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城本 悠助

シロモト ユウスケ

医学研究科 医学専攻遺伝医学講座分子遺伝学 特定助教

城本 悠助
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    Last Updated :2025/05/27

    基本情報

    学位

    • 博士（医学）(大阪大学)
    • 修士（医科学）(大阪大学)

    経歴

    • 自 2021年04月, 至 現在
      京都大学, 医学研究科
    • 自 2019年10月, 至 2021年03月
      The Wistar Institute, Associate Staff Scientist
    • 自 2014年10月, 至 2019年10月
      The Wistar Institute, Postdoctral fellow
    • 自 2017年04月, 至 2019年03月
      ウィスター研究所, JSPS 海外特別研究員
    • 自 2014年04月, 至 2014年10月
      大阪大学大学院医学系研究科, 特任研究員

    ID,URL

    researchmap URL

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      Last Updated :2025/05/27

      研究

      研究分野

      • ライフサイエンス, 分子生物学, RNA
      • ライフサイエンス, 発生生物学, 生殖細胞

      論文

      • Intracytoplasmic sperm injection induces transgenerational abnormalities in mice
        Mito Kanatsu-Shinohara; Yusuke Shiromoto; Narumi Ogonuki; Kimiko Inoue; Satoko Hattori; Kento Miura; Naomi Watanabe; Ayumi Hasegawa; Keiji Mochida; Takuya Yamamoto; Tsuyoshi Miyakawa; Atsuo Ogura; Takashi Shinohara
        Journal of Clinical Investigation, 2023年11月15日, 筆頭著者
      • Allogeneic offspring produced by induction of PD-L1 in spermatogonial stem cells via self-renewal stimulation
        Takashi Shinohara; Takuya Yamamoto; Hiroko Morimoto; Yusuke Shiromoto; Mito Kanatsu-Shinohara
        Stem Cell Reports, 2023年04月
        この論文にアクセスする：
      • ADAR1 downregulation by autophagy drives senescence independently of RNA editing by enhancing p16INK4a levels
        Xue Hao; Yusuke Shiromoto; Masayuki Sakurai; Martina Towers; Qiang Zhang; Shuai Wu; Aaron Havas; Lu Wang; Shelley Berger; Peter D. Adams; Bin Tian; Kazuko Nishikura; Andrew V. Kossenkov; Pingyu Liu; Rugang Zhang
        Nature Cell Biology, 2022年07月18日
      • Regeneration of spermatogenesis by mouse germ cell transplantation into allogeneic and xenogeneic testis primordia or organoids.
        Mito Kanatsu-Shinohara; Narumi Ogonuki; Shogo Matoba; Hiroko Morimoto; Yusuke Shiromoto; Atsuo Ogura; Takashi Shinohara
        Stem cell reports, 2022年03月08日, 査読有り
        この論文にアクセスする：
      • ADAR1 RNA editing enzyme regulates R-loop formation and genome stability at telomeres in cancer cells.
        Yusuke Shiromoto; Masayuki Sakurai; Moeko Minakuchi; Kentaro Ariyoshi; Kazuko Nishikura
        Nature communications, 2021年03月12日
      • Processing of Alu small RNAs by DICER/ADAR1 complexes and their RNAi targets.
        Yusuke Shiromoto; Masayuki Sakurai; Helen Qu; Andrew V Kossenkov; Kazuko Nishikura
        RNA (New York, N.Y.), 2020年12月
      • GPAT2 is required for piRNA biogenesis, transposon silencing, and maintenance of spermatogonia in mice†.
        Yusuke Shiromoto; Satomi Kuramochi-Miyagawa; Ippei Nagamori; Shinichiro Chuma; Tatsuhiko Arakawa; Toru Nishimura; Hidetoshi Hasuwa; Taro Tachibana; Masahito Ikawa; Toru Nakano
        Biology of reproduction, 2019年07月01日
      • Mouse GTSF1 is an essential factor for secondary piRNA biogenesis.
        Takuji Yoshimura; Toshiaki Watanabe; Satomi Kuramochi-Miyagawa; Noriaki Takemoto; Yusuke Shiromoto; Akihiko Kudo; Masami Kanai-Azuma; Fumi Tashiro; Satsuki Miyazaki; Ami Katanaya; Shinichiro Chuma; Jun-Ichi Miyazaki
        EMBO reports, 2018年04月
      • ADAR1 controls apoptosis of stressed cells by inhibiting Staufen1-mediated mRNA decay.
        Masayuki Sakurai; Yusuke Shiromoto; Hiromitsu Ota; Chunzi Song; Andrew V Kossenkov; Jayamanna Wickramasinghe; Louise C Showe; Emmanuel Skordalakes; Hsin-Yao Tang; David W Speicher; Kazuko Nishikura
        Nature structural & molecular biology, 2017年06月
      • Functions of the RNA Editing Enzyme ADAR1 and Their Relevance to Human Diseases.
        Chunzi Song; Masayuki Sakurai; Yusuke Shiromoto; Kazuko Nishikura
        Genes, 2016年12月17日
      • piRNAs derived from ancient viral processed pseudogenes as transgenerational sequence-specific immune memory in mammals.
        Nicholas F Parrish; Kan Fujino; Yusuke Shiromoto; Yuka W Iwasaki; Hongseok Ha; Jinchuan Xing; Akiko Makino; Satomi Kuramochi-Miyagawa; Toru Nakano; Haruhiko Siomi; Tomoyuki Honda; Keizo Tomonaga
        RNA (New York, N.Y.), 2015年10月
      • Comprehensive DNA Methylation Analysis of Retrotransposons in Male Germ Cells.
        Ippei Nagamori; Hisato Kobayashi; Yusuke Shiromoto; Toru Nishimura; Satomi Kuramochi-Miyagawa; Tomohiro Kono; Toru Nakano
        Cell reports, 2015年09月08日
      • Induction of DNA methylation by artificial piRNA production in male germ cells.
        Daisuke Itou; Yusuke Shiromoto; Shin-ya Yukiho; Chika Ishii; Toru Nishimura; Narumi Ogonuki; Atsuo Ogura; Hidetoshi Hasuwa; Yoshitaka Fujihara; Satomi Kuramochi-Miyagawa; Toru Nakano
        Current biology : CB, 2015年03月30日
      • DNA methylation in mouse testes.
        Satomi Kuramochi-Miyagawa; Kanako Kita-Kojima; Yusuke Shiromoto; Daisuke Ito; Hirotaka Koshima; Toru Nakano
        Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2014年
      • GPAT2, a mitochondrial outer membrane protein, in piRNA biogenesis in germline stem cells.
        Yusuke Shiromoto; Satomi Kuramochi-Miyagawa; Akito Daiba; Shinichiro Chuma; Ami Katanaya; Akiko Katsumata; Ken Nishimura; Manami Ohtaka; Mahito Nakanishi; Toshinobu Nakamura; Koichi Yoshinaga; Noriko Asada; Shota Nakamura; Teruo Yasunaga; Kanako Kojima-Kita; Daisuke Itou; Tohru Kimura; Toru Nakano
        RNA (New York, N.Y.), 2013年06月
      • MVH in piRNA processing and gene silencing of retrotransposons.
        Satomi Kuramochi-Miyagawa; Toshiaki Watanabe; Kengo Gotoh; Kana Takamatsu; Shinichiro Chuma; Kanako Kojima-Kita; Yusuke Shiromoto; Noriko Asada; Atsushi Toyoda; Asao Fujiyama; Yasushi Totoki; Tatsuhiro Shibata; Tohru Kimura; Norio Nakatsuji; Toshiaki Noce; Hiroyuki Sasaki; Toru Nakano
        Genes & development, 2010年05月

      MISC

      • TERTによるRNA合成とRNA編集との相互作用に関する検討
        毎田 佳子; 櫻井 雅之; 城本 悠助; 安川 麻美; Ghilotti Marco; 有吉 健太郎; 西倉 和子; 増富 健吉
        生命科学系学会合同年次大会, 2017年12月

      講演・口頭発表等

      • ADAR1 RNA editing enzyme regulates R-loop formation and genome stability at telomeres in cancer cells
        Shiromoto, Y; Sakurai, M; Minakuchi, M; Ariyoshi, K; Nishikura, K
        KEYSTONE SYMPOSIA, 2020年10月
      • ADAR1 controls apoptosis of stressed cells by inhibiting Staufen-mediated mRNA decay
        Sakurai, M; Shiromoto, Y; Ota, H; Song, C; Kossenkov, A.V; Wickramasinghe, J; Showe, L.C; Skordalakes, E; Tao, H.Y; Speicher, D.W; Nishikura, K
        Gordon Research Conference, 2017年03月

      書籍等出版物

      • RNA 編集酵素 ADAR1 はストレス下において mRNA 分解からの保護機構によりアポトーシスを抑制する
        櫻井雅之; 城本悠助; 西倉和子, 共著
        ライフサイエンス新着論文レビュー, 2017年

      外部資金：科学研究費補助金

      • 雄性生殖細胞におけるR-loopの解消機構と精子形成及び次世代への影響
        研究活動スタート支援
        0702:細胞レベルから個体レベルの生物学およびその関連分野
        京都大学
        城本 悠助
        自 2021年08月30日, 至 2023年03月31日, 完了
        精巣;精子幹細胞;R-loop;DNA損傷;精子形成
        https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K20655/
      • piRNAを介した生殖細胞の脱分化・腫瘍化制御機構の解明
        基盤研究(C)
        小区分49030:実験病理学関連
        京都大学
        城本 悠助
        自 2022年04月01日, 至 2025年03月31日, 交付
        精子幹細胞;piRNA;生殖細胞腫瘍
        https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K07003/
      • 精子幹細胞を用いたpiRNA経路の制御化合物の探索と精巣でのpiRNA経路の制御
        国際共同研究加速基金(国際共同研究強化)
        小区分49030:実験病理学関連
        京都大学
        城本 悠助
        自 2024年04月01日, 至 2027年03月31日, 交付
        精子幹細胞;piRNA;化合物スクリーニング
        https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23KK0304/
      • 精子幹細胞を用いた生殖細胞におけるウイルス感染の防御システムの解明
        基盤研究(C)
        小区分49030:実験病理学関連
        京都大学
        城本 悠助
        自 2025年04月01日, 至 2028年03月31日, 採択
        https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25K10303/

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