基本情報

学部兼担

• 理学部

所属学協会

• 日本分子生物学会

学位

• 2004年03月26日

  東京工業大学修士（理学）
• 2007年06月30日

  東京工業大学博士（理学）

出身学校・専攻等

• 東京工業大学, 生命理工学部生体機構学科, 卒業

経歴

• 自 2022年, 至 現在

  京都大学 大学院理学研究科, 教授
• 自 2021年, 至 2022年

  名古屋大学 大学院理学研究科, 教授
• 自 2016年, 至 2021年

  名古屋大学 大学院理学研究科, 准教授
• 自 2012年, 至 2016年

  名古屋大学 高等研究院, 特任講師
• 自 2008年, 至 2012年

  ウィーン分子病理学研究所（IMP）, EMBO Longterm Fellow､ 学振海外特別研究員

ID,URL

• J-Global ID

  201301091148938799

researchmap URL

• https://researchmap.jp/7000006269

研究

研究キーワード

• 染色体動態
• 染色体構造
• 一分子生物学
• SMC
• 遺伝性疾患
• 初期胚発生

研究分野

• ライフサイエンス, 細胞生物学
• ライフサイエンス, 分子生物学

論文

• Cohesin prevents local mixing of condensed euchromatic domains in living human cells

  Shimazoe MA; Iida S; Minami K; Higashi K; Tamura S; Kobayashi Y; Fujishiro S; Xiong L; Nakazato K; Ashwin SS; Nishiyama T; Nagata Y; Kanemaki MT; Kawaguchi A; Ohkawa Y; Schermelleh L; Toyoda A; Xie L; Kurokawa K; Ochiai H; Sasai M; Maeshima K

  Nature Genetics, 2026年09月08日

  
• Bridging-driven condensation by eukaryotic SMC complexes is a conserved feature of genome organization

  Jang JW, Higashi TL, Tang M, Kim C, Kinoshita Y, Myeong H, Lee J, Nishiyama T, Cho WK, Uhlmann F, Dekker C, Ryu JK

  Nucleic Acids Research, 2026年08月24日

  
• Single-Molecule Analyses of Human Cohesin Complex.

  Yoshimi Kinoshita; Tomoko Nishiyama

  Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2026年

  
• Functional interplay between condensin I and topoisomerase IIα in single-molecule DNA compaction

  Tsubota Y.; Shintomi K.; Kinoshita K.; Masahara-Negishi Y.; Aizawa Y.; Shima M.; Hirano T.; Nishiyama T.

  Nature Communications, 2025年

  
• Sororin is an evolutionary conserved antagonist of WAPL

  Mota PI, Galova M, Schleiffer A, Nguyen TT, Kovacikova I, Saad CF, Litos G, Nishiyama T, Gregan J, Peters J-M, Schlögelhofer P

  Nature Communications, 2024年

  
• 姉妹染色分体間接着因子コヒーシンの一分子動態解析

  Kinoshita Y, Nishiyama T

  生物物理, 2023年

  
• A loop extrusion-independent mechanism contributes to condensin I-mediated chromosome shaping

  Kinoshita K, Tsubota Y, Tane S, Aizawa Y, Sakata R, Takeuchi K, Shintomi K, Nishiyama T, Hirano T

  The Journal of Cell Biology, 2022年

  
• SMCタンパク質複合体による染色体高次構造制御

  Sakata R, Nishiyama T

  実験医学増刊, 2022年

  
• （特集）DNAの物性から理解するゲノムモダリティ

  Nishiyama T (ed.)

  月刊細胞, 2022年

  
• Cell cycle-specific loading of condensin I is regulated by the N-terminal tail of its kleisin subunit

  Tane S, Shintomi K, Tsubota Y, Yoshida MM, Nishiyama T, Hirano T

  eLife, 2022年

  
• Opening of cohesin’s SMC ring is essential for timely DNA replication and DNA loop formation

  Sakata R, Niwa K, Ugarte La Torre D, Gu C, Tahara E, Takada S, Nishiyama T

  Cell Reports, 2021年

  
• DNAループを押し出す〜ゲノム高次構造形成の原動力〜

  Sakata R, Nishiyama T

  News & Hot Paper Digest 実験医学, 2020年

  
• Compartments in the Ring

  Nishiyama T

  Molecular Cell, 2019年

  
• コヒーシン・コンデンシンの一分子解析

  Nishiyama T

  実験医学増刊, 2018年

  
• Cohesion and cohesin-dependent chromatin organization

  Nishiyama T

  Current Opinion in Cell Biology, 2018年

  
• Drosophila Dalmatian combines sororin and shugoshin roles in establishment and protection of cohesion

  Yamada T, Tahara E, Kanke M, Kuwata K, Nishiyama T

  The EMBO Journal, 2017年

  
• Cohesin acetylation and Wapl‐Pds5 oppositely regulate translocation of cohesin along DNA

  Kanke M, Tahara E, Huis in’t Veld PJ, Nishiyama T

  The EMBO Journal, 2016年

  
• Wapl is an essential regulator of chromatin structure and chromosome segregation

  Tedeschi A, Wutz G, Huet S, Jaritz M, Wuensche A, Schirghuber E, Davidson IF, Tang W, Cisneros DA, Bhaskara V, Nishiyama T, Vaziri A, Wutz A, Ellenberg J, Peters JM

  Nature, 2013年

  
• Aurora B and Cdk1 mediate Wapl activation and release of acetylated cohesin from chromosomes by phosphorylating Sororin

  Nishiyama T, Sykora MM, Huis In ‘t Veld PJ, Mechtler K, Peters JM

  Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 2013年

  
• Sister Chromatid Cohesion

  Peters JM, Nishiyama T

  Cold Spring Harbor Perspectives in Biology (DNA replication, eds Stephen D. Bell, Marcel Méchali, Melvin L. DePamphilis), 2012年

  
• Sororin mediates sister chromatid cohesion by antagonizing Wapl

  Nishiyama T, Ladurner R, Schmitz J, Kreidl E, Schleiffer A, Bhaskara V, Bando M, Shirahige K, Hyman AA, Mechtler K, Peters JM

  Cell, 2010年

  
• 脊椎動物未受精卵における減数分裂停止とその解除

  Nishiyama T, Ohsumi K

  蛋白質核酸酵素, 2008年

  
• Phosphorylation of Erp1 by p90rsk is required for cytostatic factor arrest in Xenopus laevis eggs

  Nishiyama T, Ohsumi K, Kishimoto T

  Nature, 2007年

  
• Transient activation of calcineurin is essential to initiate embryonic development in Xenopus laevis

  Nishiyama T, Yoshizaki N, Kishimoto T, Ohsumi K

  Nature, 2007年

  

書籍等出版物

• Cytostatic arrest: post-ovulation arrest until fertilization in metazoan oocytes.

  Nishiyama T.; Tachibana K.; Kishimoto T., pp 357-384

  Oogenesis: the universal process (eds Marie-Helene Verlhac and Anne Villeneuve), Wiley-Backwell, 2010年

  
• The Cell Cycle: principles of Control

  Chapter 9

  Oxford University Press, London, 2007年

  

受賞

• 2015年04月01日

  文部科学大臣表彰 若手科学者賞

メディア報道

• 先端人「染色体の姿 手に取るように」

  朝日新聞, 2022年01月

  
• 細胞分裂タンパク特定

  中日新聞, 2017年06月

  
• コヒーシンの働き解明

  中日新聞, 2016年12月

  

教育

担当科目

• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  生物物理学入門

  N488, 前期, 国際高等教育院, 2
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＤ

  9153, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＣ

  9152, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＢ

  9151, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＡ

  9150, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩA

  9146, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＤ

  9149, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＣ

  9148, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＢ

  9147, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  生物科学課題研究１７

  8720, 通年集中, 理学部, 12
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  分子生物学Ｉ

  2702, 前期, 理学部, 2
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  生物学セミナーＢ

  4732, 後期, 理学部, 2
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  染色体生物学

  3770, 前期, 理学部, 2
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  生物学実習Ａ

  3762, 前期集中, 理学部, 2
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  生物科学特論Ａ

  9011, 前期, 理学研究科, 2
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  生物物理学入門

  N488, 前期, 国際高等教育院, 2
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＤ

  9153, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＤ

  9149, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＣ

  9148, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＢ

  9147, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＣ

  9152, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＢ

  9151, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＡ

  9150, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩA

  9146, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  生物科学課題研究１７

  8720, 通年集中, 理学部, 12
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  分子生物学II

  2703, 後期, 理学部, 2
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  分子生物学Ｉ

  2702, 前期, 理学部, 2
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  生物学セミナーＢ

  4732, 後期, 理学部, 2
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  染色体生物学

  3770, 前期, 理学部, 2
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  生物学実習Ａ

  3762, 前期集中, 理学部, 2
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  生物科学特論Ａ

  9011, 前期, 理学研究科, 2
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  細胞と分子の基礎生物学実験

  2729, 後期, 理学部, 4
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  生物物理学入門

  N488, 前期, 国際高等教育院, 2
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩA

  9146, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＤ

  9153, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＤ

  9149, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＣ

  9148, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＢ

  9147, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＣ

  9152, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＢ

  9151, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＡ

  9150, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  生物科学課題研究１７

  8720, 通年集中, 理学部, 12
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  生物学セミナーＢ

  4732, 後期, 理学部, 2
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  染色体生物学

  3770, 前期, 理学部, 2
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  生物学実習Ｅ

  3766, 後期集中, 理学部, 2
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  分子生物学II

  2703, 後期, 理学部, 2
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  分子生物学Ｉ

  2702, 前期, 理学部, 2
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  生物科学特論Ａ

  9011, 前期, 理学研究科, 2
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＡ

  9150, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＤ

  9149, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＣ

  9148, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＤ

  9153, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＣ

  9152, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＩＢ

  9151, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩＢ

  9147, 後期, 理学研究科, 1
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  ゲノム多元統御学ゼミナールＩA

  9146, 前期, 理学研究科, 1
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  生物科学課題研究１７

  8720, 通年集中, 理学部, 12
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  生物学セミナーＢ

  4732, 後期, 理学部, 2
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  染色体生物学

  3770, 前期, 理学部, 2
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  生物学実習Ｅ

  3766, 後期集中, 理学部, 2
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  分子生物学Ｉ

  2702, 前期, 理学部, 2
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  生物科学特論Ａ

  9011, 前期, 理学研究科, 2

博士学位審査

• コヒーシン分子機能におけるサブユニット依存的なDNA結合安定性と構造ダイナミクスの制御機構の解析

  坂田　凌大, 理学研究科, 主査

  2026年03月23日
• Multiscale computational studies on the mechanisms that regulate chromatin conformation（クロマチン構造を制御するメカニズムのマルチスケール計算研究）

  GU CHENYANG, 理学研究科, 副査

  2025年11月25日
• 溶液AFMイメージングと粗視化分子動力学シミュレーションによる酵母コンデンシンの構造モデリング

  小出　洋輝, 理学研究科, 副査

  2025年03月24日
• ヒストンリサイクリングの分子機構に関するシミュレーション・実験融合研究

  長江　文立津, 理学研究科, 副査

  2025年03月24日
• 地球規模の海洋微生物生態学への統計的学習の応用

  金子　博人, 理学研究科, 副査

  2024年03月25日
• Unveiling the global diversity and evolution of giant viruses through ocean metagenomics（全球海洋メタゲノム解析を通じた巨大ウイルスの多様性と進化の解明）

  Lingjie Meng, 理学研究科, 副査

  2024年03月25日

大学運営

部局運営(役職等)

• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  理学部・教育委員会委員
• 自 2026年04月01日, 至 2027年03月31日

  理学部・教育委員会教務委員会委員
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  理学部・教育委員会委員
• 自 2025年04月01日, 至 2026年03月31日

  理学部・教育委員会　アドミッション委員会委員
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  理学研究科SACRA国際戦略部門委員会委員
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  理学部・教育委員会委員
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  理学部・教育委員会　少人数担任委員会
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  理学研究科自己点検・評価委員会委員
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  理学部・教育委員会委員
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  理学部・教育委員会　少人数担任委員会委員
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  理学研究科大学院教育教務委員会委員
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  理学研究科SACRA国際戦略部門委員会委員
• 自 2023年04月01日, 至 2024年03月31日

  理学研究科研究科会議構成員