Madrid), 2016.6.19-22, 2016年06月

  
• ヒト抗HIV因子APOBEC3Gの標的探索及び脱アミノ化には静電相互作用が支配的である

  神庭 圭佑; 永田 崇; 片平正人

  新学術領域「柔らかな分子系」第 16 回 ワークショップ, 2016年06月

  
• カリウムイオンを認識して活性をオフからオンへと切り替えるTat結合RNAアプタマーおよびハンマーヘッドリボザイムの開発

  山置佑大; 永田崇; 真嶋司; 片平正人

  新学術領域「柔らかな分子系」第 16 回 ワークショップ, 2016年06月

  
• Cyclin D1転写抑制を担う TLS/FUS タンパク質と非コード RNA の相互作用の NMR 法による解析

  真嶋司; 小澤 駿介; 近藤 敬子; 永田崇; 黒川 理樹; 片平 正人

  第16回日本蛋白質科学会年会、福岡国際会議場（福岡市）、2016.6.7-6.9, 2016年06月

  
• プリオン蛋白質とそれを標的とする RNA 分子の A β線維化への影響

  飯田 真美子; 真嶋 司; 山置 佑大; 永田 崇; 片平正人

  第16回日本蛋白質科学会年会、福岡国際会議場（福岡市）、2016.6.7-6.9, 2016年06月

  
• NMR analysis of the recognition of non-coding RNA and DNA by TLS/FUS which causes transcriptional repression of cyclin D1 and telomere shortening

  Tsukasa Mashima; Keiko Kondo; Takanori Oyoshi; Ryoma Yoneda; Riki Kurokawa; Takashi Nagata; Masato Katahira

  The RNA Society of Japan 18th Annual Meeting AND The 21st Annual Meeting of the RNA Society 国立京都国際会館（京都市）,2016.6.28-7.2, 2016年06月

  
• Binding properties of high-affinity RNA aptamers against AML1 Runt domain

  Ryo Amano; Kenta Takada; Yoichiro Tanaka; Takashi Nagata; Masato Katahira; Yoshikazu Nakamura; Tomoko Kozu; Taiichi Sakamoto

  The RNA Society of Japan 18th Annual Meeting AND The 21st Annual Meeting of the RNA Society 国立京都国際会館（京都市）,2016.6.28-7.2, 2016年06月

  
• K+-responsive activation of dual-quadruplex forming ribozyme system requiring no heating and cooling treatment

  Yudai Yamaoki; Tsukasa Mashima; Takashi Nagata; Masato Katahira

  The RNA Society of Japan 18th Annual Meeting AND The 21st Annual Meeting of the RNA Society 国立京都国際会館（京都市）,2016.6.28-7.2, 2016年06月

  
• Binding properties of RNA aptamer against AML1 Runt domain

  R. Amano; K. Takada; T. Nagata; Y. Nomura; J. Fukunaga; Y. Tanaka; M. Katahira; Y. Nakamura; T. Kozu; T. Sakamoto

  Aptamer 2016, St Hilda's College, Oxford, UK, 2016.4.4-5, 2016年04月

  
• Tandem GGA repeat G-quadruplex as an anti-prion protein aptamer and a K+-responsive structural/functional switching device

  T. Nagata; T. Mashima; Y. Yamaoki; F. Nishikawa; Y.O. Kamatari; S. Nishikawa; K. Kuwata; M. Katahira

  Aptamer 2016, St Hilda's College, Oxford, UK, 2016.4.4-5, 2016年04月

  
• 転写因子AML1のDNA結合部位を標的とする高親和性RNAアプタマーの開発と解析

  天野亮; 高田健多; 田中陽一郎; 永田崇; 片平正人; 中村義一; 神津知子; 坂本泰一

  第5回日本生物物理学会関東支部会、桐生, 2016年03月

  
• Binding properties of RNA aptamer that binds to the transcription factor AML1 Runt domain

  R. Amano; K. Takada; Y. Tanaka; T. Nagata; M. Katahira; Y. Nakamura; T. Kozu; T. Sakamoto

  The 8th Takeda Science Foundation Symposium on PharmaSciences, Osaka, 2016年01月

  
• NMR study of RNA aptamer that binds to the transcription factor AML1 Runt domain

  T. Sakamoto; R. Amano; Y. Nomura; T. Nagata; M. Katahira; J. Fukunaga; Y. Tanaka; Y. Nakamura; T. Kozu

  The 8th Takeda Science Foundation Symposium on PharmaSciences, Osaka, 2016年01月

  
• 転写因子AML1 Runt domainを標的とした高親和性RNAアプタマーの特徴

  高田健多; 天野亮; 田中陽一郎; 永田崇; 片平正人; 中村義一; 神津知子; 坂本泰一

  第38回日本分子生物学会年会、神戸, 2015年12月

  
• Analysis of the biocharacteristics of APOBEC3F by real-time NMR

  Li Wan; Keisuke Kamba; Takashi Nagata; Masato Katahira

  第38回日本分子生物学会年会、神戸, 2015年12月

  
• Heterologous expression and struature-activity relationship analysis of the oxidative enzymes involved in lignosellulose degradatioin from wood rotting fungi

  Mengi Lin; Takashi Nagata; Bunzo Mikami; Masato Katahira

  第38回日本分子生物学会年会、神戸, 2015年12月

  
• NMRによる実時間酵素活性アッセイにより抗ウィルス因子APOBEC3Gの脱アミノ化機構を明らかにする

  神庭圭佑; 永田崇; 片平正人

  第38回日本分子生物学会年会, 2015年12月

  
• AML1 (RUNX1)タンパク質のRuntドメインとRNAアプタマーの相互作用のNMR解析

  天野亮; 高田健多; 田中陽一郎; 永田崇; 片平正人; 野村祐介; 福永淳一; 中村義一; 神津知子; 坂本泰一

  日本核酸医薬学会第1回年会、京都, 2015年11月

  
• 海洋性Novosphingubium属細菌に由来するリグニンモデル2量体β-O-4結合開裂酵素群の酵素学的解析

  大田ゆかり; 黒澤佳奈子; 永田崇; 片平正人; 西村裕志; 渡辺隆司; 長谷川良一; 秦田勇二

  第60回リグニン討論会、つくば, 2015年11月

  
• リアルタイムNMR法の新たな展開ー抗HIVタンパク質APOBECG3Gの認識ヌクレチド、DNA上のスライディング及びエピジェネクスとの関連に関する新知見ー

  神庭圭佑; 永田崇; 片平正人

  第54回NMR討論会、千葉, 2015年11月

  
• 転写因子AML1 Runt domainに結合する高親和性RNAアプタマーのNMR解析

  高田健太; 天野亮; 田中陽一郎; 永田崇; 片平正人; 中村義一; 神津知子; 坂本泰一

  第54回NMR討論会、千葉, 2015年11月

  
• 木質バイオマスの特性を決めるリグニンー多糖結合様式の決定

  神谷明宏; 西村裕志; 永田一真; 永田崇; 渡辺隆司; 片平正人

  第54回NMR討論会、千葉, 2015年11月

  
• 異常型プリオン蛋白質の産生を抑制する四重鎖核酸の構造解析

  真嶋司; 西川富美子; 鎌足雄司; 永田崇; 西川諭; 桑田一夫; 片平正人

  第９回バイオ関連化学シンポジウム、熊本, 2015年10月

  
• カリウムイオンを認識して活性がスイッテングするTat結合RNAアプタマーおよびハンマーヘッドリボザイムの創製

  山置佑大; 真嶋司; 永田崇; 片平正人

  第９回バイオ関連化学シンポジウム、熊本, 2015年10月

  
• NMR analysis of lignin-carbohydrate complexes of wood biomass

  Akihiro Kamiya; Hiroshi Nishimura; Kazuma Nagata; Takashi Nagata; Takashi Watanabe; Masato Katahira

  6th Int. Symp. Adv. Energy Sci., Kyoto, 2015年09月

  
• Structural analysis of lignin by ultra-high sensitivity NMR for biorefinery

  T.Watanabe; H.Nishimura; T.Kishimoto; M.Nakamura; C. Qu; K. Nagata; T.Nagata; M.Katahira

  6th Int. Symp. Adv. Energy Sci., poster, Kyoto, 2015年09月

  
• NMR study of the recognition of non-coding RNA and DNA by TLS/FUS, a key regulator of cyclin D1

  Kondo, K; Mashima, T; Oyoshi, T; Kurokawa, R; Nagata, T; Katahira, M

  The 42nd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry, Himeji, 2015年09月

  
• Nucleic acid determinants of deamination by human anti-HIV factor, APOBEC3G, as revealed by real-time NMR method

  Kamba, K; Nagata, T; Katahira, M

  The 42nd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry, Himeji, 2015年09月

  
• Structural and biochemical studies on eIF1 with eIF3c and eIF5; rearrangement of subunit interaction for accurate recognition of AUC start codon

  Obayashi, E; Urano, T; Asano, K; Katahira, M; Nagata, T

  The 6th International Symposium of Advanced Energy Science～Towards the Realization of Zero-Emission Energy～, 2015年09月

  
• NMR analyses of RNA-peptide complexes for the development of biomolecules which regulate gene expression

  R. Amano; Y. Nomura; T. Nagata; N. Kobayashi; Y. Mori; J. Fukunaga; Y. Tanaka; M. Katahira; Y. Nakamura; T. Kozu; T. Sakamoto

  The 6th International Symposium of Advanced Energy Science～Towards the Realization of Zero-Emission Energy～, 2015年09月

  
• 効率よくウイルスDNAに変異を導入するAPOBEC3Gの脱アミノ化機構

  神庭 圭佑; 永田 崇; 片平 正人

  第53回日本生物物理学会年会.金沢, 2015年09月

  
• Real-time NMR methods reveals deamination mechanism by human antiviral factor APOBEC3G

  Keisuke Kamba; Takashi Nagata; Masato Katahira

  6th Asia-Pacific NMR Symposium.Hong Kong, 2015年08月

  
• New strategy for high-throughput NMR analysis of biomolecules using the NMR database BMRB and tools for automated NMR analysis, MagRO, FLYA and CYANA

  Naohiro Kobayashi; Masashi Yokochi; Takeshi Iwata; Bikash Ranjan Sahoo; Takashi Nagata; John L. Markley; Eldon L. Ulrich; Elena Schmidt; Peter Güntert; Chojiro Kojima; Toshimichi Fujiwara

  International Society of Magnetic Resonance.Shanghai, 2015年08月

  
• 転写抑制やテロメア短縮を引き起こすTLS/FUSと長鎖非コードRNAおよびDNA間結合の構造基盤

  近藤 敬子; 真嶋 司; 大吉 崇文; 黒川 理樹; 永田 崇; 片平 正人

  RNA meeting 2015.札幌, 2015年07月

  
• AML1タンパク質のDNA結合ドメインに対するRNAアプタマーの特性

  高田 健多; 天野 亮; 田中 陽一郎; 永田 崇; 片平 正人; 中村 義一; 神津 知子; 坂本泰一

  RNA meeting 2015.札幌, 2015年07月

  
• AML1 タンパク質の Runt ドメインに結合する RNA アプタマーの取得と解析

  高田健多; 天野亮; 田中陽一郎; 永田崇; 片平正人; 中村義一; 神津知子; 坂本泰一

  平成27年度日本生化学会関東支部例会, 2015年06月

  
• Development of new methods to compensate distortion of quantitation caused by difference in molecular weight (transverse relaxation time)

  Okamura, H; Nishimura, H; Nagata, T; Kigawa, T; Watanabe, T; Katahira, M

  53rd Ann. Meeting NMR Soc. Japan, 2014年11月05日, 査読有り

  
• Characterization of RNA aptamer targeting the DNA binding domain of AML1 protein

  Takada, K; Amano, R; Tanaka, Y; Nagata, T; Katahira, M; Nakamura, Y; Kozu, T; Sakamoto, T

  The 41st International Symposium on Nucleic Acids Chemistry, 2014年11月

  
• CCND1転写抑制とテロメア短縮をもたらすTLS/FUSによる非コードRNAとDNA認識機構のNMR法による解明

  近藤敬子; 真嶋司; 山置佑大; 大吉崇文; 黒川理樹; 永田崇; 片平正人

  第37回日本分子生物学会年会.横浜, 2014年11月

  
• Deamination mechanism of an anti-HIV APOBEC3G coupled with sliding on single-stranded DNA as analyzed by real-time NMR monitoring method

  K. Kanba; A. Furukawa; K. Sugase; T. Nagata; M. Katahira

  The 41st International Symposium on Nucleic Acids Chemistry.Fukuoka, 2014年11月

  
• 分子量(横緩和時間)の差に由来する物質定量のゆがみを克服する新しい測定法の開発

  岡村英保; 西村裕志; 永田崇; 木川隆則; 渡辺隆司; 片平正人

  第53回NMR討論会.吹田, 2014年11月

  
• 神経系幹細胞の未分化状態維持と発癌に関わるMusashi1タンパク質の構造基盤

  岩岡諒; 小林直宏; 津田健吾; 今井貴雄; 岡野栄之; 永田崇; 片平正人

  第53回NMR討論会.吹田, 2014年11月

  
• MagRO-NMRView、FLYAによる高度に自動化されたＮＭＲデータ解析

  小林直宏; Bikash Ranjan Sahoo; 永田崇; 服部良一; Elena Schmidt; Peter Güntert; 児嶋長次郎; 藤原敏道

  第53回NMR討論会.吹田, 2014年11月

  
• Creation of novel Tat-binding aptamer and ribozyme whose activities switch on in response to K+ via quadruplex formation

  Y. Yamaoki; T. Mashima; T. Nagata; M. Katahira

  The 41st International Symposium on Nucleic Acids Chemistry.Fukuoka, 2014年11月

  
• 神経系幹細胞の未分化状態維持と発癌に関わるMusashi1タンパク質RBD2の構造機能解析

  岩岡諒; 小林直宏; 津田健吾; 今井貴雄; 岡野栄之; 永田崇; 片平正人

  第37回日本分子生物学会年会.横浜, 2014年11月

  
• 実時間NMR法による抗HIV因子APOBEC3Gのスライディングにカップルした脱アミノ化機構の解析

  神庭圭佑; 永田崇; 片平正人

  第37回日本分子生物学会年会.横浜, 2014年11月

  
• AML1 Runt domainとRNAアプタマーの相互作用のNMR解析

  高田健多; 天野亮; 永田崇; 片平正人; 野村祐介; 田中陽一郎; 中村義一; 神津知子; 坂本泰一

  第37回日本分子生物学会年会.横浜, 2014年11月

  
• Development of new NMR methods for correct quantitation on biomass components

  Okamura, H; Nishimura, H; Nagata, T; KIgawa, T; Watanabe, T; Katahira, M

  5th Int. Symp. Adv. Energy Sci., Kyoto, 2014年10月01日

  
• NMR study of the Interaction between MDM2 and a Peptide Selected by mRNA Display

  T. Nagata; K. Shirakawa; N. Kobayashi; H. Shiheido; N. Tabata; Y. Sakuma-Yonemura; K. Horisawa; M. Katahira; N. Doi; H. Yanagawa

  Biophysical Society Thematic Meeting Disordered Motifs and Domains in Cell Control.Dublin, 2014年10月

  
• Real-time NMR monitoring of enzymatic reaction of anti-HIV protein, structure of anti-prion RNA aptamer and wood biomass analysis

  Kanba, K; Mashima, T; Okamura, H; Furukawa, A; Sugase, K; Nishimura, H; Watanabe, T; Nagata, T; Katahira, M

  The 5th Japan-Taiwan NMR symposium.Sapporo, 2014年09月

  
• Development of Tat-binding aptamer and ribozyme which switch their activities in response to K+

  Y. Yamaoki; T. Mashima; T. Nagata; M. Katahira

  第52回日本生物物理学会年会.札幌,2014.9.25-27, 2014年09月

  
• Screening for novel aptamer against prion protein and its structural study

  T. Mashima; F. Nishikawa; Y.O. Kamatari; T. Nagata; S. Nishikawa; K. Kuwata; M. Katahira

  第52回日本生物物理学会年会.札幌,2014.9.25-27, 2014年09月

  
• Substrate Recognition and Sliding Properities of an Anti-HIV Factor APOBEC3G analyzed by Real-time NMR Monitoring Strategy

  K. Kamba; T. Nagata; M. Katahira

  第52回日本生物物理学会年会.札幌,2014.9.25-27, 2014年09月

  
• NMR analysis of the interaction between an artificial RNA and a transcription factor

  K. Takada; R. Amano; T. Nagata; M. Katahira; Y. Nomura; Y. Tanaka; Y. Nakamura; T. Kozu; T. Sakamoto

  The 5th International Symposium of Advanced Energy Science -Contribution to Zero-Emission Energy-,Uji, 2014年09月

  
• Functional mechanism of an anti-HIV protein, APOBEC3G, as revealed by real-time NMR monitoring of its enzymatic reaction

  K. Kanba; A. Furukawa; K. Sugase; R. Morishita; T. Nagata; M. Katahira

  XXVIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems.Dallas, 2014年08月

  
• PROPERTIES OF RNA APTAMER BINDING TO AML1 RUNT DOMAIN

  R. Amano; Y. Nomura; T. Nagata; N. Kobayashi; Y. Mori; K. Takada; J. Fukunaga; Y. Tanaka; M. Katahira; Y. Nakamura; T. Kozu; T. Sakamoto

  XXI ROUND TABLE ON NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND NUCLEIC ACIDS CHEMICAL BIOLOGY OF NUCLEIC ACIDS.Poland, 2014年08月

  
• Functional mechanism of anti-HIV protein, APOBEC3G, elucidated by real-time monitoring of enzymatic reaction, and anti-prion activity of an RNA aptamer with its structural basis

  K. Kanba; A. Furukawa; K. Sugase; R. Morishita; T. Nagata; M. Katahira

  The 45th Annual Meeting of Korean Magnetic Resonance Society, 2014年07月, 招待有り

  
• カリウムイオンを感知して自らの活性をスイッチングするTat捕捉アプタマーおよびリボザイムの創製

  山置佑大; 真嶋司; 永田崇; 片平正人

  第16回日本RNA学会年会.名古屋, 2014年07月

  
• Structural and functional analysis of Musashi, a neural and oncogenic RNA-binding protein

  R. Iwaoka; T. Nagata; T. Imai; H; Okano; M. Katahira

  第16回日本RNA学会年会.名古屋, 2014年07月

  
• AML1タンパク質のRuntドメインに結合するRNAアプタマーの取得と解析

  高田健多; 天野亮; 永田崇; 片平正人; 中村義一; 神津知子; 坂本泰一

  日本生化学会関東支部定例会.水戸, 2014年06月

  
• The structural and energetic basis for the high-potency inhibition of MDM2-p53 interaction by MDM2-binding peptide obtained with IVV method

  T. Nagata; K. Shirakawa; B.R. Sahoo; H. Shiheido; K. Horisawa; M. Katahira; N. Kobayashi; N. Doi; H. Yanagawa

  第14回日本蛋白質科学会年会.横浜, 2014年06月

  
• CCND1転写抑制とテロメア短縮に関与する天然変性蛋白質TLS/FUSによる非コードRNAとDNAの認識機構のNMR法による解明

  近藤敬子; 真嶋司; 大吉崇文; 黒川理樹; 永田崇; 片平正人

  第14回日本蛋白質科学会年会.横浜, 2014年06月

  
• NMRによるAML1 Runtドメインと RNAアプタマーの相互作用の解析

  天野亮; 野村祐介; 永田崇; 小林直宏; 高田健太; 福永淳一; 田中陽一郎; 片平正人; 中村義一; 神津知子; 坂本泰一

  平成26年度 日本分光学会年次講演会、和光、2014.5, 2014年05月

  
• Statistical Thermodynamics for The Molecular Recognition Accompanied by a Global Structural Change of a Molecule

  T. Hayashi; H. Oshima; T. Mashima; T. Nagata; M. Katahira; M. Kinoshita

  Nagoya Symposium on Deplection Forces: Celebrating the 60th Anniversary of the Asakura-Oosawa Theory.Nagoya, 2014年03月

  
• Statistical Thermodynamics for Binding of an RNA Aptamer and a Partial Peptide of a Prion Protein

  T. Hayashi; H. Oshima; T. Mashima; T. Nagata; M. Katahira; M. Kinoshita

  58th Annual Meeting of the Biophysical Society of USA.San Francisco, 2014年02月

  
• 3P032 抗HIV 因子APOBEC3G の基質認識及びスライディング機構の実時間NMR 解析(01B. 蛋白質:構造機能相関,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

  Kamba Keisuke; Nagata Takashi; Katahira Masato

  生物物理, 2014年

  
• 1P121 新規プリオンアプタマーの探索とその構造研究(05A. 核酸 : 構造・物性,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

  Mashima Tsukasa; Nishikawa Fumiko; Kamatari Yuji O.; Nagata Takashi; Nishikawa Satoshi; Kuwata Kazuo; Katahira Masato

  生物物理, 2014年

  
• 神経系幹細胞の未分化状態維持に関わる Musashi1 タンパク質の機能発現の分子メカニズム

  岩岡諒; 櫻井悠子; 鍵矢悦久; 今井貴雄; 岡野栄之; 永田崇; 片平正人

  第36回日本分子生物学会年会.神戸, 2013年12月

  
• Development of quadruplex hammerhead ribozyme which switches on its ribozyme activity: introduction of quadruplex-forming complementary DNA to repress a basal activity

  Y. Yamaoki; T. Mashima; T. Nagata; M. Katahira

  第36回日本分子生物学会年会.神戸, 2013年12月

  
• 四重鎖構造を形成する核酸の抗プリオン活性

  真嶋司; 西川富美子; 鎌足雄司; 才村正幸; 永田崇; 西川諭; 桑田一夫; 片平正人

  第36回日本分子生物学会年会.神戸, 2013年12月

  
• ヒト抗ウィルス因子 APOBEC3G の基質認識機構及び Vif による APOBEC3G 阻害機構の解明に向けて

  神庭圭佑; 永田崇; 片平正人

  第36回日本分子生物学会年会.神戸, 2013年12月

  
• mRNA ディスプレイ法により選択された高親和性MDM2結合ペプチドＭＩＰに基づくＭＤＭ2－ｐ53相互作用阻害剤の開発

  白川貴恵; 永田崇; 小林直弘; 始平堂弘和; 新倉啓介; 片平正人; 堀澤健一; 土居信英; 柳川弘志

  第36回日本分子生物学会年会.神戸, 2013年12月

  
• 転写因子AML1に対して複数の結合部位を持つ高親和性RNAアプタマーの解析

  天野亮; 野村祐介; 永田崇; 森瑶子; 福永淳一; 田中陽一郎; 片平正人; 中村義一; 神津知子; 坂本泰一

  第36回日本分子生物学会年会.神戸, 2013年12月

  
• Dual-quadruplex forming ribozyme distinctly switches on its activity in response to K+

  Y. Yamaoki; T. Mashima; T. Nagata; M. Katahira

  The 40th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2013.Yokohama, 2013年11月

  
• Origin of the anti-prion activity of quadruplex

  T. Mashima; F. Nishikawa; Y.O. Kamatari; M. Saimura; T. Nagata; S. Nishikawa; K. Kuwata; M. Katahira

  The 40th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2013.Yokohama, 2013年11月

  
• Structural basis for the inhibition of MDM2:p53 interaction by highly selective MDM2-binding peptide obtained with IVV method

  T. Nagata; K. Shirakawa; N. Kobayashi; H. Shiheido; M. Katahira; K. Horisawa; N. Doi; H. Yanagawa

  第52回日本核磁気共鳴学会.金沢, 2013年11月

  
• Multi-site binding of high affinity aptamers against AML1 Runt domain

  R. Amano; Y. Nomura; T. Nagata; N. Kobayashi; Y. Mori; J. Fukunaga; Y. Tanaka; M. Katahira; Y. Nakamura; T. Kozu; T. Sakamoto

  The 40th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2013.Yokohama, 2013年11月

  
• Aptamer that exerts anti-prion activity and intelligent ribozyme whose activity awitches in reponse to K+

  M. Katahira; T. Mashima; Y. Yamaoki; T. Nagata; F. Nishikawa; S. Nishikawa; Y. Kamatari; K. Kuwata

  日本生物物理学会第51回年会.京都, 2013年10月

  
• Structual description for the strong binding of the peptide selected by mRNA display to MDM2

  T. Nagata; K. Shirakawa; N. Kobayashi; H. Shiheido; M. Katahira; K. Horisawa; N. Doi; H. Yanagawa

  5th Asia-Pacific NMR Symposium.Brisbane, 2013年10月

  
• Statistical Thermodynamics for Binding of an RNA Aptamer and a Partial Peptide of a Prion Protein

  T. Hayashi; H. Oshima; T. Mashima; T. Nagata; M. Katahira; M. Kinoshita

  日本生物物理学会第51回年会.京都, 2013年10月

  
• NMR analysis of the interaction between an artificial RNA and atranscription factor

  R. Amano; Y. Nomura; T. Nagata; N. Kobayashi; Y. Mori; J. Fukunaga; Y. Tanaka; M. Katahira; Y. Nakamura; T. Kozu; T. Sakamoto

  The 4th International Symposium of Advanced Energy Science.Uji, 2013年09月, 招待有り

  
• Mechanism of high affinity and anti-prion activity of anti-prion aptamer

  T. Mashima; F. Nishikawa; Y.O. Kamatari; H. Fujiwara; M. Saimura; T. Nagata; T. Kodaki; S. Nishikawa; K. Kuwata; M. Katahira

  The 10th Korea-Japan Bilateral Symposium on Biological NMR.Seoul, 2013年07月

  
• カリウムイオンによって活性がスイッチングする四重鎖リボザイムの創製：四重鎖形成相補鎖によるスイッチング性能の向上

  山置佑大; 真嶋司; 永田崇; 片平正人

  第15回日本RNA学会年会.松山, 2013年07月

  
• プリオン蛋白質を標的とするＲＮＡアプタマーの認識メカニズムとその抗プリオン活性

  真嶋司; 西川富美子; 鎌足雄司; 藤原弘道; 遠藤美紗; 永田崇; 小瀧努; 西川諭; 桑田一夫; 片平正人

  第13回 日本蛋白質科学会年会.鳥取, 2013年06月

  
• NMR実時間計測法により抗ウィルス因子APOBEC3Gのシチジン脱アミノ化反応の配列依存性を評価する

  神庭圭佑; 小瀧努; 永田崇; 片平正人

  第13回日本蛋白質科学学会年会.鳥取, 2013年06月

  
• 転写因子AML1を標的としたRNAアプタマーによるDNAの擬態

  天野亮; 野村祐介; 永田崇; 森瑶子; 福永淳一; 田中陽一郎; 片平正人; 中村義一; 神津知子; 坂本泰一

  第8回日本ケミカルバイオロジー学会.東京, 2013年06月

  
• 2P125 四重鎖形成可能な相補鎖DNAを導入することによる四重鎖リボザイムのカリウムイオン濃度依存的な活性スイッチングの高効率化(05A.核酸:構造・物性,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

  Yamaoki Yudai; Mashima Tsukasa; Nagata Takashi; Katahira Masato

  生物物理, 2013年

  
• 2P126 抗プリオンアプタマーの構造学的基盤とのその活性(05A.核酸:構造・物性,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

  Mashima Tsukasa; Nishikawa Fumiko; Kamatari Yuji O.; Saimura Masayuki; Nagata Takashi; Nishikawa Satoshi; Kuwata Kazuo; Katahira Masato

  生物物理, 2013年

  
• 3SCA-02 抗プリオン活性を示すアプタマー及びカリウムイオンに感応して活性がスイッチングするインテリジェントリボザイム(3SCA 生命現象の理解と核酸医薬を指向した機能性核酸の研究の最前線,シンポジウム,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

  片平 正人; 真嶋 司; 山置 佑大; 永田 崇; 西川 富美子; 西川 諭; 鎌足 雄司; 桑田 一夫

  生物物理, 2013年

  
• Anti-prion activity of an RNA aptamer and its structural basis.

  Tsukasa Mashima; Fumiko Nishikawa; Yuji O Kamatari; Hiromichi Fujiwara; Masayuki Saimura; Takashi Nagata; Tsutomu Kodaki; Satoshi Nishikawa; Kazuo Kuwata; Masato Katahira

  Nucleic acids research, 2013年01月

  
• Molecular recognition between an aptamer and IDP that dirupts brain function

  Takashi Nagata

  The 2nd International Symposium of Intrinsically Disordered Proteins.Yokohama, 2013年01月

  
• Creation of Novl Ribozyme whose Activity Switches on in Response to K+ via Quadruples Formation

  Yamaoki, Y; Mashima, T; Sakurai, Y; Hara, Y; Kodaki, T; Nagata, T; Katahira, M

  第35回日本分子生物学会年会.福岡, 2012年12月

  
• NMR Real-time Monitoring of the Deamination Reaction of Human Antiviral Factor APOBEC3G

  K. Kamba; A. Furukawa; T. Kodaki; T. Nagata; M. Katahira

  第35回日本分子生物学会年会.福岡, 2012年12月

  
• Interaction of RNA Aptamer with Prion Protein and Monitoring of Biodegradation of Wood Biomass

  Tsukasa Mashima; Hiroshi Nishimura; Hideyasu Okamura; Fumiko Nishikawa; Yuji O. Kamatari; Takashi Nagata; Satoshi Nishikawa; Kazuo Kuwata; Takashi Watanabe; Masato Katahira

  The 51st Annual Meeting of NMR Society of Japan, Nagoya, 2012年11月09日, 査読有り

  
• Strctural analysisi of RNA aptamer in complex with prion protein, and its anti-prion activity

  Mashima, T; Nishikawa, F; Kamatari, O. Y; Fujiwara, H; Saimura, M; Nagata, T; Kodaki, T; Nishikawa, S; Kuwata, K; Katahira, M

  The 39th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry.Nagoya,2012.11.15-17, 2012年11月

  
• プリオンタンパク質とRNAアプタマーの相互作用及び木質バイオマスの生分解のモニタリング

  真嶋司; 西村裕志; 岡村英保; 西川富美子; 鎌足雄司; 永田崇; 西村諭; 桑田一夫; 渡辺隆司; 片平正人

  第51回NMR討論会.名古屋, 2012年11月

  
• 抗HIV宿主因子 APOBEC3Gの位置依存的デアミネーション反応機構の解明

  Furukawa, A; Sugase, K; Morishita, R; Nagata, T; Ryo, A; Takaori, A; Katahira, M

  日本生物物理学会第50回年会.名古屋, 2012年09月

  
• カリウムイオン依存的な四重鎖構造形成によって活性がオンになるインテリジェントリボザイムの創製

  Yamaoki, Y; Mashima, T; Sakurai, Y; Hara, Y; Nagata, T; Katahira, M

  日本生物物理学会第50回年会.名古屋, 2012年09月

  
• Anti-prion activity and it strucural basis of RNAaptamer, and sliding-direction-dependent deaminase activity of anti-HIV enzyme

  T. Mashima; A. Furukawa; K. Sugase; H. Fujiwara; F. Nishikawa; R. Morishita; A. Ryo; Y. Kamatari; T. Nagata; S. Nishikawa; K. Kuwata; M. Katahira

  XXV international Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems，2012.Lyon,2012.8.19-24., 2012年08月

  
• NMR analysis of the interaction between AML1 Runt domain and RNA aptamer

  R. Amano; Y. Nomura; T. Nagata; J. Fukunaga; Y. Tanaka; M. Katahira; Y. Nakamura; T. Kozu; T. Sakamoto

  XXV international Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems，2012.Lyon,2012.8.19-24., 2012年08月

  
• Elucidation of the location-dependent deamination reaction mechanism of an anti-HIV factor,APOBEC3G

  A. Furukawa; K. Sugase; R. Morishita; A. Ryo; A. akaori; T. Nagata; M. Katahira

  XXV international Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems，2012.Lyon,2012.8.19-24., 2012年08月

  
• Anti-prion activity and its structural basis of RNA aptamer,and sliding-direction-dependent deaminase activity of anti-HIV enzyme

  Mashima.T,Furukawa.A; Sugase.K; Fugiwara.H; Nishikawa.F; Morishita.R,Ryo.A; Kamatari.Y; Nagata.T; Nishikawa.S; Kuwata.K; Katahira.M

  XXV international Conference on Magnetic Resonance in Biolgical Systems. Lyon, 2012年07月18日

  
• Sequence-specific RNA-recognition mechanism of Musashi1, neural and oncogenic RNA-binding Protein

  Ohyama, T; Nagata, T; Tsuda, K; Kobayashi, N; Imai, T; Okano, H; Yamazaki, T; Katahira, M

  XXV international Conference on Magnetic Resonance in Biolgical Systems. Lyon, 2012年07月18日

  
• カリウムイオン濃度を感知して活性がオンになるインテリジェントリボザイムの創製

  山置雄大; 真嶋司; 櫻井佑; 原ゆかり; 永田崇; 片平正人

  第14回日本RNA学会年会, 仙台, 2012.7.18-20, 2012年07月

  
• RNAアプタマーの抗プリオン活性とその構造的基礎

  真嶋司; 西川富美子; 鎌足雄司; 藤原弘道; 永田崇; 小瀧努; 西川諭; 桑田一夫; 片平正人

  第14回日本RNA学会年会.仙台, 2012年07月

  
• Sliding-direction-dependent activity of anti-HIV enzyme,and structural basis of anti-prion activity of RNA aptamer

  Furukawa, A; Mashima, T; Sugase, K; Fujiwara, H; Nagata, T; Morishita, R; Ryo, A; Nishikawa, F; Nishikawa, S; Kamatari, KO; Kuwata, K; Katahira, M

  Korea-Japan Bilateral NMR Symposium，2012.Seoul,2012.3.16, 2012年03月16日

  
• 大型装置の連携利用による有用バイオマス生分解の実時間モニタリングとメカニズムの解明

  西村裕志; 西村裕志; 小澤佑; 永田崇; 小瀧努; 小瀧努; 渡辺隆司; 片平正人; 片平正人

  京都大学生存基盤科学研究ユニット研究成果報告書, 2012年02月

  
• 3PT003 NMR法によるAPOBEC3Cデアミネース活性に関する研究(日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

  Iwaoka Ryo; Kitamura Shingo; Kanba Keisuke; Furukawa Ayako; Okamura Hideyasu; Sugiura Wataru; Nagata Takashi; Iwatani Yasumasa; Katahira Masato

  生物物理, 2012年

  
• NMR法によるAPOBEC3Gデアミネース活性に関する研究

  Iwaoka; S. Kitamura; K. Kanba; A. Furukawa; H. Okamura; W. Sugiura; T. Nagata; Y. Iwatani; M. Katahira

  日本生物物理学会第50回年会，2012, 2012年, 査読有り

  
• Development of intelligent ribozyme whose activity switches on in response to K＋ｖia quadruplex formation

  Y. Yamaoki; T. Mashima; Y. Sakurai; Y. Hara; T. Nagata; M. Katahira

  The 39th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry，2012, 2012年, 査読有り

  
• MR analysis of the interaction between AML1 Runt domain and RNA aptamer

  R. Amano; Y. Nomura; T. Nagata; J. Fukunaga; Y. Tanaka; M. Katahira; Y. Nakamura; T. Kozu; T. Sakamoto

  XXV international Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems，2012, 2012年, 査読有り

  
• RNAアプタマーとAML1 Runt domainの相互作用解析

  天野亮; 野村祐介; 永田崇; 福永淳一; 田中陽一郎; 片平正人; 中村義一; 神津知子; 坂本泰一

  第14回日本RNA学会年会，仙台，2012.7.18-20, 2012年

  
• Structural basis for the sequence-specific RNA-recognition mechanism of Musashi 1

  Ohyama, T; Nagata, T; Tsuda, K; Kobayashi, N; Imai, T; Okano, H; Yamazaki, T; Katahira, M

  第34回日本分子生物学会年会.横浜, 2011年12月

  
• Real-time monitoring of the cytidine deamination along single-stranded DNA by an anti-HIV factor APOBEC3G

  永田 崇

  The International Symposium on Nuclear Magnetic Resonance 2011.Yokohama,2011.11.15-18, 2011年11月15日

  
• r(GGA)4 chimeric ribozyme switches its activity in responseto K+ via quadruplex formation

  Nagata, T; Sakurai, Y; Hara, Y; Mashima, T; Kodaki, T; Katahira, M

  The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry, 2011年11月09日

  
• Quantitative analysis of location- and sequence-dependent deamination by APOBEC3G using real-time NMR spectroscopy

  A. Furukawa; K. Sugase; R. Morishita; T. Nagata; T. Kodaki; A. Takaori-Kondo; A. Ryo; M. Katahira

  日本生物物理学会第49回年会，姫路，2011.9.16-18, 2011年11月

  
• リアルタイムモニタリングによって示されたAPBEC3GによるDNA上の極性を有したスライディングとカップルしたシトシン脱アミノ基反応

  Katahira, M; Furukawa, A; Nagata, T; Takaku, H; Morishita, R; Takaori, A; Ryo, A

  第49回日本生物物理学会年会.姫路, 2011年09月

  
• NMR study of XMRV protease in complex with an inhibitor

  Okamura, H; Matsunaga, T; Furukawa, A; Sato, Y; Iwaoka, R; Nagata, T; Kobayashi, N; Takaori, A; Morishita, R; Ryo, A; Katahira, M

  第49回日本生物物理学会年会.姫路, 2011年09月

  
• MagRO-Assign: a tool for automated sequence specific assignment of chemical shifts for NMR signals of protein backbone

  Kobayashi, N; Furukawa, A; Kitazawa, R; Nagata, T; Kitahara, R; Katahira, M; Fujiwara, T

  EUROMAR2011. Frankfurt,2011.8.21, 2011年08月21日

  
• XMRVプロテアーゼのNMRによる構造解析

  古川亜矢子; 松永智子; 岩岡諒; 永田崇; 小林直弘; 高折晃史; 森下了; 梁明秀; 片平正人

  第１１回日本蛋白質科学会年会.大阪, 2011年06月

  
• 1SD-06 アルタイムモニタリングによって示されたAPOBEC3GによるDNA上の極性を有したスライディングとカップルしたシトシン脱アミノ基反応(1SD タンパク質立体構造の揺らぎと生物機能の関連にNMR法は何処まで迫れるか?,日本生物物理学会第49回年会(2011年度))

  片平 正人; Furukawa Ayako; Nagata Takashi; Takaku Hiroshi; Morishita Ryo; Takaori Akifumi; Ryo Akihide

  生物物理, 2011年

  
• NMRによるXMRVプロテアーゼとその阻害剤との複合体の構造生物学的研究

  H. Okamura; T. Matsunaga; A. Furukawa; Y. Sato; R. Iwaoka; T. Nagata; N. Kobayashi; A. Takaori; R. Morishita; A. Ryo; M. Katahira

  日本生物物理学会第49回年会，姫路，2011.9.16-18, 2011年, 査読有り

  
• Musashi1蛋白質-標的RNA複合体に含まれる新たな核酸塩基認識機構

  大山 貴子; 永田 崇; 今井 貴雄; 岡野 栄之; 山崎俊夫; 片平 正人

  第49回NMR討論会、東京, 2010年12月

  
• RNAアプタマー：プリオンタンパク質部分ペプチド複合体の構造及びA3Gタンパク質のDNA上スライディングの解析

  古川亜矢子; 真嶋司; 岩岡諒; 越田高史; 永田崇; 森下了; 梁明秀; 高折晃史; 西川富美子; 西川諭; 片平正人

  第49回NMR討論会、東京, 2010年12月

  
• Structural and functional analysis of the translational repression complex that plays a key role in differentiation regulation

  Ohyama, T; Nagata, T; Tanaka, S; Iikura, H; Imai, T; Okano, H; Yamazaki, T; Katahira, M

  第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会合同大会.神戸, 2010年12月

  
• 植物転写因子GT-1がリン酸化によりDNA結合能を上昇させる分子機構の解明

  藤本 なつき; 長崎 祐也; 能登 和明; 村田 純; 平塚 和之; 永田 崇; 片平 正人

  第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会合同大会.神戸, 2010年12月

  
• RNAi関連因子TRBPの構造生物学的解析

  山下征輔; 永田崇; 川添将仁; 竹本千重; 赤坂領吾; 木川隆則; 滝元宏治; 武藤裕; 脇山素明; 横山茂之

  第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会合同大会.神戸, 2010年12月

  
• A mechanism for an increase in DNA-binding affinity of the trihelix DNA-binding domain via its phosphorylation

  Nagata, T; Niyada, E; Fujimoto, N; Nagasaki, Y; Noto, K; Miyanoiri, Y; Murata, J; Hiratsuka, K; Katahira, M

  The 37th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry.Yokohama,2010.11.12, 2010年11月10日

  
• 抗ＨＩＶ因子ＡＰＯＢＥ３Ｇによる酵素反応のリアルタイムモニタリング

  古川亜矢子; 永田崇; 森下了; 梁明秀; 高折晃史; 片平正人

  平成22年度 日本分光学会年次講演会, 2010年11月, 査読有り

  
• マウスMusashi1による標的ＲＮＡの認識

  大山貴子; 永田崇; 今井貴雄; 岡野栄之; 山崎俊夫; 片平正人

  第49回ＮＭＲ討論会, 2010年11月, 査読有り

  
• 「ＮＭＲシグナルを用いた抗ウィルス因子活性のリアルタイムモニタリング

  古川亜矢子; 永田崇; 森下了; 高折晃史; 梁明秀; 片平正人

  第58回日本ウィルス学会学術集会.徳島, 2010年11月

  
• APOBEC3Gが抗HIV活性を発揮する酵素反応のリアルタイムモニタリング

  古川 亜矢子; 永田 崇; 森下 了; 梁 昭秀; 高折 晃史; 片平 正人

  平成22年度日本分光学会.京都, 2010年11月

  
• The real-time monitoring of the enzymatic reaction of an anti-HIV factor APOBEC3G

  Nagata, T; Mashima, T; Iwaoka, R; Sugiyama, R; Takaku, H; Takaori, A; Ryo, A; Katahira, M

  第48回生物物理学会年会.仙台,2010.9.20, 2010年09月

  
• The real-time monitoringof the enzymatic reaction of an anti-HIV factor APOBEC3G

  Furukawa, A; Nagata,T; Morishita, R; Iwaoka, R; Katahira, M

  XXIV International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems, Cairns,2010.8.22-27, 2010年08月22日

  
• Heat shock protein 70 inhibits HIV-1 Vif-mediated ubiquitination and degradation of Apobec3G

  Ryuichi Sugiyama; Hironori Nishitsuji; Yuichiro Habu; Haruki Naganuma; Hiroshi Koseki; Ayako Furukawa; Takashi Nagata; Masato Katahira; Hiroshi Takaku

  EUROPEAN JOURNAL OF MEDICAL RESEARCH, 2010年08月

  
• Structures of telomere DNA in K+ solution, Musashi in complex with RNA, and wild and mutant (phosphorylation-mimicking) DNA-binding proteins, GT-1

  Ohyama, T; Tsuchibayashi, H; Matsugami, A; Miyanoiri, Y; Niyada, E; Nagata, T; Katahira, M

  XXII International Conference on Magnetic Resonance in Biological System.Cairns,2010.8.22-27, 2010年08月

  
• Real-time monitoring of the enzymatic reaction of APOBEC3G possessing anti-HIV activity, and the structure of the RNA aptamer against prion protein

  Furukawa, A; Mashima, T; Matsugami, A; Nagata. T; Sugiyama, R; Takaku, H; Nishikawa, F; Nishikawa, S; Katahira, M

  International Symposium of Korean Society of Biochemistry and Molecular Biology -Structural Biology and Drug Discovery.Korea,2010.8, 2010年08月

  
• 分化制御の鍵をにぎる翻訳抑制複合体のNMR構造機能解析

  大山 貴子; 永田 崇; 田中 志穂; 飯倉 裕之; 河原 裕憲; 今井 貴雄; 岡野 栄之; 山崎俊夫; 片平 正人

  第１2回日本RNA学会年会、東京, 2010年07月

  
• 植物転写因子GT-1のDNA結合活性がリン酸化により増強する分子機構

  永田 崇; 長崎 祐也; 藤本 なつき; 能登 和明; 二矢田 絵美; 宮ノ入 洋平; 村田 純; 平塚 和之; 片平 正人

  第１０回日本蛋白質科学会年会．北海道, 2010年06月

  
• HIV遺伝子上でのAPOBEC3Gによるシチジンデアミネーション反応の動作機序

  古川亜矢子; 永田崇; 森下了; 杉山隆一; 高久洋; 高折晃史; 梁明秀; 片平正人

  第１０回日本蛋白質科学会年会．北海道, 2010年06月

  
• 1P122 1D1255 The real-time monitoring of the enzymatic reaction of an anti-HIV factor APOBEC3G(Nucleic acid binding proteins,Oral Presentations,The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

  Furukawa Ayako; Nagata Takashi; Morishita Ryo; Iwaoka Ryo; Sugiyama Ryuichi; Takaku Hiroshi; Takaori Akifumi; Ryo Akihide; Katahira Masato

  生物物理, 2010年

  
• 抗HIV活性を有する天然型APOBEC3Gタンパク質の構造、1本鎖DNAとの相互作用及び酵素反応のリアルタイムモニタリング

  古川 亜矢子; 永田 崇; 杉山 隆一; 高久 洋; 片平 正人

  第32回分子生物学会年会.横浜, 2009年12月

  
• 抗HIV活性を保持するタンパク質APOBEC3Gの酵素反応のリアルタイムモニタリング

  古川 亜矢子; 中居 佑介; 永田 崇; 杉山 隆一; 高久 洋; 片平 正人

  第32回分子生物学会年会.横浜, 2009年12月

  
• 翻訳制御に関わるMusashi1とPABP1の相互作用と立体構造の解析

  飯倉 裕之; 田中 志穂; 樋口 敬介; 河原 裕憲; 今井 貴雄; 岡野 栄之; 永田 崇; 片平 正人

  第32回分子生物学会年会.横浜, 2009年12月

  
• 植物遺伝子の光制御に関連したGT-1タンパク質の構造と相互作用の研究

  藤本 なつき; 長崎 裕也; 能登 和明; 二矢田 絵美; 村田 純; 平塚 和之; 永田 崇; 片平 正人

  第32回分子生物学会年会.横浜, 2009年12月

  
• 酵素反応のリアルタイムモニタリングとアプタマーによるプリオンタンパク質の捕捉機構

  古川亜矢子; 真嶋司; 永田崇; 杉山隆一; 高久洋; 西川富美子; 西川諭; 片平正人

  第４８回NMR討論会.九州大学, 2009年11月

  
• Structure, interaction and real-time monitoring of the enzymatic reaction of APOBEC3G which possesses anti-HIV activity

  Furukawa, A; Nagata, T; Sugiyama, R; Takaku, H; Katahira, M

  The 3rd Asia-Pacific NMR Symposium.Korea,2009.10.25-28, 2009年10月

  
• Musashi1,PABP,mRNAが構成する翻訳抑制複合体のNMR構造機能解析

  永田崇; 大山貴子; 杉山孝司; 飯倉裕之; 樋口敬介; 河原裕憲; 今井貴雄; 岡野栄之; 山崎俊夫; 片平正人

  日本RNA学会年会、2009.新潟, 2009年07月

  
• Anti-HIV-1 Activity of A3G is Enhanced by HSP70

  Ryuichi Sugiyama; Yuichiro Habu; Haruki Naganuma; Hiroshi Koseki; Ayako Furukawa; Takashi Nagata; Masato Katahira; Hiroshi Takaku

  ANTIVIRAL RESEARCH, 2009年05月

  
• Molecular Mechanism for the reinforcement of DNA-binding activity of GT-1 via phosphorylation

  永田 崇; 長崎 祐也; 藤本 なつき; 能登 和明; 二矢田 絵美; 宮ノ入 洋平; 村田 純; 平塚 和之; 片平 正人

  第9回日本蛋白質科学会年会.熊本, 2009年05月

  
• HIVの複製を阻害するタンパク質APOBEC3Gの構造、相互作用及び酵素反応のリアルタイムモニタリング

  古川 亜矢子; 永田 崇; 羽生 勇一郎; 杉山 隆一; 林 文晶; 横山 茂之; 高久 洋; 片平 正人

  第9回日本蛋白質科学会年会.熊本, 2009年05月

  
• 熱により不可逆的に解離するPH0470由のSPFHドメイン多量体

  桑原陽太; 雲財悟; 永田崇; 池上貴久; 廣明洋子; 藤吉好則; 廣明秀一

  第9回日本蛋白質科学会年会.熊本, 2009年05月

  
• A simultaneous RNA-binding mode of two RNA-binding domains of Musashi-1 analyzed by paramagnetic effects, PRE, PCS, and RDC

  Takashi Nagata; Takako Ohyama; Ayako Furukawa; Takashi Sugiyama; Tsukasa Mashima; Takao Imai; Hideyuki Okano; Toshio Yamazaki; Masato Katahira

  第46回日本生物物理学会.福岡, 2008年12月

  
• PARNのRRMドメインによるmRNA 5'キャップの認識機構

  永田 崇; 鈴木 咲良; 遠藤 竜太; 白水 美香子; 寺田 貴帆; 井上 真; 木川 隆則; eterGuntert; 小林 直宏; 田仲 昭子; 林崎 良英; 武藤 裕

  第31回日本分子生物学会年会・第82回日本生化学会大会.神戸, 2008年12月

  
• HIVの複製を阻害するタンパク質APOBEC3Gの構造と相互作用の解析

  古川 亜矢子; 永田 崇; 羽生 勇一郎; 杉山 隆一; 林 文晶; 横山 茂之; 高久 洋; 片平 正人

  第31回日本分子生物学会年会・第82回日本生化学会大会.神戸, 2008年12月

  
• Musashiタンパク質とPABPの相互作用の解析

  樋口 敬介; 永田 崇; 河原 裕憲; 今井 貴雄; 岡野 栄之; 片平 正人

  第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会.神戸, 2008年12月

  
• テロメレースのリクルート及び活性の増強をもたらすUP1-テロメアDNA-テロメアRNAの三者複合体の相互作用の解明

  藤本 なつき; 永田 崇; 高田 祐輔; 前田 忠計; 福田 博政; 中釜 斉; 片平 正人

  第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会.神戸, 2008年12月

  
• RDC、PRE及びPCSに基づいたMusashi-RNA複合体とプリオンタンパク質に対するRNAアプタマーの構造とダイナミクス

  大山貴子; 松上明正; 古川亜矢子; 真嶋司; 杉山孝司; 今井貴雄; 岡野栄之; 西川富美子; 西川諭; 山崎俊夫; 永田崇; 片平正人

  第４７回NMR討論会.筑波大学, 2008年11月

  
• Hsp70のHIV-1感染抑制

  杉山 隆一; 羽生 勇一郎; 長沼 晴樹; 小関 寛; 永田 崇; 古川 亜矢子; 片平 正人; 高久 洋

  第５６回ウィルス学会.岡山, 2008年10月

  
• Structural Studies of the RRM:mRNA 5' cap comple

  Nagata, T; Suzuki, S; Endo, R; Shirouzu, M; Terada, T; Inoue, M; Kigawa, T; Guntert, P; Hayashizaki, Y; Muto, Y; Yokoyama, S

  23rd International Conference of Magnetic Resonance in Biological Systems. San Diego,2008.8.24, 2008年08月24日

  
• Structures and interactions of 4’-thioDNA and RNA/DNA-binding proteins

  Ohyama, T; Matsugami, A; Furukawa, A; Mashima, T; Sugiyama, T; Yamazaki, T; Nagata, T; Katahira, M

  23rd International Conference of Magnetic Resonance in Biological Systems. San Diego,2008.8.24, 2008年08月24日

  
• Structural analysis of Musashi-RNA complex with paramagnetic effects

  Ohyama, T; Nagata, T; Furukawa, A; Sugiyama, T; Mashima, T; Yamazaki, T; Katahira, M

  XXIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems.San Diego,2008.8.24-29, 2008年08月

  
• Molecular Basis for the reinforcement of the affinity of GT-1 to DNA through phosphorylation

  Takashi Nagata; Kazuaki Noto; Emi Niyada; Youhei Miyanoiri; Jun Murata; Kazuyuki Hiratsuka; Masato Katahira

  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会.横浜, 2008年07月

  
• 構造を基盤とした転写修飾にかかわる因子の分子間相互作用解析

  武藤裕; 桑迫香奈子; 何発虎; 鈴木咲良; 津田健吾; 高橋真梨; 永田崇; 党偉栄; 遠藤竜太; 染谷龍彦; 安部千景; 菅野純夫; 林崎良英; 横山茂之

  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会.横浜, 2008年07月

  
• hnRNP A1タンパク質のアンフォールド効果及びリクルート効果とテロメア長維持との関連

  永田崇; 高田祐輔; 大柄晶太; 小野朝美; 小野愛美; 福田博政; 中釜斉; 石川冬木; 片平正人

  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会.横浜, 2008年07月

  
• HIV感染の防御に関与するAPOBEC3Gの構造機能解析

  古川亜矢子; 水内祐基; 河合文隆; 羽生勇一郎; 杉山隆一; 高久洋; 永田崇; 片平正人

  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会.横浜, 2008年07月

  
• ロングレンジの構造情報を利用したMusashiタンパク質と標的RNAとの複合体の構造解析

  大山貴子; 大柄晶太; 宮ノ入洋平; 古川亜矢子; 今井貴雄; 岡野栄之; 永田崇; 片平正人

  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会.横浜, 2008年07月

  
• NMRによる超高熱菌Pyrococcus horikoshii由来膜タンパク質PH0470 SPFHドメインの構造機能解析

  桑原陽太; 雲財悟; 永田崇; 横山英志; 松井郁夫; 廣明秀一

  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会.横浜, 2008年07月

  
• ロングレンジの距離情報の抽出に基づいたマルチドメインタンパク質Musashiと標的RNAの複合体の構造解析

  大山貴子; 永田崇; 古川亜矢子; 杉山孝司; 真嶋司; 今井貴雄; 岡野栄之; 山崎俊夫; 片平正人

  RNA meeting 2008.札幌, 2008年07月

  
• Mechanisms underlying biological activities of RNA/DNA-binding proteins, examined on the basis of the combination of structure and relaxation analyses

  Takako Ohyama; Ayako Furukawa; Tatsuya Miyoshi; Yusuke Takada; Shota Ogara; Kazuyuki Hiratsuka; Takao Imai; Hideyuki Okano; Hitoshi Nakagama; Takashi Nagata; Masato Katahira

  第46回NMR討論会.北海道, 2007年09月

  
• RNP型RNA/DNA結合ドメインを有するタンパク質、hnRNP A1/DおよびMusashi-1に関するNMRを用いた構造研究

  大山 貴子; 永田 崇; 高田 祐輔; 大柄 晶太; 宮ノ入 洋平; 今井 貴雄; 岡野 栄之; 石川 冬木; 中釜 斉; 片平 正人

  第9回日本RNA学会年会.名古屋, 2007年07月

  
• “The structure of human telomeric DNA and the interactions of hnRNP A1/hnRNP D proteins with telomeric DNA

  Matsugami, A; Ohyama, T; Ono, A; Ono, M; Nagata, T; Katahira, M

  International Workshop on Perspectives on Stable Isotope Aided NMR Methods for Protein Structural Analysis, Osaka,2007.3.30, 2007年03月30日

  
• Structural studies on transcriptional and post-transcriptional gene regulation by NMR

  Nagata, T; Ohyama, T; Noto, K; Niyada, E; Miyanoiri, Y; Imai, T; Okano, H; Hiratsuka, K; Katahira, M

  International Workshop on Perspectives on Stable Isotope Aided NMR Methods for Protein Structural Analysis.Osaka,2007.3.30-31, 2007年03月30日

  
• Molecular basis of microtubule disassembly mechanism regulated by katanin p60

  Naoko Iwaya; Kouhei Akiyama; Satoru Unzai; Kentaro Tomii; Natsuko Goda; Takashi Nagata; Hidehito Tochio; Masahiro Shirakawa; Hidekazu Hiroaki

  International Workshop on Perspectives on Stable Isotope Aided NMR Methods for Protein Structural Analysis, Osaka,2007.3.30, 2007年03月30日

  
• Structural studies on the neural RNA-binding protein Musashi1 in complex with its cognate RNA by NMR

  Ohyama, T; Nagata, T; Miyanoiri, Y; Imai, T; Okano, H; Katahira, M

  RNA 2006 Izu -Functional RNAs and Regulatory Machinery -, 2006年12月03日

  
• 植物遺伝子の光応答に関連したGT-1タンパク質のリン酸化による機能制御の構造基盤

  能登和明; 二矢田絵美; 永田崇; 宮ノ入洋平; 上杉晴一; 村田純; 平塚和之; 片平正人

  分子生物学会2006フォーラム, 2006年12月

  
• hnRNP A1タンパク質のテロメラーゼリクルート効果の構造学的研究

  小野朝美; 大西秀典; 大柄晶太; 永田崇; 上杉晴一; 中釜斉; 福田博政; 片平正人

  分子生物学会2006フォーラム, 2006年12月

  
• ラフト中のコレステロール結合タンパク質Perfringolysin Oの構造解析

  中谷圭一郎; 河合文隆; 永田崇; 上杉晴一; 嶋田由紀子; 岩下淑子; 石井毅; 若松馨; 片平正人

  分子生物学会2006フォーラム, 2006年12月

  
• Structural Biology of Functional RNA and DNA

  MATSUGAMI Akimasa; KOIZUMI Daisuke; OHYAMA Takako; INADA Masashi; TSUCHIBAYASHI Hiroaki; NAGATA Takashi; XU Yan; NOGUCHI Yuuki; SUGIYAMA Hiroshi; UMEHARA Takuya; NISHIKAWA Fumiko; NISHIKAWA Satoshi; KATAHIRA Masato; KATAHIRA Masato; KATAHIRA Masato

  Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn, 2006年11月

  
• Structural analysis of Musashi protein complexed with the target RNA

  Ohyama,T; Miyanoiri,Y; Nagata,T; Okano,H; Katahira,M

  第45回NMR討論会.京都, 2006年11月

  
• Musashiタンパク質と標的RNAの複合体の構造解析

  大山貴子; 宮ノ入洋平; 永田崇; 栃尾豪人; 岡野栄之; 片平正人

  第8回日本RNA学会年会.淡路島, 2006年07月

  
• 翻訳を抑制するタンパク質及びRNAに関する構造解析

  松上明正; 小泉大輔; 菊池邦夫; 楳原琢也; 西川冨美子; 西川諭; 大山貴子; 宮ノ入洋平; 永田崇; 栃尾豪人; 岡野栄之; 片平正人

  第8回日本RNA学会年会.淡路島, 2006年07月

  
• 転写因子GT-1タンパク質のリン酸化によるDNA結合能上昇の構造学的基盤-リン酸化をミミックする変異型と天然型の構造比較-

  二矢田絵美; 能登和明; 宮ノ入洋平; 栃尾豪人; 永田崇; 平塚和之; 片平正人

  第6回日本蛋白質科学会年会.京都, 2006年04月

  
• Structures of telomere DNA in K+ solution, Musashi in complex with RNA, and wild and mutant (phosphorylation-mimicking) DNA-binding proteins, GT-1

  Ohyama, T; Tsuchibayashi, H; Matsugami, A; Miyanoiri, Y; Niyada, E; Nagata, T; Katahira, M

  XXII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems, 2006年, 査読有り

  
• New approaches to structure determination of Protein/DNA complexes by stable isotope-assisted NMR techniques

  Nagata, T; Werner, M. H

  Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on Mechanisms of Eukaryotic Transcription, New York, 2001, 2001年

  
• Defining the functional motifs for DNA-binding and heterodimerization in AML1/RUNX1: Interactions with DNA, PEBP2b/CBFb and ETS1

  Nagata, T; Werner, M. H

  Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on Mechanisms of Eukaryotic Transcription, 2001年

  
• Defining functional motifs for DNA-binding and heterodimerization for the AML1/RUNX1 transcription factor

  Nagata, T; Werner, M. H

  Keystone Symposia on Frontiers of NMR in Molecular Biology VII,2001, 2001年

  
• Structure, backbone dynamics and interactions with RNA of RNA-binding domains of hnRNP D0 and Musashi1

  Nagata, T; Matsuda, G; Kanno, R; Kobayashi, H; Saeki, J; Kurihara, Y; Kohno, T; Yanagida, Y; Ishikawa, F; Imai, T; Sakakibara, S; Okano, H; Uesugi, S; Katahira, M

  XVIIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems,1998, 1998年

  
• Structure of UUAGGG-specific RNA binding protein hnRNP-D and it’s interaction with RNA

  Nagata, T; Kurihara, Y; Kohno, T; Kajira, Y; Ishikawa, F; Katahira, M; Uesugi, S

  The 11th Rinshoken International conference,1996, 1996年

  

講演・口頭発表等

• 分子込み合い環境における核酸のNMR解析

  永田崇; 阪本知樹; 清水まこと; 川上愛加; 近藤敬子; 山置佑大; 片平正人

  63rd Annual Meeting of the Nuclear Magnetic Resonance Society of Japan (2024), 2024年10月31日

  
• 生体高分子の運動性と構造を様々な時間領域で調べるためのin-cell NMR法の開発

  永田崇

  京都大学エネルギー理工学研究所Ｒ5年度第4回センター談話会, 2023年11月29日, 招待有り

  
• バイオマス利用に向けた構造生命科学的アプローチ：可能性と挑戦

  永田 崇

  京都大学宇治キャンパス公開2023エネルギー理工学研究所公開講演会, 2023年10月22日, 招待有り

  
• Structural Biology Approaches to Biomass Utilization: Opportunities and Challenges

  Takashi Nagata

  The 14th International Symposium of Advanced Energy Science, 2023年08月31日, 招待有り

  
• 構造生命科学で挑むエネルギー問題

  永田崇

  京都大学 第19回エネルギー理工学研究所公開講演会「宇治で発見？ 未来のエネルギー」, 2014年05月10日, 招待有り

  
• タンパク質のNMRシグナルの帰属・構造解析の基礎 ~自動化の時代~

  永田 崇

  第22回若手NMR研究会 NMRによる多彩な生体試料へのアプローチ, 2022年09月12日, 招待有り

  
• Analysis of Structure and Dynamics of Oligonucleotides in Living Human Cells

  Takashi Nagata

  Joint conference of ISMAR-APNMR-NMRSJ-SEST 2021, 2021.8.23-27., 2021年08月26日

  
• 天然変性領域を含むタンパク質のNMR解析

  永田崇

  蛋白研セミナー 生体系NMR法の最前線 基礎から学ぶ最新 NMR解析法（第一回）ー構造解析の自動化, 2020年11月06日, 招待有り

  
• Structural and functional study of the G-quadruplex anti-prion RNA aptamer and in-cell NMR of nucleic acids

  Takashi NAGATA

  International IPR Seminar, Open up a new era of structural biology with advanced NMR study, Osaka Univ., 2019.11.19-20, 2019年11月19日, 招待有り

  
• Development of anti-prion RNA aptamers and destruction of the Alzheimer's disease-related complex

  Takashi NAGATA

  The 46th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry, The 3rd Annual Meeting of Japan Society of Nucleic Acids Chemistry, Koganei Civic Center (Tokyo), 2019.10.29-31, 2019年10月31日

  
• 草木バイオマス有効利用と創薬開発に向けた構造生物学的アプローチ

  永田 崇

  第32回京都大学宇治キャンパス産学交流会. 京都大学(宇治) 2019.6.27, 2019年06月27日, 招待有り

  
• Evaluation of the structural stability and dynamics of nucleic acids inside the living cells by using in-cell NMR spectroscopy

  Nagata T; Yamaoki Y; Katahira M

  The 18th Annual Meeting of the Protein Society of Japan, 2018.6.26-28, Toki messe (Niigata), 2018年06月28日, 招待有り

  
• 機能性核酸の細胞内動的構造解析とDNA変換酵素のスライディングの活写

  永田 崇

  新学術領域「動的構造生命」 平成30年度 第4回 領域会議.ザ・ルイガンズ（福岡） 2018.6.12-14, 2018年06月12日, 招待有り

  
• DNA変換酵素のスライディングと核酸の細胞内動的構造のNMRによる研究

  永田 崇

  生物機能化学シンポジウム エネルギー理工学研究所主催エネルギー複合機構研究センター、国際・産学連携支援推進事業支援. 京都大学（宇治）2018.03.26, 2018年03月26日, 招待有り

  
• 木材分解酵素の構造機能相関研究～木質バイオマスの有効活用に向けた取り組み～

  永田 崇

  京都大学エネルギー理工学研究所第8回センター談話会、2018.01.05, 2018年01月05日

  
• 機能性核酸の細胞内動的構造解析とDNA変換酵素のスライディングの活写

  永田 崇

  新学術領域「動的構造生命」 平成29年度 第3回 領域会議.ザ・ルイガンズ（福岡） 2017.6.5-7, 2017年06月05日, 招待有り

  
• Structural study of RNA aptamer and peptide that potently perturb the function of intrinsically disordered proteins related to disease

  永田 崇

  The 5th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR, 理化学研究所横浜キャンパス（横浜市）, 2016.8.29-30, 2016年08月29日, 招待有り

  
• DNA変換酵素のスライディングと共役した酵素活性機構の動的構造基盤の解明

  永田 崇

  新学術領域 「動的構造生命」 平成28年度 第2回 領域会議.クロスウェーブ幕張（千葉） 2016.4.18-20, 2016年04月18日, 招待有り

  
• 疾患に関わる天然変性蛋白質の機能を阻害するRNAアプタマーと高親和性ペプチドのNMRによる構造機能相関解析

  永田 崇

  第4回ネオバイオ分子研究会, 大阪府立大学 (大阪), 2016年01月29日, 招待有り

  
• DNA変換酵素のスライディングと共役した酵素活性機構の動的構造基盤の解明

  永田 崇

  新学術領域 「動的構造生命」 平成27年度 第1回 領域会議.ザ・ルイガンズ(福岡) 2015.6.1-3, 2015年06月01日, 招待有り

  
• タンパク質の構造、相互作用、酵素反応のNMRによる解析

  永田 崇

  第56回日本生化学会 中国-四国支部例会.島根大学大学会館 (松江), 2015年05月29日, 招待有り

  
• 脳の機能を妨害する天然変性蛋白質とそれを標的とするアプタマーの分子認識機構の解明

  永田 崇

  新学術領域「天然変性蛋白質」平成25年度 第4回 領域会議.ひだホテルプラザ（岐阜） 2013.9.3-5, 2013年09月03日, 招待有り

  
• 脳の機能を妨害する天然変性蛋白質とそれを標的とするアプタマーの分子認識機構の解明

  永田崇

  新学術領域「天然変性蛋白質」平成24年度 第3回 領域会議.北広島クラッセホテル（北海道）2012.5.30-6.1, 2012年05月30日, 招待有り

  
• 酵素活性の実時間追跡と構造解析による抗HIV治療薬の開発型研究

  永田 崇

  第7回先端医科学研究センタープロジェクト報告会.横浜, 2012年01月, 招待有り

  
• New approaches to structure determination of Protein/DNA complexes by stable isotope-assisted NMR techniques

  Nagata, T; Werner, M. H

  The Rockefeller University, "Tri-Lab" Scientific Exchange.New York, 1999, 1999年, 招待有り

  

書籍等出版物

• 核酸のin-cell NMR：ヒト生細胞内環境における塩基対開閉ダイナミクスの解析

  永田崇; 山置佑大; 片平正人

  日本分光学会, 分光研究, 74(2), 2025年06月, 査読有り

  
• Experimental Approaches of NMR Spectroscopy -Methodology and Application to Life Science and Material Science 2nd Edition

  Nagata, T; Yamaoki, Y; Katahira, M, 執筆

  Springer Nature, 2025年03月14日, 査読有り

  
• 生命金属ダイナミクス～生体内における金属の挙動と制御～

  山置佑大; 永田崇; 片平正人, 分担執筆, 金属原子によるRNAの立体構造形成とその生理活性スイッチングへの応用, pp198-204

  NTS, 2021年01月15日, 査読有り

  
• Observation of nucleic acids inside living human cells by in-cell NMR spectroscopy

  Yamaoki Y; Nagata T; Sakamoto T; Katahira M, 共著

  Biophysics and Physicobiology, 13, 164, 2020, 2020年05月26日, 査読有り

  
• Recent progress of in-cell NMR of nucleic acids in living human cells

  Yamaoki Y; Nagata T; Sakamoto T; Katahira M, 共著

  Biophysical Reviews, 12, 411, 2020, 2020年03月06日, 査読有り

  
• ヒト生細胞中における核酸NMRシグナルの初計測

  山置佑大; 永田崇; 片平正人, 共著

  生物物理誌, 2019年01月, 査読無し

  
• 単独ドメインから成るタンパク質APOBEC3GC端ドメインはストランド間移動する能力を有する～実時間NMR計測法を用いた酵素活性測定の応用

  神庭圭佑; 永田崇; 片平正人, 共著

  新学術領域「柔らかな分子系」ニュースレター第54号（平成30年2月号）, 54, 2018年02月, 査読無し

  
• ヒト生細胞中のDNAおよびRNAのNMRシグナル観測に初めて成功

  山置佑大; 永田崇; 片平正人, 共著

  新学術領域「柔らかな分子系」ニュースレター第54号（平成30年2月号）, 54, 2018年02月, 査読無し

  
• APOBEC3Fの触媒中心近傍アミノ酸残基の役割と、DNA配列・長さ及びpHが脱アミノ化活性に及ぼす影響

  永田 崇; 片平正人, 共著

  新学術領域「柔らかな分子系」ニュースレター第54号（平成30年2月号）, 54, 2018年02月, 査読無し

  
• 随想：杉とオークのバイオマス ~週末版~

  永田 崇, 単著

  京都大学エネルギー理工学研究所ニュースレター第61号（平成28年7月号）, 61, 9, 2016年07月, 査読無し

  
• Uniform 13C/15N-labeling of DNA by tandem repeat amplification

  Werner, M. H; Gupta, V; Lambert, L. J; Nagata, T, 共著

  Methods Enzymol., 338: 283-304, 2001年, 査読有り