基本情報

学部兼担

• 工学部

全学メールアドレス

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  matsuda.shyun.2xkyoto-u.ac.jp

所属学協会

• 至 現在

  日本環境変異原ゲノム学会

学位

• 2008年03月24日

  京都大学修士（工学）
• 2012年09月24日

  京都大学博士（工学）

出身大学院・研究科等

• 京都大学, 大学院工学研究科博士後期課程都市環境工学専攻, 修了
• 京都大学, 大学院工学研究科修士課程都市環境工学専攻, 修了

出身学校・専攻等

• 京都大学, 工学部地球工学科, 卒業

経歴

• 自 2024年04月, 至 現在

  京都大学, 大学院工学研究科 都市環境工学専攻 環境衛生学講座, 准教授
• 自 2022年11月, 至 2024年03月

  第一三共株式会社, 副主任研究員
• 自 2016年01月, 至 2022年10月

  富士フイルム株式会社, 研究員
• 自 2014年04月, 至 2015年12月

  京都大学, 大学院工学研究科, 特別研究員
• 自 2012年10月, 至 2014年03月

  独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員（PD）
• 自 2012年04月, 至 2012年09月

  独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員（DC2）
• 自 2009年03月, 至 2009年09月

  京都大学, 大学院工学研究科, 研究員
• 自 2008年04月, 至 2009年02月

  大鵬薬品工業株式会社

ID,URL

• ORCID ID

  0000-0002-4181-2772

• J-Global ID

  202401005517665433

• 研究者番号

  41001209

researchmap URL

• https://researchmap.jp/shunmatsuda

研究

研究キーワード

• ピルビン酸キナーゼM2
• ダイオキシン受容体
• LC-MS/MS
• DNA損傷応答
• 遺伝毒性

研究分野

• 環境・農学, 化学物質影響, 環境毒性学

論文

• Dynamics of Fanconi anemia protein D2 in association with nuclear lipid droplet formation

  Tomoya Hotani; Motonari Goto; Yukie Otsuki; Shun Matsuda; Nobuhiro Wada; Masakazu Shinohara; Tomonari Matsuda; Masayuki Yokoi; Kaoru Sugasawa; Yuki Ohsaki; Wataru Sakai

  2025年02月05日

  
• Discovery of a Novel Dihydroorotate Dehydrogenase Inhibitor That Induces Differentiation and Overcomes Ara-C Resistance of Acute Myeloid Leukemia Cells

  Satoshi Kitazawa; Yukiko Ishii; Keiko Makita-Suzuki; Koichi Saito; Kensuke Takayanagi; Hiromi Sugihara; Shun Matsuda; Takayuki Yamakawa; Yasuhiro Tsutsui; Tadashi Tanaka; Tomohisa Hatta; Tohru Natsume; Toru Kondo; Yuichi Ishikawa; Shinji Hagiwara; Hitoshi Kiyoi

  Blood, 2019年11月13日, 査読有り

  
• Abstract 1228: FF-10850, a novel liposomal topotecan, achieved superior anti-tumor effects and a favorable safety profile via preferential distribution followed by dual payload release mechanisms in tumor

  Susumu Shimoyama; Ken Okada; Toshifumi Kimura; Noriyuki Kasagi; Shinji Nakayama; Keiko Makita-Suzuki; Shun Matsuda; Mikinaga Mori; Kiyohito Takada; Shinji Hagiwara; Takefumi Hara

  Cancer Research, 2019年07月01日, 査読有り

  
• Absolute quantification of DNA damage response proteins

  Shun Matsuda; Tsuyoshi Ikura; Tomonari Matsuda

  Genes and Environment, 2023年12月18日, 査読有り, 筆頭著者

  
• Detection of DNA damage formation by natural organic matter using EGFP-fused MDC1-expressing cells

  Kentaro Misaki; Tomonari Matsuda; Taketoshi Kusakabe; Yoshihisa Shimizu

  Chemosphere, 2019年11月, 査読有り

  
• Discovery of a new pyrimidine synthesis inhibitor eradicating glioblastoma-initiating cells

  Smile Echizenya; Yukiko Ishii; Satoshi Kitazawa; Tadashi Tanaka; Shun Matsuda; Eriko Watanabe; Masao Umekawa; Shunsuke Terasaka; Kiyohiro Houkin; Tomohisa Hatta; Tohru Natsume; Yoshimasa Maeda; Shin-Ichi Watanabe; Shinji Hagiwara; Toru Kondo

  Neuro-Oncology, 2019年09月10日, 査読有り

  
• Quantitative analysis of γH2AX reveals distinct responses in multiple mouse organs after administration of mitomycin C or ethyl methanesulfonate

  Shun Matsuda; Sayaka Wanibuchi; Toshihiko Kasahara

  Mutagenesis, 2018年12月31日, 査読有り, 筆頭著者, 責任著者

  
• Simultaneous and absolute quantification of nucleoside triphosphates using liquid chromatography–triple quadrupole tandem mass spectrometry

  Shun Matsuda; Toshihiko Kasahara

  Genes and Environment, 2018年12月, 査読有り, 筆頭著者, 責任著者

  
• High-content image analysis (HCIA) assay has the highest correlation with direct counting cell suspension compared to the ATP, WST-8 and Alamar blue assays for measurement of cytotoxicity.

  Tahara H; Matsuda S; Yamamoto Y; Yoshizawa H; Fujita M; Katsuoka Y; Kasahara T

  Journal of pharmacological and toxicological methods, 2017年11月, 査読有り

  
• DNA損傷応答の可視化と絶対定量によるDNA損傷評価—DNA damage assessment by visualization and quantification of DNA damage response

  松田 俊; 井倉 毅; 松田 知成

  放射線生物研究 = Radiation biology research communications : 放射線生物研究会機関誌, 2017年03月31日, 査読有り, 招待有り, 筆頭著者, 責任著者

  
• Chemically induced strong cellular hypertrophy often reduces the accuracy of cytotoxicity measurements obtained using the ATP assay.

  Tahara H; Yamamoto Y; Matsuda S; Yoshizawa H; Fujita M; Hioki T; Kasahara T

  The Journal of toxicological sciences, 2017年, 査読有り

  
• Disruption of DNA Damage-Response by Propyl Gallate and 9-Aminoacridine.

  Matsuda S; Matsuda Y; Yanagisawa SY; Ikura M; Ikura T; Matsuda T

  2016年06月, 査読有り, 筆頭著者

  
• Acetylation of Histone H2AX at Lys 5 by the TIP60 Histone Acetyltransferase Complex Is Essential for the Dynamic Binding of NBS1 to Damaged Chromatin

  Masae Ikura; Kanji Furuya; Shun Matsuda; Ryo Matsuda; Hiroki Shima; Jun Adachi; Tomonari Matsuda; Takuma Shiraki; Tsuyoshi Ikura

  Molecular and Cellular Biology, 2015年12月01日, 査読有り

  
• Nuclear pyruvate kinase M2 complex serves as a transcriptional coactivator of arylhydrocarbon receptor

  Shun Matsuda; Jun Adachi; Masaru Ihara; Nobuhiro Tanuma; Hiroshi Shima; Akira Kakizuka; Masae Ikura; Tsuyoshi Ikura; Tomonari Matsuda

  Nucleic Acids Research, 2015年09月23日, 査読有り, 筆頭著者

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• Mutation assay using single-molecule real-time (SMRTTM) sequencing technology

  Tomonari Matsuda; Shun Matsuda; Masami Yamada

  Genes and Environment, 2015年09月01日, 査読有り

  この論文にアクセスする：

  
• hCAS/CSE1L regulates RAD51 distribution and focus formation for homologous recombinational repair.

  Okimoto S; Sun J; Fukuto A; Horikoshi Y; Matsuda S; Matsuda T; Ikura M; Ikura T; Machida S; Kurumizaka H; Miyamoto Y; Oka M; Yoneda Y; Kiuchi Y; Tashiro S

  2015年06月, 査読有り

  
• Absolute quantification of acetylation and phosphorylation of the histone variant H2AX upon ionizing radiation reveals distinct cellular responses in two cancer cell lines

  Shun Matsuda; Kanji Furuya; Masae Ikura; Tomonari Matsuda; Tsuyoshi Ikura

  Radiation and Environmental Biophysics, 2015年06月19日, 査読有り, 筆頭著者

  
• Absolute quantification of γH2AX using liquid chromatography-triple quadrupole tandem mass spectrometry.

  Matsuda S; Ikura T; Matsuda T

  2015年05月, 査読有り, 筆頭著者

  
• Protective role of ALDH2 against acetaldehyde-derived DNA damage in oesophageal squamous epithelium.

  Amanuma Y; Ohashi S; Itatani Y; Tsurumaki M; Matsuda S; Kikuchi O; Nakai Y; Miyamoto S; Oyama T; Kawamoto T; Whelan KA; Nakagawa H; Chiba T; Matsuda T; Muto M

  2015年, 査読有り

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• An Easy-to-use Genotoxicity Assay Using EGFP-MDC1-expressing Human Cells

  Shun Matsuda; Ryo Matsuda; Yoko Matsuda; Shin-ya Yanagisawa; Masae Ikura; Tsuyoshi Ikura; Tomonari Matsuda

  Genes and Environment, 2014年, 査読有り, 筆頭著者

  
• A novel interplay between the Fanconi anemia core complex and ATR-ATRIP kinase during DNA cross-link repair

  Tomida, Junya; Itaya, Akiko; Shigechi, Tomoko; Unno, Junya; Uchida, Emi; Ikura, Masae; Masuda, Yuji; Matsuda, Shun; Adachi, Jun; Kobayashi, Masahiko; Meetei, Amom Ruhikanta; Maehara, Yoshihiko; Yamamoto, Ken-ichi; Kamiya, Kenji; Matsuura, Akira; Matsuda, Tomonari; Ikura, Tsuyoshi; Ishiai, Masamichi; Takata, Minoru

  Nucleic Acids Research, 2013年, 査読有り

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• Genotoxicity of Colloidal Fullerene C-60

  Matsuda, S; Matsui, S; Shimizu, Y; Matsuda, T

  Environmental Science & Technology, 2011年, 査読有り, 筆頭著者

  
• Lipid Peroxidation Generates Body Odor Component trans-2-Nonenal Covalently Bound to Protein in Vivo

  Ishino, K; Wakita, C; Shibata, T; Toyokuni, S; Machida, S; Matsuda, S; Matsuda, T; Uchida, K

  Journal of Biological Chemistry, 2010年, 査読有り

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• Detection of Lipid Peroxidation-Induced DNA Adducts Caused by 4-Oxo-2(E)-nonenal and 4-Oxo-2(E)-hexenal in Human Autopsy Tissues

  Chou, PH; Kageyama, S; Matsuda, S; Kanemoto, K; Sasada, Y; Oka, M; Shinmura, K; Mori, H; Kawai, K; Kasai, H; Sugimura, H; Matsuda, T

  Chemical Research in Toxicology, 2010年, 査読有り

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MISC

• 塩基除去修復因子チミンDNAグリコシラーゼの構造活性相関と機能制御

  中村 知史; 村上 浩一; 松田 俊; 松田 知成; 上原 芳彦; 小野 哲也; 西谷 秀男; 菅澤 薫

  日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集, 2015年12月

  
• ゲノムストレス応答における普遍性と多様性の相互転換 DNA損傷応答における動的クロマチン平衡とその意義

  井倉 毅; 古谷 寛治; 松田 俊; 松田 知成; 松田 涼; 田代 聡; 井倉 正枝

  日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集, 2015年12月, 招待有り

  
• 環境・衛生 miRNAイソ型の発現パターンでがんの種類を判別する

  松田 俊

  ファルマシア, 2017年11月

  
• M2型ピルビン酸キナーゼによる増殖細胞特異的なAhRの機能制御

  松田俊; 松田俊

  Endocrine Disrupter News Letter, 2017年

  
• 遺伝子制御の新たな主役 栄養シグナル 第1章 新たに見えてきた,栄養・代謝物シグナルによる遺伝子制御メカニズム 6.核内のピルビン酸キナーゼM2による転写調節機構

  松田知成; 松田俊; 松田俊; 井倉毅

  実験医学, 2016年

  
• 増殖細胞特異的なAhRの機能制御

  松田俊; 松田俊

  環境ホルモン学会研究発表会プログラム・要旨集, 2016年

  
• 画像解析装置を用いた迅速-画像解析細胞毒性試験の有用性についての検討～既存の細胞毒性試験との比較～

  田原 春菜; 山本 裕介; 吉沢 広江; 松田 俊; 藤田 正晴; 勝岡 尉浩; 笠原 利彦

  日本毒性学会学術年会, 2016年

  
• P-098(O-11) LC/MS/MSを用いたDNA修復・損傷応答タンパク質及びヒストン修飾の絶対定量(ポスターセッション,ゲノム変異の生成と抑制 : 分子メカニズムの理解からレギュラトリーサイエンスへ)

  松田,俊; 井倉,正枝; 古谷,寛治; 井倉,毅; 松田,知成

  日本環境変異原学会大会プログラム・要旨集, 2015年11月24日

  
• P-094(O-12) SMRT DNAシーケンサーを用いた突然変異検出法の開発(ポスターセッション,ゲノム変異の生成と抑制 : 分子メカニズムの理解からレギュラトリーサイエンスへ)

  松田,知成; 松田,俊; 山田,雅巳

  日本環境変異原学会大会プログラム・要旨集, 2015年11月24日

  
• ピルビン酸キナーゼとピルビン酸デヒドロゲナーゼ複合体によるアセチルCoAの地産地消モデル

  松田俊; 足立淳; 井原賢; 田沼延公; 島礼; 垣塚彰; 井倉正枝; 井倉毅; 松田知成

  日本生化学会大会(Web), 2015年

  
• 絶対定量によるヒストンH2AXのリン酸化およびアセチル化の多様性及びダイナミクス解析

  松田 俊; 古谷 寛治; 井倉 正枝; 井倉 毅; 松田 知成

  日本プロテオーム学会大会要旨集, 2015年

  
• P-034 EGFP-MDC1発現細胞を用いたDNA損傷応答阻害の検出(ポスターセッション,遺伝毒性と発がん : メカニズムを基軸とするリスク評価)

  松田,俊; 柳澤,信也; 井倉,毅; 松田,知成

  日本環境変異原学会大会プログラム・要旨集, 2014年10月31日

  
• P-014(O-3) eGFP-MDC1発現細胞を用いた簡便な変異原性試験法の開発(ポスターセッション)

  松田,俊; 井倉,正枝; 井倉,毅; 松田,知成

  日本環境変異原学会大会プログラム・要旨集, 2013年10月30日

  
• ピルビン酸キナーゼM2はダイオキシン受容体の活性化補助因子である

  松田俊; 足立淳; 井原賢; 田沼延公; 島礼; 井倉正枝; 井倉毅; 松田知成

  日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2012年10月29日

  
• P-087 BN/SDS-PAGEを用いたMLH1複合体の解析(ポスターセッション,安全・安心のための知的ネットワークの構築:分子生物学的からレギュラトリーサイエンスまで)

  竹内,智規; 松田,俊; 足立,淳; 服部,友美; 井倉,正枝; 井倉,毅; 松田,知成

  日本環境変異原学会大会プログラム・要旨集, 2011年10月20日

  
• ピルビン酸キナーゼPKM2とダイオキシン受容体AhRの相互作用の機能解明

  松田俊; 足立淳; 井原賢; 田沼延公; 島礼; 井倉正枝; 井倉毅; 松田知成

  日本環境変異原学会大会プログラム・要旨集, 2011年10月20日

  
• P-074(O-4) 芳香族炭化水素受容体(AhR)複合体のプロテオーム解析(ポスターセッション)

  松田,俊; 足立,淳; 井原,賢; 井倉,正枝; 井倉,毅; 松田,知成

  日本環境変異原学会大会プログラム・要旨集, 2010年10月29日

  
• フラーレンのin vitro毒性評価—Toxicity of fullerene in vitro—京都大学環境衛生工学研究会 第30回シンポジウム講演論文集

  松田 知成; 松田 俊; 足立 淳

  環境衛生工学研究 = Environmental & sanitary engineering research : 京都大学環境衛生工学研究会機関誌, 2008年07月

  

講演・口頭発表等

• DNA損傷応答の定量化と可視化に関する研究

  松田俊

  日本環境変異学会第46回大会, 招待有り

  
• DNA損傷応答の可視化と絶対定量による遺伝毒性評価

  松田俊

  日本環境変異学会 平成29年度公開シンポジウム「若手が拓く環境変異原研究」, 2017年06月10日, 招待有り

  
• 増殖細胞特異的なAhR機能制御

  松田俊

  環境ホルモン学会第19回研究発表会, 招待有り

  

書籍等出版物

• 遺伝情報の発現制御 : 転写機構からエピジェネティクスまで

  Latchman, David S.; 五十嵐, 和彦; 深水, 昭吉; 山本, 雅之, 共訳, 第3章 遺伝子調節におけるクロマチン構造の役割

  メディカル・サイエンス・インターナショナル, 2012年02月

  京大の蔵書を調べる：

  

産業財産権

• WO/2023/132338, 特願2022-001248, タンパク質における糖が結合したアミノ酸部位を同定する方法、及びキット

  松田俊

  
• 特許第7126556号, JP2019038117, シタラビンを含む抗腫瘍剤、シタラビンと併用される抗腫瘍効果増強剤、抗腫瘍用キット、およびシタラビンと併用される抗腫瘍剤

  北澤 諭; 石井 由紀子; 齊藤 耕一; 松田 俊

  
• 特許第7369143号, JP2019050578, ピラジン誘導体と細胞内におけるピラジン誘導体リボース三リン酸体の量を増加させる化合物とを組み合わせてなるRNAウイルス感染症治療剤

  米納 孝; 中谷 俊幸; 栗本 佑介; 松田 俊; 伴 寿一

  
• WO2020-138067, JP2019050578, ピラジン誘導体と細胞内におけるピラジン誘導体リボース三リン酸体の量を増加させる化合物とを組み合わせてなるRNAウイルス感染症治療剤

  米納 孝; 中谷 俊幸; 栗本 佑介; 松田 俊; 伴 寿一

  
• WO2020-067412, JP2019038117, シタラビンを含む抗腫瘍剤、シタラビンと併用される抗腫瘍効果増強剤、抗腫瘍用キット、およびシタラビンと併用される抗腫瘍剤

  北澤 諭; 石井 由紀子; 齊藤 耕一; 松田 俊

  
• 特開2020-005581, 特願2018-130624, γH2AXを定量する方法、ヒストン含有試料を調製する方法、およびその利用

  松田 俊

  
• 特開2019-211217, 特願2018-104340, ヌクレオチドの定量方法

  松田 俊

  

教育

担当科目

• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  環境工学先端実験演習

  F470, 後期, 工学研究科, 2
• 自 2024年04月01日, 至 2025年03月31日

  環境衛生学特論

  A626, 前期, 工学研究科, 2

学術・社会貢献

委員歴

• 自 2025年04月, 至 現在

  編集幹事, 京都大学衛生工学研究会
• 自 2022年04月, 至 現在

  Editorial Board, Genes and Environment
• 自 2022年04月, 至 現在

  第一編集委員, 日本環境変異原ゲノム学会
• 自 2021年01月, 至 2024年12月

  第二編集委員, 日本環境変異原ゲノム学会
• 自 2018年11月, 至 2018年11月

  日本環境変異原学会第47回大会 実行委員, 日本環境変異原学会